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当前共找到 1397 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-08-25 |
sc2MeNetDrug: A computational tool to uncover inter-cell signaling targets and identify relevant drugs based on single cell RNA-seq data
2024-01, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011785
PMID:38181047
|
研究论文 | 开发了一个基于单细胞RNA测序数据的计算工具sc2MeNetDrug，用于识别细胞类型、揭示细胞间信号通讯并预测潜在有效药物。 | 首次专门设计用于基于scRNA-seq数据揭示微环境中的细胞间通讯并预测抑制这些通讯的潜在药物，同时提供用户友好的图形界面以简化复杂分析流程。 | 未提及具体局限性。 | 开发一个开源计算工具，以简化scRNA-seq数据分析，识别疾病微环境中的细胞类型、异常信号通路和细胞间相互作用，并预测可干扰细胞间信号通讯的有效药物。 | 疾病微环境中的细胞，如肿瘤细胞或阿尔茨海默病大脑中的神经元，以及基质细胞和免疫细胞。 | 生物信息学 | 癌症及阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-08-25 |
Single-cell RNA-seq analysis revealed the stemness of a specific cluster of B cells in acute lymphoblastic leukemia progression
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18296
PMID:39465162
|
研究论文 | 利用单细胞RNA-seq分析，揭示急性淋巴细胞白血病进展中特定B细胞群的干性特征及其在免疫微环境中的关键作用 | 首次通过单细胞测序识别出与细胞增殖和干性相关的B细胞亚群（B cells 1），并发现其通过RXRB和MYC等关键转录因子调控肿瘤进展，为ALL靶向治疗提供新方向 | 未提及 | 探索B细胞在急性淋巴细胞白血病进展中的异质性及其对免疫微环境的调节作用 | 儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）样本和健康样本中的B细胞 | 单细胞转录组学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、Transwell实验、划痕愈合实验 | 无特定模型 | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 未明确样本数量，但包含ALL和健康样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于GEO数据库的公共数据，使用Seurat和harmony包分析，CellMarker2.0进行细胞注释 |
| 63 | 2026-08-23 |
Digital spatial profiling of segmental outflow regions in trabecular meshwork reveals a role for ADAM15
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298802
PMID:38394161
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法，鉴定小梁网中与高或低流出区域相关的基因，并发现ADAM15在分段流出中的作用 | 首次将数字空间 profiling 技术应用于小梁网分段流出区域，识别出多个可能与分段流出相关的新基因 | 研究基于器官培养前段，可能不能完全代表体内情况，且样本量有限 | 阐明小梁网分段流出相关的分子机制，特别是基因表达差异 | 人眼前段器官培养组织中的小梁网高、低流出区域 | 空间转录组学 | 青光眼（相关） | 空间转录组学 | NA | 组织切片转录组数据 | 器官培养人眼前段样本（具体数量未提供） | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx数字空间 profiling 平台 |
| 64 | 2026-08-23 |
The use of single-cell RNA-seq to study heterogeneity at varying levels of virus-host interactions
2024-01, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011898
PMID:38236826
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在研究病毒感染异质性中的应用，覆盖从单个病毒颗粒到个体间免疫反应的各个层面，并讨论了关键实验局限性和分析方法。 | 系统性地阐述了scRNA-seq在病毒感染研究中的多尺度应用，从病毒颗粒到宿主免疫反应，并重点强调了不同尺度下的实验设计和方法学决策。 | 指出了scRNA-seq在病毒感染研究中的实验局限性，如低捕获效率、技术噪音、数据分析复杂性等。 | 总结单细胞RNA测序技术在研究病毒感染异质性中的应用，并为相关研究提供方法论指导。 | 病毒感染过程中的病毒群体和宿主细胞群体。 | 单细胞测序、病毒学 | 病毒感染相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据（转录组） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2026-08-23 |
Keystone pathobionts associated with colorectal cancer promote oncogenic reprograming
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0297897
PMID:38363784
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序探究了具核梭杆菌和产肠毒素脆弱拟杆菌对结直肠癌小鼠模型及野生型小鼠上皮和免疫细胞的影响，揭示其促进致癌重编程的机制 | 首次通过单细胞RNA测序在体内模型上比较两种病原体对肠道上皮和免疫微环境的具体作用，发现其诱导癌症干细胞样细胞群并破坏CTL功能 | 主要基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且未深入探究其他潜在病原体 | 阐明具核梭杆菌和产肠毒素脆弱拟杆菌在结直肠癌发生中的具体分子机制及其对上皮和免疫细胞的调控 | 野生型小鼠及结直肠癌小鼠模型的肠道组织细胞 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 无特定模型，应用了小鼠模型（CRC模型） | 单细胞基因表达数据 | 未明确提供小鼠数量，但涉及野生型和CRC模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-08-23 |
BHLHE40 drives protective polyfunctional CD4 T cell differentiation in the female reproductive tract against Chlamydia
2024-01, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011983
PMID:38271477
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子BHLHE40在女性生殖道抗衣原体感染中对CD4 T细胞分化和多功能反应的调控作用。 | 首次揭示BHLHE40在调控女性生殖道内CD4 T细胞多能性分化中的关键作用，通过单细胞RNA测序和TCR分析发现其缺失导致干细胞样T细胞特征富集，抑制了效应功能的分化。 | 研究主要基于小鼠模型，需进一步在人类样本中验证；机制研究可能未完全阐明BHLHE40调控IL-10和T细胞分化的完整信号通路。 | 探究BHLHE40在抗衣原体感染的女性生殖道中对保护性CD4 T细胞分化和功能的作用。 | 小鼠CD4 T细胞，特别是女性生殖道内的T细胞亚群。 | 免疫学 | 衣原体感染 | 单细胞RNA测序、TCR谱分析 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 使用Bhlhe40缺陷小鼠和野生型小鼠，样本数量未明确。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'和V(D)J解决方案 |
| 67 | 2026-08-23 |
Single cell RNA sequencing reveals endothelial cell killing and resolution pathways in experimental malaria-associated acute respiratory distress syndrome
2024-01, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011929
PMID:38236930
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了实验性疟疾相关急性呼吸窘迫综合征中内皮细胞杀伤和消退通路 | 首次利用单细胞RNA测序和MultiNicheNet相互作用分析，详细描述了MA-ARDS消退过程中抗炎通路和内皮细胞增殖的动态变化，为设计辅助治疗提供了新靶点 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类MA-ARDS，且需要进一步探索验证特定的配体-受体相互作用 | 研究疟疾相关急性呼吸窘迫综合征在抗疟治疗后恢复（消退）的机制，特别是内皮细胞的损伤与修复过程 | 感染伯氏疟原虫NK65的C57BL/6小鼠的肺部组织 | 单细胞测序、病理学 | 疟疾相关急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序、微型计算机断层扫描、全身体积描记法 | MultiNicheNet（配体-受体相互作用分析） | 单细胞基因表达数据、影像数据、呼吸功能数据 | 未明确说明具体样本量，涉及感染组和药物处理组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the underlying mechanism of folliculotropism in folliculotropic mycosis fungoides
2024-01, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14992
PMID:38284188
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2026-08-23 |
From womb to wellness: early environmental exposures, cord blood DNA methylation and disease origins
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2390823
PMID:39263926
|
综述 | 本文综述了胎儿期环境暴露如何通过脐带血DNA甲基化影响个体长期健康，并探讨相关技术挑战与未来研究方向。 | 系统整合了母体营养、吸烟和毒素暴露对脐带血甲基化的影响，并展望单细胞测序等新兴技术及个性化医疗前景。 | 技术挑战包括组织特异性问题、现有甲基化芯片覆盖度有限以及细胞组成变异的混杂因素。 | 阐明产前暴露与脐带血表观基因组相互作用，为疾病预防和早期干预提供依据。 | 胎儿脐带血DNA甲基化及其与母体环境暴露的关联。 | 表观遗传学 | 肥胖、神经发育障碍等 | DNA甲基化分析、单细胞测序 | NA | 甲基化数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-08-23 |
Spatial transcriptomics and in situ immune cell profiling of the host ectocervical landscape of HIV infected Kenyan sex working women
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483346
PMID:39687623
|
研究论文 | 通过空间转录组学和原位免疫细胞分析，揭示HIV感染肯尼亚女性性工作者的宫颈外口免疫微环境变化 | 首次结合空间转录组学和MELC技术，全面刻画慢性HIV感染下宫颈外口的免疫景观，揭示组织特异性的免疫激活和结构改变 | 样本量较小且来自特定人群，可能限制结果的普遍性；未进行功能验证实验 | 研究慢性HIV感染对宫颈外口组织免疫景观的影响，揭示局部免疫激活的机制 | 肯尼亚女性性工作者的宫颈外口组织样本，包括HIV血清阳性和阴性个体 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学、MELC、基因集富集分析 | NA | 空间转录组数据、原位蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本量，但为肯尼亚女性性工作者宫颈外口组织样本 | NA | 空间转录组学、MELC | NA | NA |
| 71 | 2026-08-23 |
A new perspective on macrophage-targeted drug research: the potential of KDELR2 in bladder cancer immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1485109
PMID:39691708
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和临床数据，构建膀胱癌RNA转录组图谱，发现KDELR2在膀胱癌免疫治疗中的潜在作用 | 首次揭示KDELR2在膀胱癌中促进细胞增殖、侵袭和迁移，并与巨噬细胞浸润及免疫治疗反应相关 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内验证和临床样本的大规模验证 | 探究膀胱癌的分子靶点，特别是KDELR2在免疫治疗中的潜力 | 膀胱癌细胞系及临床数据 | 基因组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 未知 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-08-23 |
Unique lymphocyte transcriptomic profiles in septic patients with chronic critical illness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1478471
PMID:39691721
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者慢性危重症（CCI）的外周血淋巴细胞转录组，发现T细胞和NK细胞存在耗竭和免疫抑制特征。 | 首次在单细胞水平揭示CCI患者淋巴细胞亚群的独特转录组特征，特别是CD8+ TEM细胞和NK细胞的耗竭状态，并提出急性期IFN-γ产生减少作为早期预测指标。 | 样本量较小，尤其是急性期患者数量有限，可能限制统计效力；功能验证在独立队列中进行，但未进行机制探讨。 | 阐明脓毒症后慢性危重症患者外周血淋巴细胞的转录组特征及其与临床轨迹的关系。 | 脓毒症患者（急性期、快速恢复、CCI）和健康对照者的外周血淋巴细胞。 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序、ELISpot、细胞因子分析、T细胞增殖试验 | NA | 单细胞转录组数据、功能实验数据 | scRNA-seq：健康12例、急性脓毒症4例、快速恢复4例、CCI 5例；功能验证：健康19例、急性脓毒症68例、快速恢复27例、CCI 20例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 73 | 2026-08-21 |
Interleukin 13 Promotes Maturation and Proliferation in Metaplastic Gastroids
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101366
PMID:38815928
|
研究论文 | 本研究建立Meta1胃类器官模型，探究IL-13对化生性SPEM细胞成熟和增殖的促进作用及其分子机制 | 首次建立可靠的Meta1胃类器官模型，并揭示IL-13通过STAT6信号通路促进SPEM细胞成熟与增殖 | 未提及具体局限性 | 阐明IL-13在SPEM细胞成熟和增殖中的分子效应，并建立体外模型 | Mist1-Kras转基因小鼠的化生胃类器官、IL-13-tdTomato报告小鼠的ILC2细胞、人类化生胃类器官 | 分子生物学 | 胃化生 | 单细胞RNA测序、细胞分选、三维共培养、空气-液体界面培养、STAT6抑制 | 类器官模型 | 基因表达数据、细胞图像 | 小鼠类器官及人类化生胃类器官，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台，具体配置未提及 |
| 74 | 2026-08-21 |
Autophagy Contributes to Homeostasis in Esophageal Epithelium Where High Autophagic Vesicle Level Marks Basal Cells With Limited Proliferation and Enhanced Self-Renewal Potential
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.018
PMID:38452871
|
研究论文 | 通过遗传学手段抑制自噬和细胞分选分析，探究自噬在食管上皮稳态维持中的作用 | 首次揭示了高自噬囊泡水平的食管基底细胞具有有限增殖和增强自我更新能力，并利用单细胞RNA测序深入解析了其机制 | 未提供明确的局限性信息 | 明确自噬在食管上皮稳态中的作用 | 食管基底细胞和小鼠食管上皮组织 | 分子生物学 | 食管疾病 | 条件性基因敲除、流式细胞分选、RNA测序、单细胞RNA测序、三维类器官培养 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 使用他莫昔芬诱导的鳞状上皮特异性Atg7条件敲除小鼠，以及分选的Cyto-IDHigh和Cyto-IDLow食管基底细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2026-08-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals different chondrocyte states in femoral cartilage between osteoarthritis and healthy individuals
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1407679
PMID:38868774
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了骨关节炎患者与健康个体股骨软骨中不同的软骨细胞状态 | 发现了两种新的软骨细胞亚型（METRNL+和PRG4+），并提出了新的软骨细胞亚型分类，同时揭示了细胞分化过程中的转录组特征和信号通路变化 | 未在摘要中明确提及局限性 | 比较健康与骨关节炎软骨细胞的类型差异，并探讨这些类型在软骨再生和骨关节炎进展中的作用 | 健康股骨远端软骨和骨关节炎股骨软骨 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、RNA速率分析、拟时间分析、SCENIC、免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据 | 共包含75,104个细胞，分为19个簇和11个软骨细胞亚型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-08-20 |
Single-Cell Histone Modification Profiling with Cell Enrichment Using sortChIC
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4071-5_14
PMID:39141239
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合细胞富集的单细胞组蛋白修饰检测技术sortChIC，用于绘制单细胞中的组蛋白翻译后修饰图谱 | 提出sortChIC技术，将组蛋白修饰定位与基于表面染色的细胞富集相结合，实现对稀有细胞类型的单细胞组蛋白修饰分析 | 未明确说明局限性 | 开发一种灵敏的单细胞方法，用于研究异质性组织中的细胞类型特异性组蛋白修饰动态变化，特别是在稀有细胞类型中 | 组蛋白翻译后修饰，特别是干细胞和祖细胞等稀有细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞染色质免疫切割测序（sortChIC） | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-08-20 |
Integrated temporal transcriptional and epigenetic single-cell analysis reveals the intrarenal immune characteristics in an early-stage model of IgA nephropathy during its acute injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1405748
PMID:39493754
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序，揭示了IgA肾病早期急性损伤模型中肾内免疫细胞的动态特征。 | 首次整合时间序列的单细胞转录组和染色质可及性分析，识别出具有独特表观遗传特征的巨噬细胞亚群（Nlrp1b Mac）和早期T细胞耗竭亚群（CX3CR1-transTeff）。 | 基于小鼠模型，可能无法完全反映人类IgA肾病的复杂性。 | 高分辨率描绘早期IgA肾病小鼠模型急性肾损伤期间的动态免疫细胞景观。 | IgA肾病小鼠模型的肾脏免疫细胞（CD45+）及肾细胞。 | 单细胞组学 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、单细胞ATAC测序（scATACseq） | NA | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | 73个样本（对照组、IS、IA、IR各4-5只小鼠） | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-08-20 |
BCR, not TCR, repertoire diversity is associated with favorable COVID-19 prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1405013
PMID:39530088
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析康复和死亡COVID-19患者在中等和危重阶段的免疫反应，发现BCR库多样性而非TCR库多样性与良好预后相关 | 首次揭示BCR库多样性而非TCR库多样性与COVID-19良好预后相关，并发现康复者与死亡者在蛋白质生物合成和线粒体ATP代谢方面的差异 | 信息未提供 | 探究COVID-19患者康复与死亡过程中免疫反应（尤其是TCR和BCR库特征）的差异 | 康复和死亡的COVID-19患者（处于中等和危重阶段） | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 康复和死亡患者（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-08-19 |
Revealing the association between East Asian oral microbiome and colorectal cancer through Mendelian randomization and multi-omics analysis
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1452392
PMID:39355266
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析揭示东亚口腔微生物组与结直肠癌之间的关联 | 首次结合中国国家基因库和日本生物样本库的数据，利用孟德尔随机化方法鉴定出19个与结直肠癌显著相关的口腔细菌类群，并通过单细胞RNA测序和药物预测提供新的治疗策略 | 基于东亚人群数据，可能不适用于其他人群；孟德尔随机化结果需进一步实验验证 | 探究口腔微生物组与结直肠癌之间的因果关系及其潜在机制 | 2017个舌苔和1915个唾液样本中的微生物组，以及6692例结直肠癌病例和27178例对照的GWAS数据 | 微生物组学 | 结直肠癌 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、多组学分析 | NA | 微生物组数据、GWAS数据、单细胞RNA测序数据 | 2017个舌苔样本、1915个唾液样本、6692例CRC病例和27178例对照 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2026-08-19 |
Single-cell data revealed the function of natural killer cells and macrophage cells in chemotherapy tolerance in acute myeloid leukemia
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18521
PMID:39583114
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析，揭示了自然杀伤细胞和巨噬细胞在急性髓系白血病化疗耐受中的功能 | 首次应用单细胞RNA测序数据综合分析NK细胞和巨噬细胞在AML化疗耐药中的差异表达、分化轨迹及细胞间通讯机制 | 基于公共数据集分析，缺乏体内验证实验，且样本量可能有限 | 探究免疫细胞在AML化疗耐药中的调控机制，为缓解化疗耐药提供新思路 | 急性髓系白血病患者的免疫细胞（NK细胞和巨噬细胞） | 单细胞转录组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |