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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2024-08-05 |
Panoramic analysis of cell death patterns reveals prognostic and immune profiles of head and neck squamous cell carcinoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/PMDA6193
PMID:38859838
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞死亡模式在头颈部鳞状细胞癌中的预测作用和免疫特征 | 提出了细胞死亡指数(CDI)签名作为预测头颈部鳞状细胞癌预后的生物标志物,且发现CAAP1缺失可增强抗肿瘤免疫 | 目前缺乏关于头颈部鳞状细胞癌进展和治疗效果的可靠预测模型 | 探索细胞死亡模式在头颈部鳞状细胞癌中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本及其临床信息 | 数字病理学 | 头颈癌 | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 利用TCGA和GEO数据库的信息进行大规模转录组和单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA |
| 902 | 2024-08-05 |
LAYN Serves as a Prognostic Biomarker and Downregulates Tumor-Infiltrating CD8+ T Cell Function in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S464806
PMID:38859944
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研究论文 | LAYN在肝细胞癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次探讨了LAYN在肝细胞癌中与CD8+ T细胞功能障碍及临床预后之间的关系 | 尚未在临床试验中验证LAYN的治疗潜力 | 研究LAYN在肝细胞癌中的免疫功能和预后意义 | 肝细胞癌患者的肿瘤样本和免疫细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | IF,IHC,ELISA,流式细胞术,mRNA-seq | NA | 肿瘤样本 | 在研究中涉及新鲜样本的检测 | NA | NA | NA | NA |
| 903 | 2024-08-05 |
Involvement of N4BP2L1, PLEKHA4, and BEGAIN genes in breast cancer and muscle cell development
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1295403
PMID:38859961
|
研究论文 | 本研究探讨了乳腺癌患者在胸大肌细胞中基因表达的变化 | 识别了三种之前未被表征的肿瘤抑制基因,并发现它们在乳腺肿瘤中的表达下调 | 样本量较小,仅涉及50名乳腺癌患者 | 探讨乳腺癌及其与肌肉发育相关的基因表达 | 主要研究对象是乳腺癌患者的正常肌肉细胞基因表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | RNA | 50名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 904 | 2024-08-05 |
Identification of a Prognostic Model Based on NK Cell-Related Genes in Multiple Myeloma Using Single-Cell and Transcriptomic Data Analysis
2024, Blood and lymphatic cancer : targets and therapy
DOI:10.2147/BLCTT.S461529
PMID:38854627
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研究论文 | 这项研究开发了一个基于NK细胞相关基因的预后模型,以评估多发性骨髓瘤患者的预后。 | 该研究首次利用单细胞和转录组数据分析提出了一种针对多发性骨髓瘤的新的预后模型。 | 样本量和特定临床特征的限制可能影响结果的普遍适用性。 | 研究NK细胞相关基因与多发性骨髓瘤临床因素的关系。 | 研究对象为健康供体和多发性骨髓瘤患者的外周血单核细胞中的NK细胞相关基因。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组数据分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA) | Cox回归模型和LASSO回归分析 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 905 | 2024-08-05 |
Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina
2024-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.24.577060
PMID:38328114
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研究论文 | 本文建立了小鼠视网膜的综合单细胞图谱 | 生成了迄今为止最大的视网膜单细胞RNA测序数据集,并整合了公共数据集以构建小鼠视网膜细胞图谱 | 样本可能局限于特定小鼠品系,可能无法代表全部生物学变异 | 建立小鼠视网膜的统一参考数据集 | C57BL/6J小鼠全视网膜中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 大约190,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 906 | 2024-08-05 |
A targeted CRISPR-Cas9 mediated F0 screen identifies genes involved in establishment of the enteric nervous system
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0303914
PMID:38809858
|
研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9介导的F0筛选,识别与肠神经系统建立相关的基因 | 提出了一种新颖且高效的CRISPR筛选方法,专注于肠神经系统的发展 | 该研究未详细探讨所识别基因的功能机制 | 旨在揭示参与肠神经系统建立的基因 | 主要研究对象为斑马鱼中的肠神经嵴细胞及其相关基因 | 数字病理学 | Hirschsprung病 | CRISPR-Cas9 | NA | 单细胞RNA测序 | 使用斑马鱼作为模型生物,具体样本数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 907 | 2024-08-05 |
CD4+ T cell heterogeneity in gestational age and preeclampsia using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1401738
PMID:38774869
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研究论文 | 本研究探讨了妊娠期和子痫前期中CD4+ T细胞的异质性。 | 文章首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体组分析揭示了妊娠年龄对决策性CD4 T细胞亚群的多样性和克隆性的重要性。 | 未提及具体的样本数量和方法的局限性。 | 研究CD4+ T细胞在妊娠期和子痫前期中的异质性及其对母胎耐受的影响。 | 决策性CD4 T细胞亚群及其在子痫前期中的表达变化。 | 数字病理学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 908 | 2024-08-04 |
Research progress in isolation and identification of rumen probiotics
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1411482
PMID:38836057
|
研究论文 | 本文综述了瘤胃益生菌的分离和鉴定的经典技术及其最新进展 | 介绍了基于微滴的高通量细胞培养和单细胞测序的新技术及其在微生物培养和鉴定中的应用 | 大部分潜在益生菌仍未被成功培养,限制了相关研究的深入 | 旨在提供技术参考以促进瘤胃微生物学领域的发展 | 主要针对瘤胃益生菌的分离和鉴定技术 | 数字病理学 | NA | 高通量培养、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 909 | 2024-08-05 |
Revealing molecular and cellular heterogeneity in hypopharyngeal carcinogenesis through single-cell RNA and TCR/BCR sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1310376
PMID:38720887
|
研究论文 | 本文揭示了在低级和高级上皮内瘤变到癌变过程中,头颈部肿瘤HSCC的分子和细胞异质性 | 通过单细胞RNA和TCR/BCR测序,首次构建了不同疾病阶段的细胞动态转录组图谱,并揭示了主要分子 | 尚未完全理解在肿瘤形成过程中TME内不同细胞簇的具体变化及其影响 | 探究HSCC发展过程中的肿瘤微环境动态变化及机制 | 对来自不同阶段的HSCC组织样本中的60854个细胞进行研究 | 数字病理学 | 喉下癌 | 单细胞RNA测序和TCR/BCR测序 | NA | 细胞 | 九个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 910 | 2024-08-05 |
Unraveling metabolic characteristics and clinical implications in gastric cancer through single-cell resolution analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1399679
PMID:38831933
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率分析揭示了胃癌的代谢特征及其临床意义 | 利用单细胞RNA测序技术,首次深入探讨了不同细胞类型在胃癌中的代谢路径和调控机制 | 研究的局限性未在摘要中提及 | 综合研究胃癌中不同细胞类型的代谢路径及其调控机制 | 胃癌肿瘤样本和正常样本中的各种细胞类型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 911 | 2024-08-04 |
A potential defensive role of TIM-3 on T lymphocytes in the inflammatory involvement of diabetic kidney disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1365226
PMID:38812511
|
研究论文 | 本研究探讨了TIM-3在糖尿病肾病中T淋巴细胞的潜在防御作用 | 提出了TIM-3在糖尿病肾病进展中的保护性作用,并基于CD3+TIM-3+ T细胞的监测建议识别高风险患者 | 尚未完全了解各种T淋巴细胞亚群在糖尿病肾病中的调节机制 | 研究糖尿病肾病中T淋巴细胞的免疫检查点分子的功能及其对疾病进展的影响 | 360名糖尿病肾病成人患者和DKD小鼠模型的肾脏样本 | 数字病理 | 糖尿病肾病 | 流式细胞术, 免疫荧光染色, 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 图像和基因数据 | 360个糖尿病肾病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 912 | 2024-08-04 |
Deciphering the role of CX3CL1-CX3CR1 in aortic aneurysm pathogenesis: insights from Mendelian randomization and transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1383607
PMID:38715600
|
研究论文 | 本研究探讨了CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤发病机制中的作用 | 通过孟德尔随机化和转录组分析揭示了CX3CL1-CX3CR1信号通路在主动脉瘤中的潜在致病性 | 未提供具体实验验证结果的详细信息 | 研究CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤中的致病机制 | 研究了91种循环炎症蛋白与主动脉瘤之间的因果关系 | 数字病理学 | 主动脉瘤 | 孟德尔随机化分析, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了731种免疫特征和91种循环炎症蛋白 | NA | NA | NA | NA |
| 913 | 2024-08-05 |
Comprehensive scRNA-seq Analysis and Identification of CD8_+T Cell Related Gene Markers for Predicting Prognosis and Drug Resistance of Hepatocellular Carcinoma
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究分析了CD8+T细胞亚型对肝细胞癌预后和药物耐受性的影响 | 开发了一个基于CD8+ T细胞异质性的12基因标志,用于预测肝细胞癌的生存结果和免疫治疗反应 | 未提及具体的局限性 | 研究CD8+ T细胞亚型对肝细胞癌的影响,以预测预后和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者的CD8+ T细胞亚型及其相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数据来自于多个数据库的患者信息 | NA | NA | NA | NA |
| 914 | 2024-08-04 |
Exploring the diversity of cancer-associated fibroblasts: insights into mechanisms of drug resistance
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1403122
PMID:38818409
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综述 | 本文综合分析了癌症相关成纤维细胞(CAFs)的多样性及其在药物耐药机制中的作用 | 研究整合了36项独立单细胞RNA测序研究的数据,深入探讨了CAFs的亚群体及其在不同肿瘤类型中的预后相关性和功能贡献 | 可能缺乏某些肿瘤类型的全面数据,且对CAFs的具体机制仍需进一步验证 | 揭示CAFs的多样性及其在化疗耐药中的作用 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)在17种不同的人类恶性肿瘤类型中的特征 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 36项独立单细胞RNA测序研究涉及的17种人类恶性肿瘤类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 915 | 2024-08-05 |
Exploring the role of innate immunity in Cholangiocarcinoma: implications for prognosis, immune infiltration, and tumor metastasis
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94194
PMID:38817870
|
研究论文 | 本研究探讨了先天免疫系统在胆道癌中的作用,特别是在预后、免疫浸润和肿瘤转移中的影响 | 阐明了先天免疫途径与胆道癌之间的关系,并提出其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 当前研究关于先天免疫途径与癌症之间相互作用的文献有限且效果不一致 | 揭示先天免疫途径在胆道癌中的作用及其影响因素 | 胆道癌患者的肿瘤组织和正常组织样本 | 数字病理学 | 胆道癌 | 生物信息学和数据分析 | 单细胞转录组分析 | 基因表达数据和蛋白质组数据 | 胆道癌患者的肿瘤组织切片和HPA数据库中的正常组织切片 | NA | NA | NA | NA |
| 916 | 2024-08-05 |
Deconvolution analysis identified altered hepatic cell landscape in primary sclerosing cholangitis and primary biliary cholangitis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1327973
PMID:38818402
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研究论文 | 本文通过去卷积分析揭示了原发性硬化性胆管炎和原发性胆汁性胆管炎中肝细胞的变化。 | 首次利用CIBERSORTx和自定义签名矩阵系统识别特定肝细胞型的组成,展示了肝细胞在疾病中的不同功能。 | 需要更多研究以阐明这些肝细胞表型在胆汁淤积性肝损伤中的角色。 | 探讨原发性硬化性胆管炎和原发性胆汁性胆管炎中肝细胞的组成及其功能。 | 研究对象为原发性硬化性胆管炎和原发性胆汁性胆管炎患者的肝组织样本。 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序和去卷积分析 | CIBERSORTx | 基因组数据 | 分析了来自PSC和PBC患者的肝组织的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 917 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial transcriptome sequencing uncover a platinum-resistant cluster overexpressed TACSTD2 in high-grade serous ovarian cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.95269
PMID:38817863
|
研究论文 | 本研究揭示了高恶性度浆液性卵巢癌中与铂耐药性相关的E0亚群及其TACSTD2的表达 | 首次识别出铂耐药性上调TACSTD2的上皮细胞亚群,探讨了其在铂耐药性机制中的作用 | 样本量较小,仅涉及6名患者,可能限制结果的普遍性 | 分析高恶性度浆液性卵巢癌中的耐药机制及潜在靶点 | 研究对象为3名铂敏感患者和3名铂耐药患者的肿瘤组织 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 918 | 2024-08-04 |
Non-coding genome contribution to ALS
2024, International review of neurobiology
DOI:10.1016/bs.irn.2024.04.002
PMID:38802183
|
研究论文 | 总结了非编码基因组在肌肉萎缩侧索硬化症(ALS)中的贡献 | 提出细胞特异性功能注释对于发现ALS相关遗传变异的重要性 | 缺乏针对大多数ALS患者的特定遗传驱动因素的理解 | 探索非编码基因组中的遗传风险变异对ALS的影响 | ALS患者的非编码基因组遗传变异 | 数字病理学 | 肌肉萎缩侧索硬化症 | 单细胞表观遗传学分析和空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 919 | 2024-08-04 |
Dynamic changes of immunocyte subpopulations in thermogenic activation of adipose tissues
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1375138
PMID:38812501
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研究论文 | 本研究探讨了不同冷暴露期间脂肪组织内免疫细胞的动态变化 | 识别了几种新的免疫细胞亚群,这些亚群可能有助于脂肪组织在冷暴露下的产热激活 | 研究主要集中在小鼠模型,可能不完全反映人类的情况 | 探讨冷暴露对热生成脂肪组织内免疫细胞的整体变化 | 不同冷暴露期间的热生成性脂肪组织中的免疫细胞 | NA | 代谢疾病 | 单细胞测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 定量实时PCR | NA | 免疫细胞数据 | 使用了两个不同类型的热生成性脂肪组织的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 920 | 2024-08-04 |
Dissecting Spatiotemporal Structures in Spatial Transcriptomics via Diffusion-Based Adversarial Learning
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0390
PMID:38812530
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研究论文 | 本文介绍了一种计算框架PearlST,用于准确推断空间转录组数据中的时空结构 | 提出了结合偏微分方程增强对抗图自编码器的新方法,显著提升从空间转录组数据中提取特征的能力 | 未知所涉及的具体技术限制和数据集限制 | 研究空间转录组数据中的时空结构推断 | 空间转录组数据及其相关生物学背景 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 对抗图自编码器 | Wasserstein对抗正则化图自编码器 | 空间转录组数据 | 多个不同分辨率的空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |