单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 1081 - 1100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the mechanism of PI3K/AKT/mTOR signaling pathway activation in lung adenocarcinoma by KRAS mutation
2024-Jan, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3658
PMID:38282149
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了KRAS突变在肺腺癌中激活PI3K/AKT/mTOR信号通路的机制 | 首次详细探讨了KRAS突变对肺腺癌中PI3K/AKT/mTOR信号通路活性的影响 | NA | 探讨KRAS突变在肺腺癌中激活PI3K/AKT/mTOR信号通路的机制 | 肺腺癌中的KRAS突变及其对PI3K/AKT/mTOR信号通路的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用The Cancer Genome Atlas数据库中的肺腺癌患者样本 |
| 1082 | 2024-08-07 |
Comprehensive profiling of cell subsets of gastric cancer and liver metastasis based on single cell RNA-sequencing analysis
2024-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-1532
PMID:38410212
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对胃癌及其肝转移的细胞亚型进行全面分析 | 揭示了胃癌原发肿瘤和肝转移在基因表达上的差异及其对患者预后的影响 | NA | 通过单细胞RNA测序评估胃癌及其肝转移的细胞亚型，并理解其分子机制 | 胃癌及其肝转移的细胞亚型和分子机制 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)的GSE163558数据集 |
| 1083 | 2024-08-05 |
Mapping cancer biology in space: applications and perspectives on spatial omics for oncology
2024-01-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-01941-z
PMID:38291400
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研究论文 | 本文探讨了空间组学技术在肿瘤生物学中的应用和前景 | 提出了通过空间技术映射肿瘤异质性和微环境的新方法 | 缺乏针对特定模型应用空间技术的详细说明 | 研究空间组学在肿瘤学中的应用以解决肿瘤异质性等问题 | 聚焦于肿瘤及其微环境的空间特征 | 数字病理学 | 癌症 | 空间组学技术 | NA | 组织样本 | NA |
| 1084 | 2024-08-07 |
Identification of HSP90B1 in pan-cancer hallmarks to aid development of a potential therapeutic target
2024-01-20, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01920-w
PMID:38243263
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和队列验证，探讨了HSP90B1在泛癌中的动态表达，并全面评估其作为新型生物标志物的潜力，以助力精准癌症诊断和治疗的发展。 | 本研究首次全面评估HSP90B1作为癌症诊断和治疗的新型生物标志物，并发现其表达与多种癌症特征的相关性，包括免疫浸润、微卫星不稳定性、肿瘤突变负荷和肿瘤代谢等。 | NA | 探讨HSP90B1在泛癌中的表达及其作为潜在治疗靶点的可能性。 | HSP90B1在泛癌中的表达及其与癌症发展和预后的关系。 | 数字病理学 | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个癌症类型的肿瘤样本 |
| 1085 | 2024-08-05 |
Assembling spatial clustering framework for heterogeneous spatial transcriptomics data with GRAPHDeep
2024-01-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae023
PMID:38243703
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研究论文 | 本文提出了GRAPHDeep以组装异构空间转录组数据的空间聚类框架 | 提出了新的空间聚类方法并比较了现有算法的有效性，强调了基因或蛋白质数量在空间聚类算法中的重要性 | 需要进一步探索适当的图深度学习模块和图神经网络 | 研究空间转录组数据分析中的空间聚类问题 | 异构空间转录组数据 | 计算机视觉 | NA | 图神经网络 | 变分图自编码器 | 空间组学数据 | NA |
| 1086 | 2024-08-05 |
scMAE: a masked autoencoder for single-cell RNA-seq clustering
2024-01-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae020
PMID:38230824
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研究论文 | 提出了一种基于掩码自编码器的细胞聚类新方法scMAE | scMAE通过引入掩码预测器，捕捉基因之间的关系，从而增强了聚类性能 | 未提及具体的限制 | 旨在提高scRNA-seq数据分析中的细胞聚类效果 | 针对15个来自不同测序平台的scRNA-seq数据集进行细胞聚类 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 掩码自编码器 | 基因表达数据 | 15个scRNA-seq数据集 |
| 1087 | 2024-08-07 |
Ribogenesis boosts controlled by HEATR1-MYC interplay promote transition into brain tumour growth
2024-Jan, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-023-00017-1
PMID:38225354
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研究论文 | 本文揭示了脑肿瘤启动细胞（TICs）在向肿瘤生长过渡期间，通过HEATR1-MYC相互作用增强核糖体生物发生的过程。 | 首次提出脑TICs在肿瘤生长前增强核糖体生物发生，并揭示了HEATR1与MYC结合促进核糖体RNA生成和TIC扩大的机制。 | NA | 研究肿瘤启动细胞向肿瘤生长过渡的早期事件及其分子机制。 | 脑肿瘤启动细胞（TICs）及其在肿瘤生长过程中的分子调控。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用果蝇神经干细胞模型进行研究 |
| 1088 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed That the Enrichment of TPI1+ Malignant Hepatocytes Was Linked to HCC Metastasis and Immunosuppressive Microenvironment
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S453249
PMID:38410699
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了TPI1+恶性肝细胞在肝细胞癌（HCC）转移和免疫抑制微环境中的作用 | 首次发现TPI1+恶性肝细胞群与HCC转移和免疫抑制微环境的关联，为HCC免疫治疗提供了新的潜在生物标志物 | 研究样本量较小，仅基于10个HCC样本的数据，可能影响结果的普遍性 | 探讨HCC转移相关微环境中特定细胞群的作用 | HCC组织及其邻近和正常组织样本中的恶性肝细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 10个HCC样本 |
| 1089 | 2024-08-07 |
Correlation of Myeloid-Derived Suppressor Cell Expansion with Upregulated Transposable Elements in Severe COVID-19 Unveiled in Single-Cell RNA Sequencing Reanalysis
2024-Jan-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12020315
PMID:38397917
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研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，探讨了可转座元件（TEs）在严重COVID-19患者中的表达与髓源抑制细胞（MDSCs）扩增之间的关联。 | 首次在单细胞水平上研究了可转座元件表达与COVID-19免疫反应中细胞功能的可能关联。 | 研究样本量较小，仅包括六名严重COVID-19患者和三名健康捐赠者的支气管肺泡灌洗样本。 | 评估可转座元件表达与严重COVID-19患者中由SARS-CoV-2引发的免疫反应之间的可能关联。 | 严重COVID-19患者的支气管肺泡灌洗样本中的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 六名严重COVID-19患者和三名健康捐赠者的样本 |
| 1090 | 2024-08-04 |
Pan-Cancer Analysis Reveals Disulfidoptosis-Associated Genes as Promising Immunotherapeutic Targets: Insights Gained from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-Jan-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12020267
PMID:38397869
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研究论文 | 本研究探讨了与二硫化死亡相关的基因作为免疫治疗靶标的潜力 | 首次揭示二硫化死亡在不同肿瘤中的免疫和预后作用 | 研究主要依赖于公共数据库数据，缺乏临床实验证据 | 揭示二硫化死亡在肿瘤发生中的机制和临床应用潜力 | 研究了与二硫化死亡相关的基因在多种癌症中的表达及其临床意义 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，实时PCR，西方印迹 | NA | 基因表达数据，细胞系数据 | 包括多种癌症样本与细胞系的比较，具体数量未提及 |
| 1091 | 2024-08-04 |
Role and Therapeutic Potential for Targeting Fibroblast Growth Factor 10/FGFR1 in Relapsed Rheumatoid Arthritis
2024-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42674
PMID:37584284
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研究论文 | 该文章探讨了针对成纤维细胞生长因子10/FGFR1在复发性类风湿关节炎中的作用和治疗潜力 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示FLS异质性及其在复发与缓解中的作用，提出针对FGF10/FGFR1的靶向治疗的新思路 | 样本数量较少，仅包含六个配对的滑膜组织样本，限制了结果的广泛适用性 | 本研究旨在识别成纤维细胞样滑膜细胞(FLSs)的异质性及其在复发性类风湿关节炎中的致病作用 | 研究对象为三名复发性RA患者和三名缓解期患者的滑膜组织样本 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学 | 胶原诱导关节炎(CIA)模型 | 组织样本 | 六个配对的滑膜组织样本 |
| 1092 | 2024-08-07 |
Endothelial Response to Type I Interferon Contributes to Vasculopathy and Fibrosis and Predicts Disease Progression of Systemic Sclerosis
2024-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42662
PMID:37488975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨了I型干扰素在系统性硬化症患者中的作用及其对疾病进展的影响。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞中I型干扰素信号在系统性硬化症中的显著特征，并验证了其在疾病进展预测中的作用。 | 研究样本量相对较小，需要进一步的大规模研究来验证这些发现。 | 探讨I型干扰素在系统性硬化症中的作用及其对疾病进展的影响。 | 系统性硬化症患者的皮肤组织。 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 61名系统性硬化症患者 |
| 1093 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of the impact of emerging flame retardants on prostate cancer progression: The potential molecular mechanisms and immune infiltration landscape
2024-01, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2023.153681
PMID:38006928
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研究论文 | 研究探讨新兴阻燃剂与前列腺癌之间的关联及其潜在的致癌机制和免疫浸润情况 | 构建了一个具有良好预测能力的前列腺癌风险模型，并验证了六个与阻燃剂相关的预后基因 | NA | 探索新兴阻燃剂与前列腺癌之间的联系及其潜在的致癌机制 | 新兴阻燃剂对前列腺癌进展的影响及其分子机制和免疫浸润情况 | NA | 前列腺癌 | 蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用TCGA数据集和GSE70769数据集进行验证 |
| 1094 | 2024-08-07 |
PD-1 signaling uncovers a pathogenic subset of T cells in inflammatory arthritis
2024-01-22, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-023-03259-5
PMID:38254179
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和CRISPR/Cas9筛选分析了类风湿关节炎患者外周血和滑膜液中的T细胞，发现PD-1+ HLA-DRHIGH KLRG1LOW T细胞是一种新的炎症性T细胞亚群 | 本研究首次识别出PD-1+ HLA-DRHIGH KLRG1LOW T细胞作为炎症性T细胞的新亚群，并揭示了与PD-1信号传导相关的新基因 | 本研究仅限于类风湿关节炎患者，且需要进一步研究以全面了解PD-1在滑膜T细胞中的作用 | 探索PD-1信号传导在炎症性关节炎中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 类风湿关节炎患者的外周血和滑膜液中的T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术，CRISPR/Cas9筛选 | NA | RNA测序数据 | 类风湿关节炎患者的多个样本 |
| 1095 | 2024-08-07 |
Transcriptional profiling of human cartilage endplate cells identifies novel genes and cell clusters underlying degenerated and non-degenerated phenotypes
2024-01-03, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-023-03220-6
PMID:38173036
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序技术，对非退化和退化的人类软骨终板细胞进行转录组分析，以识别与退化和非退化表型相关的新基因和细胞簇。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了软骨终板细胞的表型异质性，并识别出多个具有独特基因表达和功能特征的软骨细胞和前体细胞亚群。 | 研究样本量较小，批量RNA测序仅包括4个非退化和4个退化样本，单细胞RNA测序仅包括1个非退化和1个退化样本。 | 旨在更好地表征软骨终板细胞的表型及其在软骨终板退化中的可能机制。 | 非退化和退化的人类腰椎软骨终板细胞。 | 数字病理学 | 腰痛 | RNA测序 | NA | RNA | 批量RNA测序：4个非退化样本，4个退化样本；单细胞RNA测序：1个非退化样本，1个退化样本。 |
| 1096 | 2024-08-07 |
Keystone pathobionts associated with colorectal cancer promote oncogenic reprograming
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0297897
PMID:38363784
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术探讨了两种与结直肠癌相关的病原共生菌对肠道上皮细胞和局部免疫系统的影响 | 首次详细描述了Fusobacterium nucleatum和enterotoxigenic Bacteroides fragilis在结直肠癌模型中对转录表型和免疫细胞的具体影响 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类实际情况存在差异 | 探讨特定病原共生菌在结直肠癌发展中的作用及其分子机制 | Fusobacterium nucleatum和enterotoxigenic Bacteroides fragilis对结直肠癌的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和结直肠癌小鼠模型 |
| 1097 | 2024-08-04 |
A Comprehensive Comparison between Primary Liver Cancer and Liver Metastases through scRNA-Seq Data Analysis
2024-Jan-26, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14020090
PMID:38392982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据比较原发性肝癌与肝转移癌的差异 | 本研究综合分析了原发性肝癌与肝转移癌之间的细胞类型、比例及相互作用的细节 | 缺乏临床样本的验证与更广泛的数据集支持 | 探讨原发性肝癌和结直肠肝转移癌之间的生物学差异 | 原发性肝癌及肝转移癌细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多种细胞类型的样本 |
| 1098 | 2024-08-07 |
Selective Vulnerability to Neurodegenerative Disease: Insights from Cell Type-Specific Translatome Studies
2024-Jan-23, Biology
DOI:10.3390/biology13020067
PMID:38392286
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综述 | 本文综述了通过细胞类型特异性翻译组学研究神经退行性疾病的选择性脆弱性的方法和进展 | 介绍了基于转基因技术的细胞类型特异性翻译组学方法（如RiboTag和bacTRAP）及其在神经退行性疾病研究中的应用 | 转基因技术在细胞类型特异性翻译组学中的应用相对较少，且存在一定的局限性 | 探讨不同脑区对神经退行性疾病的选择性脆弱性，以推进治疗策略的发展 | 研究对象包括肌萎缩侧索硬化症（ALS）、亨廷顿病（HD）、阿尔茨海默病（AD）以及特定的朊病毒疾病如致死性家族性失眠症（FFI）和遗传性克雅氏病（gCJD） | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、RiboTag、bacTRAP | NA | 转录组数据 | NA |
| 1099 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omic analysis of the vestibular schwannoma ecosystem uncovers a nerve injury-like state
2024-Jan-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42762-w
PMID:38216553
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析前庭神经鞘瘤的生态系统，揭示了神经损伤样状态 | 首次通过单细胞RNA测序和配对的单细胞ATAC测序以及外显子测序，深入分析了前庭神经鞘瘤的异质性和肿瘤微环境，发现了与神经损伤修复相关的细胞类型和分子途径 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探究前庭神经鞘瘤的异质性和肿瘤微环境对其发病机制的影响 | 前庭神经鞘瘤及其肿瘤微环境中的多种细胞类型 | 数字病理学 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq）、外显子测序 | NA | RNA表达数据 | 15个前庭神经鞘瘤样本，其中6个样本进行了配对的单细胞ATAC测序，12个样本进行了外显子测序 |
| 1100 | 2024-08-04 |
Expression of EPB41L2 in Cancer-Associated Fibroblasts: Prognostic Implications for Bladder Cancer and Response to Immunotherapy
2024-01, Archives of medical research
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.arcmed.2023.102927
PMID:38154234
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研究论文 | 研究了EPB41L2在膀胱癌相关成纤维细胞中的表达及其对免疫治疗的预后意义 | 首次确认了EPB41L2在膀胱癌相关成纤维细胞中的上调及其与肿瘤微环境重塑的相关性 | 未提供关于其他潜在生物标志物比较的数据 | 评估EPB41L2作为预测膀胱癌免疫治疗反应的生物标志物的潜力 | 膀胱癌患者的肿瘤微环境及相关生物标志物 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 免疫组化（IHC）和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织切片 | IMvigor210队列的患者样本和正常组织对照 |