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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Retinal microglia express more MHC class I and promote greater T-cell-driven inflammation than brain microglia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1399989
PMID:38799448
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术比较了视网膜和脑部小胶质细胞的转录组差异 | 首次发现视网膜小胶质细胞比脑部小胶质细胞表达更多MHC I类分子,并具有更强的促进T细胞驱动炎症的能力 | 研究仅使用小鼠模型,样本量有限(20只眼和3个脑组织) | 探究视网膜和脑部小胶质细胞因微环境差异导致的转录组和功能差异 | 2-4月龄野生型小鼠的视网膜和脑部小胶质细胞 | 单细胞生物学 | 病毒感染和自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,多参数流式细胞术,淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染模型 | NA | 单细胞基因表达数据,流式细胞数据 | 20只眼睛和3个脑组织来自2-4月龄野生型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
Gradient boosting reveals spatially diverse cholesterol gene signatures in colon cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1410353
PMID:39678375
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研究论文 | 本研究通过梯度提升模型识别结肠癌中与胆固醇代谢相关的空间多样化基因特征 | 首次将XGBoost模型应用于胆固醇代谢基因分析,并发现关键基因ADCY5和SLC2A1在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 研究样本仅限于TCGA数据库,缺乏外部验证队列 | 评估胆固醇代谢与结肠癌预后的关系并识别关键预后基因 | 结肠腺癌患者的肿瘤和癌旁正常组织样本 | 生物信息学 | 结肠癌 | 差异基因分析,KEGG通路分析,空间转录组学,免疫组织化学 | XGBoost,Cox比例风险模型,随机森林,Lasso回归 | 基因表达数据,空间转录组数据,蛋白质表达数据 | TCGA结肠腺癌项目的配对肿瘤和癌旁样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) deletion in myeloid cells augments cholestatic liver injury
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52710-3
PMID:38273071
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研究论文 | 本研究探讨骨髓细胞中TRAIL缺失对胆汁淤积性肝损伤的影响 | 首次揭示骨髓细胞来源的TRAIL通过限制胆管反应细胞扩张来减轻胆汁淤积性肝损伤 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 阐明TRAIL在胆汁淤积性肝损伤中的保护机制 | 野生型、Trail缺失和骨髓特异性Trail缺失的C57BL/6小鼠 | 肝脏病理学 | 胆汁淤积性肝病 | 高维质谱流式细胞术、空间转录组学、原位杂交 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、组织学数据 | 多组基因工程小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals STAT1 Drives LHPP Downregulation in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241293485
PMID:39497541
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了STAT1通过下调LHPP表达在食管鳞状细胞癌进展中的核心调控作用 | 首次发现STAT1对LHPP的转录调控关系,揭示了ESCC中复杂的调控环路 | 样本量相对有限(21例患者),需要更大规模研究验证 | 探索食管鳞状细胞癌的分子机制和细胞动态,重点关注STAT1与LHPP的调控关系 | 食管鳞状细胞癌患者组织样本和细胞系 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21例ESCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Applications of single-cell RNA sequencing in rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491318
PMID:39600707
|
综述 | 探讨单细胞RNA测序技术在类风湿关节炎研究中的应用与前景 | 系统阐述单细胞RNA测序技术在解析类风湿关节炎细胞异质性和分子机制中的创新应用价值 | 成本较高、低丰度转录本检测灵敏度不足、数据分析流程相对复杂 | 探索单细胞RNA测序在自身免疫疾病研究中的应用潜力 | 类风湿关节炎 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
Unique lymphocyte transcriptomic profiles in septic patients with chronic critical illness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1478471
PMID:39691721
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者淋巴细胞转录组特征,揭示慢性危重症患者特有的免疫细胞变化模式 | 首次在单细胞水平系统描述脓毒症后慢性危重症患者淋巴细胞群体的转录组特征,发现CD8+效应记忆T细胞和NK细胞的耗竭特征 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究脓毒症后不同临床轨迹患者的免疫细胞转录组特征 | 健康受试者、急性期脓毒症患者、快速康复患者和慢性危重症患者 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, ELISpot, 细胞因子分析, T细胞增殖实验 | NA | 单细胞转录组数据, 功能验证数据 | scRNA-seq: 12名健康人+4名急性期+4名快速康复+5名CCI;功能验证: 19名健康人+68名急性期+27名快速康复+20名CCI | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
Current state and future prospects of spatial biology in colorectal cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1513821
PMID:39711954
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综述 | 本文综述了空间生物学技术在结直肠癌研究中的最新进展、应用挑战及未来发展方向 | 系统评估空间转录组学和空间蛋白质组学在解析结直肠癌肿瘤微空间结构中的创新应用价值 | 当前方法存在组织异质性挑战,缺乏有效管理复杂数据集的计算工具 | 探讨空间生物学技术在结直肠癌精准医疗策略中的应用前景 | 结直肠癌肿瘤微环境及其空间组织结构 | 空间生物学 | 结直肠癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
Computational discovery of co-expressed antigens as dual targeting candidates for cancer therapy through bulk, single-cell, and spatial transcriptomics
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae096
PMID:39872360
|
研究论文 | 开发计算流程发现共表达抗原对作为癌症治疗的双特异性抗体靶点 | 结合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学优势,克服单一方法的局限性 | 研究聚焦于肝细胞癌,在其他癌症类型中的适用性需进一步验证 | 开发计算流程识别癌症特异性共表达抗原对用于双特异性抗体治疗 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞和正常细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 计算流程 | 转录组数据 | bulk RNA-seq数据库OCTAD,单细胞RNA-seq包含39,361个健康细胞和18,000个HCC肿瘤细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Technology Landscape in 2023
2024-01-13, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad077
PMID:37934608
|
综述 | 本文综述了2023年单细胞RNA测序技术发展现状及其在干细胞研究中的应用 | 系统梳理了单细胞RNA测序技术分类、比较优势及最新技术发展格局 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于技术现状描述 | 概述单细胞RNA测序技术发展现状与技术挑战 | 单细胞RNA测序技术方法 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基于液滴、平板、水凝胶和空间转录组学等多种技术平台 |
| 70 | 2025-10-06 |
Involvement of S100A6/S100A11 in T-Cell Immune Regulatory in HCC Revealed by Single Cell RNA-seq
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241252610
PMID:38766816
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示S100A6/S100A11在肝细胞癌T细胞免疫调控中的作用机制 | 首次发现S100A6/S100A11在肿瘤T细胞中差异表达并通过NF-κB通路影响肿瘤微环境 | 未明确说明样本数量和研究队列的具体特征 | 探究S100蛋白家族在肝细胞癌免疫细胞中的作用机制 | 肝细胞癌和乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 时序细胞轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Updates in Skin Cancer in Transplant Recipients and Immunosuppressed Patients: Review of the 2022-2023 Scientific Symposium of the International Immunosuppression and Transplant Skin Cancer Collaborative
2024, Transplant international : official journal of the European Society for Organ Transplantation
IF:2.7Q2
DOI:10.3389/ti.2024.12387
PMID:38562207
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综述 | 总结2022年国际免疫抑制与移植皮肤癌协作组科学研讨会关于移植受者和免疫抑制患者皮肤癌的最新研究进展 | 汇集了皮肤癌在免疫抑制人群中的最新研究成果,包括化学预防、免疫抑制方案、免疫治疗和空间转录组学等前沿领域 | NA | 回顾和总结移植受者和长期免疫抑制患者皮肤癌研究领域的最新科学进展 | 实体器官移植受者和其他形式长期免疫抑制患者 | NA | 皮肤癌 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment of small cell lung cancer-associated malignant pleural effusion
2024-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15145
PMID:38010064
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示小细胞肺癌相关恶性胸腔积液的肿瘤免疫微环境特征 | 首次在SCLC-MPE中应用单细胞转录组测序分析肿瘤免疫微环境 | 仅基于单一样本分析,样本量有限 | 揭示小细胞肺癌恶性胸腔积液的免疫微环境特征 | 小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8008个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞转录组测序技术 |
| 73 | 2025-10-06 |
Macrophage Dysfunction in Respiratory Disease
2024, Results and problems in cell differentiation
DOI:10.1007/978-3-031-65944-7_9
PMID:39406908
|
综述 | 本文探讨肺巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制 | 整合谱系追踪和单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞在肺部疾病中的代谢特征和线粒体活性变化 | 未涉及具体实验验证和临床干预研究 | 解析巨噬细胞功能障碍在呼吸系统疾病发病机制中的作用 | 肺巨噬细胞(包括肺泡巨噬细胞和组织驻留细胞) | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Diverse contribution of amniogenic somatopleural cells to cardiovascular development: With special reference to thyroid vasculature
2024-01, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.532
PMID:36038963
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研究论文 | 本研究探讨了羊膜生成体壁细胞在心血管发育中的多样化贡献,特别关注甲状腺血管系统的形成 | 首次发现羊膜生成体壁细胞不仅形成羊膜,还迁移入胚胎分化为多种心血管细胞类型,并揭示其在甲状腺血管形成中的特异性作用 | iASCs的详细分化过程和最终分布仍不完全清楚 | 阐明羊膜生成体壁细胞在心血管发育中的作用机制 | 鹌鹑-鸡嵌合体胚胎中的羊膜生成体壁细胞 | 发育生物学 | 心血管发育异常 | 单细胞转录组分析, 嵌合体分析, 外植体培养 | NA | 基因表达数据, 细胞分布数据 | 鹌鹑-鸡嵌合体胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics identifies candidate stromal drivers of benign prostatic hyperplasia
2024-01-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176479
PMID:37971878
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研究论文 | 通过空间转录组学识别良性前列腺增生中潜在的基质驱动因子 | 首次结合激光显微切割与空间转录组学技术定位BPH基质中的关键分泌因子,验证了IGF1和CXCL13在基质-上皮相互作用中的功能 | 研究仅部分支持历史假说,未完全阐明所有驱动BPH的分子机制 | 探究良性前列腺增生的基质驱动机制 | 良性前列腺增生患者的前列腺组织及体外培养的BPH-1细胞球体和患者来源类器官 | 空间转录组学 | 前列腺增生 | 激光显微切割,空间转录组学,RNA原位杂交,3D细胞培养 | NA | 空间转录组数据,RNA表达数据,组织图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
Integrin β1-rich extracellular vesicles of kidney recruit Fn1+ macrophages to aggravate ischemia-reperfusion-induced inflammation
2024-01-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169885
PMID:38258908
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研究论文 | 通过多组学分析揭示肾脏缺血再灌注损伤中近端肾小管细胞通过整合素β1丰富的细胞外囊泡招募Fn1+巨噬细胞加剧炎症反应的分子机制 | 首次系统分析IRI微环境中EV携带蛋白介导的细胞间通讯,发现整合素β1富集的EV在招募Fn1+巨噬细胞和放大炎症反应中的关键作用 | 缺乏对EV分泌阻断剂GW4869作用机制的深入探讨,研究主要聚焦早期IRI阶段的细胞通讯 | 阐明肾脏缺血再灌注损伤中近端肾小管细胞与单核吞噬细胞间的细胞通讯机制 | 小鼠肾脏组织、近端肾小管细胞、单核吞噬细胞(特别是Fn1+巨噬细胞) | 分子生物学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 蛋白质谱分析, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
Multiomics characterization of breast angiosarcoma from an Asian cohort reveals enrichment for angiogenesis signaling pathway and tumor-infiltrating macrophages
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1515935
PMID:39872529
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研究论文 | 本研究通过多组学方法对亚洲人群乳腺血管肉瘤进行分子特征分析,揭示了血管生成信号通路和肿瘤浸润巨噬细胞的富集 | 首次在亚洲人群中系统描述乳腺血管肉瘤的分子特征,并通过空间转录组学揭示肿瘤微环境中免疫细胞分布 | 样本量较小(16例乳腺血管肉瘤),且为单中心研究 | 阐明亚洲人群乳腺血管肉瘤的临床特征和分子机制 | 176例血管肉瘤患者,其中16例乳腺血管肉瘤和104例头颈部血管肉瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全基因组测序, 基因表达谱分析, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 基因表达数据, 空间转录组数据 | 176例血管肉瘤患者(16例乳腺血管肉瘤,104例头颈部血管肉瘤) | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学, 基因表达谱分析 | 10x Visium, NanoString nCounter | 10x Visium空间转录组技术,NanoString基因表达分析系统 |
| 78 | 2025-10-06 |
Identification of immune-related gene signatures for chronic obstructive pulmonary disease with metabolic syndrome: evidence from integrated bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-01-29, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad043
PMID:37878760
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研究论文 | 通过整合批量和单细胞RNA测序数据识别慢性阻塞性肺疾病合并代谢综合征的免疫相关基因标志物 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别出13个COPD与MetS共有的免疫相关枢纽基因,并发现肺泡巨噬细胞中活性氧的潜在关键作用 | 研究基于公共数据集,需要进一步实验验证枢纽基因的功能机制 | 识别慢性阻塞性肺疾病合并代谢综合征的共享免疫相关生物标志物 | 慢性阻塞性肺疾病和代谢综合征患者 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习 | WGCNA, 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Utilization of donor CLL-1 CAR-T cells for the treatment of relapsed of acute myeloid leukemia following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491341
PMID:39896798
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研究论文 | 评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗异基因造血干细胞移植后复发急性髓系白血病的疗效和安全性 | 首次在临床试验中评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗移植后复发AML的疗效,并使用单细胞RNA测序分析CAR-T细胞动态 | 样本量较小(仅12例患者),缺乏对照组 | 评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗移植后复发AML的疗效和安全性 | 异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病患者 | 细胞治疗 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,CAR-T细胞治疗 | NA | 临床数据,单细胞测序数据 | 14例入组患者,12例完成治疗 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Advances in epigenetic studies of plant cadmium stress
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1489155
PMID:40520647
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综述 | 本文综述了植物对镉胁迫的表观遗传响应机制研究进展 | 整合基因组学、单细胞测序和空间转录组学等先进技术研究植物镉胁迫表观遗传机制 | NA | 为分析主要作物重金属胁迫的表观遗传机制提供理论见解 | 植物 | 植物表观遗传学 | NA | 基因组学, 单细胞测序, 空间转录组学, 表观基因组学 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |