单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 1281 - 1300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1281 | 2024-08-05 |
Immuno-genomic analysis reveals eosinophilic feature and favorable prognosis of female non-smoking esophageal squamous cell carcinomas
2024-01-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216499
PMID:38013050
|
研究论文 | 本研究分析了非吸烟女性食管鳞状细胞癌的免疫基因组特征及其预后。 | 首次揭示了非吸烟女性食管鳞状细胞癌的年龄相关突变特征和特定的肿瘤免疫微环境。 | 对仅有20个非吸烟女性病例的分析样本量较小，可能影响结果的普遍适用性。 | 明确非吸烟女性食管鳞状细胞癌的基因组和免疫特征。 | 分析了94例食管鳞状细胞癌患者的全基因组或转录组测序数据。 | 数字病理学 | 食管癌 | 全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、RNA数据 | 94例食管鳞状细胞癌样本，其中包括20例非吸烟女性病例 | NA | NA | NA | NA |
| 1282 | 2024-08-05 |
Deciphering the tumor-suppressive role of PSMB9 in melanoma through multi-omics and single-cell transcriptome analyses
2024-01-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216466
PMID:37944578
|
研究论文 | 通过多组学和单细胞转录组分析揭示PSMB9在黑色素瘤中的肿瘤抑制作用 | 确定了PSMB9作为潜在的黑色素瘤抑制因子，并建立了一个基于机器学习的IFN-g敏感性特征 | 仅关注了PSMB9的作用，未探讨其他可能影响肿瘤异质性的因素 | 揭示PSMB9在黑色素瘤免疫治疗中的作用和潜在的预后价值 | 黑色素瘤患者的组织样本以及两种SKCM细胞系 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq，RNA-seq，机器学习 | NA | 组织样本，细胞系 | 10个探针特征的甲基化和表达队列，以及两个SKCM细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 1283 | 2024-08-05 |
Targeting TAM-secreted S100A9 effectively enhances the tumor-suppressive effect of metformin in treating lung adenocarcinoma
2024-01-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216497
PMID:38008395
|
研究论文 | 本研究探讨了TAM分泌的S100A9在增强MET抑制肺腺癌中的作用 | 研究首次揭示了TAM在米非司酮作用中的关键作用和S100A9的影响机制 | 研究可能受到样本量和模型选择的限制 | 阐明米非司酮在肺腺癌中的作用机制 | 主要研究TAM和S100A9在肺腺癌中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 10X Genomics单细胞测序，转录组测序，ChIP-Seq | 细胞衍生异种移植模型（CDX），患者衍生异种移植模型（PDX） | 基因组数据 | 涉及小鼠和患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1284 | 2024-08-07 |
The spatial and single-cell analysis reveals remodeled immune microenvironment induced by synthetic oncolytic adenovirus treatment
2024-01-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216485
PMID:38008394
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组测序和单细胞RNA测序，揭示了合成溶瘤腺病毒治疗后肿瘤微环境的重组特征 | 首次通过合成溶瘤腺病毒治疗，观察到肿瘤微环境的重组，包括免疫细胞和间质细胞的状态转变，以及细胞间通讯的增强 | 研究主要集中在小鼠肝细胞癌模型和I期临床试验，需要进一步在更广泛的模型和临床试验中验证 | 探讨合成溶瘤腺病毒治疗后肿瘤微环境的细胞和分子特征 | 肝细胞癌及其微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组测序和单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和I期临床试验中的肝细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1285 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of mitochondrial dysfunction in the cardiogenic toxicity of perfluorooctane sulfonate in human embryonic stem cells
2024-Jan-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.115945
PMID:38183750
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了全氟辛烷磺酸（PFOS）对人类胚胎干细胞心肌分化的影响，并检测了细胞凋亡、线粒体膜电位和ATP水平。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PFOS通过干扰线粒体功能影响心肌分化的具体机制。 | 研究仅限于体外实验，未来需进一步验证在体内的效果和机制。 | 探讨PFOS对人类胚胎干细胞心肌分化的毒性作用及其机制。 | 人类胚胎干细胞的心肌分化过程。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1286 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis to evaluate antimony exposure effects on cell-lineage communications within the Drosophila testicular niche
2024-Jan-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.115948
PMID:38184976
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了锑暴露对果蝇睾丸微环境中细胞系通讯的影响 | 首次揭示了锑暴露通过表皮生长因子受体（EGFR）和WNT信号通路影响果蝇睾丸微环境中的细胞间通讯 | NA | 探究锑暴露对果蝇睾丸微环境中细胞系通讯的影响机制 | 果蝇睾丸中的细胞系通讯 | 数字病理学 | 生殖健康 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1287 | 2024-08-07 |
SUV39H1 Ablation Enhances Long-term CAR T Function in Solid Tumors
2024-01-12, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-1350
PMID:37934001
|
研究论文 | 本文研究了通过表观遗传学调控组蛋白3赖氨酸9三甲基化（H3K9me3）途径，增强基于41BB（BBz）的嵌合抗原受体（CAR）T细胞在实体瘤中的长期功能 | 通过失活H3K9三甲基转移酶SUV39H1，增强了BBz-CAR T细胞的长期持久性，保护小鼠免受肿瘤复发和再挑战 | NA | 优化BBz-CAR T细胞的长期功能持久性，减少肿瘤复发 | BBz-CAR T细胞在实体瘤中的长期功能 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序，单细胞转座酶可及染色质分析 | NA | 单细胞转录组数据，染色质开放数据 | 涉及小鼠模型中的肿瘤浸润CAR T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1288 | 2024-08-07 |
An inappropriate decline in ribosome levels drives a diverse set of neurodevelopmental disorders
2024-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.09.574708
PMID:38260472
|
研究论文 | 本文探讨了核糖体水平下降如何导致多种神经发育障碍，并发现了一种新的机制，即核糖体水平的改变与早期大脑发育中细胞命运指定的时间有关。 | 发现了核糖体水平变化与早期大脑发育中细胞命运指定时间之间的未被重视的机制，并提出了通过增强mTOR活性来改善与智力障碍相关的发育缺陷的治疗方法。 | NA | 揭示蛋白质合成缺陷相关的人类大脑发育障碍的细胞和分子起源。 | 核糖体生物发生因子的新等位变异及其在神经发育障碍中的作用。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 蛋白质组学分析，单细胞转录组分析，单个类器官的翻译组分析 | NA | 蛋白质组，转录组 | 多个发育阶段的人类大脑类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 1289 | 2024-08-07 |
[Future Perspectives of Single-Cell RNA Sequencing in Cancer Research]
2024-Jan, Gan to kagaku ryoho. Cancer & chemotherapy
PMID:38247085
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在癌症研究中的进展和应用 | scRNA-seq技术使得能够在单细胞水平上分析动态基因表达特性，从而在癌症研究中取得了显著进展 | NA | 探讨scRNA-seq技术在理解癌症病理生物学中的应用 | 癌症及其相关的基因表达变化 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1290 | 2024-08-05 |
Exploring the mechanism of Celastrol in the treatment of rheumatoid arthritis based on systems pharmacology and multi-omics
2024-01-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48248-5
PMID:38238321
|
研究论文 | 本研究探索了Celastrol在类风湿关节炎治疗中的分子网络机制 | 提出了一种新的策略，将系统药理学、蛋白质组学、转录组学和单细胞转录组学相结合 | NA | 揭示Celastrol在类风湿关节炎治疗中的作用机制 | 类风湿关节炎相关基因和Celastrol的潜在靶标 | 系统药理学 | 类风湿关节炎 | 系统药理学、转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 195个靶标、2068个差异基因、294个差异蛋白 | NA | NA | NA | NA |
| 1291 | 2024-08-05 |
PROST: quantitative identification of spatially variable genes and domain detection in spatial transcriptomics
2024-Jan-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44835-w
PMID:38238417
|
研究论文 | 本文提出了一个框架（PROST），用于定量识别空间转录组中的空间变异基因和组织域 | 提出了PROST Index，可以有效定量表征基因表达的空间变异，并通过自注意力机制进行空间域的无监督聚类 | 现有方法在均匀量化空间变异基因方面存在不足，且大部分方法在技术上将空间变异基因和空间域的描绘割裂开 | 研究空间转录组数据的定量识别和分析 | 针对空间表达模式的基因和组织域进行定量识别 | 数字病理学 | NA | 空间转录组测序 | 自注意力机制 | 基因表达数据 | 不同空间分辨率的样本，包括多细胞和细胞级别的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1292 | 2024-08-05 |
Anoikis related genes may be novel markers associated with prognosis for ovarian cancer
2024-01-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52117-0
PMID:38238592
|
研究论文 | 本研究旨在确定与凋亡相关基因在卵巢癌中的预后意义，并基于ARG表达开发预后标志。 | 本研究首次提出ARG可能在卵巢癌预后中发挥新颖作用，并建立了基于ARG表达的预后签名。 | 需要进一步研究来验证结果并探索潜在机制。 | 探讨凋亡相关基因在卵巢癌预后中的作用。 | 卵巢癌患者的临床数据和单细胞测序数据的分析。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单样本基因集富集分析（ssGSEA），非负矩阵分解（NMF），LASSO | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1293 | 2024-08-07 |
Immune characteristics of kidney transplant recipients with acute respiratory distress syndrome induced by COVID-19 at single-cell resolution
2024-Jan-18, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02682-9
PMID:38238762
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，构建了肾移植受者（KTRs）和健康个体的外周血单个核细胞（PBMCs）的单细胞免疫图谱，以探讨COVID-19诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）在KTRs中的免疫微环境异质性 | 本研究首次在单细胞分辨率下探讨了COVID-19诱导的ARDS在肾移植受者中的免疫特征，揭示了KTRs在病毒感染和免疫抑制双重影响下的免疫微环境异质性 | 研究样本量较小，仅包括八名COVID-19诱导的ARDS患者和五名KTRs，可能影响结果的普遍性 | 旨在深入理解COVID-19诱导的ARDS在肾移植受者中的免疫特征 | 肾移植受者（KTRs）和健康个体的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 八名COVID-19诱导的ARDS患者，五名KTRs，五名健康个体 | NA | NA | NA | NA |
| 1294 | 2024-08-05 |
Multipotent progenitors instruct ontogeny of the superior colliculus
2024-Jan-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.009
PMID:38096816
|
研究论文 | 这篇文章探讨了哺乳动物上丘的多能前体细胞如何指导细胞类型的多样性生成 | 首次建立了单细胞水平上哺乳动物上丘发育的新框架 | 目前尚不清楚其他因素如何进一步影响上丘细胞的多样性 | 研究上丘细胞类型多样性的生成原理 | 主要研究了上丘的放射胶质前体细胞的多能性 | 数字病理学 | NA | 基因马赛克分析和单细胞测序 | NA | 细胞谱系数据 | 使用了多个标记的遗传马赛克小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1295 | 2024-08-05 |
Towards high-throughput parallel imaging and single-cell transcriptomics of microbial eukaryotic plankton
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0296672
PMID:38241213
|
研究论文 | 该文章探讨了微生物真核浮游生物的单细胞转录组学，应用了一种新技术用于高通量成像。 | 首次将微阵列单细胞测序技术应用于微生物真核生物，并展示了其在不同细胞结构的微生物群体中的应用潜力。 | 在研究较小的硅藻细胞时，无法有效分离单细胞转录组与背景噪音，信噪比尚需提高。 | 探索微生物真核生物的转录组特征并揭示其对生态系统的影响。 | 研究三种重要浮游生物：纤毛虫Tetrahymena thermophila、硅藻Phaeodactylum tricornutum和甲藻Heterocapsa sp。 | 数字病理学 | NA | 微阵列单细胞测序技术 (MASC-seq) | NA | 图像和转录组数据 | 三种浮游生物物种的多个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1296 | 2024-08-05 |
Cross-species single-cell landscape of vertebrate pineal gland
2024-Jan, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12927
PMID:38018267
|
研究论文 | 本研究详细分析了从鱼类到哺乳动物的松果体进化过程 | 揭示了松果体细胞在不同物种间的独特转录变化和配体-受体相互作用 | 研究样本主要局限于斑马鱼、老鼠和猴子，结果的普遍性需进一步验证 | 探讨松果体从鱼类到哺乳动物的进化及其功能多样性 | 斑马鱼、老鼠和猴子的松果体单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共计22,431个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1297 | 2024-08-07 |
sc2MeNetDrug: A computational tool to uncover inter-cell signaling targets and identify relevant drugs based on single cell RNA-seq data
2024-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011785
PMID:38181047
|
研究论文 | 开发了一种名为sc2MeNetDrug的计算工具，用于基于单细胞RNA测序数据揭示细胞间信号传导目标并识别相关药物 | sc2MeNetDrug工具专门设计用于识别疾病微环境中的细胞类型，揭示单个细胞类型内的功能障碍信号通路及不同细胞类型间的相互作用，并预测可能破坏细胞间信号传导的有效药物 | NA | 开发一种新的计算工具，帮助研究人员基于单细胞RNA测序数据发现新的细胞间信号传导和治疗方案 | 单细胞RNA测序数据中的细胞间信号传导和相关药物 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1298 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of the cellular landscape of vulvar melanoma provides new insight for immunotherapy administration
2024-Jan-17, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11839-0
PMID:38233802
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了外阴黑色素瘤的细胞景观，为免疫治疗提供了新的见解 | 发现了CD8+ T细胞激活在外阴黑色素瘤中的作用，以及抗原呈递分子功能在黑色素瘤转移中的参与 | 研究样本仅来自一位68岁女性患者，可能影响结果的普遍性 | 阐明外阴黑色素瘤中紊乱的免疫微环境在癌症进展中的作用 | 外阴黑色素瘤的细胞景观及其在免疫治疗中的潜在应用 | 数字病理学 | 外阴黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 12,243个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1299 | 2024-08-07 |
Splenic monocytes drive pathogenic subretinal inflammation in age-related macular degeneration
2024-Jan-17, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03011-z
PMID:38233865
|
研究论文 | 本文研究了年龄相关性黄斑变性（AMD）中脾脏单核细胞在病理性视网膜下炎症中的作用 | 首次展示了血管紧张素II能够动员ATR1脾脏单核细胞，并通过单细胞RNA测序揭示了其转录特征，这些细胞在功能上与骨髓单核细胞不同 | NA | 探讨脾脏单核细胞在年龄相关性黄斑变性中的作用及其潜在的治疗策略 | 年龄相关性黄斑变性中的脾脏单核细胞 | NA | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1300 | 2024-08-07 |
Heterogeneous Expression Patterns of the Minichromosome Maintenance Complex Members in Retinoblastoma Unveil Its Clinical Significance
2024-Jan-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.1.31
PMID:38231525
|
研究论文 | 研究探讨了微染色体维持（MCM）复合体成员在视网膜母细胞瘤（RB）中的表达模式及其临床意义 | 首次在单细胞水平上整合了来自正常视网膜、眼内和眼外RB样本的单细胞RNA测序数据，以表征MCM复合体成员的表达模式 | NA | 探索MCM复合体成员在视网膜母细胞瘤中的表达模式及其临床意义 | MCM复合体成员在视网膜母细胞瘤中的表达 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个正常视网膜样本、六个眼内RB样本和五个眼外RB样本 | NA | NA | NA | NA |