单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2024-08-07 |
Prognostic Risk Models Using Epithelial Cells Identify β-Sitosterol as a Potential Therapeutic Target Against Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S447023
PMID:38559590
|
研究论文 | 本研究利用上皮细胞开发预测食管鳞状细胞癌（ESCC）预后的风险模型，并识别β-谷甾醇作为潜在的治疗靶点 | 通过单细胞RNA测序和功能富集分析，识别了与ESCC相关的核心基因，并构建了基于这些基因的预后模型 | NA | 研究食管鳞状细胞癌中上皮细胞异质性，并开发基于这些细胞类型的预测风险模型 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）中的上皮细胞异质性及其与预后和免疫反应的关系 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 773个食管鳞状细胞癌基因和3407个上皮细胞标记基因 |
| 1022 | 2024-08-07 |
scAnnoX: an R package integrating multiple public tools for single-cell annotation
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17184
PMID:38560451
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为scAnnoX的R包，该包整合了多种单细胞注释算法，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | scAnnoX提供了一个综合框架，用于整合和比较多种单细胞注释算法，提高了注释效率和准确性 | NA | 开发一个综合工具，用于整合和比较现有的单细胞注释算法 | 单细胞注释算法 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | NA |
| 1023 | 2024-08-07 |
An androgen receptor-based signature to predict prognosis and identification of ORC1 as a therapeutical target for prostate adenocarcinoma
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16850
PMID:38562999
|
研究论文 | 本研究旨在通过基于雄激素受体（AR）的特征来预测前列腺腺癌（PRAD）的预后，并识别ORC1作为治疗靶点 | 本研究首次识别了基于AR的10个相关基因（ARGs），并发现ORC1作为关键靶点，能够促进PRAD细胞的增殖和干细胞样特性，增强对enzalutamide的敏感性 | NA | 识别新的AR驱动特征以预测前列腺腺癌的预后，并揭示潜在的治疗靶点 | 前列腺腺癌及其对enzalutamide的耐药性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | 来自GSE99795的单细胞RNA测序数据 |
| 1024 | 2024-08-07 |
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.04.574196
PMID:38260616
|
研究论文 | 本文描述了通过多种测序技术识别出一种由表观遗传控制的记忆星形胶质细胞亚群，该亚群在重新刺激后表现出加剧的促炎反应 | 首次揭示了星形胶质细胞记忆由代谢酶ATP柠檬酸裂解酶（ACLY）和组蛋白乙酰转移酶p300共同调控，这一发现为神经系统疾病的治疗提供了新的靶点 | NA | 研究星形胶质细胞在中枢神经系统病理中的作用及其调控机制 | 星形胶质细胞及其在多发性硬化症（MS）和实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的作用 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转座酶可及染色质测序（ATAC-seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、核酸检测和测序的细胞特异性聚焦（FIND-seq）、CRISPR/Cas9基因扰动研究 | NA | 细胞 | 急性和慢性EAE模型中的星形胶质细胞，慢性MS病变中的人类星形胶质细胞 |
| 1025 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing provides insight into multiple chemotherapy resistance in a patient with refractory DLBCL: a case report
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1303310
PMID:38533514
|
病例报告 | 本研究利用单细胞转录组测序和常规批量下一代测序（NGS）分析了一位经历多次化疗复发的大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者的肿瘤全景 | 结合NGS和单细胞RNA测序技术，揭示了肿瘤微环境中的异质性和免疫抑制特性，为治疗难治性DLBCL提供了潜在的治疗靶点 | 研究仅基于单一病例，结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 阐明DLBCL进展的机制并开发新的治疗方法 | 一位经历多次化疗复发的大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者 | 数字病理学 | 大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组测序, NGS | NA | 转录组 | 单一患者样本 |
| 1026 | 2024-08-07 |
Identification of TIMPs signatures in Randall plaque from single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) analysis
2024-Jan-16, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01296-0
PMID:38225514
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1027 | 2024-08-07 |
Comparative study on differential expression analysis methods for single-cell RNA sequencing data with small biological replicates: Based on single-cell transcriptional data of PBMCs from COVID-19 severe patients
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0299358
PMID:38536877
|
研究论文 | 本文比较了在生物学重复样本较少的情况下，八种差异表达分析（DEA）方法在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的适应性 | 提出了基于信息熵的新方法DEF-scRNA-seq，在生物学重复样本较少的情况下具有显著优势 | NA | 评估和比较在生物学重复样本较少的情况下，不同差异表达分析方法的性能 | COVID-19重症患者的PBMCs单细胞转录组数据 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 生物学重复样本较少 |
| 1028 | 2024-08-07 |
Association Between Diverse Cell Death Patterns Related Gene Signature and Prognosis, Drug Sensitivity, and Immune Microenvironment in Glioblastoma
2024-Jan-12, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-023-02181-4
PMID:38214842
|
研究论文 | 本研究基于多种程序性细胞死亡模式相关基因构建了一个新的预测胶质母细胞瘤（GBM）预后的模型，并探讨了该模型与药物敏感性和免疫微环境的关系 | 首次整合了11种程序性细胞死亡模式相关基因，构建了一个新的预后模型，并验证了其在不同数据集中的有效性 | 需要进一步的研究来验证该模型在更大规模样本和不同人群中的应用效果 | 开发一个有效的工具来预测GBM的预后，并探讨其与药物敏感性和免疫微环境的关系 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者的预后、药物敏感性和免疫微环境 | 数字病理学 | 脑瘤 | 转录组数据分析 | Cox回归分析 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-GBM、REMBRANDT、CGGA和GSE162631数据集的GBM病例的bulk和单细胞转录组数据及临床数据 |
| 1029 | 2024-08-07 |
Single-cell disulfidptosis regulator patterns guide intercellular communication of tumor microenvironment that contribute to kidney renal clear cell carcinoma progression and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1288240
PMID:38292868
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肾透明细胞癌中的硫化物凋亡调控因子模式，揭示了其在肿瘤微环境中对细胞间通讯的影响及其与疾病进展和免疫治疗的关系 | 首次详细探讨了硫化物凋亡在肿瘤微环境中的具体作用，并揭示了其与肾透明细胞癌生物特性和预后的关联 | 研究样本量相对较小，且仅限于肾透明细胞癌，可能限制了结果的广泛适用性 | 探讨硫化物凋亡调控因子在肾透明细胞癌肿瘤微环境中的作用及其对疾病进展和免疫治疗的影响 | 肾透明细胞癌的肿瘤微环境中的单细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF） | RNA | 41,784个单细胞，来自7个肾透明细胞癌样本 |
| 1030 | 2024-08-07 |
Cytotoxic CD8+ Temra cells show loss of chromatin accessibility at genes associated with T cell activation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1285798
PMID:38370415
|
研究论文 | 研究探讨了人类衰老过程中记忆T细胞的扩张及其与CMV感染的关系，特别是Temra细胞的表观遗传模式和细胞异质性 | 通过单细胞转录组分析和ATAC-seq技术，揭示了Temra细胞与Tcm/em细胞在染色质可及性方面的差异，并发现了与基因表达相关的染色质可及性位点 | 研究主要集中在Temra细胞与Tcm/em细胞的比较，未涉及其他T细胞亚群的全面分析 | 探究衰老和CMV感染对CD8 Temra细胞分子和细胞异质性的影响 | CD8 Temra细胞及其与CMV感染的关系 | 免疫学 | NA | ATAC-seq, 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 涉及多个个体，具体数量未在摘要中明确 |
| 1031 | 2024-08-07 |
Integrative analysis identifies cancer cell-intrinsic RARRES1 as a predictor of prognosis and immune response in triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1360507
PMID:38533207
|
研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序数据，揭示了三阴性乳腺癌（TNBC）中肿瘤微环境（TME）的细胞组成异质性，并识别了与TME相关的基因RARRES1，该基因表达与TNBC患者的预后和免疫检查点抑制剂（ICIs）反应呈正相关 | 本研究提出了一种定量评估TME免疫特征的方法，并提供了一个框架，通过综合分析识别与TME相关的癌细胞内在特征 | NA | 揭示三阴性乳腺癌中癌细胞与肿瘤微环境之间的关系，并识别预测治疗反应和预后的生物标志物 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1032 | 2024-08-07 |
Regulatory T cells and IFN-γ-producing Th1 cells play a critical role in the pathogenesis of Sjögren's Syndrome
2024-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.23.576314
PMID:38328096
|
研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞和IFN-γ产生Th1细胞在Sjögren综合征发病机制中的关键作用 | 报道了一个更准确的Sjögren综合征小鼠模型，并提供了调节性T细胞和IFN-γ产生Th1细胞在Sjögren综合征发病机制中的关键作用的证据 | NA | 研究Sjögren综合征的发病机制 | Sjögren综合征患者的唾液腺和泪腺以及淋巴组织 | NA | 自身免疫疾病 | RNA测序, 流式细胞术, 单细胞转录组分析 | NA | RNA | 小鼠模型和Sjögren综合征患者的外周血单个核细胞 |
| 1033 | 2024-08-07 |
GLIPR2: a potential biomarker and therapeutic target unveiled - Insights from extensive pan-cancer analyses, with a spotlight on lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1280525
PMID:38476239
|
研究论文 | 本研究通过广泛的数据集分析，探讨了GLIPR2在多种人类恶性肿瘤中的表达情况及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力，特别关注肺腺癌。 | 首次全面分析GLIPR2在多种癌症中的表达及其与免疫细胞浸润的关系，揭示了其在肺腺癌中的诊断和预后价值。 | NA | 探讨GLIPR2在多种癌症中的表达及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力。 | GLIPR2在多种人类恶性肿瘤中的表达及其与免疫细胞浸润的关系。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 多中心队列涵盖多种癌症类型 |
| 1034 | 2024-08-07 |
Coniferyl ferulate alleviate xylene-caused hematopoietic stem and progenitor cell toxicity by Mgst2
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1334445
PMID:38523643
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了松脂素阿魏酸酯（CF）通过靶向Mgst2基因减轻二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的作用 | 首次揭示了松脂素阿魏酸酯通过靶向Mgst2基因减轻二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的新机制 | NA | 探讨松脂素阿魏酸酯对二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的缓解作用及其分子机制 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs）及二甲苯引起的毒性 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的骨髓造血干细胞和祖细胞 |
| 1035 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals landscape of endometrial cancer response to estrogen and identification of early diagnostic markers
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0301128
PMID:38517922
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了子宫内膜癌对雌激素反应的景观，并识别了早期诊断标志物 | 本研究首次在单细胞分辨率下阐明了子宫内膜癌对雌激素反应的潜在生物学机制，并识别了24个早期诊断标志物 | NA | 探讨子宫内膜癌对雌激素的反应机制，并寻找早期诊断标志物 | 子宫内膜癌细胞及其对雌激素的反应 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST） | 逻辑回归（LR）、高斯朴素贝叶斯（GaussianNB）、k-最近邻（KNN）、支持向量机（SVM）、极端梯度提升（XGB）和神经网络（NK） | 转录组数据 | NA |
| 1036 | 2024-08-04 |
Long-read single-cell sequencing reveals expressions of hypermutation clusters of isoforms in human liver cancer cells
2024-Jan-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87607
PMID:38206124
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于LOOPSeq技术的合成长读取单细胞测序技术，以分析人类肝癌细胞中的超突变亚型表达 | 本研究的创新点在于应用LOOPSeq技术实现精确的长读取单细胞转录组测序，并识别出特定于肝癌细胞的突变mRNA亚型 | 本研究的局限性未具体提到，故为NA | 本研究旨在揭示人类肝癌细胞中蛋白表达谱的复杂性 | 本研究对象为来自个体的447个肝细胞癌和良性肝脏转录组 | 数字病理学 | 肝癌 | 长读取测序 | NA | 转录组 | 447个转录组样本 |
| 1037 | 2024-08-07 |
Stiffness-dependent MSC homing and differentiation into CAFs - implications for breast cancer invasion
2024-01-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.261145
PMID:38108421
|
研究论文 | 研究探讨了肿瘤微环境中癌细胞与间充质干细胞（MSCs）在不同硬度基质下的相互作用如何影响三阴性乳腺癌（TNBC）的侵袭性 | 首次展示了在预转移阶段，MSCs向癌症相关成纤维细胞（CAFs）的分化如何促进TNBC的侵袭和转移 | NA | 研究肿瘤微环境中细胞异质性和细胞外基质（ECM）硬化对乳腺癌侵袭性的影响 | 三阴性乳腺癌（TNBC）中的间充质干细胞（MSCs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及高侵袭性三阴性乳腺癌（TNBC）的原发肿瘤、次级部位和循环肿瘤细胞簇中的亚群细胞 |
| 1038 | 2024-08-07 |
Chronic active Epstein-Barr virus disease originates from infected hematopoietic stem cells
2024-01-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021074
PMID:37824804
|
研究论文 | 本研究通过多种检测方法，包括定量聚合酶链反应、PrimeFlow和单细胞RNA测序，分析了慢性活动性EB病毒病（CAEBV）患者的骨髓和外周血细胞，揭示了CAEBV疾病的起源及其对免疫系统的影响 | 首次通过单细胞RNA测序等技术证实CAEBV疾病起源于感染的造血干细胞，并展示了EBV感染对免疫系统的具体影响 | 研究样本量较小，仅包括5名CAEBV患者和少数对照组，可能影响结果的普遍性 | 探究慢性活动性EB病毒病的病因及其对免疫系统的影响 | 慢性活动性EB病毒病患者的骨髓和外周血细胞 | NA | 慢性活动性EB病毒病 | 定量聚合酶链反应、PrimeFlow、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名CAEBV患者、1名EBV相关噬血细胞性淋巴组织细胞增生症患者和2名健康对照 |
| 1039 | 2024-08-04 |
Comparative and integrative single cell analysis reveals new insights into the transcriptional immaturity of stem cell-derived β cells
2024-Jan-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10013-x
PMID:38267908
|
研究论文 | 文章探讨了干细胞衍生的β细胞（SC-β细胞）的转录身份，尤其是与原代胎儿和成年β细胞的关系 | 揭示了SC-β细胞具有独特的转录特征，特别是持续表达和激活前体和神经偏向基因网络 | 尚未明确SC-β细胞与原代β细胞的关系，需要进一步研究 | 研究干细胞衍生β细胞的转录身份及其发育过程中神经转录网络的作用 | 研究对象为干细胞衍生的β细胞、胎儿β细胞和成年β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 转录数据 | NA |
| 1040 | 2024-08-04 |
Stimulated Human Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells Enhance the Osteogenesis and Cranial Bone Regeneration through IL-32 Mediated P38 Signaling Pathway
2024, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2024/6693292
PMID:38510207
|
研究论文 | 本研究探讨了刺激人脐带间充质干细胞（S-HuMSCs）对骨生成和颅骨再生的影响，重点分析了IL-32介导的P38信号通路 | 发现IL-32可以通过激活P38信号通路增强间充质干细胞的骨生成分化，揭示了IL-32在颅骨损伤治疗中的潜在疗效 | 本研究主要在体外和动物模型中进行，临床应用的效果尚待进一步验证 | 研究刺激人脐带间充质干细胞对骨生成及颅骨再生的机制 | 人脐带间充质干细胞（S-HuMSCs）及其IL-32高表达变体（IL-32highHuMSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、流式细胞术、定量实时聚合酶链反应、西方印迹 | NA | 细胞、组织 | 实验中使用了多种细胞类型和一只大鼠颅骨缺损模型 |