单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-05-23 |
Chemokine receptors in primary and secondary lymphoid tissues
2024, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2023.11.003
PMID:39260934
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综述 | 本文综述了趋化因子受体在初级和次级淋巴组织中的存在和功能 | 详细讨论了常规趋化因子受体在免疫细胞中的关键作用及其在淋巴组织中的功能 | 主要关注常规趋化因子受体，对非典型趋化因子受体的讨论较少 | 探讨趋化因子受体在免疫细胞和淋巴组织中的作用 | 初级和次级淋巴组织中的免疫细胞 | 免疫学 | NA | 高维光谱流式细胞术、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 102 | 2025-05-22 |
Digital profiling of cancer transcriptomes from histology images with grouped vision attention
2024-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.28.560068
PMID:37808782
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research paper | 开发了一种基于transformer的深度学习模型，用于从组织学图像预测癌症转录组 | 首次将transformer架构应用于组织学图像，通过预训练和微调策略解决了小数据集和参数爆炸的问题 | 模型在组织水平上训练，空间基因表达模式的预测能力仍需进一步验证 | 通过深度学习从组织学图像中预测癌症转录组，以改善癌症管理和个性化治疗 | 癌症组织学图像和转录组数据 | digital pathology | cancer | 深度学习 | transformer | image | 预训练使用1,802个正常组织样本，微调和评估使用4,331个肿瘤样本，验证使用1,305个肿瘤样本 |
| 103 | 2025-05-22 |
Origin and adult renewal of the gut lacteal musculature from villus myofibroblasts
2024-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.19.523242
PMID:36712064
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道绒毛平滑肌细胞的起源和成年更新机制，以及它们与邻近乳糜管组装的关键信号通路 | 首次发现绒毛平滑肌细胞来源于上皮下成纤维体祖细胞的局部层次结构，并揭示了NOTCH3-DLL4信号轴在肌肉与乳糜管组装中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类肠道中得到验证 | 探究肠道绒毛平滑肌细胞的起源、分化机制及其在成年期的更新过程 | 小鼠肠道绒毛平滑肌细胞 | 细胞生物学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序、定量谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 104 | 2025-05-20 |
Underrepresentation of activating KIR gene expression in single-cell RNA-seq data is due to KIR gene misassignment
2024-Jan, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350590
PMID:37944995
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research paper | 该文章揭示了标准单细胞RNA测序比对流程在杀伤免疫球蛋白样受体（KIR）转录本分配上的错误倾向，导致KIR表达量化的不准确 | 指出了标准单细胞RNA测序比对流程中KIR转录本错误分配的问题，特别是激活型KIR转录本被误分类为抑制型KIR表达 | NA | 研究单细胞RNA测序比对流程中KIR转录本错误分配的问题 | 杀伤免疫球蛋白样受体（KIR）转录本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 105 | 2025-05-15 |
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.07.574209
PMID:38249519
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研究论文 | 该研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术，筛选胰腺癌表面受体靶点用于分子影像学和治疗诊断 | 提出了一种基于数据驱动选择分子靶点的新方法，并发现紧密连接蛋白claudin-4作为治疗诊断靶点 | 研究仅针对胰腺癌，未验证在其他癌症类型中的适用性 | 开发胰腺癌分子影像学和治疗诊断的新方法 | 胰腺癌表面受体靶点 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | 未明确说明样本数量 |
| 106 | 2025-05-14 |
Single-cell RNA sequencing reveals the dysfunctional characteristics of PBMCs in patients with type 2 diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1501660
PMID:39916961
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了2型糖尿病患者外周血单个核细胞的功能失调特征 | 首次利用scRNA-seq技术对T2DM患者PBMCs进行转录组分析，揭示了免疫细胞的异常功能和潜在分子机制 | 样本量较小（仅3名健康参与者和3名T2DM患者），可能影响结果的普遍性 | 探索T2DM患者外周血免疫细胞的功能异常及其分子机制 | 2型糖尿病患者和健康对照者的外周血单个核细胞（PBMCs） | digital pathology | diabetes mellitus | scRNA-seq, Ficoll密度梯度离心法 | NA | RNA-seq数据 | 3名健康参与者和3名T2DM患者 |
| 107 | 2025-05-14 |
Single-cell RNA sequencing highlights the influence of innate and adaptive immune response mechanisms in psoriatic arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1490051
PMID:40084238
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术探索了银屑病关节炎（PsA）患者与健康对照之间以及不同PsA临床表型之间的基因表达差异 | 首次在单细胞水平上比较了伴有和不伴有皮肤银屑病的PsA患者的免疫细胞基因表达谱，揭示了先天和适应性免疫反应机制的差异 | 未发现PsA-only和PsA/PsC患者之间的差异表达基因，样本量相对有限（70例患者和10例对照） | 探索PsA患者不同临床表型与免疫发病机制之间的关联 | 银屑病关节炎患者（70例）和健康对照（10例）的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），BD Rhapsody™单细胞分析系统 | 差异表达分析（DE），基因集富集分析（GSEA） | 单细胞转录组数据 | 80例（70例PsA患者和10例健康对照） |
| 108 | 2025-05-10 |
The cancer-associated fibroblasts interact with malignant T cells in mycosis fungoides and promote the disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1474564
PMID:39963655
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了蕈样肉芽肿（MF）中恶性T细胞与癌症相关成纤维细胞（CAFs）的相互作用及其在疾病进展中的作用 | 揭示了恶性T细胞从TRM主导表型向TCM主导表型的转变过程，以及CAFs通过IL-6/JAK2/STAT3/SOX4或IL-6/HIF-1α/SOX4通路促进恶性T细胞侵袭和转移的机制 | 研究样本来自晚期MF患者，可能无法完全代表早期MF的特征 | 探究蕈样肉芽肿的发病机制及肿瘤微环境在其中的作用 | 晚期蕈样肉芽肿患者及健康对照的肿瘤组织、邻近正常组织和外周血单个核细胞 | 肿瘤微环境研究 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 晚期MF患者和健康对照的肿瘤组织、邻近正常组织和PBMC样本 |
| 109 | 2025-05-08 |
A review of single-cell transcriptomics and epigenomics studies in maternal and child health
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2343276
PMID:38709139
|
review | 本文综述了单细胞转录组学和表观基因组学在母婴健康领域的研究 | 总结了16个人类和哺乳动物胎盘的单细胞图谱以及31项关于母体暴露和并发症的单细胞研究 | NA | 综述单细胞测序技术在母婴健康领域的应用 | 人类和哺乳动物胎盘以及母体暴露和并发症 | 单细胞测序 | 母婴健康相关疾病 | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 单细胞测序数据 | 16个单细胞图谱和31项单细胞研究 |
| 110 | 2025-05-08 |
Single-cell RNA sequencing and AlphaFold 3 insights into cytokine signaling and its role in uveal melanoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458041
PMID:39916959
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和AlphaFold 3技术，揭示了葡萄膜黑色素瘤（UVM）中的细胞异质性及其与细胞因子信号传导的关系，并鉴定了预后生物标志物 | 首次在UVM中构建了单细胞分辨率的细胞因子反应字典，并利用AlphaFold 3预测关键蛋白的3D结构 | 样本量相对有限，且主要依赖生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 阐明UVM的细胞异质性并鉴定预后生物标志物，为靶向治疗提供依据 | 葡萄膜黑色素瘤（UVM）的原发性和转移性肿瘤样本 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR-Cas9筛选分析、AlphaFold 3 | LASSO回归、ROC曲线分析、Kaplan-Meier生存分析 | RNA-seq数据、蛋白质结构预测数据 | TCGA-UVM和GSE84976队列中的样本 |
| 111 | 2025-05-08 |
Deciphering the role of metal ion transport-related genes in T2D pathogenesis and immune cell infiltration via scRNA-seq and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1479166
PMID:39926598
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和机器学习探索了2型糖尿病（T2D）的发病机制，特别关注免疫细胞浸润 | 结合scRNA-seq和12种机器学习算法，识别了与金属离子转运相关的关键基因，并揭示了它们与免疫细胞的关联 | 研究样本量有限，仅分析了T2D和非糖尿病患者的胰岛细胞数据 | 探索T2D的分子机制，特别是金属离子转运相关基因在疾病中的作用 | T2D和非糖尿病患者的胰岛细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | scRNA-seq, ssGSEA, PPI网络分析 | Stepglm[backward] plus GBM | RNA测序数据 | T2D和ND患者的胰岛细胞数据 |
| 112 | 2025-05-08 |
Single-cell sequencing uncovers the mechanistic role of DAPK1 in glioma and its diagnostic and prognostic implications
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1463747
PMID:39926603
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究DAPK1在胶质瘤中的机制作用及其诊断和预后意义 | 利用单细胞RNA测序数据识别与生存相关的基因簇，并开发基于DAPK1的预后模型 | DAPK1在胶质瘤中的具体机制尚未完全阐明 | 开发基于DAPK1的预后标志物以预测胶质瘤患者的预后 | 胶质瘤患者 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA-seq, 微阵列 | LASSO, 逐步回归算法 | RNA-seq数据, 微阵列数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA和GEO的胶质瘤患者数据 |
| 113 | 2025-05-08 |
Single-cell RNA sequencing revealed PPARG promoted osteosarcoma progression: based on osteoclast proliferation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506225
PMID:39936154
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究PPARG在促进骨肉瘤进展中的作用，重点关注破骨细胞增殖 | 首次在单细胞水平上识别出C2MKI67+破骨细胞亚群，并发现PPARG作为关键转录因子在破骨细胞增殖和分化中的重要作用 | 研究主要基于单细胞测序数据的分析，需要进一步的体内外实验验证 | 寻找新的骨肉瘤治疗靶点以阻止肿瘤进展和局部扩散 | 骨肉瘤患者和破骨细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RT-qPCR, CCK-8实验, 伤口愈合实验, Transwell实验 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 114 | 2025-05-08 |
Serum and tear autoantibodies from NOD and NOR mice as potential diagnostic indicators of local and systemic inflammation in Sjögren's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1516330
PMID:39936155
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研究论文 | 研究通过分析NOD和NOR小鼠的血清和泪液自身抗体，探讨其在干燥综合征（SjD）相关局部和全身炎症中的潜在诊断价值 | 首次在两种SjD小鼠模型中系统比较了血清和泪液自身抗体的差异，并发现泪液IgA同型自身抗体比IgG更具多样性 | 研究仅使用雄性小鼠模型，可能无法完全反映人类SjD的性别差异特征 | 探索干燥综合征相关自身抗体的诊断标志物 | NOD和NOR小鼠的泪腺组织、血清和泪液样本 | 自身免疫疾病研究 | 干燥综合征 | 免疫荧光、自身抗体微阵列、scRNA-Seq | NOD和NOR小鼠模型 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 两种SjD小鼠模型（具体数量未明确说明）与健康BALB/c小鼠对照 |
| 115 | 2025-05-07 |
Characterizing tumor biology and immune microenvironment in high-grade serous ovarian cancer via single-cell RNA sequencing: insights for targeted and personalized immunotherapy strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1500153
PMID:39896800
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究高级别浆液性卵巢癌的肿瘤生物学特性及免疫微环境，为靶向和个性化免疫治疗策略提供见解 | 利用单细胞RNA测序技术系统研究HGSOC的肿瘤异质性和免疫微环境，发现与不良预后相关的C2 IGF2+肿瘤细胞亚型及其与肿瘤进展的关联 | 研究依赖于公开数据库的scRNA-seq数据，可能受限于样本量和数据质量 | 揭示HGSOC进展和治疗抵抗的分子机制，开发更有效的个性化治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）的肿瘤细胞亚型及其免疫微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 |
| 116 | 2025-05-07 |
Elucidating the causal associations and mechanisms between circulating immune cells and idiopathic pulmonary fibrosis: new insights from Mendelian randomization and transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1437984
PMID:39896814
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组学分析，探讨循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及潜在生物标志物 | 结合孟德尔随机化和转录组学数据，首次系统性地研究了免疫细胞表型与IPF的因果关系，并鉴定了三个新的生物标志物 | 研究依赖于公开数据库的GWAS数据，可能存在样本选择偏倚 | 阐明循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及机制 | 循环免疫细胞表型和特发性肺纤维化患者 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 孟德尔随机化分析、转录组学分析、单细胞RNA测序 | IVW等五种孟德尔随机化方法 | 基因组关联研究数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自公开数据库的GWAS数据和IPF患者样本 |
| 117 | 2025-05-07 |
Novel pyroptosis-immune-related lncRNA signature exhibits a distinct immune cell infiltration landscape in breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522327
PMID:39906743
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研究论文 | 本研究通过分析焦亡和免疫相关的长链非编码RNA（lncRNA），构建了一个六-lncRNA特征，用于预测乳腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次构建了一个结合焦亡和免疫相关lncRNA的特征，用于预测乳腺癌预后和免疫治疗反应，并揭示了不同的免疫细胞浸润模式 | 研究依赖于TCGA数据集，需要进一步的外部验证 | 识别乳腺癌的潜在治疗靶点，并预测患者的预后和免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | Pearson相关系数、单变量Cox回归分析、LASSO方法、单细胞测序 | 六-lncRNA特征模型 | RNA-seq数据、单细胞测序数据 | TCGA数据集中的乳腺癌患者样本 |
| 118 | 2025-05-07 |
Immune regulatory genes impact the hot/cold tumor microenvironment, affecting cancer treatment and patient outcomes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382842
PMID:39911580
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研究论文 | 研究通过分析肿瘤微环境中的免疫基因，区分热/冷肿瘤，并探索其对癌症治疗和患者预后的影响 | 开发了一个框架来区分不同癌症类型中具有临床意义的免疫亚型，并确定了几个潜在靶点用于将冷肿瘤转化为热肿瘤以提高抗癌治疗效果 | 尚未就热/冷肿瘤的临床相关定义达成共识，且免疫基因对热/冷肿瘤形成的影响仍知之甚少 | 探索免疫调控基因如何影响肿瘤微环境，从而影响癌症治疗和患者预后 | 33种不同类型的癌症数据，以及胰腺腺癌临床队列 | 肿瘤免疫学 | 多种癌症（包括膀胱尿路上皮癌、胰腺腺癌和宫颈鳞状细胞癌） | CIBERSORT算法、基因集变异分析、单细胞RNA测序、多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、免疫组织化学数据 | 来自The Cancer Genome Atlas数据库的33种癌症数据，以及胰腺腺癌临床队列 |
| 119 | 2025-05-04 |
Heterogeneity and synaptic plasticity analysis of hippocampus based on db-/- mice induced diabetic encephalopathy
2024-01, Psychoneuroendocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.psyneuen.2023.106412
PMID:37898037
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析了糖尿病脑病模型中海马细胞的异质性和突触可塑性变化 | 首次在糖尿病认知障碍模型中构建了海马区单细胞转录图谱，发现了5个独特的少突胶质前体细胞亚群及其标记基因 | 研究仅基于db/db小鼠模型，结果向人类糖尿病脑病的推广需要进一步验证 | 探究长期高血糖状态下海马细胞异质性及其与认知功能障碍的关系 | db/db糖尿病小鼠模型的海马组织细胞 | 神经科学 | 糖尿病脑病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，新物体识别(NOR)行为测试 | db/db小鼠糖尿病模型 | 单细胞转录组数据 | 实验组21,379个细胞，对照组20,045个细胞 |
| 120 | 2025-05-04 |
Single-cell mitophagy patterns within the tumor microenvironment modulate intercellular communication, impacting the progression and prognosis of hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1448878
PMID:39835122
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析肝细胞癌肿瘤微环境中的线粒体自噬模式，探讨其对细胞间通讯及患者预后的影响 | 首次在单细胞水平揭示肝细胞癌肿瘤微环境中线粒体自噬的异质性模式及其与细胞通讯的关系 | 未证实线粒体自噬对免疫治疗效果的直接影响 | 探究肝细胞癌肿瘤微环境中线粒体自噬的细胞特异性模式及其临床意义 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境细胞 | 肿瘤微环境研究 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, NMF聚类, CellChat, Monocle, SCENIC | NA | 单细胞转录组数据 | 来自肝细胞癌患者的25,189个细胞 |