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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2024-08-07 |
Correlation of Myeloid-Derived Suppressor Cell Expansion with Upregulated Transposable Elements in Severe COVID-19 Unveiled in Single-Cell RNA Sequencing Reanalysis
2024-Jan-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12020315
PMID:38397917
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研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据,探讨了可转座元件(TEs)在严重COVID-19患者中的表达与髓源抑制细胞(MDSCs)扩增之间的关联。 | 首次在单细胞水平上研究了可转座元件表达与COVID-19免疫反应中细胞功能的可能关联。 | 研究样本量较小,仅包括六名严重COVID-19患者和三名健康捐赠者的支气管肺泡灌洗样本。 | 评估可转座元件表达与严重COVID-19患者中由SARS-CoV-2引发的免疫反应之间的可能关联。 | 严重COVID-19患者的支气管肺泡灌洗样本中的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 六名严重COVID-19患者和三名健康捐赠者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1122 | 2024-08-04 |
Pan-Cancer Analysis Reveals Disulfidoptosis-Associated Genes as Promising Immunotherapeutic Targets: Insights Gained from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-Jan-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12020267
PMID:38397869
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研究论文 | 本研究探讨了与二硫化死亡相关的基因作为免疫治疗靶标的潜力 | 首次揭示二硫化死亡在不同肿瘤中的免疫和预后作用 | 研究主要依赖于公共数据库数据,缺乏临床实验证据 | 揭示二硫化死亡在肿瘤发生中的机制和临床应用潜力 | 研究了与二硫化死亡相关的基因在多种癌症中的表达及其临床意义 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,实时PCR,西方印迹 | NA | 基因表达数据,细胞系数据 | 包括多种癌症样本与细胞系的比较,具体数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1123 | 2024-08-04 |
Role and Therapeutic Potential for Targeting Fibroblast Growth Factor 10/FGFR1 in Relapsed Rheumatoid Arthritis
2024-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42674
PMID:37584284
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研究论文 | 该文章探讨了针对成纤维细胞生长因子10/FGFR1在复发性类风湿关节炎中的作用和治疗潜力 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示FLS异质性及其在复发与缓解中的作用,提出针对FGF10/FGFR1的靶向治疗的新思路 | 样本数量较少,仅包含六个配对的滑膜组织样本,限制了结果的广泛适用性 | 本研究旨在识别成纤维细胞样滑膜细胞(FLSs)的异质性及其在复发性类风湿关节炎中的致病作用 | 研究对象为三名复发性RA患者和三名缓解期患者的滑膜组织样本 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学 | 胶原诱导关节炎(CIA)模型 | 组织样本 | 六个配对的滑膜组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1124 | 2024-08-07 |
Endothelial Response to Type I Interferon Contributes to Vasculopathy and Fibrosis and Predicts Disease Progression of Systemic Sclerosis
2024-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42662
PMID:37488975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨了I型干扰素在系统性硬化症患者中的作用及其对疾病进展的影响。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞中I型干扰素信号在系统性硬化症中的显著特征,并验证了其在疾病进展预测中的作用。 | 研究样本量相对较小,需要进一步的大规模研究来验证这些发现。 | 探讨I型干扰素在系统性硬化症中的作用及其对疾病进展的影响。 | 系统性硬化症患者的皮肤组织。 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 61名系统性硬化症患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1125 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of the impact of emerging flame retardants on prostate cancer progression: The potential molecular mechanisms and immune infiltration landscape
2024-01, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2023.153681
PMID:38006928
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研究论文 | 研究探讨新兴阻燃剂与前列腺癌之间的关联及其潜在的致癌机制和免疫浸润情况 | 构建了一个具有良好预测能力的前列腺癌风险模型,并验证了六个与阻燃剂相关的预后基因 | NA | 探索新兴阻燃剂与前列腺癌之间的联系及其潜在的致癌机制 | 新兴阻燃剂对前列腺癌进展的影响及其分子机制和免疫浸润情况 | NA | 前列腺癌 | 蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用TCGA数据集和GSE70769数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 1126 | 2024-08-07 |
PD-1 signaling uncovers a pathogenic subset of T cells in inflammatory arthritis
2024-01-22, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-023-03259-5
PMID:38254179
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和CRISPR/Cas9筛选分析了类风湿关节炎患者外周血和滑膜液中的T细胞,发现PD-1+ HLA-DRHIGH KLRG1LOW T细胞是一种新的炎症性T细胞亚群 | 本研究首次识别出PD-1+ HLA-DRHIGH KLRG1LOW T细胞作为炎症性T细胞的新亚群,并揭示了与PD-1信号传导相关的新基因 | 本研究仅限于类风湿关节炎患者,且需要进一步研究以全面了解PD-1在滑膜T细胞中的作用 | 探索PD-1信号传导在炎症性关节炎中的作用,并寻找新的治疗靶点 | 类风湿关节炎患者的外周血和滑膜液中的T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术,CRISPR/Cas9筛选 | NA | RNA测序数据 | 类风湿关节炎患者的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1127 | 2024-08-07 |
Transcriptional profiling of human cartilage endplate cells identifies novel genes and cell clusters underlying degenerated and non-degenerated phenotypes
2024-01-03, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-023-03220-6
PMID:38173036
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序技术,对非退化和退化的人类软骨终板细胞进行转录组分析,以识别与退化和非退化表型相关的新基因和细胞簇。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了软骨终板细胞的表型异质性,并识别出多个具有独特基因表达和功能特征的软骨细胞和前体细胞亚群。 | 研究样本量较小,批量RNA测序仅包括4个非退化和4个退化样本,单细胞RNA测序仅包括1个非退化和1个退化样本。 | 旨在更好地表征软骨终板细胞的表型及其在软骨终板退化中的可能机制。 | 非退化和退化的人类腰椎软骨终板细胞。 | 数字病理学 | 腰痛 | RNA测序 | NA | RNA | 批量RNA测序:4个非退化样本,4个退化样本;单细胞RNA测序:1个非退化样本,1个退化样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 1128 | 2024-08-07 |
Keystone pathobionts associated with colorectal cancer promote oncogenic reprograming
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0297897
PMID:38363784
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术探讨了两种与结直肠癌相关的病原共生菌对肠道上皮细胞和局部免疫系统的影响 | 首次详细描述了Fusobacterium nucleatum和enterotoxigenic Bacteroides fragilis在结直肠癌模型中对转录表型和免疫细胞的具体影响 | 研究主要基于小鼠模型,可能与人类实际情况存在差异 | 探讨特定病原共生菌在结直肠癌发展中的作用及其分子机制 | Fusobacterium nucleatum和enterotoxigenic Bacteroides fragilis对结直肠癌的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和结直肠癌小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1129 | 2024-08-04 |
A Comprehensive Comparison between Primary Liver Cancer and Liver Metastases through scRNA-Seq Data Analysis
2024-Jan-26, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14020090
PMID:38392982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据比较原发性肝癌与肝转移癌的差异 | 本研究综合分析了原发性肝癌与肝转移癌之间的细胞类型、比例及相互作用的细节 | 缺乏临床样本的验证与更广泛的数据集支持 | 探讨原发性肝癌和结直肠肝转移癌之间的生物学差异 | 原发性肝癌及肝转移癌细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多种细胞类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1130 | 2024-08-07 |
Selective Vulnerability to Neurodegenerative Disease: Insights from Cell Type-Specific Translatome Studies
2024-Jan-23, Biology
DOI:10.3390/biology13020067
PMID:38392286
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综述 | 本文综述了通过细胞类型特异性翻译组学研究神经退行性疾病的选择性脆弱性的方法和进展 | 介绍了基于转基因技术的细胞类型特异性翻译组学方法(如RiboTag和bacTRAP)及其在神经退行性疾病研究中的应用 | 转基因技术在细胞类型特异性翻译组学中的应用相对较少,且存在一定的局限性 | 探讨不同脑区对神经退行性疾病的选择性脆弱性,以推进治疗策略的发展 | 研究对象包括肌萎缩侧索硬化症(ALS)、亨廷顿病(HD)、阿尔茨海默病(AD)以及特定的朊病毒疾病如致死性家族性失眠症(FFI)和遗传性克雅氏病(gCJD) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、RiboTag、bacTRAP | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1131 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omic analysis of the vestibular schwannoma ecosystem uncovers a nerve injury-like state
2024-Jan-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42762-w
PMID:38216553
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析前庭神经鞘瘤的生态系统,揭示了神经损伤样状态 | 首次通过单细胞RNA测序和配对的单细胞ATAC测序以及外显子测序,深入分析了前庭神经鞘瘤的异质性和肿瘤微环境,发现了与神经损伤修复相关的细胞类型和分子途径 | 研究样本量相对较小,可能影响结果的普遍性 | 探究前庭神经鞘瘤的异质性和肿瘤微环境对其发病机制的影响 | 前庭神经鞘瘤及其肿瘤微环境中的多种细胞类型 | 数字病理学 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、外显子测序 | NA | RNA表达数据 | 15个前庭神经鞘瘤样本,其中6个样本进行了配对的单细胞ATAC测序,12个样本进行了外显子测序 | NA | NA | NA | NA |
| 1132 | 2024-08-04 |
Expression of EPB41L2 in Cancer-Associated Fibroblasts: Prognostic Implications for Bladder Cancer and Response to Immunotherapy
2024-01, Archives of medical research
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.arcmed.2023.102927
PMID:38154234
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研究论文 | 研究了EPB41L2在膀胱癌相关成纤维细胞中的表达及其对免疫治疗的预后意义 | 首次确认了EPB41L2在膀胱癌相关成纤维细胞中的上调及其与肿瘤微环境重塑的相关性 | 未提供关于其他潜在生物标志物比较的数据 | 评估EPB41L2作为预测膀胱癌免疫治疗反应的生物标志物的潜力 | 膀胱癌患者的肿瘤微环境及相关生物标志物 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 免疫组化(IHC)和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织切片 | IMvigor210队列的患者样本和正常组织对照 | NA | NA | NA | NA |
| 1133 | 2024-08-07 |
ABHD5-CPT1B: An Important Way of Regulating Placental Lipid Metabolism in Gestational Diabetes Mellitus
2024-01, Archives of medical research
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.arcmed.2023.102925
PMID:38042031
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研究论文 | 本研究探讨了妊娠期糖尿病中胎盘脂质代谢的调控机制,特别是ABHD5-CPT1B的作用 | 首次揭示了ABHD5-CPT1B在妊娠期糖尿病胎盘脂质代谢中的重要调控作用 | 研究样本量较小,需要进一步的大规模验证 | 探究妊娠期糖尿病中胎盘脂质代谢的分子机制 | 妊娠期糖尿病患者的胎盘和正常孕妇的胎盘 | NA | 妊娠期糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15名妊娠期糖尿病患者和15名正常孕妇 | NA | NA | NA | NA |
| 1134 | 2024-08-07 |
Leveraging baseline transcriptional features and information from single-cell data to power the prediction of influenza vaccine response
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1243586
PMID:38384303
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研究论文 | 本研究利用基因表达数据和单细胞数据,探索构建流感疫苗反应预测模型的改进策略 | 本研究采用了组合建模策略,并利用单细胞水平的信息来优化流感疫苗反应预测模型 | NA | 探索利用基因表达数据和单细胞数据构建流感疫苗反应预测模型的改进策略 | 流感疫苗反应预测模型的构建 | 生物信息学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自Immune Signatures Data Resource (IS2)的基因表达和免疫反应数据,具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1135 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of genetic associations and single-cell expression profiles reveals potential links between migraine and multiple diseases: a phenome-wide association study
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1301208
PMID:38385040
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研究论文 | 本研究通过综合分析遗传关联和单细胞表达谱,揭示了偏头痛与其他多种疾病之间的潜在联系 | 首次通过单细胞RNA测序和PheWAS研究,揭示了偏头痛与多种疾病之间的多效性关系及其生物学基础 | NA | 探究偏头痛与其他复杂疾病之间的遗传和生物学联系 | 偏头痛及其与416种表型的关联 | 遗传学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, qPCR | NA | 基因表达数据 | 73个偏头痛易感基因在不同脑细胞类型中的表达 | NA | NA | NA | NA |
| 1136 | 2024-08-07 |
Unraveling T cell exhaustion in the immune microenvironment of osteosarcoma via single-cell RNA transcriptome
2024-Jan-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03585-2
PMID:38280005
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了骨肉瘤中的T细胞耗竭现象,并构建了预测模型以评估其对患者预后的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了骨肉瘤中T细胞耗竭的分子特征及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | NA | 探讨T细胞耗竭在骨肉瘤免疫微环境中的作用及其对疾病进展的影响 | 骨肉瘤中的T细胞耗竭现象及其相关基因表达 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1137 | 2024-08-04 |
Joint L2,p-norm and random walk graph constrained PCA for single-cell RNA-seq data
2024 Jan-Mar, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2023.2188106
PMID:36912759
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研究论文 | 本文提出了一种称为RWPPCA的新方法用于改善单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | RWPPCA结合了随机游走算法和图正则化,以更精确地确定数据点之间的局部几何关系,并引入-Lp范数使主成分更稀疏,提升了解释性 | 传统PCA在挖掘数据的非线性流形结构时存在缺陷,可能会受主成分过密的影响 | 提高单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别的有效性 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 高维数据 | 模拟数据和单细胞RNA测序数据的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1138 | 2024-08-04 |
Multi-omics and single-cell sequencing analyses reveal the potential significance of circadian pathways in cancer therapy
2024 Jan-Feb, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2023.2296668
PMID:38288973
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研究论文 | 该研究探讨了生物钟通路在癌症治疗中的潜在重要性 | 首次全面分析了癌症中的生物钟相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 该研究仅使用了TCGA数据库的数据,可能无法涵盖所有相关表型和样本 | 探索生物钟相关基因在泛癌症中的影响 | 研究多个不同类型肿瘤中的生物钟相关基因表达及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序, 免疫组织化学 | NA | 基因组数据 | 使用TCGA数据库的多种癌症相关数据,包括多个肿瘤类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1139 | 2024-08-04 |
Association of peripheral B cells and delirium: combined single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1343726
PMID:38379709
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研究论文 | 本研究探讨了外周B细胞与谵妄的关联,分析了炎症压力下的免疫细胞亚群变化。 | 首次结合单细胞测序和孟德尔随机化法来探究外周免疫细胞与谵妄的因果关系 | 本研究的结果可能受到样本量和遗传数据的限制 | 研究外周免疫细胞亚群在炎症应激情况下的变化及其与谵妄的因果关联 | 人类外周血单核细胞(PBMC)及其亚群 | 数字病理学 | 谵妄 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因型数据、单细胞转录组数据 | 70个与PBMC相关的免疫性状 | NA | NA | NA | NA |
| 1140 | 2024-08-04 |
Selective inhibition of DNA ligase IV provides additional efficacy to the treatment of anaplastic thyroid cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1323313
PMID:38380364
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研究论文 | 本研究探讨了选择性抑制DNA连接酶IV对治疗未分化甲状腺癌的额外疗效 | 本研究首次显示了DNA连接酶IV抑制剂与DNA损伤剂联合应用对未分化甲状腺癌的治疗潜力 | 样本量和模型的应用限制了研究结果的广泛适用性 | 探讨选择性抑制DNA连接酶IV对未分化甲状腺癌治疗的影响 | 未分化甲状腺癌细胞系(C643和Hth74)及甲状腺癌不同亚型患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 未分化甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,DNA损伤响应监测 | NA | RNA测序数据,细胞培养实验结果 | 多个不同亚型甲状腺癌患者的单细胞数据,使用小鼠异种移植模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |