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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2024-08-07 |
Transcriptional profile of human thymus reveals IGFBP5 is correlated with age-related thymic involution
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1322214
PMID:38318192
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研究论文 | 研究通过收集和整合公开的人类单细胞转录组测序数据,构建了人类胸腺细胞图谱,并发现了与年龄相关的胸腺退化相关的关键调节因子IGFBP5 | 首次系统地探索了早期胸腺细胞的细胞间通讯和调节因子,以及年龄相关的人类胸腺差异,并通过生物信息学和实验验证,揭示了IGFBP5作为胸腺退化的功能标记 | NA | 研究人类胸腺中与年龄相关的退化机制 | 人类胸腺的细胞和分子机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 350,678个细胞来自36个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1042 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell type-specific immune regulation associated with human neuromyelitis optica spectrum disorder
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1322125
PMID:38440735
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类视神经脊髓炎谱系障碍(NMOSD)患者的外周血单个核细胞,揭示了细胞类型特异性的免疫调控 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了NMOSD患者外周血单个核细胞的免疫特征 | NA | 探讨视神经脊髓炎谱系障碍(NMOSD)的外周免疫特征 | NMOSD患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 神经免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1043 | 2024-08-07 |
Increased glycolysis and cellular crosstalk in eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1321560
PMID:38444858
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研究论文 | 本研究探讨了嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉(eCRSwNP)中糖酵解酶基因表达增加及其与细胞间相互作用的关系 | 首次通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)揭示了eCRSwNP中糖酵解重编程与细胞间相互作用的关系 | NA | 研究嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉(eCRSwNP)中糖酵解酶基因表达增加及其与细胞间相互作用的关系 | 嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉(eCRSwNP)患者的上皮细胞、基质细胞和记忆T细胞亚群 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1044 | 2024-08-04 |
MMR vaccination induces trained immunity via functional and metabolic reprogramming of γδ T cells
2024-Jan-30, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170848
PMID:38290093
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研究论文 | 这篇文章系统地研究了MMR疫苗是否可以诱导先天免疫细胞的长期功能变化。 | 这项研究首次揭示了MMR疫苗通过功能和代谢重编程γδ T细胞来诱导训练免疫的机制。 | 这项研究的样本量较小,仅涉及39名健康成年人,可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究MMR疫苗是否能诱导先天免疫细胞的长期功能变化。 | 39名健康成年人,接受MMR疫苗或安慰剂的随机对照试验。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39名健康成年人 | NA | NA | NA | NA |
| 1045 | 2024-08-04 |
Cancer-associated fibroblasts: protagonists of the tumor microenvironment in gastric cancer
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1340124
PMID:38562556
|
综述 | 本研究回顾了癌相关成纤维细胞在胃癌肿瘤微环境中的关键作用 | 探讨了癌相关成纤维细胞的异质性以及其如何促进胃癌的侵袭性和耐药性 | 癌相关成纤维细胞的异质性可能会使针对其的治疗策略开发变得复杂 | 旨在揭示癌相关成纤维细胞在胃癌中的作用及其潜在治疗策略 | 主要研究癌相关成纤维细胞及其在胃癌中的角色 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1046 | 2024-08-04 |
Clinical implications of single cell sequencing for bladder cancer
2024, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2024.045442
PMID:38560564
|
综述 | 本综述总结了单细胞测序在膀胱癌中的临床应用现状 | 该研究首次系统总结了单细胞测序在膀胱癌中的应用,展示其在预后预测和免疫检查点抑制治疗反应评估中的潜力 | 此综述主要基于已发表的研究,可能存在选择偏倚 | 探讨单细胞测序在膀胱癌临床应用的现状和潜在影响 | 膀胱癌及其相关的单细胞研究 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | 41篇发表的研究 | NA | NA | NA | NA |
| 1047 | 2024-08-04 |
Lung single-cell RNA profiling reveals response of pulmonary capillary to sepsis-induced acute lung injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1308915
PMID:38348045
|
研究论文 | 这篇文章探讨了肺毛细血管在脓毒症诱导的急性肺损伤中的反应 | 揭示了不同类型的肺毛细血管在脓毒症急性肺损伤过程中的免疫互动和功能 | 尚不清楚Cd74+毛细血管的功能倾向是免疫还是耐受,需进一步研究确认 | 研究脓毒症引起的急性肺损伤中内皮细胞的功能和相互作用 | 小鼠的肺毛细血管及其在急性肺损伤中的反应 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠肺组织样本,时间点为0、24和48小时 | NA | NA | NA | NA |
| 1048 | 2024-08-07 |
Cystic Fibrosis Mice Are Highly Susceptible to Repeated Acute Pseudomonas aeruginosa Pneumonia after Intranasal Inoculation
2024, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2024/4769779
PMID:38347907
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研究论文 | 研究囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌肺炎感染后的易感性 | 首次发现囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌感染后比非囊性纤维化小鼠更易感,并揭示了非囊性纤维化小鼠中性粒细胞招募和效应功能的改善 | 研究仅限于F508del转基因囊性纤维化小鼠模型,可能需要进一步研究其他囊性纤维化小鼠模型 | 探讨囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌肺炎感染后的免疫反应和易感性 | 囊性纤维化小鼠和非囊性纤维化小鼠 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 囊性纤维化小鼠和非囊性纤维化小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1049 | 2024-08-07 |
Prognostic Risk Models Using Epithelial Cells Identify β-Sitosterol as a Potential Therapeutic Target Against Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S447023
PMID:38559590
|
研究论文 | 本研究利用上皮细胞开发预测食管鳞状细胞癌(ESCC)预后的风险模型,并识别β-谷甾醇作为潜在的治疗靶点 | 通过单细胞RNA测序和功能富集分析,识别了与ESCC相关的核心基因,并构建了基于这些基因的预后模型 | NA | 研究食管鳞状细胞癌中上皮细胞异质性,并开发基于这些细胞类型的预测风险模型 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)中的上皮细胞异质性及其与预后和免疫反应的关系 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 773个食管鳞状细胞癌基因和3407个上皮细胞标记基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1050 | 2024-08-07 |
scAnnoX: an R package integrating multiple public tools for single-cell annotation
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17184
PMID:38560451
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为scAnnoX的R包,该包整合了多种单细胞注释算法,用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | scAnnoX提供了一个综合框架,用于整合和比较多种单细胞注释算法,提高了注释效率和准确性 | NA | 开发一个综合工具,用于整合和比较现有的单细胞注释算法 | 单细胞注释算法 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1051 | 2024-08-07 |
An androgen receptor-based signature to predict prognosis and identification of ORC1 as a therapeutical target for prostate adenocarcinoma
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16850
PMID:38562999
|
研究论文 | 本研究旨在通过基于雄激素受体(AR)的特征来预测前列腺腺癌(PRAD)的预后,并识别ORC1作为治疗靶点 | 本研究首次识别了基于AR的10个相关基因(ARGs),并发现ORC1作为关键靶点,能够促进PRAD细胞的增殖和干细胞样特性,增强对enzalutamide的敏感性 | NA | 识别新的AR驱动特征以预测前列腺腺癌的预后,并揭示潜在的治疗靶点 | 前列腺腺癌及其对enzalutamide的耐药性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO和多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | 来自GSE99795的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1052 | 2024-08-07 |
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.04.574196
PMID:38260616
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研究论文 | 本文描述了通过多种测序技术识别出一种由表观遗传控制的记忆星形胶质细胞亚群,该亚群在重新刺激后表现出加剧的促炎反应 | 首次揭示了星形胶质细胞记忆由代谢酶ATP柠檬酸裂解酶(ACLY)和组蛋白乙酰转移酶p300共同调控,这一发现为神经系统疾病的治疗提供了新的靶点 | NA | 研究星形胶质细胞在中枢神经系统病理中的作用及其调控机制 | 星形胶质细胞及其在多发性硬化症(MS)和实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)中的作用 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)、核酸检测和测序的细胞特异性聚焦(FIND-seq)、CRISPR/Cas9基因扰动研究 | NA | 细胞 | 急性和慢性EAE模型中的星形胶质细胞,慢性MS病变中的人类星形胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1053 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing provides insight into multiple chemotherapy resistance in a patient with refractory DLBCL: a case report
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1303310
PMID:38533514
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病例报告 | 本研究利用单细胞转录组测序和常规批量下一代测序(NGS)分析了一位经历多次化疗复发的大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的肿瘤全景 | 结合NGS和单细胞RNA测序技术,揭示了肿瘤微环境中的异质性和免疫抑制特性,为治疗难治性DLBCL提供了潜在的治疗靶点 | 研究仅基于单一病例,结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 阐明DLBCL进展的机制并开发新的治疗方法 | 一位经历多次化疗复发的大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者 | 数字病理学 | 大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组测序, NGS | NA | 转录组 | 单一患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1054 | 2024-08-07 |
Comparative study on differential expression analysis methods for single-cell RNA sequencing data with small biological replicates: Based on single-cell transcriptional data of PBMCs from COVID-19 severe patients
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0299358
PMID:38536877
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研究论文 | 本文比较了在生物学重复样本较少的情况下,八种差异表达分析(DEA)方法在单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中的适应性 | 提出了基于信息熵的新方法DEF-scRNA-seq,在生物学重复样本较少的情况下具有显著优势 | NA | 评估和比较在生物学重复样本较少的情况下,不同差异表达分析方法的性能 | COVID-19重症患者的PBMCs单细胞转录组数据 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 生物学重复样本较少 | NA | NA | NA | NA |
| 1055 | 2024-08-07 |
Association Between Diverse Cell Death Patterns Related Gene Signature and Prognosis, Drug Sensitivity, and Immune Microenvironment in Glioblastoma
2024-Jan-12, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-023-02181-4
PMID:38214842
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研究论文 | 本研究基于多种程序性细胞死亡模式相关基因构建了一个新的预测胶质母细胞瘤(GBM)预后的模型,并探讨了该模型与药物敏感性和免疫微环境的关系 | 首次整合了11种程序性细胞死亡模式相关基因,构建了一个新的预后模型,并验证了其在不同数据集中的有效性 | 需要进一步的研究来验证该模型在更大规模样本和不同人群中的应用效果 | 开发一个有效的工具来预测GBM的预后,并探讨其与药物敏感性和免疫微环境的关系 | 胶质母细胞瘤(GBM)患者的预后、药物敏感性和免疫微环境 | 数字病理学 | 脑瘤 | 转录组数据分析 | Cox回归分析 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-GBM、REMBRANDT、CGGA和GSE162631数据集的GBM病例的bulk和单细胞转录组数据及临床数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1056 | 2024-08-07 |
Single-cell disulfidptosis regulator patterns guide intercellular communication of tumor microenvironment that contribute to kidney renal clear cell carcinoma progression and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1288240
PMID:38292868
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肾透明细胞癌中的硫化物凋亡调控因子模式,揭示了其在肿瘤微环境中对细胞间通讯的影响及其与疾病进展和免疫治疗的关系 | 首次详细探讨了硫化物凋亡在肿瘤微环境中的具体作用,并揭示了其与肾透明细胞癌生物特性和预后的关联 | 研究样本量相对较小,且仅限于肾透明细胞癌,可能限制了结果的广泛适用性 | 探讨硫化物凋亡调控因子在肾透明细胞癌肿瘤微环境中的作用及其对疾病进展和免疫治疗的影响 | 肾透明细胞癌的肿瘤微环境中的单细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 非负矩阵分解(NMF) | RNA | 41,784个单细胞,来自7个肾透明细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1057 | 2024-08-07 |
Cytotoxic CD8+ Temra cells show loss of chromatin accessibility at genes associated with T cell activation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1285798
PMID:38370415
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研究论文 | 研究探讨了人类衰老过程中记忆T细胞的扩张及其与CMV感染的关系,特别是Temra细胞的表观遗传模式和细胞异质性 | 通过单细胞转录组分析和ATAC-seq技术,揭示了Temra细胞与Tcm/em细胞在染色质可及性方面的差异,并发现了与基因表达相关的染色质可及性位点 | 研究主要集中在Temra细胞与Tcm/em细胞的比较,未涉及其他T细胞亚群的全面分析 | 探究衰老和CMV感染对CD8 Temra细胞分子和细胞异质性的影响 | CD8 Temra细胞及其与CMV感染的关系 | 免疫学 | NA | ATAC-seq, 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 涉及多个个体,具体数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 1058 | 2024-08-07 |
Integrative analysis identifies cancer cell-intrinsic RARRES1 as a predictor of prognosis and immune response in triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1360507
PMID:38533207
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序数据,揭示了三阴性乳腺癌(TNBC)中肿瘤微环境(TME)的细胞组成异质性,并识别了与TME相关的基因RARRES1,该基因表达与TNBC患者的预后和免疫检查点抑制剂(ICIs)反应呈正相关 | 本研究提出了一种定量评估TME免疫特征的方法,并提供了一个框架,通过综合分析识别与TME相关的癌细胞内在特征 | NA | 揭示三阴性乳腺癌中癌细胞与肿瘤微环境之间的关系,并识别预测治疗反应和预后的生物标志物 | 三阴性乳腺癌(TNBC)及其肿瘤微环境(TME) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1059 | 2024-08-07 |
Regulatory T cells and IFN-γ-producing Th1 cells play a critical role in the pathogenesis of Sjögren's Syndrome
2024-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.23.576314
PMID:38328096
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研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞和IFN-γ产生Th1细胞在Sjögren综合征发病机制中的关键作用 | 报道了一个更准确的Sjögren综合征小鼠模型,并提供了调节性T细胞和IFN-γ产生Th1细胞在Sjögren综合征发病机制中的关键作用的证据 | NA | 研究Sjögren综合征的发病机制 | Sjögren综合征患者的唾液腺和泪腺以及淋巴组织 | NA | 自身免疫疾病 | RNA测序, 流式细胞术, 单细胞转录组分析 | NA | RNA | 小鼠模型和Sjögren综合征患者的外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1060 | 2024-08-07 |
GLIPR2: a potential biomarker and therapeutic target unveiled - Insights from extensive pan-cancer analyses, with a spotlight on lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1280525
PMID:38476239
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研究论文 | 本研究通过广泛的数据集分析,探讨了GLIPR2在多种人类恶性肿瘤中的表达情况及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力,特别关注肺腺癌。 | 首次全面分析GLIPR2在多种癌症中的表达及其与免疫细胞浸润的关系,揭示了其在肺腺癌中的诊断和预后价值。 | NA | 探讨GLIPR2在多种癌症中的表达及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力。 | GLIPR2在多种人类恶性肿瘤中的表达及其与免疫细胞浸润的关系。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 多中心队列涵盖多种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |