单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-05-24
Immunological characterization and comparison of children with COVID-19 from their adult counterparts at single-cell resolution
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序比较儿童与成人COVID-19患者的免疫特征 首次在单细胞分辨率下系统比较儿童和成人COVID-19患者的免疫细胞差异,揭示儿童更强的NK细胞毒性和较少的炎症反应 初步研究,样本量较小(15名儿童和18名成人) 阐明儿童COVID-19患者免于重症的免疫保护机制 COVID-19儿童和成人患者的外周血免疫细胞 单细胞组学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 15名儿童(8名患者)和18名成人(13名患者) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
62 2026-05-24
Altered immune cell in human severe acute pancreatitis revealed by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示重症急性胰腺炎患者中免疫细胞的变化 首次构建了重症急性胰腺炎患者外周血单核细胞的单细胞转录组图谱,并发现了一种高表达PPBP和PF4的新型单核细胞亚群 样本量较小,仅7名未经治疗的重症急性胰腺炎患者,且健康对照数据来自公共数据库 了解重症急性胰腺炎中特定免疫细胞亚型的变化及其作用机制,并识别预测急性胰腺炎严重程度的潜在生物标志物 重症急性胰腺炎患者的外周血单核细胞 单细胞转录组学 重症急性胰腺炎 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 7名未治疗的重症急性胰腺炎患者,6名健康对照(来自GEO数据库) NA 单细胞RNA-seq NA NA
63 2026-05-23
Exploring myometrial microenvironment changes at the single-cell level from nonpregnant to term pregnant states
2024-01-01, Physiological genomics IF:2.5Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序和空间转录组学构建非孕期和足月孕期女性子宫肌层的单细胞转录组图谱,揭示细胞微环境变化 首次在单细胞水平上揭示非孕期与足月孕期子宫肌层的微环境变化,特别是平滑肌细胞亚群比例改变和M2巨噬细胞增加 未提及具体局限性信息 探索人类子宫肌层从非孕期到足月孕期在单细胞水平上的微环境变化 非孕期和足月孕期女性的子宫肌层组织 单细胞转录组学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 12个人类子宫肌层组织样本,87,845个高质量单细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'试剂盒,10x Visium空间转录组学平台
64 2026-05-23
The functional role of L-fucose on dendritic cell function and polarization
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 揭示L-岩藻糖对树突状细胞功能和极化的促进作用,及其在肿瘤免疫治疗中的潜在应用 首次发现膳食糖L-岩藻糖能增强树突状细胞的免疫刺激活性,促进其抗原摄取和加工,并调节T细胞活化 尚未明确L-岩藻糖增强DC功能的具体分子机制和信号通路 探索L-岩藻糖增强树突状细胞功能以提升抗肿瘤免疫应答的潜力 小鼠树突状细胞及黑色素瘤和乳腺癌模型中的瘤内树突状细胞 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序 未提及 单细胞转录组数据 黑色素瘤和乳腺癌荷瘤小鼠模型的样本 未提及 单细胞RNA测序 未提及 未提及
65 2026-05-23
Single-cell transcriptomic analysis of pea shoot development and cell-type-specific responses to boron deficiency
2024-01, The Plant journal : for cell and molecular biology
研究论文 通过单细胞RNA测序分析硼缺乏条件下豌豆芽发育及细胞类型特异性响应 首次在单细胞水平揭示豌豆茎尖不同细胞类型对硼缺乏的差异化响应机制,并构建茎尖分生组织发育轨迹及其转录因子互作网络 本研究仅关注硼缺乏单一胁迫条件,未涉及其他营养胁迫或联合胁迫效应 探究营养胁迫(硼缺乏)如何影响植物生长发育的分子机制 豌豆(Pisum sativum)茎尖分生组织细胞 数字病理学 植物营养胁迫 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 15个细胞簇,来源为硼缺乏条件下生长的豌豆茎尖 NA 单细胞RNA-seq NA NA
66 2026-05-22
Pain sensitivity genes as therapeutic targets in knee osteoarthritis: A comprehensive analysis
2024 Jan-Dec, Molecular pain IF:2.8Q2
研究论文 对膝骨关节炎中疼痛敏感基因作为治疗靶点进行了全面分析 系统分析了疼痛敏感相关基因在膝骨关节炎中的作用,并通过单细胞RNA测序揭示了不同细胞亚群中的异质性表达 NA 分析膝骨关节炎中疼痛敏感基因的角色及其作为治疗靶点的潜力 膝骨关节炎中的疼痛敏感相关基因 机器学习 膝骨关节炎 RNA-seq, 单细胞RNA测序 LASSO, SVM, 随机森林 基因表达数据 使用GSE114007和GSE169077数据集进行差异表达分析,以及GSE152805、GSE133449和GSE104782数据集进行单细胞RNA测序分析 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
67 2026-05-22
Upregulation of interferon-γ response genes in monocytes and T cells identified by single-cell transcriptomics in patients with anti-citrullinated peptide antibody-positive early rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组学分析,揭示抗瓜氨酸化蛋白抗体阳性早期类风湿关节炎患者单核细胞和T细胞中干扰素-γ应答基因的上调 首次在单细胞水平上系统比较ACPA阳性与阴性早期RA患者的外周免疫细胞差异,发现IFN-γ应答基因在单核细胞和T细胞中特异性上调 NA 探究ACPA阳性与阴性早期RA患者免疫系统的差异 抗瓜氨酸化蛋白抗体阳性与阴性的早期类风湿关节炎患者 单细胞转录组学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序,多重细胞因子检测 NA 单细胞转录组数据,血清细胞因子数据 37,318个细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
68 2026-05-22
Immunometabolic alterations in type 2 diabetes mellitus revealed by single-cell RNA sequencing: insights into subtypes and therapeutic targets
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示2型糖尿病的免疫代谢改变,并识别出亚型和潜在治疗靶点 首次通过单细胞转录组学分析将2型糖尿病患者分为三种免疫代谢亚型,并利用机器学习模型基于代谢特征进行分类,结合转录因子和药物富集分析发现潜在治疗靶点 样本量相对较小(37例患者和11例健康对照),且研究仅基于外周血单个核细胞,未涉及组织驻留免疫细胞或代谢器官的微环境 阐明2型糖尿病中免疫细胞在单细胞水平的代谢异质性及其与疾病亚型的关联,并探索潜在治疗靶点 2型糖尿病患者和健康对照的外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞转录组学 2型糖尿病 scRNA-seq NA 基因表达数据 37例T2DM患者和11例健康对照的PBMCs NA 单细胞RNA测序 NA NA
69 2026-05-21
Comprehensive bioinformatics analysis identifies metabolic and immune-related diagnostic biomarkers shared between diabetes and COPD using multi-omics and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 通过多组学和机器学习综合分析,鉴定糖尿病与慢性阻塞性肺疾病共有的代谢和免疫相关诊断生物标志物 首次通过多组学数据结合多种机器学习算法,系统鉴定出糖尿病与COPD共有的4个诊断生物标志物(CADPS、EDNRB、THBS4、TMEM27),并利用单细胞测序、临床样本和动物模型进行验证 未说明具体局限性 揭示糖尿病与慢性阻塞性肺疾病之间的分子机制联系,寻找共有诊断生物标志物 糖尿病和慢性阻塞性肺疾病患者 机器学习 糖尿病, 慢性阻塞性肺疾病 RNA-seq, 单细胞测序 WGCNA, 机器学习算法 基因表达数据, 单细胞测序数据 多中心患者队列,具体样本量未说明 NA NA NA NA
70 2026-05-21
Exploring the role of metabolic pathways in TNBC immunotherapy: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
综述 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在三阴性乳腺癌(TNBC)代谢通路与免疫功能相互作用中的研究进展 结合单细胞和空间转录组学技术,系统阐述TNBC代谢重编程对免疫细胞功能调节的影响,并探讨代谢干预联合免疫检查点抑制剂治疗的潜力 主要基于现有文献总结,未提供新的实验数据或机制验证 探讨TNBC中代谢通路与免疫功能相互作用,为免疫治疗策略提供新见解 三阴性乳腺癌及其肿瘤微环境中的免疫细胞 数字病理学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
71 2026-05-21
Identification of a pancreatic stellate cell gene signature and lncRNA interactions associated with type 2 diabetes progression
2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 通过分析2型糖尿病胰岛细胞的基因表达模式,识别胰腺星状细胞特异性的基因标志物及其与lncRNA的相互作用网络 首次发现COL1A2hi/VCANhi/SULF1hi胰腺星状细胞是2型糖尿病特有的基因签名,并揭示了lncRNA-mRNA调控网络在2型糖尿病免疫微环境重塑中的潜在作用 结果主要基于公开数据集分析,缺乏实验验证;lncRNA-mRNA相互作用为预测性分析,未进行功能实验确认 探索2型糖尿病胰岛细胞的基因表达特征及胰腺星状细胞在疾病进展中的作用机制 2型糖尿病和1型糖尿病患者的胰岛细胞及外周血单核细胞 自然语言处理 2型糖尿病 RNA-seq、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个公共数据集:3个T2D单细胞RNA测序数据集、1个T1D单细胞RNA测序数据集及2个T2D批量测序数据集 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
72 2026-05-20
Identifying the NEAT1/miR-26b-5p/S100A2 axis as a regulator in Parkinson's disease based on the ferroptosis-related genes
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 基于铁死亡相关基因识别帕金森病中的NEAT1/miR-26b-5p/S100A2轴作为调节因子 首次通过整合铁死亡相关基因与竞争性内源RNA网络,鉴定出NEAT1/miR-26b-5p/S100A2轴在帕金森病发病机制中的调控作用 未提及具体局限性,但结果需进一步在更大样本和临床环境中验证 识别铁死亡相关基因并构建竞争性内源RNA网络,以评估帕金森病的发病机制 帕金森病患者和对照组的97个黑质样本 机器学习 帕金森病 RNA-seq, 单细胞RNA测序 机器学习算法(包括随机森林、支持向量机等) 基因表达数据 97个黑质样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
73 2026-05-20
Characterization of NOD-like receptor-based molecular heterogeneity in glioma and its association with immune micro-environment and metabolism reprogramming
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 揭示NOD样受体信号通路在高级胶质瘤中的分子异质性及其与免疫微环境和代谢重编程的关联 首次基于NLR基因表达谱将胶质母细胞瘤患者精确分为两种临床亚型,并开发了基于TRIP6基因的新型预后分子标志物 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏前瞻性验证队列;单细胞分析样本量有限 探索NLR信号通路在胶质母细胞瘤临床异质性中的作用,并识别其关键调控基因 胶质母细胞瘤患者 机器学习 胶质母细胞瘤 NMF聚类算法,LASSO回归,COX回归,随机森林算法,单细胞测序 NMF, LASSO, COX, 随机森林 转录组数据,单细胞测序数据 496例胶质母细胞瘤患者 NA 单细胞测序 NA NA
74 2026-05-20
Utilization of donor CLL-1 CAR-T cells for the treatment of relapsed of acute myeloid leukemia following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
research paper 评估供体来源的CLL-1 CAR-T细胞治疗异基因造血干细胞移植后复发急性髓系白血病的安全性和有效性 首次研究供体来源的CLL-1 CAR-T细胞在异基因HSCT后复发AML患者中的应用,并通过单细胞RNA测序揭示CAR-T细胞动态变化 样本量较小(12名患者),且2名患者因疾病快速进展退出研究 评估供体来源的CLL-1 CAR-T细胞治疗异基因造血干细胞移植后复发急性髓系白血病的疗效和安全性 14名异基因HSCT后复发的AML患者,其中12名接受CLL-1 CAR-T细胞治疗 machine learning 急性髓系白血病 CAR-T细胞治疗,单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据、临床数据 12名AML患者,1个患者样本用于单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序 NA 用于患者4的CAR-T细胞输注产品和扩增峰值期PBMCs的单细胞RNA测序
75 2026-05-20
Characterizing tumor biology and immune microenvironment in high-grade serous ovarian cancer via single-cell RNA sequencing: insights for targeted and personalized immunotherapy strategies
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序表征高级别浆液性卵巢癌的肿瘤生物学和免疫微环境,为靶向和个性化免疫治疗策略提供见解 首次通过单细胞RNA测序系统解析高级别浆液性卵巢癌中C2 IGF2+肿瘤亚型及其与成纤维细胞通过MK信号通路的复杂互作,并基于该亚型构建预后模型结合免疫浸润和药物敏感性分析 未明确提及,可能包括样本量有限、功能验证范围及临床转化中的潜在挑战 利用单细胞RNA测序阐明高级别浆液性卵巢癌的分子机制、免疫景观和药物敏感性,以识别新治疗靶点并改善患者预后 高级别浆液性卵巢癌的肿瘤细胞亚型及其微环境 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自GEO数据库的公共数据集,具体样本数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
76 2026-05-19
A brief history of somatostatin interneuron taxonomy or: how many somatostatin subtypes are there, really?
2024, Frontiers in neural circuits IF:3.4Q2
评论 综述了生长抑素中间神经元分类的历史,重点讨论了基于单细胞RNA-seq的现代分类方法及其对实验神经科学的影响 提出将生长抑素中间神经元划分为约十个“超型”作为最实用的分类层级,批评基于细微基因表达差异的精细分类缺乏表型差异,对实验研究帮助有限 作者承认该综述具有主观偏见,未涵盖所有相关研究,且对基因表达差异的生物学意义评估可能不全面 探讨生长抑素中间神经元分类的演变历史,并建议适用于实验神经科学的实用分类策略 生长抑素中间神经元(somatostatin interneurons) 神经科学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA(综述文章,未涉及具体样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
77 2026-05-19
Histamine H4 receptor and TRPV1 mediate itch induced by cadaverine, a metabolite of the microbiome
2024 Jan-Dec, Molecular pain IF:2.8Q2
研究论文 研究发现微生物代谢物尸胺通过组胺H4受体和TRPV1通路介导瘙痒反应 首次揭示尸胺作为一种新型内源性瘙痒原,通过结合H4R并激活TRPV1信号通路诱导瘙痒 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证,且未完全阐明肠道微生物产生尸胺与瘙痒之间的直接体内联系 探究尸胺是否调节疼痛或瘙痒及其分子机制 小鼠及DRG神经元 机器学习 瘙痒相关疾病 分子对接模拟、scRNA-Seq、钙成像、膜片钳 NA 序列数据、成像数据 实验小鼠及DRG神经元样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
78 2026-05-19
Nature and nurture in fruit fly hearing
2024, Frontiers in neural circuits IF:3.4Q2
综述 综述了果蝇听觉感知中先天性因素和学习性因素的研究进展 将单细胞转录组和脑连接组学数据与传统分子遗传学结合,研究果蝇听觉感知中的“先天与后天”交互作用 未提供 概述果蝇鸣声偏好的本质及其神经机制 果蝇 机器学习 未提供 单细胞转录组 未提供 转录组数据 未提供 未提供 单细胞RNA测序 未提供 未提供
79 2026-05-18
Discovery of optimal cell type classification marker genes from single cell RNA sequencing data
2024, BMC methods
研究论文 介绍NS-Forest v4.0算法,用于从单细胞RNA测序数据中发现最优细胞类型分类标记基因 引入On-Target Fraction指标量化标记基因的特异性,通过模块化决策树提升标记基因选择的效率和准确性 未明确说明局限性,但模拟研究和真实数据验证仍可能受限于数据集大小和细胞类型复杂性 开发可扩展的数据驱动方法,识别最小组合的必需且足够标记基因,以最大分类精度捕获细胞类型身份 人类器官(脑、肾、肺)的单细胞RNA测序数据 机器学习 无特定疾病 单细胞RNA测序 随机森林 单细胞基因表达数据 包含数百万个人类细胞的多个数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
80 2026-05-17
Nephron progenitors rhythmically alternate between renewal and differentiation phases that synchronize with kidney branching morphogenesis
2024-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过空间转录组学数据与分支生命周期的关联,发现肾单位祖细胞在Wnt、Hippo-Yap、视黄酸等通路中节律性交替更新与分化相,并与肾脏分支形态发生同步 首次揭示肾单位祖细胞节律性交替更新与分化相,并证明其与分支形态发生同步的机制,通过时空转录组学整合发现Wnt/β-catenin与YAP激活的时间重叠信号转换 主要在人和小鼠类器官模型中验证,未在完整发育肾中直接验证节律性信号的时间模式,且信号通路的相互作用细节尚需进一步阐明 解析肾单位祖细胞更新与分化平衡的时空调控机制及其与分支形态发生的同步性 小鼠发育肾和人干细胞来源的肾单位祖细胞类器官 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 小鼠发育肾样本和人干细胞来源类器官样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台用于分析小鼠肾组织切片
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