单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 1061 - 1080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2024-08-07 |
Coniferyl ferulate alleviate xylene-caused hematopoietic stem and progenitor cell toxicity by Mgst2
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1334445
PMID:38523643
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了松脂素阿魏酸酯（CF）通过靶向Mgst2基因减轻二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的作用 | 首次揭示了松脂素阿魏酸酯通过靶向Mgst2基因减轻二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的新机制 | NA | 探讨松脂素阿魏酸酯对二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的缓解作用及其分子机制 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs）及二甲苯引起的毒性 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的骨髓造血干细胞和祖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1062 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals landscape of endometrial cancer response to estrogen and identification of early diagnostic markers
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0301128
PMID:38517922
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了子宫内膜癌对雌激素反应的景观，并识别了早期诊断标志物 | 本研究首次在单细胞分辨率下阐明了子宫内膜癌对雌激素反应的潜在生物学机制，并识别了24个早期诊断标志物 | NA | 探讨子宫内膜癌对雌激素的反应机制，并寻找早期诊断标志物 | 子宫内膜癌细胞及其对雌激素的反应 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST） | 逻辑回归（LR）、高斯朴素贝叶斯（GaussianNB）、k-最近邻（KNN）、支持向量机（SVM）、极端梯度提升（XGB）和神经网络（NK） | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1063 | 2024-08-04 |
Long-read single-cell sequencing reveals expressions of hypermutation clusters of isoforms in human liver cancer cells
2024-Jan-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87607
PMID:38206124
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于LOOPSeq技术的合成长读取单细胞测序技术，以分析人类肝癌细胞中的超突变亚型表达 | 本研究的创新点在于应用LOOPSeq技术实现精确的长读取单细胞转录组测序，并识别出特定于肝癌细胞的突变mRNA亚型 | 本研究的局限性未具体提到，故为NA | 本研究旨在揭示人类肝癌细胞中蛋白表达谱的复杂性 | 本研究对象为来自个体的447个肝细胞癌和良性肝脏转录组 | 数字病理学 | 肝癌 | 长读取测序 | NA | 转录组 | 447个转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1064 | 2024-08-07 |
Stiffness-dependent MSC homing and differentiation into CAFs - implications for breast cancer invasion
2024-01-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.261145
PMID:38108421
|
研究论文 | 研究探讨了肿瘤微环境中癌细胞与间充质干细胞（MSCs）在不同硬度基质下的相互作用如何影响三阴性乳腺癌（TNBC）的侵袭性 | 首次展示了在预转移阶段，MSCs向癌症相关成纤维细胞（CAFs）的分化如何促进TNBC的侵袭和转移 | NA | 研究肿瘤微环境中细胞异质性和细胞外基质（ECM）硬化对乳腺癌侵袭性的影响 | 三阴性乳腺癌（TNBC）中的间充质干细胞（MSCs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及高侵袭性三阴性乳腺癌（TNBC）的原发肿瘤、次级部位和循环肿瘤细胞簇中的亚群细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1065 | 2024-08-07 |
Chronic active Epstein-Barr virus disease originates from infected hematopoietic stem cells
2024-01-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021074
PMID:37824804
|
研究论文 | 本研究通过多种检测方法，包括定量聚合酶链反应、PrimeFlow和单细胞RNA测序，分析了慢性活动性EB病毒病（CAEBV）患者的骨髓和外周血细胞，揭示了CAEBV疾病的起源及其对免疫系统的影响 | 首次通过单细胞RNA测序等技术证实CAEBV疾病起源于感染的造血干细胞，并展示了EBV感染对免疫系统的具体影响 | 研究样本量较小，仅包括5名CAEBV患者和少数对照组，可能影响结果的普遍性 | 探究慢性活动性EB病毒病的病因及其对免疫系统的影响 | 慢性活动性EB病毒病患者的骨髓和外周血细胞 | NA | 慢性活动性EB病毒病 | 定量聚合酶链反应、PrimeFlow、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名CAEBV患者、1名EBV相关噬血细胞性淋巴组织细胞增生症患者和2名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 1066 | 2024-08-04 |
Comparative and integrative single cell analysis reveals new insights into the transcriptional immaturity of stem cell-derived β cells
2024-Jan-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10013-x
PMID:38267908
|
研究论文 | 文章探讨了干细胞衍生的β细胞（SC-β细胞）的转录身份，尤其是与原代胎儿和成年β细胞的关系 | 揭示了SC-β细胞具有独特的转录特征，特别是持续表达和激活前体和神经偏向基因网络 | 尚未明确SC-β细胞与原代β细胞的关系，需要进一步研究 | 研究干细胞衍生β细胞的转录身份及其发育过程中神经转录网络的作用 | 研究对象为干细胞衍生的β细胞、胎儿β细胞和成年β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 转录数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1067 | 2024-08-04 |
Stimulated Human Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells Enhance the Osteogenesis and Cranial Bone Regeneration through IL-32 Mediated P38 Signaling Pathway
2024, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2024/6693292
PMID:38510207
|
研究论文 | 本研究探讨了刺激人脐带间充质干细胞（S-HuMSCs）对骨生成和颅骨再生的影响，重点分析了IL-32介导的P38信号通路 | 发现IL-32可以通过激活P38信号通路增强间充质干细胞的骨生成分化，揭示了IL-32在颅骨损伤治疗中的潜在疗效 | 本研究主要在体外和动物模型中进行，临床应用的效果尚待进一步验证 | 研究刺激人脐带间充质干细胞对骨生成及颅骨再生的机制 | 人脐带间充质干细胞（S-HuMSCs）及其IL-32高表达变体（IL-32highHuMSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、流式细胞术、定量实时聚合酶链反应、西方印迹 | NA | 细胞、组织 | 实验中使用了多种细胞类型和一只大鼠颅骨缺损模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1068 | 2024-08-07 |
Identification of Transcriptomic Signatures of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma-Derived Exosomes That Promote Macrophage M2 Polarization and Predict Prognosis: S100A9 Reveals Tumor Progression
2024, Clinical Medicine Insights. Oncology
DOI:10.1177/11795549241239042
PMID:38510315
|
研究论文 | 本研究通过分析胰腺导管腺癌（PDAC）细胞衍生的外泌体中的关键基因，揭示了其促进巨噬细胞M2极化并预测预后的机制，特别是S100A9在肿瘤进展中的作用 | 本研究首次建立了PDAC衍生外泌体和M2巨噬细胞的风险评分模型，并揭示了S100A9在巨噬细胞M2极化中的重要作用 | NA | 探讨胰腺导管腺癌细胞衍生的外泌体如何促进巨噬细胞M2极化及其在预后预测中的作用 | 胰腺导管腺癌细胞衍生的外泌体、巨噬细胞M2极化、S100A9基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 差异表达基因分析（DEGs）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、多变量Cox回归分析、定量聚合酶链反应（qPCR）、蛋白质印迹（western blot）、流式细胞术、细胞转染、Transwell实验、CCK-8实验 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 使用来自exoRbase 2.0、TCGA和ICGC数据库的数据，以及BxPC-3细胞系的外泌体进行体外实验 | NA | NA | NA | NA |
| 1069 | 2024-08-04 |
Integrated analysis reveals crosstalk between pyroptosis and immune regulation in renal fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1247382
PMID:38343546
|
研究论文 | 这项研究探讨了程序性焦亡在肾纤维化中的免疫微环境调节中的潜在作用 | 本研究揭示了程序性焦亡与免疫调节之间的交叉作用，并识别了五种中心调节因子作为肾纤维化的生物标志物 | 本研究的局限性在于使用的是动物模型，可能无法完全反映人类肾纤维化的复杂性 | 研究肾纤维化中程序性焦亡与免疫微环境之间的关系 | 研究对象为肾纤维化患者的样本和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包括肾纤维化和正常肾样本的27个程序性焦亡相关调节因子的评估 | NA | NA | NA | NA |
| 1070 | 2024-08-07 |
"The Good, the Bad, and the Ugly" - About Diverse Phenotypes of Hepatic Stellate Cells in the Liver
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.002
PMID:38216053
|
research paper | 本文探讨了肝星状细胞（HSCs）及其激活衍生物在慢性肝损伤进展中的多样性表型及其作用 | 利用遗传谱系追踪模型和单细胞转录组及蛋白质组分析技术，揭示了HSC和MF群体在健康状态及慢性肝损伤各阶段组织变形中的隐藏异质性 | NA | 识别HSC/MF轴上的不同表型，为针对特定MF表型作为慢性肝损伤潜在治疗方法奠定基础 | 肝星状细胞（HSCs）及其激活衍生物，即肌成纤维细胞（MFs） | NA | 肝病 | 遗传谱系追踪模型，单细胞转录组及蛋白质组分析 | NA | 转录组，蛋白质组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1071 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics and single-nucleus RNA sequencing reveal a transcriptomic atlas of adult human spinal cord
2024-Jan-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92046
PMID:38289829
|
研究论文 | 该文章揭示了成人人体脊髓的转录组图谱，分类了脊髓神经元并分析了其空间分布 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组技术对成人脊髓神经元进行详细分类和空间分布研究 | 成人脊髓的细胞异质性的分子证据相对有限 | 研究成人脊髓神经元的类型和功能异质性 | 来自九名人类供体的脊髓神经元 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单核RNA测序和空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 来自九名人类供体的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1072 | 2024-08-07 |
Opportunities and tradeoffs in single-cell transcriptomic technologies
2024-01, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2023.10.003
PMID:37953195
|
review | 本文综述了单细胞转录组技术的最新进展及其优缺点 | 介绍了长读长测序方法在单细胞转录组分析中的应用，突破了以往全转录组表征的障碍 | 单细胞转录组分析中仍存在细胞数量与全长转录本覆盖度之间的权衡问题 | 全面概述单细胞转录组分析的可用选项，并强调每种方法的关键优缺点 | 单细胞转录组技术及其应用 | NA | NA | 长读长测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1073 | 2024-08-04 |
DOT1L promotes expression of CD44 through the Wnt/β-catenin signaling pathway in early gastric carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.90170
PMID:38495505
|
研究论文 | 本研究评估了DOT1L基因在胃癌组织中的表达及其促进癌症干细胞介导的上皮-间质转化的功能 | 发现DOT1L通过Wnt/β-连环蛋白信号通路促进CD44的表达，揭示了其在胃癌干细胞调节中的重要性 | 样本量相对较小，限制了结果的广泛适用性和外推性 | 研究DOT1L在早期胃癌中的作用及其机制 | 通过单细胞测序分析早期胃癌和低级别上皮内瘤变的组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序、单细胞测序 | NA | 组织样本 | 24个样本（来自8名患者的3个阶段，其中每个阶段各8个样本） | NA | NA | NA | NA |
| 1074 | 2024-08-04 |
Identification of T-cell exhaustion-related genes and prediction of their immunotherapeutic role in lung adenocarcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.92839
PMID:38495503
|
研究论文 | 本文探讨了与T细胞耗竭相关的基因及其在肺腺癌免疫治疗中的预测作用 | 构建了一个基于T细胞耗竭的模型，用于评估肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 未提及具体的实验限制 | 探讨T细胞耗竭对肿瘤微环境的影响及其在肺腺癌中的作用 | 肺腺癌患者的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq (scRNA-seq)，RNA-seq | LASSO-Cox分析 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO的LUAD患者数据，涉及多个验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 1075 | 2024-08-07 |
Inhibiting PLA2G7 reverses the immunosuppressive function of intratumoral macrophages and augments immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2024-01-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008094
PMID:38272562
|
研究论文 | 本文研究了磷脂酶A2组VII（PLA2G7）在肝细胞癌（HCC）中的作用，并探讨了抑制PLA2G7对肿瘤内巨噬细胞免疫抑制功能的影响及其在免疫治疗中的应用 | 发现PLA2G7在肿瘤内巨噬细胞中的高表达与免疫治疗抵抗和预后不良相关，并通过药物抑制PLA2G7增强了免疫检查点阻断疗法的疗效 | NA | 旨在识别与HCC进展及免疫治疗抵抗相关的巨噬细胞亚群 | 肝细胞癌（HCC）中的肿瘤内巨噬细胞及其对免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及HCC患者的组织样本及HCC小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1076 | 2024-08-07 |
Biomarkers of Pathologic Complete Response to Neoadjuvant Immunotherapy in Mismatch Repair-Deficient Colorectal Cancer
2024-01-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-2213
PMID:37906636
|
研究论文 | 本研究旨在识别错配修复缺陷型结直肠癌患者对新辅助免疫治疗病理完全反应的生物标志物 | 本研究首次综合分析了基因组、转录组和免疫细胞密度，以及肿瘤微环境对病理完全反应的影响 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探索错配修复缺陷型结直肠癌患者对新辅助免疫治疗反应的生物标志物 | 42名接受新辅助PD-1阻断治疗的错配修复缺陷型结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 下一代测序, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 免疫细胞密度数据 | 42名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1077 | 2024-08-07 |
scRNA-Seq and Bulk-Seq Analysis Identifies S100A9 Plasma Cells as a Potentially Effective Immunotherapeutic Agent for Multiple Myeloma
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S452062
PMID:38481477
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量测序技术分析多发性骨髓瘤患者，识别出S100A9浆细胞作为潜在有效的免疫治疗剂 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量测序技术，识别出S100A9浆细胞在多发性骨髓瘤免疫治疗中的潜在作用 | NA | 研究多发性骨髓瘤的免疫治疗策略 | 多发性骨髓瘤患者的浆细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量测序 | NA | RNA | 多发性骨髓瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1078 | 2024-08-07 |
Data-driven detection of age-related arbitrary monotonic changes in single-cell gene expression distributions
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16851
PMID:38344300
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新的工作流程，用于检测单细胞表达谱中与年龄相关的任意单调变化分布 | 使用信息论量化分布差异，并通过距离矩阵进行关联分析 | NA | 理解衰老背后的机制 | 单细胞基因表达随年龄的变化 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1079 | 2024-08-04 |
Signaling Pathway Alterations Driven by BRCA1 and BRCA2 Germline Mutations are Sufficient to Initiate Breast Tumorigenesis by the PIK3CAH1047R Oncogene
2024-01-05, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0330
PMID:38059556
|
研究论文 | 本研究生成了BRCA1和BRCA2突变携带者乳腺组织的单细胞转录组图谱，并与健康非携带者进行了比较 | 首次揭示了BRCA1和BRCA2突变对乳腺上皮细胞转录组的特定影响，并阐明了其与肿瘤发生的关系 | 本研究的样本仅限于BRCA1和BRCA2突变携带者，未能涵盖所有类型的乳腺癌变异 | 研究BRCA1和BRCA2突变在乳腺肿瘤发生中的信号通路改变 | BRCA1和BRCA2突变携带者及健康非携带者的乳腺上皮细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | BRCA1和BRCA2突变携带者的乳腺组织样本与健康非携带者样本进行比较 | NA | NA | NA | NA |
| 1080 | 2024-08-04 |
Spatial Distribution of Immune Cells Drives Resistance to Neoadjuvant Chemotherapy in Triple-Negative Breast Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0076
PMID:37856875
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学探讨三阴性乳腺癌中免疫细胞的空间分布对新辅助化疗的影响 | 研究通过空间转录组学的方法，更深入地理解了三阴性乳腺癌生态系统的复杂元素及其与新辅助化疗反应之间的关系 | 研究基于回顾性病例系列，样本量相对较小，仅包含24名患者 | 旨在探索三阴性乳腺癌对新辅助化疗反应的机制 | 涉及24名三阴性乳腺癌患者，其中12名患者经历了病理完全反应，12名患者则未反应或疾病进展 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 24例三阴性乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |