单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 1161 - 1180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1161 | 2024-08-04 |
The use of single-cell RNA-seq to study heterogeneity at varying levels of virus-host interactions
2024-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011898
PMID:38236826
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综述 | 本研究描述了利用单细胞RNA测序技术研究病毒感染异质性的方法。 | 提出使用单细胞RNA测序技术来研究病毒与宿主相互作用中存在的复杂性和细胞异质性。 | 强调了在不同尺度上分析单细胞RNA测序数据时的一些关键实验限制和方法选择。 | 研究病毒感染过程中的异质性及感染细胞人群的动态变化。 | 研究对象包括个别病毒粒子和感染个体之间的免疫反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成千上万的个体细胞 |
| 1162 | 2024-08-07 |
BHLHE40 drives protective polyfunctional CD4 T cell differentiation in the female reproductive tract against Chlamydia
2024-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011983
PMID:38271477
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | 首次揭示了Bhlhe40在调节CD4 T细胞分化和多功能反应中的关键作用，对抗沙眼衣原体感染 | NA | 研究Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应 | 免疫学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序结合TCR分析 | NA | RNA | Bhlhe40缺陷小鼠和野生型小鼠的CD4 T细胞 |
| 1163 | 2024-08-07 |
MAPK-activated protein kinase 2 is associated with poor prognosis of glioma patients and immune inhibition in glioma
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1307992
PMID:38322416
|
研究论文 | 本研究探讨了MAPK激活蛋白激酶2（MAPKAPK2）在胶质瘤中的表达及其对患者预后和免疫抑制的影响 | 首次揭示了MAPKAPK2在胶质瘤中的临床意义和分子功能，特别是在细胞增殖、迁移、DNA损伤修复和免疫调节中的作用 | NA | 研究MAPKAPK2在胶质瘤中的临床意义和分子功能 | MAPKAPK2在胶质瘤组织中的表达及其对患者预后和免疫抑制的影响 | 数字病理学 | 脑瘤 | 免疫组织化学、转录组测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 组织样本、RNA序列 | 使用了来自TCGA和CGGA的数据，具体样本数量未详细说明 |
| 1164 | 2024-08-07 |
Development and Validation of a Novel Nomogram Integrated with Hypoxic and Lactate Metabolic Characteristics for Prognosis Prediction in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S446313
PMID:38333220
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种新型诺模图，该诺模图整合了缺氧和乳酸代谢特征，用于预测肝细胞癌的预后 | 本研究创新性地构建了一个与缺氧和乳酸代谢相关的预后模型（HLPM），并开发了一个整合HLPM和临床特征的诺模图，用于肝细胞癌的预后预测 | NA | 旨在构建一个与缺氧和乳酸代谢相关的预后模型，以评估肝细胞癌患者的生存和治疗反应，并开发一个整合这些特征的诺模图用于预后预测 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 诺模图 | 组织样本 | 14对组织样本和单细胞RNA测序数据集 |
| 1165 | 2024-08-05 |
The unfolded protein response pathway as a possible link in the pathogenesis of COVID-19 and sepsis
2024-Jan-08, Archives of virology
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s00705-023-05948-7
PMID:38191819
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研究论文 | 本研究揭示了在单细胞水平上COVID-19和脓毒症的发病机制中未折叠蛋白反应（UPR）通路的重要性 | 提供了COVID-19与脓毒症之间的共同发病机制的新分子视角 | 未在研究中提及具体的生物标志物或临床数据的长时间追踪 | 探讨COVID-19与脓毒症之间的潜在联系及其共同的发病机制 | COVID-19和脓毒症病例的单细胞RNA-seq数据及转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 1166 | 2024-08-07 |
The Gut Microbiome Controls Liver Tumors via the Vagus Nerve
2024-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.23.576951
PMID:38328040
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研究论文 | 本文探讨了肠道微生物群通过迷走神经影响肝脏肿瘤的机制 | 首次揭示肠道微生物群通过迷走神经调节肝脏肿瘤的机制，并发现迷走神经通过乙酰胆碱影响CD8+ T细胞活性 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人体中验证 | 研究肠道微生物群与迷走神经在肝脏肿瘤发展中的相互作用 | 肝脏肿瘤、肠道微生物群、迷走神经、CD8+ T细胞 | NA | 肝脏肿瘤 | scRNA-seq | NA | 微生物群数据 | 涉及Rag1KO小鼠和无肿瘤小鼠 |
| 1167 | 2024-08-05 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576260
PMID:38328172
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞。 | 创新之处在于应用DEGAS工具，将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据上，以识别为2型糖尿病病理提供关键的β细胞亚群。 | 本研究没有涉及与其他潜在影响因素的交互作用。 | 本研究旨在优先识别与疾病相关的β细胞亚群，以更好理解2型糖尿病的发病机制。 | 研究对象为与2型糖尿病和肥胖相关的不同β细胞亚群。 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq | 深度迁移学习模型 | 基因表达数据 | 涉及来自健康和2型糖尿病供体的人类胰腺切片 |
| 1168 | 2024-08-05 |
Timing and precision of rattlesnake spinal motoneurons are determined by the KV72/3 potassium channel
2024-01-22, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2023.11.062
PMID:38157862
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研究论文 | 该文章探讨了响尾蛇运动神经元的生理特性及其对新型行为的影响 | 研究表明，响尾蛇体部和尾部的运动神经元具有根本不同的生理特性，这对于超快速肌肉的高时间精度控制是至关重要的 | 单细胞RNA测序未能揭示KV7通道表达的差异，可能限制了对其在生理学影响中的理解 | 探讨响尾蛇运动模式发生改变的生物机制 | 响尾蛇的运动神经元及其在体部和尾部的不同特性 | 数字病理学 | NA | 补丁钳记录电生理学 | NA | NA | NA |
| 1169 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of the pig cecum at various developmental stages
2024-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对不同发育阶段的猪盲肠细胞进行了全面的转录组分析 | 首次揭示了猪盲肠在不同发育阶段的单细胞基因表达图谱，并发现了多种细胞类型及其特异性基因和转录因子 | NA | 探究猪盲肠在不同发育阶段的细胞异质性和功能 | 猪盲肠在不同发育阶段的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 45,572个细胞，来自7个不同发育阶段的猪盲肠样本 |
| 1170 | 2024-08-05 |
Construction and validation of a mitochondria-associated genes prognostic signature and immune microenvironment characteristic of sepsis
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111275
PMID:37995567
|
研究论文 | 本文研究了与脓毒症相关的线粒体基因预后模型及其免疫微环境特征 | 建立了脓毒症的线粒体预后模型，并探讨了其与免疫微环境的关系 | 尚未明确线粒体与脓毒症免疫微环境之间的所有交互机制 | 旨在构建线粒体相关基因的预后模型来预测脓毒症患者的预后 | 研究对象为脓毒症患者的临床血样和线粒体相关基因 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序 | NA | 临床血样 | 5个与脓毒症相关的线粒体基因 |
| 1171 | 2024-08-05 |
Identifying the critical oncogenic mechanism of LDHA based on a prognostic model of T-cell synthetic drivers
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111265
PMID:38000233
|
研究论文 | 本研究揭示了与T细胞合成驱动因子相关的预后模型在肺腺癌中的重要性 | 首次展示了LDHA在肺腺癌恶性进展中的关键作用，并开发了一个相关的预后模型 | 缺乏对其他类型肿瘤的综合分析，可能对广泛应用有所限制 | 改善肺腺癌的免疫疗法效果 | 关注肺腺癌患者的T细胞合成驱动因子 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | Lasso Cox回归模型 | 临床数据 | NA |
| 1172 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing indicates cordycepin remodels the tumor immune microenvironment to enhance TIGIT blockade's anti-tumor effect in colon cancer
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111268
PMID:37992442
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了虫草素与TIGIT阻断疗法联合使用在结肠癌中的抗肿瘤效果及其对肿瘤免疫微环境的重组作用 | 发现虫草素治疗能显著增强Cd226基因的表达，从而提高TIGIT阻断疗法的效果，并通过单细胞RNA测序证实了这一联合疗法在肿瘤免疫微环境中对NK细胞和CD8 T细胞的积极影响 | NA | 研究虫草素与TIGIT阻断疗法联合使用在结肠癌中的抗肿瘤效果 | 结肠癌肿瘤模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了MC38肿瘤模型中的免疫细胞进行分析 |
| 1173 | 2024-08-07 |
Transcriptomic and genomic profiling of multiple primary colorectal cancers reveals intratumor heterogeneity and a distinct immune microenvironment
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111276
PMID:38016348
|
研究论文 | 本研究报告了单一患者多发性原发性结直肠癌（MPCC）不同肿瘤病变的肿瘤内基因组和免疫学异质性 | 首次通过全外显子测序和单细胞RNA测序揭示了MPCC中肿瘤病变的分子和微环境特征，特别是发现了横结肠肿瘤病变中黏膜相关不变T细胞（MAIT）的富集 | 研究样本量较小，仅基于单一患者的数据，可能限制了结果的普遍性 | 探索MPCC患者不同原发部位肿瘤病变的分子和微环境特征 | 来自同一72岁男性MPCC患者的三个肿瘤病变，分别位于横结肠肝曲、乙状结肠和直肠 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 全外显子测序（WES）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、转录组数据 | 三个肿瘤样本 |
| 1174 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing in double-hit lymphoma: IMPDH2 induces the progression of lymphoma by activating the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway" [Int. Immunopharmacol. 125(Part A) (2023) 111125]
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111292
PMID:38042635
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1175 | 2024-08-07 |
Inferring Gene Regulatory Networks and Predicting the Effect of Gene Perturbations via IQCELL
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2022_465
PMID:36790623
|
研究论文 | IQCELL平台从单细胞RNA测序数据中推断布尔基因调控网络，并模拟正常和扰动条件下的网络行为 | 开发了IQCELL平台，能够从单细胞RNA测序数据中推断布尔基因调控网络，并模拟其在正常和扰动条件下的行为 | NA | 提供使用IQCELL平台从原始数据集推断基因调控网络的详细指南 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 布尔网络 | RNA测序数据 | NA |
| 1176 | 2024-08-07 |
Single-Cell mRNA-sncRNA Co-sequencing of Preimplantation Embryos
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_487
PMID:37278916
|
研究论文 | 本文介绍了一种方法，通过在同一胚胎细胞上同时进行单细胞RNA测序（Smart-Seq2）和单细胞小非编码RNA测序（Small-Seq），来阐明胚胎的细胞动力学 | 本文创新地结合了单细胞RNA测序和小非编码RNA测序技术，以更全面地研究胚胎细胞的多样性和异质性 | NA | 研究胚胎细胞的分子机制和细胞动力学 | 胚胎细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（Smart-Seq2）和小非编码RNA测序（Small-Seq） | NA | RNA | NA |
| 1177 | 2024-08-07 |
Evaluation of Stem-Cell Embryo Models by Integration with a Human Embryo Single-Cell Transcriptome Atlas
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_492
PMID:37351839
|
研究论文 | 本文通过整合人类胚胎单细胞转录组图谱，评估了干细胞胚胎模型的转录组景观 | 利用单细胞RNA测序技术，实现了对早期胚胎分子过程的深入理解，并提供了评估早期胚胎细胞组成的手段 | 不同实验室和不同技术获取的单细胞数据集之间的比较存在挑战 | 通过比较分析胚胎的转录组景观，以更好地理解和改进基于干细胞的胚胎模型 | 人类囊胚模型（blastoids）与人类胚胎数据集及二维体外早期发育模型系统的整合分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 1178 | 2024-08-05 |
The molecular mechanism of "Dahuang-Shengjiang-Banxia decoction" in the treatment of diabetic kidney disease was verified based on network pharmacology and molecular docking
2024-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24776
PMID:38312712
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研究论文 | 探索大黄生姜半夏汤在糖尿病肾病中的分子机制 | 利用网络药理学和分子对接技术，揭示了大黄生姜半夏汤对糖尿病肾病的多成分、多途径和多靶点效应 | 未提及具体的临床试验数据支持所述结果 | 研究大黄生姜半夏汤治疗糖尿病肾病的分子机制 | 大黄生姜半夏汤及其在糖尿病肾病中的有效成分和靶点 | 数字药理学 | 糖尿病肾病 | 网络药理学、分子对接 | NA | 靶点数据、成分数据 | 共筛选出177种大黄生姜半夏汤成分和2906种糖尿病肾病靶点 |
| 1179 | 2024-08-07 |
Taste receptor type 1 member 3 is required for the fertility of male mice
2024-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24577
PMID:38312691
|
research paper | 本文研究了味觉受体类型1成员3（TAS1R3）在雄性小鼠生育中的作用 | 首次揭示了TAS1R3通过PKA/CREB/StAR信号通路在雄性生育中的关键作用 | NA | 探究TAS1R3对雄性小鼠生殖功能的影响 | 野生型和敲除（KO）小鼠 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型和敲除小鼠 |
| 1180 | 2024-08-05 |
Cebp1 and Cebpβ transcriptional axis controls eosinophilopoiesis in zebrafish
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45029-0
PMID:38280871
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研究论文 | 本研究分析了斑马鱼中嗜酸性粒细胞的分化、分布和调节 | 建立了一个特异性标记嗜酸性粒细胞谱系的斑马鱼报告线，并揭示了Cebp1和Cebpβ转录轴在嗜酸性粒细胞分化中的作用 | 未明确提到本研究的限制 | 研究嗜酸性粒细胞的发育模式和调节机制 | 斑马鱼嗜酸性粒细胞谱系及其发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了特异性标记的嗜酸性粒细胞谱系细胞 |