单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1387 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2024-08-05 |
Alteration of Thyroid Hormones in Mouse Models of Alzheimer's Disease and Aging
2024, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000536089
PMID:38228117
|
研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病和衰老小鼠模型中甲状腺激素的变化 | 本研究首次揭示了免疫细胞浸润与甲状腺激素变化之间的潜在机制 | 研究仅限于小鼠模型，临床应用需要进一步验证 | 探讨甲状腺激素与阿尔茨海默病及衰老之间的关系 | FAD4T小鼠模型和自然衰老小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | FAD4T小鼠和自然衰老小鼠的甲状腺样本 |
| 902 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals a pathogenic role of cytotoxic CD4+ T cells in giant cell arteritis
2024-01, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103124
PMID:37952293
|
研究论文 | 本研究揭示了细胞毒性CD4+ T细胞在巨细胞动脉炎中的致病作用 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体谱分析深入探讨了CD4 T细胞在巨细胞动脉炎中的作用 | 研究可能受到样本大小限制，仅包括八名巨细胞动脉炎患者和八名健康对照 | 进一步阐明CD4 T细胞在巨细胞动脉炎中的角色 | 114,799个循环CD4 T细胞来源于活动性和缓解期的巨细胞动脉炎患者与健康对照 | 数字病理学 | 巨细胞动脉炎 | 单细胞RNA测序和T细胞受体谱分析 | NA | 细胞数据 | 114,799个CD4 T细胞，来自8名巨细胞动脉炎患者和8名健康对照 |
| 903 | 2024-08-05 |
Predicting mitophagy-related genes and unveiling liver endothelial cell heterogeneity in hepatic ischemia-reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1370647
PMID:38694511
|
研究论文 | 本研究探讨了线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的作用 | 该研究识别了8个关键基因并建立了基于这些基因的诊断模型，揭示了内皮细胞的异质性 | 研究仅基于有限的样本和单细胞数据分析，可能需要更广泛的验证 | 探究线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的重要性 | 研究对象包括44个肝脏缺血再灌注损伤样本及44个正常对照样本 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 44个肝脏缺血再灌注损伤样本和44个正常对照样本 |
| 904 | 2024-08-05 |
The bone marrow of mouse-rat chimeras contains progenitors of multiple pulmonary cell lineages
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1394098
PMID:38694819
|
研究论文 | 本研究使用小鼠-大鼠嵌合体以增强骨髓中的呼吸道前体细胞，以研究其在放射性肺损伤后的贡献 | 使用小鼠-大鼠嵌合体创造了一个独特的骨髓细胞移植模型，能够提供多种呼吸道细胞类型的前体 | 研究主要集中在小鼠模型中，尚未在临床转化中验证其有效性 | 探讨小鼠-大鼠嵌合体中骨髓细胞对放射性肺损伤的修复作用 | 小鼠-大鼠嵌合体的骨髓细胞及其对放射性肺损伤小鼠的贡献 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 造模用小鼠-大鼠嵌合体的骨髓细胞和致死性放射照射小鼠 |
| 905 | 2024-08-04 |
Miracula polaris - A New Species of Miracula from the East Fjords of Iceland
2024, Mycobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/12298093.2024.2333611
PMID:38690034
|
research paper | 本研究在冰岛东峡湾发现了一种新物种Miracula polaris。 | 发现了新的寄生生物Miracula polaris，扩展了对早分支卵菌类多样性的理解。 | 研究未深入探讨与已知物种之间的关联性，可能存在未知物种。 | 调查冰岛东峡湾的早分支卵菌类的多样性。 | 研究了寄生在海洋硅藻属中的新寄生物种。 | NA | NA | 分子系统发育学和形态特征分析 | NA | 环境测序数据 | 在冰岛东峡湾的研究站进行了取样，具体样本数量未说明 |
| 906 | 2024-08-05 |
Coupled scRNA-seq and Bulk-seq reveal the role of HMMR in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363834
PMID:38633247
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研究论文 | 本研究揭示了HMMR在肝细胞癌中的作用，强调其作为诊断和治疗标志物的潜力 | 首次表明HMMR在肝细胞癌中的高表达与肿瘤免疫微环境和预后相关 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，临床应用尚需进一步验证 | 探讨HMMR在肝细胞癌中的角色及其作为潜在分子标志物的可行性 | HMMR在肝细胞癌组织与正常组织的表达及其对HCC细胞增殖和迁移的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | qRT-PCR, 流式细胞术, 递归分割分析, 体外实验 | NA | RNA测序 | 多个队列研究和HCC组织微阵列 |
| 907 | 2024-08-05 |
PAGER-scFGA: unveiling cell functions and molecular mechanisms in cell trajectories through single-cell functional genomics analysis
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1336135
PMID:38690527
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞功能基因组分析的新工具 PAGER-scFGA，旨在揭示细胞功能和分子机制。 | PAGER-scFGA 将细胞功能注释和基因集富集分析整合到流行的单细胞分析流程中，以提供细胞轨迹的深入理解。 | 尽管 PAGER-scFGA 在揭示细胞发育过程中的功能上表现出色，但可能存在样本特异性和模型可扩展性的局限性。 | 本研究的目的是开发一个工具以支持单细胞功能基因组学分析，揭示细胞运动轨迹中的分子机制。 | 研究对象为小鼠自然杀伤细胞及其成熟过程中的不同细胞群体。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠自然杀伤细胞的不同细胞簇 |
| 908 | 2024-08-05 |
Role of proteoglycan synthesis genes in osteosarcoma stem cells
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1325794
PMID:38690160
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研究论文 | 本研究探讨了蛋白多糖合成基因在骨肉瘤干细胞中的作用 | 揭示了蛋白多糖和糖胺聚糖在骨肉瘤干细胞表型及肿瘤恶性程度中的关键作用 | 对蛋白多糖合成机制的了解依然有限 | 研究蛋白多糖/糖胺聚糖生物合成及相关基因在骨肉瘤中的作用 | 骨肉瘤干细胞及其相关临床样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq和传统RNA-seq | NA | 临床样本的基因表达数据 | 临床骨肉瘤标本的多个样本 |
| 909 | 2024-08-04 |
Galectin-3 aggravates microglial activation and tau transmission in tauopathy
2024-Jan-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI165523
PMID:37988169
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研究论文 | 本文研究了Galectin-3在tau病中的作用，发现其加剧了小胶质细胞的活化和tau的传递 | 这篇文章揭示了Galectin-3在tau病中的新作用及其作为潜在治疗靶点的可能性 | 研究主要集中在小鼠模型和人类细胞，可能存在模型的局限性 | 探讨Galectin-3在tau病中的角色及其机制 | 小胶质细胞、超磷酸化tau和tau病小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | THY-Tau22小鼠模型 | 细胞和分子数据 | 纳入人类和小鼠的小胶质细胞样本 |
| 910 | 2024-08-04 |
scRNA-seq characterizing the heterogeneity of fibroblasts in breast cancer reveals a novel subtype SFRP4+ CAF that inhibits migration and predicts prognosis
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1348299
PMID:38686196
|
研究论文 | 本文研究了乳腺癌中癌相关成纤维细胞的异质性，并首次发现了一种新的SFRP4+ CAF亚型，抑制迁移并预测预后 | 首次鉴定了SFRP4+ CAF亚型，主要存在于正常组织中，并发现其对乳腺癌细胞迁移具有抑制作用 | 尽管发现了新的CAF亚型，但其功能机制和临床应用仍需进一步研究 | 旨在全面了解乳腺癌中癌相关成纤维细胞的特征和作用 | 研究对象为14个乳腺癌正常-肿瘤配对样本中的CAF | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 样本 | 14个乳腺癌正常-肿瘤配对样本 |
| 911 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing and ATAC sequencing identify novel biomarkers for bicuspid aortic valve-associated thoracic aortic aneurysm
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1265378
PMID:38685981
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序和ATAC测序识别与二尖瓣主动脉和胸主动脉瘤相关的新生物标志物 | 首次系统性评估了二尖瓣主动脉与胸主动脉瘤相关组织的细胞组成，并识别了不同表达基因 | 样本量较小，仅来自两名BAV患者和两名心脏移植供体 | 提高对二尖瓣主动脉病因学的理解 | 二尖瓣主动脉和胸主动脉瘤相关的组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，ATAC测序 | NA | 组织样本 | 4个样本（2名BAV患者和2名心脏移植供体） |
| 912 | 2024-08-05 |
A Novel Four-Gene Signature Based on Nonsense-Mediated RNA Decay for Predicting Prognosis in Hepatocellular Carcinoma: Bioinformatics Analysis and Functional Validation
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S450711
PMID:38680213
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研究论文 | 本文提出了一种基于无义介导的RNA降解(NMD)的四基因风险模型，用于预测肝细胞癌的预后 | 创新的NMD风险模型通过四个NMD相关基因有效区分肝细胞癌的高低风险组 | 尚未提及具体的临床试验数据来进一步支持模型的临床适用性 | 研究NMD在肝细胞癌预后方面的潜力 | 374个肝细胞癌样本和50个正常肝样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | LASSO-Cox回归 | 无 | 基因表达数据 | 374个肝细胞癌样本和50个正常肝样本 |
| 913 | 2024-08-04 |
Gene Expression Patterns in the Ctenophore Pleurobrachia bachei: In Situ Hybridization
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_9
PMID:38668969
|
研究论文 | 本研究提出了一种用于观察海洋无脊椎动物Pleurobrachia bachei的基因表达模式的原位杂交方法 | 提供了适用于高度脆弱的动物的原位杂交协议，并展示了细胞表型标记的表达模式 | 对脆弱动物的应用具有挑战性，可能限制了方法的通用性 | 研究Ctenophora类动物的基因表达模式 | 成年Pleurobrachia bachei | 数字病理学 | NA | 原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 成年Pleurobrachia bachei的样本 |
| 914 | 2024-08-04 |
Analysis and Visualization of Single-Cell Sequencing Data with Scanpy and MetaCell: A Tutorial
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_17
PMID:38668977
|
教程 | 本章节提供了对单细胞RNA测序数据分析流程的概述和实践指南 | 提出了使用Scanpy和MetaCell的实用指南，以及对主要分析步骤和数据可视化的最佳实践的比较 | 尚未充分代表用户在使用scRNA-seq分析中所需的实用指南 | 旨在为单细胞RNA测序的数据分析提供系统性的方法和实用指南 | 以单细胞RNA测序数据为研究对象，分析生物样本的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 使用了来自栅鳗鱼的scRNA-seq数据集，相应样本大小未具体说明 |
| 915 | 2024-08-05 |
hsa-miR-34a-5p enhances temozolomide anti-tumoral effects on glioblastoma: in-silico and in-vitro study
2024, EXCLI journal
IF:3.8Q1
DOI:10.17179/excli2023-6404
PMID:38655096
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研究论文 | 本研究探讨了hsa-miR-34a-5p及其与替莫唑胺组合对胶质母细胞瘤的影响及相关分子机制 | 本研究验证了hsa-miR-34a-5p在增强替莫唑胺抗肿瘤效应中的作用，并揭示了其通过MAPK通路的机制 | 研究未提及样本的临床前验证和长期效果 | 研究hsa-miR-34a-5p及其与替莫唑胺组合在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤效果 | 胶质母细胞瘤细胞系A172及TCGA-GTEx, CGGA等多个数据集 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | qRT-PCR, MTT, 流式细胞术, 克隆形成实验, Annexin V/PI分析 | NA | RNA测序 | 使用了多个数据集及A172细胞系进行分析 |
| 916 | 2024-08-05 |
Investigating the Cell Origin and Liver Metastasis Factors of Colorectal Cancer by Single-Cell Transcriptome Analysis
2024, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S454295
PMID:38644955
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了结直肠癌肝转移的细胞来源和驱动因素 | 本研究首次利用单细胞分析中发现了与肝转移相关的上皮细胞，并建立了LM指数预测肝转移风险 | 本研究的功能实验仅在体外进行，尚未在体内验证 | 研究结直肠癌肝转移风险相关的细胞来源和生物标志物 | 结直肠癌患者特别是高风险肝转移的患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 917 | 2024-08-05 |
Identification of tumor heterogeneity associated with KRAS/TP53 co-mutation status in lung adenocarcinoma based on single-cell RNA sequencing
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38455404
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序研究KRAS/TP53共突变状态对肺腺癌的影响 | 提出了一种包含七个预后基因的新预测风险模型，并通过LASSO回归验证其预测能力 | NA | 探讨KRAS/TP53共突变状态对肺腺癌肿瘤微环境的影响 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 918 | 2024-08-05 |
Single-cell type annotation with deep learning in 265 cell types for humans
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae054
PMID:38645719
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研究论文 | 本文开发了一个基于深度学习的单细胞类型预测工具，能够为人类的265种不同细胞类型赋予类型标签 | 该工具首先通过对约五百万个细胞的数据进行处理，并利用细胞本体校正注释，从而显著提高了模型的准确性 | 目前数据库中的不一致标记影响了模型的准确性，并且依赖于现有数据库的注释限制了未来的应用 | 旨在通过深度学习工具提高单细胞RNA测序数据的细胞类型注释准确性 | 研究对象为265种不同的人类细胞类型 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | RNA测序数据 | 约五百万个细胞 |
| 919 | 2024-08-05 |
The functional role of L-fucose on dendritic cell function and polarization
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1353570
PMID:38646527
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研究论文 | 本文报告了饮食糖L-岩藻糖对树突细胞功能和极化的影响 | 提供了L-岩藻糖增强树突细胞功能的新机制，首次证明其能提高抗肿瘤免疫反应 | 研究中未提及样本规模或长期效果评估 | 探讨如何利用L-岩藻糖提升树突细胞的功能以增强免疫治疗 | 研究了L-岩藻糖对树突细胞的极化和免疫刺激活性的影响 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞和分子数据 | 小鼠模型中的肿瘤浸润树突细胞 |
| 920 | 2024-08-04 |
A case report of a family with developmental arrest of human prokaryotic stage zygote
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1280797
PMID:38606321
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病例报告 | 研究了一对父母及其子女的遗传变异，导致其在受精过程中出现PN停滞现象 | 首次揭示了与人类PN期合子停滞相关的遗传变异及其机制 | 研究样本仅限于一家人，可能无法代表更广泛的群体 | 探讨导致PN期合子停滞表型的遗传变异 | 研究对象为一对出现多次PN停滞的夫妇及其后代 | 数字病理学 | 女性不育 | 全外显子测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据和转录组数据 | 2名个体的外周血样本及3个PN停滞合子 |