单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1387 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2024-08-07 |
Dandelion uses the single-cell adaptive immune receptor repertoire to explore lymphocyte developmental origins
2024-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01734-7
PMID:37055623
|
研究论文 | 本文介绍了Dandelion计算流程，用于单细胞适应性免疫受体（scVDJ-seq）分析，以探索淋巴细胞发育起源 | Dandelion能够应用标准V(D)J分析工作流程于单细胞数据集，提供改进的V(D)J contig注释和非生产性及部分剪接contig的识别 | NA | 研究淋巴细胞生物学，特别是人类胸腺发育轨迹和细胞系承诺的调控因子 | 单细胞基因表达和适应性免疫受体序列数据 | 生物信息学 | NA | scVDJ-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1022 | 2024-08-07 |
Opportunities and tradeoffs in single-cell transcriptomic technologies
2024-01, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2023.10.003
PMID:37953195
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review | 本文综述了单细胞转录组技术的最新进展及其优缺点 | 介绍了长读长测序方法在单细胞转录组分析中的应用，突破了以往全转录组表征的障碍 | 单细胞转录组分析中仍存在细胞数量与全长转录本覆盖度之间的权衡问题 | 全面概述单细胞转录组分析的可用选项，并强调每种方法的关键优缺点 | 单细胞转录组技术及其应用 | NA | NA | 长读长测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1023 | 2024-08-04 |
DOT1L promotes expression of CD44 through the Wnt/β-catenin signaling pathway in early gastric carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.90170
PMID:38495505
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研究论文 | 本研究评估了DOT1L基因在胃癌组织中的表达及其促进癌症干细胞介导的上皮-间质转化的功能 | 发现DOT1L通过Wnt/β-连环蛋白信号通路促进CD44的表达，揭示了其在胃癌干细胞调节中的重要性 | 样本量相对较小，限制了结果的广泛适用性和外推性 | 研究DOT1L在早期胃癌中的作用及其机制 | 通过单细胞测序分析早期胃癌和低级别上皮内瘤变的组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序、单细胞测序 | NA | 组织样本 | 24个样本（来自8名患者的3个阶段，其中每个阶段各8个样本） |
| 1024 | 2024-08-04 |
Identification of T-cell exhaustion-related genes and prediction of their immunotherapeutic role in lung adenocarcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.92839
PMID:38495503
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研究论文 | 本文探讨了与T细胞耗竭相关的基因及其在肺腺癌免疫治疗中的预测作用 | 构建了一个基于T细胞耗竭的模型，用于评估肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 未提及具体的实验限制 | 探讨T细胞耗竭对肿瘤微环境的影响及其在肺腺癌中的作用 | 肺腺癌患者的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq (scRNA-seq)，RNA-seq | LASSO-Cox分析 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO的LUAD患者数据，涉及多个验证队列 |
| 1025 | 2024-08-07 |
Inhibiting PLA2G7 reverses the immunosuppressive function of intratumoral macrophages and augments immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2024-01-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008094
PMID:38272562
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研究论文 | 本文研究了磷脂酶A2组VII（PLA2G7）在肝细胞癌（HCC）中的作用，并探讨了抑制PLA2G7对肿瘤内巨噬细胞免疫抑制功能的影响及其在免疫治疗中的应用 | 发现PLA2G7在肿瘤内巨噬细胞中的高表达与免疫治疗抵抗和预后不良相关，并通过药物抑制PLA2G7增强了免疫检查点阻断疗法的疗效 | NA | 旨在识别与HCC进展及免疫治疗抵抗相关的巨噬细胞亚群 | 肝细胞癌（HCC）中的肿瘤内巨噬细胞及其对免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及HCC患者的组织样本及HCC小鼠模型 |
| 1026 | 2024-08-07 |
Biomarkers of Pathologic Complete Response to Neoadjuvant Immunotherapy in Mismatch Repair-Deficient Colorectal Cancer
2024-01-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-2213
PMID:37906636
|
研究论文 | 本研究旨在识别错配修复缺陷型结直肠癌患者对新辅助免疫治疗病理完全反应的生物标志物 | 本研究首次综合分析了基因组、转录组和免疫细胞密度，以及肿瘤微环境对病理完全反应的影响 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探索错配修复缺陷型结直肠癌患者对新辅助免疫治疗反应的生物标志物 | 42名接受新辅助PD-1阻断治疗的错配修复缺陷型结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 下一代测序, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 免疫细胞密度数据 | 42名患者 |
| 1027 | 2024-08-07 |
scRNA-Seq and Bulk-Seq Analysis Identifies S100A9 Plasma Cells as a Potentially Effective Immunotherapeutic Agent for Multiple Myeloma
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S452062
PMID:38481477
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量测序技术分析多发性骨髓瘤患者，识别出S100A9浆细胞作为潜在有效的免疫治疗剂 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量测序技术，识别出S100A9浆细胞在多发性骨髓瘤免疫治疗中的潜在作用 | NA | 研究多发性骨髓瘤的免疫治疗策略 | 多发性骨髓瘤患者的浆细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量测序 | NA | RNA | 多发性骨髓瘤患者样本 |
| 1028 | 2024-08-07 |
Data-driven detection of age-related arbitrary monotonic changes in single-cell gene expression distributions
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16851
PMID:38344300
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新的工作流程，用于检测单细胞表达谱中与年龄相关的任意单调变化分布 | 使用信息论量化分布差异，并通过距离矩阵进行关联分析 | NA | 理解衰老背后的机制 | 单细胞基因表达随年龄的变化 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1029 | 2024-08-04 |
Signaling Pathway Alterations Driven by BRCA1 and BRCA2 Germline Mutations are Sufficient to Initiate Breast Tumorigenesis by the PIK3CAH1047R Oncogene
2024-01-05, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0330
PMID:38059556
|
研究论文 | 本研究生成了BRCA1和BRCA2突变携带者乳腺组织的单细胞转录组图谱，并与健康非携带者进行了比较 | 首次揭示了BRCA1和BRCA2突变对乳腺上皮细胞转录组的特定影响，并阐明了其与肿瘤发生的关系 | 本研究的样本仅限于BRCA1和BRCA2突变携带者，未能涵盖所有类型的乳腺癌变异 | 研究BRCA1和BRCA2突变在乳腺肿瘤发生中的信号通路改变 | BRCA1和BRCA2突变携带者及健康非携带者的乳腺上皮细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | BRCA1和BRCA2突变携带者的乳腺组织样本与健康非携带者样本进行比较 |
| 1030 | 2024-08-04 |
Spatial Distribution of Immune Cells Drives Resistance to Neoadjuvant Chemotherapy in Triple-Negative Breast Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0076
PMID:37856875
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学探讨三阴性乳腺癌中免疫细胞的空间分布对新辅助化疗的影响 | 研究通过空间转录组学的方法，更深入地理解了三阴性乳腺癌生态系统的复杂元素及其与新辅助化疗反应之间的关系 | 研究基于回顾性病例系列，样本量相对较小，仅包含24名患者 | 旨在探索三阴性乳腺癌对新辅助化疗反应的机制 | 涉及24名三阴性乳腺癌患者，其中12名患者经历了病理完全反应，12名患者则未反应或疾病进展 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 24例三阴性乳腺癌患者 |
| 1031 | 2024-08-07 |
Bexmarilimab Activates Human Tumor-Associated Macrophages to Support Adaptive Immune Responses in Interferon-Poor Immune Microenvironments
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0350
PMID:37922365
|
研究论文 | 本文研究了bexmarilimab在干扰素贫乏的免疫微环境中激活人肿瘤相关巨噬细胞以支持适应性免疫反应的作用。 | 首次揭示了bexmarilimab在低基线干扰素信号的巨噬细胞中效果最佳，并阐明了其在免疫冷肿瘤中的应用潜力。 | 目前尚不清楚bexmarilimab在个体患者中治疗结果的机制。 | 探讨bexmarilimab在卵巢癌腹水巨噬细胞中的反应，并评估其在免疫冷肿瘤中的治疗效果。 | 卵巢癌腹水巨噬细胞及bexmarilimab的治疗效果。 | 免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1032 | 2024-08-07 |
Combination of Anti-PD-1 and Electroacupuncture Induces a Potent Antitumor Immune Response in Microsatellite-Stable Colorectal Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0309
PMID:37956404
|
研究论文 | 研究电针（EA）与抗PD-1联合治疗在微卫星稳定（MSS）结直肠癌中的抗肿瘤效果 | 首次探讨了电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的应用，并发现这种联合疗法通过激活STING通路增强了肿瘤的免疫反应 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步的临床试验验证其安全性和有效性 | 探索电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的抗肿瘤效果及机制 | 微卫星稳定的结直肠癌 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个MSS结直肠癌小鼠模型 |
| 1033 | 2024-08-04 |
BCG vaccination stimulates integrated organ immunity by feedback of the adaptive immune response to imprint prolonged innate antiviral resistance
2024-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01700-0
PMID:38036767
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研究论文 | 本研究探讨了BCG疫苗如何通过适应性免疫反应反馈刺激整合的器官免疫。 | 展示了BCG疫苗通过CD4 T细胞在组织巨噬细胞和上皮细胞中的反馈作用，促进了持久的广泛先天抗病毒抵抗力。 | 仅在小鼠模型中进行，没有在人类实验中验证结果 | 揭示BCG疫苗对异源病原体的非特异性保护机制 | BCG疫苗接种的小鼠 | 免疫学 | 呼吸道疾病 | 流式细胞术, 空间转录组学 | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 小鼠数量不明确，但涉及多种病毒感染 |
| 1034 | 2024-08-04 |
The exploration of mitochondrial-related features helps to reveal the prognosis and immunotherapy methods of colorectal cancer
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1914
PMID:37903487
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研究论文 | 该文章探讨了线粒体相关特征如何揭示结直肠癌的预后和免疫疗法方法 | 文章通过线粒体相关基因风险评分构建预后模型，并与其他模型进行比较，展示了新的预后评估方法 | 该研究可能仅限于数据库中的数据，临床实用性需要进一步验证 | 研究结直肠癌中线粒体特征与肿瘤微环境及免疫景观的关系 | 使用非负矩阵分解（NMF）对结直肠癌患者数据进行亚组分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化和单细胞测序 | 风险评分模型 | 临床数据和基因数据 | 使用内外部队列的 CRC 患者数据进行广泛测试 |
| 1035 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing to analyze the heterogeneity of hepatocellular carcinoma and establish a prognostic model
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1935
PMID:37994394
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，分析肝细胞癌的异质性，并建立了一个预测模型 | 本研究首次结合单细胞和批量RNA测序数据，探讨了肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联，并开发了一个新的预测模型 | NA | 研究肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联 | 肝细胞癌的肿瘤细胞异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | Cox比例风险模型 | RNA测序数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库，具体样本数量未提及 |
| 1036 | 2024-08-07 |
The challenge of defining rare genetic programs by single-cell RNA sequencing: Insights from phloem studies
2024-01-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.12.012
PMID:38115581
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1037 | 2024-08-04 |
Transcriptomics and Spatial Proteomics for Discovery and Validation of Missing Proteins in the Human Ovary
2024-01-05, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.3c00545
PMID:38085962
|
研究论文 | 该研究通过转录组学和空间蛋白组学发现并验证了人类卵巢中缺失的蛋白质 | 首次识别并验证了14种在人类卵巢中缺失的蛋白质，提供了新的研究方向 | 样本数量有限，仅包含7到32岁之间的卵巢皮层样本 | 探索人类卵巢中缺失蛋白质的功能和角色 | 卵巢皮层中的卵母细胞和颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq，高分辨率抗体基于蛋白质分析，单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个新RNA-seq样本 |
| 1038 | 2024-08-04 |
Research progress and application of single-cell sequencing in head and neck malignant tumors
2024-01, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00691-2
PMID:37968342
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研究论文 | 本文系统介绍了单细胞测序在头颈部恶性肿瘤中的最新进展和应用 | 本文提出了单细胞测序在研究头颈部恶性肿瘤发病机制中的应用，提供了新视角 | 由于篇幅限制，可能未能详细覆盖所有相关研究进展 | 探讨单细胞测序在头颈部恶性肿瘤临床诊断和治疗中的应用 | 头颈部恶性肿瘤的单细胞基因组和转录组 | 数字病理学 | 头颈部恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 数千个细胞 |
| 1039 | 2024-08-07 |
CILP is a potential pan-cancer marker: combined silico study and in vitro analyses
2024-01, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00688-x
PMID:37968343
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研究论文 | 本研究主要探讨了CILP在肿瘤发生发展中的作用及其作为潜在泛癌标志物的可能性 | 首次系统研究了CILP在多种肿瘤中的表达及其对肿瘤发生和患者生存预后的影响，并通过细胞实验验证了CILP的功能 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验，未来需要更多临床样本验证CILP的泛癌标志物作用 | 探索CILP在肿瘤中的作用及其作为泛癌标志物的潜力 | CILP在不同肿瘤类型中的表达及其对肿瘤发生和患者生存预后的影响 | NA | 肿瘤 | RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 使用了来自UCSC Xena的泛癌数据和GSE152938的单细胞数据，以及人肾细胞癌ACHN和786-O细胞系进行实验验证 |
| 1040 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial profiling identify three response trajectories to pembrolizumab and radiation therapy in triple negative breast cancer
2024-01-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.12.012
PMID:38194915
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和空间蛋白组学分析三阴性乳腺癌对pembrolizumab和放疗的反应轨迹 | 首次识别了三阴性乳腺癌患者对pembrolizumab和联合放疗的三种不同反应轨迹 | 该研究的样本主要集中于三阴性乳腺癌，可能不适用于其他类型的癌症 | 旨在改善对接受单一免疫疗法或需要额外治疗的患者的识别 | 三阴性乳腺癌活检样本，比较治疗前后的免疫微环境 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞转录组学和空间蛋白组学 | 小鼠模型 | 生物样本 | NA |