单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk transcriptome analysis of R-loop score-based signature with regard to immune microenvironment, lipid metabolism and prognosis in HCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1487372
PMID:39850878
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析，构建了基于R-loop评分的特征模型，探索其在肝细胞癌免疫微环境、脂质代谢和预后中的作用 | 首次构建了基于R-loop评分的预后模型，揭示了R-loop调节因子CLTC通过调控脂质代谢促进肝癌进展的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限；样本来源和数量可能存在限制 | 探索R-loop在肝细胞癌进展中的作用机制，并构建预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, WGCNA分析, 体外实验, 体内实验 | R-loop评分模型, 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 来自GSE149614和CRA002308数据集的HCC患者单细胞数据，TCGA数据库的批量数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2025-10-06 |
ScRNA-seq unveils the functional characteristics of glioma-associated macrophages and the regulatory effects of chlorogenic acid on the immune microenvironment-a study based on mouse models and clinical practice
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494806
PMID:39867913
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质瘤相关巨噬细胞的功能特征及绿原酸对免疫微环境的调控作用 | 首次结合小鼠模型和临床实践，系统揭示绿原酸通过JAK-STAT通路调控肿瘤相关巨噬细胞功能并改善免疫微环境 | 研究样本量有限，仅包含一个临床病例，需要更大规模的临床试验验证 | 探索胶质瘤免疫微环境特征及绿原酸的免疫调节作用 | 胶质瘤模型小鼠和临床患者 | 单细胞测序分析 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, PPI网络分析, 分子对接 | 分子对接模型 | 单细胞转录组数据, 临床数据 | 模型小鼠和1例临床患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-10-06 |
CD36 restricts lipid-associated macrophages accumulation in white adipose tissues during atherogenesis
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1436865
PMID:39156133
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了CD36在动脉粥样硬化过程中调控白色脂肪组织中脂质相关巨噬细胞积累的新机制 | 首次在动脉粥样硬化模型中定义了白色脂肪组织中'不健康巨噬细胞'亚群，并发现CD36缺失通过促进LAM积累来平衡脂质代谢与炎症 | 研究基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证；单细胞测序样本量有限 | 探究CD36在动脉粥样硬化过程中对白色脂肪组织巨噬细胞异质性和功能的调控作用 | 饮食诱导的动脉粥样硬化小鼠模型及其白色脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 细胞代谢分析, 功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 动脉粥样硬化小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-06 |
BIOINFORMATICS APPLICATIONS UNDER CONDITION CONTROL: HIGH DIAGNOSTIC VALUE OF DDX47 IN REAL MEDICAL SETTINGS
2024-01-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002199
PMID:37553903
|
研究论文 | 本研究提出基于真实医疗场景的条件控制方法，发现DDX47基因在脓毒症诊断中具有重要价值 | 开发了基于真实医疗场景的条件控制方法，通过逐步放宽限制识别独特的差异基因 | 研究仅包含三个数据集，样本量有限，且缺乏标准诊断金标准 | 探索基因表达谱在脓毒症诊断中的应用价值 | 脓毒症和脓毒性休克患者 | 生物信息学 | 脓毒症 | 基因表达谱分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 三个数据集，包括GEO数据库数据和华西医院2020-2021年ICU患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-06 |
SINGLE-CELL TRANSCRIPTOME ANALYSIS IN HEALTH AND DISEASE
2024-01-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002274
PMID:37962963
|
综述 | 本文概述了单细胞转录组分析在健康和疾病研究中的应用现状 | 全面总结了单细胞转录组分析的技术优势、平台多样性和计算分析方法的发展 | 未涉及具体实验数据或案例研究，仅为方法论概述 | 探讨单细胞转录组分析在揭示健康和疾病状态下组织细胞多样性与复杂性的应用 | 各类生物组织中的单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-10-06 |
Connecting genomic results for psychiatric disorders to human brain cell types and regions reveals convergence with functional connectivity
2024-Jan-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.01.18.24301478
PMID:38410450
|
研究论文 | 通过整合基因组关联研究与单细胞转录组数据，揭示精神疾病与特定脑细胞类型和脑区的关联 | 首次利用成人全脑单细胞图谱将精神疾病基因组结果与特定脑细胞类型和脑区连接，并验证功能连接性 | 依赖人类脑图谱数据的完整性，需进一步实验验证具体机制 | 解析精神疾病的时空脑区定位和细胞类型基础 | 精神疾病（精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症）及相关认知特征 | 生物信息学 | 精神疾病 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序 | 富集分析，功能连接分析 | 基因组数据，转录组数据，fMRI影像数据 | 精神疾病患者与神经典型对照组的fMRI数据 | NA | 单细胞RNA-seq，功能磁共振成像 | NA | 成人全脑单细胞图谱 |
| 107 | 2025-10-06 |
Identifying immune signatures of sepsis to increase diagnostic accuracy in very preterm babies
2024-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44387-5
PMID:38195661
|
研究论文 | 通过多参数流式细胞术、单细胞RNA测序和血浆分析识别极早产儿败血症的免疫特征 | 发现双调蛋白在败血症期间白细胞群体中的上调，可作为即使C反应蛋白正常时仍与疾病临床体征相关的血浆分析物 | 研究样本仅限于极早产儿(<32周妊娠)，样本量相对有限 | 提高极早产儿败血症诊断准确性 | 极早产儿(<32周妊娠)的血液样本 | 数字病理学 | 败血症 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序,血浆分析 | NA | 流式细胞数据,单细胞RNA测序数据,血浆分析数据 | 极早产儿血液样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-10-06 |
Evaluation of nanoscale versus hybrid micro/nano surface topographies for endosseous implants
2024-01-01, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2023.10.030
PMID:37918471
|
研究论文 | 评估纳米级与混合微/纳米级表面形貌对骨整合过程中细胞行为的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术鉴定体内植入物表面早期细胞群，并比较纯纳米级与混合微/纳米级表面形貌的差异 | 研究主要关注短期效应（21天内），长期效果需要进一步验证 | 研究不同表面形貌对骨整合过程中细胞功能的影响 | 间充质干细胞和骨髓来源巨噬细胞 | 生物材料 | 骨科植入 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-06 |
Cardiac Development at a Single-Cell Resolution
2024, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-44087-8_14
PMID:38884716
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在哺乳动物心脏发育研究中的应用与进展 | 利用单细胞RNA测序技术首次实现了对心脏发育过程中异质性细胞群体的精细解析 | NA | 探索哺乳动物心脏发育的分子机制和细胞多样性 | 人类和小鼠的心脏发育过程 | 单细胞生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序，单细胞多组学 | NA | 转录组数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 110 | 2025-10-06 |
Single-cell Transcriptomics Reveals Activation of Macrophages in All-trans Retinoic Acid (atRA)-induced Cleft Palate
2024 Jan-Feb 01, The Journal of craniofacial surgery
IF:1.0Q3
DOI:10.1097/SCS.0000000000009782
PMID:38049149
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示全反式维甲酸诱导腭裂中巨噬细胞的激活机制 | 首次在单细胞水平系统描绘atRA诱导腭裂的细胞图谱，发现髓系细胞特别是M1样巨噬细胞的显著激活 | 研究仅针对小鼠胚胎第16.5天的腭组织，未涵盖其他发育阶段 | 探究atRA诱导腭裂的细胞分子机制 | 小鼠胚胎腭组织 | 单细胞转录组学 | 腭裂 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | atRA暴露组和正常组小鼠胚胎腭组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2025-10-06 |
The intricate cellular ecosystem of human peripheral veins as revealed by single-cell transcriptomic analysis
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0296264
PMID:38206912
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示人类外周静脉中复杂的细胞生态系统 | 首次在单细胞水平系统解析人类外周静脉的微解剖结构，发现静脉内皮细胞、平滑肌细胞和成纤维细胞的新型功能表型 | 样本量较小（仅4个非病变静脉），仅关注上肢静脉，缺乏疾病状态对照 | 解析人类外周静脉在单细胞水平的微解剖结构及其与血管壁结构、重塑过程和炎症反应的关系 | 来自器官捐献者的4个非病变人类上肢静脉（3个头静脉，1个贵要静脉） | 单细胞生物学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，组织学分析 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据，组织学图像数据 | 4个人类静脉样本，20,006个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2025-10-06 |
The BCL-2 inhibitor APG-2575 resets tumor-associated macrophages toward the M1 phenotype, promoting a favorable response to anti-PD-1 therapy via NLRP3 activation
2024-01, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-023-01112-y
PMID:38062129
|
研究论文 | 本研究揭示BCL-2抑制剂APG-2575通过激活NLRP3信号通路将肿瘤相关巨噬细胞重编程为M1表型，从而增强抗PD-1疗法的疗效 | 首次发现APG-2575能直接结合NF-κB p65激活NLRP3信号通路，介导巨噬细胞表型转化并增强抗肿瘤免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型，临床验证数据有限，需进一步人体试验确认 | 探索BCL-2抑制剂与免疫检查点抑制剂联合治疗的协同作用机制 | 同系和人源化CD34+小鼠模型及患者肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 小鼠模型和患者样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2025-10-06 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45028-1
PMID:38280868
|
研究论文 | 本研究通过基因组比对和计算结构建模系统分析了果蝇谱系特异性从头基因的起源、进化和蛋白质结构演化 | 首次结合高质量全基因组比对和计算结构建模方法，系统研究果蝇谱系特异性从头基因的蛋白质结构演化规律 | 研究主要基于计算预测和序列分析，缺乏实验验证蛋白质结构和功能 | 探究果蝇中从头基因的起源和结构演化机制 | 黑腹果蝇及其近缘种中的555个从头基因候选 | 基因组学 | NA | 全基因组比对，计算结构建模，单细胞RNA-seq，祖先序列重建 | 计算结构模型 | 基因组序列，转录组数据 | 555个从头基因候选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing analysis and multiple machine-learning models revealed the cellular crosstalk of dendritic cells and identified FABP5 and KLRB1 as novel biomarkers for psoriasis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374763
PMID:38596682
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析和多种机器学习模型揭示了树突状细胞在银屑病中的细胞相互作用，并鉴定出FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 | 首次发现树突状细胞通过CD70/CD27信号通路调控T细胞在银屑病炎症反应中的作用，并鉴定出FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探索银屑病的发病机制并识别有价值的生物标志物 | 银屑病皮肤组织、树突状细胞、T细胞、HaCaT细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞测序, 机器学习, RT-qPCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 多种机器学习模型 | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-10-06 |
Deconvolution of synovial myeloid cell subsets across pathotypes and role of COL3A1+ macrophages in rheumatoid arthritis remission
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1307748
PMID:38601143
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，鉴定滑膜髓系细胞亚群并发现COL3A1+巨噬细胞在类风湿关节炎缓解中的潜在作用 | 首次发现COL3A1+巨噬细胞这一成纤维细胞样M2亚型在髓系病理型中富集，并揭示其通过表达抗炎因子、增强黏附和形成物理屏障缓解关节炎的机制 | 研究样本量有限（81例患者），且部分功能验证仍需进一步实验确认 | 探究单核/巨噬细胞亚群在类风湿关节炎活动中的作用及特定亚型在疾病缓解中的生物学功能 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织和髓系细胞亚群 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 多色免疫荧光, 流式细胞术, 免疫组化染色, 黏附实验, RT-qPCR | Liger整合算法, 反卷积分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 流式细胞数据, 图像数据 | 81例早期关节炎队列患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell analysis of LUAD: elucidating immune cell dynamics and prognostic modeling based on exhausted CD8+ T cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366096
PMID:38596689
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析构建了肺腺癌免疫微环境图谱，并基于耗竭CD8+ T细胞建立预后模型 | 首次整合单细胞分析揭示肺腺癌免疫细胞动态特征，基于CD8_Tex-LAYN基因建立预后模型，并发现GALNT2作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限（19例患者），需要在更大队列中验证模型的普适性 | 阐明肺腺癌免疫微环境特征并建立有效的预后预测模型 | 肺腺癌患者肿瘤微环境中的免疫细胞（CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、髓系细胞等） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，RT-PCR，细胞实验 | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据，临床数据 | 19例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2025-10-06 |
Single-cell insights into development of the bovine placenta†
2024-01-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioad123
PMID:37707543
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究牛胎盘发育过程中的细胞类型和分子机制 | 首次构建了牛胚胎发育过程中胎盘细胞的数字图谱，揭示了滋养层细胞分化的轨迹和关键转录因子 | 样本数量有限（每个时间点3-4个样本），仅分析了特定发育时间点 | 探究牛胎盘发育的细胞和分子调控机制 | 牛胚胎和绒毛膜组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 第17天牛胚胎和24、30、50天绒毛膜组织，每个时间点3-4个样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 118 | 2025-10-06 |
The many faces of the megakaryocytes and their biological implications
2024-01-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000793
PMID:37910197
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序揭示的巨核细胞谱系转录异质性和功能可塑性 | 通过单细胞RNA测序技术首次系统识别巨核细胞的多个功能亚群及其组织分布特征 | NA | 探讨巨核细胞亚群的功能表型可塑性及其在健康与疾病中的作用 | 巨核细胞及其转录亚群 | 单细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2025-10-06 |
The immune landscape of fetal chorionic villous tissue in term placenta
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506305
PMID:39872537
|
研究论文 | 本研究深入表征了足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的表型和功能多样性 | 首次系统描绘足月胎盘绒毛组织的免疫景观，并揭示孕前肥胖对绒毛髓系细胞表型和功能的调控作用 | 样本来源仅限于无并发症的足月妊娠，未涵盖病理妊娠状态 | 探究足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的表型特征和功能状态 | 人类足月胎盘绒毛组织中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 妊娠相关疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, CITE-seq, 单核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 蛋白质表达数据 | 足月无并发症妊娠的绒毛组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 单细胞ATAC测序 | NA | CITE-seq（细胞表面蛋白与转录组联合测序）, snATAC-seq（单核染色质可及性测序） |
| 120 | 2025-10-06 |
A Network Medical Framework based on Inflammatory Genes to Identify Drug Candidates for Abdominal Aortic Aneurysms
2024, Current molecular pharmacology
IF:2.4Q3
|
研究论文 | 本研究基于炎症基因构建网络医学框架，识别腹主动脉瘤的潜在药物候选物 | 整合单细胞RNA测序、RNA测序和网络医学数据，开发基于网络的邻近性测量方法识别靶向SLC2A3的潜在药物 | 研究主要依赖计算模拟，缺乏实验验证 | 识别腹主动脉瘤的关键靶点和潜在治疗药物化合物 | 腹主动脉瘤和非动脉瘤对照样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,药物-靶点相互作用分析,蛋白质-蛋白质相互作用分析,分子动力学模拟 | 网络医学框架 | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,药物靶点数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |