单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1284 篇文献，本页显示第 1181 - 1200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2024-08-07 |
Quercetin inhibits caspase-1-dependent macrophage pyroptosis in experimental folic acid nephropathy
2024-Jan-16, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-024-00885-2
PMID:38229085
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研究论文 | 本研究探讨了槲皮素在实验性叶酸肾病中抑制依赖于caspase-1的巨噬细胞焦亡的作用 | 首次验证了槲皮素通过下调巨噬细胞中的caspase-1来保护细胞免受焦亡的影响 | NA | 验证焦亡在实验性叶酸肾病中的重要性，并探索槲皮素对焦亡的保护作用 | 槲皮素对巨噬细胞焦亡的影响及其在叶酸肾病中的作用 | NA | 肾病 | 基因集富集分析（GSEA），加权基因共表达网络分析（WGCNA），分子对接，单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据，细胞数据 | 动物模型和RAW264.7细胞系 |
| 1182 | 2024-08-05 |
CellSTAR: a comprehensive resource for single-cell transcriptomic annotation
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad874
PMID:37855686
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研究论文 | 本研究开发了一个名为CellSTAR的综合单细胞转录组注释资源数据库 | 首次提供全面专家注释的参考数据，可用于注释数百种细胞类型，并结合数万个标记基因 | NA | 探讨细胞异质性和准确注释细胞类型的重要性 | 单细胞转录组信息和细胞类型的注释 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 包含数百种细胞类型的参考数据和数万个标记基因 |
| 1183 | 2024-08-07 |
CellCommuNet: an atlas of cell-cell communication networks from single-cell RNA sequencing of human and mouse tissues in normal and disease states
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad906
PMID:37850657
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research paper | 介绍了一个名为CellCommuNet的综合数据资源，用于探索人类和小鼠组织在正常和疾病状态下基于单细胞RNA测序数据的细胞间通信网络 | CellCommuNet提供了一个全面的平台，用于分析和比较健康与疾病状态下的细胞间通信强度和相关信号通路 | NA | 研究细胞间通信在维持细胞、器官和整个生物体生物功能及微环境稳态中的作用 | 人类和小鼠组织在正常和疾病状态下的细胞间通信网络 | digital pathology | cancer | scRNA-seq | NA | scRNA-seq data | 376个单数据集，118个疾病与正常样本的比较数据集 |
| 1184 | 2024-08-05 |
Tumor immune microenvironment-based therapies in pancreatic ductal adenocarcinoma: time to update the concept
2024-Jan-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02935-3
PMID:38167055
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综述 | 本文探讨了肿瘤免疫微环境在胰腺导管腺癌中的疗法及其最新研究进展 | 提出了通过单细胞测序技术对胰腺导管腺癌的免疫表型进行更全面的分类 | 未详细说明特定治疗对不同免疫表型患者的效果和适应性 | 增强对胰腺导管腺癌治疗中肿瘤免疫微环境的理解 | 肿瘤细胞、免疫细胞、癌症相关成纤维细胞（CAF）及细胞外基质（ECM） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 1185 | 2024-08-07 |
Saa3 promotes pro-inflammatory macrophage differentiation and contributes to sepsis-induced AKI
2024-Jan-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111417
PMID:38134592
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞RNA测序数据，探讨了脓毒症诱导的急性肾损伤中免疫反应的复杂机制，特别是识别了Saa3基因在促进炎症性巨噬细胞分化中的作用。 | 本研究首次揭示了Saa3在脓毒症诱导的急性肾损伤中的重要作用，并提出其可能作为预测标记。 | 需要进一步探索人类同源基因以验证Saa3作为预测标记的潜力。 | 探讨脓毒症诱导的急性肾损伤中免疫细胞失调的机制。 | 脓毒症诱导的急性肾损伤中的免疫反应和巨噬细胞的作用。 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 利用公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 1186 | 2024-08-07 |
PD-1 and TIGIT coexpressing CD8 + CD103 + tissue-resident memory cells in endometrial cancer as potential targets for immunotherapy
2024-Jan-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111381
PMID:38150880
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研究论文 | 本研究探讨了程序性细胞死亡蛋白1基因（PD-1）和T细胞免疫球蛋白和ITIM结构域基因（TIGIT）共表达的组织驻留记忆细胞在子宫内膜癌中的潜在免疫治疗靶点 | 本研究发现PD-1和TIGIT在组织驻留记忆细胞中共表达，并通过双重阻断PD-1和TIGIT更有效地恢复T细胞功能，增强了治疗潜力 | NA | 探索PD-1和TIGIT共表达的组织驻留记忆细胞在子宫内膜癌中的潜在免疫治疗靶点 | 子宫内膜癌中的组织驻留记忆细胞 | 免疫学 | 子宫内膜癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 1187 | 2024-08-07 |
Artesunate attenuates serum amyloid A-induced M1 macrophage differentiation through the promotion of PHGDH
2024-Jan-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111462
PMID:38159553
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研究论文 | 研究探讨了青蒿琥酯通过促进PHGDH表达减轻血清淀粉样蛋白A诱导的M1巨噬细胞分化 | 发现青蒿琥酯通过上调PHGDH表达抑制M1巨噬细胞分化和促炎细胞因子水平，从而减轻系统性红斑狼疮的疾病活动 | NA | 阐明血清淀粉样蛋白A与系统性红斑狼疮中特定免疫细胞类型的关系 | 血清淀粉样蛋白A、M1巨噬细胞、系统性红斑狼疮 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用GEO数据库中的单细胞RNA测序数据和MRL/lpr模型中的脾脏巨噬细胞 |
| 1188 | 2024-08-07 |
Computer-assisted interpretation, in-depth exploration and single cell type annotation of RNA sequence data using k-means clustering algorithm
2024-Jan-18, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2023.2300685
PMID:38235728
|
research paper | 本文提出了一种计算机辅助方法，用于对单细胞RNA测序数据进行深度探索和细胞类型注释，使用k-means聚类算法进行数据分析 | 本文引入了计算机辅助的细胞类型注释方法，减少了人工依赖，提高了结果的一致性和准确性 | NA | 开发一种自动化的方法来注释单细胞RNA测序数据中的细胞类型，并探索细胞的分子、表型和功能属性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型及其基因表达模式 | natural language processing | NA | scRNA-seq | k-means clustering | RNA sequence | 组织样本中的所有单个细胞 |
| 1189 | 2024-08-07 |
The phosphatase DUSP22 inhibits UBR2-mediated K63-ubiquitination and activation of Lck downstream of TCR signalling
2024-Jan-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44843-w
PMID:38225265
|
研究论文 | 本文研究了磷酸酶DUSP22通过抑制UBR2介导的K63泛素化和Lck激酶的激活来抑制T细胞活化的机制 | 首次揭示了DUSP22通过去磷酸化UBR2并导致其泛素化降解，从而抑制Lck的激活，进而调控T细胞活化和炎症反应 | NA | 探讨DUSP22在T细胞活化和炎症调控中的作用机制 | DUSP22、UBR2和Lck在T细胞活化中的相互作用 | 生物学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1190 | 2024-08-05 |
SORC: an integrated spatial omics resource in cancer
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad820
PMID:37811897
|
研究论文 | 本文开发了一个集成的癌症空间组学资源（SORC），用于交互式可视化和分析癌症中的空间转录组数据 | SORC整合了17种癌症的空间转录组数据，并提供了多种分析模块以满足空间转录组学分析的关键需求 | 目前的空间转录组数据主要集中在17种癌症，可能不代表所有癌症类型 | 研究肿瘤细胞与微环境之间的相互作用，以揭示癌症的复杂动态 | 手动整理的空间转录组数据和引用的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 722899个点和269个切片的数据，涉及334379个细胞和46种不同的细胞类型 |
| 1191 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomic Sequencing Reveals Tissue Architecture and Deciphers Pathological Reprogramming During Retinal Ischemia in Macaca fascicularis
2024-Jan-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.1.27
PMID:38214685
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了猕猴视网膜缺血过程中的组织结构变化和病理重编程 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究急性视网膜动脉缺血疾病的分子复杂性 | NA | 旨在理解急性视网膜动脉缺血疾病的分子机制 | 猕猴视网膜在缺血条件下的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 两例猕猴的视网膜样本 |
| 1192 | 2024-08-05 |
Alzheimer's Disease and Aging Association: Identification and Validation of Related Genes
2024, The journal of prevention of Alzheimer's disease
DOI:10.14283/jpad.2023.101
PMID:38230733
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研究论文 | 本研究旨在通过生物信息学分析识别与阿尔茨海默病相关的潜在衰老基因 | 本文创新性地结合了衰老相关基因和差异表达基因，以识别新的生物标志物和潜在药物 | 使用的数据集可能存在偏倚，结果的泛化能力需在更大样本中验证 | 研究衰老与阿尔茨海默病之间的关系，识别相关基因 | 选取与阿尔茨海默病相关的衰老基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 共计582个样本来自GSE36980和GSE5281数据集 |
| 1193 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-Seq Elucidates the Crosstalk Between Cancer Stem Cells and the Tumor Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.92185
PMID:38230205
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序阐明了肝细胞癌中癌症干细胞与肿瘤微环境之间的相互作用 | 本文创新性地揭示了癌症干细胞和肿瘤微环境中基质细胞或免疫细胞之间的相互作用机制，并建立了一种预后风险模型 | 缺乏对CSC与TME中特定细胞类型间更细致的交互作用的研究 | 探讨肝细胞癌中癌症干细胞与肿瘤微环境的相互作用及其影响机制 | 研究对象为16例肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | 机器学习算法 | 基因组数据 | 16名肝细胞癌患者的样本 |
| 1194 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing Data Analysis Unveiled HDAC1 as the Therapeutic Target for Chronic Pancreatitis
2024-Jan, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-023-00718-x
PMID:37022596
|
研究论文 | 本研究揭示了HDAC1作为慢性胰腺炎的治疗靶点 | 通过单细胞测序数据发现HDAC1的过表达，并验证其在小鼠模型中的功能 | 缺乏临床试验数据来支持HDAC1作为靶点的有效性 | 探索慢性胰腺炎的治疗生物标志物 | 主要研究特发性慢性胰腺炎患者的基因表达变化 | 数字病理学 | 胰腺炎 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 208个特发性慢性胰腺炎患者的基因 |
| 1195 | 2024-08-07 |
Whole-embryo scRNA-seq of mouse development
2024-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01633-2
PMID:38110717
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1196 | 2024-08-07 |
Exploring the resistance mechanism of triple-negative breast cancer to paclitaxel through the scRNA-seq analysis
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0297260
PMID:38227591
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探索三阴性乳腺癌对紫杉醇的耐药机制。 | 识别了与紫杉醇耐药相关的三个关键转录因子和它们的抑制剂，为临床治疗提供了新的分子基础和指导。 | 研究仅基于从GEO数据库下载的数据，可能需要进一步的实验验证。 | 揭示三阴性乳腺癌对紫杉醇的耐药机制，寻找新的治疗靶点。 | 三阴性乳腺癌细胞对紫杉醇的耐药性。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 2798个细胞 |
| 1197 | 2024-08-07 |
Characterization of the Immune Microenvironment and Identification of Biomarkers in Chronic Rhinosinusitis with Nasal Polyps Using Single-Cell RNA Sequencing and Transcriptome Analysis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S440409
PMID:38229690
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和转录组分析技术，研究慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）的免疫微环境，并鉴定相关的生物标志物 | 本研究首次整合单细胞RNA测序和全转录组测序技术，筛选并鉴定了与CRSwNP进展相关的树突状细胞（DC）相关生物标志物 | NA | 阐明慢性鼻窦炎伴鼻息肉的病理机制，并探索相关的生物标志物 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的鼻黏膜免疫防御机制 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1198 | 2024-08-05 |
SORCS2 activity in pancreatic α-cells safeguards insulin granule formation and release from glucose-stressed β-cells
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108725
PMID:38226160
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研究论文 | 研究了SORTS2在胰腺α细胞中的作用，保护胰腺β细胞在葡萄糖压力下的胰岛素颗粒形成和释放 | 首次揭示SORTS2在胰腺中的作用及其对胰腺β细胞的保护机制 | 研究仅限于SORCS2缺失小鼠，可能无法完全代表人类胰腺功能 | 探讨SORTS2在胰腺尤其是胰岛α细胞中的生理功能 | SORCS2缺失小鼠及其胰腺组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 胰腺组织 | SORCS2缺失小鼠的胰腺组织 |
| 1199 | 2024-08-05 |
Bisphenol A Analogues Induce Neuroendocrine Disruption via Gut-Brain Regulation in Zebrafish
2024-Jan-16, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.3c05282
PMID:38165294
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研究论文 | 本研究探讨了双酚A及其类似物通过肠脑调节导致神经内分泌干扰的机制 | 揭示了双酚G和双酚AF对神经内分泌系统的不同影响机制 | 尚未充分了解这些物质在更复杂生物系统中的长期影响 | 揭示双酚化合物对神经内分泌功能的影响机制 | 斑马鱼胚胎和转基因斑马鱼 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物学数据 | 斑马鱼胚胎和幼鱼，具体数量未说明 |
| 1200 | 2024-08-07 |
Single-cell insights into development of the bovine placenta†
2024-Jan-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioad123
PMID:37707543
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析（scRNA-seq）探索了牛胎盘发育的细胞和分子机制 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了牛胎盘发育过程中的细胞类型及其发育轨迹，并识别了调控胎盘发育的关键转录因子 | 研究仅限于特定发育阶段的样本，可能无法全面反映整个胎盘发育过程 | 揭示牛胎盘发育的细胞和分子机制 | 牛胎盘的细胞类型及其发育轨迹 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 17天、24天、30天和50天的牛胚胎样本，每组3-4个样本 |