单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 1081 - 1100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2024-08-04 |
Advances in the Application of Single-Cell Transcriptomics in Plant Systems and Synthetic Biology
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0029
PMID:38435807
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综述 | 本文总结了单细胞转录组在植物系统和合成生物学中的应用进展 | 探讨了单细胞RNA测序技术在植物生物系统设计和合成生物学中的潜在应用及未来技术进展的影响 | 目前单细胞RNA测序的应用仅限于少量植物物种，且技术成本较高 | 旨在提供单细胞RNA测序在植物样本中的选择指南，并探讨其在植物系统生物学和合成生物学中的不同应用 | 植物生物系统及其合成生物学研究 | 合成生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 仅限于少量植物物种，包括模型植物、农业作物和生物能源作物 |
| 1082 | 2024-08-07 |
Integrative Omics Analysis Reveals Metabolic Features of Ground-Glass Opacity-Associated Lung Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.92437
PMID:38434969
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研究论文 | 本研究通过代谢组学和转录组学分析，揭示了磨玻璃影（GGO）相关肺癌的代谢特征 | 首次全面探讨了GGO相关肺癌的代谢特征和关键代谢基因，特别是发现MAOB在抑制LUAD细胞增殖和转移中的重要作用 | 研究样本量有限，且仅限于GGO相关肺癌，未来需扩大样本量并验证其他类型肺癌中的发现 | 识别GGO相关肺癌的异常代谢途径和关键代谢基因，为该疾病的诊断和治疗提供新策略 | GGO相关肺癌组织及其邻近正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 代谢组学分析, 转录组学分析, 实时定量PCR | NA | 基因表达数据, 代谢数据 | 40对GGO相关肺癌组织及邻近正常组织 |
| 1083 | 2024-08-07 |
Mendelian Randomization Validates the Immune Landscape Mediated by Aggrephagy in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Patients from the Perspectives of Multi-omics
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.93376
PMID:38434988
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研究论文 | 通过生物信息学方法研究食管鳞状细胞癌（ESCC）患者中由自噬介导的免疫景观，并利用孟德尔随机化方法识别与食管癌有因果关系的预后细胞簇基因。 | 揭示了自噬相关簇在介导ESCC患者预后和免疫治疗中的作用，并识别出与食管癌发生有因果关系的基因。 | NA | 阐明自噬在ESCC患者中调节的免疫景观，并识别与食管癌有因果关系的预后细胞簇基因。 | 食管鳞状细胞癌患者的免疫景观和预后细胞簇基因。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序 | NMF聚类 | 单细胞转录组数据 | 19种不同的细胞亚群 |
| 1084 | 2024-08-07 |
Characterizing CD8+ TEMRA Cells in CP/CPPS Patients: Insights from Targeted Single-Cell Transcriptomic and Functional Investigations
2024, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S451199
PMID:38435982
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研究论文 | 本研究通过靶向单细胞转录组学和功能研究，探讨了CD8+ TEMRA细胞在慢性前列腺炎/慢性骨盆疼痛综合征（CP/CPPS）患者中的作用 | 首次详细探索了CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS患者中的具体作用，并揭示了其在疾病发病机制中的关键角色 | 研究样本量较小，仅包括两名CP/CPPS患者和两名健康对照 | 阐明CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS中的作用，并寻找潜在的治疗靶点 | CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS患者中的分子特征和功能 | NA | 慢性前列腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 两名CP/CPPS患者和两名健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs） |
| 1085 | 2024-08-07 |
Co-differential genes between DKD and aging: implications for a diagnostic model of DKD
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17046
PMID:38435999
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研究论文 | 本研究通过筛选糖尿病肾病（DKD）和衰老相关的共同差异基因，构建了一个基于这些基因的DKD诊断模型 | 发现了DKD和衰老之间的共同差异基因，并基于这些基因开发了一个遗传诊断模型 | NA | 探索糖尿病肾病（DKD）和衰老之间的共同差异基因，并建立一个基于这些基因的DKD诊断模型 | 糖尿病肾病（DKD）和衰老相关的共同差异基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归 | 基因表达数据 | DKD小鼠模型（通过链脲佐菌素（STZ）注射构建并由组织切片染色确认） |
| 1086 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial multi-omics highlight effects of anti-integrin therapy across cellular compartments in ulcerative colitis
2024-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.21.525036
PMID:36711576
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研究论文 | 本文研究了抗整合素疗法对溃疡性结肠炎中细胞不同群体的影响 | 首次通过单细胞转录组和蛋白组分析揭示了VDZ对炎症细胞的影响及其在溃疡性结肠炎中的作用 | 本研究未详细阐明VDZ对于其他细胞亚群体的广泛影响 | 确定参与溃疡性结肠炎的炎症细胞及其受VDZ影响的程度 | 健康对照组及接受VDZ或其他疗法的溃疡性结肠炎患者的外周血和结肠活检样本 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学和蛋白组学分析 | NA | 外周血和结肠活检样本 | 健康对照组和接受不同治疗的溃疡性结肠炎患者的样本 |
| 1087 | 2024-08-04 |
Conceptual Framework of Epigenetic Analyses of Plant Responses to Sedentary Endoparasitic Nematodes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3638-1_12
PMID:38427303
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章节 | 本章节提供了一种用于研究植物与寄生线虫相互作用的表观遗传调控的概念框架 | 提供了针对miRNA调控和功能的当前及新兴方法的详细分析 | 文章提到了一些方法的局限性并讨论如何克服这些问题 | 阐明植物与寄生线虫相互作用过程中的表观遗传调控 | 关注植物表观基因组中各种成分在寄生线虫感染中的作用 | NA | NA | 单细胞测序技术、基因组编辑 | NA | NA | NA |
| 1088 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the mechanism of PI3K/AKT/mTOR signaling pathway activation in lung adenocarcinoma by KRAS mutation
2024-Jan, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3658
PMID:38282149
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了KRAS突变在肺腺癌中激活PI3K/AKT/mTOR信号通路的机制 | 首次详细探讨了KRAS突变对肺腺癌中PI3K/AKT/mTOR信号通路活性的影响 | NA | 探讨KRAS突变在肺腺癌中激活PI3K/AKT/mTOR信号通路的机制 | 肺腺癌中的KRAS突变及其对PI3K/AKT/mTOR信号通路的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用The Cancer Genome Atlas数据库中的肺腺癌患者样本 |
| 1089 | 2024-08-07 |
Comprehensive profiling of cell subsets of gastric cancer and liver metastasis based on single cell RNA-sequencing analysis
2024-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-1532
PMID:38410212
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对胃癌及其肝转移的细胞亚型进行全面分析 | 揭示了胃癌原发肿瘤和肝转移在基因表达上的差异及其对患者预后的影响 | NA | 通过单细胞RNA测序评估胃癌及其肝转移的细胞亚型，并理解其分子机制 | 胃癌及其肝转移的细胞亚型和分子机制 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)的GSE163558数据集 |
| 1090 | 2024-08-05 |
Mapping cancer biology in space: applications and perspectives on spatial omics for oncology
2024-01-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-01941-z
PMID:38291400
|
研究论文 | 本文探讨了空间组学技术在肿瘤生物学中的应用和前景 | 提出了通过空间技术映射肿瘤异质性和微环境的新方法 | 缺乏针对特定模型应用空间技术的详细说明 | 研究空间组学在肿瘤学中的应用以解决肿瘤异质性等问题 | 聚焦于肿瘤及其微环境的空间特征 | 数字病理学 | 癌症 | 空间组学技术 | NA | 组织样本 | NA |
| 1091 | 2024-08-07 |
Identification of HSP90B1 in pan-cancer hallmarks to aid development of a potential therapeutic target
2024-01-20, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01920-w
PMID:38243263
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和队列验证，探讨了HSP90B1在泛癌中的动态表达，并全面评估其作为新型生物标志物的潜力，以助力精准癌症诊断和治疗的发展。 | 本研究首次全面评估HSP90B1作为癌症诊断和治疗的新型生物标志物，并发现其表达与多种癌症特征的相关性，包括免疫浸润、微卫星不稳定性、肿瘤突变负荷和肿瘤代谢等。 | NA | 探讨HSP90B1在泛癌中的表达及其作为潜在治疗靶点的可能性。 | HSP90B1在泛癌中的表达及其与癌症发展和预后的关系。 | 数字病理学 | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个癌症类型的肿瘤样本 |
| 1092 | 2024-08-05 |
Assembling spatial clustering framework for heterogeneous spatial transcriptomics data with GRAPHDeep
2024-01-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae023
PMID:38243703
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研究论文 | 本文提出了GRAPHDeep以组装异构空间转录组数据的空间聚类框架 | 提出了新的空间聚类方法并比较了现有算法的有效性，强调了基因或蛋白质数量在空间聚类算法中的重要性 | 需要进一步探索适当的图深度学习模块和图神经网络 | 研究空间转录组数据分析中的空间聚类问题 | 异构空间转录组数据 | 计算机视觉 | NA | 图神经网络 | 变分图自编码器 | 空间组学数据 | NA |
| 1093 | 2024-08-05 |
scMAE: a masked autoencoder for single-cell RNA-seq clustering
2024-01-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae020
PMID:38230824
|
研究论文 | 提出了一种基于掩码自编码器的细胞聚类新方法scMAE | scMAE通过引入掩码预测器，捕捉基因之间的关系，从而增强了聚类性能 | 未提及具体的限制 | 旨在提高scRNA-seq数据分析中的细胞聚类效果 | 针对15个来自不同测序平台的scRNA-seq数据集进行细胞聚类 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 掩码自编码器 | 基因表达数据 | 15个scRNA-seq数据集 |
| 1094 | 2024-08-07 |
Ribogenesis boosts controlled by HEATR1-MYC interplay promote transition into brain tumour growth
2024-Jan, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-023-00017-1
PMID:38225354
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研究论文 | 本文揭示了脑肿瘤启动细胞（TICs）在向肿瘤生长过渡期间，通过HEATR1-MYC相互作用增强核糖体生物发生的过程。 | 首次提出脑TICs在肿瘤生长前增强核糖体生物发生，并揭示了HEATR1与MYC结合促进核糖体RNA生成和TIC扩大的机制。 | NA | 研究肿瘤启动细胞向肿瘤生长过渡的早期事件及其分子机制。 | 脑肿瘤启动细胞（TICs）及其在肿瘤生长过程中的分子调控。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用果蝇神经干细胞模型进行研究 |
| 1095 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed That the Enrichment of TPI1+ Malignant Hepatocytes Was Linked to HCC Metastasis and Immunosuppressive Microenvironment
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S453249
PMID:38410699
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了TPI1+恶性肝细胞在肝细胞癌（HCC）转移和免疫抑制微环境中的作用 | 首次发现TPI1+恶性肝细胞群与HCC转移和免疫抑制微环境的关联，为HCC免疫治疗提供了新的潜在生物标志物 | 研究样本量较小，仅基于10个HCC样本的数据，可能影响结果的普遍性 | 探讨HCC转移相关微环境中特定细胞群的作用 | HCC组织及其邻近和正常组织样本中的恶性肝细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 10个HCC样本 |
| 1096 | 2024-08-07 |
Correlation of Myeloid-Derived Suppressor Cell Expansion with Upregulated Transposable Elements in Severe COVID-19 Unveiled in Single-Cell RNA Sequencing Reanalysis
2024-Jan-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12020315
PMID:38397917
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研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，探讨了可转座元件（TEs）在严重COVID-19患者中的表达与髓源抑制细胞（MDSCs）扩增之间的关联。 | 首次在单细胞水平上研究了可转座元件表达与COVID-19免疫反应中细胞功能的可能关联。 | 研究样本量较小，仅包括六名严重COVID-19患者和三名健康捐赠者的支气管肺泡灌洗样本。 | 评估可转座元件表达与严重COVID-19患者中由SARS-CoV-2引发的免疫反应之间的可能关联。 | 严重COVID-19患者的支气管肺泡灌洗样本中的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 六名严重COVID-19患者和三名健康捐赠者的样本 |
| 1097 | 2024-08-04 |
Pan-Cancer Analysis Reveals Disulfidoptosis-Associated Genes as Promising Immunotherapeutic Targets: Insights Gained from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-Jan-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12020267
PMID:38397869
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研究论文 | 本研究探讨了与二硫化死亡相关的基因作为免疫治疗靶标的潜力 | 首次揭示二硫化死亡在不同肿瘤中的免疫和预后作用 | 研究主要依赖于公共数据库数据，缺乏临床实验证据 | 揭示二硫化死亡在肿瘤发生中的机制和临床应用潜力 | 研究了与二硫化死亡相关的基因在多种癌症中的表达及其临床意义 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，实时PCR，西方印迹 | NA | 基因表达数据，细胞系数据 | 包括多种癌症样本与细胞系的比较，具体数量未提及 |
| 1098 | 2024-08-04 |
Role and Therapeutic Potential for Targeting Fibroblast Growth Factor 10/FGFR1 in Relapsed Rheumatoid Arthritis
2024-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42674
PMID:37584284
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研究论文 | 该文章探讨了针对成纤维细胞生长因子10/FGFR1在复发性类风湿关节炎中的作用和治疗潜力 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示FLS异质性及其在复发与缓解中的作用，提出针对FGF10/FGFR1的靶向治疗的新思路 | 样本数量较少，仅包含六个配对的滑膜组织样本，限制了结果的广泛适用性 | 本研究旨在识别成纤维细胞样滑膜细胞(FLSs)的异质性及其在复发性类风湿关节炎中的致病作用 | 研究对象为三名复发性RA患者和三名缓解期患者的滑膜组织样本 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学 | 胶原诱导关节炎(CIA)模型 | 组织样本 | 六个配对的滑膜组织样本 |
| 1099 | 2024-08-07 |
Endothelial Response to Type I Interferon Contributes to Vasculopathy and Fibrosis and Predicts Disease Progression of Systemic Sclerosis
2024-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42662
PMID:37488975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨了I型干扰素在系统性硬化症患者中的作用及其对疾病进展的影响。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞中I型干扰素信号在系统性硬化症中的显著特征，并验证了其在疾病进展预测中的作用。 | 研究样本量相对较小，需要进一步的大规模研究来验证这些发现。 | 探讨I型干扰素在系统性硬化症中的作用及其对疾病进展的影响。 | 系统性硬化症患者的皮肤组织。 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 61名系统性硬化症患者 |
| 1100 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of the impact of emerging flame retardants on prostate cancer progression: The potential molecular mechanisms and immune infiltration landscape
2024-01, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2023.153681
PMID:38006928
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研究论文 | 研究探讨新兴阻燃剂与前列腺癌之间的关联及其潜在的致癌机制和免疫浸润情况 | 构建了一个具有良好预测能力的前列腺癌风险模型，并验证了六个与阻燃剂相关的预后基因 | NA | 探索新兴阻燃剂与前列腺癌之间的联系及其潜在的致癌机制 | 新兴阻燃剂对前列腺癌进展的影响及其分子机制和免疫浸润情况 | NA | 前列腺癌 | 蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用TCGA数据集和GSE70769数据集进行验证 |