单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1397 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-08-04 |
Exploring the resistance mechanism of triple-negative breast cancer to paclitaxel through the scRNA-seq analysis
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0297260
PMID:38227591
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示三阴性乳腺癌对紫杉醇的耐药机制 | 利用scRNA-seq数据结合伪时间分析和SCENIC分析，首次鉴定出与紫杉醇耐药相关的三个关键转录因子（STAT1、CEBPB和IRF7）及其抑制剂作为潜在联合治疗策略 | 该研究基于公共数据库的转录组数据，缺乏实验验证；样本量较小，且未涉及临床样本验证 | 探究三阴性乳腺癌对紫杉醇化疗耐药的分子机制，寻找新的治疗靶点 | 紫杉醇处理不同时间点的三阴性乳腺癌细胞（HCC1143细胞系） | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2798个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-08-04 |
Integrative multi-omics analysis reveals a novel subtype of hepatocellular carcinoma with biological and clinical relevance
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517312
PMID:39712016
|
研究论文 | 整合多组学分析揭示肝细胞癌的一个具有生物学和临床意义的新亚型 | 通过整合多组学数据（包括bulk RNA-seq、蛋白质组学、单细胞RNA-seq、空间转录组和基因组测序）识别出与肿瘤纯度和肿瘤微环境风险相关的新的HCC亚型XPO1+上皮细胞，并通过功能富集、转录因子活性、细胞互作、药物敏感性和突变分析进行了全面验证 | 未明确提及局限性 | 构建肝细胞癌的预后风险预测模型，并识别新的亚型以改善预后评估和个性化药物治疗 | 肝细胞癌患者样本，包括实验室数据和公共队列 | 多组学分析 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序，蛋白质组分析，单细胞RNA测序，空间转录组测序，基因组测序 | 预后风险模型（基于肿瘤纯度和肿瘤微环境） | 转录组数据，蛋白质组数据，单细胞转录组数据，空间转录组数据，基因组数据，临床数据 | 来自实验室和公共队列的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq，蛋白质组学，单细胞RNA-seq，空间转录组测序，基因组测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-08-04 |
Exploring the heterogeneity of osteosarcoma cell characteristics and metabolic states and their association with clinical prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1507476
PMID:39712023
|
研究论文 | 本研究利用RNA测序和单细胞RNA测序数据，探索骨肉瘤细胞异质性和代谢状态及其与临床预后的关联 | 通过单细胞测序分析骨肉瘤细胞的代谢异质性，并结合WGCNA和风险特征模型，提供了新的预后评估和治疗靶点视角 | 研究基于公共数据库的数据，样本量有限，且未进行体外或体内实验验证 | 阐明骨肉瘤的分子机制和代谢特征，及其与患者预后的关系，为靶向治疗和预后评估提供新方法 | 骨肉瘤样本和健康对照的RNA测序数据及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 风险特征模型（基于基因表达） | 基因表达数据 | 9个样本（单细胞测序），患者数据来自多个公共数据库 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-08-04 |
Effects of PGK1 on immunoinfiltration by integrated single-cell and bulk RNA-sequencing analysis in sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1449975
PMID:39712033
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序分析，研究PGK1在脓毒症中的表达及其对免疫浸润的影响 | 首次揭示PGK1作为脓毒症的新型诊断生物标志物，并通过单细胞和批量RNA测序数据的综合分析阐明其在免疫调节中的作用 | 文章未明确提及局限性 | 探究PGK1在脓毒症中的表达水平及其与免疫细胞浸润的相关性，评估其作为诊断生物标志物的潜力 | 脓毒症患者和健康对照的血液样本及GEO数据库中的微阵列和RNA测序数据 | 基因组学 | 脓毒症 | 微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序、定量实时PCR、蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 多个数据集，具体样本数未说明 | NA | 微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-08-04 |
Innovative strategies to optimise colorectal cancer immunotherapy through molecular mechanism insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1509658
PMID:39717768
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析结直肠癌组织样本，识别关键肿瘤亚型和预后基因，构建风险评分模型以优化免疫治疗策略 | 基于单细胞RNA测序识别出与癌症进展和不良预后显著相关的C0 FXYD5+肿瘤细胞亚型，并通过体外实验验证DLX2作为潜在治疗靶点 | 样本量较小，仅来自4名患者，且未进行体内验证 | 通过分子机制分析优化结直肠癌的免疫治疗策略 | 4名结直肠癌患者的13份组织样本 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 13份组织样本（来自4名患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-08-01 |
A randomized, placebo-controlled trial of the BTK inhibitor zanubrutinib in hospitalized patients with COVID-19 respiratory distress: immune biomarker and clinical findings
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1369619
PMID:39906744
|
随机对照试验 | 评估BTK抑制剂zanubrutinib在住院COVID-19呼吸窘迫患者中的免疫生物标志物和临床结果 | 首次评估下一代BTK抑制剂zanubrutinib对COVID-19患者免疫反应和临床结局的影响，并采用单细胞转录组分析 | 样本量小，且多数患者同时接受类固醇和抗病毒治疗，可能影响结果 | 评估zanubrutinib对COVID-19呼吸窘迫患者的疗效及其对免疫应答的影响 | 住院的SARS-CoV-2感染患者（未机械通气或机械通气≤24小时） | 临床医学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 临床数据、单细胞转录组数据 | 队列1：63例（zanubrutinib组30例，安慰剂组33例）；队列2：4例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序（推测） |
| 107 | 2026-07-30 |
A pancreatic cancer organoid platform identifies an inhibitor specific to mutant KRAS
2024-01-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.11.011
PMID:38151022
|
研究论文 | 利用胰腺癌类器官平台鉴定出一种针对突变型KRAS的特异性抑制剂 | 构建了等基因小鼠胰腺类器官高通量药物筛选平台，发现佩海克西林马来酸盐可特异性抑制突变型KRAS驱动的肿瘤生长和胆固醇合成通路，并阐明其通过下调SREBP2发挥作用 | 该平台基于小鼠模型，人源类器官验证规模有限，且未深入探讨佩海克西林马来酸盐的临床转化可行性 | 开发针对胰腺导管腺癌中常见KRAS突变（G12D、G12V）的新型抑制剂 | 等基因小鼠胰腺类器官（野生型及携带PDAC驱动突变）及人源原代PDAC类器官 | 类器官药物筛选 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 超过6000种化合物筛选，涉及小鼠和人类类器官样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'文库制备 |
| 108 | 2026-07-30 |
Preparation of Healthy Single Neuron or Astrocyte Suspension from Adult Mouse Brain for RNA-seq
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3810-1_29
PMID:38630243
|
研究论文 | 描述从成年小鼠大脑制备健康单神经元或星形胶质细胞悬液用于RNA-seq的方法 | 优化蛋白酶消化脑片方法，从成年大脑获得数百万健康细胞 | NA | 开发从成年啮齿动物大脑分离健康单神经细胞的方法 | 成年小鼠大脑中的神经元和星形胶质细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠大脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-07-28 |
Isolation and Phenotypic Characterization of Tumor-Infiltrating NK Cells in Skin Carcinoma
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_512
PMID:38329617
|
研究论文 | 建立皮肤癌中肿瘤浸润NK细胞的分离与表型表征方法 | 首次对恶性黑色素瘤转移灶中的肿瘤浸润NK细胞进行单细胞RNA-seq分析，揭示其与循环NK细胞在转录程序上的显著差异以及功能特化 | 未提供具体样本量、数据验证或临床样本来源的详细描述 | 理解并可能调节皮肤癌肿瘤微环境中NK细胞的独特特征和功能，以开发更有效的免疫治疗策略 | 皮肤癌（包括恶性黑色素瘤）中的肿瘤浸润NK细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌，恶性黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 110 | 2026-07-28 |
Integration of bulk/scRNA-seq and multiple machine learning algorithms identifies PIM1 as a biomarker associated with cuproptosis and ferroptosis in abdominal aortic aneurysm
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1486209
PMID:39723205
|
研究论文 | 通过整合批量/单细胞RNA测序数据和多种机器学习算法，鉴定PIM1为腹主动脉瘤中与铜死亡和铁死亡相关的生物标志物 | 首次结合多种机器学习算法（LASSO、REF、RF和SVM）与单细胞RNA测序分析，发现PIM1作为腹主动脉瘤中铜死亡和铁死亡的新型生物标志物 | 未提及 | 通过生物信息学分析结合机器学习模型，鉴定腹主动脉瘤中与铁死亡/铜死亡相关的标志物并进行实验验证 | 来自不同小鼠模型的三个单细胞RNA测序数据集以及一个人类外周血单核细胞批量RNA测序数据集 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，RT-qPCR，蛋白质印迹 | LASSO, REF, RF, SVM | 基因表达数据 | 三个小鼠模型单细胞RNA测序数据集和一个人类PBMC批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-07-28 |
Migrasome regulator TSPAN4 shapes the suppressive tumor immune microenvironment in pan-cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1419420
PMID:39723210
|
研究论文 | 分析TSPAN4在泛癌中对肿瘤免疫微环境的抑制作用 | 首次揭示迁移体调节因子TSPAN4在泛癌中塑造抑制性肿瘤免疫微环境的作用 | 主要基于公共数据库分析，缺乏更多实验验证 | 探索TSPAN4在癌症中的作用及其与免疫抑制微环境的关系 | 多种癌症类型（泛癌） | 机器学习 | 泛癌 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据（RNA-seq和单细胞RNA-seq） | TCGA Pan-Cancer, TARGET GTEx等多个数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-07-10 |
Multi-omics and single-cell sequencing analyses reveal the potential significance of circadian pathways in cancer therapy
2024 Jan-Feb, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2023.2296668
PMID:38288973
|
研究论文 | 通过多组学和单细胞测序分析揭示昼夜节律通路在癌症治疗中的潜在重要性 | 首次系统性地在泛癌水平上分析昼夜节律相关基因（CRGs）的表达、突变、甲基化及与免疫微环境的关系，并计算昼夜节律通路评分（CRS）以评估其作为免疫治疗标志物的潜力 | 仅依赖TCGA等公共数据库数据，缺乏大规模独立验证；未深入探讨CRGs调控肿瘤微环境的具体分子机制 | 探索昼夜节律相关基因在泛癌中的表达模式、预后价值及作为免疫治疗新靶点的可能性 | 泛癌（包括KIRC等多种肿瘤类型）的肿瘤样本及肿瘤微环境细胞 | 机器学习 | 泛癌（多类型肿瘤） | 多组学分析、单细胞测序、免疫组化（IHC）、单样本基因集富集分析（ssGSEA） | NA | 基因表达数据、拷贝数变异、单核苷酸变异、甲基化数据、单细胞测序数据 | 使用TCGA数据库中多个肿瘤类型的大规模样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-07-10 |
The conserved wobble uridine tRNA thiolase Ctu1 is required for angiogenesis and embryonic development
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0315854
PMID:39705244
|
研究论文 | 研究发现保守性摆动尿苷tRNA硫醇酶Ctu1在血管生成和胚胎发育中起关键作用 | 首次在脊椎动物模型中揭示CTU1在血管生成和胚胎发育中的必要性 | 仅使用斑马鱼和人类内皮细胞模型，尚未涉及更复杂的哺乳动物模型或临床样本 | 确定Ctu1在血管生成和胚胎发育中的生物学功能 | 斑马鱼胚胎和人类内皮细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼胚胎样本和人类内皮细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达 |
| 114 | 2026-07-06 |
Designing Oligonucleotide-Based FISH Probe Sets with PaintSHOP
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3766-1_12
PMID:38502486
|
研究论文 | 介绍PaintSHOP平台用于设计基于寡核苷酸的FISH探针集 | PaintSHOP是一个用户友好的网络平台，整合了大量预发现的探针库和功能序列数据库，并提供交互式工具用于探针设计 | 文中未明确讨论局限性 | 描述PaintSHOP平台在寡核苷酸FISH探针设计中的应用方法 | DNA寡核苷酸FISH探针 | 数字病理学 | NA | 荧光原位杂交(FISH) | NA | 核酸序列 | NA | NA | 空间转录组学, 空间基因组学 | NA | NA |
| 115 | 2026-07-05 |
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12
PMID:38622400
|
研究论文 | 描述了从狼疮易感MRL/lpr小鼠中分离调节性B细胞并进行单细胞转录组分析的方法 | 首次在转录组水平上深入表征调节性B细胞，超越了表面标志物的传统方法 | 未提供实验结果的验证或大规模样本分析 | 建立调节性B细胞的分离方案以进行单细胞转录组分析，探究其在自身免疫和癌症免疫中的作用 | 从狼疮易感小鼠中分离的调节性B细胞 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病（狼疮） | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据（单细胞RNA测序） | 狼疮易感MRL/lpr小鼠（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 116 | 2026-07-01 |
Deciphering the role of CX3CL1-CX3CR1 in aortic aneurysm pathogenesis: insights from Mendelian randomization and transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1383607
PMID:38715600
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组分析揭示CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤发病机制中的作用 | 首次通过孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序技术，系统阐明CX3CL1-CX3CR1信号通路在主动脉瘤中介导内皮细胞与中间单核细胞相互作用的遗传机制 | 基于公开数据库的分析可能存在人群偏倚，且孟德尔随机化结果需进一步实验验证 | 探索炎症相关细胞因子和免疫特征与主动脉瘤的因果关系，并解析CX3CL1-CX3CR1信号通路的致病机制 | 主动脉瘤患者的血液免疫特征、主动脉组织转录组数据及单细胞测序数据 | 机器学习、数字病理学 | 主动脉瘤 | 孟德尔随机化分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、Cellchat分析 | na | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 91种循环炎症蛋白和731种免疫特征的GWAS数据，以及批量RNA测序和单细胞RNA测序的公共数据集 | na | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | na | na |
| 117 | 2026-07-01 |
Single-cell transcriptomics reveals a role for pancreatic duct cells as potential mediators of inflammation in diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381319
PMID:38742118
|
research paper | 通过单细胞转录组学揭示胰管细胞在糖尿病炎症中可能作为介质的作用 | 首次发现胰管细胞亚群在所有胰腺细胞类型中呈现独特的促炎特征，为理解胰岛炎症传播机制提供新视角 | 未提及具体局限性 | 探索暴露于炎症环境的人类胰腺细胞的细胞类型特异性分子反应 | 原代人胰腺细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本量 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 118 | 2026-07-01 |
Network-based pharmacology and UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS reveal Jinhua Qinggan granule's mechanism in reducing cellular inflammation in COVID-19
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382524
PMID:39026676
|
研究论文 | 通过网络药理学和UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS技术揭示金花清感颗粒在新冠肺炎中减轻细胞炎症的机制 | 本研究结合UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS、网络药理学和单细胞RNA测序技术，系统分析了金花清感颗粒的活性成分及其在免疫细胞调控中的作用，揭示其通过调节中性粒细胞、单核细胞等免疫细胞活性来减轻新冠肺炎炎症的机制 | NA | 探究金花清感颗粒在治疗新冠肺炎中的疗效和作用机制 | 金花清感颗粒的活性成分及其对新冠肺炎患者外周血单核细胞中免疫细胞的影响 | 网络药理学 | 新冠肺炎 | UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS, 单细胞RNA测序 | NA | 质谱数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2026-07-01 |
B-cell immune dysregulation with low soluble CD22 levels in refractory seronegative myasthenia gravis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382320
PMID:38711503
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序和血浆蛋白质组分析，揭示了难治性血清阴性重症肌无力患者中以B细胞为中心的免疫失调及可溶性CD22水平降低的免疫病理机制 | 首次利用单细胞RNA测序联合血浆蛋白质组学分析，阐明难治性血清阴性MG中B细胞免疫失调与可溶性CD22水平降低的关联，为B细胞靶向治疗提供新方向 | 样本量较小（仅30名女性参与者），且仅限于外周血分析，未涉及组织或中枢免疫器官的免疫状态验证 | 阐明血清阴性重症肌无力的免疫病理机制，探索免疫失调状态与疾病严重程度的关系 | 30名女性患者（10名健康对照、10名早发型AChR阳性MG、10名难治性早发型血清阴性MG）的外周血样本 | machine learning | geriatric disease | single-cell RNA-seq, plasma proteome analysis | NA | gene expression data, proteomic data | 30例女性患者外周血样本（每组10例，治疗前后对比） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-07-01 |
Data Analysis Pipeline for scRNA-seq Experiments to Study Early Oogenesis
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3698-5_15
PMID:38351456
|
研究论文 | 介绍用于研究早期卵子发生的单细胞RNA测序数据分析流程 | 针对生殖细胞发育过程中异步分化和高度细胞异质性的挑战，利用单细胞RNA测序技术以单细胞分辨率揭示转录调控机制 | 未明确说明局限性 | 描述如何使用单细胞RNA测序分析早期雌性生殖细胞发育 | 小鼠E11.5至E14.5卵巢中的早期生殖细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自小鼠E11.5至E14.5卵巢的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |