单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 1141 - 1160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2024-08-04 |
LCP1 knockdown in monocyte-derived macrophages: mitigating ischemic brain injury and shaping immune cell signaling and metabolism
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.88678
PMID:38164159
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研究论文 | 本研究探讨了LCP1在单核细胞来源的巨噬细胞中对缺血性脑损伤的影响 | 研究首次揭示了LCP1在缺血性脑损伤中的作用，并阐明了其对免疫细胞信号和代谢的调节机制 | 尚不清楚LCP1在缺血性中风中作用的完整机制以及临床应用的可行性 | 旨在深入理解LCP1在缺血性脑伤害和免疫反应中的功能 | 研究对象为单核细胞来源的巨噬细胞及其对缺血性脑损伤的影响 | 数字病理学 | 缺血性中风 | CyTOF 技术 | 小鼠模型 | 单细胞测序数据 | 小鼠样本数量未知 |
| 1142 | 2024-08-04 |
Palmitoylation of PKCδ by ZDHHC5 in hypothalamic microglia presents as a therapeutic target for fatty liver disease
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.89602
PMID:38250049
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研究论文 | 本研究发现PKCδ的棕榈酰化在下丘脑小胶质细胞中作为脂肪肝疾病的治疗靶点 | 首次揭示了抗疟药物阿莫西林通过抑制小胶质细胞的活化，改善脂质代谢，并确定了PKCδ作为直接靶 alvo | 该研究主要在小鼠模型中进行，临床应用的有效性和安全性尚需进一步验证 | 探讨下丘脑小胶质细胞中PKCδ的棕榈酰化在脂肪肝疾病中的作用 | 高脂饮食诱导的小鼠及人类脑组织样本 | 数字病理学 | 脂肪肝疾病 | 生物素标记化学探针 | NA | 组织样本 | 高脂饮食诱导的小鼠和人类脑组织样本 |
| 1143 | 2024-08-07 |
Reciprocal interactions between malignant cells and macrophages enhance cancer stemness and M2 polarization in HBV-associated hepatocellular carcinoma
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.87962
PMID:38169544
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了HBV相关肝细胞癌患者的肿瘤微环境，揭示了恶性细胞与巨噬细胞之间的相互作用如何增强癌症干细胞特性和M2极化 | 首次详细描述了HBV相关肝细胞癌中恶性细胞与巨噬细胞之间的相互作用，以及这种作用如何影响癌症干细胞特性和M2极化 | 研究仅基于九名患者的样本，可能存在样本量较小的问题 | 探讨肿瘤微环境中恶性细胞与巨噬细胞的相互作用对癌症干细胞特性和M2极化的影响 | HBV相关肝细胞癌患者的恶性细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 九名HBV相关肝细胞癌患者 |
| 1144 | 2024-08-07 |
Exosomes derived from CD271+CD56+ bone marrow mesenchymal stem cell subpopoulation identified by single-cell RNA sequencing promote axon regeneration after spinal cord injury
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.89008
PMID:38169566
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现了一种特殊的骨髓间充质干细胞亚群，该亚群能够促进脊髓损伤后的轴突再生，并探讨了其治疗效果及机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术发现了一种能够促进脊髓损伤后轴突再生的骨髓间充质干细胞亚群，并开发了一种持续释放系统的治疗方法 | NA | 探索能够增强脊髓损伤后轴突再生的途径 | 骨髓间充质干细胞亚群及其衍生的外泌体在脊髓损伤后的治疗效果 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1145 | 2024-08-07 |
Comprehensive characterization of early-programmed tumor microenvironment by tumor-associated macrophages reveals galectin-1 as an immune modulatory target in breast cancer
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.88917
PMID:38169569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在早期肿瘤发展中对肿瘤微环境（TME）的调控作用，并发现Galectin-1作为免疫调节靶点 | 首次揭示了TAMs在早期肿瘤发展中对TME的全面调控作用，并确定了Galectin-1作为关键分子因子 | NA | 研究TAMs在早期肿瘤发展中对TME的调控作用及关键分子因子 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、肿瘤微环境（TME）、Galectin-1 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1146 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomics develops a robust neuroendocrine cell-intrinsic signature to predict prostate cancer progression
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.92336
PMID:38250042
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组学数据，开发了一种稳健的神经内分泌细胞内在特征，用于预测前列腺癌的进展 | 开发了一种集成分析流程，识别了762个高质量的神经内分泌标记物，并创建了一个名为NEPAL的R包，用于预测神经内分泌前列腺癌的风险评分 | NA | 精确识别神经内分泌前列腺癌细胞，为研究和临床应用提供重要意义 | 神经内分泌前列腺癌细胞及其在前列腺癌进展中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 共包含210,879个单细胞，包括66个肿瘤样本 |
| 1147 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals S100a9hi macrophages promote the transition from acute inflammation to fibrotic remodeling after myocardial ischemia‒reperfusion
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.91180
PMID:38323308
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和流式细胞术探讨了心肌缺血再灌注后巨噬细胞亚型及其在炎症和纤维化过程中的作用 | 首次鉴定出一种独特的S100a9巨噬细胞亚型，该亚型参与急性炎症和纤维化过程，并揭示了其在心肌缺血再灌注后的作用机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类中验证这些发现 | 探讨心肌缺血再灌注后巨噬细胞的异质性和转化机制 | 心肌缺血再灌注后的巨噬细胞及其在炎症和纤维化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用S100a9小鼠建立心肌缺血再灌注模型，并进行了骨髓来源的巨噬细胞再灌注实验 |
| 1148 | 2024-08-07 |
Tumor cell senescence-induced macrophage CD73 expression is a critical metabolic immune checkpoint in the aging tumor microenvironment
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.91119
PMID:38323313
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研究论文 | 本研究探讨了衰老细胞在肿瘤微环境中的代谢重塑作用，特别是肿瘤细胞诱导的肿瘤相关巨噬细胞CD73上调对腺苷积累的影响 | 首次揭示了衰老肿瘤微环境的代谢景观，特别是肿瘤细胞诱导的肿瘤相关巨噬细胞CD73上调对腺苷积累的影响 | NA | 探索从代谢角度增强衰老细胞诱导的抗肿瘤免疫的精确靶点 | 衰老细胞在肿瘤微环境中的代谢重塑作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 流式细胞术, 免疫荧光染色, 单细胞转录组测序 | NA | 肿瘤间质液, 临床样本 | 使用8 Gy×3放射治疗或顺铂化疗诱导的衰老模型, 以及10 Gy照射或顺铂处理的模型 |
| 1149 | 2024-08-07 |
Patterning ganglionic eminences in developing human brain organoids using a morphogen-gradient-inducing device
2024-Jan-22, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100689
PMID:38228151
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研究论文 | 本文开发了一种利用聚二甲基硅氧烷装置生成持续化学梯度的方法，用于制备具有空间模式的大脑类器官，称为形态素梯度诱导的大脑类器官（MIBOs） | MIBOs能够在体外复制早期神经发育中的背腹模式，并通过单细胞RNA测序揭示了不同类型的神经元 | NA | 建立更精确的体外大脑发育模型 | 大脑类器官及其在神经发育和疾病模型中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | MIBOs培养时间长达5.5个月 |
| 1150 | 2024-08-07 |
[Research Progress in the Molecular Regulatory Mechanisms of Alveolar Bone Restoration]
2024-Jan-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20240160501
PMID:38322519
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研究论文 | 本文综述了牙槽骨修复的分子调控机制的研究进展 | 探讨了Notch、Wnt、Toll样受体（TLR）和核因子-κB（NF-κB）等多种信号通路在牙槽骨修复中的作用 | 目前研究尚未构建成熟的牙槽骨修复分子调控网络 | 深入理解牙槽骨修复的分子调控机制，探索新的治疗靶点 | 牙槽骨、成骨细胞、破骨细胞、牙周韧带细胞等多种细胞类型及其信号通路 | NA | 口腔炎症疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | NA | 转录组 | NA |
| 1151 | 2024-08-07 |
Human iPSC modeling recapitulates in vivo sympathoadrenal development and reveals an aberrant developmental subpopulation in familial neuroblastoma
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108096
PMID:38222111
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研究论文 | 本文通过人类多能干细胞和单细胞RNA测序技术，重现了交感肾上腺系的正常发育过程，并识别出与家族性神经母细胞瘤相关的异常发育亚群 | 开发了一种新的分化模型，用于重现交感肾上腺系的正常发育过程，并利用单细胞RNA测序技术揭示了分子事件 | NA | 研究神经嵴相关疾病如儿童癌症神经母细胞瘤的早期破坏事件 | 人类多能干细胞及其在交感肾上腺系发育中的应用 | 数字病理学 | 儿童癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自携带生殖系激活突变的患者来源的iPSC细胞 |
| 1152 | 2024-08-07 |
In-depth transcriptomic analysis of Anopheles gambiae hemocytes uncovers novel genes and the oenocytoid developmental lineage
2024-Jan-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-09986-6
PMID:38243165
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research paper | 本研究通过大规模RNA测序和组装，构建了成年雌性A. gambiae蚊子的血细胞转录组，发现了大量新的基因和转录本，并重新定义了血细胞的分化路径 | 本研究首次构建了详细的血细胞转录组，发现了大量新的基因和转录本，为低丰度细胞的单细胞转录组数据分析提供了全面的参考转录本 | NA | 研究蚊子血细胞的转录组，揭示血细胞发育和功能的新方面 | 成年雌性A. gambiae蚊子的血细胞 | digital pathology | NA | RNA sequencing | NA | RNA | 约24亿个短Illumina高质量读取和约940万个长PacBio高质量读取 |
| 1153 | 2024-08-07 |
PancrESS - a meta-analysis resource for understanding cell-type specific expression in the human pancreas
2024-Jan-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-09964-y
PMID:38238687
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meta-analysis | 本文通过分析胰腺单细胞RNA测序数据，提供了一个数据库和工具，用于理解人类胰腺中细胞类型特异性表达 | 本文介绍了一个多功能工具，该工具可自由获取为R包，并允许集成到现有工作流程中，且适用于其他生物系统 | NA | 理解人类胰腺中细胞类型特异性的转录程序，以开发胰腺疾病的疗法 | 人类胰腺中的细胞类型特异性表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1154 | 2024-08-04 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal a Cancer-Associated Fibroblast Subset in HNSCC That Restricts Infiltration and Antitumor Activity of CD8+ T Cells
2024-01-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1448
PMID:37930937
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序揭示了一种与肿瘤免疫逃逸相关的癌相关成纤维细胞亚群 | 该研究首次识别了高表达MHC-I和Galectin-9的癌相关成纤维细胞亚群，并探讨了它们对CD8+ T细胞浸润和功能的抑制作用 | 本研究仅通过五对肿瘤及相邻组织进行分析，样本数量较少，可能影响结果的普遍适用性 | 阐明调节HNSCC肿瘤微环境中CD8+ T细胞浸润和功能障碍的关键机制 | 研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本及其相邻组织 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 五对肿瘤及相邻组织样本 |
| 1155 | 2024-08-04 |
Integration of Pan-Cancer Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals Stromal Cell Features and Therapeutic Targets in Tumor Microenvironment
2024-01-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1418
PMID:38225927
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤微环境中基质细胞的特征及治疗靶点 | 首次进行泛癌症分析，识别了39种基质亚群并探讨其功能特征与治疗相关性 | 分析仅限于258名患者，可能无法代表所有癌症类型的基质细胞特征 | 设计针对基质细胞的抗肿瘤策略 | 214,972个非免疫基质细胞及来自16种癌症类型的患者样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 258名患者的样本和16名患者的空间转录组数据 |
| 1156 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immune microenvironment landscape of osteosarcoma before and after chemotherapy
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23601
PMID:38332885
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了化疗前后骨肉瘤患者的免疫微环境变化 | 首次详细描述了化疗对骨肉瘤免疫微环境的具体影响，包括免疫细胞组成的变化及其功能调整 | 研究样本量较小，且仅包括化疗前后的骨肉瘤组织，可能影响结果的普遍性 | 探讨化疗对骨肉瘤免疫微环境的影响及其机制 | 骨肉瘤患者的免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6名未接受化疗的骨肉瘤患者和7名接受化疗的骨肉瘤患者的组织样本 |
| 1157 | 2024-08-07 |
Multiscale spatial mapping of cell populations across anatomical sites in healthy human skin and basal cell carcinoma
2024-Jan-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313326120
PMID:38165934
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研究论文 | 本文创建了一个多尺度的健康皮肤和基底细胞癌（BCC）空间图谱，结合了光学相干断层扫描、单细胞RNA测序、空间全局转录组分析和原位测序技术，揭示了不同细胞群在特定组织环境中的定位。 | 本文首次通过多尺度空间图谱揭示了健康皮肤和基底细胞癌中细胞群的定位及其与组织环境的关系，特别是发现了与毛囊相关的细胞群在癌症中的扩张。 | NA | 旨在深入理解人体皮肤细胞在不同解剖部位和肿瘤形成中的差异。 | 健康人体皮肤和基底细胞癌中的细胞群及其空间分布。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 光学相干断层扫描、单细胞RNA测序、空间全局转录组分析、原位测序 | NA | 图像、基因序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1158 | 2024-08-04 |
Single-cell analysis reveals the stromal dynamics and tumor-specific characteristics in the microenvironment of ovarian cancer
2024-01-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05733-x
PMID:38182756
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研究论文 | 本研究揭示了卵巢癌微环境中的基质动态和肿瘤特异性特征 | 通过单细胞转录组学分析，识别了高基质和低基质肿瘤中免疫细胞和非免疫细胞的独特转录组景观 | 样本量较小，仅包括20个数据集 | 研究高级别浆液性卵巢癌微环境中基质细胞的作用及其与免疫细胞的相互作用 | 卵巢癌（HGSOC）的微环境中的基质细胞亚型及其相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 20个样本 |
| 1159 | 2024-08-04 |
Spatial Omics Driven Crossmodal Pretraining Applied to Graph-based Deep Learning for Cancer Pathology Analysis
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160300
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研究论文 | 该文章探讨了利用空间组学数据与对比跨模态预训练机制相结合，提高基于图的深度学习模型对癌症病理分析的提取能力 | 将空间转录组学数据与图形化深度学习结合的对比跨模态预训练机制，展示了对形态和分子层面理解的提升 | 未提及具体的局限性 | 提高用于癌症病理分析的图基深度学习模型的性能 | 癌症病理图像中的形态和分子信息 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | 图形神经网络 | 图像和转录组数据 | 具体样本数量未明确提供 |
| 1160 | 2024-08-04 |
Pan-cancer and single-cell analysis reveal THRAP3 as a prognostic and immunological biomarker for multiple cancer types
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1277541
PMID:38333620
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研究论文 | 本研究揭示了THRAP3在多种癌症中的预后和免疫学标志物的潜力 | 首次全面分析了THRAP3在泛癌症中的作用，并验证了其在肺癌中的表达水平 | THRAP3的低表达在肺鳞状细胞癌中未得到详细探讨 | 探讨THRAP3在多种癌症中的生物学活性及其作为预后标志物的有效性 | 研究了THRAP3在肺癌及其他多种癌症中的表达和预后关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组化(IHC)和单细胞测序(ScRNA-seq) | NA | 生物信息学数据库数据 | 在研究中利用了多种癌症类型的样本，具体样本数量未明示 |