单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2024-08-04 |
Non-coding genome contribution to ALS
2024, International review of neurobiology
DOI:10.1016/bs.irn.2024.04.002
PMID:38802183
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研究论文 | 总结了非编码基因组在肌肉萎缩侧索硬化症（ALS）中的贡献 | 提出细胞特异性功能注释对于发现ALS相关遗传变异的重要性 | 缺乏针对大多数ALS患者的特定遗传驱动因素的理解 | 探索非编码基因组中的遗传风险变异对ALS的影响 | ALS患者的非编码基因组遗传变异 | 数字病理学 | 肌肉萎缩侧索硬化症 | 单细胞表观遗传学分析和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 882 | 2024-08-04 |
Dynamic changes of immunocyte subpopulations in thermogenic activation of adipose tissues
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1375138
PMID:38812501
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研究论文 | 本研究探讨了不同冷暴露期间脂肪组织内免疫细胞的动态变化 | 识别了几种新的免疫细胞亚群，这些亚群可能有助于脂肪组织在冷暴露下的产热激活 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不完全反映人类的情况 | 探讨冷暴露对热生成脂肪组织内免疫细胞的整体变化 | 不同冷暴露期间的热生成性脂肪组织中的免疫细胞 | NA | 代谢疾病 | 单细胞测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 定量实时PCR | NA | 免疫细胞数据 | 使用了两个不同类型的热生成性脂肪组织的样本 |
| 883 | 2024-08-04 |
Dissecting Spatiotemporal Structures in Spatial Transcriptomics via Diffusion-Based Adversarial Learning
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0390
PMID:38812530
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研究论文 | 本文介绍了一种计算框架PearlST，用于准确推断空间转录组数据中的时空结构 | 提出了结合偏微分方程增强对抗图自编码器的新方法，显著提升从空间转录组数据中提取特征的能力 | 未知所涉及的具体技术限制和数据集限制 | 研究空间转录组数据中的时空结构推断 | 空间转录组数据及其相关生物学背景 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 对抗图自编码器 | Wasserstein对抗正则化图自编码器 | 空间转录组数据 | 多个不同分辨率的空间转录组数据集 |
| 884 | 2024-08-05 |
Autoimmune CD8+ T cells in type 1 diabetes: from single-cell RNA sequencing to T-cell receptor redirection
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1377322
PMID:38800484
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评论 | 本文探讨了1型糖尿病中自身免疫CD8+ T细胞及其T细胞受体的机制。 | 提出了通过调节自身反应性CD8+ T细胞来治疗或显著改善1型糖尿病的潜在策略。 | 缺乏对CD8+ T细胞的精确和稳定靶向治疗的机制探讨。 | 探讨1型糖尿病中自身免疫CD8+ T细胞及其TCR的作用机制。 | 自身免疫CD8+ T细胞和T细胞受体。 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9, CAR-T | NA | NA | NA |
| 885 | 2024-08-05 |
Development and verification of a manganese metabolism- and immune-related genes signature for prediction of prognosis and immune landscape in gastric cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1377472
PMID:38807601
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种与锰代谢和免疫相关的基因标志，以预测胃癌的预后和免疫环境 | 首次利用锰代谢和免疫相关基因来识别胃癌的预后相关基因 | 未提及此研究的具体局限性 | 研究旨在预测胃癌患者的临床结果并指导未来的免疫治疗干预 | 胃癌患者及其相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，基因表达组数据库分析 | 未提供 | 转录组信息，临床数据 | 未提供具体样本数量 |
| 886 | 2024-08-05 |
Quantitative Modeling of Stemness in Single-Cell RNA Sequencing Data: A Nonlinear One-Class Support Vector Machine Method
2024-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0484
PMID:38010500
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA测序数据的干性量化模型。 | 创新性地使用一类Hadamard核支持向量机(OCHSVM)来定义和量化细胞的干性。 | NA | 研究单细胞的干性量化，以评估自我更新和分化的潜力。 | 主要研究对象包括预植入胚胎细胞、诱导多能干细胞和肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 一类Hadamard核支持向量机(OCHSVM) | 数据集，包括细胞转录组数据 | 涉及多个数据集，包括预植入胚胎细胞、诱导多能干细胞和肿瘤细胞 |
| 887 | 2024-08-05 |
Evaluation of Therapeutic Mechanism of Hedyotis Diffusa Willd (HDW)‒ Scutellaria Barbata (SB) in Clear Cell Renal Cell Carcinoma via Singlecell RNA Sequencing and Network Pharmacology
2024, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究旨在探讨Hedyotis diffusa Willd (HDW)和Scutellaria barbata (SB)在透明细胞肾癌(ccRCC)中的治疗机制 | 通过单细胞RNA测序和网络药理学识别了29个针对ccRCC的关键基因，揭示了其在诊断和预后中的良好表现 | 未提及具体的临床实验数据来进一步验证发现 | 研究HDW-SB在ccRCC中的治疗机制 | Hedyotis diffusa Willd和Scutellaria barbata的活性成分及其在ccRCC中的靶点基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用两个不同的数据集进行分析，其中GSE53757和GSE121638 |
| 888 | 2024-08-04 |
Alveolar macrophage-expressed Plet1 is a driver of lung epithelial repair after viral pneumonia
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44421-6
PMID:38167746
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研究论文 | 本研究探讨了Plet1在病毒性肺炎后对肺上皮修复的作用 | 首次揭示了Plet1在肺修复中的重要投射及其作为治疗潜力的作用 | 未能具体说明Plet1在其他类型的肺损伤中的效果 | 研究Plet1在肺上皮细胞增殖和修复过程中的作用 | 研究对象为经历IAV感染的骨髓衍生巨噬细胞和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 高维单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 889 | 2024-08-04 |
MicroRNAs: exploring their role in farm animal disease and mycotoxin challenges
2024, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2024.1372961
PMID:38803799
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综述 | 本综述文章总结了微小RNA（miRNA）在农场动物疾病和霉菌毒素挑战中的作用 | 该文章创新地展示了miRNA在特定农场动物疾病中的作用，强调它们作为生物标志物和减缓策略的潜力 | 目前只有少量的miRNA在农场动物中被功能性特征化，尚需更专注的研究 | 探讨miRNA在农场动物疾病及霉菌毒素中的潜在角色和应用 | 研究涉及多种农场动物疾病，包括病毒和细菌感染及霉菌中毒 | 数字病理学 | 农场动物疾病 | CRISPR-Cas9筛查、单细胞测序、综合多组学方法 | NA | 文献综述 | NA |
| 890 | 2024-08-04 |
Single cells and TRUST4 reveal immunological features of the HFRS transcriptome
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1403335
PMID:38803345
|
研究论文 | 本研究利用TRUST4工具揭示了HFRS转录组的免疫特征 | 通过单细胞RNA测序数据进行免疫细胞克隆性和多样性的深入分析，探索了免疫细胞亚群和细胞间相互作用的机制 | 现有的T细胞受体和B细胞受体库的测序技术存在成本高和局限性 | 阐明HFRS发病过程中的免疫细胞动态变化 | 来自HFRS患者的外周血样本中提取的单细胞免疫细胞 | 数字病理学 | 肾综合征出血热 | RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从HFRS患者的外周血样本中提取的11种细胞亚群 |
| 891 | 2024-08-05 |
B-cell immune dysregulation with low soluble CD22 levels in refractory seronegative myasthenia gravis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382320
PMID:38711503
|
研究论文 | 本研究揭示了难治性无抗体型重症肌无力的免疫病理，强调了以B细胞为中心的免疫失调和可溶性CD22水平降低 | 首次使用单细胞RNA测序和血浆蛋白质组分析研究无抗体型重症肌无力的病理机制 | 样本量较小，仅涉及30名患者，可能影响结果的普遍性 | 阐明难治性无抗体型重症肌无力的病理机制 | 对30名女性患者（健康对照、早发AChR阳性MG和难治性早发无抗体型MG患者）的外周血样本进行分析 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序，血浆蛋白组分析 | NA | 血液样本 | 30名女性患者，包括10名健康对照，10名早发AChR阳性MG患者，10名难治性早发无抗体型MG患者 |
| 892 | 2024-08-05 |
Novel insights into the ontogeny of basophils
2024, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2024.1402841
PMID:38803659
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综述 | 本文总结了小鼠和人类嗜碱性粒细胞的发育新发现 | 提出了嗜碱性粒细胞分化与红细胞/巨核细胞相关的观点，并发现了小鼠骨髓中新型嗜碱性粒细胞祖细胞 | 主要集中在小鼠模型和scRNA-seq技术，限制了对其他物种或技术的广泛应用 | 探讨嗜碱性粒细胞的发育过程及其相关机制 | 嗜碱性粒细胞及其祖细胞 | 数字病理学 | 过敏反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 893 | 2024-08-05 |
Serglycin secreted by late-stage nucleus pulposus cells is a biomarker of intervertebral disc degeneration
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44313-9
PMID:38167807
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研究论文 | 本文探讨了晚期髓核细胞分泌的serglycin作为椎间盘退变的生物标志物 | 首次识别了晚期髓核细胞并确认了serglycin如何调节椎间盘退变的潜在机制 | 样本量较小，仅包含三名男性和四名女性 | 研究serglycin在椎间盘退变中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 晚期髓核细胞及其分泌的serglycin | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 七个（男性三名，女性四名） |
| 894 | 2024-08-04 |
PANoptosis and Autophagy-Related Molecular Signature and Immune Landscape in Ulcerative Colitis: Integrated Analysis and Experimental Validation
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S455862
PMID:38800594
|
研究论文 | 本研究调查了与PANoptosis和自噬相关的溃疡性结肠炎(UC)的分子特征和免疫微环境 | 本研究首次识别并验证了与UC相关的PANoptosis和自噬的新分子特征，可能影响免疫失调和伤口愈合 | 研究中对候选基因的验证主要基于小鼠模型，缺乏大规模临床样本支持 | 探讨溃疡性结肠炎中PANoptosis和自噬相关基因的分子特征及免疫微环境 | 溃疡性结肠炎患者及小鼠模型的相关基因和免疫细胞渗透 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 机器学习 | NA | 基因表达数据 | 分析了UC数据集GSE206285，验证了小鼠模型中的关键候选基因表达 |
| 895 | 2024-08-05 |
Unveiling the molecular complexity of proliferative diabetic retinopathy through scRNA-seq, AlphaFold 2, and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1382896
PMID:38800474
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、非负矩阵因式分解、机器学习和AlphaFold 2方法探索增殖性糖尿病视网膜病变的分子水平 | 创新点在于结合多种高科技手段对PDR的细胞和分子特征进行深入研究 | 本研究可能受到样本量和研究设计的限制 | 探究增殖性糖尿病视网膜病变的复杂分子病理机制 | 针对增殖性糖尿病视网膜病变患者和健康对照者的单细胞RNA测序数据进行分析 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), AlphaFold 2, 机器学习 | NA | 基因表达数据 | 包含增殖性糖尿病视网膜病变患者与健康对照者的样本 |
| 896 | 2024-08-05 |
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12
PMID:38622400
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研究论文 | 本研究描述了一种针对小鼠调节性B细胞的分离协议，以进行单细胞RNA测序分析 | 提出了一种新的小鼠调节性B细胞的分离和分析方法，拓展了对调节性B细胞生物学的理解 | 研究主要集中于小鼠模型，可能在转化到人类时存在局限性 | 研究调节性B细胞在健康和疾病中的生物学特征 | 以易患狼疮的小鼠（MRL/lpr小鼠）为研究对象 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 897 | 2024-08-05 |
Lysyl Oxidase Regulates Epithelial Differentiation and Barrier Integrity in Eosinophilic Esophagitis
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.025
PMID:38340809
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研究论文 | 本研究探讨了赖氨酸氧化酶（LOX）在嗜酸性食管炎中的作用，尤其是在上皮细胞分化和屏障完整性方面 | 本研究首次揭示了LOX在食管上皮中的非经典角色，作为重要的信号分子参与上皮稳态调节 | 本研究主要基于体外实验，临床应用的直接证据有限 | 研究LOX在嗜酸性食管炎中的功能作用及其对上皮细胞分化和屏障完整性的影响 | 人类嗜酸性食管炎患者来源的类器官和细胞文化模型 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序 | 三维类器官模型 | 基因组数据 | 使用了患者来源的类器官 |
| 898 | 2024-08-05 |
Identification of CFH and FHL2 as biomarkers for idiopathic pulmonary fibrosis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1363643
PMID:38784225
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研究论文 | 本研究识别了CFH和FHL2作为特发性肺纤维化的生物标志物 | 本研究首次确认CFH和FHL2在特发性肺纤维化中的诊断价值 | 该研究缺乏长期临床验证，临床适用性尚需进一步评估 | 研究CFH和FHL2在特发性肺纤维化中的作用及其与免疫细胞的关系 | 特发性肺纤维化相关的关键基因及其在免疫细胞中的表达 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 基因微阵列分析、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 两组数据共涉及647个差异表达基因 |
| 899 | 2024-08-04 |
Network Analysis of Osteoarthritis Progression Using a Steiner Minimal Tree Algorithm
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S438407
PMID:38779430
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研究论文 | 本文提供了与骨关节炎相关基因的综合分析 | 采用Steiner最小树算法分析骨关节炎进展及发现新的生物分子 | 未提及研究的局限性 | 分析与骨关节炎相关的基因及其生物通路 | 与骨关节炎相关的177个基因 | 数字病理学 | 骨关节炎 | Steiner最小树算法 | NA | 基因数据 | 从187项研究中收集了177个与骨关节炎显著相关的基因 |
| 900 | 2024-08-04 |
Overactivated MX1 Positive Natural Killer Cells Promote the Progression of Sepsis-Induced Acute Respiratory Distress Syndrome
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S460259
PMID:38779429
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研究论文 | 本研究探讨了在脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中MX1阳性自然杀伤(NK)细胞的特征及其对疾病进展的影响 | 本研究首次识别出在脓毒症诱导的ARDS中独特的MX1+NK细胞群体，并揭示其在疾病进展中的作用 | 由于样本数量有限，需要更大规模的样本进行进一步探索 | 探讨脓毒症诱导的ARDS中NK细胞的特征及其在疾病中的作用 | 本研究以115名脓毒症患者为对象，其中包括63名发展为ARDS的患者 | 数字病理 | 急性呼吸窘迫综合征 | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 转录组数据，细胞群体数据 | 总共分析了115名脓毒症患者，其中63名发展为ARDS，52名未发展为ARDS |