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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Evaluation of nanoscale versus hybrid micro/nano surface topographies for endosseous implants
2024-01-01, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2023.10.030
PMID:37918471
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研究论文 | 评估纳米级与混合微/纳米级表面形貌对骨整合过程中细胞行为的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术鉴定体内植入物表面早期细胞群,并比较纯纳米级与混合微/纳米级表面形貌的差异 | 研究主要关注短期效应(21天内),长期效果需要进一步验证 | 研究不同表面形貌对骨整合过程中细胞功能的影响 | 间充质干细胞和骨髓来源巨噬细胞 | 生物材料 | 骨科植入 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
Cardiac Development at a Single-Cell Resolution
2024, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-44087-8_14
PMID:38884716
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在哺乳动物心脏发育研究中的应用与进展 | 利用单细胞RNA测序技术首次实现了对心脏发育过程中异质性细胞群体的精细解析 | NA | 探索哺乳动物心脏发育的分子机制和细胞多样性 | 人类和小鼠的心脏发育过程 | 单细胞生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | 转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Single-cell Transcriptomics Reveals Activation of Macrophages in All-trans Retinoic Acid (atRA)-induced Cleft Palate
2024 Jan-Feb 01, The Journal of craniofacial surgery
IF:1.0Q3
DOI:10.1097/SCS.0000000000009782
PMID:38049149
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示全反式维甲酸诱导腭裂中巨噬细胞的激活机制 | 首次在单细胞水平系统描绘atRA诱导腭裂的细胞图谱,发现髓系细胞特别是M1样巨噬细胞的显著激活 | 研究仅针对小鼠胚胎第16.5天的腭组织,未涵盖其他发育阶段 | 探究atRA诱导腭裂的细胞分子机制 | 小鼠胚胎腭组织 | 单细胞转录组学 | 腭裂 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | atRA暴露组和正常组小鼠胚胎腭组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
The intricate cellular ecosystem of human peripheral veins as revealed by single-cell transcriptomic analysis
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0296264
PMID:38206912
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示人类外周静脉中复杂的细胞生态系统 | 首次在单细胞水平系统解析人类外周静脉的微解剖结构,发现静脉内皮细胞、平滑肌细胞和成纤维细胞的新型功能表型 | 样本量较小(仅4个非病变静脉),仅关注上肢静脉,缺乏疾病状态对照 | 解析人类外周静脉在单细胞水平的微解剖结构及其与血管壁结构、重塑过程和炎症反应的关系 | 来自器官捐献者的4个非病变人类上肢静脉(3个头静脉,1个贵要静脉) | 单细胞生物学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,组织学分析 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据,组织学图像数据 | 4个人类静脉样本,20,006个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
The BCL-2 inhibitor APG-2575 resets tumor-associated macrophages toward the M1 phenotype, promoting a favorable response to anti-PD-1 therapy via NLRP3 activation
2024-01, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-023-01112-y
PMID:38062129
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研究论文 | 本研究揭示BCL-2抑制剂APG-2575通过激活NLRP3信号通路将肿瘤相关巨噬细胞重编程为M1表型,从而增强抗PD-1疗法的疗效 | 首次发现APG-2575能直接结合NF-κB p65激活NLRP3信号通路,介导巨噬细胞表型转化并增强抗肿瘤免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证数据有限,需进一步人体试验确认 | 探索BCL-2抑制剂与免疫检查点抑制剂联合治疗的协同作用机制 | 同系和人源化CD34+小鼠模型及患者肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 小鼠模型和患者样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45028-1
PMID:38280868
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研究论文 | 本研究通过基因组比对和计算结构建模系统分析了果蝇谱系特异性从头基因的起源、进化和蛋白质结构演化 | 首次结合高质量全基因组比对和计算结构建模方法,系统研究果蝇谱系特异性从头基因的蛋白质结构演化规律 | 研究主要基于计算预测和序列分析,缺乏实验验证蛋白质结构和功能 | 探究果蝇中从头基因的起源和结构演化机制 | 黑腹果蝇及其近缘种中的555个从头基因候选 | 基因组学 | NA | 全基因组比对,计算结构建模,单细胞RNA-seq,祖先序列重建 | 计算结构模型 | 基因组序列,转录组数据 | 555个从头基因候选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing analysis and multiple machine-learning models revealed the cellular crosstalk of dendritic cells and identified FABP5 and KLRB1 as novel biomarkers for psoriasis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374763
PMID:38596682
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析和多种机器学习模型揭示了树突状细胞在银屑病中的细胞相互作用,并鉴定出FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 | 首次发现树突状细胞通过CD70/CD27信号通路调控T细胞在银屑病炎症反应中的作用,并鉴定出FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索银屑病的发病机制并识别有价值的生物标志物 | 银屑病皮肤组织、树突状细胞、T细胞、HaCaT细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞测序, 机器学习, RT-qPCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 多种机器学习模型 | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
Deconvolution of synovial myeloid cell subsets across pathotypes and role of COL3A1+ macrophages in rheumatoid arthritis remission
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1307748
PMID:38601143
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,鉴定滑膜髓系细胞亚群并发现COL3A1+巨噬细胞在类风湿关节炎缓解中的潜在作用 | 首次发现COL3A1+巨噬细胞这一成纤维细胞样M2亚型在髓系病理型中富集,并揭示其通过表达抗炎因子、增强黏附和形成物理屏障缓解关节炎的机制 | 研究样本量有限(81例患者),且部分功能验证仍需进一步实验确认 | 探究单核/巨噬细胞亚群在类风湿关节炎活动中的作用及特定亚型在疾病缓解中的生物学功能 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织和髓系细胞亚群 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 多色免疫荧光, 流式细胞术, 免疫组化染色, 黏附实验, RT-qPCR | Liger整合算法, 反卷积分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 流式细胞数据, 图像数据 | 81例早期关节炎队列患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell analysis of LUAD: elucidating immune cell dynamics and prognostic modeling based on exhausted CD8+ T cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366096
PMID:38596689
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析构建了肺腺癌免疫微环境图谱,并基于耗竭CD8+ T细胞建立预后模型 | 首次整合单细胞分析揭示肺腺癌免疫细胞动态特征,基于CD8_Tex-LAYN基因建立预后模型,并发现GALNT2作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限(19例患者),需要在更大队列中验证模型的普适性 | 阐明肺腺癌免疫微环境特征并建立有效的预后预测模型 | 肺腺癌患者肿瘤微环境中的免疫细胞(CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、髓系细胞等) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,RT-PCR,细胞实验 | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床数据 | 19例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
Single-cell insights into development of the bovine placenta†
2024-01-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioad123
PMID:37707543
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究牛胎盘发育过程中的细胞类型和分子机制 | 首次构建了牛胚胎发育过程中胎盘细胞的数字图谱,揭示了滋养层细胞分化的轨迹和关键转录因子 | 样本数量有限(每个时间点3-4个样本),仅分析了特定发育时间点 | 探究牛胎盘发育的细胞和分子调控机制 | 牛胚胎和绒毛膜组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 第17天牛胚胎和24、30、50天绒毛膜组织,每个时间点3-4个样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 71 | 2025-10-06 |
The many faces of the megakaryocytes and their biological implications
2024-01-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000793
PMID:37910197
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序揭示的巨核细胞谱系转录异质性和功能可塑性 | 通过单细胞RNA测序技术首次系统识别巨核细胞的多个功能亚群及其组织分布特征 | NA | 探讨巨核细胞亚群的功能表型可塑性及其在健康与疾病中的作用 | 巨核细胞及其转录亚群 | 单细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
The immune landscape of fetal chorionic villous tissue in term placenta
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506305
PMID:39872537
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研究论文 | 本研究深入表征了足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的表型和功能多样性 | 首次系统描绘足月胎盘绒毛组织的免疫景观,并揭示孕前肥胖对绒毛髓系细胞表型和功能的调控作用 | 样本来源仅限于无并发症的足月妊娠,未涵盖病理妊娠状态 | 探究足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的表型特征和功能状态 | 人类足月胎盘绒毛组织中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 妊娠相关疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, CITE-seq, 单核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 蛋白质表达数据 | 足月无并发症妊娠的绒毛组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 单细胞ATAC测序 | NA | CITE-seq(细胞表面蛋白与转录组联合测序), snATAC-seq(单核染色质可及性测序) |
| 73 | 2025-10-06 |
A Network Medical Framework based on Inflammatory Genes to Identify Drug Candidates for Abdominal Aortic Aneurysms
2024, Current molecular pharmacology
IF:2.4Q3
|
研究论文 | 本研究基于炎症基因构建网络医学框架,识别腹主动脉瘤的潜在药物候选物 | 整合单细胞RNA测序、RNA测序和网络医学数据,开发基于网络的邻近性测量方法识别靶向SLC2A3的潜在药物 | 研究主要依赖计算模拟,缺乏实验验证 | 识别腹主动脉瘤的关键靶点和潜在治疗药物化合物 | 腹主动脉瘤和非动脉瘤对照样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,药物-靶点相互作用分析,蛋白质-蛋白质相互作用分析,分子动力学模拟 | 网络医学框架 | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,药物靶点数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Exploring the Immune-related Molecular Mechanisms Underlying the Comorbidity of Temporal Lobe Epilepsy and Major Depressive Disorder through Integrated Data Set Analysis
2024, Current molecular pharmacology
IF:2.4Q3
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研究论文 | 通过整合数据分析探索颞叶癫痫与重度抑郁症共病的免疫相关分子机制 | 首次系统识别TLE和MDD共病的共享基因模块,结合机器学习模型筛选诊断标志物,并通过单细胞测序验证基因的细胞类型表达 | 基于公共数据库的回顾性分析,样本来源有限,需要进一步实验验证 | 阐明TLE与MDD共病的分子病理机制并探索诊断治疗应用 | 颞叶癫痫和重度抑郁症患者的脑组织基因表达数据 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 基因表达分析,单细胞测序 | LASSO,随机森林 | 基因表达数据 | 从GEO数据库获取的脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
Inflammatory Alterations to Renal Lymphatic Endothelial Cell Gene Expression in Mouse Models of Hypertension
2024, Kidney & blood pressure research
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000539721
PMID:38972305
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高血压小鼠模型中肾淋巴管内皮细胞的基因表达变化 | 首次在高血压模型中系统揭示肾淋巴管内皮细胞的转录组多样性增加和炎症反应特征 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 评估高血压条件下肾淋巴管内皮细胞的具体变化 | 小鼠肾组织中的CD31+和podoplanin+细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种高血压小鼠模型(血管紧张素II诱导型和盐敏感型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
Uncover spatially informed variations for single-cell spatial transcriptomics with STew
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae064
PMID:38827413
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研究论文 | 提出一种名为STew的空间转录组多视图表示学习方法,用于联合分析空间信息和基因表达 | 开发了首个空间转录组多视图表示学习方法,能够有效利用空间信息揭示与基因表达共享的变异 | NA | 解决空间转录组数据分析中有效利用空间信息的挑战 | 人类背外侧前额叶皮层、小鼠主嗅球和银屑病皮肤组织 | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学 | 多视图表示学习 | 空间转录组数据 | 多个数据集,包含数千个空间位置 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium, Slide-seqV2 | 10x Visium空间转录组技术、Slide-seqV2技术、10x Xenium单细胞空间转录组技术 |
| 77 | 2025-10-06 |
Genetic and Functional Analyses of Cutibacterium Acnes Isolates Reveal the Association of a Linear Plasmid with Skin Inflammation
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.029
PMID:37478901
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研究论文 | 本研究通过遗传和功能分析揭示痤疮丙酸杆菌携带线性质粒与皮肤炎症的关联 | 发现线性质粒的存在与痤疮丙酸杆菌的促炎能力相关,表明菌株类型不足以预测炎症反应 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,需要进一步人体验证 | 探究不同痤疮丙酸杆菌菌株类型与皮肤炎症的关系 | 痤疮丙酸杆菌分离株 | 微生物学 | 痤疮 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 从健康受试者和痤疮患者皮肤拭子分离的痤疮丙酸杆菌菌株 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
Aggressive high-grade NF2 mutant meningiomas downregulate oncogenic YAP signaling via the upregulation of VGLL4 and FAT3/4
2024 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae148
PMID:39380691
|
研究论文 | 本研究揭示侵袭性高级别NF2突变脑膜瘤通过上调VGLL4和FAT3/4下调致癌YAP信号通路 | 首次发现侵袭性NF2突变脑膜瘤中YAP1靶基因表达降低与VGLL4和FAT3/4表达升高相关 | 研究主要基于体外细胞系实验,需要更多体内实验验证 | 探究不同级别NF2突变脑膜瘤对YAP活性的依赖性差异 | 人类脑膜瘤组织和细胞系 | 肿瘤生物学 | 脑膜瘤 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大型人类脑膜瘤队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Evaluating methods for integrating single-cell data and genetics to understand inflammatory disease complexity
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1454263
PMID:39703500
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研究论文 | 评估整合单细胞数据与遗传学数据以理解炎症疾病复杂性的方法 | 首次对三种整合GWAS和scRNA-seq的算法进行系统性基准测试,并评估非编码SNP整合方法 | 依赖现有单细胞技术,缺乏疾病特异性图谱时结果可能产生误导 | 开发评估整合遗传学和单细胞数据方法的框架,以识别炎症疾病中遗传相关的细胞状态和基因 | 类风湿性关节炎和溃疡性结肠炎患者 | 生物信息学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | scGWAS, scDRS, scPagwas, MAGMA | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据 | 单细胞数据:183,742和228,211个细胞;GWAS数据:97,173和45,975个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Myeloid and lymphoid expression of C9orf72 regulates IL-17A signaling in mice
2024-01-31, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg7895
PMID:38295187
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研究论文 | 本研究通过基因敲除技术揭示了C9orf72在髓系和淋巴系细胞中调控IL-17A信号通路的作用机制 | 首次发现C9orf72通过调控CD80分子运输抑制IL-17A信号通路,为ALS/FTD相关神经炎症提供了新治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究C9orf72基因在免疫细胞中对IL-17A信号通路的调控作用及其在神经炎症中的机制 | 基因敲除小鼠的造血祖细胞、脊髓、大脑皮层和脾脏组织 | 分子免疫学 | 肌萎缩侧索硬化症、额颞叶痴呆 | 条件性基因突变、质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 | 多组织来源的鼠类和人类样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |