单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals that GPRC5A is an important prognostic gene in pancreatic cancer and is associated with B-cell Infiltration in pancreatic cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1283164
PMID:38634049
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，揭示了GPRC5A作为胰腺癌的重要预后基因，并与B细胞浸润相关 | 首次综合利用scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，构建了多因素Cox预后模型，并验证了GPRC5A与B细胞浸润及患者预后的关联 | NA | 确定影响胰腺癌预后的相关基因，并研究其与免疫浸润的关系 | 胰腺癌的预后基因及免疫浸润 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq），实时荧光定量PCR（RT-PCR） | Cox回归分析，Lasso回归分析 | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的胰腺癌单细胞芯片数据和TCGA的临床数据 |
| 962 | 2024-08-07 |
Noncanonical TRAIL Signaling Promotes Myeloid-Derived Suppressor Cell Abundance and Tumor Growth in Cholangiocarcinoma
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.006
PMID:38219900
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研究论文 | 本研究探讨了非经典TRAIL信号在胆管癌中促进骨髓来源抑制细胞（MDSCs）丰度和肿瘤生长的机制。 | 发现非经典TRAIL信号通过激活核因子-κB促进MDSCs的增殖，并揭示了MDSCs对TRAIL介导的凋亡的抵抗机制。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 旨在阐明TRAIL+癌细胞如何利用非经典TRAIL信号在骨髓来源抑制细胞（MDSCs）中促进其丰度，从而影响胆管癌的发展。 | 研究对象包括TRAIL信号、骨髓来源抑制细胞（MDSCs）以及胆管癌。 | 肿瘤学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序和细胞转录组及表位的测序 | NA | RNA | 使用了多个免疫健全的同基因、原位胆管癌模型的小鼠肿瘤样本 |
| 963 | 2024-08-07 |
Telocytes in the Luminal GI Tract
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.002
PMID:38342300
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综述 | 本文综述了间质细胞（telocytes）在胃肠道腔内的作用及其在干细胞微环境中的角色 | 探讨了间质细胞通过其长细胞质突起与其他细胞类型连接，形成三维网络，并在肠道中作为干细胞微环境的关键组成部分，提供Wnt蛋白促进干细胞和祖细胞增殖 | 单细胞RNA测序分析揭示了其他基质群体和微环境组织机制，对间质细胞在干细胞微环境中的作用提出了疑问 | 探讨间质细胞在胃肠道腔内的当前研究状态、存在的争议及未来研究方向 | 间质细胞在胃肠道腔内的作用及其在干细胞微环境中的角色 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 964 | 2024-08-04 |
Decoding the gene regulatory network of endosperm differentiation in maize
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44369-7
PMID:38167709
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研究论文 | 本研究分析了玉米胚乳分化过程中的基因调控网络 | 首次利用单细胞转录组技术解剖玉米胚乳的基因调控网络 | 本研究仅关注于玉米的胚乳，不一定适用于其他作物的研究 | 揭示玉米胚乳发育过程中的基因调控机制 | 发育中的玉米胚乳，分析细胞分化的转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | 17,022个单细胞 |
| 965 | 2024-08-04 |
Integrative single-cell characterization of a frugivorous and an insectivorous bat kidney and pancreas
2024-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44186-y
PMID:38195585
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研究论文 | 该文章研究了蝙蝠的肾脏和胰腺的细胞和分子特点 | 通过整合的单细胞测序揭示水果食性和昆虫食性蝙蝠在细胞群体、基因表达和调控元素上的关键差异 | 主要研究限于特定的水果蝙蝠和昆虫蝙蝠，可能无法完全代表其他物种 | 探究水果食性蝙蝠及其与人类疾病的关系 | 水果蝙蝠（如牙买加水果蝙蝠）和昆虫蝙蝠（如大棕蝙蝠） | NA | 糖尿病 | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 细胞 | NA |
| 966 | 2024-08-04 |
Molecular features of luminal breast cancer defined through spatial and single-cell transcriptomics
2024-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1548
PMID:38282415
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和单细胞RNA测序分析了ER+乳腺癌中的细胞群体特征 | 研究揭示了ER+乳腺癌中四个空间上不同的细胞区室及其功能多样性 | 研究的结果需在更大样本中进行验证以确保普遍适用性 | 探讨ER+乳腺癌中细胞空间异质性及其对激素依赖性肿瘤生长的重要性 | 使用来自患者的异种移植模型(PDXs)进行分析 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 两个ER高的PDX模型和一个ER低的PDX模型 |
| 967 | 2024-08-07 |
Preparation of Healthy Single Neuron or Astrocyte Suspension from Adult Mouse Brain for RNA-seq
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3810-1_29
PMID:38630243
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研究论文 | 本文描述了优化脑切片蛋白酶消化方法，以从成年大脑中获得数百万健康细胞用于单细胞RNA测序 | 本文提出了一种优化蛋白酶消化脑切片的方法，提高了从成年大脑中获取健康单个神经细胞的效率 | NA | 研究单细胞RNA测序在神经科学中的应用 | 成年小鼠大脑中的单个神经元或星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数百万个细胞 |
| 968 | 2024-08-04 |
Deciphering the molecular landscape: integrating single-cell transcriptomics to unravel myofibroblast dynamics and therapeutic targets in clear cell renal cell carcinomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374931
PMID:38562930
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研究论文 | 该文章探讨了在透明细胞肾细胞癌中，单细胞转录组学揭示的肌成纤维细胞动态及治疗靶点 | 首次利用单细胞转录组分析深入探讨肌成纤维细胞与肿瘤细胞的相互作用和信号通路 | 目前缺乏对其他细胞类型相互作用的详细分析 | 揭示透明细胞肾细胞癌中肌成纤维细胞的动态及其作为治疗靶点的潜力 | 透明细胞肾细胞癌中的肌成纤维细胞亚群及其与肿瘤的相互作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组分析 | NA | RNA-seq | ccRCC人群中涉及大量样本 |
| 969 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing analysis and multiple machine-learning models revealed the cellular crosstalk of dendritic cells and identified FABP5 and KLRB1 as novel biomarkers for psoriasis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374763
PMID:38596682
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研究论文 | 本研究分析了树突状细胞与T细胞在牛皮癣中的相互作用，并确定FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 | 揭示了FABP5和KLRB1在牛皮癣发病机制中的新角色，并提出了它们作为潜在生物标志物的可能性 | 研究可能受到样本数量或样本多样性的限制 | 识别牛皮癣的关键生物标志物并阐明其发病机制 | 研究对象为牛皮癣患者的皮肤组织和相关细胞 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 单细胞测序、机器学习 | NA | 多层次数据 | 牛皮癣皮肤组织样本和M5诱导的HaCaT细胞 |
| 970 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals SERPINE1-expressing CAFs remodelling tumour microenvironment in recurrent osteosarcoma
2024-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1527
PMID:38193644
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 971 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of the cellular microenvironment in three different colonic polyp subtypes in children
2024-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1535
PMID:38264936
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫组织化学分析，探讨了儿童结肠息肉不同亚型的细胞微环境特征 | 识别了不同结肠息肉亚型中共有的和疾病特异性的细胞亚群及表达模式，揭示了这些细胞在塑造独特细胞微环境中的重要作用 | NA | 加深对儿童结肠息肉异质性细胞微环境的理解，并识别潜在的治疗策略以减少息肉的复发 | 儿童结肠息肉的三种不同亚型：孤立性幼年息肉（SJPs）、息肉病综合征（PJS）和Peutz-Jeghers综合征（PJS） | 数字病理学 | 结肠息肉 | 单细胞RNA测序，多重免疫组织化学（mIHC） | NA | 细胞 | 从儿童患者中获得的正常结肠组织和不同类型的结肠息肉样本 |
| 972 | 2024-08-07 |
Cellular plasticity in the breast cancer ecosystem
2024, Upsala journal of medical sciences
IF:1.5Q2
DOI:10.48101/ujms.v129.10629
PMID:38571887
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综述 | 本文综述了乳腺癌生态系统中细胞可塑性和异质性的最新发现，重点讨论了癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的作用。 | 文章揭示了乳腺癌细胞表现出由内在遗传因素和外部微环境信号驱动的表型可塑性，并探讨了单细胞RNA测序研究揭示的CAFs和TAMs的多样性亚型及其在肿瘤微环境中的功能基因表达程序和空间组织。 | NA | 理解细胞表型的层次关系和微环境信号，为靶向治疗干预提供新机会。 | 乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 973 | 2024-08-04 |
Intermittent fasting promotes ILC3s secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.29.555436
PMID:37693430
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研究论文 | 本文研究了间歇性禁食如何促进ILC3分泌IL-22，从而促进白色脂肪组织的变褐。 | 提出了ILC3/IL-22/IL-22R轴在间歇性禁食代谢益处中的作用机制。 | 未涉及潜在的临床转化和人类研究 | 探讨间歇性禁食对代谢益处的机制。 | 研究了小鼠肠道内的ILC3细胞和其对白色脂肪组织变褐的影响。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 饮食诱导肥胖小鼠 |
| 974 | 2024-08-04 |
Intratumoral CXCR4hi neutrophils display ferroptotic and immunosuppressive signatures in hepatoblastoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363454
PMID:38487536
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研究论文 | 本研究发现肝母细胞瘤中的CXCR4高表达中性粒细胞表现出铁死亡和免疫抑制特征 | 揭示了肝母细胞瘤内不同发展阶段的中性粒细胞及其在肿瘤免疫抑制中的作用 | 未提及具体的临床试验数据或长期结果 | 探讨肝母细胞瘤中肿瘤浸润中性粒细胞的功能特征 | 肝母细胞瘤中的肿瘤浸润中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 批量RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 研究中分析了不同发育阶段的中性粒细胞的样本 |
| 975 | 2024-08-04 |
Unraveling the mechanisms of NK cell dysfunction in aging and Alzheimer's disease: insights from GWAS and single-cell transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1360687
PMID:38464521
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研究论文 | 本研究探讨了衰老与阿尔茨海默病(NK细胞功能失常)之间的机制 | 通过GWAS和单细胞转录组学分析，揭示NK细胞在衰老与阿尔茨海默病中的作用 | 未提及具体的实验室验证或长期跟踪研究 | 研究衰老如何影响NK细胞的功能以及与阿尔茨海默病的关系 | 研究对象为不同年龄段的阿尔茨海默病患者的NK细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核转录组测序，基因组宽关联研究(GWAS) | NA | 基因表达数据 | 2,171名60岁以上的老年人 |
| 976 | 2024-08-07 |
Precursor exhausted CD8+T cells in colorectal cancer tissues associated with patient's survival and immunotherapy responsiveness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1362140
PMID:38510246
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研究论文 | 本研究利用多色免疫组织化学技术（mIHC）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了结直肠癌（CRC）组织中肿瘤浸润T细胞的定位及其临床意义，并探讨了其在免疫治疗反应中的作用。 | 本研究首次通过mIHC技术和scRNA-seq分析，揭示了结直肠癌微环境中T细胞的转录和功能特性，并证实了其在患者生存和免疫治疗反应中的关键作用。 | NA | 探讨结直肠癌组织中T细胞的分布及其在患者生存和免疫治疗反应中的作用。 | 结直肠癌组织中的T细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多色免疫组织化学（mIHC），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 人类结直肠癌组织及小鼠MC38肿瘤模型 |
| 977 | 2024-08-07 |
Novel prognostic biomarker TBC1D1 is associated with immunotherapy resistance in gliomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372113
PMID:38529286
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研究论文 | 本文通过分析TCGA、CGGA和GEO数据库，鉴定了与胶质瘤免疫治疗抵抗相关的基因TBC1D1，并通过多种实验方法验证了其在免疫治疗中的作用。 | 首次发现TBC1D1作为胶质瘤免疫治疗抵抗的新型预后生物标志物，并探讨了其在免疫抑制微环境中的作用。 | NA | 研究胶质瘤免疫治疗抵抗的机制，并寻找新的预后生物标志物。 | 胶质瘤及其免疫治疗抵抗机制。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | qRT-PCR, 蛋白质印迹, GSEA, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质水平数据 | 使用了来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多组数据 |
| 978 | 2024-08-07 |
A division-of-labor mode contributes to the cardioprotective potential of mesenchymal stem/stromal cells in heart failure post myocardial infarction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363517
PMID:38562923
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研究论文 | 本研究探讨了3D培养的间充质干细胞（MSCs）在心肌梗死后心力衰竭治疗中的保护作用及其机制 | 本研究首次揭示了3D MSCs在细胞层面的异质性和分工模式，并通过机器学习预测模型和网络服务器开发了预测MSCs分泌效能的配体模型 | NA | 提高MSCs的生产效率并寻找评估其治疗效能的新方法 | 3D培养的人脐带间充质干细胞（hUC-MSCs）及其在心肌梗死后心力衰竭治疗中的应用 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞和批量RNA测序 | 机器学习预测模型 | RNA测序数据 | 使用了125种组合算法进行筛选，并对CD142+和CD142- MSCs进行了差异表达分析 |
| 979 | 2024-08-07 |
Comprehensive investigation into the influence of glycosylation on head and neck squamous cell carcinoma and development of a prognostic model for risk assessment and anticipating immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1364082
PMID:38562924
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研究论文 | 本文研究了糖基化在头颈鳞状细胞癌中的影响，并开发了一个预测模型用于风险评估和免疫治疗反应预测 | 首次详细阐明了糖基化与头颈鳞状细胞癌的关系，并开发了一个基于糖基化相关基因的风险预测模型 | NA | 研究糖基化在头颈鳞状细胞癌中的作用，并开发一个预测模型以评估患者风险和免疫治疗反应 | 头颈鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归和Lasso回归 | 基因数据 | 184个调控糖基化的基因 |
| 980 | 2024-08-07 |
Integrative single-cell analysis of LUAD: elucidating immune cell dynamics and prognostic modeling based on exhausted CD8+ T cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366096
PMID:38596689
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术，构建了肺腺癌（LUAD）的免疫微环境图谱，并基于耗竭的CD8+ T细胞标记基因建立了LUAD的预后模型 | 首次构建了LUAD的单细胞图谱，并基于耗竭的CD8+ T细胞标记基因建立了预后模型，识别了GALNT2作为潜在的治疗靶点 | NA | 旨在详细描绘LUAD及其相关微环境的特征，并建立基于耗竭CD8+ T细胞的预后模型 | LUAD的免疫细胞，包括CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 19名患者 |