单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1397 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2024-08-05 |
ECT2 promotes the occurrence and is a prognostic biomarker of head and neck squamous cell carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.95515
PMID:38947403
|
研究论文 | 本研究探讨了ECT2在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的作用，发现其可能是一个预后生物标志物 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据首次明确了ECT2在HNSCC中的特定角色 | 本研究可能在样本多样性和临床外部验证方面存在局限性 | 研究ECT2在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 头颈部鳞状细胞癌样本及相关细胞系HSC-3 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据和细胞功能实验数据 | 头颈部鳞状细胞癌样本和细胞系HSC-3 | NA | NA | NA | NA |
| 922 | 2024-08-05 |
PathFinder: a novel graph transformer model to infer multi-cell intra- and inter-cellular signaling pathways and communications
2024, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2024.1369242
PMID:38846640
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新颖的图变换模型PathFinder，用于推断多细胞间及细胞内的信号传导路径与通讯 | PathFinder基于分而治之策略设计，将复杂的信号网络分为信号路径，并采用新颖的图变换架构进行评分和排名 | 暂无提及具体局限性 | 旨在理解阿尔茨海默病微环境内复杂的信号机制 | 使用的研究对象包括APOE4基因型特异性的AD和人类肝硬化队列 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | 图变换模型 | 基因表达数据 | 两个scRNA-seq数据队列 | NA | NA | NA | NA |
| 923 | 2024-08-05 |
Prognostic and predictive value of super-enhancer-derived signatures for survival and lung metastasis in osteosarcoma
2024-01-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04902-8
PMID:38254188
|
研究论文 | 本研究探讨了超增强子衍生签名在骨肉瘤生存和肺转移中的预后和预测价值 | 该研究开发了基于超增强子的预后签名，显著提高了骨肉瘤患者的预后准确性 | 本研究仅基于回顾性分析，缺乏前瞻性验证 | 提高骨肉瘤患者的预后评估准确性 | 研究对象为212名接受标准治疗的骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 212名骨肉瘤患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 924 | 2024-08-05 |
The role of immune cells in different stages of atherosclerosis
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.94570
PMID:38774746
|
综述 | 本文探讨了免疫细胞在动脉粥样硬化不同阶段的作用 | 强调了免疫细胞亚型的多样性及其在动脉粥样硬化进展中的适应性 | 未详细探讨临床应用的具体策略 | 理解免疫细胞及其亚型如何影响动脉粥样硬化的发展 | 关注动脉粥样硬化病变内的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 高维质谱和单细胞RNA测序 | NA | 细胞、组织样本 | 利用动脉粥样硬化病变中的白血球样本 | NA | NA | NA | NA |
| 925 | 2024-08-04 |
Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Unravels the Molecular Feature of Tumor-Associated Macrophage of Acute Myeloid Leukemia
2024, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2024/5539065
PMID:38205232
|
研究论文 | 本文探讨了急性髓系白血病及其相关的巨噬细胞分子特征 | 提出了一种巨噬细胞相关指数（MRI）来评估AML患者的预后和免疫特征 | 研究可能受到数据源和样本量的限制，可能需进一步验证 | 深入探索急性髓系白血病与巨噬细胞之间的关联 | 急性髓系白血病患者的基因表达谱和临床变量特征 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | RNA测序 | LASSO和多变量Cox分析 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA, GEO和TARGET数据库的AML患者数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 926 | 2024-08-04 |
Prognostic and therapeutic insights into colorectal carcinoma through immunogenic cell death gene profiling
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17629
PMID:38938617
|
研究论文 | 本研究探讨了免疫原性细胞死亡在结直肠癌中的作用，并开发了新型的量化系统来预测患者的预后与免疫治疗效果 | 开发了一种新颖的免疫原性细胞死亡量化系统，并在肿瘤免疫微环境中构建了ICD评分 | 本研究侧重于结直肠癌的特定类型，可能无法广泛适用于其他癌症类型 | 研究免疫原性细胞死亡在结直肠癌中的作用与预测患者治疗结果的潜力 | 研究对象为被诊断为结肠腺癌/直肠腺癌的1,184名患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | 主成分分析 (PCA) | 基因组数据 | 1,184名结肠腺癌/直肠腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 927 | 2024-08-04 |
Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptomics to Uncover and Elucidate GP73-Mediated Pro-Angiogenic Regulatory Networks in Hepatocellular Carcinoma
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0387
PMID:38939041
|
研究论文 | 本研究展示了GP73介导的促血管生成调控网络在肝细胞癌中的作用 | 揭示了GP73与血管内皮细胞的细胞通信及其在肝细胞癌血管发育中的作用 | 研究可能未能涵盖所有肝细胞癌类型及其复杂性 | 探讨GP73在肝细胞癌中促血管生成的机制及其临床相关性 | 肝细胞癌患者的细胞及其在血管生成中的关键角色 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞空间转录组学 | NA | 细胞、血清 | 肝细胞癌患者的样本未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 928 | 2024-08-05 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies an aneuploidy-based gene signature to predict sensitivity of lung adenocarcinoma to traditional chemotherapy drugs and patients' prognosis
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17545
PMID:38938612
|
研究论文 | 该文章研究了一个基于基因签名的模型，以预测肺腺癌对传统化疗药物的敏感性和患者的预后 | 开发了一个五基因异倍体相关风险评分（ARS）模型，发现高表达的CKS1B促进肺腺癌细胞系的增殖、迁移和侵袭性表型 | 目前对异倍体相关基因在肺腺癌中的预后和免疫治疗能力的研究仍然有限 | 研究异倍体相关基因在肺腺癌中的潜在作用，以改善诊断和治疗方法 | 以肺腺癌（LUAD）细胞系为研究对象，筛选与异倍体相关的基因 | 数字病理 | 肺癌 | RNA测序 | Cox回归与Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 使用公共数据库的肿瘤数据以及细胞实验验证 | NA | NA | NA | NA |
| 929 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of a new transgenic t(8;21) preleukemia mouse model reveals regulatory networks promoting leukemic transformation
2024-01, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-02063-z
PMID:37838757
|
研究论文 | 本研究描述了一种新的转基因鼠模型，揭示了促使白血病转化的调控网络 | 开发了一种新的AE9a基因敲入小鼠模型，适合研究前白血病阶段的改变 | 可能在临床上的适用性仍需进一步验证 | 研究t(8;21)的前白血病机理及其调控网络 | 使用AE9a小鼠模型分析前白血病细胞群体及其转化 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠 | 基因表达数据 | 使用AE9a小鼠模型观察多个细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 930 | 2024-08-05 |
Single cell transcriptomic analysis of the canine duodenum in chronic inflammatory enteropathy and health
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1397590
PMID:38933260
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析慢性炎性肠病犬的十二指肠细胞多样性 | 揭示了犬类十二指肠黏膜的细胞异质性和潜在的分子机制 | 该研究样本量较小，仅涉及7只狗 | 研究慢性炎性肠病中犬类十二指肠的细胞组成及其影响 | 健康犬和患有慢性炎性肠病的犬 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 7个样本（3只健康犬和4只慢性炎性肠病犬） | NA | NA | NA | NA |
| 931 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals the heterogeneity of B cells and tertiary lymphoid structures in muscle-invasive bladder cancer
2024-01-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04860-1
PMID:38216927
|
研究论文 | 该研究揭示了肌肉侵袭性膀胱癌(MIBC)中B细胞和三级淋巴结构的异质性 | 本研究提供了关于MIBC中B细胞亚型的异质性及TLSs在MIBC结果中的重要作用的新见解 | 本研究的局限性在于样本大小较小，仅涉及12名膀胱癌患者 | 探索肌肉侵袭性膀胱癌中肿瘤浸润B细胞和三级淋巴结构的功能和机制 | 该研究的对象为12名膀胱癌患者的B细胞和T细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12名膀胱癌患者的11612个B细胞和55392个T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 932 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals aberrantly activated inter-tumor cell signaling pathways in the development of clear cell renal cell carcinoma
2024-01-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04818-9
PMID:38191424
|
研究论文 | 本研究探讨了在透明细胞肾细胞癌发展过程中异常激活的肿瘤细胞间信号传导通路 | 首次揭示了透明细胞肾细胞癌中异常激活的细胞间信号通路及其特定的癌干细胞亚群体的作用 | 只分析了少量病例，且未深入探讨信号通路的具体机制 | 研究透明细胞肾细胞癌发展相关的细胞间信号传导 | 6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本 | 数字病理学 | 透明细胞肾细胞癌 | scRNA-seq | NA | NA | 6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 933 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals heterogeneous features of myeloid-derived suppressor cells in newborns
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1367230
PMID:38919617
|
研究论文 | 本研究揭示了新生儿骨髓源抑制细胞的异质性特征和成熟轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序明确了新生儿多形核骨髓源抑制细胞的分化阶段 | 尚未深入探讨新生儿MDSCs在免疫系统中的具体功能和机制 | 探讨新生儿骨髓源抑制细胞的组成及功能异质性 | 新生儿外周血中的多形核骨髓源抑制细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 新生儿的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 934 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Transcriptome of the Human Endometrium Reveals Epithelial Characterizations Associated with Recurrent Implantation Failure
2024-01, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300110
PMID:37690851
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序揭示了与反复植入失败（RIF）相关的子宫内膜上皮特征 | 首次表明RIF患者子宫内膜腺体中MAP2K6 EPCAM上皮细胞替代腺上皮细胞，并表明RIF患者衍生的腺体类器官对性激素反应减弱 | 研究样本量较小，仅包括3名RIF患者，可能影响结果的普适性 | 探讨反复植入失败患者中子宫内膜的细胞和分子机制 | 研究对象为3名反复植入失败患者的子宫内膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 3名反复植入失败患者，分析25,315个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 935 | 2024-08-05 |
T cell-related ubiquitination genes as prognostic indicators in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1424752
PMID:38919610
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于T细胞相关泛素化基因的HCC预后风险评分 | 提出了一种新的预后和免疫治疗效果预测指标，基于T细胞相关泛素化基因 | 未提及具体的限制 | 为肝细胞癌患者设计新的预后评估工具 | 肝细胞癌患者的T细胞相关泛素化基因 | 数字病理 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 风险评分模型 | RNA数据 | 3050个T细胞标记基因，结合TCGA的临床数据 | NA | NA | NA | NA |
| 936 | 2024-08-04 |
CellsFromSpace: a fast, accurate, and reference-free tool to deconvolve and annotate spatially distributed omics data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae081
PMID:38915885
|
研究论文 | 提出了一种名为CellsFromSpace的新分析框架，用于分析空间转录组数据 | CellsFromSpace无需依赖单细胞参考数据集，通过独立成分分析(ICA)有效分析多种技术的空间转录组数据 | 尚未提及具体的局限性 | 旨在提高空间转录组学数据的分析准确性和效率 | 空间转录组学数据和不同类型细胞的分析 | 数字病理学 | NA | 独立成分分析(ICA) | NA | 空间转录组数据 | 使用真实样本进行验证，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 937 | 2024-08-04 |
DDIT3 is associated with breast cancer prognosis and immune microenvironment: an integrative bioinformatic and immunohistochemical analysis
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96491
PMID:38911383
|
研究论文 | 本研究探讨了DDIT3在乳腺癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 采用新型多组学整合策略，揭示DDIT3与乳腺癌差预后的关联及其在肿瘤微环境中的空间表达模式 | 尚未明确DDIT3在乳腺癌进展中的具体作用 | 研究DDIT3在乳腺癌中的作用及其在免疫微环境中的角色 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的DDIT3表现 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序、单细胞测序、空间转录组学、免疫组化 | NA | NA | 涉及乳腺癌患者多组学数据 | NA | NA | NA | NA |
| 938 | 2024-08-04 |
Spatial and Single-Cell Investigations Illuminate Theragnostic value and Immune Landscape of Mitochondrial Dynamin-Like GTPase in Breast Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96100
PMID:38911373
|
研究论文 | 本研究探讨了线粒体动态蛋白OPA1/3在乳腺癌中的治疗诊断价值及其免疫微环境 | 揭示了OPA1/3在乳腺癌肿瘤发生和进展中的复杂角色及其作为潜在生物标志物的价值 | 未提及具体的实验设计与样本处理的局限性 | 研究OPA1/3在乳腺癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 乳腺癌中线粒体蛋白OPA1/3的表达和功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、药物基因组学 | NA | 数据集、临床样本 | 涉及来自多个数据库的乳腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 939 | 2024-08-04 |
Experimental Validation and Multi-omics Analysis Identified ARPC1A as a Novel Oncogene and Potential Therapeutic Target in Glioblastoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94552
PMID:38911374
|
研究论文 | 这项研究探讨了ARPC1A在胶质母细胞瘤中的生物学作用及其作为新的肿瘤基因和潜在治疗靶点的可能性 | 确立了ARPC1A在多种癌症中的预后价值并揭示其在胶质母细胞瘤耐药性中的调节机制 | 文章未详细探讨ARPC1A在其他癌症中的作用机制 | 研究ARPC1A在胼胶质瘤和其他多种癌症中的作用及机制 | 研究对象为ARPC1A在多种癌症中的表达、突变及其免疫微环境作用 | 数字病理 | NA | 基因组分析，基因集富集分析(GSEA)，单细胞测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 在多种癌症组织中分析了ARPC1A的表达与突变 | NA | NA | NA | NA |
| 940 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of the clinical significance and molecular mechanism of T-box transcription factor 3 in osteosarcoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96168
PMID:38911382
|
研究论文 | 该文章研究了TBX3在骨肉瘤中的临床意义和分子机制 | 文章首次揭示TBX3在骨肉瘤进展中的潜在作用及其作为生物标志物的可能性 | 研究采用的数据来自微阵列和RNA-seq，可能存在数据偏差的风险 | 研究TBX3在骨肉瘤中的作用及其临床重要性 | 重点研究TBX3在不同骨肉瘤阶段的表达以及与疾病进展的关系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |