单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-05-14 |
Cardiac Development at a Single-Cell Resolution
2024, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-44087-8_14
PMID:38884716
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research paper | 该论文利用单细胞RNA测序技术深入研究了哺乳动物心脏发育的复杂过程 | 揭示了心脏发育过程中的时空转录组景观，发现了新的心脏祖细胞群和腔室特异性发育特征 | NA | 探索心脏发育的基本机制及其相关复杂疾病 | 人类和小鼠心脏发育过程中的细胞群 | 基因组学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 62 | 2025-05-14 |
Single-cell RNA sequencing reveals the dysfunctional characteristics of PBMCs in patients with type 2 diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1501660
PMID:39916961
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了2型糖尿病患者外周血单个核细胞的功能失调特征 | 首次利用scRNA-seq技术对T2DM患者PBMCs进行转录组分析，揭示了免疫细胞的异常功能和潜在分子机制 | 样本量较小（仅3名健康参与者和3名T2DM患者），可能影响结果的普遍性 | 探索T2DM患者外周血免疫细胞的功能异常及其分子机制 | 2型糖尿病患者和健康对照者的外周血单个核细胞（PBMCs） | digital pathology | diabetes mellitus | scRNA-seq, Ficoll密度梯度离心法 | NA | RNA-seq数据 | 3名健康参与者和3名T2DM患者 |
| 63 | 2025-05-14 |
Single-cell RNA sequencing highlights the influence of innate and adaptive immune response mechanisms in psoriatic arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1490051
PMID:40084238
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术探索了银屑病关节炎（PsA）患者与健康对照之间以及不同PsA临床表型之间的基因表达差异 | 首次在单细胞水平上比较了伴有和不伴有皮肤银屑病的PsA患者的免疫细胞基因表达谱，揭示了先天和适应性免疫反应机制的差异 | 未发现PsA-only和PsA/PsC患者之间的差异表达基因，样本量相对有限（70例患者和10例对照） | 探索PsA患者不同临床表型与免疫发病机制之间的关联 | 银屑病关节炎患者（70例）和健康对照（10例）的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），BD Rhapsody™单细胞分析系统 | 差异表达分析（DE），基因集富集分析（GSEA） | 单细胞转录组数据 | 80例（70例PsA患者和10例健康对照） |
| 64 | 2025-05-10 |
The cancer-associated fibroblasts interact with malignant T cells in mycosis fungoides and promote the disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1474564
PMID:39963655
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了蕈样肉芽肿（MF）中恶性T细胞与癌症相关成纤维细胞（CAFs）的相互作用及其在疾病进展中的作用 | 揭示了恶性T细胞从TRM主导表型向TCM主导表型的转变过程，以及CAFs通过IL-6/JAK2/STAT3/SOX4或IL-6/HIF-1α/SOX4通路促进恶性T细胞侵袭和转移的机制 | 研究样本来自晚期MF患者，可能无法完全代表早期MF的特征 | 探究蕈样肉芽肿的发病机制及肿瘤微环境在其中的作用 | 晚期蕈样肉芽肿患者及健康对照的肿瘤组织、邻近正常组织和外周血单个核细胞 | 肿瘤微环境研究 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 晚期MF患者和健康对照的肿瘤组织、邻近正常组织和PBMC样本 |
| 65 | 2025-05-08 |
A review of single-cell transcriptomics and epigenomics studies in maternal and child health
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2343276
PMID:38709139
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review | 本文综述了单细胞转录组学和表观基因组学在母婴健康领域的研究 | 总结了16个人类和哺乳动物胎盘的单细胞图谱以及31项关于母体暴露和并发症的单细胞研究 | NA | 综述单细胞测序技术在母婴健康领域的应用 | 人类和哺乳动物胎盘以及母体暴露和并发症 | 单细胞测序 | 母婴健康相关疾病 | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 单细胞测序数据 | 16个单细胞图谱和31项单细胞研究 |
| 66 | 2025-05-08 |
Single-cell RNA sequencing and AlphaFold 3 insights into cytokine signaling and its role in uveal melanoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458041
PMID:39916959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和AlphaFold 3技术，揭示了葡萄膜黑色素瘤（UVM）中的细胞异质性及其与细胞因子信号传导的关系，并鉴定了预后生物标志物 | 首次在UVM中构建了单细胞分辨率的细胞因子反应字典，并利用AlphaFold 3预测关键蛋白的3D结构 | 样本量相对有限，且主要依赖生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 阐明UVM的细胞异质性并鉴定预后生物标志物，为靶向治疗提供依据 | 葡萄膜黑色素瘤（UVM）的原发性和转移性肿瘤样本 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR-Cas9筛选分析、AlphaFold 3 | LASSO回归、ROC曲线分析、Kaplan-Meier生存分析 | RNA-seq数据、蛋白质结构预测数据 | TCGA-UVM和GSE84976队列中的样本 |
| 67 | 2025-05-08 |
Deciphering the role of metal ion transport-related genes in T2D pathogenesis and immune cell infiltration via scRNA-seq and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1479166
PMID:39926598
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和机器学习探索了2型糖尿病（T2D）的发病机制，特别关注免疫细胞浸润 | 结合scRNA-seq和12种机器学习算法，识别了与金属离子转运相关的关键基因，并揭示了它们与免疫细胞的关联 | 研究样本量有限，仅分析了T2D和非糖尿病患者的胰岛细胞数据 | 探索T2D的分子机制，特别是金属离子转运相关基因在疾病中的作用 | T2D和非糖尿病患者的胰岛细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | scRNA-seq, ssGSEA, PPI网络分析 | Stepglm[backward] plus GBM | RNA测序数据 | T2D和ND患者的胰岛细胞数据 |
| 68 | 2025-05-08 |
Single-cell sequencing uncovers the mechanistic role of DAPK1 in glioma and its diagnostic and prognostic implications
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1463747
PMID:39926603
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究DAPK1在胶质瘤中的机制作用及其诊断和预后意义 | 利用单细胞RNA测序数据识别与生存相关的基因簇，并开发基于DAPK1的预后模型 | DAPK1在胶质瘤中的具体机制尚未完全阐明 | 开发基于DAPK1的预后标志物以预测胶质瘤患者的预后 | 胶质瘤患者 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA-seq, 微阵列 | LASSO, 逐步回归算法 | RNA-seq数据, 微阵列数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA和GEO的胶质瘤患者数据 |
| 69 | 2025-05-08 |
Single-cell RNA sequencing revealed PPARG promoted osteosarcoma progression: based on osteoclast proliferation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506225
PMID:39936154
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究PPARG在促进骨肉瘤进展中的作用，重点关注破骨细胞增殖 | 首次在单细胞水平上识别出C2MKI67+破骨细胞亚群，并发现PPARG作为关键转录因子在破骨细胞增殖和分化中的重要作用 | 研究主要基于单细胞测序数据的分析，需要进一步的体内外实验验证 | 寻找新的骨肉瘤治疗靶点以阻止肿瘤进展和局部扩散 | 骨肉瘤患者和破骨细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RT-qPCR, CCK-8实验, 伤口愈合实验, Transwell实验 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 70 | 2025-05-08 |
Serum and tear autoantibodies from NOD and NOR mice as potential diagnostic indicators of local and systemic inflammation in Sjögren's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1516330
PMID:39936155
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研究论文 | 研究通过分析NOD和NOR小鼠的血清和泪液自身抗体，探讨其在干燥综合征（SjD）相关局部和全身炎症中的潜在诊断价值 | 首次在两种SjD小鼠模型中系统比较了血清和泪液自身抗体的差异，并发现泪液IgA同型自身抗体比IgG更具多样性 | 研究仅使用雄性小鼠模型，可能无法完全反映人类SjD的性别差异特征 | 探索干燥综合征相关自身抗体的诊断标志物 | NOD和NOR小鼠的泪腺组织、血清和泪液样本 | 自身免疫疾病研究 | 干燥综合征 | 免疫荧光、自身抗体微阵列、scRNA-Seq | NOD和NOR小鼠模型 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 两种SjD小鼠模型（具体数量未明确说明）与健康BALB/c小鼠对照 |
| 71 | 2025-05-07 |
Characterizing tumor biology and immune microenvironment in high-grade serous ovarian cancer via single-cell RNA sequencing: insights for targeted and personalized immunotherapy strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1500153
PMID:39896800
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究高级别浆液性卵巢癌的肿瘤生物学特性及免疫微环境，为靶向和个性化免疫治疗策略提供见解 | 利用单细胞RNA测序技术系统研究HGSOC的肿瘤异质性和免疫微环境，发现与不良预后相关的C2 IGF2+肿瘤细胞亚型及其与肿瘤进展的关联 | 研究依赖于公开数据库的scRNA-seq数据，可能受限于样本量和数据质量 | 揭示HGSOC进展和治疗抵抗的分子机制，开发更有效的个性化治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）的肿瘤细胞亚型及其免疫微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 |
| 72 | 2025-05-07 |
Elucidating the causal associations and mechanisms between circulating immune cells and idiopathic pulmonary fibrosis: new insights from Mendelian randomization and transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1437984
PMID:39896814
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组学分析，探讨循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及潜在生物标志物 | 结合孟德尔随机化和转录组学数据，首次系统性地研究了免疫细胞表型与IPF的因果关系，并鉴定了三个新的生物标志物 | 研究依赖于公开数据库的GWAS数据，可能存在样本选择偏倚 | 阐明循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及机制 | 循环免疫细胞表型和特发性肺纤维化患者 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 孟德尔随机化分析、转录组学分析、单细胞RNA测序 | IVW等五种孟德尔随机化方法 | 基因组关联研究数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自公开数据库的GWAS数据和IPF患者样本 |
| 73 | 2025-05-07 |
Novel pyroptosis-immune-related lncRNA signature exhibits a distinct immune cell infiltration landscape in breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522327
PMID:39906743
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研究论文 | 本研究通过分析焦亡和免疫相关的长链非编码RNA（lncRNA），构建了一个六-lncRNA特征，用于预测乳腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次构建了一个结合焦亡和免疫相关lncRNA的特征，用于预测乳腺癌预后和免疫治疗反应，并揭示了不同的免疫细胞浸润模式 | 研究依赖于TCGA数据集，需要进一步的外部验证 | 识别乳腺癌的潜在治疗靶点，并预测患者的预后和免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | Pearson相关系数、单变量Cox回归分析、LASSO方法、单细胞测序 | 六-lncRNA特征模型 | RNA-seq数据、单细胞测序数据 | TCGA数据集中的乳腺癌患者样本 |
| 74 | 2025-05-07 |
Immune regulatory genes impact the hot/cold tumor microenvironment, affecting cancer treatment and patient outcomes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382842
PMID:39911580
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研究论文 | 研究通过分析肿瘤微环境中的免疫基因，区分热/冷肿瘤，并探索其对癌症治疗和患者预后的影响 | 开发了一个框架来区分不同癌症类型中具有临床意义的免疫亚型，并确定了几个潜在靶点用于将冷肿瘤转化为热肿瘤以提高抗癌治疗效果 | 尚未就热/冷肿瘤的临床相关定义达成共识，且免疫基因对热/冷肿瘤形成的影响仍知之甚少 | 探索免疫调控基因如何影响肿瘤微环境，从而影响癌症治疗和患者预后 | 33种不同类型的癌症数据，以及胰腺腺癌临床队列 | 肿瘤免疫学 | 多种癌症（包括膀胱尿路上皮癌、胰腺腺癌和宫颈鳞状细胞癌） | CIBERSORT算法、基因集变异分析、单细胞RNA测序、多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、免疫组织化学数据 | 来自The Cancer Genome Atlas数据库的33种癌症数据，以及胰腺腺癌临床队列 |
| 75 | 2025-05-04 |
Heterogeneity and synaptic plasticity analysis of hippocampus based on db-/- mice induced diabetic encephalopathy
2024-01, Psychoneuroendocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.psyneuen.2023.106412
PMID:37898037
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析了糖尿病脑病模型中海马细胞的异质性和突触可塑性变化 | 首次在糖尿病认知障碍模型中构建了海马区单细胞转录图谱，发现了5个独特的少突胶质前体细胞亚群及其标记基因 | 研究仅基于db/db小鼠模型，结果向人类糖尿病脑病的推广需要进一步验证 | 探究长期高血糖状态下海马细胞异质性及其与认知功能障碍的关系 | db/db糖尿病小鼠模型的海马组织细胞 | 神经科学 | 糖尿病脑病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，新物体识别(NOR)行为测试 | db/db小鼠糖尿病模型 | 单细胞转录组数据 | 实验组21,379个细胞，对照组20,045个细胞 |
| 76 | 2025-05-04 |
Single-cell mitophagy patterns within the tumor microenvironment modulate intercellular communication, impacting the progression and prognosis of hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1448878
PMID:39835122
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析肝细胞癌肿瘤微环境中的线粒体自噬模式，探讨其对细胞间通讯及患者预后的影响 | 首次在单细胞水平揭示肝细胞癌肿瘤微环境中线粒体自噬的异质性模式及其与细胞通讯的关系 | 未证实线粒体自噬对免疫治疗效果的直接影响 | 探究肝细胞癌肿瘤微环境中线粒体自噬的细胞特异性模式及其临床意义 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境细胞 | 肿瘤微环境研究 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, NMF聚类, CellChat, Monocle, SCENIC | NA | 单细胞转录组数据 | 来自肝细胞癌患者的25,189个细胞 |
| 77 | 2025-05-04 |
Single-cell sequencing analysis reveals cancer-associated pericyte subgroup in esophageal squamous cell carcinoma to predict prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1474673
PMID:39835116
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research paper | 通过单细胞测序分析揭示了食管鳞状细胞癌中与癌症相关的周细胞亚群，用于预测预后 | 识别了六种周细胞亚型，并发现其中两种亚型与预后显著相关，为免疫治疗提供了新的靶点 | 研究仅基于转录组数据，未深入探讨这些亚型在肿瘤微环境中的具体作用机制 | 探究食管鳞状细胞癌中癌症相关周细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 食管鳞状细胞癌中的癌症相关周细胞 | digital pathology | esophageal squamous cell carcinoma | scRNA-seq, Bulk RNA-seq, 多重免疫荧光, 药物预测与分子对接 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 大样本单细胞转录组测序数据 |
| 78 | 2025-05-04 |
Single-cell transcriptome atlas of peripheral immune features to Omicron breakthrough infection under booster vaccination strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460442
PMID:39835127
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和T细胞/B细胞受体测序，分析了加强疫苗接种策略下Omicron突破感染的免疫特征 | 揭示了Omicron突破感染后免疫细胞的I型干扰素通路激活、T和B淋巴细胞的分化特征以及TCR/BCR克隆扩增的模式，并发现第四剂雾化Ad5-nCoV疫苗可能诱导'训练免疫'现象 | 样本量较小（15例PBMC样本），且仅针对特定疫苗（Ad5-nCoV）的效果进行了观察 | 探究加强疫苗接种策略下Omicron突破感染的免疫特征 | 外周血单个核细胞（PBMC） | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序、TCR/BCR测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15例PBMC样本（来自Omicron感染者和未感染的疫苗接种者） |
| 79 | 2025-05-04 |
Single-cell RNA sequencing and immune microenvironment analysis reveal PLOD2-driven malignant transformation in cervical cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522655
PMID:39840054
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫微环境分析，揭示了PLOD2在宫颈癌恶性转化中的作用 | 鉴定了宫颈癌中的8种细胞类型和5种恶性上皮细胞亚群，建立了NNMT CAEPCs风险评分（NCRS）模型，并验证了PLOD2作为预后基因的重要性 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证部分仅限于体外实验 | 探索宫颈癌肿瘤微环境，寻找潜在治疗靶点 | 宫颈癌恶性上皮细胞（EPCs）及其亚群 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NCRS模型 | RNA测序数据 | 来自UCSC和ArrayExpress数据库的数据 |
| 80 | 2025-05-04 |
Targeting immune cellular populations and transcription factors: unraveling the therapeutic potential of JQF for NAFLD
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1445924
PMID:39840059
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研究论文 | 本研究探讨了降糖清热方（JQF）对非酒精性脂肪肝病（NAFLD）的治疗潜力及其作用机制 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示JQF通过调节特定免疫细胞亚群和转录因子发挥治疗作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探索JQF对NAFLD的治疗机制 | 高脂饮食诱导的NAFLD小鼠模型 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 组织病理学数据 | NAFLD小鼠模型（具体数量未说明） |