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当前共找到 1397 篇文献,本页显示第 821 - 840 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
821 2024-08-14
Systematic analysis on the horse-shoe-like effect in PCA plots of scRNA-seq data
2024, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本研究系统分析了单细胞RNA测序数据PCA图中马蹄形效应的现象 首次系统解释了PCA图中马蹄形效应,并提出了一个数学模型来解释这一现象 NA 探索并解释单细胞RNA测序数据PCA图中的马蹄形效应 单细胞RNA测序数据的PCA图中的马蹄形效应 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 PCA 数据集 使用模拟和真实单细胞RNA测序数据集 NA NA NA NA
822 2024-08-13
Characterizing Rare Dormant and Cycling Lineages Using the Watermelon System
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了Watermelon系统,该系统能够在单细胞水平上同时追踪细胞谱系、转录状态和增殖状态 Watermon系统通过使用基于条形码的谱系追踪方法,实现了从单细胞RNA测序转录数据中解卷积谱系身份 NA 开发一种能够在单细胞水平上同时追踪细胞谱系、转录状态和增殖状态的新系统 罕见的休眠和循环细胞谱系 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录数据 NA NA NA NA NA
823 2024-08-12
Commensal bacteria promote type I interferon signaling to maintain immune tolerance in mice
2024-Jan-01, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 本文揭示了共生细菌Bacteroides fragilis通过经典的抗病毒途径调节肠道树突细胞和调节T细胞反应,从而促进肠道免疫耐受 首次阐明共生细菌通过I型干扰素信号途径支持肠道免疫耐受的机制 NA 探究共生细菌如何通过I型干扰素信号途径维持肠道免疫耐受 共生细菌Bacteroides fragilis、肠道树突细胞和调节T细胞 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 肠道调节T细胞 NA NA NA NA
824 2024-08-11
Revealing the characteristics of SETD2-mutated clear cell renal cell carcinoma through tumor heterogeneity analysis
2024, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了SETD2突变的透明细胞肾细胞癌的肿瘤异质性特征 发现了SETD2突变诱导的亚群可以刺激巨噬细胞M2极化,增加了转移倾向,并建立了一个有效的预测透明细胞肾细胞癌患者总体生存的预后模型 NA 探究SETD2突变对透明细胞肾细胞癌特征和行为的影响 透明细胞肾细胞癌中的SETD2突变 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序 PCA, Leiden算法, InferCNV, VIA, cellphoneDB, Deseq2, hdWGCNA, Cox, LASSO RNA测序数据 69和53个独特的细胞集群,进一步分类为12种独特的细胞类型 NA NA NA NA
825 2024-08-10
Single-cell and Spatial Transcriptomics Reveals Ferroptosis as The Most Enriched Programmed Cell Death Process in Hemorrhage Stroke-induced Oligodendrocyte-mediated White Matter Injury
2024, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 研究使用单细胞转录组和空间转录组技术,探讨了脑出血后程序性细胞死亡相关基因表达趋势,发现铁死亡是主要程序性细胞死亡过程,主要影响成熟的少突胶质细胞 首次揭示了脑出血后铁死亡作为主要程序性细胞死亡过程,并阐明了微胶质细胞与少突胶质细胞之间的特定相互作用 研究仅在 rat 模型上进行,需要进一步在人类中验证 探讨脑出血后不同程序性细胞死亡模式的区别及其对白质损伤的影响 脑出血后的程序性细胞死亡过程及其对神经系统的影响 数字病理学 脑卒中 单细胞 RNA 测序,空间 RNA 测序 NA 转录组数据 rat 脑组织样本 NA NA NA NA
826 2024-08-10
scRNA sequencing technology for PitNET studies
2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
综述 本文综述了使用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)研究垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs)的最新进展 scRNA-seq技术因其单细胞水平的高分辨率而在研究中发挥重要作用 NA 理解调控这些高度异质性肿瘤的分子机制 垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs) 数字病理学 垂体神经内分泌肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA数据 NA NA NA NA NA
827 2024-08-10
Single-cell RNA sequencing in ovarian cancer: revealing new perspectives in the tumor microenvironment
2024, American journal of translational research IF:1.7Q4
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在卵巢癌肿瘤微环境研究中的应用和进展 单细胞测序技术揭示了卵巢癌肿瘤微环境中细胞异质性和细胞间复杂交互作用的新视角 NA 探讨单细胞测序技术在卵巢癌肿瘤微环境研究中的应用,以改善诊断和治疗策略 卵巢癌肿瘤微环境中的细胞异质性和细胞间交互作用 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
828 2024-08-10
scDiffCoAM: A complete framework to identify potential biomarkers for esophageal squamous cell carcinoma using scRNA-Seq data analysis
2024, Journal of biosciences IF:2.1Q2
PMID:39119913
研究论文 本文提出了一种完整的差异共表达分析框架scDiffCoAM,用于从scRNA-Seq数据中提取网络模块并识别关键基因,以发现食管鳞状细胞癌的潜在生物标志物 该方法在大多数情况下表现优于其他四种现有的关键基因发现方法,并能识别其他方法未检测到的独特潜在生物标志物 NA 旨在通过scRNA-Seq数据分析识别食管鳞状细胞癌的潜在生物标志物 食管鳞状细胞癌的scRNA-Seq数据 数字病理学 食管鳞状细胞癌 scRNA-Seq 差异共表达分析 单细胞RNA测序数据 具体样本数量未在摘要中提及 NA NA NA NA
829 2024-08-09
Identification of CGNL1 as a diagnostic marker in fibroblasts of diabetic foot ulcers: Insights from single cell RNA sequencing and bulk sequencing data
2024 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology IF:3.0Q2
研究论文 本研究旨在探索糖尿病足溃疡(DFUs)中成纤维细胞亚型的独特转录特征及铁死亡的作用 通过单细胞RNA测序和批量测序数据,本研究首次确定了CGNL1作为成纤维细胞中的一个独特诊断标志物,并揭示了其在促炎性成纤维细胞中的正相关性 NA 探索糖尿病足溃疡中成纤维细胞亚型的独特转录特征及铁死亡的作用 糖尿病足溃疡中的成纤维细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 83529个单细胞转录组来自足部样本 NA NA NA NA
830 2024-08-09
Deciphering the immune-metabolic nexus in sepsis: a single-cell sequencing analysis of neutrophil heterogeneity and risk stratification
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了脓毒症中的免疫细胞景观及其与代谢途径的关联,揭示了中性粒细胞在脓毒症代谢紊乱中的作用及其异质性 通过单细胞RNA测序和机器学习技术,本研究首次揭示了脓毒症中中性粒细胞的复杂交互作用和其在代谢紊乱中的关键角色,并开发了一种新的风险评分模型用于预测脓毒症预后 NA 旨在深入理解脓毒症中的免疫代谢相互作用,并开发新的预后和治疗策略 脓毒症中的免疫细胞和代谢途径 数字病理学 脓毒症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习 单细胞RNA测序数据 未具体说明样本数量 NA NA NA NA
831 2024-08-08
Advancing bladder cancer management: development of a prognostic model and personalized therapy
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究旨在通过单细胞和批量RNA测序数据,开发和验证一种基于基底鳞状亚型相关基因的膀胱癌预后模型,并探索个性化治疗策略。 本研究首次基于基底鳞状亚型相关基因开发了一种新的膀胱癌预后模型,并验证了其在不同临床环境中的预测性能。 NA 提高对膀胱癌分子异质性的理解,并开发有效的预后模型和个性化治疗策略。 膀胱癌的分子亚型、预后模型和个性化治疗策略。 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序 LASSO和Cox回归分析 RNA测序数据 使用了来自多个来源的单细胞和批量RNA测序数据,包括GSE135337、GSE13507、GSE31684、GSE32894、GSE69795和TCGA-BLCA。 NA NA NA NA
832 2024-08-08
Multiplexed spatial transcriptomics methods and the application of expansion microscopy
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了空间转录组学方法,特别是序列(ISS)方法、杂交(ISH)技术以及基于下一代测序(NGS)的区域捕获测序技术,并探讨了扩展显微镜(ExM)在这些技术中的应用 扩展显微镜(ExM)通过控制生物样本的放大,实现了超分辨率成像,克服了传统显微镜的衍射极限,使得在空间转录组学方法中精确观察RNA成为可能 空间转录组学实验的一个挑战是细胞内RNA检测的光学拥挤限制 探讨空间转录组学方法及其在生物学和医学中的应用 空间转录组学技术及其与扩展显微镜(ExM)的结合 NA NA 扩展显微镜(ExM) NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
833 2024-08-07
Elucidating T cell dynamics and molecular mechanisms in syngeneic and allogeneic islet transplantation through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了同种异体和异种胰岛移植中T细胞动态和分子机制 揭示了同种异体和异种胰岛移植中T细胞亚群的基因变异和分子差异,以及细胞间通信模式的复杂性 NA 阐明胰岛移植中T细胞动态和分子机制,以增强移植物接受度和更有效地管理糖尿病治疗 同种异体和异种胰岛移植中的T细胞亚群及其基因表达差异 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 t-SNE 基因表达数据 未明确提及具体样本数量 NA NA NA NA
834 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals cellular dynamics and therapeutic effects of astragaloside IV in slow transit constipation
2024-Jan-29, Biomolecules & biomedicine
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了黄芪甲苷IV在治疗慢传输型便秘中的细胞动态和治疗效果 首次揭示了黄芪甲苷IV对慢传输型便秘模型中肠道细胞比例和功能的调节作用,并通过网络药理学分析了其作用机制 研究仅限于动物模型,需要进一步的人体试验验证 确定慢传输型便秘模型中结肠组织细胞的动态变化,并研究黄芪甲苷IV治疗的效果 慢传输型便秘的小鼠模型和黄芪甲苷IV的治疗效果 数字病理学 消化系统疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 使用洛哌丁胺诱导的慢传输型便秘小鼠模型 NA NA NA NA
835 2024-08-07
Dysregulation of endometrial stromal serotonin homeostasis leading to abnormal phosphatidylcholine metabolism impairs decidualization in patients with recurrent implantation failure
2024, Human reproduction open IF:8.3Q1
研究论文 本研究探讨了异常的血清素稳态是否导致反复植入失败(RIF)患者子宫内膜蜕膜化受损 发现RIF患者子宫内膜中血清素代谢稳态异常,伴随单胺氧化酶(MAO)表达减少,影响子宫内膜基质细胞的蜕膜化,导致胚胎植入失败 研究揭示了血清素代谢稳态受损和MAO表达异常降低是RIF的原因之一,但血清素在子宫内膜中的来源和其他潜在功能仍需进一步探索 探讨异常的血清素稳态是否导致反复植入失败(RIF)患者子宫内膜蜕膜化受损及其机制 反复植入失败(RIF)患者的子宫内膜样本和生育能力正常的患者子宫内膜样本 NA 生殖系统疾病 ELISA、免疫荧光组织化学、单细胞测序、RNA测序(RNA-seq)、液相色谱-质谱(LC/MS) NA 细胞、基因表达数据 50个子宫内膜样本(25个RIF患者和25个生育能力正常的患者) NA NA NA NA
836 2024-08-07
Identifying potential therapeutic targets in lung adenocarcinoma: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2024, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据与孟德尔随机化方法,旨在识别肺腺癌的新治疗靶点 本研究采用多组学方法,结合批量和单细胞RNA测序数据,以及孟德尔随机化分析,揭示了肺腺癌的潜在治疗靶点 NA 识别肺腺癌的新治疗靶点 肺腺癌及其相关基因和细胞类型 数字病理学 肺腺癌 RNA测序 NA RNA测序数据 513个肺腺癌组织和59个非肿瘤组织 NA NA NA NA
837 2024-08-07
The role of metabolic memory in diabetic kidney disease: identification of key genes and therapeutic targets
2024, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了代谢记忆在糖尿病肾病中的作用,并通过单细胞RNA测序数据识别关键基因和治疗靶点 本研究首次结合人类数据和动物模型,识别出与代谢记忆和纤维化相关的关键基因NDRG1,并验证了其作为治疗靶点的潜力 研究主要基于数据库数据和动物模型,需要进一步的人体临床试验验证 探索代谢记忆在糖尿病肾病中的作用及潜在的治疗靶点 糖尿病肾病中的代谢记忆和纤维化相关基因 生物信息学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及12种细胞类型,包括人类和动物模型 NA NA NA NA
838 2024-08-05
Systems biology-based analysis exploring shared biomarkers and pathogenesis of myocardial infarction combined with osteoarthritis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过系统生物学探讨了心肌梗死和骨关节炎共享的生物标志物和发病机制 首次揭示了DUSP1、FOS和THBS1作为心肌梗死和骨关节炎的三个新共享生物标志物及其相关信号通路 未提及研究的具体局限性 探讨心肌梗死与骨关节炎的共享生物标志物和发病机制 心肌梗死(MI)和骨关节炎(OA)患者的基因表达数据 数字病理学 心肌梗死与骨关节炎 基因表达分析,单细胞RNA测序,RT-qPCR 无特定模型类型 基因表达数据 涉及心肌细胞和软骨细胞的样本,具体样本数量未说明 NA NA NA NA
839 2024-08-05
Integrative single-cell analysis of longitudinal t(8;21) AML reveals heterogeneous immune cell infiltration and prognostic signatures
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究对t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫微环境进行了综合单细胞分析 本研究通过scRNA-seq发现了与疾病进展和药物耐受性相关的独特T细胞特征 论文未提及具体的样本数量及其来源,限制了结果的普遍性 探究急性髓性白血病患者的免疫细胞浸润状况与预后的关系 t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫细胞特征 数字病理学 急性髓性白血病 单细胞RNA测序 NA 免疫细胞浸润数据 包括原发和纵向t(8;21)急性髓性白血病样本以及外部队列 NA NA NA NA
840 2024-08-04
Integrated analyses of single-cell transcriptome and Mendelian randomization reveal the protective role of FCRL3 in multiple sclerosis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析,发现FCRL3在多发性硬化中的保护作用 创新点在于整合了单细胞转录组和孟德尔随机化分析来寻找MS的新治疗靶点 本文未提及具体的实验验证或临床试验数据 发现多发性硬化的新治疗靶点 对FCRL3在多发性硬化中的作用进行分析 数字病理学 多发性硬化 单细胞RNA测序,孟德尔随机化 NA 基因组数据,单细胞转录组数据 收集了1123个在七种外周细胞类型中观察到的表达变化 NA NA NA NA
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