单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1298 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2024-08-05 |
Characterization of Cell Type Abundance and Gene Expression Timeline from Burned Skin Bulk Transcriptomics by Deconvolution
2024-01-05, Journal of burn care & research : official publication of the American Burn Association
IF:1.5Q3
DOI:10.1093/jbcr/irad178
PMID:37956340
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研究论文 | 本研究探讨了热损伤皮肤中细胞异质性及基因表达时间线。 | 提出了一种通过解卷积技术分析皮肤大规模转录组数据来识别不同细胞类型的丰度和基因表达的时间进程。 | 尚未建立热损伤皮肤细胞异质性的全面时间线。 | 研究热损伤后皮肤中细胞类型丰度及基因表达的变化。 | 重点分析了中性粒细胞、巨噬细胞、内皮细胞和其他皮肤细胞在烧伤后的表现。 | 数字病理学 | NA | CIBERSORTx解卷积 | NA | 转录组数据 | 使用了独立的正常皮肤和外周血单细胞RNA测序数据集 |
| 762 | 2024-08-04 |
KHDRBS1 as a novel prognostic signaling biomarker influencing hepatocellular carcinoma cell proliferation, migration, immune microenvironment, and drug sensitivity
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1393801
PMID:38660302
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研究论文 | 本研究探讨了KHDRBS1在肝细胞癌发展中的作用及其作为预后信号生物标志物的潜力 | 发现KHDRBS1在肝细胞癌中的促肿瘤作用，并揭示了其在肿瘤进展中的临床意义 | 缺乏更广泛的临床试验数据来验证KHDRBS1作为治疗靶点的有效性 | 研究KHDRBS1在肝细胞癌中的表达模式及其对癌症细胞增殖和迁移的影响 | 针对肝细胞癌中的KHDRBS1阳性和阴性恶性细胞进行分析 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据、临床样本 | 来自公共数据库的多队列数据和临床样本 |
| 763 | 2024-08-04 |
Integration of bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq constructs: a cancer-associated fibroblasts-related signature to predict prognosis and therapeutic response in clear cell renal cell carcinoma
2024, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/VCCZ1477
PMID:38715811
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研究论文 | 本研究提出了一种与癌症相关的成纤维细胞特征，以预测透明细胞肾细胞癌的预后和治疗反应 | 文章创新性在于结合了大规模RNA测序和单细胞RNA测序，识别并验证了预测预后和治疗反应的成纤维细胞相关基因特征 | 文章未提供不同肿瘤类型间的比较，且需要在更大样本上验证CRG特征的有效性 | 研究透明细胞肾细胞癌患者的预后和治疗响应的预测方法 | 研究癌症相关成纤维细胞及其在透明细胞肾细胞癌中的作用 | 数字病理学 | 透明细胞肾细胞癌 | RNA-seq | 加权相关网络分析 | 基因表达数据 | 涉及TCGA肿瘤样本和ccRCC细胞系 |
| 764 | 2024-08-05 |
Comprehensive Analysis of the Immunosuppressive Function of Regulatory T Cells in Human Hepatocellular Carcinoma Tissues
2024 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748241251580
PMID:38712609
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研究论文 | 本文对人类肝细胞癌组织中的调节性T细胞的免疫抑制功能进行了综合分析 | 建立了一种基于Treg相关基因组的预后模型，并揭示了Tregs在HCC中的独特作用及其与其他免疫细胞的相互作用 | 研究主要基于现有的转录组数据，尚需更多临床验证 | 探讨调节性T细胞在肝细胞癌患者中的作用及其对治疗效果的影响 | 重点研究肝细胞癌患者组织中的调节性T细胞及其免疫调节机制 | 数字病理学 | 肝癌 | 多色荧光免疫组织化学(mIHC)和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 组织样本和转录组数据 | 涉及肝细胞癌组织样本和相关数据集的多样本分析 |
| 765 | 2024-08-05 |
From G1 to M: a comparative study of methods for identifying cell cycle phases
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad517
PMID:38261342
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综述 | 本文深入探讨了单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中识别细胞周期阶段的标准流程以及几种代表性方法的比较 | 提出了一种误差函数，并利用多个基准数据集评估不同方法的准确性，突出了参考数据与被分析数据集的适配性对细胞周期阶段识别方法有效性的影响 | 该研究主要集中在已有的识别方法的比较上，可能未涵盖所有现有技术或方法的局限性 | 研究单细胞RNA测序数据中细胞周期阶段的识别方法及其准确性 | 多种细胞周期阶段识别方法及其在不同数据集中的表现 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | 多个包含人类和小鼠的数据集 |
| 766 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics and Mendelian randomization reveal LUCAT1's role in right-sided colorectal cancer risk
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1357704
PMID:38711918
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研究论文 | 这项研究探讨了单细胞转录组学和孟德尔随机化对右侧结直肠癌风险中LUCAT1作用的研究 | 确认了LUCAT1与右侧结直肠癌风险之间的潜在因果关系 | 未提及限制性因素 | 研究右侧结直肠癌的病理机制 | 对左侧和右侧结直肠癌的细胞级差异进行分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 孟德尔随机化 | 基因组数据 | NA |
| 767 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Integrated analysis of single-cell RNA-seq and chipset data unravels PANoptosis-related genes in sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1415915
PMID:38715603
|
更正 | 这篇文章更正了之前的研究内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 768 | 2024-08-05 |
Unveiling novel insights in acute myeloid leukemia through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1365330
PMID:38711849
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在急性髓系白血病中的新发现 | 通过单细胞RNA测序技术洞察了急性髓系白血病的复杂性和异质性，以及AML细胞与免疫细胞和骨髓微环境之间的相互作用 | 文章强调了单细胞RNA测序在急性髓系白血病领域的当前局限性和未来方向 | 研究急性髓系白血病的病理机制和治疗潜力 | 急性髓系白血病细胞及其微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 769 | 2024-08-05 |
Identification of a distinct cluster of GDF15high macrophages induced by in vitro differentiation exhibiting anti-inflammatory activities
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1309739
PMID:38655264
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研究论文 | 本文研究了在体外分化中诱导的GDF15high巨噬细胞的特征及其抗炎活性 | 本研究首次识别出一种GDF15high巨噬细胞亚群，并揭示其独特的分子特征和抗炎功能 | 无法排除体外诱导协议对GDF15high巨噬细胞抗炎表型的影响 | 探讨GDF15high巨噬细胞的身份及其在炎症反应中的角色 | 来源于人外周血单核细胞和大鼠骨髓单核细胞的GDF15high巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | NA | 约1%的人外周血单核细胞和大鼠骨髓单核细胞中带有GDF15high表型的细胞 |
| 770 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Integrative single-cell RNA sequencing and metabolomics decipher the imbalanced lipid-metabolism in maladaptive immune responses during sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1418495
PMID:38711509
|
更正 | 这篇文章是对先前发表文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 771 | 2024-08-05 |
Alteration of Thyroid Hormones in Mouse Models of Alzheimer's Disease and Aging
2024, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000536089
PMID:38228117
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病和衰老小鼠模型中甲状腺激素的变化 | 本研究首次揭示了免疫细胞浸润与甲状腺激素变化之间的潜在机制 | 研究仅限于小鼠模型，临床应用需要进一步验证 | 探讨甲状腺激素与阿尔茨海默病及衰老之间的关系 | FAD4T小鼠模型和自然衰老小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | FAD4T小鼠和自然衰老小鼠的甲状腺样本 |
| 772 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals a pathogenic role of cytotoxic CD4+ T cells in giant cell arteritis
2024-01, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103124
PMID:37952293
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研究论文 | 本研究揭示了细胞毒性CD4+ T细胞在巨细胞动脉炎中的致病作用 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体谱分析深入探讨了CD4 T细胞在巨细胞动脉炎中的作用 | 研究可能受到样本大小限制，仅包括八名巨细胞动脉炎患者和八名健康对照 | 进一步阐明CD4 T细胞在巨细胞动脉炎中的角色 | 114,799个循环CD4 T细胞来源于活动性和缓解期的巨细胞动脉炎患者与健康对照 | 数字病理学 | 巨细胞动脉炎 | 单细胞RNA测序和T细胞受体谱分析 | NA | 细胞数据 | 114,799个CD4 T细胞，来自8名巨细胞动脉炎患者和8名健康对照 |
| 773 | 2024-08-05 |
Predicting mitophagy-related genes and unveiling liver endothelial cell heterogeneity in hepatic ischemia-reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1370647
PMID:38694511
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的作用 | 该研究识别了8个关键基因并建立了基于这些基因的诊断模型，揭示了内皮细胞的异质性 | 研究仅基于有限的样本和单细胞数据分析，可能需要更广泛的验证 | 探究线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的重要性 | 研究对象包括44个肝脏缺血再灌注损伤样本及44个正常对照样本 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 44个肝脏缺血再灌注损伤样本和44个正常对照样本 |
| 774 | 2024-08-05 |
The bone marrow of mouse-rat chimeras contains progenitors of multiple pulmonary cell lineages
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1394098
PMID:38694819
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研究论文 | 本研究使用小鼠-大鼠嵌合体以增强骨髓中的呼吸道前体细胞，以研究其在放射性肺损伤后的贡献 | 使用小鼠-大鼠嵌合体创造了一个独特的骨髓细胞移植模型，能够提供多种呼吸道细胞类型的前体 | 研究主要集中在小鼠模型中，尚未在临床转化中验证其有效性 | 探讨小鼠-大鼠嵌合体中骨髓细胞对放射性肺损伤的修复作用 | 小鼠-大鼠嵌合体的骨髓细胞及其对放射性肺损伤小鼠的贡献 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 造模用小鼠-大鼠嵌合体的骨髓细胞和致死性放射照射小鼠 |
| 775 | 2024-08-04 |
Miracula polaris - A New Species of Miracula from the East Fjords of Iceland
2024, Mycobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/12298093.2024.2333611
PMID:38690034
|
research paper | 本研究在冰岛东峡湾发现了一种新物种Miracula polaris。 | 发现了新的寄生生物Miracula polaris，扩展了对早分支卵菌类多样性的理解。 | 研究未深入探讨与已知物种之间的关联性，可能存在未知物种。 | 调查冰岛东峡湾的早分支卵菌类的多样性。 | 研究了寄生在海洋硅藻属中的新寄生物种。 | NA | NA | 分子系统发育学和形态特征分析 | NA | 环境测序数据 | 在冰岛东峡湾的研究站进行了取样，具体样本数量未说明 |
| 776 | 2024-08-05 |
Coupled scRNA-seq and Bulk-seq reveal the role of HMMR in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363834
PMID:38633247
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研究论文 | 本研究揭示了HMMR在肝细胞癌中的作用，强调其作为诊断和治疗标志物的潜力 | 首次表明HMMR在肝细胞癌中的高表达与肿瘤免疫微环境和预后相关 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，临床应用尚需进一步验证 | 探讨HMMR在肝细胞癌中的角色及其作为潜在分子标志物的可行性 | HMMR在肝细胞癌组织与正常组织的表达及其对HCC细胞增殖和迁移的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | qRT-PCR, 流式细胞术, 递归分割分析, 体外实验 | NA | RNA测序 | 多个队列研究和HCC组织微阵列 |
| 777 | 2024-08-05 |
PAGER-scFGA: unveiling cell functions and molecular mechanisms in cell trajectories through single-cell functional genomics analysis
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1336135
PMID:38690527
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞功能基因组分析的新工具 PAGER-scFGA，旨在揭示细胞功能和分子机制。 | PAGER-scFGA 将细胞功能注释和基因集富集分析整合到流行的单细胞分析流程中，以提供细胞轨迹的深入理解。 | 尽管 PAGER-scFGA 在揭示细胞发育过程中的功能上表现出色，但可能存在样本特异性和模型可扩展性的局限性。 | 本研究的目的是开发一个工具以支持单细胞功能基因组学分析，揭示细胞运动轨迹中的分子机制。 | 研究对象为小鼠自然杀伤细胞及其成熟过程中的不同细胞群体。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠自然杀伤细胞的不同细胞簇 |
| 778 | 2024-08-05 |
Role of proteoglycan synthesis genes in osteosarcoma stem cells
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1325794
PMID:38690160
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研究论文 | 本研究探讨了蛋白多糖合成基因在骨肉瘤干细胞中的作用 | 揭示了蛋白多糖和糖胺聚糖在骨肉瘤干细胞表型及肿瘤恶性程度中的关键作用 | 对蛋白多糖合成机制的了解依然有限 | 研究蛋白多糖/糖胺聚糖生物合成及相关基因在骨肉瘤中的作用 | 骨肉瘤干细胞及其相关临床样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq和传统RNA-seq | NA | 临床样本的基因表达数据 | 临床骨肉瘤标本的多个样本 |
| 779 | 2024-08-04 |
Galectin-3 aggravates microglial activation and tau transmission in tauopathy
2024-Jan-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI165523
PMID:37988169
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研究论文 | 本文研究了Galectin-3在tau病中的作用，发现其加剧了小胶质细胞的活化和tau的传递 | 这篇文章揭示了Galectin-3在tau病中的新作用及其作为潜在治疗靶点的可能性 | 研究主要集中在小鼠模型和人类细胞，可能存在模型的局限性 | 探讨Galectin-3在tau病中的角色及其机制 | 小胶质细胞、超磷酸化tau和tau病小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | THY-Tau22小鼠模型 | 细胞和分子数据 | 纳入人类和小鼠的小胶质细胞样本 |
| 780 | 2024-08-04 |
scRNA-seq characterizing the heterogeneity of fibroblasts in breast cancer reveals a novel subtype SFRP4+ CAF that inhibits migration and predicts prognosis
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1348299
PMID:38686196
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研究论文 | 本文研究了乳腺癌中癌相关成纤维细胞的异质性，并首次发现了一种新的SFRP4+ CAF亚型，抑制迁移并预测预后 | 首次鉴定了SFRP4+ CAF亚型，主要存在于正常组织中，并发现其对乳腺癌细胞迁移具有抑制作用 | 尽管发现了新的CAF亚型，但其功能机制和临床应用仍需进一步研究 | 旨在全面了解乳腺癌中癌相关成纤维细胞的特征和作用 | 研究对象为14个乳腺癌正常-肿瘤配对样本中的CAF | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 样本 | 14个乳腺癌正常-肿瘤配对样本 |