单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-05-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the heterogeneity and function of mast cells in human ccRCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494025
PMID:39840068
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research paper | 该研究通过单细胞转录组学揭示了人类透明细胞肾癌（ccRCC）中肥大细胞的异质性和功能 | 首次在ccRCC中进行了全面的肥大细胞单细胞研究，鉴定了四种肥大细胞特征基因，并揭示了肥大细胞在ccRCC中的表型转变 | 样本量较小（仅4名ccRCC患者），且需要进一步验证肥大细胞在ccRCC中的具体作用机制 | 探究ccRCC中肥大细胞的异质性和功能 | 透明细胞肾癌（ccRCC）患者组织样本 | digital pathology | 肾癌 | 单细胞测序、空间转录组学、多重免疫组化（mIHC） | NA | 单细胞转录组数据、批量组织测序数据 | 4名ccRCC患者的组织样本，整合了在线测序数据库的数据 |
| 82 | 2025-05-04 |
Comprehensive bioinformatics analysis identifies metabolic and immune-related diagnostic biomarkers shared between diabetes and COPD using multi-omics and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1475958
PMID:39845878
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研究论文 | 通过多组学和机器学习方法，识别糖尿病和慢性阻塞性肺疾病（COPD）共有的代谢和免疫相关诊断生物标志物 | 首次通过多中心患者队列、多组学分析和多种机器学习算法，识别出糖尿病和COPD共有的4个生物标志物（CADPS、EDNRB、THBS4和TMEM27），并在单细胞测序、临床样本和动物模型中验证了其稳健性 | 未明确说明样本的具体数量或来源限制，且未提及外部验证队列的结果 | 探索糖尿病和COPD之间的分子机制联系，并识别共有的诊断生物标志物 | 糖尿病和COPD患者的多中心队列数据、临床样本和动物模型 | 生物信息学 | 糖尿病, 慢性阻塞性肺疾病 | 多组学分析（包括基因表达分析）、机器学习算法、单细胞测序 | 多种机器学习算法（未具体说明）、WGCNA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | 多中心患者队列（具体数量未说明）、临床样本和动物模型 |
| 83 | 2025-05-04 |
Deciphering hub genes and immune landscapes related to neutrophil extracellular traps in rheumatoid arthritis: insights from integrated bioinformatics analyses and experiments
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1521634
PMID:39845946
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和实验，揭示了类风湿性关节炎中与中性粒细胞胞外陷阱相关的枢纽基因和免疫景观 | 首次阐明了RA滑膜微环境中中性粒细胞的异质性与成纤维细胞的通讯机制，并鉴定和验证了4个潜在的NET相关生物标志物 | 研究结果需要进一步在更大规模的临床队列中进行验证 | 探索NETs在RA发病机制中的分子机制和关键基因 | 类风湿性关节炎患者和佐剂诱导的关节炎大鼠模型 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、免疫组织化学、实时定量PCR | 机器学习（三种技术） | RNA测序数据、微阵列数据 | 多个GEO数据集和临床队列 |
| 84 | 2025-05-04 |
Impact of glioma metabolism-related gene ALPK1 on tumor immune heterogeneity and the regulation of the TGF-β pathway
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1512491
PMID:39845963
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研究论文 | 该研究通过整合多源胶质瘤数据集，利用NMF和WGCNA方法识别关键代谢基因，并构建预测模型，探讨ALPK1基因在胶质瘤免疫异质性和TGF-β通路调控中的作用 | 采用多数据集策略和101种机器学习技术组合构建预测模型，首次阐明ALPK1基因在胶质瘤免疫调控中的相关性 | 研究结果需要进一步实验验证，且样本来源可能影响模型的泛化能力 | 探索胶质瘤分子分型、寻找新的预后生物标志物并理解其免疫微环境特征 | 胶质瘤患者及其相关基因表达数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | NMF, WGCNA, 单细胞测序 | LASSO+GBM | 基因表达数据 | 多源胶质瘤数据集（未明确具体数量） |
| 85 | 2025-05-04 |
Exploring the shared mechanism of fatigue between systemic lupus erythematosus and myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome: monocytic dysregulation and drug repurposing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1440922
PMID:39845969
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研究论文 | 探索系统性红斑狼疮(SLE)和肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征(ME/CFS)之间疲劳的共同机制，包括单核细胞失调和药物再利用 | 首次识别了SLE和ME/CFS共有的58个重叠基因，并确定了5个关键靶点(IL1β、CCL2、TLR2、STAT1、IFIH1)，发现这些靶点在单核细胞中富集，并通过RT-qPCR验证了在激活的单核细胞中的上调表达 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探索SLE和ME/CFS中疲劳的共同机制并预测潜在治疗药物 | 系统性红斑狼疮(SLE)和肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征(ME/CFS) | 生物信息学 | 自身免疫性疾病/神经系统疾病 | 生物信息学分析(GO、KEGG、PPI网络构建)、单细胞聚类、RT-qPCR、分子对接 | THP-1细胞炎症模型 | 基因表达数据 | NA |
| 86 | 2025-05-04 |
Exploring the role of metabolic pathways in TNBC immunotherapy: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1528248
PMID:39850483
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review | 本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）中代谢途径与免疫功能之间的相互作用，强调了单细胞和空间转录组学技术的最新进展 | 探讨了代谢重编程在调节免疫细胞功能中的关键作用，并提出了针对代谢途径的策略可能增强免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的响应性 | NA | 研究TNBC中代谢途径与免疫功能的相互作用及其对免疫治疗的影响 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | digital pathology | breast cancer | single-cell transcriptomics, spatial transcriptomics | NA | transcriptomics data | NA |
| 87 | 2025-05-04 |
Integrated single-cell RNA sequencing reveals the tumor heterogeneity and microenvironment landscape during liver metastasis in adenocarcinoma of esophagogastric junction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1484234
PMID:39850884
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research paper | 利用单细胞RNA测序技术揭示食管胃结合部腺癌肝转移过程中的肿瘤异质性和微环境景观 | 首次在AEGJ肝转移中鉴定出一种特定的成纤维细胞类型，并发现SFRP2基因在周细胞中的高表达可能通过Wnt通路影响血管稳定性和血管生成 | 样本量较小，未进行功能验证实验 | 探究食管胃结合部腺癌肝转移的细胞和分子机制 | 食管胃结合部腺癌肝转移患者的肿瘤组织和微环境 | digital pathology | esophagogastric junction adenocarcinoma | single-cell RNA sequencing, immunofluorescence staining | NA | RNA-seq data, immunofluorescence images | AEGJ肝转移患者样本（具体数量未明确说明） |
| 88 | 2025-05-04 |
Combining single-cell analysis and molecular docking techniques to construct a prognostic model for colon adenocarcinoma and uncovering inhibin subunit βb as a novel therapeutic target
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1524560
PMID:39850875
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研究论文 | 结合单细胞分析和分子对接技术构建结肠腺癌预后模型，并揭示抑制素亚基βb作为新型治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序数据和分子对接技术，构建基于失巢凋亡相关基因的结肠腺癌预后模型，并发现INHBB作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于体外细胞实验 | 探索失巢凋亡与结肠腺癌的生物学联系及其在肿瘤进展中的机制，寻找新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者和细胞系 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、分子对接、基因敲除 | Cox比例风险模型、Lasso回归 | 转录组数据、临床信息 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌患者数据 |
| 89 | 2025-05-04 |
Integrated single-cell and bulk transcriptome analysis of R-loop score-based signature with regard to immune microenvironment, lipid metabolism and prognosis in HCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1487372
PMID:39850878
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research paper | 该研究通过整合单细胞和批量转录组分析，构建了一个基于R-loop评分的特征模型，以探索其在HCC免疫微环境、脂质代谢和预后中的作用 | 首次构建了基于R-loop评分的特征模型，揭示了R-loop调节基因（RLRGs）与HBV感染、脂质代谢及HCC进展的关系，并发现CLTC作为潜在的治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据，缺乏对R-loop形成和功能机制的深入实验验证 | 探索R-loop在HCC进展中的作用，并构建预后风险模型以识别潜在治疗靶点 | HCC患者的单细胞和批量转录组数据，以及体外和体内实验验证 | digital pathology | hepatocellular carcinoma | scRNA-seq, WGCNA分析 | 预后风险模型 | 转录组数据 | 来自GSE149614和CRA002308的HCC患者数据，以及TCGA数据库的数据 |
| 90 | 2025-05-04 |
Macrophage heterogeneity and oncogenic mechanisms in lung adenocarcinoma: insights from scRNA-seq analysis and predictive modeling
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491872
PMID:39850883
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析探索了肺腺癌中巨噬细胞的异质性及其潜在的致癌机制，并基于巨噬细胞相关基因构建了一个预后模型 | 揭示了巨噬细胞亚群的复杂性及其在肺腺癌中的潜在致癌作用，构建了一个基于巨噬细胞标记基因的预后模型，并验证了其在预测预后和免疫治疗效果方面的有效性 | 研究主要依赖于TCGA数据，可能受到样本量和数据质量的限制，且细胞实验仅验证了COL5A1的致癌机制 | 探索肺腺癌中巨噬细胞的特性及其对预后的影响，并构建一个有效的预后模型 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞 | digital pathology | lung cancer | scRNA-seq, RT-PCR | Lasso regression, multivariate Cox regression | scRNA-seq data, clinical data | TCGA数据集及多个外部验证数据集 |
| 91 | 2025-05-04 |
The emergence of DNAM-1 as the facilitator of NK cell-mediated killing in ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1477781
PMID:39835114
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研究论文 | 本研究探讨了DNAM-1在卵巢癌中促进NK细胞介导的杀伤作用 | 揭示了DNAM-1在卵巢癌中作为NK细胞杀伤促进因子的新作用，并发现PVR/DNAM-1轴在肿瘤免疫逃逸中的关键作用 | 样本量相对有限(80例)，且主要为观察性研究，缺乏机制层面的深入探索 | 探索卵巢癌中NK细胞的表型和功能特征及其与临床预后的关系 | 80名卵巢癌患者的血液、原发肿瘤和转移组织中的NK细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 流式细胞术、scRNA-seq | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 80名卵巢癌患者样本 |
| 92 | 2025-05-04 |
Integrating single cell analysis and machine learning methods reveals stem cell-related gene S100A10 as an important target for prediction of liver cancer diagnosis and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1534723
PMID:39840058
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研究论文 | 结合单细胞分析和机器学习方法，揭示干细胞相关基因S100A10作为肝癌诊断和免疫治疗预测的重要靶点 | 首次将单细胞RNA测序与机器学习技术结合，识别出与肝癌干细胞相关的关键基因S100A10，并验证其作为预后标志物的潜力 | 研究仅针对肝癌，未在其他癌症类型中验证S100A10的普适性 | 提高肝癌的诊断精度和免疫治疗效果 | 肝癌干细胞相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | XGBoost | 基因表达数据 | 多个数据集（具体数量未提及） |
| 93 | 2025-05-03 |
Transcriptomic profiling of thymic dysregulation and viral tropism after neonatal roseolovirus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1375508
PMID:38895117
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究新生儿玫瑰疹病毒感染后胸腺的转录组变化和病毒趋向性 | 首次全面描述了玫瑰疹病毒在新生儿感染后的胸腺趋向性，并建立了首个体外易感MRV感染的细胞培养系统 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究新生儿玫瑰疹病毒感染如何导致胸腺功能失调和自身免疫疾病 | 小鼠玫瑰疹病毒(MRV)感染的胸腺细胞 | 转录组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 转录组数据 | 未明确说明样本数量，研究对象为MRV感染的小鼠胸腺细胞 |
| 94 | 2025-05-03 |
Metabolic reprogramming and macrophage expansion define ACPA-negative rheumatoid arthritis: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1512483
PMID:39830504
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究ACPA阴性类风湿关节炎（ACPA- RA）的代谢重编程和巨噬细胞扩增特征 | 首次整合单细胞RNA测序与机器学习，构建神经网络模型区分ACPA- RA患者与健康对照，并揭示其独特的代谢特征 | 样本来源仅限于外周血单个核细胞和滑膜组织，未涉及其他可能相关的组织或细胞类型 | 阐明ACPA- RA的独特细胞和代谢特征，以提供更有针对性的诊断和治疗策略 | ACPA阴性和阳性类风湿关节炎患者及健康对照的外周血单个核细胞和滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 神经网络 | RNA测序数据 | ACPA- RA患者、ACPA+ RA患者及健康对照的外周血单个核细胞和滑膜组织样本 |
| 95 | 2025-05-03 |
Myeloid dendritic cells and periodontal disease association: integrated study of single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522281
PMID:39830509
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，探讨髓样树突状细胞与牙周病之间的关联 | 结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，首次发现LIMA1基因在牙周病进展中的关键作用 | 研究样本来源于公开数据集，可能无法完全代表所有牙周病患者群体 | 阐明牙周病的发病机制，为精准医疗提供新靶点 | 牙周病患者和健康对照的免疫细胞 | 生物信息学 | 牙周病 | scRNA-seq, 孟德尔随机化分析 | Seurat, CellChat, ClusterProfilerR | 单细胞RNA测序数据 | GSE152042数据集中的样本 |
| 96 | 2025-05-03 |
scRNA-seq reveals elevated interferon responses and TNF-α signaling via NFkB in monocytes in children with uncomplicated malaria
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10233
PMID:39830896
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究儿童无并发症疟疾中单核细胞的干扰素反应和TNF-α信号传导机制 | 首次在儿童无并发症疟疾中，利用单细胞RNA测序技术揭示了单核细胞中干扰素反应和TNF-α信号传导的增强现象 | 样本量相对较小（n=11），且仅针对无并发症疟疾儿童，结果可能不适用于其他人群或疾病阶段 | 探究宿主-寄生虫因素与症状性疟疾的关系，以及免疫反应的差异 | 224名个体（134名患者和90名无症状对照），其中11名进行了单细胞RNA测序 | 免疫学 | 疟疾 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 224名个体（11名进行scRNA-seq） |
| 97 | 2025-05-01 |
Angiogenesis-on-a-chip coupled with single-cell RNA sequencing reveals spatially differential activations of autophagy along angiogenic sprouts
2024-01-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44427-0
PMID:38172108
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研究论文 | 通过血管生成芯片与单细胞RNA测序结合，揭示了血管生成芽中自噬的空间差异性激活 | 首次利用血管生成芯片重建具有清晰端点的3D血管芽，并通过单细胞RNA测序揭示了自噬在血管芽中的空间差异性激活 | 研究模型可能无法完全模拟体内复杂的血管生成环境 | 探究自噬在血管生成芽中内皮细胞的功能异质性 | 血管生成芽中的内皮细胞 | 生物医学工程 | NA | 单细胞RNA测序 | 血管生成芯片 | RNA测序数据 | NA |
| 98 | 2025-04-18 |
Multiomic spatial landscape of innate immune cells at human central nervous system borders
2024-Jan, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02673-1
PMID:38123840
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研究论文 | 通过多组学空间分析，揭示了人类中枢神经系统边界先天免疫细胞的多样性和分布特征 | 整合单细胞RNA测序、飞行时间质谱流式细胞术和单细胞空间转录组学，首次全面表征了人类CNS界面的免疫系统 | 样本量相对有限（102名个体），且主要关注髓系细胞 | 探索人类中枢神经系统边界先天免疫细胞的时空分布特征 | 人类中枢神经系统边界的先天免疫细胞（如小胶质细胞和CNS相关巨噬细胞） | 免疫学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序、飞行时间质谱流式细胞术、单细胞空间转录组学、命运图谱、高级免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 102名个体的356,000个转录组，15名接受外周血干细胞移植的个体 |
| 99 | 2025-04-17 |
Preparation of a Single-Cell Suspension from Mouse Carotid Arteries for Single-Cell Sequencing
2024-01-19, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65863
PMID:38314826
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研究论文 | 本文提出了一种用于从小鼠颈动脉制备单细胞悬浮液的方案，以进行单细胞测序 | 设计了一种两步消化方法，结合胶原酶/DNase和胰蛋白酶的消化过程，以减少细胞损伤 | 该方案可能需要针对其他组织的血管进行适当修改 | 开发一种适用于单细胞测序的小鼠颈动脉单细胞悬浮液制备方案 | 小鼠颈动脉 | 单细胞测序 | 颈动脉粥样硬化 | 单细胞测序，AO/PI双荧光计数 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠颈动脉细胞 |
| 100 | 2025-04-15 |
Spatial transcriptomics reveals that metabolic characteristics define the tumor immunosuppression microenvironment via iCAF transformation in oral squamous cell carcinoma
2024-01-30, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-023-00267-8
PMID:38287007
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示了口腔鳞状细胞癌中代谢特征通过iCAF转化定义肿瘤免疫抑制微环境的机制 | 利用单细胞和空间转录组学测序技术，揭示了高代谢区域中成纤维细胞通过乳酸转化为iCAFs，进而招募Tregs形成免疫抑制微环境的机制 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证 | 阐明口腔鳞状细胞癌中不同代谢区域与肿瘤免疫微环境的关系 | 口腔鳞状细胞癌组织 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序(SC), 空间转录组学(ST), TCGA批量数据 | k-means聚类, SPOTlight反卷积, CellPhoneDB, NicheNet | 转录组数据 | 未明确说明样本数量 |