单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 1121 - 1140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2024-08-07 |
High migratory activity of dermal sheath cup cells associated with the clinical efficacy of autologous cell-based therapy for pattern hair loss
2024-Jan, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.11.003
PMID:38016881
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研究论文 | 本文研究了真皮鞘杯细胞（DSC）在自体细胞疗法中治疗男性及女性脱发的效果及其机制 | 首次揭示了ITGA6阳性DSC细胞的高迁移活性可能通过促进细胞迁移到附近的毛囊来增强细胞疗法的效果 | NA | 探究DSC细胞在细胞疗法中的有效性及其作用机制 | DSC细胞的基因表达及其在细胞疗法中的效果 | NA | 脱发 | bulk转录组分析、定量聚合酶链反应、单细胞转录组分析、活细胞成像结合免疫染色 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | NA |
| 1122 | 2024-08-07 |
Widespread monoclonal IgE antibody convergence to an immunodominant, proanaphylactic Ara h 2 epitope in peanut allergy
2024-01, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.08.035
PMID:37748654
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了花生过敏中人类单克隆IgE抗体的序列、亲和力、克隆性和功能特性 | 发现了IgE单克隆抗体的显著趋同进化现象，并揭示了主要过敏原蛋白上的免疫优势表位 | NA | 定义花生过敏中人类单克隆IgE抗体的序列、亲和力、克隆性和功能特性 | 花生过敏患者的单克隆IgE抗体 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自不同年龄、性别、种族和地理位置的过敏个体样本 |
| 1123 | 2024-08-04 |
BACH1 promotes tissue necrosis and Mycobacterium tuberculosis susceptibility
2024-Jan, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01523-7
PMID:38066332
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研究论文 | 本文研究了转录因子BACH1在结核分枝杆菌感染中的作用及其对组织坏死的促进作用 | 该研究首次揭示了BACH1作为细胞和组织坏死及宿主对结核分枝杆菌感染抵抗力的关键调节因子 | 本研究主要基于动物模型，可能无法完全反映人类的情况 | 探索BACH1在结核分枝杆菌感染中的作用及其对宿主抵抗力的影响 | 研究对象为感染结核分枝杆菌的小鼠模型 | 数字病理学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 感染结核分枝杆菌的小鼠样本 |
| 1124 | 2024-08-07 |
Data Analysis Pipeline for scRNA-seq Experiments to Study Early Oogenesis
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3698-5_15
PMID:38351456
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研究论文 | 本文介绍了一种用于分析早期卵母细胞发育的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析流程 | 通过使用scRNA-seq技术，能够在单细胞分辨率下解析卵母细胞发育的转录组，克服了传统批量RNA测序中细胞异步分化和高细胞异质性的挑战 | NA | 旨在揭示调控配子发生过程中细胞和分子机制的转录调控机制 | 早期卵母细胞发育的转录组分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 从E11.5到E14.5的小鼠卵巢中生成的scRNA-seq数据 |
| 1125 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals colonic immune perturbations during amyloid-β driven Alzheimer's disease in mice
2024-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.27.573841
PMID:38352325
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研究论文 | 这篇论文揭示了在阿尔茨海默病小鼠模型中，肠道免疫扰动的单细胞转录组学研究 | 文章首次揭示了阿尔茨海默病与肠道免疫机制之间的关联，特别是CXCR4抗体分泌细胞的显著减少 | 该研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的免疫机制 | 研究肠-脑轴在阿尔茨海默病中的免疫机制 | 使用5XFAD阿米洛β小鼠模型研究肠道免疫活动 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用5XFAD小鼠模型进行实验，样本数量未具体说明 |
| 1126 | 2024-08-07 |
Toward the Identifiability of Comparative Deep Generative Models
2024-Jan-29, ArXiv
PMID:38351930
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研究论文 | 本文提出了一种针对比较深度生成模型（DGMs）的可识别性理论，通过扩展非线性独立成分分析领域的最新进展，展示了在混合函数为分段仿射（如由ReLU神经网络参数化）时模型的可识别性，并探讨了模型误指定的影响。 | 本文通过理论分析和实验验证，提出了一种新的方法来提高比较DGMs的可识别性，特别是在处理多个数据源时通过多目标优化和约束优化调整超参数。 | 文章指出，现有的比较DGMs方法通常依赖于没有理论基础的临时正则化方案，且在实际应用中，DGMs自然推断可解释和模块化的潜在表示是一个问题。 | 研究旨在提高比较深度生成模型的可识别性和实用性。 | 研究对象是比较深度生成模型及其在不同数据集比较中的应用。 | 机器学习 | NA | 深度生成模型（DGMs） | ReLU神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 文章未具体提及样本数量 |
| 1127 | 2024-08-04 |
scCorrector: a robust method for integrating multi-study single-cell data
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad525
PMID:38271483
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研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器的模型scCorrector，用于整合来自不同研究的单细胞数据 | scCorrector通过研究特异性自适应归一化来优化不同研究的单细胞数据整合，且在不同条件下表现出竞争力和稳健性 | 暂无明确提及的限制 | 旨在解决多研究单细胞数据整合过程中的技术噪声、样本异质性等挑战 | 整合来自不同研究的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 变分自编码器 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1128 | 2024-08-07 |
Nasopharyngeal neutrophilic-retention signatures could predict disease progression in early SARS-CoV-2 infection
2024-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29328
PMID:38146903
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析了COVID-19患者鼻咽拭子中的中性粒细胞相关基因表达，并发现与疾病严重程度相关的四个基因组成的NSAP可以作为早期诊断严重COVID-19的标志物 | 首次揭示了鼻咽部中性粒细胞的功能特征及其在预测COVID-19疾病进展中的作用，并识别出与疾病进展相关的四个基因组成的NSAP | NA | 探究鼻咽部中性粒细胞在COVID-19早期感染中的动态变化及其预测疾病进展的作用 | COVID-19患者的鼻咽拭子样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 包括轻度、中度、重度COVID-19患者及健康对照的鼻咽拭子样本 |
| 1129 | 2024-08-07 |
Ivabradine Alleviates Experimental Autoimmune Myocarditis-Mediated Myocardial Injury
2024, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-330
PMID:38296563
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研究论文 | 研究伊伐布雷定在实验性自身免疫性心肌炎模型中对心肌损伤的影响及其机制 | 首次探讨伊伐布雷定通过抑制HCNs通道在心肌炎中的抗炎作用 | 研究仅在动物模型中进行，需进一步在人体中验证 | 探究伊伐布雷定在心肌炎中的作用及其机制 | 实验性自身免疫性心肌炎大鼠模型 | 心血管疾病 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 32只Lewis大鼠 |
| 1130 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of single cell and bulk data develops a promising prognostic signature for improving immunotherapy responses in ovarian cancer
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298125
PMID:38346070
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量数据集成的优势，分析卵巢癌的肿瘤异质性，并开发了一种新的预后标志物，以改善卵巢癌患者的免疫治疗反应 | 首次综合利用单细胞和批量数据来解码卵巢癌的肿瘤异质性，并开发了一种稳定的细胞特征基因相关预后标志物（CCIS） | 研究基于公开数据集，可能存在样本选择偏倚；预后标志物的临床应用需要进一步的验证 | 探索卵巢癌的肿瘤异质性，并开发新的预后标志物以改善患者的免疫治疗反应 | 卵巢癌患者的肿瘤异质性及预后标志物 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 包括E-MTAB-8107、TCGA-OV、GSE63885和GSE26193四个队列的公开数据集 |
| 1131 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics of the immune system in ME/CFS at baseline and following symptom provocation
2024-01-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101373
PMID:38232699
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研究论文 | 本文研究了慢性疲劳综合症 (ME/CFS) 中免疫系统的单细胞转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示ME/CFS患者在基线和剧烈运动后免疫细胞的变化 | 样本大小和特定群体的选择可能限制了研究结果的普遍适用性 | 探讨ME/CFS中免疫系统的失调 | ME/CFS患者与对照组的免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性疲劳综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | ME/CFS患者和对照组的免疫细胞样本 |
| 1132 | 2024-08-07 |
Targeting cell-type-specific, choroid-peripheral immune signaling to treat age-related macular degeneration
2024-01-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101353
PMID:38232696
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了65名包括AMD患者和对照组的外周血单核细胞，并整合现有脉络膜数据，生成AMD中失调的脉络膜-外周免疫交互网络，验证了CYR61在抑制CNV中的作用。 | 首次揭示了CYR61在脉络膜静脉中的上调及其对循环中单核细胞的信号作用，并验证了其在小鼠模型中抑制CNV的作用。 | NA | 旨在通过靶向细胞特异性、脉络膜外周免疫信号来治疗年龄相关性黄斑变性。 | 年龄相关性黄斑变性患者的外周血单核细胞和脉络膜。 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 65名个体 |
| 1133 | 2024-08-07 |
Intercellular crosstalk shapes purinergic metabolism and signaling in cancer cells
2024-01-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113643
PMID:38175748
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研究论文 | 本文评估了五种癌症细胞系在常氧和缺氧条件下所有关键嘌呤外酶的酶动力学，并结合单细胞RNA测序数据分析了嘌呤代谢的异质性 | 发现嘌呤代谢在癌症组织中具有空间异质性，且在不同细胞类型间存在差异 | NA | 研究细胞间对话如何影响癌症细胞中的嘌呤代谢和信号传导 | 五种癌症细胞系（霍奇金淋巴瘤、多发性骨髓瘤、胰腺腺癌、膀胱癌和胶质母细胞瘤）的嘌呤外酶酶动力学 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五种癌症细胞系，包括恶性细胞、基质细胞和免疫细胞 |
| 1134 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptional Analysis of Lamina Propria Lymphocytes in the Jejunum Reveals Innate Lymphoid Cell-like Cells in Pigs
2024-01-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300463
PMID:37975680
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析猪空肠中的淋巴细胞，发现猪空肠固有层淋巴细胞中存在类似先天淋巴细胞的细胞 | 首次详细描述了猪空肠先天淋巴细胞的基因表达、亚型分类及各种先天淋巴细胞的标记物 | NA | 探索猪肠道黏膜免疫的深入研究 | 猪空肠固有层淋巴细胞中的先天淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 猪空肠中的多种细胞类型 |
| 1135 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Differences in Chromatin Remodeling and Energy Metabolism among In Vivo-Developed, In Vitro-Fertilized, and Parthenogenetically Activated Embryos from the Oocyte to 8-Cell Stages in Pigs
2024-Jan-31, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14030465
PMID:38338108
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研究论文 | 该文章分析了体外受精和孤雌发育胚胎与体内发育胚胎在小猪早期胚胎发育过程中的转录组差异 | 揭示了体外胚胎在早期发展中与体内胚胎相比面临的独特转录组特征和挑战 | 未涉及不同发育阶段后续的长远影响 | 探讨小猪胚胎在不同受精方式下的基因表达差异 | 小猪的体内发育、体外受精和孤雌发育胚胎 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 对小猪的多个胚胎样本进行了分析 |
| 1136 | 2024-08-07 |
scDisInFact: disentangled learning for integration and prediction of multi-batch multi-condition single-cell RNA-sequencing data
2024-Jan-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45227-w
PMID:38291052
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研究论文 | 介绍了一种名为scDisInFact的深度学习框架，用于处理多批次多条件单细胞RNA测序数据中的批次效应和条件效应 | scDisInFact能够分离条件效应和批次效应，同时执行批次效应去除、条件相关关键基因检测和扰动预测 | NA | 开发一种能够同时处理批次效应和条件效应的深度学习框架，以提高多批次多条件单细胞RNA测序数据整合和预测的准确性 | 多批次多条件单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 1137 | 2024-08-07 |
RNA polymerase II pausing is essential during spermatogenesis for appropriate gene expression and completion of meiosis
2024-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45177-3
PMID:38287033
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research paper | 本文通过稳态、新生和单细胞RNA测序策略，全面分析了雄性生殖细胞群体中的基因表达，揭示了RNA聚合酶II（Pol II）在精子分化早期暂停的必要性及其在调控基因活性和完成减数分裂中的作用。 | 发现RNA聚合酶II在精子分化早期的暂停对于建立发育过程中的基因活性景观至关重要，并揭示了Pol II暂停在减数分裂调控中的新角色。 | NA | 旨在解析雄性生殖细胞发育过程中基因调控的机制，并为治疗相关不孕症提供新见解。 | 雄性生殖细胞的基因表达调控及其在精子发生中的作用。 | NA | infertility | RNA sequencing | NA | RNA | 涉及多种雄性生殖细胞群体 |
| 1138 | 2024-08-04 |
Multiomics characterization of pyroptosis in the tumor microenvironment and therapeutic relevance in metastatic melanoma
2024-01-17, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-03175-0
PMID:38229080
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研究论文 | 该文章研究了肿瘤微环境中热焦亡的多组学特征及其在转移性黑素瘤中的治疗相关性 | 提出了一种计算模型PScore来评估热焦亡状态，并展示其在预测免疫疗法有效性方面的潜力 | 对不同肿瘤免疫微环境中热焦亡角色的理解仍然不足，限制了相关治疗的发展 | 研究热焦亡在转移性黑素瘤中的作用及其与免疫反应的关系 | 研究对象为1388例黑素瘤样本及多个公开独立队列 | 数字病理学 | 黑素瘤 | 多组学数据分析 | 计算模型（PScore） | 基因表达数据 | 1388例黑素瘤样本和其他多个公开独立队列 |
| 1139 | 2024-08-04 |
Comprehensive benchmark of differential transcript usage analysis for static and dynamic conditions
2024-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.14.575548
PMID:38313260
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研究论文 | 本文对差异转录使用分析中的多种工具进行全面基准测试 | 通过考虑不同实验条件和数据类型，提供了工具选择的系统比较和推荐 | 主要集中于现有工具的比较，对新工具的开发和优化没有深入探讨 | 帮助用户选择最适合其实验任务的转录组分析工具 | 模拟和实际的转录组数据集，包括时间序列数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 使用了模拟的和实际的转录组数据集，包括时间序列数据 |
| 1140 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in donor and end-stage heart failure patients identifies NLRP3 as a therapeutic target for arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy
2024-01-08, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-03232-8
PMID:38185631
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了供体和终末期心力衰竭患者的血液及双心室心肌细胞，识别出NLRP3作为治疗心律失常右室心肌病的潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术在心律失常右室心肌病患者中发现NLRP3的表达与右室扩张和功能障碍相关，并验证了其作为治疗靶点的有效性 | 研究样本量较小，仅包括8名研究参与者，且仅使用了Dsg2mut/mut小鼠模型进行验证 | 探索心律失常右室心肌病的新治疗靶点 | 心律失常右室心肌病患者的血液及双心室心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 8名研究参与者，包括6名终末期心力衰竭的心律失常右室心肌病患者和2名正常对照 |