单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2025-06-06	Aryl hydrocarbon receptor confers protection against macrophage pyroptosis and intestinal inflammation through regulating polyamine biosynthesis 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.95749 PMID:39113799	研究论文	研究芳烃受体（AhR）在调节巨噬细胞焦亡和肠道炎症中的作用及其机制	揭示了AhR通过调节多胺生物合成抑制巨噬细胞焦亡的新机制，并提出了AhR/ODC1/多胺轴在维持肠道稳态中的功能作用	研究主要基于小鼠模型，人类样本的相关性分析有限	探索AhR在炎症性肠病发病机制中的作用	巨噬细胞和肠道炎症	免疫学	炎症性肠病	单细胞RNA测序、RNA-seq、RT-qPCR、荧光素酶报告基因检测、染色质免疫沉淀、免疫荧光染色	DSS诱导的小鼠结肠炎模型	基因表达数据、蛋白质数据	小鼠模型和溃疡性结肠炎患者的肠黏膜活检样本
82	2025-06-06	Single-cell RNA sequencing highlights the immunosuppression of IDO1+ macrophages in the malignant transformation of oral leukoplakia 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.99112 PMID:39239507	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了IDO1+巨噬细胞在口腔白斑恶性转化中的免疫抑制作用	首次在口腔癌变过程中鉴定出具有免疫抑制功能的Macro-IDO1巨噬细胞亚群，并揭示其通过IFN-γ-JAK-STAT通路上调IDO1的机制	样本量较小（仅3例患者），且主要基于转录组数据，需要更多功能实验验证	探究口腔癌变过程中免疫抑制性肿瘤微环境的形成机制	口腔鳞状细胞癌(OSCC)、癌前口腔白斑(preca-OLK)和癌旁组织(PCA)	digital pathology	oral cancer	single-cell RNA sequencing, multicolor immunofluorescence staining	NA	single-cell transcriptome data	3例患者（同时包含OSCC、preca-OLK和PCA组织）和4NQO诱导的小鼠口腔癌模型
83	2025-06-06	Single cell RNA-sequencing delineates CD8+ tissue resident memory T cells maintaining rejection in liver transplantation 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.96928 PMID:39239518	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序等多组学方法，分析了人和小鼠肝移植样本中的组织驻留记忆T细胞（TRMs）在移植排斥中的作用	揭示了CD8+ TRMs在移植排斥中的显著增加及其独特的表达谱，包括组织驻留标记、免疫检查点、细胞毒性标记和增殖标记的上调，以及转录因子EOMES和RUNX3的高表达	样本量相对较小（人类17例，小鼠16例），可能限制统计效力	探索肝移植中与免疫机制相关的组织驻留记忆T细胞的作用	人和小鼠的肝移植样本	免疫学	肝移植	单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫学技术	NA	RNA测序数据	人类17例，小鼠16例，共计235,116个细胞
84	2025-06-06	Activation of Toll-like receptor 2 promotes mesenchymal stem/stromal cell-mediated immunoregulation and angiostasis through AKR1C1 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.100327 PMID:39239520	研究论文	本研究探讨了Toll样受体2（TLR2）激活如何通过AKR1C1促进间充质干细胞/基质细胞（MSCs）的免疫调节和血管生成抑制作用	首次揭示了TLR2-AKR1C1信号通路在MSCs中的免疫调节和血管生成抑制作用，并发现AKR1C1能保护MSCs免于铁死亡	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探究TLRs是否影响MSCs在损伤后的稳态功能	间充质干细胞/基质细胞（MSCs）、单核细胞/巨噬细胞、小鼠无菌损伤诱导的炎症性角膜血管生成模型	细胞生物学	炎症性疾病	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	NA
85	2025-06-06	DAB2 + macrophages support FAP + fibroblasts in shaping tumor barrier and inducing poor clinical outcomes in liver cancer 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.99046 PMID:39239526	research paper	该研究通过整合单细胞、批量和空间转录组分析及多重免疫荧光技术，揭示了肝细胞癌和肝内胆管癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其与肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的相互作用	首次全面解析了CAFs在肝细胞癌和肝内胆管癌中的异质性及其与TAMs的相互作用，揭示了这种相互作用在形成免疫屏障和影响临床结果中的关键作用	研究样本量相对有限（90例HCC患者），且部分发现需要进一步验证	探索CAFs在肝细胞癌和肝内胆管癌中的异质性及其与TAMs的相互作用，以提高免疫治疗效果和改善临床结果	肝细胞癌（HCC）和肝内胆管癌（ICC）中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）	digital pathology	liver cancer	single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, spatial transcriptome profiling, multiplexed immunofluorescence	NA	transcriptomic data, immunofluorescence data	235个肝癌单细胞RNA-seq样本（超过120万个细胞）和90例HCC患者的临床队列
86	2025-06-06	Oncofetal TRIM71 drives liver cancer carcinogenesis through remodeling CEBPA-mediated serine/glycine metabolism 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.99633 PMID:39267787	研究论文	该研究揭示了TRIM71通过重塑CEBPA介导的丝氨酸/甘氨酸代谢驱动肝癌发生的机制	首次发现TRIM71在肝癌中特异性表达，并通过m6A依赖的方式稳定CEBPA mRNA，促进丝氨酸/甘氨酸代谢通路	研究主要基于小鼠模型和细胞实验，临床转化需要进一步验证	探索肝癌维持恶性特征的核心调控因子	肝癌细胞及其微环境	癌症生物学	肝癌	scRNA-seq, bulk RNA-seq	小鼠模型	RNA测序数据	胎儿肝脏、正常肝脏、肝肿瘤及其邻近组织的样本
87	2025-06-06	MCT1-mediated endothelial cell lactate shuttle as a target for promoting axon regeneration after spinal cord injury 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.96374 PMID:39310103	研究论文	本研究探讨了脊髓损伤(SCI)后内皮细胞与神经元间的乳酸穿梭机制及其对轴突再生的影响	发现了MCT1介导的内皮细胞-神经元乳酸穿梭在脊髓损伤修复中的新作用机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证	探究脊髓损伤后代谢改变对神经组织重塑和功能恢复的影响	脊髓损伤小鼠模型中的内皮细胞和神经元	神经科学	脊髓损伤	代谢组学分析、单细胞RNA测序、腺相关病毒(AAV)载体技术	NA	代谢组数据、基因表达数据	未明确说明数量的SCI小鼠模型
88	2025-06-06	Conditional ablation of DIS3L2 ribonuclease in pre-meiotic germ cells causes defective spermatogenesis and infertility in male mice 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.98620 PMID:39310107	research paper	该研究通过建立条件性敲除小鼠模型，揭示了DIS3L2核糖核酸酶在雄性生殖细胞发育中的关键作用	首次揭示了DIS3L2在雄性生殖细胞发育中的功能，发现其缺失会导致精子发生缺陷和雄性不育	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证	探究DIS3L2核糖核酸酶在雄性生殖细胞发育和精子发生过程中的功能	条件性敲除DIS3L2的小鼠模型	生殖生物学	不育症	bulk RNA-seq, scRNA-seq	条件性基因敲除小鼠模型	RNA测序数据	条件性敲除小鼠睾丸组织
89	2025-06-06	Hepatocyte-specific Smad4 deficiency inhibits hepatocarcinogenesis by promoting CXCL10/CXCR3-dependent CD8+- T cell-mediated anti-tumor immunity 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.97276 PMID:39346534	研究论文	本研究探讨了肝细胞特异性Smad4缺失通过促进CXCL10/CXCR3依赖的CD8+ T细胞介导的抗肿瘤免疫抑制肝癌发生的机制	揭示了Smad4在肝细胞中通过调控CXCL10/mTOR/LDHA通路增强CD8 T细胞糖酵解活性的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	阐明Smad4在肝细胞中调控肝癌发生的具体作用机制	肝细胞特异性Smad4缺失小鼠模型和HCC患者样本	肿瘤免疫学	肝癌	免疫荧光、FACS、单细胞RNA测序	小鼠肝癌模型	基因表达数据、免疫细胞分析数据	未明确说明样本数量，包括基因工程小鼠和HCC患者样本
90	2025-06-06	Single-cell RNA-Seq analysis of molecular changes during radiation-induced skin injury: the involvement of Nur77 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.100417 PMID:39346541	研究论文	通过单细胞RNA测序分析辐射诱导皮肤损伤过程中的分子变化及Nur77的参与	首次在单细胞水平上揭示了辐射诱导皮肤损伤的转录框架，并鉴定了关键分子Nur77的功能	研究样本量有限，仅包括核事故患者和辐射暴露大鼠的皮肤样本	阐明辐射诱导皮肤损伤的分子机制及潜在治疗靶点	人类皮肤样本和大鼠皮肤样本	数字病理	皮肤损伤	scRNA-Seq	NA	RNA序列数据	核事故患者的皮肤样本和辐射暴露大鼠的皮肤样本
91	2025-06-06	Spatial transcriptomic sequencing reveals immune microenvironment features of Mycobacterium tuberculosis granulomas in lung and omentum 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.99038 PMID:39431015	研究论文	本研究通过空间转录组测序技术，揭示了肺部和网膜结核肉芽肿的免疫微环境特征	首次利用空间转录组学技术分析了结核肉芽肿中细胞群体的空间分布和转录组特征，并鉴定了与肉芽肿形成相关的关键基因	样本量较小（仅4例临床活检样本），且未涉及其他器官的结核肉芽肿研究	解析结核肉芽肿形成和发展的核心转录组特征	结核分枝杆菌感染的肺组织和网膜组织	数字病理	结核病	空间转录组测序	organoid-macrophage共培养模型	空间转录组数据	4例临床活检样本（2例结核感染，2例非结核对照）
92	2025-06-05	Re-analysis of single-cell transcriptomics reveals a critical role of macrophage-like smooth muscle cells in advanced atherosclerotic plaque 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.87201 PMID:38389849	研究论文	通过单细胞转录组学重新分析，揭示了巨噬细胞样平滑肌细胞在晚期动脉粥样硬化斑块中的关键作用	发现了五种功能不同的平滑肌细胞亚型，并特别指出一种具有巨噬细胞样表型的亚型在斑块不稳定中的重要作用，同时揭示了IRF8通过激活NF-κB信号通路促进平滑肌细胞向巨噬细胞转分化的分子机制	研究主要基于人类颈动脉斑块样本，可能不适用于其他部位的动脉粥样硬化病变	探究晚期动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞表型的多样性及其分子机制	人类颈动脉斑块中的平滑肌细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞转录组学、RNA-seq、谱系追踪技术	NA	转录组数据	人类颈动脉斑块样本
93	2025-06-05	Mrc1+ macrophage-derived IGF1 mitigates crystal nephropathy by promoting renal tubule cell proliferation via the AKT/Rb signaling pathway 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.89174 PMID:38389846	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了Mrc1+巨噬细胞来源的IGF1通过AKT/Rb信号通路促进肾小管细胞增殖，从而缓解晶体肾病的机制	首次构建了乙醛酸盐诱导晶体肾病的单细胞图谱，并发现Mrc1+巨噬细胞通过分泌IGF1促进肾小管修复的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证	探索晶体肾病中细胞特征和通讯机制，寻找潜在治疗靶点	乙醛酸盐诱导的小鼠晶体肾病模型	数字病理学	肾病	scRNA-seq, 10× Genomics, CellChat分析	NA	单细胞转录组数据	超过40000个单细胞，包含15种细胞群体
94	2025-05-31	Single cell RNA sequencing of human FAPs reveals different functional stages in Duchenne muscular dystrophy 2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2024.1399319 PMID:39045456	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究人类FAPs在杜氏肌营养不良症中的不同功能状态	首次使用单细胞RNA测序技术揭示DMD患者与健康对照组FAPs的转录组差异，并识别出不同的FAPs亚群及其功能特征	样本量相对较小（n=9验证样本），且仅聚焦于FAPs细胞，未全面研究其他细胞类型在DMD中的作用	探究杜氏肌营养不良症中FAPs的分子调控机制及其在肌肉退化和再生中的作用	人类纤维脂肪前体细胞（FAPs）	单细胞组学	杜氏肌营养不良症	单细胞RNA测序（scRNAseq），10X Genomics，Illumina，qPCR	Seurat分析	单细胞转录组数据	未明确总测序样本数，验证样本n=9
95	2025-05-23	Spatiotemporal modulation of growth factors directs the generation of multilineage mouse embryonic stem cell-derived mammary organoids 2024-01-22, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.003 PMID:38159568	research paper	通过定向分化小鼠胚胎干细胞，研究团队成功生成了多谱系ESC来源的乳腺类器官（MEMOs），并研究了其发育过程	首次通过BMP4和PTHrP的顺序激活及HH信号抑制，将皮肤类器官模型中的真皮间充质转化为乳腺特异性间充质，并生成MEMOs	研究仅在小鼠胚胎干细胞中进行，尚未在人类细胞中验证	研究乳腺等外胚层附属器官的发育过程，为再生医学和疾病建模提供基础	小鼠胚胎干细胞（mESCs）及其衍生的乳腺类器官（MEMOs）	再生医学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	乳腺类器官模型（MEMO）	基因表达数据	NA
96	2025-05-23	YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulation in murine bone development 2024-01-22, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2023.11.029 PMID:38141609	research paper	该研究揭示了YAP和TAZ在小鼠骨骼发育中如何协调成骨前体细胞的动员与血管生成及力学调控	首次发现YAP和TAZ在胚胎骨骼发育中协调成骨前体细胞动员与血管生成，并介导力学调控	研究主要基于小鼠模型，人类细胞共培养实验仅作为补充验证	探究胚胎骨骼发育中成骨前体细胞动员与血管生成协调的分子机制	小鼠胚胎骨骼发育过程中的成骨前体细胞和血管系统	发育生物学	骨骼发育异常	单细胞RNA测序，3D人类细胞共培养	小鼠模型	基因表达数据，细胞培养数据	NA
97	2025-05-23	Deciphering maternal-fetal cross-talk in the human placenta during parturition using single-cell RNA sequencing 2024-01-10, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adh8335 PMID:38198568	研究论文	利用单细胞RNA测序技术解析人类胎盘在分娩过程中的母胎交流	首次建立人类胎盘的单细胞图谱，揭示分娩过程中母体和胎儿细胞类型的转录组活性变化，并发现胎盘源性单细胞特征可用于无创预测早产	研究主要关注足月分娩，对早产的预测仍需进一步验证	解析分娩过程中母胎交流的细胞贡献和通讯机制	人类胎盘中的母体和胎儿细胞	单细胞转录组学	妊娠相关疾病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	人类胎盘组织样本（具体数量未明确说明）
98	2025-05-23	Insights into midgut cell types and their crucial role in antiviral immunity in the lepidopteran model Bombyx mori 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1349428 PMID:38420120	review	该综述探讨了鳞翅目模型家蚕中肠细胞类型及其在抗病毒免疫中的关键作用	揭示了昆虫中肠细胞在免疫防御中的新机制，包括单细胞转录组学发现的新亚群以及昆虫与高等哺乳动物胃肠道的相似性	NA	阐明中肠细胞类型在昆虫免疫防御中的复杂作用	家蚕中肠细胞（柱状细胞、肠内分泌细胞、杯状细胞和再生细胞）	昆虫免疫学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
99	2025-05-23	Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from pregnant women with Systemic lupus erythematosus 2024, International reviews of immunology IF:4.3Q2 DOI:10.1080/08830185.2024.2376649 PMID:39066603	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了系统性红斑狼疮（SLE）孕妇外周血单个核细胞的免疫细胞组成和基因表达谱	首次在单细胞水平上比较了妊娠期活动性和非活动性SLE患者的免疫细胞类型比例和转录模式	样本量较小（仅12例患者），且未包含健康孕妇对照组	阐明妊娠期SLE患者的免疫细胞变化和分子机制	系统性红斑狼疮孕妇的外周血单个核细胞	数字病理学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序（10x Genomics技术）	NA	RNA测序数据	12例患者（分为4组，每组3人）
100	2025-05-23	Immune cell profiling of preeclamptic pregnant and postpartum women by single-cell RNA sequencing 2024, International reviews of immunology IF:4.3Q2 DOI:10.1080/08830185.2022.2144291 PMID:36369864	研究论文	通过单细胞RNA测序技术对先兆子痫孕妇及产后妇女的免疫细胞进行分析	首次在单细胞水平上描绘了先兆子痫患者母体免疫系统的景观和异质性	样本量较小（3例患者和2例对照）	研究先兆子痫与免疫系统改变的关系	先兆子痫孕妇及产后妇女的外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞转录组学	先兆子痫	单细胞RNA测序（10× genomics平台）	NA	单细胞转录组数据	3例早发型先兆子痫孕妇和2例健康对照的PBMCs样本，共获得80,429个单细胞转录组