单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1387 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2024-08-04 |
Challenges and Opportunities for the Clinical Translation of Spatial Transcriptomics Technologies
2024 Jan-Dec, Glomerular diseases
DOI:10.1159/000538344
PMID:38600956
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综述 | 本文讨论了空间转录组学技术的临床转化的挑战和机遇。 | 探讨了GeoMx和Visium平台在肾脏疾病研究中的新见解。 | NA | 阐明肾脏疾病的病理生理学并开发新的诊断测试。 | 主要集中在跟踪空间上解析的基因和蛋白质表达数据。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因和蛋白质表达数据 | NA |
| 922 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq reveals T cell exhaustion and immune response landscape in osteosarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1362970
PMID:38629071
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研究论文 | 本文研究了骨肉瘤中T细胞耗竭及免疫反应的全景。 | 本文提出了一种基于T细胞耗竭相关基因的预后模型，并揭示了CD8+ T细胞在骨肉瘤微环境中的不同耗竭情况。 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，可能存在样本选择偏倚。 | 探讨T细胞耗竭在骨肉瘤免疫治疗和进展中的作用。 | 研究对象为骨肉瘤中的CD8+ T细胞及其亚群。 | 数字病理 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 使用了GEO数据库中的单细胞RNA-seq数据，具体样本量未说明。 |
| 923 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to construct liver hepatocellular carcinoma stem cell signatures to explore their impact on patient prognosis and treatment
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298004
PMID:38635528
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研究论文 | 本研究整合了单细胞RNA测序和整体RNA测序，以构建肝细胞癌干细胞特征，并探讨其对患者预后和治疗的影响 | 开发了一种与癌症干细胞相关的预后风险特征，为肝细胞癌的诊断、预后和治疗提供了新的思路 | 尚未提及具体的限制 | 探讨干细胞特征与肝细胞癌患者预后及治疗之间的关系 | 肝细胞癌患者的干细胞特征及其相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，整体RNA转录组数据 | 风险模型 | 基因组数据 | NA |
| 924 | 2024-08-07 |
CD177 drives the transendothelial migration of Treg cells enriched in human colorectal cancer
2024, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1506
PMID:38596253
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研究论文 | 本研究探讨了CD177在人结直肠癌中浸润调节性T细胞（Treg细胞）中的表达模式及其对Treg细胞迁移能力的影响 | 发现CD177高表达的Treg细胞具有更强的激活状态和跨内皮迁移能力，为免疫治疗提供了新的潜在靶点 | 研究仅限于体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 旨在识别增强免疫治疗效果的潜在靶点 | 结直肠癌患者的肿瘤组织、瘤周组织和外周血单个核细胞中的Treg细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术 | NA | RNA序列数据、生存数据 | 21例结直肠癌患者样本 |
| 925 | 2024-08-07 |
Deconvolution of synovial myeloid cell subsets across pathotypes and role of COL3A1+ macrophages in rheumatoid arthritis remission
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1307748
PMID:38601143
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和去卷积分析，探讨了不同病理类型下关节滑膜单核/巨噬细胞（Mo/Mp）亚群的分布及其在类风湿关节炎（RA）缓解中的作用 | 首次报道了COL3A1+巨噬细胞在不同病理类型RA中的分布及其可能的免疫调节功能 | NA | 研究不同病理类型下关节滑膜单核/巨噬细胞亚群的分布及其在类风湿关节炎活动和缓解中的作用 | 关节滑膜单核/巨噬细胞亚群及其在类风湿关节炎中的作用 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 去卷积分析, 多色免疫荧光, 流式细胞术 | NA | RNA-seq数据 | 81名早期关节炎队列（PEAC）患者 |
| 926 | 2024-08-07 |
Elucidating the changes in the heterogeneity and function of radiation-induced cardiac macrophages using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363278
PMID:38601160
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了辐射诱导的心脏损伤小鼠模型中，心脏巨噬细胞异质性和功能的早期变化 | 首次在辐射诱导的心脏损伤动物模型中，描述了早期阶段巨噬细胞的多样性、特征及其演变 | NA | 研究辐射诱导心脏损伤后心脏功能的早期变化及心脏巨噬细胞在此过程中的作用 | 辐射诱导心脏损伤的小鼠模型中的心脏巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自心脏组织的免疫细胞 |
| 927 | 2024-08-07 |
Advancing diabetes treatment: the role of mesenchymal stem cells in islet transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1389134
PMID:38605972
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综述 | 本文综述了间充质干细胞（MSCs）在胰岛移植治疗糖尿病中的作用 | 利用MSCs的免疫调节特性和分化潜能，以及MSC衍生的细胞外囊泡等创新方法，来提高胰岛移植的效果 | MSCs的异质性和治疗应用的优化仍存在挑战 | 探讨MSCs在提高胰岛移植疗效中的作用，并评估其在糖尿病治疗中的潜力 | 间充质干细胞（MSCs）及其在胰岛移植中的应用 | 再生医学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 928 | 2024-08-07 |
Unraveling the tumor immune microenvironment of lung adenocarcinoma using single-cell RNA sequencing
2024, Therapeutic advances in medical oncology
IF:4.3Q2
DOI:10.1177/17588359231210274
PMID:38606165
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综述 | 本文系统回顾了使用单细胞RNA测序技术在肺腺癌中研究肿瘤免疫微环境的最新进展 | 总结了肿瘤免疫微环境的异质性及其在患者预后和治疗反应中的相关标记物或模型 | NA | 探讨肿瘤免疫微环境在肺腺癌发展和治疗中的作用 | 肺腺癌的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 929 | 2024-08-07 |
Amino acid transporter SLC7A5 regulates cell proliferation and secretary cell differentiation and distribution in the mouse intestine
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.94297
PMID:38617535
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研究论文 | 本文研究了氨基酸转运蛋白SLC7A5在小鼠肠道中的作用，发现其影响细胞增殖和分泌细胞的分化与分布 | 首次报道了肠道上皮细胞特异性敲除氨基酸转运蛋白SLC7A5，并揭示了其对mTORC1信号通路的影响 | NA | 探讨SLC7A5在肠道上皮细胞增殖和分泌细胞分化中的作用 | 小鼠肠道上皮细胞和分泌细胞 | 生物学 | NA | scRNA-seq, 电子显微镜 | NA | 细胞 | 小鼠肠道隐窝细胞 |
| 930 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals that GPRC5A is an important prognostic gene in pancreatic cancer and is associated with B-cell Infiltration in pancreatic cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1283164
PMID:38634049
|
研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，揭示了GPRC5A作为胰腺癌的重要预后基因，并与B细胞浸润相关 | 首次综合利用scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，构建了多因素Cox预后模型，并验证了GPRC5A与B细胞浸润及患者预后的关联 | NA | 确定影响胰腺癌预后的相关基因，并研究其与免疫浸润的关系 | 胰腺癌的预后基因及免疫浸润 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq），实时荧光定量PCR（RT-PCR） | Cox回归分析，Lasso回归分析 | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的胰腺癌单细胞芯片数据和TCGA的临床数据 |
| 931 | 2024-08-07 |
Noncanonical TRAIL Signaling Promotes Myeloid-Derived Suppressor Cell Abundance and Tumor Growth in Cholangiocarcinoma
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.006
PMID:38219900
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研究论文 | 本研究探讨了非经典TRAIL信号在胆管癌中促进骨髓来源抑制细胞（MDSCs）丰度和肿瘤生长的机制。 | 发现非经典TRAIL信号通过激活核因子-κB促进MDSCs的增殖，并揭示了MDSCs对TRAIL介导的凋亡的抵抗机制。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 旨在阐明TRAIL+癌细胞如何利用非经典TRAIL信号在骨髓来源抑制细胞（MDSCs）中促进其丰度，从而影响胆管癌的发展。 | 研究对象包括TRAIL信号、骨髓来源抑制细胞（MDSCs）以及胆管癌。 | 肿瘤学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序和细胞转录组及表位的测序 | NA | RNA | 使用了多个免疫健全的同基因、原位胆管癌模型的小鼠肿瘤样本 |
| 932 | 2024-08-07 |
Telocytes in the Luminal GI Tract
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.002
PMID:38342300
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综述 | 本文综述了间质细胞（telocytes）在胃肠道腔内的作用及其在干细胞微环境中的角色 | 探讨了间质细胞通过其长细胞质突起与其他细胞类型连接，形成三维网络，并在肠道中作为干细胞微环境的关键组成部分，提供Wnt蛋白促进干细胞和祖细胞增殖 | 单细胞RNA测序分析揭示了其他基质群体和微环境组织机制，对间质细胞在干细胞微环境中的作用提出了疑问 | 探讨间质细胞在胃肠道腔内的当前研究状态、存在的争议及未来研究方向 | 间质细胞在胃肠道腔内的作用及其在干细胞微环境中的角色 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 933 | 2024-08-04 |
Decoding the gene regulatory network of endosperm differentiation in maize
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44369-7
PMID:38167709
|
研究论文 | 本研究分析了玉米胚乳分化过程中的基因调控网络 | 首次利用单细胞转录组技术解剖玉米胚乳的基因调控网络 | 本研究仅关注于玉米的胚乳，不一定适用于其他作物的研究 | 揭示玉米胚乳发育过程中的基因调控机制 | 发育中的玉米胚乳，分析细胞分化的转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | 17,022个单细胞 |
| 934 | 2024-08-04 |
Integrative single-cell characterization of a frugivorous and an insectivorous bat kidney and pancreas
2024-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44186-y
PMID:38195585
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研究论文 | 该文章研究了蝙蝠的肾脏和胰腺的细胞和分子特点 | 通过整合的单细胞测序揭示水果食性和昆虫食性蝙蝠在细胞群体、基因表达和调控元素上的关键差异 | 主要研究限于特定的水果蝙蝠和昆虫蝙蝠，可能无法完全代表其他物种 | 探究水果食性蝙蝠及其与人类疾病的关系 | 水果蝙蝠（如牙买加水果蝙蝠）和昆虫蝙蝠（如大棕蝙蝠） | NA | 糖尿病 | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 细胞 | NA |
| 935 | 2024-08-04 |
Molecular features of luminal breast cancer defined through spatial and single-cell transcriptomics
2024-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1548
PMID:38282415
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学和单细胞RNA测序分析了ER+乳腺癌中的细胞群体特征 | 研究揭示了ER+乳腺癌中四个空间上不同的细胞区室及其功能多样性 | 研究的结果需在更大样本中进行验证以确保普遍适用性 | 探讨ER+乳腺癌中细胞空间异质性及其对激素依赖性肿瘤生长的重要性 | 使用来自患者的异种移植模型(PDXs)进行分析 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 两个ER高的PDX模型和一个ER低的PDX模型 |
| 936 | 2024-08-04 |
Digital spatial profiling of segmental outflow regions in trabecular meshwork reveals a role for ADAM15
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298802
PMID:38394161
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研究论文 | 本研究采用空间转录组学方法识别与小梁网中的高或低排出区域相关的基因 | 研究发现ADAM15及其他基因在不同排出区域的表达有显著差异，揭示了新的与排出段流动相关的基因 | 研究主要集中于人类前房段的体外培养，可能在体内情况中存在差异 | 研究小梁网中影响房水排出区域基因的表达 | 高和低排出区域的基因表达 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 组织切片 | 人类前房段的组织样本 |
| 937 | 2024-08-07 |
Preparation of Healthy Single Neuron or Astrocyte Suspension from Adult Mouse Brain for RNA-seq
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3810-1_29
PMID:38630243
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研究论文 | 本文描述了优化脑切片蛋白酶消化方法，以从成年大脑中获得数百万健康细胞用于单细胞RNA测序 | 本文提出了一种优化蛋白酶消化脑切片的方法，提高了从成年大脑中获取健康单个神经细胞的效率 | NA | 研究单细胞RNA测序在神经科学中的应用 | 成年小鼠大脑中的单个神经元或星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数百万个细胞 |
| 938 | 2024-08-04 |
Deciphering the molecular landscape: integrating single-cell transcriptomics to unravel myofibroblast dynamics and therapeutic targets in clear cell renal cell carcinomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374931
PMID:38562930
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研究论文 | 该文章探讨了在透明细胞肾细胞癌中，单细胞转录组学揭示的肌成纤维细胞动态及治疗靶点 | 首次利用单细胞转录组分析深入探讨肌成纤维细胞与肿瘤细胞的相互作用和信号通路 | 目前缺乏对其他细胞类型相互作用的详细分析 | 揭示透明细胞肾细胞癌中肌成纤维细胞的动态及其作为治疗靶点的潜力 | 透明细胞肾细胞癌中的肌成纤维细胞亚群及其与肿瘤的相互作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组分析 | NA | RNA-seq | ccRCC人群中涉及大量样本 |
| 939 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing analysis and multiple machine-learning models revealed the cellular crosstalk of dendritic cells and identified FABP5 and KLRB1 as novel biomarkers for psoriasis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374763
PMID:38596682
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研究论文 | 本研究分析了树突状细胞与T细胞在牛皮癣中的相互作用，并确定FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 | 揭示了FABP5和KLRB1在牛皮癣发病机制中的新角色，并提出了它们作为潜在生物标志物的可能性 | 研究可能受到样本数量或样本多样性的限制 | 识别牛皮癣的关键生物标志物并阐明其发病机制 | 研究对象为牛皮癣患者的皮肤组织和相关细胞 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 单细胞测序、机器学习 | NA | 多层次数据 | 牛皮癣皮肤组织样本和M5诱导的HaCaT细胞 |
| 940 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals SERPINE1-expressing CAFs remodelling tumour microenvironment in recurrent osteosarcoma
2024-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1527
PMID:38193644
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |