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当前共找到 1397 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-08-13 |
nf-core/airrflow: an adaptive immune receptor repertoire analysis workflow employing the Immcantation framework
2024-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576147
PMID:38293151
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研究论文 | 开发并评估了nf-core/airrflow，一个基于Immcantation框架的适应性免疫受体库分析工作流程，用于处理Bulk和单细胞AIRR-seq数据 | 提供了端到端的、可扩展且可移植的AIRR-seq处理流程，整合了Immcantation框架，并支持高通量并行处理大规模数据集 | 未明确提及局限性，可能包括对特定计算基础设施的依赖或对新用户的复杂性 | 解决现有AIRR-seq工具在跨样本并行化、可扩展性和高性能计算基础设施可移植性方面的不足 | B细胞和T细胞受体序列，来自Bulk和单细胞测序的适应性免疫受体库数据 | 生物信息学 | COVID-19 | AIRR-seq | NA | 测序数据（Bulk和单细胞） | 97名COVID-19感染者和99名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-08-13 |
The Fibroblast Landscape in Stomach Carcinogenesis
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.001
PMID:38342299
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综述 | 总结并讨论了过去几年中利用单细胞RNA测序和空间转录组学研究胃致癌过程中成纤维细胞异质性和可塑性的最新进展 | 首次系统阐述了从正常胃到化生、不典型增生和癌症过程中，成纤维细胞群体的异质性及其可塑性的变化，特别是PDGFRA表达的端粒细胞样细胞在化生和异型增生中的作用 | 本文为综述，未包含原始实验数据，可能受限于所引用研究的范围 | 总结并讨论胃致癌过程中成纤维细胞群体的异质性、可塑性及其在癌微环境中的作用 | 人类胃组织中的成纤维细胞群体，从正常胃到化生、不典型增生和癌症各阶段 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2026-08-13 |
Lysyl Oxidase Regulates Epithelial Differentiation and Barrier Integrity in Eosinophilic Esophagitis
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.025
PMID:38340809
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研究论文 | 本研究探讨赖氨酰氧化酶在嗜酸性食管炎中对上皮分化和屏障完整性的调节作用 | 首次揭示LOX在食管上皮中的非经典信号分子角色，通过激活BMP通路调节上皮稳态，提出了LOX/BMP轴作为治疗靶点 | 研究主要基于体外模型，需进一步在体内验证；LOX/BMP轴的详细机制尚待深入探索 | 阐明LOX在嗜酸性食管炎食管上皮中的功能作用及潜在治疗价值 | 人食管上皮类器官和气液界面培养模型 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 患者来源的类器官样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-08-13 |
Noncanonical TRAIL Signaling Promotes Myeloid-Derived Suppressor Cell Abundance and Tumor Growth in Cholangiocarcinoma
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.006
PMID:38219900
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研究论文 | 本研究揭示了非经典TRAIL信号通过促进髓源性抑制细胞增殖进而支持胆管癌肿瘤生长的机制 | 首次证明肿瘤细胞上的TRAIL通过非经典信号通路激活MDSC中的核因子-κB，从而增强MDSC增殖并抵抗凋亡，挑战了TRAIL仅作为促凋亡因子的传统观点 | 研究主要在鼠类模型中进行，人类胆管癌中的相关机制尚需进一步验证 | 阐明TRAIL+癌细胞通过非经典TRAIL信号在MDSC中促进其丰度并支持肿瘤生长的机制，以探索新的治疗靶点 | 小鼠胆管癌模型中的癌细胞和髓源性抑制细胞 | 癌症免疫学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序、转录组和表位细胞索引测序 | 小鼠同基因原位肿瘤模型 | 单细胞转录组和表位数据 | 多种免疫活性同基因原位小鼠胆管癌模型，具体样本数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞转录组和表位细胞索引测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序和CITE-seq |
| 85 | 2026-08-13 |
Telocytes in the Luminal GI Tract
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.002
PMID:38342300
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综述 | 本文综述了腔内胃肠道中端粒细胞的研究现状、争议和未来方向，重点讨论其在干细胞巢中的作用 | 结合单细胞RNA测序发现，提出端粒细胞作为干细胞巢成分的潜在争议和替代机制 | 未提供实验数据，仅基于文献综述，可能受限于现有研究的范围和解释 | 探讨腔内胃肠道中端粒细胞的结构功能、在干细胞巢中的作用，以及其存在的争议和未来研究方向 | 腔内胃肠道中的端粒细胞及相关基质细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | 不适用（综述） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-08-13 |
Interindividual Variation in Gut Nitrergic Neuron Density Is Regulated By GDNF Levels and ETV1
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101405
PMID:39299667
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研究论文 | 本研究探讨了GDNF水平通过ETV1调控肠道氮能神经元密度的个体间差异及其对肠道功能的影响 | 首次揭示了GDNF水平在人类结肠中的自然变异（约5倍）与氮能神经元标记物表达的强相关性，并鉴定出miR-9和miR-133作为GDNF表达的进化保守负调控因子，以及ETV1作为介导GDNF调控氮能谱系发育的关键转录因子 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的关联分析，尚需进一步的因果验证和临床转化研究 | 探究肠道氮能神经元密度个体间差异的分子机制及其对肠道功能的影响 | 人类正常成人结肠活检样本（41例）、人类和小鼠发育期肠道、转基因小鼠模型、原代神经元培养 | 分子生物学 | 胃肠道疾病 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、siRNA、原代神经元培养 | 转基因小鼠模型 | 转录组数据、单细胞基因表达数据、表型数据 | 41例人类结肠活检、转基因小鼠及原代神经元培养样本 | NA | RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-08-13 |
Deciphering the impact of senescence in kidney transplant rejection: An integrative machine learning and multi-omics analysis via bulk and single-cell RNA sequencing
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312272
PMID:39602449
|
研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析（包括批量及单细胞RNA测序），探讨衰老在肾移植排斥反应中的作用，并开发诊断和预后模型。 | 首次结合多种机器学习算法与多组学数据识别衰老相关预测基因，并构建高精度的急性排斥诊断模型和移植物存活预后模型。 | 未在独立外部队列或前瞻性研究中验证模型；单细胞分析可能受样本量限制。 | 阐明衰老在肾移植排斥中的角色，并开发基于衰老相关基因的生物标志物以改善诊断和预后。 | 肾移植受者及其移植肾组织样本，包括微阵列和单细胞RNA测序数据。 | 机器学习 | 肾移植排斥反应 | 微阵列、单细胞RNA测序 | 随机森林、支持向量机、极端梯度提升、广义线性模型和最小绝对收缩和选择算子 | 基因表达数据（微阵列和单细胞RNA测序数据） | 未明确指定，但包含来自基因表达综合库的多个数据集。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2026-08-12 |
Ultrasound-Guided Fine Needle Biopsy of Human Axillary Lymph Nodes to Assess B Cell Responses to Vaccination
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3950-4_2
PMID:39017882
|
研究论文 | 本文描述了超声引导下细针穿刺活检人腋窝淋巴结的方法，以评估疫苗接种后淋巴结内的B细胞反应，并介绍了后续的流式细胞术和单细胞RNA测序分析流程 | 首次详细描述了在人类腋窝淋巴结中进行超声引导下细针穿刺活检以动态研究疫苗接种后B细胞反应及T-B细胞相互作用的可行方法，克服了该解剖部位难以直接研究的挑战 | 文中未提及具体限制，但从内容看可能涉及样本量有限及操作技术依赖性强等潜在不足 | 提供一种安全有效的方法来评估人类腋窝淋巴结对疫苗接种的免疫反应，特别是B细胞动态过程及其与T细胞的相互作用 | 人类腋窝淋巴结中的B细胞和T细胞群体 | 数字病理学 | 不适用 | 超声引导下细针穿刺活检，流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本（淋巴结细胞） | 未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2026-08-12 |
Diverse physiological roles of the MqsR/MqsA toxin/antitoxin system
2024-Jan, Sustainable microbiology
DOI:10.1093/sumbio/qvae006
PMID:42576895
|
综述 | 本文总结了MqsR/MqsA毒素/抗毒素系统在细菌生理中的多种作用，包括一般应激反应、生物膜形成、胆汁酸应激、氧化应激和噬菌体防御 | 系统性地总结了MqsR/MqsA系统在多种生理过程中的作用，特别强调了其在噬菌体防御和持留态形成中的重要性，并基于单细胞转录组研究提供了新见解 | 未提及具体局限性 | 阐明MqsR/MqsA毒素/抗毒素系统在细菌生理中的多样作用及其在噬菌体疗法中的意义 | 大肠杆菌中的MqsR/MqsA毒素/抗毒素系统 | 微生物学 | 细菌感染 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-08-11 |
CD4+ T cell heterogeneity in gestational age and preeclampsia using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1401738
PMID:38774869
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和T细胞受体库分析，探究蜕膜CD4+ T细胞在孕龄和子痫前期中的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体库分析揭示蜕膜CD4+ T细胞亚群的多样性和克隆性随孕龄变化，并鉴定出子痫前期中可能驱动炎症的Th1/Th2中间型和效应Treg样亚群 | 未提供具体限制信息 | 研究蜕膜CD4+ T细胞在孕龄和子痫前期中的异质性及其在母胎免疫耐受中的作用 | 蜕膜CD4+ T细胞亚群，包括Th1/Th2中间型、Th1和Treg细胞 | 单细胞测序 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序、T细胞受体库分析 | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 | 涉及早孕期、晚孕期健康妊娠及子痫前期蜕膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-08-11 |
Identification and validation of Rab GTPases RAB13 as biomarkers for peritoneal metastasis and immune cell infiltration in colorectal cancer patients
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1403008
PMID:39192986
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研究论文 | 通过信息学分析和实验验证，鉴定RAB13为结直肠癌腹膜转移和免疫细胞浸润的生物标志物。 | 首次将RAB13与结直肠癌腹膜转移及免疫细胞浸润相关联，并利用多种算法和单细胞测序分析其作用，提出其作为治疗靶点的潜力。 | 缺乏功能实验验证RAB13在腹膜转移中的具体机制，且主要依赖公共数据库和有限的样本。 | 确定与结直肠癌腹膜转移相关的生物标志物及其与免疫细胞浸润的关系。 | 结直肠癌患者组织样本及公共数据库中的基因表达数据。 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 基因集富集分析(GSEA) | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞转录组数据 | 未明确给出具体样本数量，使用了公共数据库和少量结直肠癌组织。 | NA | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 92 | 2026-08-11 |
Multi-omics landscape of Interferon-stimulated gene OASL reveals a potential biomarker in pan-cancer: from prognosis to tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1402951
PMID:39286258
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研究论文 | 通过多组学分析揭示干扰素刺激基因OASL在泛癌中的预后和免疫微环境相关作用 | 系统性泛癌分析OASL的表达、遗传异质性及其与预后的关联，并首次揭示其通过IFN-γ/STAT1和IL-6/JAK/STAT3通路调控PD-L1表达，影响肿瘤微环境中巨噬细胞浸润和细胞毒性T淋巴细胞功能障碍 | 主要基于公共数据库的生物信息学分析，实验验证仅限于胰腺癌细胞系，机制验证不够深入 | 探讨OASL在泛癌中的表达模式、预后价值及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 33种肿瘤类型的样本及胰腺癌细胞系 | 生物信息学 | 泛癌 | 多组学分析（包括转录组、蛋白组）、单细胞转录组测序、细胞实验 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞转录组数据 | 33种肿瘤类型的多个样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2026-08-09 |
Alzheimer's Disease and Aging Association: Identification and Validation of Related Genes
2024, The journal of prevention of Alzheimer's disease
DOI:10.14283/jpad.2023.101
PMID:38230733
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别并验证了与阿尔茨海默病相关的衰老相关基因，并筛选出四个潜在的早期诊断生物标志物。 | 结合差异表达基因和衰老基因筛选，利用多种算法鉴定核心基因，并采用单细胞测序分析和ROC曲线评估诊断价值，最终预测了靶向药物。 | 未提供明确的局限信息 | 识别和验证与阿尔茨海默病相关的衰老相关基因，并评估其作为早期诊断生物标志物的潜力。 | 阿尔茨海默病相关的衰老相关基因及其表达特征 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 基因表达微阵列分析、单细胞测序、ROC曲线分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 包括GSE36980、GSE5281和GSE44770数据集，具体样本数量未在摘要中提及 | NA | 基因表达微阵列、单细胞测序 | NA | NA |
| 94 | 2026-08-07 |
Identification of biomarkers related to angiogenesis in myocardial ischemia-reperfusion injury and prediction of potential drugs
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0300790
PMID:38935597
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研究论文 | 本研究利用GEO数据库的测序数据，通过WGCNA、Mfuzz聚类和蛋白质相互作用网络等方法，识别了与心肌缺血再灌注损伤中血管生成相关的关键基因（Stat3、Rela、Ubb），并预测了潜在的治疗药物 | 首次从血管生成角度，结合多种生物信息学分析和单细胞测序，系统识别了MIRI相关的核心基因，并通过分子对接验证了潜在药物的结合活性 | 研究主要基于公开数据库的二次分析，缺乏实验验证，且预测的药物需进一步临床前和临床研究证实 | 识别心肌缺血再灌注损伤中与血管生成相关的生物标志物，并预测潜在的治疗药物，为早期诊断和治疗提供依据 | 心肌缺血再灌注损伤相关的基因表达数据及单细胞数据 | 生物信息学 | 心肌缺血再灌注损伤 | 转录组测序、单细胞测序 | WGCNA、Mfuzz聚类、蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 未在标题和摘要中明确说明 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-08-07 |
SinglePointRNA, an user-friendly application implementing single cell RNA-seq analysis software
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0300567
PMID:38889133
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研究论文 | 开发了一个基于Shiny的R应用SinglePointRNA，为单细胞RNA-seq数据分析提供图形界面，旨在帮助湿实验室研究人员自主进行详细和定制的数据分析。 | 提供了一个用户友好的图形界面，整合了多种公开可用的单细胞RNA-seq分析工具，并配有丰富的用户指南，以降低计算技能门槛。 | 摘要中未提及具体局限性。 | 缩小湿实验室与干实验室能力之间的差距，使研究人员无需深厚的编程知识即可进行单细胞RNA-seq数据分析。 | 单细胞RNA-seq数据。 | 生物信息学 | 不适用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 96 | 2026-08-07 |
Ribogenesis boosts controlled by HEATR1-MYC interplay promote transition into brain tumour growth
2024-01, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-023-00017-1
PMID:38225354
|
研究论文 | 本研究利用果蝇模型揭示脑肿瘤起始细胞在转变为肿瘤生长过程中通过HEATR1-MYC相互作用增强核糖体生物发生，并发现该机制在胶质母细胞瘤中具有临床相关性 | 首次提出脑肿瘤起始细胞在肿瘤生长之前即增强核糖体生物发生，并发现HEATR1与MYC的相互作用是此过程的关键调控机制 | 研究主要基于果蝇模型，其与人类肿瘤起始细胞的相关性需要进一步验证；未深入探讨HEATR1-MYC相互作用的分子细节 | 阐明脑肿瘤起始细胞向肿瘤生长转变过程中的早期事件及其调控机制 | 脑肿瘤起始细胞（基于果蝇brat神经干细胞模型）及患者来源的胶质母细胞瘤干细胞 | 单细胞转录组学 | 脑肿瘤（胶质母细胞瘤） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 果蝇模型及患者来源的胶质母细胞瘤干细胞（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 97 | 2026-08-06 |
Relative effect size-based profiles as an alternative to differentiation analysis in multi-species single-cell transcriptional studies
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0305874
PMID:38917129
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研究论文 | 本文提出了一种基于效应量谱的多物种单细胞转录组数据分析方法，作为传统差异表达分析的替代方案，用于整合小样本和多生物数据。 | 该方法利用效应量谱替代基于p值的传统差异分析，并基于效应量指标建立谱图，以连接不同物种的细胞类型簇，尤其在批次效应主导的小样本多物种研究中显示出优势。 | 文章未明确说明方法的局限性，但可能包括对效应量谱的阈值选择依赖性和在极端小样本或强批次效应下的稳健性仍需进一步验证。 | 证明基于效应量谱的方法在多物种单细胞RNA测序数据整合中，尤其是在小样本和批次效应存在时，是传统差异表达分析的有效替代方案。 | 人类和牛外周血单核细胞，以及来自多个物种的已发表scRNA-seq数据集，包括结核分枝杆菌刺激的细胞。 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据（单细胞转录组） | 人类和牛外周血单核细胞的小样本数据，具体数量未在摘要中提供。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-08-06 |
Glyoxalase 1: Emerging biomarker and therapeutic target in cervical cancer progression
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0299345
PMID:38870176
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研究论文 | 本研究评估了乙二醛酶1在宫颈癌中的表达及功能，表明其上调与癌症进展相关，并作为潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次结合免疫组化、体外实验、单细胞RNA测序和公共基因表达数据综合分析GLO1在宫颈癌中的作用，揭示其在糖酵解代谢中的参与 | 研究样本量有限，且未深入探讨GLO1在临床应用中具体机制 | 探究GLO1在宫颈癌进展中的表达和功能，评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 宫颈癌患者样本和HeLa细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 免疫组化、单细胞RNA测序、基因集变异分析、微阵列数据分析 | NA | 组织切片图像、基因表达数据 | 58名宫颈癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-08-04 |
Single-Cell Sequencing of 3' RNA Transcripts
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3918-4_16
PMID:38907922
|
研究论文 | 本文描述了一种通过单细胞封装和捕获mRNA转录本3'端多聚腺苷酸尾，结合细胞和分子条形码进行单细胞RNA测序的方法，以识别细胞中表达的基因。 | 该方法通过捕获3'端转录本并结合细胞和分子条形码，实现了对单细胞RNA的高通量测序，能够分析细胞状态、亚型和疾病中的细胞行为。 | 未在摘要中提及限制。 | 开发一种用于单细胞RNA测序的方法，以测量单个细胞的RNA表达谱。 | 单个细胞中的RNA转录本。 | 单细胞测序 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | RNA序列数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 100 | 2026-08-04 |
Sequencing: 10X Genomics 3' HT Assay for Gene Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3918-4_15
PMID:38907921
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研究论文 | 本文介绍了10X Genomics 3' HT assay用于单细胞RNA测序的方法，涵盖样品质量控制、Chromium X仪器操作、cDNA合成及文库制备等步骤 | 该3' HT assay相比前代3' v3.1，具有更高数量的细胞条形码、新型专有芯片（每通道可靶向多达60,000个细胞）以及每次运行最多16个样品的捕获能力，并支持全细胞和细胞核输入 | 未在摘要中明确提及局限性，可能包括捕获率约60%并非100%等潜在限制 | 描述10X Genomics 3' HT assay的实验方法，以支持单细胞基因表达分析 | 单细胞或细胞核，用于基因表达分析 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达序列和细胞条形码数据 | 每个通道最多60,000个细胞，每次运行最多16个样品 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium X | 3' HT assay，使用液滴法分离细胞，凝胶珠带有独特条形码引物，支持全细胞和细胞核输入，捕获率约60% |