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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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741 | 2024-08-05 |
Adipose-tissue regulatory T cells are a consortium of subtypes that evolves with age and diet
2024-Jan-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320602121
PMID:38227656
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研究论文 | 研究表明,脂肪组织中的调节性T细胞随着年龄和饮食的变化而演变 | 发现脂肪组织中存在功能上不同的调节性T细胞亚型,并且这些亚型在不同年龄和饮食下表现出不同的基因表达特征 | 未涉及具体的临床应用示例,仅在小鼠模型中进行研究 | 探索年龄和饮食对脂肪组织调节性T细胞异质性的影响 | 研究了小鼠的腹膜内脂肪组织中的调节性T细胞亚型 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄和饮食的小鼠多个样本 |
742 | 2024-08-04 |
Endothelial cell ferroptosis influences IDH wild-type glioblastoma growth in recurrent glioblastoma multiforme patients
2024, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2024e13961
PMID:38985083
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研究论文 | 该研究揭示了内皮细胞铁死亡在复发性胶质母细胞瘤中的作用 | 本研究首次通过单细胞测序分析复发性胶质母细胞瘤中内皮细胞铁死亡的上调及其对肿瘤生长的影响 | 研究主要集中在内皮细胞与胶质母细胞瘤的相互作用,可能忽略了其它细胞类型的影响 | 理解复发性胶质母细胞瘤中肿瘤内变化驱动因素 | 分析复发性和原发性胶质母细胞瘤的内皮细胞铁死亡特征 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | 对两对原发性和复发性胶质母细胞瘤进行分析 |
743 | 2024-08-05 |
M2 Macrophage Classification of Colorectal Cancer Reveals Intrinsic Connections with Metabolism Reprogramming and Clinical Characteristics
2024, Pharmacogenomics and personalized medicine
DOI:10.2147/PGPM.S458798
PMID:39011168
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研究论文 | 本文研究了结直肠癌中M2巨噬细胞的分类及其与代谢重编程和临床特征的内在联系 | 提出了一种独特的M2分类技术,并发现了代谢表型与免疫特征之间的关系 | 仍需进一步研究以确认所识别的基因特征在免疫与肿瘤代谢之间的关键作用 | 探讨结直肠癌中免疫细胞代谢演变的临床意义 | M2巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的代谢变化 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和批量RNA测序 | 混合聚类模型 | 基因表达数据 | 分析了来自TCGA和GEO数据集的多组样本 |
744 | 2024-08-05 |
Increased blood CSF3R+ myeloid-derived suppressor cell is a predictor for breast cancer recurrence
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/MUKD2745
PMID:39005677
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研究论文 | 本研究探讨了CSF3R+骨髓来源抑制细胞(MDSCs)在乳腺癌复发中的潜在作用 | 首次确认CSF3R+ MDSCs作为预测乳腺癌复发的生物标志物 | 该研究样本量较小,仅包含35名乳腺癌患者 | 研究MDSCs在乳腺癌复发中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 乳腺癌患者中MDSCs的丰度及基因表达特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NanoString分析 | 动物模型 | 血液标本 | 35名乳腺癌患者 |
745 | 2024-08-05 |
Integrated pan-cancer genomic analysis reveals the role of SLC30A5 in the proliferation, metastasis, and prognosis of hepatocellular carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.97214
PMID:39006068
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研究论文 | 本研究探讨了SLC30A5在肝细胞癌中的表达及其预后意义。 | 发现SLC30A5在多个肿瘤类型中表达上调,并与肝细胞癌的不良预后相关联。 | 研究主要集中于肝细胞癌,其他类型癌症的相关性尚需进一步验证。 | 探讨SLC30A家族基因在多种癌症中的表达及其预后影响,特别是在肝细胞癌中的作用。 | 主要研究对象为SLC30A5及其在肝细胞癌中的作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据 | 涉及33种癌症类型的样本,Huh7细胞系用于功能实验 |
746 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Identifies Distinct Populations of Cytotoxic CD4+ T Cells Linked to the Therapeutic Efficacy of Immune Checkpoint Inhibitors in Metastatic Renal Cell Carcinoma
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S457570
PMID:39006494
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序分析了转移性肾细胞癌患者中的细胞毒性CD4+ T细胞亚群及其与免疫检查点抑制剂疗效之间的关系 | 首次揭示了转移性肾细胞癌中细胞毒性CD4+ T细胞的不同状态及其在抗肿瘤免疫中的关键作用 | 该研究的验证主要依赖于初步的多重免疫荧光染色,进一步验证需要更多的实验支持 | 探讨细胞毒性CD4+ T细胞在转移性肾细胞癌患者接受免疫检查点抑制剂治疗时的作用 | 转移性肾细胞癌患者的CD4+ T细胞亚群 | 免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 转移性肾细胞癌患者的相关数据集 |
747 | 2024-08-05 |
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559634
PMID:37823036
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研究论文 | 这篇论文研究了早发性阿尔茨海默病中高度干扰素反应性T细胞的扩展 | 发现早发性阿尔茨海默病中抗病毒样ISAGhi T细胞显著扩展 | 该研究主要基于单细胞RNA测序和公共数据,可能缺乏临床样本的多样性 | 探讨早发性阿尔茨海默病中的免疫反应及相关的T细胞特征 | 早发性阿尔茨海默病患者及临床正常对照的外周血单核细胞 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)及滴液数字PCR(ddPCR) | NA | 细胞数据 | 分析了约182,000个PBMC样本 |
748 | 2024-08-04 |
Ehmt2 inactivation in pancreatic epithelial cells shapes the transcriptional landscape and inflammation response of the whole pancreas
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1412767
PMID:38948355
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研究论文 | 本研究探讨了Ehmt2在胰腺细胞中的失活如何影响整个胰腺的转录谱和炎症反应 | 揭示了Ehmt2在维护器官免受炎症影响中的重要作用,并展示了其对胰腺癌起始和炎症相关疾病的调控机制 | 未具体说明样本数量和特定实验条件的限制 | 研究Ehmt2在胰腺细胞中的作用及其对转录和炎症反应的影响 | 条件性缺失的胰腺外分泌上皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 来自条件性缺失动物的正常和年轻成人胰腺组织的比较研究 |
749 | 2024-08-05 |
Deciphering the Underlying Mechanisms of Sanleng-Ezhu for the Treatment of Idiopathic Pulmonary Fibrosis Based on Network Pharmacology and Single-cell RNA Sequencing Data
2024, Current computer-aided drug design
IF:1.5Q3
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研究论文 | 本文揭示了三棱-莪术对特发性肺纤维化的治疗机制 | 首次利用网络药理学和单细胞RNA测序数据探索了三棱-莪术的作用机制,并确定了其影响的细胞类型和信号通路 | 未进行长期临床试验以验证三棱-莪术的疗效和安全性 | 探究三棱-莪术在特发性肺纤维化治疗中的潜在机制 | 特发性肺纤维化相关基因及生物活性成分 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | LC-MS/MS和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | GSE53845数据集中有1907个差异表达基因 |
750 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing and multiple machine learning algorithms to identify key T-cell differentiation gene for progression of NAFLD cirrhosis to hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1301099
PMID:38993839
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研究论文 | 该文章探讨了T细胞分化基因在NAFLD肝硬化进展为肝细胞癌中的关键作用 | 通过单细胞测序和多种机器学习算法,系统地识别出五种不同的T细胞分化状态,并确定LDHA为核心基因 | 目前的研究主要集中于HCC的发生,而精确的免疫发病机制仍然不明确 | 研究NAFLD肝硬化向肝细胞癌进展过程中T细胞的分化及其相关基因 | 采用来自两种NAFLD肝硬化样本和五个健康样本的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 2个NAFLD肝硬化样本和5个健康样本 |
751 | 2024-08-04 |
Mitophagy and clear cell renal cell carcinoma: insights from single-cell and spatial transcriptomics analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1400431
PMID:38994370
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体自噬在透明细胞肾癌中的变化及其对肿瘤微环境的影响 | 揭示了UBB基因及其相关的泛素化过程在透明细胞肾癌发展中的重要性 | NA | 深入研究透明细胞肾癌中线粒体自噬活性变化及其对肿瘤代谢和发展策略的影响 | 透明细胞肾癌肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 多个透明细胞肾癌肿瘤组织样本 |
752 | 2024-08-05 |
A High Immune-Related Index with the Suppression of cGAS-STING Pathway is a Key Determinant to Herceptin Resistance in HER2+ Breast Cancer
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.94868
PMID:38993569
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研究论文 | 本研究探讨了免疫相关指标与HER2+乳腺癌Herceptin耐药性之间的关系 | 提出了一种可信的免疫相关预后指标,该指标考虑了免疫渗透,与Herceptin耐药的乳腺癌有重要关联 | 缺乏理想的预后模型全面考虑免疫渗透 | 研究HER2+乳腺癌中的免疫微环境及其对Herceptin耐药性的影响 | 与HER2+乳腺癌相关的细胞系和样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | Cox回归、XGBoost和Lasso算法 | 基因表达数据 | 85例HER2+乳腺癌样本 |
753 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell sequencing with machine learning and Mendelian randomization analysis identifies the NAP1L1 gene as a predictive biomarker for Alzheimer's disease
2024, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2024.1406160
PMID:38988327
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞测序、机器学习和孟德尔随机化分析识别NAP1L1基因作为阿尔茨海默病的预测生物标志物 | 该文章首次将单细胞测序与机器学习及孟德尔随机化结合,以识别与阿尔茨海默病相关的特定基因 | 研究可能在外部验证样本的范围和多样性方面有局限性 | 识别可靠的阿尔茨海默病生物标志物,以便提前预测疾病并及时干预 | 阿尔茨海默病患者的外周血单核细胞及对照组样本 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
754 | 2024-08-05 |
New HCC Subtypes Based on CD8 Tex-Related lncRNA Signature Could Predict Prognosis, Immunological and Drug Sensitivity Characteristics of Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S459150
PMID:38983937
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研究论文 | 该文章探讨了CD8 Tex相关lncRNA在肝细胞癌中的作用及其与预后、免疫和药物敏感性的关系 | 首次基于CD8 Tex相关lncRNA签名识别新的HCC亚型,揭示了其在HCC中的预后和免疫特性 | 尚未深入探讨CD8 Tex相关lncRNAs的具体功能机制 | 研究CD8 Tex相关lncRNAs在肝细胞癌中的作用及其对免疫和药物反应的影响 | CD8 Tex相关lncRNAs及其在HCC细胞中的表达和功能 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据 | 多样本(具体数量未提及) |
755 | 2024-08-04 |
Cuproptosis-Related Genes as Prognostic Biomarkers for Sepsis: Insights into Immune Function and Personalized Immunotherapy
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S461766
PMID:38979432
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研究论文 | 本研究旨在通过分析新型细胞死亡过程cuproptosis,发现败血症免疫治疗的诊断和预后生物标志物 | 首次将cuproptosis相关基因与败血症的免疫功能和个性化免疫疗法联系起来 | 研究可能受到样本量和群体分类的限制 | 探讨cuproptosis相关基因在败血症预后中的作用 | 败血症患者的转录组数据以及cuproptosis相关基因 | 数字病理学 | 败血症 | 转录组测序,单细胞测序,实时定量PCR | 预测模型 | 转录组数据 | 涉及败血症患者和健康对照的样本 |
756 | 2024-08-04 |
Deciphering head and neck cancer microenvironment: Single-cell and spatial transcriptomics reveals human papillomavirus-associated differences
2024-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29386
PMID:38235919
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研究论文 | 本文研究了人乳头瘤病毒(HPV)相关的头颈癌微环境的分子特征 | 通过单细胞和空间转录组学分析,发现了HPV感染与癌症干细胞特性之间的关键基因PKM2及其在转移肿瘤中的作用 | 样本数量有限,仅包括8个单细胞RNA样本和6个空间转录组样本 | 探讨HPV在头颈鳞状细胞癌中的微环境作用及其对转移的影响 | 主要研究基于HPV状态的原发肿瘤和淋巴结转移肿瘤的分子特征 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 8个单细胞RNA样本和6个空间转录组样本 |
757 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell sequencing and machine learning identifies a signature based on monocyte/macrophage hub genes to analyze the intracranial aneurysm associated immune microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1397475
PMID:38979407
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习分析识别与颅内动脉瘤相关的单核细胞/巨噬细胞基因特征,以阐明其与免疫微环境的关系 | 结合六种机器学习算法识别出与单核细胞/巨噬细胞相关的关键基因,并开发了多层感知机神经模型用于颅内动脉瘤的诊断 | 尽管研究揭示了单核细胞浸润的分子特征,但在针对颅内动脉瘤的靶向治疗方面的有效性仍需进一步验证 | 识别单核细胞/巨噬细胞相关的基因特征,以阐明其在颅内动脉瘤发病机制和免疫微环境中的作用 | 主要研究对象为颅内动脉瘤中的单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 多层感知机(MLP) | 基因数据 | NA |
758 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas of the aging mouse ovary
2024-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00552-5
PMID:38200272
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研究论文 | 本研究绘制了小鼠卵巢衰老的单细胞转录组图谱 | 首次提供了衰老小鼠卵巢的全面细胞图谱,揭示了早期卵巢衰退的驱动因素 | 该研究主要集中在小鼠模型上,可能无法完全转化到人类卵巢衰老 | 研究小鼠卵巢衰老过程中的转录组变化 | 对3个月和9个月小鼠卵巢组织进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠卵巢组织,3个月和9个月各一组 |
759 | 2024-08-05 |
Lysyl oxidase-like 1 predicts the prognosis of patients with primary glioblastoma and promotes tumor invasion via EMT pathway
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17579
PMID:38978755
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研究论文 | 这篇文章探讨了赖氨酸氧化酶样1(LOXL1)在原发性胶质母细胞瘤患者预后中的预测作用及其通过上皮-间质转化(EMT)途径促进肿瘤侵犯的机制 | 提出了基于LOXL1的预后风险评分模型和诺莫图,展示了其在评估胶质母细胞瘤患者预后中的潜在应用 | 只使用了TCGA和CGGA数据进行分析,结果可能受限于数据的可获取性和样本的多样性 | 研究LOXs在胶质母细胞瘤中的作用及其对患者预后的影响 | 主要研究对象是原发性胶质母细胞瘤患者及其相关的LOXs基因 | 肿瘤病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,CCK-8,western blot,伤口愈合实验,Transwell侵袭实验 | NA | 基因组数据,临床生存数据 | 使用TCGA和CGGA数据集的患者,具体样本量未在摘要中提及 |
760 | 2024-08-05 |
The association between vitamin D and the progression of diabetic nephropathy: insights into potential mechanisms
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1388074
PMID:38978780
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研究论文 | 本研究调查了维生素D水平与糖尿病肾病进展之间的关联及潜在机制 | 揭示了维生素D缺乏与糖尿病肾病进展相关的分子机制 | 本研究仅基于特定患者群体,可能存在样本选择偏差 | 探索维生素D水平与糖尿病肾病进展之间的关系和机制 | 567名2型糖尿病患者及221名健康对照的临床数据 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | RNA-seq,scRNA-seq | NA | 临床数据,基因表达数据 | 567名2型糖尿病患者和221名健康对照 |