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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2024-08-04 |
Molecular classification of small cell lung cancer subtypes: Characteristics, prognostic factors, and clinical translation
2024-Jan-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002693
PMID:37660289
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综述 | 本文回顾并总结了小细胞肺癌的分子分类特征、预后因素和临床应用。 | 研究了基于小细胞肺癌的关键转录因子的新兴分子分类,为肿瘤的病理生理学、转移、免疫微环境及获得性治疗抵抗提供了更多信息 | NA | 探讨小细胞肺癌的分子分类及其临床转化 | 小细胞肺癌的不同亚型及其特征 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1102 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal different maturation stages and sublineage commitment of human thymic invariant natural killer T cells
2024-01-19, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad113
PMID:37742056
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研究论文 | 本研究揭示了人类胸腺不变自然杀伤T细胞不同的成熟阶段和亚谱系承诺 | 首次定义了人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育过程中的成熟阶段,并评估了亚谱系承诺 | 研究仅限于从胸腺中提取的细胞,缺乏对外周血中细胞的广泛分析 | 探讨人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育中的成熟阶段和亚谱系承诺 | 人类Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从胸腺提取的Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1103 | 2024-08-04 |
Role of immune cells in the pathogenesis of myocarditis
2024-01-19, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad143
PMID:37949833
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研究论文 | 此文章总结了免疫细胞在心肌炎发病机制中的角色 | 本研究强调了免疫细胞的复杂性和细胞间相互作用对心肌炎病理过程的重要性 | 目前尚不清楚心肌炎的详细发病机制 | 探讨免疫细胞在心肌炎发病机制中的作用 | 研究涉及心肌炎患者及多种动物模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心肌炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1104 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics of Treg reveals hallmarks and trajectories of immunological aging
2024-01-05, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad104
PMID:37675661
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研究论文 | 研究了与年龄相关的免疫衰老对CD4+调节性T细胞的影响 | 识别了6个转录组特异性克隆的调节性T细胞,并揭示了与衰老相关的特征和变化轨迹 | 主要基于小鼠模型,可能无法完全反映人类的情况 | 探讨老化对调节性T细胞的影响以及与免疫衰老相关的机制 | 小鼠淋巴和脂肪组织来源的调节性T细胞 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 针对3个月、18个月和24个月龄小鼠的调节性T细胞进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 1105 | 2024-08-07 |
BCG vaccination induces innate immune memory in γδ T cells in humans
2024-01-05, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad103
PMID:37672677
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研究论文 | 本研究探讨了卡介苗(BCG)疫苗是否能在人类γδ T细胞中诱导出训练免疫,从而增强其对异源细菌和真菌感染的交叉保护作用 | 首次证明了BCG疫苗能在人类γδ T细胞中诱导出训练免疫,增强其对异源细菌和真菌刺激的反应性 | NA | 确定人类γδ T细胞是否能通过BCG疫苗诱导出训练免疫,从而增强其交叉保护作用 | 健康人类志愿者的γδ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序技术 | NA | RNA | 健康人类志愿者 | NA | NA | NA | NA |
| 1106 | 2024-08-04 |
Generating single-cell gene expression profiles for high-resolution spatial transcriptomics based on cell boundary images
2024, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.110
PMID:38434932
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研究论文 | 本研究介绍了一种更新的软件STCellbin,能够生成高分辨率的单细胞空间基因表达特征 | 该软件结合了细胞膜/细胞壁染色图像与空间基因表达图,增强了单细胞基因表达轮廓的捕获能力 | NA | 提升空间转录组学中单细胞基因表达的分析精度 | 小鼠肝脏和种子数据集的单细胞基因表达轮廓 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 多个小鼠肝脏和种子的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1107 | 2024-08-04 |
Advances in the Application of Single-Cell Transcriptomics in Plant Systems and Synthetic Biology
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0029
PMID:38435807
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综述 | 本文总结了单细胞转录组在植物系统和合成生物学中的应用进展 | 探讨了单细胞RNA测序技术在植物生物系统设计和合成生物学中的潜在应用及未来技术进展的影响 | 目前单细胞RNA测序的应用仅限于少量植物物种,且技术成本较高 | 旨在提供单细胞RNA测序在植物样本中的选择指南,并探讨其在植物系统生物学和合成生物学中的不同应用 | 植物生物系统及其合成生物学研究 | 合成生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 仅限于少量植物物种,包括模型植物、农业作物和生物能源作物 | NA | NA | NA | NA |
| 1108 | 2024-08-07 |
Integrative Omics Analysis Reveals Metabolic Features of Ground-Glass Opacity-Associated Lung Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.92437
PMID:38434969
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研究论文 | 本研究通过代谢组学和转录组学分析,揭示了磨玻璃影(GGO)相关肺癌的代谢特征 | 首次全面探讨了GGO相关肺癌的代谢特征和关键代谢基因,特别是发现MAOB在抑制LUAD细胞增殖和转移中的重要作用 | 研究样本量有限,且仅限于GGO相关肺癌,未来需扩大样本量并验证其他类型肺癌中的发现 | 识别GGO相关肺癌的异常代谢途径和关键代谢基因,为该疾病的诊断和治疗提供新策略 | GGO相关肺癌组织及其邻近正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 代谢组学分析, 转录组学分析, 实时定量PCR | NA | 基因表达数据, 代谢数据 | 40对GGO相关肺癌组织及邻近正常组织 | NA | NA | NA | NA |
| 1109 | 2024-08-07 |
Mendelian Randomization Validates the Immune Landscape Mediated by Aggrephagy in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Patients from the Perspectives of Multi-omics
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.93376
PMID:38434988
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研究论文 | 通过生物信息学方法研究食管鳞状细胞癌(ESCC)患者中由自噬介导的免疫景观,并利用孟德尔随机化方法识别与食管癌有因果关系的预后细胞簇基因。 | 揭示了自噬相关簇在介导ESCC患者预后和免疫治疗中的作用,并识别出与食管癌发生有因果关系的基因。 | NA | 阐明自噬在ESCC患者中调节的免疫景观,并识别与食管癌有因果关系的预后细胞簇基因。 | 食管鳞状细胞癌患者的免疫景观和预后细胞簇基因。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序 | NMF聚类 | 单细胞转录组数据 | 19种不同的细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 1110 | 2024-08-07 |
Characterizing CD8+ TEMRA Cells in CP/CPPS Patients: Insights from Targeted Single-Cell Transcriptomic and Functional Investigations
2024, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S451199
PMID:38435982
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研究论文 | 本研究通过靶向单细胞转录组学和功能研究,探讨了CD8+ TEMRA细胞在慢性前列腺炎/慢性骨盆疼痛综合征(CP/CPPS)患者中的作用 | 首次详细探索了CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS患者中的具体作用,并揭示了其在疾病发病机制中的关键角色 | 研究样本量较小,仅包括两名CP/CPPS患者和两名健康对照 | 阐明CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS中的作用,并寻找潜在的治疗靶点 | CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS患者中的分子特征和功能 | NA | 慢性前列腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 两名CP/CPPS患者和两名健康对照的外周血单个核细胞(PBMCs) | NA | NA | NA | NA |
| 1111 | 2024-08-07 |
Co-differential genes between DKD and aging: implications for a diagnostic model of DKD
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17046
PMID:38435999
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研究论文 | 本研究通过筛选糖尿病肾病(DKD)和衰老相关的共同差异基因,构建了一个基于这些基因的DKD诊断模型 | 发现了DKD和衰老之间的共同差异基因,并基于这些基因开发了一个遗传诊断模型 | NA | 探索糖尿病肾病(DKD)和衰老之间的共同差异基因,并建立一个基于这些基因的DKD诊断模型 | 糖尿病肾病(DKD)和衰老相关的共同差异基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO回归 | 基因表达数据 | DKD小鼠模型(通过链脲佐菌素(STZ)注射构建并由组织切片染色确认) | NA | NA | NA | NA |
| 1112 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial multi-omics highlight effects of anti-integrin therapy across cellular compartments in ulcerative colitis
2024-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.21.525036
PMID:36711576
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研究论文 | 本文研究了抗整合素疗法对溃疡性结肠炎中细胞不同群体的影响 | 首次通过单细胞转录组和蛋白组分析揭示了VDZ对炎症细胞的影响及其在溃疡性结肠炎中的作用 | 本研究未详细阐明VDZ对于其他细胞亚群体的广泛影响 | 确定参与溃疡性结肠炎的炎症细胞及其受VDZ影响的程度 | 健康对照组及接受VDZ或其他疗法的溃疡性结肠炎患者的外周血和结肠活检样本 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学和蛋白组学分析 | NA | 外周血和结肠活检样本 | 健康对照组和接受不同治疗的溃疡性结肠炎患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1113 | 2024-08-04 |
Conceptual Framework of Epigenetic Analyses of Plant Responses to Sedentary Endoparasitic Nematodes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3638-1_12
PMID:38427303
|
章节 | 本章节提供了一种用于研究植物与寄生线虫相互作用的表观遗传调控的概念框架 | 提供了针对miRNA调控和功能的当前及新兴方法的详细分析 | 文章提到了一些方法的局限性并讨论如何克服这些问题 | 阐明植物与寄生线虫相互作用过程中的表观遗传调控 | 关注植物表观基因组中各种成分在寄生线虫感染中的作用 | NA | NA | 单细胞测序技术、基因组编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1114 | 2024-08-07 |
Comprehensive profiling of cell subsets of gastric cancer and liver metastasis based on single cell RNA-sequencing analysis
2024-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-1532
PMID:38410212
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对胃癌及其肝转移的细胞亚型进行全面分析 | 揭示了胃癌原发肿瘤和肝转移在基因表达上的差异及其对患者预后的影响 | NA | 通过单细胞RNA测序评估胃癌及其肝转移的细胞亚型,并理解其分子机制 | 胃癌及其肝转移的细胞亚型和分子机制 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)的GSE163558数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1115 | 2024-08-05 |
Mapping cancer biology in space: applications and perspectives on spatial omics for oncology
2024-01-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-01941-z
PMID:38291400
|
研究论文 | 本文探讨了空间组学技术在肿瘤生物学中的应用和前景 | 提出了通过空间技术映射肿瘤异质性和微环境的新方法 | 缺乏针对特定模型应用空间技术的详细说明 | 研究空间组学在肿瘤学中的应用以解决肿瘤异质性等问题 | 聚焦于肿瘤及其微环境的空间特征 | 数字病理学 | 癌症 | 空间组学技术 | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1116 | 2024-08-07 |
Identification of HSP90B1 in pan-cancer hallmarks to aid development of a potential therapeutic target
2024-01-20, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01920-w
PMID:38243263
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和队列验证,探讨了HSP90B1在泛癌中的动态表达,并全面评估其作为新型生物标志物的潜力,以助力精准癌症诊断和治疗的发展。 | 本研究首次全面评估HSP90B1作为癌症诊断和治疗的新型生物标志物,并发现其表达与多种癌症特征的相关性,包括免疫浸润、微卫星不稳定性、肿瘤突变负荷和肿瘤代谢等。 | NA | 探讨HSP90B1在泛癌中的表达及其作为潜在治疗靶点的可能性。 | HSP90B1在泛癌中的表达及其与癌症发展和预后的关系。 | 数字病理学 | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个癌症类型的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1117 | 2024-08-05 |
Assembling spatial clustering framework for heterogeneous spatial transcriptomics data with GRAPHDeep
2024-01-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae023
PMID:38243703
|
研究论文 | 本文提出了GRAPHDeep以组装异构空间转录组数据的空间聚类框架 | 提出了新的空间聚类方法并比较了现有算法的有效性,强调了基因或蛋白质数量在空间聚类算法中的重要性 | 需要进一步探索适当的图深度学习模块和图神经网络 | 研究空间转录组数据分析中的空间聚类问题 | 异构空间转录组数据 | 计算机视觉 | NA | 图神经网络 | 变分图自编码器 | 空间组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1118 | 2024-08-05 |
scMAE: a masked autoencoder for single-cell RNA-seq clustering
2024-01-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae020
PMID:38230824
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研究论文 | 提出了一种基于掩码自编码器的细胞聚类新方法scMAE | scMAE通过引入掩码预测器,捕捉基因之间的关系,从而增强了聚类性能 | 未提及具体的限制 | 旨在提高scRNA-seq数据分析中的细胞聚类效果 | 针对15个来自不同测序平台的scRNA-seq数据集进行细胞聚类 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 掩码自编码器 | 基因表达数据 | 15个scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1119 | 2024-08-07 |
Ribogenesis boosts controlled by HEATR1-MYC interplay promote transition into brain tumour growth
2024-Jan, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-023-00017-1
PMID:38225354
|
研究论文 | 本文揭示了脑肿瘤启动细胞(TICs)在向肿瘤生长过渡期间,通过HEATR1-MYC相互作用增强核糖体生物发生的过程。 | 首次提出脑TICs在肿瘤生长前增强核糖体生物发生,并揭示了HEATR1与MYC结合促进核糖体RNA生成和TIC扩大的机制。 | NA | 研究肿瘤启动细胞向肿瘤生长过渡的早期事件及其分子机制。 | 脑肿瘤启动细胞(TICs)及其在肿瘤生长过程中的分子调控。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用果蝇神经干细胞模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 1120 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed That the Enrichment of TPI1+ Malignant Hepatocytes Was Linked to HCC Metastasis and Immunosuppressive Microenvironment
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S453249
PMID:38410699
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了TPI1+恶性肝细胞在肝细胞癌(HCC)转移和免疫抑制微环境中的作用 | 首次发现TPI1+恶性肝细胞群与HCC转移和免疫抑制微环境的关联,为HCC免疫治疗提供了新的潜在生物标志物 | 研究样本量较小,仅基于10个HCC样本的数据,可能影响结果的普遍性 | 探讨HCC转移相关微环境中特定细胞群的作用 | HCC组织及其邻近和正常组织样本中的恶性肝细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 10个HCC样本 | NA | NA | NA | NA |