单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1387 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of the cellular microenvironment in three different colonic polyp subtypes in children
2024-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1535
PMID:38264936
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫组织化学分析，探讨了儿童结肠息肉不同亚型的细胞微环境特征 | 识别了不同结肠息肉亚型中共有的和疾病特异性的细胞亚群及表达模式，揭示了这些细胞在塑造独特细胞微环境中的重要作用 | NA | 加深对儿童结肠息肉异质性细胞微环境的理解，并识别潜在的治疗策略以减少息肉的复发 | 儿童结肠息肉的三种不同亚型：孤立性幼年息肉（SJPs）、息肉病综合征（PJS）和Peutz-Jeghers综合征（PJS） | 数字病理学 | 结肠息肉 | 单细胞RNA测序，多重免疫组织化学（mIHC） | NA | 细胞 | 从儿童患者中获得的正常结肠组织和不同类型的结肠息肉样本 |
| 942 | 2024-08-07 |
Cellular plasticity in the breast cancer ecosystem
2024, Upsala journal of medical sciences
IF:1.5Q2
DOI:10.48101/ujms.v129.10629
PMID:38571887
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综述 | 本文综述了乳腺癌生态系统中细胞可塑性和异质性的最新发现，重点讨论了癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的作用。 | 文章揭示了乳腺癌细胞表现出由内在遗传因素和外部微环境信号驱动的表型可塑性，并探讨了单细胞RNA测序研究揭示的CAFs和TAMs的多样性亚型及其在肿瘤微环境中的功能基因表达程序和空间组织。 | NA | 理解细胞表型的层次关系和微环境信号，为靶向治疗干预提供新机会。 | 乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 943 | 2024-08-04 |
Intermittent fasting promotes ILC3s secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.29.555436
PMID:37693430
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研究论文 | 本文研究了间歇性禁食如何促进ILC3分泌IL-22，从而促进白色脂肪组织的变褐。 | 提出了ILC3/IL-22/IL-22R轴在间歇性禁食代谢益处中的作用机制。 | 未涉及潜在的临床转化和人类研究 | 探讨间歇性禁食对代谢益处的机制。 | 研究了小鼠肠道内的ILC3细胞和其对白色脂肪组织变褐的影响。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 饮食诱导肥胖小鼠 |
| 944 | 2024-08-04 |
Intratumoral CXCR4hi neutrophils display ferroptotic and immunosuppressive signatures in hepatoblastoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363454
PMID:38487536
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研究论文 | 本研究发现肝母细胞瘤中的CXCR4高表达中性粒细胞表现出铁死亡和免疫抑制特征 | 揭示了肝母细胞瘤内不同发展阶段的中性粒细胞及其在肿瘤免疫抑制中的作用 | 未提及具体的临床试验数据或长期结果 | 探讨肝母细胞瘤中肿瘤浸润中性粒细胞的功能特征 | 肝母细胞瘤中的肿瘤浸润中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 批量RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 研究中分析了不同发育阶段的中性粒细胞的样本 |
| 945 | 2024-08-04 |
Unraveling the mechanisms of NK cell dysfunction in aging and Alzheimer's disease: insights from GWAS and single-cell transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1360687
PMID:38464521
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研究论文 | 本研究探讨了衰老与阿尔茨海默病(NK细胞功能失常)之间的机制 | 通过GWAS和单细胞转录组学分析，揭示NK细胞在衰老与阿尔茨海默病中的作用 | 未提及具体的实验室验证或长期跟踪研究 | 研究衰老如何影响NK细胞的功能以及与阿尔茨海默病的关系 | 研究对象为不同年龄段的阿尔茨海默病患者的NK细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核转录组测序，基因组宽关联研究(GWAS) | NA | 基因表达数据 | 2,171名60岁以上的老年人 |
| 946 | 2024-08-07 |
Precursor exhausted CD8+T cells in colorectal cancer tissues associated with patient's survival and immunotherapy responsiveness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1362140
PMID:38510246
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研究论文 | 本研究利用多色免疫组织化学技术（mIHC）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了结直肠癌（CRC）组织中肿瘤浸润T细胞的定位及其临床意义，并探讨了其在免疫治疗反应中的作用。 | 本研究首次通过mIHC技术和scRNA-seq分析，揭示了结直肠癌微环境中T细胞的转录和功能特性，并证实了其在患者生存和免疫治疗反应中的关键作用。 | NA | 探讨结直肠癌组织中T细胞的分布及其在患者生存和免疫治疗反应中的作用。 | 结直肠癌组织中的T细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多色免疫组织化学（mIHC），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 人类结直肠癌组织及小鼠MC38肿瘤模型 |
| 947 | 2024-08-07 |
Novel prognostic biomarker TBC1D1 is associated with immunotherapy resistance in gliomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372113
PMID:38529286
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研究论文 | 本文通过分析TCGA、CGGA和GEO数据库，鉴定了与胶质瘤免疫治疗抵抗相关的基因TBC1D1，并通过多种实验方法验证了其在免疫治疗中的作用。 | 首次发现TBC1D1作为胶质瘤免疫治疗抵抗的新型预后生物标志物，并探讨了其在免疫抑制微环境中的作用。 | NA | 研究胶质瘤免疫治疗抵抗的机制，并寻找新的预后生物标志物。 | 胶质瘤及其免疫治疗抵抗机制。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | qRT-PCR, 蛋白质印迹, GSEA, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质水平数据 | 使用了来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多组数据 |
| 948 | 2024-08-07 |
A division-of-labor mode contributes to the cardioprotective potential of mesenchymal stem/stromal cells in heart failure post myocardial infarction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363517
PMID:38562923
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研究论文 | 本研究探讨了3D培养的间充质干细胞（MSCs）在心肌梗死后心力衰竭治疗中的保护作用及其机制 | 本研究首次揭示了3D MSCs在细胞层面的异质性和分工模式，并通过机器学习预测模型和网络服务器开发了预测MSCs分泌效能的配体模型 | NA | 提高MSCs的生产效率并寻找评估其治疗效能的新方法 | 3D培养的人脐带间充质干细胞（hUC-MSCs）及其在心肌梗死后心力衰竭治疗中的应用 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞和批量RNA测序 | 机器学习预测模型 | RNA测序数据 | 使用了125种组合算法进行筛选，并对CD142+和CD142- MSCs进行了差异表达分析 |
| 949 | 2024-08-07 |
Comprehensive investigation into the influence of glycosylation on head and neck squamous cell carcinoma and development of a prognostic model for risk assessment and anticipating immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1364082
PMID:38562924
|
研究论文 | 本文研究了糖基化在头颈鳞状细胞癌中的影响，并开发了一个预测模型用于风险评估和免疫治疗反应预测 | 首次详细阐明了糖基化与头颈鳞状细胞癌的关系，并开发了一个基于糖基化相关基因的风险预测模型 | NA | 研究糖基化在头颈鳞状细胞癌中的作用，并开发一个预测模型以评估患者风险和免疫治疗反应 | 头颈鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归和Lasso回归 | 基因数据 | 184个调控糖基化的基因 |
| 950 | 2024-08-07 |
Integrative single-cell analysis of LUAD: elucidating immune cell dynamics and prognostic modeling based on exhausted CD8+ T cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366096
PMID:38596689
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术，构建了肺腺癌（LUAD）的免疫微环境图谱，并基于耗竭的CD8+ T细胞标记基因建立了LUAD的预后模型 | 首次构建了LUAD的单细胞图谱，并基于耗竭的CD8+ T细胞标记基因建立了预后模型，识别了GALNT2作为潜在的治疗靶点 | NA | 旨在详细描绘LUAD及其相关微环境的特征，并建立基于耗竭CD8+ T细胞的预后模型 | LUAD的免疫细胞，包括CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 19名患者 |
| 951 | 2024-08-04 |
Comparative analysis of single-cell transcriptome reveals heterogeneity and commonality in the immune microenvironment of colorectal cancer and inflammatory bowel disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1356075
PMID:38529274
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研究论文 | 本文分析了结直肠癌（CRC）和炎症性肠病（IBD）免疫微环境的异质性和共性 | 首次通过单细胞转录组分析深入探讨了CRC和IBD的细胞通信及其与衰老和炎症反应的关系 | 未详细阐明分子机制，且样本数虽大但仍可能不足以覆盖所有变异 | 旨在理解衰老、炎症与肿瘤在CRC和IBD中的特征 | 研究对象为92名CRC患者和24名IBD患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 432,314个单细胞，来自92名CRC患者和24名IBD患者 |
| 952 | 2024-08-04 |
Tumor-specific activation of folate receptor beta enables reprogramming of immune cells in the tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1354735
PMID:38384467
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研究论文 | 该文章展示了肿瘤特异性激活叶酸受体β如何重编程肿瘤微环境中的免疫细胞 | 阐明了FRβ在肿瘤微环境中的特定作用以及其对免疫细胞重编程的影响 | 未明确提及研究的局限性 | 研究FRβ在肿瘤相关巨噬细胞中的功能及其对肿瘤微环境的重编程作用 | 主要研究肿瘤微环境中的免疫抑制性巨噬细胞及其功能变化 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 953 | 2024-08-07 |
Decoding the tumor microenvironment and molecular mechanism: unraveling cervical cancer subpopulations and prognostic signatures through scRNA-Seq and bulk RNA-seq analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1351287
PMID:38482016
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，深入分析宫颈癌的肿瘤微环境和分子机制，识别关键的肿瘤上皮细胞亚群及其对宫颈癌进展的影响 | 首次识别出C3 PLP2+肿瘤上皮祖细胞作为宫颈癌中的一个重要亚群，并建立了独立的预后指标PLP2+肿瘤EPCs评分 | NA | 深入理解影响宫颈癌进展的决定因素，提高对宫颈癌肿瘤微环境的认识，并为未来的宫颈癌治疗提供有价值的见解 | 宫颈癌的肿瘤上皮细胞亚群及其对疾病进展的影响 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-seq） | NA | RNA | 四份宫颈癌患者样本 |
| 954 | 2024-08-07 |
Innovative prognostic modeling in ESCC: leveraging scRNA-seq and bulk-RNA for dendritic cell heterogeneity analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1352454
PMID:38515748
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA分析，深入探讨了食管鳞状细胞癌（ESCC）中树突状细胞的异质性及其对患者预后的影响 | 本研究通过scRNA-seq和批量RNA分析，揭示了树突状细胞在ESCC中的异质性，并开发了基于树突状细胞相关基因签名的预后模型 | NA | 深入研究食管鳞状细胞癌中树突状细胞的异质性及其对患者预后的影响 | 食管鳞状细胞癌中的树突状细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA分析 | NA | RNA | GSE53624队列（n = 119）、TCGA-ESCC队列（n = 139）、IMvigor210免疫治疗队列（n = 298） |
| 955 | 2024-08-04 |
Comprehending the cuproptosis and cancer-immunity cycle network: delving into the immune landscape and its predictive role in breast cancer immunotherapy responses and clinical endpoints
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1344023
PMID:38312844
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研究论文 | 本研究探索了cuproptosis与乳腺癌免疫反应和预后结果之间的关系 | 提出了基于cuproptosis-CICs的影响因素，并建立了预测模型以个性化乳腺癌治疗 | 缺乏临床试验结果来进一步验证模型的实际应用效果 | 探讨cuproptosis-CIC网络对乳腺癌患者免疫反应和预后结果的影响 | 使用TCGA、GEO及ICGC数据对乳腺癌患者进行研究 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, LASSO-Cox模型 | Cox比例风险回归模型 | 基因组数据 | 研究中使用了TCGA、GEO和ICGC数据，样本数量NA |
| 956 | 2024-08-04 |
Molecular mechanisms of pancreatic cancer liver metastasis: the role of PAK2
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1347683
PMID:38343537
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研究论文 | 本研究深入探讨了胰腺癌肝转移的分子机制，强调了PAK2的作用。 | 发现PAK2作为胰腺癌肝转移的关键基因，并揭示其通过激活TGF-β信号通路促进转移。 | 本研究的局限性在于主要依赖于生物信息学分析，缺乏大规模临床验证。 | 研究胰腺癌肝转移的机制，以为未来治疗方法和药物的发展提供科学依据。 | 研究对象为胰腺癌细胞及其肝转移相关基因。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序, 批量数据分析, 药物敏感性分析 | 无特定模型 | 基因表达数据 | 多个数据集(GSE155698, GSE154778, GSE71729, GSE19279, TCGA-PAAD) |
| 957 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the dynamics and heterogeneity of lymph node immune cells during acute and chronic viral infections
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1341985
PMID:38352870
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、scTCR-seq和scBCR-seq技术，探讨了急性与慢性病毒感染下淋巴结CD45+免疫细胞的动态变化和异质性 | 首次在单细胞水平上全面比较了急性与慢性病毒感染下淋巴组织免疫细胞的差异 | NA | 探索急性与慢性病毒感染下免疫反应的景观 | 淋巴结CD45+免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), scTCR-seq, scBCR-seq | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行急性（LCMV Armstrong）和慢性（LCMV clone 13）病毒感染的研究 |
| 958 | 2024-08-07 |
Comparison of the single-cell and single-nucleus hepatic myeloid landscape within decompensated cirrhosis patients
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1346520
PMID:38380322
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）技术，对比了失代偿期肝硬化患者经颈静脉肝穿刺（TJB）获取的肝组织中的肝髓系细胞景观。 | 首次通过单核转录组测序技术，有效克服了临床标本采集的复杂性，并能够充分分析所有主要的肝细胞类型，包括所有髓系细胞亚群。 | scRNA-seq平台未能恢复足够的枯否细胞数量，且其他单核细胞/巨噬细胞表现出应激相关参数的高表达。 | 旨在通过比较单细胞和单核RNA测序技术，全面理解失代偿期肝硬化患者的肝髓系细胞景观。 | 失代偿期肝硬化患者的肝组织中的髓系细胞。 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | 3名失代偿期肝硬化患者的肝组织样本 |
| 959 | 2024-08-07 |
Prognostic stratification of sepsis through DNA damage response based RiskScore system: insights from single-cell RNA-sequencing and transcriptomic profiling
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1345321
PMID:38404591
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研究论文 | 本研究通过基于DNA损伤反应（DDR）的风险评分系统，利用单细胞RNA测序和转录组分析，对脓毒症进行预后分层 | 开发了一种基于DNA损伤反应的新型风险评分系统，用于提高脓毒症预后预测的准确性，并可能指导更有效的治疗方案的创建 | NA | 旨在通过基于DNA损伤反应的风险评分系统，提高脓毒症预后预测的准确性，并探索个性化治疗策略 | 脓毒症患者的预后分层和治疗策略 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归 | 转录组数据 | 涉及多种细胞亚型，包括单核细胞、巨核细胞、CD4+ T细胞和中性粒细胞 |
| 960 | 2024-08-07 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:37782774
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研究论文 | 研究探讨了蛋白精氨酸甲基转移酶5（PRMT5）靶向治疗在套细胞淋巴瘤（MCL）中的耐药性问题 | 发现使用temsirolimus靶向阻断mTORC1可以克服PRMT5抑制剂的耐药性，并在耐药的MCL细胞系中显示出治疗协同作用 | 研究主要基于患者来源的异种移植（PDX）模型和细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的耐药机制并寻找克服耐药性的策略 | 套细胞淋巴瘤（MCL）及其对PRMT5抑制剂的耐药性 | NA | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 敏感细胞系4个，初级耐药细胞系4个，耐药PDX模型若干 |