单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
961	2024-08-07	ABHD5-CPT1B: An Important Way of Regulating Placental Lipid Metabolism in Gestational Diabetes Mellitus 2024-01, Archives of medical research IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.arcmed.2023.102925 PMID:38042031	研究论文	本研究探讨了妊娠期糖尿病中胎盘脂质代谢的调控机制，特别是ABHD5-CPT1B的作用	首次揭示了ABHD5-CPT1B在妊娠期糖尿病胎盘脂质代谢中的重要调控作用	研究样本量较小，需要进一步的大规模验证	探究妊娠期糖尿病中胎盘脂质代谢的分子机制	妊娠期糖尿病患者的胎盘和正常孕妇的胎盘	NA	妊娠期糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA	15名妊娠期糖尿病患者和15名正常孕妇
962	2024-08-07	Leveraging baseline transcriptional features and information from single-cell data to power the prediction of influenza vaccine response 2024, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcimb.2024.1243586 PMID:38384303	研究论文	本研究利用基因表达数据和单细胞数据，探索构建流感疫苗反应预测模型的改进策略	本研究采用了组合建模策略，并利用单细胞水平的信息来优化流感疫苗反应预测模型	NA	探索利用基因表达数据和单细胞数据构建流感疫苗反应预测模型的改进策略	流感疫苗反应预测模型的构建	生物信息学	流感	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用来自Immune Signatures Data Resource (IS2)的基因表达和免疫反应数据，具体样本数量未提及
963	2024-08-07	Comprehensive analysis of genetic associations and single-cell expression profiles reveals potential links between migraine and multiple diseases: a phenome-wide association study 2024, Frontiers in neurology IF:2.7Q3 DOI:10.3389/fneur.2024.1301208 PMID:38385040	研究论文	本研究通过综合分析遗传关联和单细胞表达谱，揭示了偏头痛与其他多种疾病之间的潜在联系	首次通过单细胞RNA测序和PheWAS研究，揭示了偏头痛与多种疾病之间的多效性关系及其生物学基础	NA	探究偏头痛与其他复杂疾病之间的遗传和生物学联系	偏头痛及其与416种表型的关联	遗传学	神经系统疾病	单细胞RNA测序, qPCR	NA	基因表达数据	73个偏头痛易感基因在不同脑细胞类型中的表达
964	2024-08-07	Unraveling T cell exhaustion in the immune microenvironment of osteosarcoma via single-cell RNA transcriptome 2024-Jan-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-023-03585-2 PMID:38280005	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序数据分析了骨肉瘤中的T细胞耗竭现象，并构建了预测模型以评估其对患者预后的影响	首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了骨肉瘤中T细胞耗竭的分子特征及其在肿瘤免疫微环境中的作用	NA	探讨T细胞耗竭在骨肉瘤免疫微环境中的作用及其对疾病进展的影响	骨肉瘤中的T细胞耗竭现象及其相关基因表达	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未具体说明样本数量
965	2024-08-04	Joint L2,p-norm and random walk graph constrained PCA for single-cell RNA-seq data 2024 Jan-Mar, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering IF:1.7Q3 DOI:10.1080/10255842.2023.2188106 PMID:36912759	研究论文	本文提出了一种称为RWPPCA的新方法用于改善单细胞RNA测序数据的细胞类型识别	RWPPCA结合了随机游走算法和图正则化，以更精确地确定数据点之间的局部几何关系，并引入-Lp范数使主成分更稀疏，提升了解释性	传统PCA在挖掘数据的非线性流形结构时存在缺陷，可能会受主成分过密的影响	提高单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别的有效性	单细胞RNA测序数据	数字病理学	NA	RNA-seq	NA	高维数据	模拟数据和单细胞RNA测序数据的多个样本
966	2024-08-04	Multi-omics and single-cell sequencing analyses reveal the potential significance of circadian pathways in cancer therapy 2024 Jan-Feb, Expert review of molecular diagnostics IF:3.9Q1 DOI:10.1080/14737159.2023.2296668 PMID:38288973	研究论文	该研究探讨了生物钟通路在癌症治疗中的潜在重要性	首次全面分析了癌症中的生物钟相关基因及其在肿瘤微环境中的作用	该研究仅使用了TCGA数据库的数据，可能无法涵盖所有相关表型和样本	探索生物钟相关基因在泛癌症中的影响	研究多个不同类型肿瘤中的生物钟相关基因表达及其对免疫微环境的影响	数字病理学	肿瘤	单细胞测序, 免疫组织化学	NA	基因组数据	使用TCGA数据库的多种癌症相关数据，包括多个肿瘤类型的样本
967	2024-08-04	Association of peripheral B cells and delirium: combined single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis 2024, Frontiers in neurology IF:2.7Q3 DOI:10.3389/fneur.2024.1343726 PMID:38379709	研究论文	本研究探讨了外周B细胞与谵妄的关联，分析了炎症压力下的免疫细胞亚群变化。	首次结合单细胞测序和孟德尔随机化法来探究外周免疫细胞与谵妄的因果关系	本研究的结果可能受到样本量和遗传数据的限制	研究外周免疫细胞亚群在炎症应激情况下的变化及其与谵妄的因果关联	人类外周血单核细胞(PBMC)及其亚群	数字病理学	谵妄	单细胞转录组测序	NA	基因型数据、单细胞转录组数据	70个与PBMC相关的免疫性状
968	2024-08-04	Selective inhibition of DNA ligase IV provides additional efficacy to the treatment of anaplastic thyroid cancer 2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2024.1323313 PMID:38380364	研究论文	本研究探讨了选择性抑制DNA连接酶IV对治疗未分化甲状腺癌的额外疗效	本研究首次显示了DNA连接酶IV抑制剂与DNA损伤剂联合应用对未分化甲状腺癌的治疗潜力	样本量和模型的应用限制了研究结果的广泛适用性	探讨选择性抑制DNA连接酶IV对未分化甲状腺癌治疗的影响	未分化甲状腺癌细胞系（C643和Hth74）及甲状腺癌不同亚型患者的单细胞转录组数据	数字病理学	未分化甲状腺癌	单细胞RNA测序，DNA损伤响应监测	NA	RNA测序数据，细胞培养实验结果	多个不同亚型甲状腺癌患者的单细胞数据，使用小鼠异种移植模型进行实验
969	2024-08-07	Distinct Transcriptional Profiles in the Different Phenotypes of Neurofibroma from the Same Subject with Neurofibromatosis 1 2024-01, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2023.03.1688 PMID:37301319	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析，探讨了同一患者中皮肤神经纤维瘤（cNF）和丛状神经纤维瘤（pNF）的转录特征和微环境差异	首次揭示了同一患者中cNF和pNF具有不同的转录特征，pNF中富含具有恶性特征的施万细胞和癌症相关成纤维细胞样表型的成纤维细胞，而cNF中富含带有组织驻留标记的CD8 T细胞	研究样本数量有限，仅包括来自不同患者的六例cNF和五例pNF	探讨神经纤维瘤病1中不同表型的转录特征和微环境差异	皮肤神经纤维瘤（cNF）和丛状神经纤维瘤（pNF）的细胞类型和转录特征	数字病理学	神经纤维瘤病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	六例cNF和五例pNF样本
970	2024-08-07	ΔNp63 Regulates Homeostasis, Stemness, and Suppression of Inflammation in the Adult Epidermis 2024-01, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2023.07.005 PMID:37543242	研究论文	本研究探讨了ΔNp63在成年表皮中的作用，发现其缺失会导致角质形成细胞增殖和自我维持受损，并触发类似银屑病的炎症反应	首次揭示了ΔNp63在成年表皮中调控稳态、干细胞特性及抑制炎症的关键作用	研究主要集中在ΔNp63的急性遗传消融对成年表皮的影响，未涉及长期或慢性消融的效应	探究ΔNp63在成年表皮中的功能及其对表皮稳态、干细胞特性和炎症抑制的调控机制	ΔNp63在成年表皮中的作用及其对角质形成细胞增殖、自我维持和炎症反应的影响	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
971	2024-08-04	A comprehensive pan-cancer analysis of prognostic value and potential clinical implications of FTH1 in cancer immunotherapy 2024-Jan-28, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-023-03625-x PMID:38281198	研究论文	本文系统探讨了FTH1在癌症免疫疗法中的预后意义和免疫角色	本研究揭示了FTH1在肿瘤免疫微环境中的重要作用及其与免疫疗法抵抗之间的关联	本文未明确评估不同类型肿瘤对FTH1表达的影响及其潜在机制	探讨FTH1在多种癌症免疫治疗中的预后价值和临床潜力	探究FTH1作为各种实体癌免疫治疗靶点的潜力	数字病理学	NA	单细胞测序分析和多重免疫荧光染色技术	NA	NA	NA
972	2024-08-04	Integrating bulk-RNA sequencing and single-cell sequencing analyses to characterize adenosine-enriched tumor microenvironment landscape and develop an adenosine-related prognostic signature predicting immunotherapy in lung adenocarcinoma 2024-Jan-24, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s10142-023-01281-z PMID:38265702	研究论文	该文章探讨了腺苷信号在肺腺癌肿瘤微环境中的生物学作用，并开发了与腺苷相关的预后特征。	文章创新点在于量化腺苷信号，并建立了腺苷相关的预后特征，预测免疫治疗的有效性。	数据分析主要集中在腺苷信号与免疫微环境的关系，可能未涵盖其他重要的生物标志物。	探讨腺苷信号在肺腺癌肿瘤微环境中的作用及其在免疫治疗中的预后价值。	研究对象为肺腺癌样本中的腺苷信号和肿瘤免疫微环境。	数字病理学	肺癌	bulk-RNA测序和单细胞测序	NA	样本数据	LUAD样本的具体样本数量未提及
973	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing reveals the transcriptional heterogeneity of Tbx18-positive cardiac cells during heart development 2024-Jan-24, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s10142-024-01290-6 PMID:38265516	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了Tbx18阳性心脏细胞在心脏发育过程中的转录异质性	首次全面揭示了Tbx18阳性心脏细胞在发育过程中的转录景观和细胞异质性	研究基于已发表的单细胞RNA测序数据，未涉及实验验证	探索Tbx18阳性心脏细胞在心脏发育过程中的异质性和转录景观	Tbx18阳性心脏细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用了已发表的小鼠心脏单细胞RNA测序数据
974	2024-08-04	Transcription Factor IRF7 is Involved in Psoriasis Development and Response to Guselkumab Treatment 2024, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S450048 PMID:38375022	研究论文	本研究探讨了转录因子IRF7在银屑病发生和guselkumab治疗反应中的作用	该研究首次确认了IRF7在银屑病及其对guselkumab治疗反应中的重要性	研究可能在样本数量和多样性上存在局限性	研究银屑病病因及guselkumab治疗的新治疗策略	针对银屑病患者的基因表达及单细胞RNA测序数据进行分析	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	对12周guselkumab治疗前后的银屑病皮肤样本进行分析
975	2024-08-07	Single-cell RNA-seq reveals a link of ovule abortion and sugar transport in Camellia oleifera 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1274013 PMID:38371413	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了油茶中胚珠流产与糖运输之间的关联	首次报道了木本作物卵巢的单细胞转录组图谱，并探讨了胚珠流产可能与胎盘和胚珠中的糖运输有关	NA	探讨胚珠流产的机制及其与糖运输的关系	油茶的不同胚珠流产率品种的成熟卵巢细胞	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	20,526个高质量细胞
976	2024-08-07	Sputum Transcriptomics Reveals FCN1+ Macrophage Activation in Mild Eosinophilic Asthma Compared to Non-Asthmatic Eosinophilic Bronchitis 2024-Jan, Allergy, asthma & immunology research DOI:10.4168/aair.2024.16.1.55 PMID:38262391	研究论文	本文通过痰液转录组学分析，比较了轻度嗜酸性哮喘与非哮喘性嗜酸性支气管炎中FCN1+巨噬细胞活化的差异。	首次通过单细胞RNA测序揭示了FCN1+巨噬细胞在嗜酸性哮喘中的活化及其与气道重塑过程的关系。	研究样本量较小，且未涉及更广泛的哮喘类型和更深入的分子机制探讨。	比较嗜酸性哮喘与非哮喘性嗜酸性支气管炎在痰液转录组学层面的差异，探讨其背后的分子机制。	嗜酸性哮喘患者、非哮喘性嗜酸性支气管炎患者及健康对照者的痰液细胞。	数字病理学	哮喘	RNA测序	单细胞RNA测序	转录组数据	嗜酸性哮喘患者18例，非哮喘性嗜酸性支气管炎患者15例，健康对照者28例
977	2024-08-07	Interferon-γ signaling in eosinophilic esophagitis has implications for epithelial barrier function and programmed cell death 2024-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.01.26.577407 PMID:38352458	研究论文	研究干扰素-γ信号在嗜酸性食管炎中的作用及其对上皮屏障功能和程序性细胞死亡的影响	通过单细胞RNA测序和体外器官模型，揭示了干扰素-γ信号在嗜酸性食管炎中对上皮细胞功能的影响	NA	旨在解开免疫细胞与上皮细胞之间的相互作用，并探讨其在食管上皮细胞中的功能意义	嗜酸性食管炎患者的食管上皮细胞	NA	嗜酸性食管炎	单细胞RNA测序	NA	RNA	嗜酸性食管炎患者的食管上皮细胞样本
978	2024-08-04	Glycogen metabolism-mediated intercellular communication in the tumor microenvironment influences liver cancer prognosis 2024, Oncology research IF:2.0Q3 DOI:10.32604/or.2023.029697 PMID:38361757	研究论文	本研究揭示了糖原代谢在肝细胞癌微环境中介导细胞间通信的作用	首次揭示了糖原代谢在肝细胞癌微环境中介导细胞间通信的机制	暂无该研究的局限性信息	探讨糖原代谢在肝细胞癌微环境中的功能及其对预后的影响	肝细胞癌肿瘤样本中的69个细胞簇和65个糖原代谢基因	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	细胞	10个HCC肿瘤样本，共计64,545个细胞
979	2024-08-07	Spatiotemporal modulation of growth factors directs the generation of multilineage mouse embryonic stem cell-derived mammary organoids 2024-Jan-22, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.003 PMID:38159568	研究论文	本文通过定向分化小鼠胚胎干细胞（mESCs），报道了多谱系ESC衍生乳腺类器官（MEMOs）的生成	首次通过序列激活骨形态发生蛋白4（BMP4）和甲状旁腺激素相关蛋白（PTHrP）以及抑制hedgehog（HH）信号通路，诱导真皮间充质转化为乳腺特异性间充质，生成多谱系ESC衍生乳腺类器官	NA	研究外胚层附属物的发育，并为再生医学和疾病建模提供基础	小鼠胚胎干细胞衍生乳腺类器官的生成及其功能	再生医学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
980	2024-08-04	An aging-related immune landscape in the hematopoietic immune system 2024-Jan-02, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1 DOI:10.1186/s12979-023-00403-2 PMID:38169405	研究论文	本文描述了年轻和老年小鼠的脾脏和骨髓的造血免疫图谱	研究揭示了老化过程中造血干细胞的功能和组成发生了重大变化	未提及具体的样本数量和多样性	探讨老龄化对造血免疫系统的整体影响	年轻和老年小鼠的造血免疫系统	数字病理	老年疾病	单细胞测序和流式细胞术	NA	细胞	NA