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当前共找到 1397 篇文献，本页显示第 1261 - 1280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1261 | 2024-08-07 |
Genome-wide analyses reveal the contribution of somatic variants to the immune landscape of multiple cancer types
2024-Jan, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011134
PMID:38241355
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析探索了22种TCGA癌症类型中癌细胞基因变异与74种免疫特征之间的关联 | 发现KEAP1突变在肺腺癌中对多个免疫特征的变异贡献超过10%，并证实KEAP1突变激活NRF2通路，影响肿瘤微环境 | NA | 理解癌细胞中的遗传变异如何影响免疫调控，以改进免疫治疗患者分层和识别新的免疫肿瘤学靶点 | 22种TCGA癌症类型中的癌细胞基因变异与免疫特征的关联 | 数字病理学 | 肺腺癌 | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 涉及22种TCGA癌症类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1262 | 2024-08-05 |
Decoding leukemia at the single-cell level: clonal architecture, classification, microenvironment, and drug resistance
2024-Jan-30, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00479-6
PMID:38291542
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review | 本文综述了单细胞测序技术在白血病研究中的应用 | 通过单细胞测序技术揭示了白血病的克隆结构、亚型分类、肿瘤微环境及耐药机制 | 传统的批量测序技术无法有效揭示个体肿瘤细胞之间的异质性 | 探讨白血病的发生机制和耐药性 | 白血病相关的单细胞研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1263 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq mapping of chicken peripheral blood leukocytes
2024-Jan-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10044-4
PMID:38287279
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研究论文 | 本研究评估了单细胞RNA-seq作为识别鸡外周血白细胞的工具 | 首次识别出具有高SOX5表达的鸡外周B细胞亚群，并提供了TCRγ/δ + T细胞亚群的新见解 | 该方法在一定程度上受限于鸡基因组的不完全注释，且某些细胞类型的解读较为复杂 | 研究单细胞转录组学在鸡外周血白细胞中的应用 | 来自4只临床健康母鸡的纯化脱 thrombocyte 的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞3' RNA-seq | NA | 转录组数据 | 4只母鸡的白细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1264 | 2024-08-07 |
Characterization of CD90/Thy-1 as a crucial molecular signature for myogenic differentiation in human urine-derived cells through single-cell RNA sequencing
2024-01-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52530-5
PMID:38282008
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了CD90/Thy-1在人尿源细胞中作为肌源性分化的关键分子标志的作用 | 首次发现CD90/Thy-1在人尿源细胞中高度表达，并与高肌源性潜能的亚群细胞相关，对肌源性分化有重要影响 | CD90的过表达并未增强非CD90阳性细胞的肌源性分化，表明其作用可能有限 | 探究CD90/Thy-1在人尿源细胞肌源性分化中的作用及其机制 | 人尿源细胞（UDCs）及其肌源性分化能力 | NA | Duchenne肌营养不良（DMD） | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 有限亚群的人尿源细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1265 | 2024-08-05 |
Analysis of the potential biological value of pyruvate dehydrogenase E1 subunit β in human cancer
2024-Jan-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i1.144
PMID:38292838
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法综合分析了丙酮酸脱氢酶E1亚单位β（PDHB）在不同癌症中的潜在生物价值。 | 本研究首次系统性探讨了PDHB在各种癌症中的诊断、预后及免疫相关性，并发现其在肝癌细胞中的调节作用。 | 该研究大部分分析依赖于现有数据库，缺乏广泛的临床实验验证。 | 研究PDHB在癌症中的生物学作用及其作为肿瘤标志物的潜力。 | 本研究的对象主要为不同类型的癌症样本和肝癌细胞。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种癌症的大量样本，具体数字未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 1266 | 2024-08-07 |
Identification of Cancer Stem Cell-related Gene by Single-cell and Machine Learning Predicts Immune Status, Chemotherapy Drug, and Prognosis in Lung Adenocarcinoma
2024, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
|
研究论文 | 本研究旨在基于癌症干细胞相关基因识别肺腺癌的分子类型和预后模型 | 本研究首次构建了一个基于8个基因的预后模型，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | NA | 识别肺腺癌的分子类型和预后模型 | 肺腺癌的分子类型和预后模型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归分析 | 单细胞RNA测序数据 | 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌临床信息和RNA-seq数据，以及来自GEO数据库的scRNA数据集GSE131907和5个GSE数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1267 | 2024-08-07 |
Identification of Stem Cell-related Gene Markers by Comprehensive Transcriptome Analysis to Predict the Prognosis and Immunotherapy of Lung Adenocarcinoma
2024, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
|
研究论文 | 本研究通过综合转录组分析识别与肺腺癌预后和免疫治疗相关的干细胞相关基因标记 | 开发了一种新的癌症干细胞评估指标和一个4基因标记，用于评估肺腺癌对免疫检查点阻断疗法或抗肿瘤治疗的反应 | NA | 评估肺腺癌细胞的干细胞特性及其对预后和免疫治疗的影响 | 肺腺癌中的癌症干细胞及其相关基因标记 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | LASSO和COX回归分析 | 基因表达数据 | 4个样本，共3455个恶性细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1268 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the epithelial cell, fibroblast, and key gene alterations in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-01-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52341-8
PMID:38280891
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了慢性鼻窦炎伴鼻息肉中上皮细胞、成纤维细胞及关键基因的改变 | 首次在单细胞水平上揭示了慢性鼻窦炎伴鼻息肉中上皮细胞和成纤维细胞的动态变化及关键基因WFDC2和CCL26的作用 | NA | 探究慢性鼻窦炎伴鼻息肉发展过程中上皮细胞和成纤维细胞的变化及其关键基因 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的上皮细胞、成纤维细胞及关键基因 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1269 | 2024-08-07 |
A resource of single-cell gene expression profiles in a planarian Dugesia japonica
2024-Jan, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12893
PMID:37779230
|
研究论文 | 本文收集了Dugesia japonica细胞并进行了单细胞RNA测序分析，通过一种新颖的自动迭代细胞聚类策略，生成了包含3,404个细胞的数据集，这些细胞可根据基因表达谱分为63种细胞类型 | 引入了一种新颖的自动迭代细胞聚类策略，生成了包含3,404个细胞的数据集，并展示了该数据集在功能相关基因表达分析中的应用 | NA | 研究Dugesia japonica中的干细胞和再生机制 | Dugesia japonica的单细胞基因表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 3,404个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1270 | 2024-08-07 |
Intratumor APOL3 delineates a distinctive immunogenic ferroptosis subset with prognosis prediction in colorectal cancer
2024-Jan, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16009
PMID:37986654
|
研究论文 | 本研究探讨了APOL3在结直肠癌中的表达及其对预后和生物学预测价值的影响 | APOL3被发现促进免疫活性微环境，通过促进铁死亡、下调巨噬细胞和上调CD8+ T细胞浸润，作为独立预后因子和预测标志物 | NA | 研究APOL3在结直肠癌中的表达及其对预后和生物学预测价值的影响 | APOL3在结直肠癌中的表达及其生物学功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录数据, 蛋白质表达 | 911个肿瘤微阵列样本, 412个转录数据样本, 30个单细胞RNA测序样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1271 | 2024-08-07 |
Identification of target cells of human papillomavirus 18 using squamocolumnar junction organoids
2024-Jan, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15988
PMID:37996972
|
研究论文 | 本研究通过建立HPV18LCR-GFP载体并将其转导至患者来源的鳞状柱状交界处类器官，以识别HPV18感染的细胞并阐明其复制机制 | 本研究建立了一种新的实验模型，用于识别HPV18早期启动子活性的相关基因，这些分子可能作为HPV18感染宫颈病变的治疗靶点 | NA | 识别HPV18感染的细胞并阐明其复制机制 | HPV18感染的细胞及其复制机制 | NA | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | GFP阳性细胞和GFP阴性细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1272 | 2024-08-07 |
A novel iTreg-related signature for prognostic prediction in lung adenocarcinoma
2024-Jan, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16015
PMID:38015097
|
研究论文 | 本研究探讨了诱导性调节T细胞（iTregs）相关基因在肺腺癌（LUAD）中的预后价值和治疗效果 | 构建了一个基于七个iTreg相关基因的预后风险特征，用于预测肺腺癌患者的预后和化疗敏感性 | NA | 识别肺腺癌的新型预后生物标志物 | 肺腺癌患者及其iTreg相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | RNA测序数据 | 数据来自The Cancer Genome Atlas、Gene Expression Omnibus和Tumor Immune Single-cell Hub 2数据库的LUAD患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1273 | 2024-08-05 |
Inference of differentiation trajectories by transfer learning across biological processes
2024-01-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.12.002
PMID:38128536
|
研究论文 | 这篇文章研究了细胞分化轨迹的推断方法，使用迁移学习在不同生物过程中量化可预测性 | 提出了一种新的框架，通过迁移学习推断不同行为过程中的细胞分化，并展示了非线性方法的优越性 | 在成人造血过程中，预测结果与真实数据的一致性较低 | 量化和利用细胞分化轨迹的可预测性 | 早期胚胎发育和成人造血过程中的细胞分化 | 计算生物学 | NA | 迁移学习，自定义变分自编码器 | 变分自编码器 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1274 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing analysis within biologically relevant dimensions
2024-01-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.12.005
PMID:38198894
|
研究论文 | 本文提出了一种基于生物相关维度的单细胞分析策略Seqtometry | Seqtometry跳过了无监督聚类和单个聚类的注释，结合了定性和定量的细胞类型识别 | NA | 探索和分析基因表达及可及性在不同器官系统中的变化 | 多种免疫细胞以及其他来自不同器官和疾病诱导状态的细胞，包括多发性骨髓瘤和阿尔茨海默病 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1275 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis the prognostic and immune characteristics of mitochondrial transport-related gene SFXN1 in lung adenocarcinoma
2024-Jan-17, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11646-z
PMID:38233752
|
研究论文 | 本研究旨在探讨线粒体运输相关基因SFXN1在肺腺癌中的预后和免疫特性 | 首次评估SFXN1作为肺腺癌潜在预后生物标志物的可能性 | NA | 识别和评估SFXN1作为肺腺癌的潜在预后生物标志物 | SFXN1基因在肺腺癌中的表达及其对预后和免疫环境的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 实时定量PCR, 免疫印迹, 免疫组织化学 | NA | mRNA, 蛋白质 | 90例临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1276 | 2024-08-05 |
Construction of multiplexed transcriptome NGS libraries of microdissected tissue samples based on combinational DNA barcode microbeads
2024-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300294
PMID:37818700
|
研究论文 | 本文提出了一种基于组合DNA条形码的中通量转录组分析方法 | 文章首次介绍了组合DNA条形码（CDB）测序的应用，结合了Smart-3SEQ和CDB磁微珠以提高转录组分析的通量 | 文中没有明确提及CDB-seq方法在其他类型组织样本中的适用性 | 研究旨在开发一种成本效益高的中通量转录组分析方法 | 研究对象为微切割的组织样本，包括小鼠脑组织样本 | 数字病理学 | NA | NGS | NA | RNA提取物 | 数十个微切割样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1277 | 2024-08-05 |
Glomerular spatial transcriptomics of IgA nephropathy according to the presence of mesangial proliferation
2024-01-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52581-8
PMID:38278877
|
研究论文 | 本研究探讨了根据系膜增生的存在，IgA肾病（IgAN）肾小球的基因表达谱 | 使用空间特异性转录组分析，揭示了M1-IgAN与对照之间基因表达的显著差异 | 研究仅涵盖了12个病例，且各病例仅分析了三个肾小球 | 研究IgAN中系膜增生对肾小球基因表达的影响 | IgAN患者及供体控制样本的肾小球组织 | 数字病理学 | 肾病 | GeoMx数字空间分析 | NA | 基因表达数据 | 12个病例，分析每个病例的3个肾小球 | NA | NA | NA | NA |
| 1278 | 2024-08-07 |
Multi-omics reveals the role of ENO1 in bladder cancer and constructs an epithelial-related prognostic model to predict prognosis and efficacy
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52573-8
PMID:38273010
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研究论文 | 研究探讨ENO1在膀胱癌中的作用，并通过多组学分析构建了一个与上皮细胞相关的预测模型，用于预测膀胱癌的预后和治疗反应 | 通过多组学分析揭示了ENO1在膀胱癌中的高表达及其与不良预后、CD8+ T细胞耗竭和上皮异质性的关联，并构建了一个新的预测模型 | NA | 探索ENO1在膀胱癌中的作用，并构建一个预测膀胱癌预后和治疗反应的模型 | ENO1在膀胱癌中的表达及其对预后和治疗反应的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | IHC, RNA-seq, scRNA-seq | LASSO分析 | 组织样本, 细胞样本 | 249个关键基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1279 | 2024-08-07 |
Identification of gene signatures and molecular mechanisms underlying the mutual exclusion between psoriasis and leprosy
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52783-0
PMID:38273053
|
研究论文 | 本研究旨在揭示牛皮癣和麻风病相互排斥的分子机制，通过分析差异表达基因和富集分析，识别出关键的相互排斥基因并探讨其与免疫细胞浸润的关系。 | 本研究首次识别出APOE, CYP27A1, 和SOAT1作为牛皮癣和麻风病相互排斥的关键基因，并通过胆固醇代谢途径解释了两者之间的负相关机制。 | 本研究主要基于数据库中的数据进行分析，未来需要更多的实验验证和临床数据支持。 | 揭示牛皮癣和麻风病相互排斥的分子机制 | 牛皮癣和麻风病的差异表达基因及相互排斥机制 | NA | 牛皮癣, 麻风病 | DEseq2, 单样本基因集富集分析 (ssGSEA) | 蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络 | 基因表达数据 | 1098个差异表达基因在麻风病数据集中，3839个差异表达基因在牛皮癣数据集中 | NA | NA | NA | NA |
| 1280 | 2024-08-07 |
Exploring Immune Cell Diversity in the Lacrimal Glands of Healthy Mice: A Single-Cell RNA-Sequencing Atlas
2024-Jan-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25021208
PMID:38279208
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和生物信息学分析，探索了正常小鼠泪腺中的免疫细胞多样性及其分子特征 | 首次详细描述了泪腺中18种不同细胞簇和26种免疫细胞亚群的多样性及其细胞间相互作用 | NA | 深入了解泪腺中的免疫系统及其与相关疾病的关系 | 小鼠泪腺中的免疫细胞及其分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类 | 细胞 | 34,891个细胞 | NA | NA | NA | NA |