单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
961 2024-08-04
Comprehensive molecular and cellular characterization of endoplasmic reticulum stress-related key genes in renal ischemia/reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究全面表征了与内质网应激相关的三种关键基因在肾脏缺血/再灌注损伤中的作用 该研究首次确定了与内质网应激相关的三种关键基因,并探讨了它们在肾脏移植后愈后预后的价值 研究的限制在于使用了已有的数据集,可能无法完全捕捉肾脏缺血/再灌注损伤的所有机制 研究旨在揭示肾脏缺血/再灌注损伤的潜在机制,以发现有效的肾脏保护靶点 研究对象为在肾脏缺血/再灌注损伤中涉及的关键基因及其相关途径 数字病理学 肾脏疾病 RNA-seq NA 转录组数据 从GEO数据库收集了495个肾脏样本进行研究
962 2024-08-05
Apolipoprotein L genes are novel mediators of inflammation in beta cells
2024-Jan, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本文研究了载脂蛋白L基因在炎症引起的β细胞损伤中的新作用 发现APOL基因在β细胞中的表达受到炎症的显著上调,揭示了它们在胰腺炎症中的新调节作用 研究主要集中在单一细胞模型,可能无法全面反映复杂的体内环境 探讨载脂蛋白L基因在β细胞炎症损伤中的作用机制 主要研究人类胰腺β细胞以及与糖尿病相关的细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 使用了原代人胰岛细胞和EndoC-βH1细胞
963 2024-08-07
Multi-omics and tumor immune microenvironment characterization of a prognostic model based on aging-related genes in melanoma
2024, American journal of cancer research IF:3.6Q2
研究论文 本文通过分析与衰老相关的基因,构建了一个针对黑色素瘤的预后模型,并探讨了其与肿瘤免疫微环境的关系 首次基于衰老相关基因构建黑色素瘤预后模型,并展示了其在预测患者死亡率方面的高准确性 NA 构建一个基于衰老相关基因的黑色素瘤预后模型,并探讨其在免疫治疗中的潜在应用 黑色素瘤及其免疫微环境 数字病理学 黑色素瘤 单细胞转录组分析 预后模型 转录组数据 未明确提及具体样本数量
964 2024-08-04
Spatial transcriptomics reveals altered lipid metabolism and inflammation-related gene expression of sebaceous glands in psoriasis and atopic dermatitis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的脂质代谢和炎症相关基因表达的变化 首次深入探讨了皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的作用,揭示其与炎症微环境的相互影响 未能探讨其他炎症性皮肤疾病对皮脂腺的影响 研究皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的作用 银屑病和特应性皮炎患者的人类皮肤样本 数字病理学 银屑病, 特应性皮炎 空间转录组学 NA 人类皮肤样本 涉及银屑病和特应性皮炎患者的皮肤样本
965 2024-08-07
Unveiling macrophage diversity in myocardial ischemia-reperfusion injury: identification of a distinct lipid-associated macrophage subset
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,在心肌缺血-再灌注损伤中鉴定出一种新型脂质相关巨噬细胞亚型,并探讨了其在心肌重塑中的潜在作用 首次在心肌缺血-再灌注损伤中发现并鉴定了一种新型脂质相关巨噬细胞亚型,该亚型具有高表达的Spp1和Trem2等基因 NA 旨在识别心肌缺血-再灌注损伤中的巨噬细胞亚型,并探索其对心脏修复和损伤的双重作用 心肌缺血-再灌注损伤中的巨噬细胞亚型 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 使用小鼠和人类的心脏样本进行研究
966 2024-08-07
Integrative analysis identifies oxidative stress biomarkers in non-alcoholic fatty liver disease via machine learning and weighted gene co-expression network analysis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过机器学习和加权基因共表达网络分析,识别非酒精性脂肪肝病中的氧化应激生物标志物 本研究发现了两个与非酒精性脂肪肝病中氧化应激密切相关的关键基因,CDKN1B和TFAM,这些基因可能作为新的诊断和治疗靶点 NA 识别非酒精性脂肪肝病中的氧化应激生物标志物,为临床管理提供新的视角 非酒精性脂肪肝病中的氧化应激相关基因 机器学习 非酒精性脂肪肝病 加权基因共表达网络分析(WGCNA) LASSO回归, SVM-RFE, 随机森林 基因表达数据 涉及31个交集基因和NASH小鼠模型中的肝脏组织
967 2024-08-07
CD81 and CD82 expressing tumor-infiltrating lymphocytes in the NSCLC tumor microenvironment play a crucial role in T-cell activation and cytokine production
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了非小细胞肺癌肿瘤微环境中表达CD81和CD82的肿瘤浸润淋巴细胞在T细胞激活和细胞因子产生中的重要作用 发现四跨膜蛋白家族成员CD81和CD82在激活的T细胞中表达,并与激活和耗竭标记物有强相关性,体外实验证实IL-2刺激的T细胞中CD81和CD82表达增加 NA 阐明非小细胞肺癌肿瘤微环境中与T细胞激活相关的分子特征 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本中的T细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 19名非小细胞肺癌患者
968 2024-08-07
SAP-expressing T peripheral helper cells identify systemic lupus erythematosus patients with lupus nephritis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文研究了SAP表达的T外周辅助细胞在系统性红斑狼疮(SLE)患者中的作用,特别是与狼疮性肾炎(LN)的关系。 首次探讨了SAP表达的T外周辅助细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用,并利用单细胞RNA测序数据验证了其在肾浸润T细胞中的表达。 NA 探讨SAP表达的T外周辅助细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用。 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞(PBMC)和肾浸润T细胞。 免疫学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序(scRNA seq) NA 细胞表面标记和细胞内SAP的表达数据 30名SLE患者(包括10名LN患者)和对照组
969 2024-08-07
Identification of potential biomarkers for idiopathic pulmonary arterial hypertension using single-cell and bulk RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用单细胞和批量RNA测序分析,探索特发性肺动脉高压(IPAH)中的细胞异质性和分子病理,并识别潜在的生物标志物 本研究结合单细胞和批量RNA测序数据,首次识别出12个候选生物标志物,并通过RT-qPCR验证了其中5个基因在肺动脉内皮细胞中的表达差异 NA 揭示IPAH的潜在诊断标志物和治疗靶点 特发性肺动脉高压(IPAH)的细胞异质性和分子病理 数字病理学 肺动脉高压 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序 NA RNA 涉及三个IPAH数据集和两个额外的PAH数据集
970 2024-08-04
Direct male development in chromosomally ZZ zebrafish
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本文探讨了NA斑马鱼的性别决定和生殖腺发育机制。 揭示了NA斑马鱼在性别决定过程中的直接雄性发育机制,以及性腺发育中不同染色体的作用。 研究主要集中于特定的斑马鱼品系,可能无法广泛适用于其他物种。 了解NA斑马鱼的性腺发育机制。 研究对象为NA斑马鱼及其不同性别的发育过程。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 文本和图像 19dpf和30dpf的性腺样本
971 2024-08-07
Targeting Monocyte Derived CCL17 Attenuates Murine Crescentic Glomerulonephritis by Affecting Renal CCR4+ Regulatory T-Cell Recruitment
2024, American journal of nephrology IF:4.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了人及小鼠肾炎肾脏中的白细胞,发现CCL17作为免疫介导性肾脏疾病的潜在治疗靶点,并通过小鼠模型探讨了靶向CCL17的效果。 首次研究了化学因子受体CCR4及其配体CCL17在免疫介导性新月形肾小球肾炎中的功能重要性及其对白细胞招募的相关性。 NA 探讨化学因子受体CCR4及其配体CCL17在免疫介导性新月形肾小球肾炎中的作用及治疗潜力。 人及小鼠肾炎肾脏中的白细胞,以及小鼠新月形肾小球肾炎模型。 NA 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 人及小鼠肾炎肾脏中的白细胞样本
972 2024-08-07
Identification and validation of immune and cuproptosis - related genes for diabetic nephropathy by WGCNA and machine learning
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过WGCNA和机器学习方法,识别并验证了与糖尿病肾病相关的免疫和铜死亡相关基因 结合机器学习、WGCNA、免疫细胞浸润和PPI分析,首次识别出与铜死亡、免疫和糖尿病肾病相关的三个关键基因 NA 探索糖尿病肾病的早期诊断方法,并识别潜在的诊断标志物 糖尿病肾病相关的免疫和铜死亡相关基因 机器学习 糖尿病肾病 WGCNA, 机器学习, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 NA 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 包括GSE30122和GSE30529两个数据集,以及STZ诱导和db/db糖尿病肾病小鼠模型
973 2024-08-04
The significance of single-cell transcriptome analysis in epididymis research
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本文探讨了单细胞转录组分析在附睾研究中的重要性 通过单细胞测序技术揭示了附睾不同区域的细胞组成和特定基因表达模式 对附睾的重要性认识仍然有限 重新评估附睾对男性生育能力的重要性 附睾不同区域的细胞组成及其基因表达模式 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA
974 2024-08-07
Bulk and single-cell transcriptome sequencing reveal the metabolic feature in chronic rhinosinusitis with polyps
2024-01, Clinical and experimental allergy : journal of the British Society for Allergy and Clinical Immunology IF:6.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
975 2024-08-04
Phylogenomic position of eupelagonemids, abundant, and diverse deep-ocean heterotrophs
2024-Jan-08, The ISME journal
研究论文 本研究探讨了深海异养原生生物Eupelagonemids的系统发育位置 研究通过单细胞转录组技术揭示了Eupelagonemids的多样性及其与其他分类群的关系 目前对Eupelagonemids的培养和研究仍然有限,数据主要来自光学显微镜图像和部分基因序列 确定Eupelagonemids在真核生物树中的位置,并填补其生物学信息的缺失 研究对象为两种Eupelagonemid细胞 NA NA 单细胞转录组学 NA 基因序列 两个Eupelagonemid细胞
976 2024-08-04
Single-cell Sequencing Data Reveals Aggressive CD68-type Macrophages and Prognostic Models in Bladder Cancer
2024, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究揭示了膀胱癌中激进CD68型巨噬细胞及其预后模型 研究首次利用单细胞测序数据鉴定了膀胱癌中的预后生物标志物,并构建了膀胱癌预后风险指导系统 研究主要基于公共数据库的数据,可能存在样本选择偏差 研究膀胱癌中相关免疫细胞类型与侵袭性之间的关系以及建立预后管理系统 以膀胱癌为研究对象,分析与其侵袭性相关的CD68型巨噬细胞 数字病理学 膀胱癌 单细胞测序 COX回归分析 基因表达数据 使用了来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌细胞测序数据,具体样本数量未注明
977 2024-08-04
Identification of Key Genes in Angiogenesis of Breast and Prostate Cancers in the Context of Different Cell Types
2024, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 这篇文章识别了在乳腺癌和前列腺癌的不同细胞类型中,与血管生成相关的关键基因 文章揭示了不同细胞类型中血管生成相关基因模块的过表达模式 没有具体提到研究的局限性 研究不同细胞类型如何影响血管生成过程 前列腺癌和乳腺癌样本中的血管生成相关基因 数字病理学 乳腺癌, 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 分析了乳腺癌和前列腺癌样本中的单细胞RNA-Seq数据
978 2024-08-07
Penile cavernous sinusoids are Prox1-positive hybrid vessels
2024-Jan-01, Vascular biology (Bristol, England)
研究论文 本文鉴定了阴茎海绵体窦状血管为表达淋巴内皮细胞身份基因Prox1、Vegfr3和Lyve1的新型混合血管床 发现了阴茎海绵体窦状血管作为新的混合血管床,并揭示了其在糖尿病相关勃起功能障碍中的转录变化 NA 详细描述混合阴茎海绵体窦状血管的分子特征,并为治疗失调的阴茎血管疾病提供分子靶点 阴茎海绵体窦状血管的混合特性及其在勃起功能障碍中的作用 NA 勃起功能障碍 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 人类阴茎海绵体组织
979 2024-08-07
Inflammasome signaling is dispensable for ß-amyloid-induced neuropathology in preclinical models of Alzheimer's disease
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文评估了在阿尔茨海默病(AD)的ß-淀粉样蛋白诱导的神经病理学模型中,炎症小体信号在体内的作用 研究结果质疑了炎症小体激活在预临床淀粉样蛋白模型中的普遍作用 研究仅限于特定的鼠标模型,可能不适用于所有AD模型 探讨炎症小体信号在ß-淀粉样蛋白诱导的AD神经病理学中的作用 APP/PS1和AppNL-G-F鼠标模型中的微胶质细胞和全身炎症小体信号 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA RNA 多个鼠标模型
980 2024-08-04
The ontogenesis and heterogeneity of basophils
2024, Discovery immunology
综述 该文章综述了嗜碱细胞的发育过程和异质性 该综述强调了嗜碱细胞发育途径中的新发现,包括新识别的嗜碱细胞前体和成熟亚群 该综述未提供新的实验数据或实验结果 探讨嗜碱细胞的发育和生物学 各种物种的嗜碱细胞发育过程 数字病理学 过敏性疾病 单细胞转录组学 NA 文献综述 NA
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