单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 1061 - 1080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2024-08-07 |
Targeting tumor-stromal interactions in triple-negative breast cancer using a human vascularized micro-tumor model
2024-01-05, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01760-y
PMID:38183074
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研究论文 | 本研究利用人血管化微肿瘤模型，探索三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子基础及潜在治疗靶点 | 采用先进的体外微生理系统——血管化微肿瘤模型，结合单细胞RNA测序技术，揭示了正常乳腺组织基质细胞在三阴性乳腺癌微环境中的促癌信号通路 | NA | 研究三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子机制，并探索潜在的治疗靶点 | 三阴性乳腺癌中的肿瘤-基质相互作用及其治疗靶点 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 血管化微肿瘤模型 | RNA | NA |
| 1062 | 2024-08-04 |
Tumor-associated macrophages promoting PD-L1 expression in infiltrating B cells through the CXCL12/CXCR4 axis in human hepatocellular carcinoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38455420
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研究论文 | 该研究探讨了肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞通过CXCL12/CXCR4轴促进浸润B细胞PD-L1表达的机制 | 发现了一种新型的调节性B细胞PD-L1 Bregs，揭示了它们与CXCL12 TAMs之间的相互作用以及其在肝细胞癌中的作用 | 该研究的局限性可能在于基于单细胞RNA-seq数据的分析，这可能不能完全代表肿瘤微环境的复杂性 | 研究肝细胞癌中细胞间通信的机制 | 调节性B细胞、肿瘤相关巨噬细胞及其在肝细胞癌中的相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA-seq、免疫组化 | 小鼠模型 | RNA序列数据 | 使用了小鼠模型进行实验验证，具体样本数量未提供 |
| 1063 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals one cancer-associated fibroblasts subtype linked to metastasis in breast cancer: MXRA5 as a potential novel marker for prognosis
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38455411
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了乳腺癌中与转移相关的特定癌症相关成纤维细胞亚型FN1+CAF2，并鉴定了MXRA5作为潜在的新型预后标志物。 | 首次识别出与乳腺癌转移相关的特定癌症相关成纤维细胞亚型FN1+CAF2，并发现MXRA5可能作为新的标志物参与乳腺癌转移的调控。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未来需要更多的实验验证MXRA5在乳腺癌转移中的具体作用机制。 | 揭示乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在转移中的作用，寻找新的预后标志物。 | 乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞及其亚型，以及它们与乳腺癌转移的关系。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个乳腺癌患者的组织样本 |
| 1064 | 2024-08-04 |
Connecting genomic results for psychiatric disorders to human brain cell types and regions reveals convergence with functional connectivity
2024-Jan-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.01.18.24301478
PMID:38410450
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研究论文 | 本研究整合了精神障碍的基因组结果与人脑细胞类型和区域，揭示了功能连接的汇聚 | 本研究利用人类成年大脑综合图谱，重点关注精神障碍的特定神经元簇，并探讨了其与基因组和转录组数据的结合 | 先前的研究主要依赖于小鼠图谱，可能限制了结果的普遍适用性 | 探讨精神障碍的时间和空间脑区，促进针对性的神经生物研究 | 包括精神分裂症、双相障碍和重度抑郁障碍的神经元簇及其与智力、教育和神经质的关系 | 数字病理学 | 精神障碍 | 单细胞转录组技术 | NA | 基因组、转录组和功能MRI连接数据 | 精神分裂症患者与神经典型对照的功能MRI数据 |
| 1065 | 2024-08-07 |
Soluble TREM2 triggers microglial dysfunction in neuromyelitis optica spectrum disorders
2024-01-04, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awad321
PMID:37740498
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研究论文 | 研究探讨了可溶性触发受体表达于髓样细胞2（sTREM2）在神经脊髓炎视谱系疾病（NMOSD）中的病理生理作用及其作为生物标志物的潜力 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序，揭示了sTREM2与NMOSD风险之间的遗传关联，并阐明了sTREM2介导的微胶质细胞功能障碍的分子机制 | NA | 阐明sTREM2在NMOSD中的病理生理作用及其作为治疗靶点的潜力 | sTREM2在NMOSD患者中的表达及其对微胶质细胞功能的影响 | 神经科学 | 神经脊髓炎视谱系疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类巨噬细胞/微胶质样细胞样本 |
| 1066 | 2024-08-07 |
Characterizing hedgehog pathway features in senescence associated osteoarthritis through Integrative multi-omics and machine learning analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1255455
PMID:38444758
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研究论文 | 本研究通过整合多组学和机器学习分析，探讨了Hedgehog信号通路在衰老相关骨关节炎中的特征 | 首次结合Bulk RNA-seq和scRNA-seq技术，识别并验证了与骨关节炎相关的Hedgehog信号通路中的关键基因 | NA | 旨在阐明Hedgehog信号通路在骨关节炎发病机制中的作用 | 骨关节炎中的Hedgehog信号通路及相关基因 | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq, scRNA-seq, Real-time PCR | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及八个Bulk RNA-seq数据集和一个scRNA-seq数据集 |
| 1067 | 2024-08-04 |
A novel variable neighborhood search approach for cell clustering for spatial transcriptomics
2024, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.109
PMID:38440167
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研究论文 | 本文提出了一种新的基于可变邻域搜索的细胞聚类方法，结合基因表达和空间坐标进行细胞聚类 | 引入了基于可变邻域搜索的模型，超越了传统细胞类型聚类，能够在空间域中进行聚类 | NA | 研究细胞聚类的方法，特别是在空间转录组学领域 | 细胞聚类，基于基因表达和空间坐标的信息 | 数字病理学 | NA | 可变邻域搜索 | NA | 基因表达矩阵和空间坐标 | NA |
| 1068 | 2024-08-04 |
Molecular classification of small cell lung cancer subtypes: Characteristics, prognostic factors, and clinical translation
2024-Jan-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002693
PMID:37660289
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综述 | 本文回顾并总结了小细胞肺癌的分子分类特征、预后因素和临床应用。 | 研究了基于小细胞肺癌的关键转录因子的新兴分子分类，为肿瘤的病理生理学、转移、免疫微环境及获得性治疗抵抗提供了更多信息 | NA | 探讨小细胞肺癌的分子分类及其临床转化 | 小细胞肺癌的不同亚型及其特征 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序分析 | NA | NA | NA |
| 1069 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal different maturation stages and sublineage commitment of human thymic invariant natural killer T cells
2024-01-19, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad113
PMID:37742056
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研究论文 | 本研究揭示了人类胸腺不变自然杀伤T细胞不同的成熟阶段和亚谱系承诺 | 首次定义了人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育过程中的成熟阶段，并评估了亚谱系承诺 | 研究仅限于从胸腺中提取的细胞，缺乏对外周血中细胞的广泛分析 | 探讨人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育中的成熟阶段和亚谱系承诺 | 人类Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从胸腺提取的Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞 |
| 1070 | 2024-08-04 |
Role of immune cells in the pathogenesis of myocarditis
2024-01-19, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad143
PMID:37949833
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研究论文 | 此文章总结了免疫细胞在心肌炎发病机制中的角色 | 本研究强调了免疫细胞的复杂性和细胞间相互作用对心肌炎病理过程的重要性 | 目前尚不清楚心肌炎的详细发病机制 | 探讨免疫细胞在心肌炎发病机制中的作用 | 研究涉及心肌炎患者及多种动物模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心肌炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 1071 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics of Treg reveals hallmarks and trajectories of immunological aging
2024-01-05, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad104
PMID:37675661
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研究论文 | 研究了与年龄相关的免疫衰老对CD4+调节性T细胞的影响 | 识别了6个转录组特异性克隆的调节性T细胞，并揭示了与衰老相关的特征和变化轨迹 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 探讨老化对调节性T细胞的影响以及与免疫衰老相关的机制 | 小鼠淋巴和脂肪组织来源的调节性T细胞 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 针对3个月、18个月和24个月龄小鼠的调节性T细胞进行分析 |
| 1072 | 2024-08-07 |
BCG vaccination induces innate immune memory in γδ T cells in humans
2024-01-05, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad103
PMID:37672677
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研究论文 | 本研究探讨了卡介苗（BCG）疫苗是否能在人类γδ T细胞中诱导出训练免疫，从而增强其对异源细菌和真菌感染的交叉保护作用 | 首次证明了BCG疫苗能在人类γδ T细胞中诱导出训练免疫，增强其对异源细菌和真菌刺激的反应性 | NA | 确定人类γδ T细胞是否能通过BCG疫苗诱导出训练免疫，从而增强其交叉保护作用 | 健康人类志愿者的γδ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序技术 | NA | RNA | 健康人类志愿者 |
| 1073 | 2024-08-04 |
Generating single-cell gene expression profiles for high-resolution spatial transcriptomics based on cell boundary images
2024, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.110
PMID:38434932
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研究论文 | 本研究介绍了一种更新的软件STCellbin，能够生成高分辨率的单细胞空间基因表达特征 | 该软件结合了细胞膜/细胞壁染色图像与空间基因表达图，增强了单细胞基因表达轮廓的捕获能力 | NA | 提升空间转录组学中单细胞基因表达的分析精度 | 小鼠肝脏和种子数据集的单细胞基因表达轮廓 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 多个小鼠肝脏和种子的样本 |
| 1074 | 2024-08-04 |
Advances in the Application of Single-Cell Transcriptomics in Plant Systems and Synthetic Biology
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0029
PMID:38435807
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综述 | 本文总结了单细胞转录组在植物系统和合成生物学中的应用进展 | 探讨了单细胞RNA测序技术在植物生物系统设计和合成生物学中的潜在应用及未来技术进展的影响 | 目前单细胞RNA测序的应用仅限于少量植物物种，且技术成本较高 | 旨在提供单细胞RNA测序在植物样本中的选择指南，并探讨其在植物系统生物学和合成生物学中的不同应用 | 植物生物系统及其合成生物学研究 | 合成生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 仅限于少量植物物种，包括模型植物、农业作物和生物能源作物 |
| 1075 | 2024-08-07 |
Integrative Omics Analysis Reveals Metabolic Features of Ground-Glass Opacity-Associated Lung Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.92437
PMID:38434969
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研究论文 | 本研究通过代谢组学和转录组学分析，揭示了磨玻璃影（GGO）相关肺癌的代谢特征 | 首次全面探讨了GGO相关肺癌的代谢特征和关键代谢基因，特别是发现MAOB在抑制LUAD细胞增殖和转移中的重要作用 | 研究样本量有限，且仅限于GGO相关肺癌，未来需扩大样本量并验证其他类型肺癌中的发现 | 识别GGO相关肺癌的异常代谢途径和关键代谢基因，为该疾病的诊断和治疗提供新策略 | GGO相关肺癌组织及其邻近正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 代谢组学分析, 转录组学分析, 实时定量PCR | NA | 基因表达数据, 代谢数据 | 40对GGO相关肺癌组织及邻近正常组织 |
| 1076 | 2024-08-07 |
Mendelian Randomization Validates the Immune Landscape Mediated by Aggrephagy in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Patients from the Perspectives of Multi-omics
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.93376
PMID:38434988
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研究论文 | 通过生物信息学方法研究食管鳞状细胞癌（ESCC）患者中由自噬介导的免疫景观，并利用孟德尔随机化方法识别与食管癌有因果关系的预后细胞簇基因。 | 揭示了自噬相关簇在介导ESCC患者预后和免疫治疗中的作用，并识别出与食管癌发生有因果关系的基因。 | NA | 阐明自噬在ESCC患者中调节的免疫景观，并识别与食管癌有因果关系的预后细胞簇基因。 | 食管鳞状细胞癌患者的免疫景观和预后细胞簇基因。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序 | NMF聚类 | 单细胞转录组数据 | 19种不同的细胞亚群 |
| 1077 | 2024-08-07 |
Characterizing CD8+ TEMRA Cells in CP/CPPS Patients: Insights from Targeted Single-Cell Transcriptomic and Functional Investigations
2024, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S451199
PMID:38435982
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研究论文 | 本研究通过靶向单细胞转录组学和功能研究，探讨了CD8+ TEMRA细胞在慢性前列腺炎/慢性骨盆疼痛综合征（CP/CPPS）患者中的作用 | 首次详细探索了CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS患者中的具体作用，并揭示了其在疾病发病机制中的关键角色 | 研究样本量较小，仅包括两名CP/CPPS患者和两名健康对照 | 阐明CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS中的作用，并寻找潜在的治疗靶点 | CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS患者中的分子特征和功能 | NA | 慢性前列腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 两名CP/CPPS患者和两名健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs） |
| 1078 | 2024-08-07 |
Co-differential genes between DKD and aging: implications for a diagnostic model of DKD
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17046
PMID:38435999
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研究论文 | 本研究通过筛选糖尿病肾病（DKD）和衰老相关的共同差异基因，构建了一个基于这些基因的DKD诊断模型 | 发现了DKD和衰老之间的共同差异基因，并基于这些基因开发了一个遗传诊断模型 | NA | 探索糖尿病肾病（DKD）和衰老之间的共同差异基因，并建立一个基于这些基因的DKD诊断模型 | 糖尿病肾病（DKD）和衰老相关的共同差异基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归 | 基因表达数据 | DKD小鼠模型（通过链脲佐菌素（STZ）注射构建并由组织切片染色确认） |
| 1079 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial multi-omics highlight effects of anti-integrin therapy across cellular compartments in ulcerative colitis
2024-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.21.525036
PMID:36711576
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研究论文 | 本文研究了抗整合素疗法对溃疡性结肠炎中细胞不同群体的影响 | 首次通过单细胞转录组和蛋白组分析揭示了VDZ对炎症细胞的影响及其在溃疡性结肠炎中的作用 | 本研究未详细阐明VDZ对于其他细胞亚群体的广泛影响 | 确定参与溃疡性结肠炎的炎症细胞及其受VDZ影响的程度 | 健康对照组及接受VDZ或其他疗法的溃疡性结肠炎患者的外周血和结肠活检样本 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学和蛋白组学分析 | NA | 外周血和结肠活检样本 | 健康对照组和接受不同治疗的溃疡性结肠炎患者的样本 |
| 1080 | 2024-08-04 |
Conceptual Framework of Epigenetic Analyses of Plant Responses to Sedentary Endoparasitic Nematodes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3638-1_12
PMID:38427303
|
章节 | 本章节提供了一种用于研究植物与寄生线虫相互作用的表观遗传调控的概念框架 | 提供了针对miRNA调控和功能的当前及新兴方法的详细分析 | 文章提到了一些方法的局限性并讨论如何克服这些问题 | 阐明植物与寄生线虫相互作用过程中的表观遗传调控 | 关注植物表观基因组中各种成分在寄生线虫感染中的作用 | NA | NA | 单细胞测序技术、基因组编辑 | NA | NA | NA |