单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
901 2024-08-04
Signaling Pathway Alterations Driven by BRCA1 and BRCA2 Germline Mutations are Sufficient to Initiate Breast Tumorigenesis by the PIK3CAH1047R Oncogene
2024-01-05, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究生成了BRCA1和BRCA2突变携带者乳腺组织的单细胞转录组图谱,并与健康非携带者进行了比较 首次揭示了BRCA1和BRCA2突变对乳腺上皮细胞转录组的特定影响,并阐明了其与肿瘤发生的关系 本研究的样本仅限于BRCA1和BRCA2突变携带者,未能涵盖所有类型的乳腺癌变异 研究BRCA1和BRCA2突变在乳腺肿瘤发生中的信号通路改变 BRCA1和BRCA2突变携带者及健康非携带者的乳腺上皮细胞和间质细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞转录组学 NA 转录组数据 BRCA1和BRCA2突变携带者的乳腺组织样本与健康非携带者样本进行比较
902 2024-08-04
Spatial Distribution of Immune Cells Drives Resistance to Neoadjuvant Chemotherapy in Triple-Negative Breast Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学探讨三阴性乳腺癌中免疫细胞的空间分布对新辅助化疗的影响 研究通过空间转录组学的方法,更深入地理解了三阴性乳腺癌生态系统的复杂元素及其与新辅助化疗反应之间的关系 研究基于回顾性病例系列,样本量相对较小,仅包含24名患者 旨在探索三阴性乳腺癌对新辅助化疗反应的机制 涉及24名三阴性乳腺癌患者,其中12名患者经历了病理完全反应,12名患者则未反应或疾病进展 数字病理学 三阴性乳腺癌 空间转录组学 NA 转录组数据 24例三阴性乳腺癌患者
903 2024-08-07
Bexmarilimab Activates Human Tumor-Associated Macrophages to Support Adaptive Immune Responses in Interferon-Poor Immune Microenvironments
2024-01-03, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本文研究了bexmarilimab在干扰素贫乏的免疫微环境中激活人肿瘤相关巨噬细胞以支持适应性免疫反应的作用。 首次揭示了bexmarilimab在低基线干扰素信号的巨噬细胞中效果最佳,并阐明了其在免疫冷肿瘤中的应用潜力。 目前尚不清楚bexmarilimab在个体患者中治疗结果的机制。 探讨bexmarilimab在卵巢癌腹水巨噬细胞中的反应,并评估其在免疫冷肿瘤中的治疗效果。 卵巢癌腹水巨噬细胞及bexmarilimab的治疗效果。 免疫学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA RNA 具体样本数量未在摘要中提及
904 2024-08-07
Combination of Anti-PD-1 and Electroacupuncture Induces a Potent Antitumor Immune Response in Microsatellite-Stable Colorectal Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 研究电针(EA)与抗PD-1联合治疗在微卫星稳定(MSS)结直肠癌中的抗肿瘤效果 首次探讨了电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的应用,并发现这种联合疗法通过激活STING通路增强了肿瘤的免疫反应 研究主要在动物模型中进行,需要进一步的临床试验验证其安全性和有效性 探索电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的抗肿瘤效果及机制 微卫星稳定的结直肠癌 肿瘤学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA RNA 多个MSS结直肠癌小鼠模型
905 2024-08-04
BCG vaccination stimulates integrated organ immunity by feedback of the adaptive immune response to imprint prolonged innate antiviral resistance
2024-Jan, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究探讨了BCG疫苗如何通过适应性免疫反应反馈刺激整合的器官免疫。 展示了BCG疫苗通过CD4 T细胞在组织巨噬细胞和上皮细胞中的反馈作用,促进了持久的广泛先天抗病毒抵抗力。 仅在小鼠模型中进行,没有在人类实验中验证结果 揭示BCG疫苗对异源病原体的非特异性保护机制 BCG疫苗接种的小鼠 免疫学 呼吸道疾病 流式细胞术, 空间转录组学 小鼠模型 生物样本数据 小鼠数量不明确,但涉及多种病毒感染
906 2024-08-04
The exploration of mitochondrial-related features helps to reveal the prognosis and immunotherapy methods of colorectal cancer
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
研究论文 该文章探讨了线粒体相关特征如何揭示结直肠癌的预后和免疫疗法方法 文章通过线粒体相关基因风险评分构建预后模型,并与其他模型进行比较,展示了新的预后评估方法 该研究可能仅限于数据库中的数据,临床实用性需要进一步验证 研究结直肠癌中线粒体特征与肿瘤微环境及免疫景观的关系 使用非负矩阵分解(NMF)对结直肠癌患者数据进行亚组分析 数字病理学 结直肠癌 免疫组化和单细胞测序 风险评分模型 临床数据和基因数据 使用内外部队列的 CRC 患者数据进行广泛测试
907 2024-08-07
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing to analyze the heterogeneity of hepatocellular carcinoma and establish a prognostic model
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,分析肝细胞癌的异质性,并建立了一个预测模型 本研究首次结合单细胞和批量RNA测序数据,探讨了肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联,并开发了一个新的预测模型 NA 研究肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联 肝细胞癌的肿瘤细胞异质性 数字病理学 肝细胞癌 RNA测序 Cox比例风险模型 RNA测序数据 数据来自TCGA和GEO数据库,具体样本数量未提及
908 2024-08-07
The challenge of defining rare genetic programs by single-cell RNA sequencing: Insights from phloem studies
2024-01-01, Molecular plant IF:17.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
909 2024-08-04
Transcriptomics and Spatial Proteomics for Discovery and Validation of Missing Proteins in the Human Ovary
2024-01-05, Journal of proteome research IF:3.8Q1
研究论文 该研究通过转录组学和空间蛋白组学发现并验证了人类卵巢中缺失的蛋白质 首次识别并验证了14种在人类卵巢中缺失的蛋白质,提供了新的研究方向 样本数量有限,仅包含7到32岁之间的卵巢皮层样本 探索人类卵巢中缺失蛋白质的功能和角色 卵巢皮层中的卵母细胞和颗粒细胞 数字病理学 NA RNA-seq,高分辨率抗体基于蛋白质分析,单细胞转录组学 NA 转录组数据 四个新RNA-seq样本
910 2024-08-04
Research progress and application of single-cell sequencing in head and neck malignant tumors
2024-01, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
研究论文 本文系统介绍了单细胞测序在头颈部恶性肿瘤中的最新进展和应用 本文提出了单细胞测序在研究头颈部恶性肿瘤发病机制中的应用,提供了新视角 由于篇幅限制,可能未能详细覆盖所有相关研究进展 探讨单细胞测序在头颈部恶性肿瘤临床诊断和治疗中的应用 头颈部恶性肿瘤的单细胞基因组和转录组 数字病理学 头颈部恶性肿瘤 单细胞测序 NA 基因组和转录组数据 数千个细胞
911 2024-08-07
CILP is a potential pan-cancer marker: combined silico study and in vitro analyses
2024-01, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
研究论文 本研究主要探讨了CILP在肿瘤发生发展中的作用及其作为潜在泛癌标志物的可能性 首次系统研究了CILP在多种肿瘤中的表达及其对肿瘤发生和患者生存预后的影响,并通过细胞实验验证了CILP的功能 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,未来需要更多临床样本验证CILP的泛癌标志物作用 探索CILP在肿瘤中的作用及其作为泛癌标志物的潜力 CILP在不同肿瘤类型中的表达及其对肿瘤发生和患者生存预后的影响 NA 肿瘤 RNA测序 NA 单细胞数据 使用了来自UCSC Xena的泛癌数据和GSE152938的单细胞数据,以及人肾细胞癌ACHN和786-O细胞系进行实验验证
912 2024-08-05
Single-cell and spatial profiling identify three response trajectories to pembrolizumab and radiation therapy in triple negative breast cancer
2024-01-08, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和空间蛋白组学分析三阴性乳腺癌对pembrolizumab和放疗的反应轨迹 首次识别了三阴性乳腺癌患者对pembrolizumab和联合放疗的三种不同反应轨迹 该研究的样本主要集中于三阴性乳腺癌,可能不适用于其他类型的癌症 旨在改善对接受单一免疫疗法或需要额外治疗的患者的识别 三阴性乳腺癌活检样本,比较治疗前后的免疫微环境 数字病理学 三阴性乳腺癌 单细胞转录组学和空间蛋白组学 小鼠模型 生物样本 NA
913 2024-08-07
Neoadjuvant radioimmunotherapy synergy in triple-negative breast cancer: Is microenvironment-guided patient selection on the horizon?
2024-01-08, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 研究探讨了新辅助化疗联合免疫治疗在三阴性乳腺癌中的应用,并通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学分析揭示了放疗与pembrolizumab之间的协同作用。 通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学分析,揭示了放疗与pembrolizumab在三阴性乳腺癌中的协同作用。 NA 研究新辅助化疗联合免疫治疗在三阴性乳腺癌中的效果及潜在的协同机制。 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境。 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA NA
914 2024-08-07
Quantifying and correcting bias in transcriptional parameter inference from single-cell data
2024-01-02, Biophysical journal IF:3.2Q2
研究论文 本文开发了一种理论,用于解释在使用标准电报模型从单细胞数据推断参数时估计偏差的大小和符号 本文发现了特定偏差特征,这些特征取决于外在噪声的来源(即哪个参数在细胞间变化最大)和转录活性模式 本文假设没有外在噪声,即参数在细胞间不变化,因此估计的参数应理解为近似群体中的平均值 量化并修正从单细胞数据推断转录参数时的偏差 单细胞数据中的mRNA计数分布和转录参数 分子生物学 NA 单分子荧光原位杂交,单细胞RNA测序 两状态电报模型 单细胞数据 NA
915 2024-08-07
Combined BRAF, MEK, and heat-shock protein 90 inhibition in advanced BRAF V600-mutant melanoma
2024-01, Cancer IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了在晚期BRAF V600突变型黑色素瘤中,联合使用BRAF、MEK抑制剂及热休克蛋白90(HSP90)抑制剂的效果。 本研究首次尝试在晚期BRAF V600突变型黑色素瘤中联合使用BRAF、MEK及HSP90抑制剂,并评估了其疗效和安全性。 联合治疗显示出显著的毒性,需要频繁减少剂量,这可能导致了相对较低的无进展生存期,尽管肿瘤反应率较高。 评估在晚期BRAF V600突变型黑色素瘤中,联合使用BRAF、MEK及HSP90抑制剂的疗效和安全性。 晚期BRAF V600突变型黑色素瘤患者。 NA 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 25名患者
916 2024-08-07
Corrigendum: Dissecting the single-cell transcriptome network of immune environment underlying cervical premalignant lesion, cervical cancer and metastatic lymph nodes
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
correction NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
917 2024-08-07
Targeting tumor-stromal interactions in triple-negative breast cancer using a human vascularized micro-tumor model
2024-01-05, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用人血管化微肿瘤模型,探索三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子基础及潜在治疗靶点 采用先进的体外微生理系统——血管化微肿瘤模型,结合单细胞RNA测序技术,揭示了正常乳腺组织基质细胞在三阴性乳腺癌微环境中的促癌信号通路 NA 研究三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子机制,并探索潜在的治疗靶点 三阴性乳腺癌中的肿瘤-基质相互作用及其治疗靶点 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 血管化微肿瘤模型 RNA NA
918 2024-08-04
Tumor-associated macrophages promoting PD-L1 expression in infiltrating B cells through the CXCL12/CXCR4 axis in human hepatocellular carcinoma
2024, American journal of cancer research IF:3.6Q2
PMID:38455420
研究论文 该研究探讨了肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞通过CXCL12/CXCR4轴促进浸润B细胞PD-L1表达的机制 发现了一种新型的调节性B细胞PD-L1 Bregs,揭示了它们与CXCL12 TAMs之间的相互作用以及其在肝细胞癌中的作用 该研究的局限性可能在于基于单细胞RNA-seq数据的分析,这可能不能完全代表肿瘤微环境的复杂性 研究肝细胞癌中细胞间通信的机制 调节性B细胞、肿瘤相关巨噬细胞及其在肝细胞癌中的相互作用 数字病理学 肝癌 单细胞RNA-seq、免疫组化 小鼠模型 RNA序列数据 使用了小鼠模型进行实验验证,具体样本数量未提供
919 2024-08-07
Clusterin knockdown has effects on intracellular and secreted von Willebrand factor in human umbilical vein endothelial cells
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 研究了clusterin(CLU)对人类脐静脉内皮细胞中von Willebrand因子(VWF)的调控作用 首次通过单细胞RNA测序分析确定了CLU作为VWF的潜在调控因子,并使用siRNA和CRISPR-Cas9技术验证了CLU敲除对VWF含量的影响 研究仅限于细胞水平,未涉及临床试验或动物模型 探讨CLU在VWF调控中的作用,特别是与von Willebrand病(VWD)相关的调控机制 人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)中的VWF和CLU NA von Willebrand病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),siRNA,CRISPR-Cas9 NA RNA 涉及VWD患者的内皮细胞和正常对照内皮细胞
920 2024-08-07
Single-cell analysis reveals one cancer-associated fibroblasts subtype linked to metastasis in breast cancer: MXRA5 as a potential novel marker for prognosis
2024, American journal of cancer research IF:3.6Q2
PMID:38455411
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了乳腺癌中与转移相关的特定癌症相关成纤维细胞亚型FN1+CAF2,并鉴定了MXRA5作为潜在的新型预后标志物。 首次识别出与乳腺癌转移相关的特定癌症相关成纤维细胞亚型FN1+CAF2,并发现MXRA5可能作为新的标志物参与乳腺癌转移的调控。 研究主要基于单细胞RNA测序数据,未来需要更多的实验验证MXRA5在乳腺癌转移中的具体作用机制。 揭示乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在转移中的作用,寻找新的预后标志物。 乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞及其亚型,以及它们与乳腺癌转移的关系。 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个乳腺癌患者的组织样本
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