单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2024-08-07 |
Inflammasome signaling is dispensable for ß-amyloid-induced neuropathology in preclinical models of Alzheimer's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1323409
PMID:38352874
|
研究论文 | 本文评估了在阿尔茨海默病（AD）的ß-淀粉样蛋白诱导的神经病理学模型中，炎症小体信号在体内的作用 | 研究结果质疑了炎症小体激活在预临床淀粉样蛋白模型中的普遍作用 | 研究仅限于特定的鼠标模型，可能不适用于所有AD模型 | 探讨炎症小体信号在ß-淀粉样蛋白诱导的AD神经病理学中的作用 | APP/PS1和AppNL-G-F鼠标模型中的微胶质细胞和全身炎症小体信号 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个鼠标模型 |
| 1002 | 2024-08-04 |
The ontogenesis and heterogeneity of basophils
2024, Discovery immunology
DOI:10.1093/discim/kyae003
PMID:38567293
|
综述 | 该文章综述了嗜碱细胞的发育过程和异质性 | 该综述强调了嗜碱细胞发育途径中的新发现，包括新识别的嗜碱细胞前体和成熟亚群 | 该综述未提供新的实验数据或实验结果 | 探讨嗜碱细胞的发育和生物学 | 各种物种的嗜碱细胞发育过程 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 文献综述 | NA |
| 1003 | 2024-08-07 |
The collagen landscape in cancer: profiling collagens in tumors and in circulation reveals novel markers of cancer-associated fibroblast subtypes
2024-01, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6207
PMID:37728068
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研究论文 | 本研究旨在通过分析肿瘤和循环中的胶原蛋白表达，识别癌症相关成纤维细胞亚型的潜在标志物 | 发现了特定胶原蛋白亚型与癌症相关成纤维细胞亚型（如iCAFs和myCAFs）的关联，并揭示了这些胶原蛋白在不同实体瘤中的表达失调与生存率的关联 | NA | 识别癌症生物标志物并探索新的治疗靶点 | 癌症相关成纤维细胞及其胶原蛋白表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用公开的单细胞RNA测序数据集和TCGA数据库中的肿瘤样本，以及癌症患者的血清样本 |
| 1004 | 2024-08-07 |
Transcriptional profile of human thymus reveals IGFBP5 is correlated with age-related thymic involution
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1322214
PMID:38318192
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研究论文 | 研究通过收集和整合公开的人类单细胞转录组测序数据，构建了人类胸腺细胞图谱，并发现了与年龄相关的胸腺退化相关的关键调节因子IGFBP5 | 首次系统地探索了早期胸腺细胞的细胞间通讯和调节因子，以及年龄相关的人类胸腺差异，并通过生物信息学和实验验证，揭示了IGFBP5作为胸腺退化的功能标记 | NA | 研究人类胸腺中与年龄相关的退化机制 | 人类胸腺的细胞和分子机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 350,678个细胞来自36个样本 |
| 1005 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell type-specific immune regulation associated with human neuromyelitis optica spectrum disorder
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1322125
PMID:38440735
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类视神经脊髓炎谱系障碍（NMOSD）患者的外周血单个核细胞，揭示了细胞类型特异性的免疫调控 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了NMOSD患者外周血单个核细胞的免疫特征 | NA | 探讨视神经脊髓炎谱系障碍（NMOSD）的外周免疫特征 | NMOSD患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 神经免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1006 | 2024-08-07 |
Increased glycolysis and cellular crosstalk in eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1321560
PMID:38444858
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研究论文 | 本研究探讨了嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉（eCRSwNP）中糖酵解酶基因表达增加及其与细胞间相互作用的关系 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了eCRSwNP中糖酵解重编程与细胞间相互作用的关系 | NA | 研究嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉（eCRSwNP）中糖酵解酶基因表达增加及其与细胞间相互作用的关系 | 嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉（eCRSwNP）患者的上皮细胞、基质细胞和记忆T细胞亚群 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1007 | 2024-08-04 |
MMR vaccination induces trained immunity via functional and metabolic reprogramming of γδ T cells
2024-Jan-30, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170848
PMID:38290093
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研究论文 | 这篇文章系统地研究了MMR疫苗是否可以诱导先天免疫细胞的长期功能变化。 | 这项研究首次揭示了MMR疫苗通过功能和代谢重编程γδ T细胞来诱导训练免疫的机制。 | 这项研究的样本量较小，仅涉及39名健康成年人，可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究MMR疫苗是否能诱导先天免疫细胞的长期功能变化。 | 39名健康成年人，接受MMR疫苗或安慰剂的随机对照试验。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39名健康成年人 |
| 1008 | 2024-08-07 |
Dynamics of Endothelial Cell Generation and Turnover in Arteries During Homeostasis and Diseases
2024-01-09, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文通过使用基于Cre-loxP和Dre-rox的双重组系统，开发了一种遗传系统，用于在体内无缝记录内皮细胞（EC）的增殖，并结合单细胞RNA测序和基因敲除，揭示了动脉中EC生成在稳态和疾病中的细胞和分子机制。 | 本文创新性地使用遗传增殖追踪技术，结合单细胞RNA测序和基因敲除，精确测量了动脉中内皮细胞的生成动态，并揭示了其与疾病状态的关系。 | 由于大型血管如动脉的增殖频率较低，目前评估动脉中内皮细胞生成动态仍具有挑战性。 | 旨在深入理解血管稳态和疾病的细胞机制，特别是内皮细胞的生成和周转。 | 研究对象为动脉中的内皮细胞（EC）及其在稳态和疾病状态下的生成和周转。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 成年小鼠的主动脉内皮细胞 |
| 1009 | 2024-08-04 |
Cancer-associated fibroblasts: protagonists of the tumor microenvironment in gastric cancer
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1340124
PMID:38562556
|
综述 | 本研究回顾了癌相关成纤维细胞在胃癌肿瘤微环境中的关键作用 | 探讨了癌相关成纤维细胞的异质性以及其如何促进胃癌的侵袭性和耐药性 | 癌相关成纤维细胞的异质性可能会使针对其的治疗策略开发变得复杂 | 旨在揭示癌相关成纤维细胞在胃癌中的作用及其潜在治疗策略 | 主要研究癌相关成纤维细胞及其在胃癌中的角色 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA |
| 1010 | 2024-08-04 |
Clinical implications of single cell sequencing for bladder cancer
2024, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2024.045442
PMID:38560564
|
综述 | 本综述总结了单细胞测序在膀胱癌中的临床应用现状 | 该研究首次系统总结了单细胞测序在膀胱癌中的应用，展示其在预后预测和免疫检查点抑制治疗反应评估中的潜力 | 此综述主要基于已发表的研究，可能存在选择偏倚 | 探讨单细胞测序在膀胱癌临床应用的现状和潜在影响 | 膀胱癌及其相关的单细胞研究 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | 41篇发表的研究 |
| 1011 | 2024-08-04 |
Lung single-cell RNA profiling reveals response of pulmonary capillary to sepsis-induced acute lung injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1308915
PMID:38348045
|
研究论文 | 这篇文章探讨了肺毛细血管在脓毒症诱导的急性肺损伤中的反应 | 揭示了不同类型的肺毛细血管在脓毒症急性肺损伤过程中的免疫互动和功能 | 尚不清楚Cd74+毛细血管的功能倾向是免疫还是耐受，需进一步研究确认 | 研究脓毒症引起的急性肺损伤中内皮细胞的功能和相互作用 | 小鼠的肺毛细血管及其在急性肺损伤中的反应 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠肺组织样本，时间点为0、24和48小时 |
| 1012 | 2024-08-07 |
Cystic Fibrosis Mice Are Highly Susceptible to Repeated Acute Pseudomonas aeruginosa Pneumonia after Intranasal Inoculation
2024, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2024/4769779
PMID:38347907
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研究论文 | 研究囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌肺炎感染后的易感性 | 首次发现囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌感染后比非囊性纤维化小鼠更易感，并揭示了非囊性纤维化小鼠中性粒细胞招募和效应功能的改善 | 研究仅限于F508del转基因囊性纤维化小鼠模型，可能需要进一步研究其他囊性纤维化小鼠模型 | 探讨囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌肺炎感染后的免疫反应和易感性 | 囊性纤维化小鼠和非囊性纤维化小鼠 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 囊性纤维化小鼠和非囊性纤维化小鼠 |
| 1013 | 2024-08-07 |
Prognostic Risk Models Using Epithelial Cells Identify β-Sitosterol as a Potential Therapeutic Target Against Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S447023
PMID:38559590
|
研究论文 | 本研究利用上皮细胞开发预测食管鳞状细胞癌（ESCC）预后的风险模型，并识别β-谷甾醇作为潜在的治疗靶点 | 通过单细胞RNA测序和功能富集分析，识别了与ESCC相关的核心基因，并构建了基于这些基因的预后模型 | NA | 研究食管鳞状细胞癌中上皮细胞异质性，并开发基于这些细胞类型的预测风险模型 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）中的上皮细胞异质性及其与预后和免疫反应的关系 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 773个食管鳞状细胞癌基因和3407个上皮细胞标记基因 |
| 1014 | 2024-08-07 |
scAnnoX: an R package integrating multiple public tools for single-cell annotation
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17184
PMID:38560451
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为scAnnoX的R包，该包整合了多种单细胞注释算法，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | scAnnoX提供了一个综合框架，用于整合和比较多种单细胞注释算法，提高了注释效率和准确性 | NA | 开发一个综合工具，用于整合和比较现有的单细胞注释算法 | 单细胞注释算法 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | NA |
| 1015 | 2024-08-07 |
An androgen receptor-based signature to predict prognosis and identification of ORC1 as a therapeutical target for prostate adenocarcinoma
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16850
PMID:38562999
|
研究论文 | 本研究旨在通过基于雄激素受体（AR）的特征来预测前列腺腺癌（PRAD）的预后，并识别ORC1作为治疗靶点 | 本研究首次识别了基于AR的10个相关基因（ARGs），并发现ORC1作为关键靶点，能够促进PRAD细胞的增殖和干细胞样特性，增强对enzalutamide的敏感性 | NA | 识别新的AR驱动特征以预测前列腺腺癌的预后，并揭示潜在的治疗靶点 | 前列腺腺癌及其对enzalutamide的耐药性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | 来自GSE99795的单细胞RNA测序数据 |
| 1016 | 2024-08-07 |
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.04.574196
PMID:38260616
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研究论文 | 本文描述了通过多种测序技术识别出一种由表观遗传控制的记忆星形胶质细胞亚群，该亚群在重新刺激后表现出加剧的促炎反应 | 首次揭示了星形胶质细胞记忆由代谢酶ATP柠檬酸裂解酶（ACLY）和组蛋白乙酰转移酶p300共同调控，这一发现为神经系统疾病的治疗提供了新的靶点 | NA | 研究星形胶质细胞在中枢神经系统病理中的作用及其调控机制 | 星形胶质细胞及其在多发性硬化症（MS）和实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的作用 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转座酶可及染色质测序（ATAC-seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、核酸检测和测序的细胞特异性聚焦（FIND-seq）、CRISPR/Cas9基因扰动研究 | NA | 细胞 | 急性和慢性EAE模型中的星形胶质细胞，慢性MS病变中的人类星形胶质细胞 |
| 1017 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing provides insight into multiple chemotherapy resistance in a patient with refractory DLBCL: a case report
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1303310
PMID:38533514
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病例报告 | 本研究利用单细胞转录组测序和常规批量下一代测序（NGS）分析了一位经历多次化疗复发的大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者的肿瘤全景 | 结合NGS和单细胞RNA测序技术，揭示了肿瘤微环境中的异质性和免疫抑制特性，为治疗难治性DLBCL提供了潜在的治疗靶点 | 研究仅基于单一病例，结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 阐明DLBCL进展的机制并开发新的治疗方法 | 一位经历多次化疗复发的大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者 | 数字病理学 | 大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组测序, NGS | NA | 转录组 | 单一患者样本 |
| 1018 | 2024-08-07 |
Identification of TIMPs signatures in Randall plaque from single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) analysis
2024-Jan-16, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01296-0
PMID:38225514
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1019 | 2024-08-07 |
Comparative study on differential expression analysis methods for single-cell RNA sequencing data with small biological replicates: Based on single-cell transcriptional data of PBMCs from COVID-19 severe patients
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0299358
PMID:38536877
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研究论文 | 本文比较了在生物学重复样本较少的情况下，八种差异表达分析（DEA）方法在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的适应性 | 提出了基于信息熵的新方法DEF-scRNA-seq，在生物学重复样本较少的情况下具有显著优势 | NA | 评估和比较在生物学重复样本较少的情况下，不同差异表达分析方法的性能 | COVID-19重症患者的PBMCs单细胞转录组数据 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 生物学重复样本较少 |
| 1020 | 2024-08-07 |
Association Between Diverse Cell Death Patterns Related Gene Signature and Prognosis, Drug Sensitivity, and Immune Microenvironment in Glioblastoma
2024-Jan-12, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-023-02181-4
PMID:38214842
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研究论文 | 本研究基于多种程序性细胞死亡模式相关基因构建了一个新的预测胶质母细胞瘤（GBM）预后的模型，并探讨了该模型与药物敏感性和免疫微环境的关系 | 首次整合了11种程序性细胞死亡模式相关基因，构建了一个新的预后模型，并验证了其在不同数据集中的有效性 | 需要进一步的研究来验证该模型在更大规模样本和不同人群中的应用效果 | 开发一个有效的工具来预测GBM的预后，并探讨其与药物敏感性和免疫微环境的关系 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者的预后、药物敏感性和免疫微环境 | 数字病理学 | 脑瘤 | 转录组数据分析 | Cox回归分析 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-GBM、REMBRANDT、CGGA和GSE162631数据集的GBM病例的bulk和单细胞转录组数据及临床数据 |