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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2024-08-05 |
Single-cell type annotation with deep learning in 265 cell types for humans
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae054
PMID:38645719
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研究论文 | 本文开发了一个基于深度学习的单细胞类型预测工具,能够为人类的265种不同细胞类型赋予类型标签 | 该工具首先通过对约五百万个细胞的数据进行处理,并利用细胞本体校正注释,从而显著提高了模型的准确性 | 目前数据库中的不一致标记影响了模型的准确性,并且依赖于现有数据库的注释限制了未来的应用 | 旨在通过深度学习工具提高单细胞RNA测序数据的细胞类型注释准确性 | 研究对象为265种不同的人类细胞类型 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | RNA测序数据 | 约五百万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1042 | 2024-08-04 |
A case report of a family with developmental arrest of human prokaryotic stage zygote
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1280797
PMID:38606321
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病例报告 | 研究了一对父母及其子女的遗传变异,导致其在受精过程中出现PN停滞现象 | 首次揭示了与人类PN期合子停滞相关的遗传变异及其机制 | 研究样本仅限于一家人,可能无法代表更广泛的群体 | 探讨导致PN期合子停滞表型的遗传变异 | 研究对象为一对出现多次PN停滞的夫妇及其后代 | 数字病理学 | 女性不育 | 全外显子测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据和转录组数据 | 2名个体的外周血样本及3个PN停滞合子 | NA | NA | NA | NA |
| 1043 | 2024-08-04 |
Challenges and Opportunities for the Clinical Translation of Spatial Transcriptomics Technologies
2024 Jan-Dec, Glomerular diseases
DOI:10.1159/000538344
PMID:38600956
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综述 | 本文讨论了空间转录组学技术的临床转化的挑战和机遇。 | 探讨了GeoMx和Visium平台在肾脏疾病研究中的新见解。 | NA | 阐明肾脏疾病的病理生理学并开发新的诊断测试。 | 主要集中在跟踪空间上解析的基因和蛋白质表达数据。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因和蛋白质表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1044 | 2024-08-07 |
CD177 drives the transendothelial migration of Treg cells enriched in human colorectal cancer
2024, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1506
PMID:38596253
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研究论文 | 本研究探讨了CD177在人结直肠癌中浸润调节性T细胞(Treg细胞)中的表达模式及其对Treg细胞迁移能力的影响 | 发现CD177高表达的Treg细胞具有更强的激活状态和跨内皮迁移能力,为免疫治疗提供了新的潜在靶点 | 研究仅限于体外实验,需要进一步的体内实验验证 | 旨在识别增强免疫治疗效果的潜在靶点 | 结直肠癌患者的肿瘤组织、瘤周组织和外周血单个核细胞中的Treg细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术 | NA | RNA序列数据、生存数据 | 21例结直肠癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1045 | 2024-08-07 |
Advancing diabetes treatment: the role of mesenchymal stem cells in islet transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1389134
PMID:38605972
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综述 | 本文综述了间充质干细胞(MSCs)在胰岛移植治疗糖尿病中的作用 | 利用MSCs的免疫调节特性和分化潜能,以及MSC衍生的细胞外囊泡等创新方法,来提高胰岛移植的效果 | MSCs的异质性和治疗应用的优化仍存在挑战 | 探讨MSCs在提高胰岛移植疗效中的作用,并评估其在糖尿病治疗中的潜力 | 间充质干细胞(MSCs)及其在胰岛移植中的应用 | 再生医学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1046 | 2024-08-07 |
Unraveling the tumor immune microenvironment of lung adenocarcinoma using single-cell RNA sequencing
2024, Therapeutic advances in medical oncology
IF:4.3Q2
DOI:10.1177/17588359231210274
PMID:38606165
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综述 | 本文系统回顾了使用单细胞RNA测序技术在肺腺癌中研究肿瘤免疫微环境的最新进展 | 总结了肿瘤免疫微环境的异质性及其在患者预后和治疗反应中的相关标记物或模型 | NA | 探讨肿瘤免疫微环境在肺腺癌发展和治疗中的作用 | 肺腺癌的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1047 | 2024-08-07 |
Amino acid transporter SLC7A5 regulates cell proliferation and secretary cell differentiation and distribution in the mouse intestine
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.94297
PMID:38617535
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研究论文 | 本文研究了氨基酸转运蛋白SLC7A5在小鼠肠道中的作用,发现其影响细胞增殖和分泌细胞的分化与分布 | 首次报道了肠道上皮细胞特异性敲除氨基酸转运蛋白SLC7A5,并揭示了其对mTORC1信号通路的影响 | NA | 探讨SLC7A5在肠道上皮细胞增殖和分泌细胞分化中的作用 | 小鼠肠道上皮细胞和分泌细胞 | 生物学 | NA | scRNA-seq, 电子显微镜 | NA | 细胞 | 小鼠肠道隐窝细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1048 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals that GPRC5A is an important prognostic gene in pancreatic cancer and is associated with B-cell Infiltration in pancreatic cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1283164
PMID:38634049
|
研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据,揭示了GPRC5A作为胰腺癌的重要预后基因,并与B细胞浸润相关 | 首次综合利用scRNA-seq和bulk RNA-seq数据,构建了多因素Cox预后模型,并验证了GPRC5A与B细胞浸润及患者预后的关联 | NA | 确定影响胰腺癌预后的相关基因,并研究其与免疫浸润的关系 | 胰腺癌的预后基因及免疫浸润 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq),实时荧光定量PCR(RT-PCR) | Cox回归分析,Lasso回归分析 | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的胰腺癌单细胞芯片数据和TCGA的临床数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1049 | 2024-08-04 |
Decoding the gene regulatory network of endosperm differentiation in maize
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44369-7
PMID:38167709
|
研究论文 | 本研究分析了玉米胚乳分化过程中的基因调控网络 | 首次利用单细胞转录组技术解剖玉米胚乳的基因调控网络 | 本研究仅关注于玉米的胚乳,不一定适用于其他作物的研究 | 揭示玉米胚乳发育过程中的基因调控机制 | 发育中的玉米胚乳,分析细胞分化的转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | 17,022个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1050 | 2024-08-04 |
Integrative single-cell characterization of a frugivorous and an insectivorous bat kidney and pancreas
2024-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44186-y
PMID:38195585
|
研究论文 | 该文章研究了蝙蝠的肾脏和胰腺的细胞和分子特点 | 通过整合的单细胞测序揭示水果食性和昆虫食性蝙蝠在细胞群体、基因表达和调控元素上的关键差异 | 主要研究限于特定的水果蝙蝠和昆虫蝙蝠,可能无法完全代表其他物种 | 探究水果食性蝙蝠及其与人类疾病的关系 | 水果蝙蝠(如牙买加水果蝙蝠)和昆虫蝙蝠(如大棕蝙蝠) | NA | 糖尿病 | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1051 | 2024-08-04 |
Molecular features of luminal breast cancer defined through spatial and single-cell transcriptomics
2024-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1548
PMID:38282415
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学和单细胞RNA测序分析了ER+乳腺癌中的细胞群体特征 | 研究揭示了ER+乳腺癌中四个空间上不同的细胞区室及其功能多样性 | 研究的结果需在更大样本中进行验证以确保普遍适用性 | 探讨ER+乳腺癌中细胞空间异质性及其对激素依赖性肿瘤生长的重要性 | 使用来自患者的异种移植模型(PDXs)进行分析 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 两个ER高的PDX模型和一个ER低的PDX模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1052 | 2024-08-04 |
Deciphering the molecular landscape: integrating single-cell transcriptomics to unravel myofibroblast dynamics and therapeutic targets in clear cell renal cell carcinomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374931
PMID:38562930
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研究论文 | 该文章探讨了在透明细胞肾细胞癌中,单细胞转录组学揭示的肌成纤维细胞动态及治疗靶点 | 首次利用单细胞转录组分析深入探讨肌成纤维细胞与肿瘤细胞的相互作用和信号通路 | 目前缺乏对其他细胞类型相互作用的详细分析 | 揭示透明细胞肾细胞癌中肌成纤维细胞的动态及其作为治疗靶点的潜力 | 透明细胞肾细胞癌中的肌成纤维细胞亚群及其与肿瘤的相互作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组分析 | NA | RNA-seq | ccRCC人群中涉及大量样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1053 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals SERPINE1-expressing CAFs remodelling tumour microenvironment in recurrent osteosarcoma
2024-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1527
PMID:38193644
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1054 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of the cellular microenvironment in three different colonic polyp subtypes in children
2024-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1535
PMID:38264936
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫组织化学分析,探讨了儿童结肠息肉不同亚型的细胞微环境特征 | 识别了不同结肠息肉亚型中共有的和疾病特异性的细胞亚群及表达模式,揭示了这些细胞在塑造独特细胞微环境中的重要作用 | NA | 加深对儿童结肠息肉异质性细胞微环境的理解,并识别潜在的治疗策略以减少息肉的复发 | 儿童结肠息肉的三种不同亚型:孤立性幼年息肉(SJPs)、息肉病综合征(PJS)和Peutz-Jeghers综合征(PJS) | 数字病理学 | 结肠息肉 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学(mIHC) | NA | 细胞 | 从儿童患者中获得的正常结肠组织和不同类型的结肠息肉样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1055 | 2024-08-07 |
Cellular plasticity in the breast cancer ecosystem
2024, Upsala journal of medical sciences
IF:1.5Q2
DOI:10.48101/ujms.v129.10629
PMID:38571887
|
综述 | 本文综述了乳腺癌生态系统中细胞可塑性和异质性的最新发现,重点讨论了癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的作用。 | 文章揭示了乳腺癌细胞表现出由内在遗传因素和外部微环境信号驱动的表型可塑性,并探讨了单细胞RNA测序研究揭示的CAFs和TAMs的多样性亚型及其在肿瘤微环境中的功能基因表达程序和空间组织。 | NA | 理解细胞表型的层次关系和微环境信号,为靶向治疗干预提供新机会。 | 乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1056 | 2024-08-04 |
Intermittent fasting promotes ILC3s secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.29.555436
PMID:37693430
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研究论文 | 本文研究了间歇性禁食如何促进ILC3分泌IL-22,从而促进白色脂肪组织的变褐。 | 提出了ILC3/IL-22/IL-22R轴在间歇性禁食代谢益处中的作用机制。 | 未涉及潜在的临床转化和人类研究 | 探讨间歇性禁食对代谢益处的机制。 | 研究了小鼠肠道内的ILC3细胞和其对白色脂肪组织变褐的影响。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 饮食诱导肥胖小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1057 | 2024-08-04 |
Intratumoral CXCR4hi neutrophils display ferroptotic and immunosuppressive signatures in hepatoblastoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363454
PMID:38487536
|
研究论文 | 本研究发现肝母细胞瘤中的CXCR4高表达中性粒细胞表现出铁死亡和免疫抑制特征 | 揭示了肝母细胞瘤内不同发展阶段的中性粒细胞及其在肿瘤免疫抑制中的作用 | 未提及具体的临床试验数据或长期结果 | 探讨肝母细胞瘤中肿瘤浸润中性粒细胞的功能特征 | 肝母细胞瘤中的肿瘤浸润中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 批量RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 研究中分析了不同发育阶段的中性粒细胞的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1058 | 2024-08-04 |
Unraveling the mechanisms of NK cell dysfunction in aging and Alzheimer's disease: insights from GWAS and single-cell transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1360687
PMID:38464521
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研究论文 | 本研究探讨了衰老与阿尔茨海默病(NK细胞功能失常)之间的机制 | 通过GWAS和单细胞转录组学分析,揭示NK细胞在衰老与阿尔茨海默病中的作用 | 未提及具体的实验室验证或长期跟踪研究 | 研究衰老如何影响NK细胞的功能以及与阿尔茨海默病的关系 | 研究对象为不同年龄段的阿尔茨海默病患者的NK细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核转录组测序,基因组宽关联研究(GWAS) | NA | 基因表达数据 | 2,171名60岁以上的老年人 | NA | NA | NA | NA |
| 1059 | 2024-08-07 |
Precursor exhausted CD8+T cells in colorectal cancer tissues associated with patient's survival and immunotherapy responsiveness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1362140
PMID:38510246
|
研究论文 | 本研究利用多色免疫组织化学技术(mIHC)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了结直肠癌(CRC)组织中肿瘤浸润T细胞的定位及其临床意义,并探讨了其在免疫治疗反应中的作用。 | 本研究首次通过mIHC技术和scRNA-seq分析,揭示了结直肠癌微环境中T细胞的转录和功能特性,并证实了其在患者生存和免疫治疗反应中的关键作用。 | NA | 探讨结直肠癌组织中T细胞的分布及其在患者生存和免疫治疗反应中的作用。 | 结直肠癌组织中的T细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多色免疫组织化学(mIHC),单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 组织样本 | 人类结直肠癌组织及小鼠MC38肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1060 | 2024-08-07 |
Novel prognostic biomarker TBC1D1 is associated with immunotherapy resistance in gliomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372113
PMID:38529286
|
研究论文 | 本文通过分析TCGA、CGGA和GEO数据库,鉴定了与胶质瘤免疫治疗抵抗相关的基因TBC1D1,并通过多种实验方法验证了其在免疫治疗中的作用。 | 首次发现TBC1D1作为胶质瘤免疫治疗抵抗的新型预后生物标志物,并探讨了其在免疫抑制微环境中的作用。 | NA | 研究胶质瘤免疫治疗抵抗的机制,并寻找新的预后生物标志物。 | 胶质瘤及其免疫治疗抵抗机制。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | qRT-PCR, 蛋白质印迹, GSEA, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质水平数据 | 使用了来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多组数据 | NA | NA | NA | NA |