单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2024-08-04 |
Comparative analysis of single-cell transcriptome reveals heterogeneity and commonality in the immune microenvironment of colorectal cancer and inflammatory bowel disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1356075
PMID:38529274
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研究论文 | 本文分析了结直肠癌（CRC）和炎症性肠病（IBD）免疫微环境的异质性和共性 | 首次通过单细胞转录组分析深入探讨了CRC和IBD的细胞通信及其与衰老和炎症反应的关系 | 未详细阐明分子机制，且样本数虽大但仍可能不足以覆盖所有变异 | 旨在理解衰老、炎症与肿瘤在CRC和IBD中的特征 | 研究对象为92名CRC患者和24名IBD患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 432,314个单细胞，来自92名CRC患者和24名IBD患者 |
| 982 | 2024-08-04 |
Tumor-specific activation of folate receptor beta enables reprogramming of immune cells in the tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1354735
PMID:38384467
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研究论文 | 该文章展示了肿瘤特异性激活叶酸受体β如何重编程肿瘤微环境中的免疫细胞 | 阐明了FRβ在肿瘤微环境中的特定作用以及其对免疫细胞重编程的影响 | 未明确提及研究的局限性 | 研究FRβ在肿瘤相关巨噬细胞中的功能及其对肿瘤微环境的重编程作用 | 主要研究肿瘤微环境中的免疫抑制性巨噬细胞及其功能变化 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 983 | 2024-08-07 |
Decoding the tumor microenvironment and molecular mechanism: unraveling cervical cancer subpopulations and prognostic signatures through scRNA-Seq and bulk RNA-seq analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1351287
PMID:38482016
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，深入分析宫颈癌的肿瘤微环境和分子机制，识别关键的肿瘤上皮细胞亚群及其对宫颈癌进展的影响 | 首次识别出C3 PLP2+肿瘤上皮祖细胞作为宫颈癌中的一个重要亚群，并建立了独立的预后指标PLP2+肿瘤EPCs评分 | NA | 深入理解影响宫颈癌进展的决定因素，提高对宫颈癌肿瘤微环境的认识，并为未来的宫颈癌治疗提供有价值的见解 | 宫颈癌的肿瘤上皮细胞亚群及其对疾病进展的影响 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-seq） | NA | RNA | 四份宫颈癌患者样本 |
| 984 | 2024-08-07 |
Innovative prognostic modeling in ESCC: leveraging scRNA-seq and bulk-RNA for dendritic cell heterogeneity analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1352454
PMID:38515748
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA分析，深入探讨了食管鳞状细胞癌（ESCC）中树突状细胞的异质性及其对患者预后的影响 | 本研究通过scRNA-seq和批量RNA分析，揭示了树突状细胞在ESCC中的异质性，并开发了基于树突状细胞相关基因签名的预后模型 | NA | 深入研究食管鳞状细胞癌中树突状细胞的异质性及其对患者预后的影响 | 食管鳞状细胞癌中的树突状细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA分析 | NA | RNA | GSE53624队列（n = 119）、TCGA-ESCC队列（n = 139）、IMvigor210免疫治疗队列（n = 298） |
| 985 | 2024-08-04 |
Comprehending the cuproptosis and cancer-immunity cycle network: delving into the immune landscape and its predictive role in breast cancer immunotherapy responses and clinical endpoints
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1344023
PMID:38312844
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研究论文 | 本研究探索了cuproptosis与乳腺癌免疫反应和预后结果之间的关系 | 提出了基于cuproptosis-CICs的影响因素，并建立了预测模型以个性化乳腺癌治疗 | 缺乏临床试验结果来进一步验证模型的实际应用效果 | 探讨cuproptosis-CIC网络对乳腺癌患者免疫反应和预后结果的影响 | 使用TCGA、GEO及ICGC数据对乳腺癌患者进行研究 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, LASSO-Cox模型 | Cox比例风险回归模型 | 基因组数据 | 研究中使用了TCGA、GEO和ICGC数据，样本数量NA |
| 986 | 2024-08-04 |
Molecular mechanisms of pancreatic cancer liver metastasis: the role of PAK2
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1347683
PMID:38343537
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研究论文 | 本研究深入探讨了胰腺癌肝转移的分子机制，强调了PAK2的作用。 | 发现PAK2作为胰腺癌肝转移的关键基因，并揭示其通过激活TGF-β信号通路促进转移。 | 本研究的局限性在于主要依赖于生物信息学分析，缺乏大规模临床验证。 | 研究胰腺癌肝转移的机制，以为未来治疗方法和药物的发展提供科学依据。 | 研究对象为胰腺癌细胞及其肝转移相关基因。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序, 批量数据分析, 药物敏感性分析 | 无特定模型 | 基因表达数据 | 多个数据集(GSE155698, GSE154778, GSE71729, GSE19279, TCGA-PAAD) |
| 987 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the dynamics and heterogeneity of lymph node immune cells during acute and chronic viral infections
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1341985
PMID:38352870
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、scTCR-seq和scBCR-seq技术，探讨了急性与慢性病毒感染下淋巴结CD45+免疫细胞的动态变化和异质性 | 首次在单细胞水平上全面比较了急性与慢性病毒感染下淋巴组织免疫细胞的差异 | NA | 探索急性与慢性病毒感染下免疫反应的景观 | 淋巴结CD45+免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), scTCR-seq, scBCR-seq | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行急性（LCMV Armstrong）和慢性（LCMV clone 13）病毒感染的研究 |
| 988 | 2024-08-07 |
Comparison of the single-cell and single-nucleus hepatic myeloid landscape within decompensated cirrhosis patients
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1346520
PMID:38380322
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）技术，对比了失代偿期肝硬化患者经颈静脉肝穿刺（TJB）获取的肝组织中的肝髓系细胞景观。 | 首次通过单核转录组测序技术，有效克服了临床标本采集的复杂性，并能够充分分析所有主要的肝细胞类型，包括所有髓系细胞亚群。 | scRNA-seq平台未能恢复足够的枯否细胞数量，且其他单核细胞/巨噬细胞表现出应激相关参数的高表达。 | 旨在通过比较单细胞和单核RNA测序技术，全面理解失代偿期肝硬化患者的肝髓系细胞景观。 | 失代偿期肝硬化患者的肝组织中的髓系细胞。 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | 3名失代偿期肝硬化患者的肝组织样本 |
| 989 | 2024-08-07 |
Prognostic stratification of sepsis through DNA damage response based RiskScore system: insights from single-cell RNA-sequencing and transcriptomic profiling
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1345321
PMID:38404591
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研究论文 | 本研究通过基于DNA损伤反应（DDR）的风险评分系统，利用单细胞RNA测序和转录组分析，对脓毒症进行预后分层 | 开发了一种基于DNA损伤反应的新型风险评分系统，用于提高脓毒症预后预测的准确性，并可能指导更有效的治疗方案的创建 | NA | 旨在通过基于DNA损伤反应的风险评分系统，提高脓毒症预后预测的准确性，并探索个性化治疗策略 | 脓毒症患者的预后分层和治疗策略 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归 | 转录组数据 | 涉及多种细胞亚型，包括单核细胞、巨核细胞、CD4+ T细胞和中性粒细胞 |
| 990 | 2024-08-07 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:37782774
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研究论文 | 研究探讨了蛋白精氨酸甲基转移酶5（PRMT5）靶向治疗在套细胞淋巴瘤（MCL）中的耐药性问题 | 发现使用temsirolimus靶向阻断mTORC1可以克服PRMT5抑制剂的耐药性，并在耐药的MCL细胞系中显示出治疗协同作用 | 研究主要基于患者来源的异种移植（PDX）模型和细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的耐药机制并寻找克服耐药性的策略 | 套细胞淋巴瘤（MCL）及其对PRMT5抑制剂的耐药性 | NA | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 敏感细胞系4个，初级耐药细胞系4个，耐药PDX模型若干 |
| 991 | 2024-08-04 |
Comprehensive molecular and cellular characterization of endoplasmic reticulum stress-related key genes in renal ischemia/reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1340997
PMID:38495888
|
研究论文 | 本研究全面表征了与内质网应激相关的三种关键基因在肾脏缺血/再灌注损伤中的作用 | 该研究首次确定了与内质网应激相关的三种关键基因，并探讨了它们在肾脏移植后愈后预后的价值 | 研究的限制在于使用了已有的数据集，可能无法完全捕捉肾脏缺血/再灌注损伤的所有机制 | 研究旨在揭示肾脏缺血/再灌注损伤的潜在机制，以发现有效的肾脏保护靶点 | 研究对象为在肾脏缺血/再灌注损伤中涉及的关键基因及其相关途径 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 从GEO数据库收集了495个肾脏样本进行研究 |
| 992 | 2024-08-05 |
Apolipoprotein L genes are novel mediators of inflammation in beta cells
2024-Jan, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-06033-z
PMID:37924378
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研究论文 | 本文研究了载脂蛋白L基因在炎症引起的β细胞损伤中的新作用 | 发现APOL基因在β细胞中的表达受到炎症的显著上调，揭示了它们在胰腺炎症中的新调节作用 | 研究主要集中在单一细胞模型，可能无法全面反映复杂的体内环境 | 探讨载脂蛋白L基因在β细胞炎症损伤中的作用机制 | 主要研究人类胰腺β细胞以及与糖尿病相关的细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了原代人胰岛细胞和EndoC-βH1细胞 |
| 993 | 2024-08-07 |
Multi-omics and tumor immune microenvironment characterization of a prognostic model based on aging-related genes in melanoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/UZGP9704
PMID:38590405
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研究论文 | 本文通过分析与衰老相关的基因，构建了一个针对黑色素瘤的预后模型，并探讨了其与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次基于衰老相关基因构建黑色素瘤预后模型，并展示了其在预测患者死亡率方面的高准确性 | NA | 构建一个基于衰老相关基因的黑色素瘤预后模型，并探讨其在免疫治疗中的潜在应用 | 黑色素瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | 预后模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 994 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals altered lipid metabolism and inflammation-related gene expression of sebaceous glands in psoriasis and atopic dermatitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1334844
PMID:38433843
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研究论文 | 本研究揭示了皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的脂质代谢和炎症相关基因表达的变化 | 首次深入探讨了皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的作用，揭示其与炎症微环境的相互影响 | 未能探讨其他炎症性皮肤疾病对皮脂腺的影响 | 研究皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的作用 | 银屑病和特应性皮炎患者的人类皮肤样本 | 数字病理学 | 银屑病, 特应性皮炎 | 空间转录组学 | NA | 人类皮肤样本 | 涉及银屑病和特应性皮炎患者的皮肤样本 |
| 995 | 2024-08-07 |
Unveiling macrophage diversity in myocardial ischemia-reperfusion injury: identification of a distinct lipid-associated macrophage subset
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1335333
PMID:38449872
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在心肌缺血-再灌注损伤中鉴定出一种新型脂质相关巨噬细胞亚型，并探讨了其在心肌重塑中的潜在作用 | 首次在心肌缺血-再灌注损伤中发现并鉴定了一种新型脂质相关巨噬细胞亚型，该亚型具有高表达的Spp1和Trem2等基因 | NA | 旨在识别心肌缺血-再灌注损伤中的巨噬细胞亚型，并探索其对心脏修复和损伤的双重作用 | 心肌缺血-再灌注损伤中的巨噬细胞亚型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用小鼠和人类的心脏样本进行研究 |
| 996 | 2024-08-07 |
Integrative analysis identifies oxidative stress biomarkers in non-alcoholic fatty liver disease via machine learning and weighted gene co-expression network analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1335112
PMID:38476236
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研究论文 | 本研究通过机器学习和加权基因共表达网络分析，识别非酒精性脂肪肝病中的氧化应激生物标志物 | 本研究发现了两个与非酒精性脂肪肝病中氧化应激密切相关的关键基因，CDKN1B和TFAM，这些基因可能作为新的诊断和治疗靶点 | NA | 识别非酒精性脂肪肝病中的氧化应激生物标志物，为临床管理提供新的视角 | 非酒精性脂肪肝病中的氧化应激相关基因 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | LASSO回归, SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据 | 涉及31个交集基因和NASH小鼠模型中的肝脏组织 |
| 997 | 2024-08-07 |
CD81 and CD82 expressing tumor-infiltrating lymphocytes in the NSCLC tumor microenvironment play a crucial role in T-cell activation and cytokine production
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1336246
PMID:38515751
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了非小细胞肺癌肿瘤微环境中表达CD81和CD82的肿瘤浸润淋巴细胞在T细胞激活和细胞因子产生中的重要作用 | 发现四跨膜蛋白家族成员CD81和CD82在激活的T细胞中表达，并与激活和耗竭标记物有强相关性，体外实验证实IL-2刺激的T细胞中CD81和CD82表达增加 | NA | 阐明非小细胞肺癌肿瘤微环境中与T细胞激活相关的分子特征 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本中的T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19名非小细胞肺癌患者 |
| 998 | 2024-08-07 |
SAP-expressing T peripheral helper cells identify systemic lupus erythematosus patients with lupus nephritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1327437
PMID:38550577
|
研究论文 | 本文研究了SAP表达的T外周辅助细胞在系统性红斑狼疮（SLE）患者中的作用，特别是与狼疮性肾炎（LN）的关系。 | 首次探讨了SAP表达的T外周辅助细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用，并利用单细胞RNA测序数据验证了其在肾浸润T细胞中的表达。 | NA | 探讨SAP表达的T外周辅助细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用。 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞（PBMC）和肾浸润T细胞。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA seq） | NA | 细胞表面标记和细胞内SAP的表达数据 | 30名SLE患者（包括10名LN患者）和对照组 |
| 999 | 2024-08-07 |
Identification of potential biomarkers for idiopathic pulmonary arterial hypertension using single-cell and bulk RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1328234
PMID:38586587
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序分析，探索特发性肺动脉高压（IPAH）中的细胞异质性和分子病理，并识别潜在的生物标志物 | 本研究结合单细胞和批量RNA测序数据，首次识别出12个候选生物标志物，并通过RT-qPCR验证了其中5个基因在肺动脉内皮细胞中的表达差异 | NA | 揭示IPAH的潜在诊断标志物和治疗靶点 | 特发性肺动脉高压（IPAH）的细胞异质性和分子病理 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序 | NA | RNA | 涉及三个IPAH数据集和两个额外的PAH数据集 |
| 1000 | 2024-08-04 |
Direct male development in chromosomally ZZ zebrafish
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1362228
PMID:38529407
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研究论文 | 本文探讨了NA斑马鱼的性别决定和生殖腺发育机制。 | 揭示了NA斑马鱼在性别决定过程中的直接雄性发育机制，以及性腺发育中不同染色体的作用。 | 研究主要集中于特定的斑马鱼品系，可能无法广泛适用于其他物种。 | 了解NA斑马鱼的性腺发育机制。 | 研究对象为NA斑马鱼及其不同性别的发育过程。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本和图像 | 19dpf和30dpf的性腺样本 |