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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2024-08-05 |
Causal relationship between immune cells and hepatocellular carcinoma: a Mendelian randomisation study
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96744
PMID:38947379
|
研究论文 | 本研究探讨了731种免疫细胞表型与肝细胞癌(HCC)之间的因果关系 | 通过孟德尔随机ization和单细胞测序技术揭示了免疫细胞表型与HCC的潜在因果关联 | 研究依赖于公开的遗传数据集,可能存在选择偏差和混杂因素 | 揭示免疫细胞表型与肝细胞癌之间的因果关系,以发现有效的药物靶点 | 731种免疫细胞表型及其与HCC的关联 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化,单细胞测序 | NA | 遗传数据,单细胞数据 | 利用公开遗传数据集进行的两样本孟德尔随机化分析 | NA | NA | NA | NA |
| 842 | 2024-08-05 |
Elevated RACGAP1 Expression Enhances Malignant Potential in Lung Adenocarcinoma and Serves as a Prognostic Factor
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96334
PMID:38947404
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研究论文 | 本研究分析了RACGAP1在肺腺癌中的作用及其作为预后因子的潜力 | 通过综合分析和单细胞测序数据,揭示了RACGAP1在肺腺癌的肿瘤相关过程中的作用,并建立了有效的预后模型 | 研究未涉及RACGAP1在其他肿瘤类型中的作用及机制 | 探讨RACGAP1在肺腺癌中的表达及其对预后的影响 | 肺腺癌患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | Cox回归模型,LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA数据库的肺腺癌患者数据和实验验证样本 | NA | NA | NA | NA |
| 843 | 2024-08-05 |
Metabolic Heterogeneity of Tumor Cells and its Impact on Colon Cancer Metastasis: Insights from Single-Cell and Bulk Transcriptome Analyses
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94630
PMID:38947396
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和大规模转录组分析探索结直肠癌中的代谢异质性,其对转移的影响 | 首次整合单细胞与大规模转录组分析揭示了结直肠癌内的代谢景观及其影响疾病进展的机制 | 尚未详尽探讨某些代谢基因在转移中的作用 | 研究代谢重编程如何影响结直肠癌细胞的异质性及其转移 | 结直肠癌细胞的代谢异质性及其相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,微阵列分析 | 随机森林模型 | 转录组数据 | 使用GEO和TCGA中的微阵列与单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 844 | 2024-08-05 |
ECT2 promotes the occurrence and is a prognostic biomarker of head and neck squamous cell carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.95515
PMID:38947403
|
研究论文 | 本研究探讨了ECT2在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的作用,发现其可能是一个预后生物标志物 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据首次明确了ECT2在HNSCC中的特定角色 | 本研究可能在样本多样性和临床外部验证方面存在局限性 | 研究ECT2在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 头颈部鳞状细胞癌样本及相关细胞系HSC-3 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据和细胞功能实验数据 | 头颈部鳞状细胞癌样本和细胞系HSC-3 | NA | NA | NA | NA |
| 845 | 2024-08-05 |
PathFinder: a novel graph transformer model to infer multi-cell intra- and inter-cellular signaling pathways and communications
2024, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2024.1369242
PMID:38846640
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新颖的图变换模型PathFinder,用于推断多细胞间及细胞内的信号传导路径与通讯 | PathFinder基于分而治之策略设计,将复杂的信号网络分为信号路径,并采用新颖的图变换架构进行评分和排名 | 暂无提及具体局限性 | 旨在理解阿尔茨海默病微环境内复杂的信号机制 | 使用的研究对象包括APOE4基因型特异性的AD和人类肝硬化队列 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | 图变换模型 | 基因表达数据 | 两个scRNA-seq数据队列 | NA | NA | NA | NA |
| 846 | 2024-08-05 |
Prognostic and predictive value of super-enhancer-derived signatures for survival and lung metastasis in osteosarcoma
2024-01-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04902-8
PMID:38254188
|
研究论文 | 本研究探讨了超增强子衍生签名在骨肉瘤生存和肺转移中的预后和预测价值 | 该研究开发了基于超增强子的预后签名,显著提高了骨肉瘤患者的预后准确性 | 本研究仅基于回顾性分析,缺乏前瞻性验证 | 提高骨肉瘤患者的预后评估准确性 | 研究对象为212名接受标准治疗的骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 212名骨肉瘤患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 847 | 2024-08-05 |
The role of immune cells in different stages of atherosclerosis
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.94570
PMID:38774746
|
综述 | 本文探讨了免疫细胞在动脉粥样硬化不同阶段的作用 | 强调了免疫细胞亚型的多样性及其在动脉粥样硬化进展中的适应性 | 未详细探讨临床应用的具体策略 | 理解免疫细胞及其亚型如何影响动脉粥样硬化的发展 | 关注动脉粥样硬化病变内的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 高维质谱和单细胞RNA测序 | NA | 细胞、组织样本 | 利用动脉粥样硬化病变中的白血球样本 | NA | NA | NA | NA |
| 848 | 2024-08-04 |
Identification of biomarkers related to angiogenesis in myocardial ischemia-reperfusion injury and prediction of potential drugs
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0300790
PMID:38935597
|
研究论文 | 本研究识别与心肌缺血再灌注损伤相关的血管生成生物标志物并预测潜在药物 | 本研究首次识别Stat3、Rela和Ubb作为心肌缺血再灌注损伤与血管生成的关键基因 | 研究未提及样本的多样性及临床实验证据 | 探索心肌缺血再灌注损伤中的血管生成机制及相关生物标志物 | 心肌缺血再灌注损伤的生物标志物和潜在药物 | 数字病理 | 心血管疾病 | 测序 | WGCNA | 基因序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 849 | 2024-08-04 |
Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Unravels the Molecular Feature of Tumor-Associated Macrophage of Acute Myeloid Leukemia
2024, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2024/5539065
PMID:38205232
|
研究论文 | 本文探讨了急性髓系白血病及其相关的巨噬细胞分子特征 | 提出了一种巨噬细胞相关指数(MRI)来评估AML患者的预后和免疫特征 | 研究可能受到数据源和样本量的限制,可能需进一步验证 | 深入探索急性髓系白血病与巨噬细胞之间的关联 | 急性髓系白血病患者的基因表达谱和临床变量特征 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | RNA测序 | LASSO和多变量Cox分析 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA, GEO和TARGET数据库的AML患者数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 850 | 2024-08-04 |
Prognostic and therapeutic insights into colorectal carcinoma through immunogenic cell death gene profiling
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17629
PMID:38938617
|
研究论文 | 本研究探讨了免疫原性细胞死亡在结直肠癌中的作用,并开发了新型的量化系统来预测患者的预后与免疫治疗效果 | 开发了一种新颖的免疫原性细胞死亡量化系统,并在肿瘤免疫微环境中构建了ICD评分 | 本研究侧重于结直肠癌的特定类型,可能无法广泛适用于其他癌症类型 | 研究免疫原性细胞死亡在结直肠癌中的作用与预测患者治疗结果的潜力 | 研究对象为被诊断为结肠腺癌/直肠腺癌的1,184名患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | 主成分分析 (PCA) | 基因组数据 | 1,184名结肠腺癌/直肠腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 851 | 2024-08-04 |
Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptomics to Uncover and Elucidate GP73-Mediated Pro-Angiogenic Regulatory Networks in Hepatocellular Carcinoma
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0387
PMID:38939041
|
研究论文 | 本研究展示了GP73介导的促血管生成调控网络在肝细胞癌中的作用 | 揭示了GP73与血管内皮细胞的细胞通信及其在肝细胞癌血管发育中的作用 | 研究可能未能涵盖所有肝细胞癌类型及其复杂性 | 探讨GP73在肝细胞癌中促血管生成的机制及其临床相关性 | 肝细胞癌患者的细胞及其在血管生成中的关键角色 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞空间转录组学 | NA | 细胞、血清 | 肝细胞癌患者的样本未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 852 | 2024-08-05 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies an aneuploidy-based gene signature to predict sensitivity of lung adenocarcinoma to traditional chemotherapy drugs and patients' prognosis
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17545
PMID:38938612
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研究论文 | 该文章研究了一个基于基因签名的模型,以预测肺腺癌对传统化疗药物的敏感性和患者的预后 | 开发了一个五基因异倍体相关风险评分(ARS)模型,发现高表达的CKS1B促进肺腺癌细胞系的增殖、迁移和侵袭性表型 | 目前对异倍体相关基因在肺腺癌中的预后和免疫治疗能力的研究仍然有限 | 研究异倍体相关基因在肺腺癌中的潜在作用,以改善诊断和治疗方法 | 以肺腺癌(LUAD)细胞系为研究对象,筛选与异倍体相关的基因 | 数字病理 | 肺癌 | RNA测序 | Cox回归与Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 使用公共数据库的肿瘤数据以及细胞实验验证 | NA | NA | NA | NA |
| 853 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of a new transgenic t(8;21) preleukemia mouse model reveals regulatory networks promoting leukemic transformation
2024-01, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-02063-z
PMID:37838757
|
研究论文 | 本研究描述了一种新的转基因鼠模型,揭示了促使白血病转化的调控网络 | 开发了一种新的AE9a基因敲入小鼠模型,适合研究前白血病阶段的改变 | 可能在临床上的适用性仍需进一步验证 | 研究t(8;21)的前白血病机理及其调控网络 | 使用AE9a小鼠模型分析前白血病细胞群体及其转化 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠 | 基因表达数据 | 使用AE9a小鼠模型观察多个细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 854 | 2024-08-05 |
Single cell transcriptomic analysis of the canine duodenum in chronic inflammatory enteropathy and health
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1397590
PMID:38933260
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析慢性炎性肠病犬的十二指肠细胞多样性 | 揭示了犬类十二指肠黏膜的细胞异质性和潜在的分子机制 | 该研究样本量较小,仅涉及7只狗 | 研究慢性炎性肠病中犬类十二指肠的细胞组成及其影响 | 健康犬和患有慢性炎性肠病的犬 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 7个样本(3只健康犬和4只慢性炎性肠病犬) | NA | NA | NA | NA |
| 855 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals the heterogeneity of B cells and tertiary lymphoid structures in muscle-invasive bladder cancer
2024-01-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04860-1
PMID:38216927
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研究论文 | 该研究揭示了肌肉侵袭性膀胱癌(MIBC)中B细胞和三级淋巴结构的异质性 | 本研究提供了关于MIBC中B细胞亚型的异质性及TLSs在MIBC结果中的重要作用的新见解 | 本研究的局限性在于样本大小较小,仅涉及12名膀胱癌患者 | 探索肌肉侵袭性膀胱癌中肿瘤浸润B细胞和三级淋巴结构的功能和机制 | 该研究的对象为12名膀胱癌患者的B细胞和T细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12名膀胱癌患者的11612个B细胞和55392个T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 856 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals aberrantly activated inter-tumor cell signaling pathways in the development of clear cell renal cell carcinoma
2024-01-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04818-9
PMID:38191424
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研究论文 | 本研究探讨了在透明细胞肾细胞癌发展过程中异常激活的肿瘤细胞间信号传导通路 | 首次揭示了透明细胞肾细胞癌中异常激活的细胞间信号通路及其特定的癌干细胞亚群体的作用 | 只分析了少量病例,且未深入探讨信号通路的具体机制 | 研究透明细胞肾细胞癌发展相关的细胞间信号传导 | 6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本 | 数字病理学 | 透明细胞肾细胞癌 | scRNA-seq | NA | NA | 6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 857 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals heterogeneous features of myeloid-derived suppressor cells in newborns
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1367230
PMID:38919617
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研究论文 | 本研究揭示了新生儿骨髓源抑制细胞的异质性特征和成熟轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序明确了新生儿多形核骨髓源抑制细胞的分化阶段 | 尚未深入探讨新生儿MDSCs在免疫系统中的具体功能和机制 | 探讨新生儿骨髓源抑制细胞的组成及功能异质性 | 新生儿外周血中的多形核骨髓源抑制细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 新生儿的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 858 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Transcriptome of the Human Endometrium Reveals Epithelial Characterizations Associated with Recurrent Implantation Failure
2024-01, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300110
PMID:37690851
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序揭示了与反复植入失败(RIF)相关的子宫内膜上皮特征 | 首次表明RIF患者子宫内膜腺体中MAP2K6 EPCAM上皮细胞替代腺上皮细胞,并表明RIF患者衍生的腺体类器官对性激素反应减弱 | 研究样本量较小,仅包括3名RIF患者,可能影响结果的普适性 | 探讨反复植入失败患者中子宫内膜的细胞和分子机制 | 研究对象为3名反复植入失败患者的子宫内膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 3名反复植入失败患者,分析25,315个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 859 | 2024-08-05 |
T cell-related ubiquitination genes as prognostic indicators in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1424752
PMID:38919610
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研究论文 | 本研究开发了一种基于T细胞相关泛素化基因的HCC预后风险评分 | 提出了一种新的预后和免疫治疗效果预测指标,基于T细胞相关泛素化基因 | 未提及具体的限制 | 为肝细胞癌患者设计新的预后评估工具 | 肝细胞癌患者的T细胞相关泛素化基因 | 数字病理 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 风险评分模型 | RNA数据 | 3050个T细胞标记基因,结合TCGA的临床数据 | NA | NA | NA | NA |
| 860 | 2024-08-05 |
Relative effect size-based profiles as an alternative to differentiation analysis in multi-species single-cell transcriptional studies
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0305874
PMID:38917129
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研究论文 | 该文章展示了一种基于效应大小的替代方法,用于多物种单细胞RNA测序的差异分析 | 提出了一种基于效应大小的分析管道,适用于小样本和多物种数据的融合 | 涉及的样本小,且可能存在批次效应导致的偏差 | 旨在展示效应大小配置文件作为单细胞转录组分析的有效替代 | 探讨来自于人类和牛的外周血单核细胞的转录组数据 | 数字病理学 | 其他 | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多个物种的小样本数据,包括人类和牛的外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |