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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals S100a9hi macrophages promote the transition from acute inflammation to fibrotic remodeling after myocardial ischemia‒reperfusion
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.91180
PMID:38323308
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和流式细胞术探讨了心肌缺血再灌注后巨噬细胞亚型及其在炎症和纤维化过程中的作用 | 首次鉴定出一种独特的S100a9巨噬细胞亚型,该亚型参与急性炎症和纤维化过程,并揭示了其在心肌缺血再灌注后的作用机制 | 研究主要集中在小鼠模型上,未来需要进一步在人类中验证这些发现 | 探讨心肌缺血再灌注后巨噬细胞的异质性和转化机制 | 心肌缺血再灌注后的巨噬细胞及其在炎症和纤维化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用S100a9小鼠建立心肌缺血再灌注模型,并进行了骨髓来源的巨噬细胞再灌注实验 | NA | NA | NA | NA |
| 1182 | 2024-08-07 |
Tumor cell senescence-induced macrophage CD73 expression is a critical metabolic immune checkpoint in the aging tumor microenvironment
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.91119
PMID:38323313
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研究论文 | 本研究探讨了衰老细胞在肿瘤微环境中的代谢重塑作用,特别是肿瘤细胞诱导的肿瘤相关巨噬细胞CD73上调对腺苷积累的影响 | 首次揭示了衰老肿瘤微环境的代谢景观,特别是肿瘤细胞诱导的肿瘤相关巨噬细胞CD73上调对腺苷积累的影响 | NA | 探索从代谢角度增强衰老细胞诱导的抗肿瘤免疫的精确靶点 | 衰老细胞在肿瘤微环境中的代谢重塑作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 流式细胞术, 免疫荧光染色, 单细胞转录组测序 | NA | 肿瘤间质液, 临床样本 | 使用8 Gy×3放射治疗或顺铂化疗诱导的衰老模型, 以及10 Gy照射或顺铂处理的模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1183 | 2024-08-07 |
Patterning ganglionic eminences in developing human brain organoids using a morphogen-gradient-inducing device
2024-Jan-22, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100689
PMID:38228151
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研究论文 | 本文开发了一种利用聚二甲基硅氧烷装置生成持续化学梯度的方法,用于制备具有空间模式的大脑类器官,称为形态素梯度诱导的大脑类器官(MIBOs) | MIBOs能够在体外复制早期神经发育中的背腹模式,并通过单细胞RNA测序揭示了不同类型的神经元 | NA | 建立更精确的体外大脑发育模型 | 大脑类器官及其在神经发育和疾病模型中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | MIBOs培养时间长达5.5个月 | NA | NA | NA | NA |
| 1184 | 2024-08-07 |
[Research Progress in the Molecular Regulatory Mechanisms of Alveolar Bone Restoration]
2024-Jan-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20240160501
PMID:38322519
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研究论文 | 本文综述了牙槽骨修复的分子调控机制的研究进展 | 探讨了Notch、Wnt、Toll样受体(TLR)和核因子-κB(NF-κB)等多种信号通路在牙槽骨修复中的作用 | 目前研究尚未构建成熟的牙槽骨修复分子调控网络 | 深入理解牙槽骨修复的分子调控机制,探索新的治疗靶点 | 牙槽骨、成骨细胞、破骨细胞、牙周韧带细胞等多种细胞类型及其信号通路 | NA | 口腔炎症疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1185 | 2024-08-07 |
Human iPSC modeling recapitulates in vivo sympathoadrenal development and reveals an aberrant developmental subpopulation in familial neuroblastoma
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108096
PMID:38222111
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研究论文 | 本文通过人类多能干细胞和单细胞RNA测序技术,重现了交感肾上腺系的正常发育过程,并识别出与家族性神经母细胞瘤相关的异常发育亚群 | 开发了一种新的分化模型,用于重现交感肾上腺系的正常发育过程,并利用单细胞RNA测序技术揭示了分子事件 | NA | 研究神经嵴相关疾病如儿童癌症神经母细胞瘤的早期破坏事件 | 人类多能干细胞及其在交感肾上腺系发育中的应用 | 数字病理学 | 儿童癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自携带生殖系激活突变的患者来源的iPSC细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1186 | 2024-08-04 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal a Cancer-Associated Fibroblast Subset in HNSCC That Restricts Infiltration and Antitumor Activity of CD8+ T Cells
2024-01-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1448
PMID:37930937
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序揭示了一种与肿瘤免疫逃逸相关的癌相关成纤维细胞亚群 | 该研究首次识别了高表达MHC-I和Galectin-9的癌相关成纤维细胞亚群,并探讨了它们对CD8+ T细胞浸润和功能的抑制作用 | 本研究仅通过五对肿瘤及相邻组织进行分析,样本数量较少,可能影响结果的普遍适用性 | 阐明调节HNSCC肿瘤微环境中CD8+ T细胞浸润和功能障碍的关键机制 | 研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本及其相邻组织 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 五对肿瘤及相邻组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1187 | 2024-08-04 |
Integration of Pan-Cancer Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals Stromal Cell Features and Therapeutic Targets in Tumor Microenvironment
2024-01-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1418
PMID:38225927
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤微环境中基质细胞的特征及治疗靶点 | 首次进行泛癌症分析,识别了39种基质亚群并探讨其功能特征与治疗相关性 | 分析仅限于258名患者,可能无法代表所有癌症类型的基质细胞特征 | 设计针对基质细胞的抗肿瘤策略 | 214,972个非免疫基质细胞及来自16种癌症类型的患者样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 258名患者的样本和16名患者的空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1188 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immune microenvironment landscape of osteosarcoma before and after chemotherapy
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23601
PMID:38332885
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了化疗前后骨肉瘤患者的免疫微环境变化 | 首次详细描述了化疗对骨肉瘤免疫微环境的具体影响,包括免疫细胞组成的变化及其功能调整 | 研究样本量较小,且仅包括化疗前后的骨肉瘤组织,可能影响结果的普遍性 | 探讨化疗对骨肉瘤免疫微环境的影响及其机制 | 骨肉瘤患者的免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6名未接受化疗的骨肉瘤患者和7名接受化疗的骨肉瘤患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1189 | 2024-08-07 |
Multiscale spatial mapping of cell populations across anatomical sites in healthy human skin and basal cell carcinoma
2024-Jan-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313326120
PMID:38165934
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研究论文 | 本文创建了一个多尺度的健康皮肤和基底细胞癌(BCC)空间图谱,结合了光学相干断层扫描、单细胞RNA测序、空间全局转录组分析和原位测序技术,揭示了不同细胞群在特定组织环境中的定位。 | 本文首次通过多尺度空间图谱揭示了健康皮肤和基底细胞癌中细胞群的定位及其与组织环境的关系,特别是发现了与毛囊相关的细胞群在癌症中的扩张。 | NA | 旨在深入理解人体皮肤细胞在不同解剖部位和肿瘤形成中的差异。 | 健康人体皮肤和基底细胞癌中的细胞群及其空间分布。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 光学相干断层扫描、单细胞RNA测序、空间全局转录组分析、原位测序 | NA | 图像、基因序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1190 | 2024-08-04 |
Single-cell analysis reveals the stromal dynamics and tumor-specific characteristics in the microenvironment of ovarian cancer
2024-01-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05733-x
PMID:38182756
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研究论文 | 本研究揭示了卵巢癌微环境中的基质动态和肿瘤特异性特征 | 通过单细胞转录组学分析,识别了高基质和低基质肿瘤中免疫细胞和非免疫细胞的独特转录组景观 | 样本量较小,仅包括20个数据集 | 研究高级别浆液性卵巢癌微环境中基质细胞的作用及其与免疫细胞的相互作用 | 卵巢癌(HGSOC)的微环境中的基质细胞亚型及其相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 20个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1191 | 2024-08-04 |
Pan-cancer and single-cell analysis reveal THRAP3 as a prognostic and immunological biomarker for multiple cancer types
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1277541
PMID:38333620
|
研究论文 | 本研究揭示了THRAP3在多种癌症中的预后和免疫学标志物的潜力 | 首次全面分析了THRAP3在泛癌症中的作用,并验证了其在肺癌中的表达水平 | THRAP3的低表达在肺鳞状细胞癌中未得到详细探讨 | 探讨THRAP3在多种癌症中的生物学活性及其作为预后标志物的有效性 | 研究了THRAP3在肺癌及其他多种癌症中的表达和预后关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组化(IHC)和单细胞测序(ScRNA-seq) | NA | 生物信息学数据库数据 | 在研究中利用了多种癌症类型的样本,具体样本数量未明示 | NA | NA | NA | NA |
| 1192 | 2024-08-04 |
The use of single-cell RNA-seq to study heterogeneity at varying levels of virus-host interactions
2024-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011898
PMID:38236826
|
综述 | 本研究描述了利用单细胞RNA测序技术研究病毒感染异质性的方法。 | 提出使用单细胞RNA测序技术来研究病毒与宿主相互作用中存在的复杂性和细胞异质性。 | 强调了在不同尺度上分析单细胞RNA测序数据时的一些关键实验限制和方法选择。 | 研究病毒感染过程中的异质性及感染细胞人群的动态变化。 | 研究对象包括个别病毒粒子和感染个体之间的免疫反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成千上万的个体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1193 | 2024-08-07 |
BHLHE40 drives protective polyfunctional CD4 T cell differentiation in the female reproductive tract against Chlamydia
2024-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011983
PMID:38271477
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | 首次揭示了Bhlhe40在调节CD4 T细胞分化和多功能反应中的关键作用,对抗沙眼衣原体感染 | NA | 研究Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应 | 免疫学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序结合TCR分析 | NA | RNA | Bhlhe40缺陷小鼠和野生型小鼠的CD4 T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1194 | 2024-08-07 |
MAPK-activated protein kinase 2 is associated with poor prognosis of glioma patients and immune inhibition in glioma
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1307992
PMID:38322416
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研究论文 | 本研究探讨了MAPK激活蛋白激酶2(MAPKAPK2)在胶质瘤中的表达及其对患者预后和免疫抑制的影响 | 首次揭示了MAPKAPK2在胶质瘤中的临床意义和分子功能,特别是在细胞增殖、迁移、DNA损伤修复和免疫调节中的作用 | NA | 研究MAPKAPK2在胶质瘤中的临床意义和分子功能 | MAPKAPK2在胶质瘤组织中的表达及其对患者预后和免疫抑制的影响 | 数字病理学 | 脑瘤 | 免疫组织化学、转录组测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 组织样本、RNA序列 | 使用了来自TCGA和CGGA的数据,具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 1195 | 2024-08-07 |
Development and Validation of a Novel Nomogram Integrated with Hypoxic and Lactate Metabolic Characteristics for Prognosis Prediction in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S446313
PMID:38333220
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种新型诺模图,该诺模图整合了缺氧和乳酸代谢特征,用于预测肝细胞癌的预后 | 本研究创新性地构建了一个与缺氧和乳酸代谢相关的预后模型(HLPM),并开发了一个整合HLPM和临床特征的诺模图,用于肝细胞癌的预后预测 | NA | 旨在构建一个与缺氧和乳酸代谢相关的预后模型,以评估肝细胞癌患者的生存和治疗反应,并开发一个整合这些特征的诺模图用于预后预测 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 诺模图 | 组织样本 | 14对组织样本和单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1196 | 2024-08-05 |
The unfolded protein response pathway as a possible link in the pathogenesis of COVID-19 and sepsis
2024-Jan-08, Archives of virology
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s00705-023-05948-7
PMID:38191819
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研究论文 | 本研究揭示了在单细胞水平上COVID-19和脓毒症的发病机制中未折叠蛋白反应(UPR)通路的重要性 | 提供了COVID-19与脓毒症之间的共同发病机制的新分子视角 | 未在研究中提及具体的生物标志物或临床数据的长时间追踪 | 探讨COVID-19与脓毒症之间的潜在联系及其共同的发病机制 | COVID-19和脓毒症病例的单细胞RNA-seq数据及转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1197 | 2024-08-07 |
The Gut Microbiome Controls Liver Tumors via the Vagus Nerve
2024-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.23.576951
PMID:38328040
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研究论文 | 本文探讨了肠道微生物群通过迷走神经影响肝脏肿瘤的机制 | 首次揭示肠道微生物群通过迷走神经调节肝脏肿瘤的机制,并发现迷走神经通过乙酰胆碱影响CD8+ T细胞活性 | 研究主要集中在小鼠模型上,需要进一步在人体中验证 | 研究肠道微生物群与迷走神经在肝脏肿瘤发展中的相互作用 | 肝脏肿瘤、肠道微生物群、迷走神经、CD8+ T细胞 | NA | 肝脏肿瘤 | scRNA-seq | NA | 微生物群数据 | 涉及Rag1KO小鼠和无肿瘤小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1198 | 2024-08-05 |
Timing and precision of rattlesnake spinal motoneurons are determined by the KV72/3 potassium channel
2024-01-22, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2023.11.062
PMID:38157862
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研究论文 | 该文章探讨了响尾蛇运动神经元的生理特性及其对新型行为的影响 | 研究表明,响尾蛇体部和尾部的运动神经元具有根本不同的生理特性,这对于超快速肌肉的高时间精度控制是至关重要的 | 单细胞RNA测序未能揭示KV7通道表达的差异,可能限制了对其在生理学影响中的理解 | 探讨响尾蛇运动模式发生改变的生物机制 | 响尾蛇的运动神经元及其在体部和尾部的不同特性 | 数字病理学 | NA | 补丁钳记录电生理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1199 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of the pig cecum at various developmental stages
2024-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,对不同发育阶段的猪盲肠细胞进行了全面的转录组分析 | 首次揭示了猪盲肠在不同发育阶段的单细胞基因表达图谱,并发现了多种细胞类型及其特异性基因和转录因子 | NA | 探究猪盲肠在不同发育阶段的细胞异质性和功能 | 猪盲肠在不同发育阶段的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 45,572个细胞,来自7个不同发育阶段的猪盲肠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1200 | 2024-08-05 |
Construction and validation of a mitochondria-associated genes prognostic signature and immune microenvironment characteristic of sepsis
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111275
PMID:37995567
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研究论文 | 本文研究了与脓毒症相关的线粒体基因预后模型及其免疫微环境特征 | 建立了脓毒症的线粒体预后模型,并探讨了其与免疫微环境的关系 | 尚未明确线粒体与脓毒症免疫微环境之间的所有交互机制 | 旨在构建线粒体相关基因的预后模型来预测脓毒症患者的预后 | 研究对象为脓毒症患者的临床血样和线粒体相关基因 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序 | NA | 临床血样 | 5个与脓毒症相关的线粒体基因 | NA | NA | NA | NA |