单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1298 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2024-08-05 |
Hyperoxia impairs induced pluripotent stem cell-derived endothelial cells and drives an atherosclerosis-like transcriptional phenotype
2024, JVS-vascular science
DOI:10.1016/j.jvssci.2024.100193
PMID:38770110
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研究论文 | 本研究探讨了高氧环境对诱导多能干细胞来源的内皮细胞的影响及其导致的动脉粥样硬化样转录表型 | 该研究揭示了高氧环境条件下细胞内转录变化，并比较了与动脉粥样硬化内皮细胞的相似性 | 在标准条件下高通量培养的细胞仍未能保持血管生成能力 | 探讨不同氧浓度对诱导多能干细胞衍生的内皮细胞在生理条件下的影响 | 研究对象为诱导多能干细胞衍生的内皮细胞 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 742 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome revealed dysregulated RNA-binding protein expression patterns and functions in human ankylosing spondylitis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1369341
PMID:38770048
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研究论文 | 本研究探讨了强直性脊柱炎（AS）不同免疫细胞类型中 RNA 结合蛋白（RBP）的表达特征和调控模式。 | 揭示了 AS 患者不同免疫细胞中 RBP 的特定表达特点及其在病理过程中的关键作用。 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。 | 研究 RBPs 在强直性脊柱炎发生和发展中的潜在关键作用。 | 研究对象为健康对照组（HC）和强直性脊柱炎（AS）患者的外周血单核细胞（PBMC）样本。 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | scRNA-seq 和大规模 RNA-seq | NA | RNA 数据 | HC 29 例，AS 10 例，此外还有 NC 3 例，AS 5 例 |
| 743 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing to Identify an Immunogenic Cell Death-Related 5-Gene Prognostic Signature in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S449419
PMID:38770169
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，识别出与免疫原性细胞死亡相关的5基因预后标志在肝细胞癌中的应用 | 提出了一种新的预后模型，基于免疫原性细胞死亡相关基因的表达来评估HCC患者对免疫治疗的敏感性 | 研究可能受到样本数量和来源的限制，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨免疫原性细胞死亡相关基因在肝细胞癌中的作用及其与预后的关系 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境中的细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了肝细胞癌样本及细胞系进行验证 |
| 744 | 2024-08-05 |
State transition and intercellular communication of synovial fibroblasts in response to chronic and acute shoulder injuries unveiled by single-cell transcriptomic analyses
2024-01, Connective tissue research
IF:2.8Q1
DOI:10.1080/03008207.2023.2295322
PMID:38090785
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研究论文 | 本研究揭示了滑膜成纤维细胞在慢性与急性肩部损伤反应中的状态转变和细胞间通讯的异质性 | 首次利用单细胞转录组学分析揭示了肩部滑膜成纤维细胞的异质性及其细胞状态转变的潜力 | 研究未明确提及样本的具体来源及数量限制 | 探讨滑膜成纤维细胞的异质性及其在细胞状态转变中的潜力 | 滑膜成纤维细胞及其在肩部慢性旋转袖撕裂和急性近端肱骨骨折中的作用 | 数字病理学 | 肩部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 涉及慢性旋转袖撕裂和急性近端肱骨骨折患者的样本 |
| 745 | 2024-08-05 |
Heat Inactivation of Nipah Virus for Downstream Single-Cell RNA Sequencing Does Not Interfere with Sample Quality
2024-Jan-09, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13010062
PMID:38251369
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研究论文 | 本文研究了热灭活尼帕病毒对单细胞RNA测序样本质量的影响 | 提出了一种在不影响样本质量的情况下有效灭活尼帕病毒的新步骤 | 研究中只测试了特定的病毒类型，不一定适用于所有BSL-4病原体 | 探讨如何在处理BSL-4病原体时有效灭活病毒以确保下游分析的安全性 | 尼帕病毒（NiV） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 746 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of juvenile idiopathic arthritis patients' immune characteristics based on bulk and single-cell sequencing data
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1359235
PMID:38751447
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研究论文 | 本研究基于大规模和单细胞测序数据，综合分析了青少年特发性关节炎（JIA）患者的免疫特征 | 该研究揭示了JIA患者在T细胞受体和B细胞受体谱的克隆性和多样性方面的显著差异，并识别出特定的V基因和J基因，扩展了对JIA的理解 | 本研究未深入探讨JIA的所有分子机制，尚需更多研究验证相关发现 | 研究青少年特发性关节炎（JIA）患者的免疫特征及其潜在的免疫治疗策略 | 青少年特发性关节炎（JIA）患者及健康对照组 | 数字病理学 | 青少年特发性关节炎 | Bulk RNA-seq和单细胞RNA分析 | NA | RNA序列数据 | JIA患者和健康对照组的外周血样本 |
| 747 | 2024-08-04 |
Predictive biomarkers and initial analysis of maternal immune alterations in postpartum preeclampsia reveal an immune-driven pathology
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380629
PMID:38745664
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研究论文 | 本文研究了产后高血压（PPPE）中母体免疫变化及预测生物标志物的潜在性 | 发现胎盘CD163+细胞和初始妊娠期血压可作为非侵入性预测PPPE的生物标志物 | 研究样本的规模和多样性可能限制了结论的普遍性 | 理解PPPE诊断时的免疫贡献及周产期生物标志物的预测潜力 | 通过采集PPPE患者和健康对照组的胎盘和血液样本进行比较分析 | 数字病理学 | 产后高血压 | 单细胞转录组学、流式细胞术、细胞内细胞因子染色 | NA | 血液样本、胎盘组织 | 涉及PPPE患者和健康对照组的样本 |
| 748 | 2024-08-04 |
Identification of PANoptosis-related predictors for prognosis and tumor microenvironment by multiomics analysis in glioma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94200
PMID:38577605
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研究论文 | 本研究探讨了PANoptosis相关基因在胶质瘤进展中的功能，并识别了预测胶质瘤预后的相关指标 | 本研究首次识别了与PANoptosis相关的四个预测因子，并建立了PANRG评分模型，与肿瘤微环境的关系得到了探讨 | 本研究的局限性在于样本数量和实验验证的范围可能不足 | 研究PANoptosis相关基因在胶质瘤中的预后预测和新治疗靶点的开发 | 胶质瘤患者的基因数据和临床样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq | LASSO-Cox回归分析 | 基因数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的胶质瘤患者的bulk和单细胞RNA-seq数据 |
| 749 | 2024-08-05 |
Prognostic and Immune Landscape Analysis of Ubiquitination-related Genes in Hepatocellular Carcinoma: Based on Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.93425
PMID:38577593
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研究论文 | 本研究分析了与泛素化相关基因在肝细胞癌中的预后和免疫景观 | 本研究首次基于泛素化相关基因建立了肝细胞癌预测模型，并确定了三个关键生物标志物 | 目前仍缺乏关于泛素化相关基因在肝细胞癌免疫疗法中的实际应用验证 | 探讨泛素化相关基因在肝细胞癌预后和免疫治疗中的作用 | 主要研究肝细胞癌中与泛素化相关的基因及其表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，转录组差异表达分析 | 加权基因共表达网络分析，Cox回归，Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据集，样本大小未具体提及 |
| 750 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome reveals highly complement activated microglia cells in association with pediatric tuberculous meningitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387808
PMID:38745656
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研究论文 | 该研究揭示了与儿童结核性脑膜炎相关的高度补体激活的微胶质细胞。 | 首次在结核性脑膜炎患儿的脑脊液和外周血单核细胞中发现了33种单核细胞亚群和补体激活的微胶质细胞。 | 样本量仅为6个患儿，可能影响结果的普遍性。 | 揭示结核性脑膜炎中的免疫机制及微胶质细胞的作用。 | 研究对象为患有结核性脑膜炎的儿童及其外周血单核细胞和脑脊液细胞。 | 数字病理学 | 结核性脑膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 6名儿童 |
| 751 | 2024-08-05 |
Characteristics of T Cells in Single-Cell Datasets of Peripheral Blood and Cerebrospinal Fluid in Alzheimer's Disease Patients
2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-230784
PMID:38043012
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的特征 | 揭示了阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的扩展及其功能特征 | 没有提及具体的样本量和实验限制 | 探索阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的潜在特征 | 阿尔茨海默病患者的外周血和脑脊液中T细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据集（GSE181279和GSE134578） | NA |
| 752 | 2024-08-05 |
Copper-binding protein modelling by single-cell transcriptome and Bulk transcriptome to predict overall survival in lung adenocarcinoma patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94588
PMID:38577594
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和大规模转录组模型预测肺腺癌患者的总体生存率 | 提出了一种新的铜结合蛋白模型，显示其在肺腺癌预后中的高预测能力 | 未提及可能的样本选择偏倚或数据集的局限性 | 旨在评估铜结合蛋白在肺腺癌预后中的作用 | 肺腺癌患者的铜结合蛋白及其在生存预测中的表现 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，LASSO-Cox分析，RT-qPCR | CBPRS模型 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的多个队列，具体样本数量未说明 |
| 753 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals a role for pancreatic duct cells as potential mediators of inflammation in diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381319
PMID:38742118
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研究论文 | 本研究揭示了胰管细胞在糖尿病相关炎症中的潜在介导作用 | 首次识别出在炎症环境中胰管细胞亚群表现出独特的促炎症信号 | 研究未明确揭示胰管细胞与其他免疫细胞之间的具体相互作用 | 探索暴露于炎症环境中的原代人胰腺细胞的细胞类型特异性分子反应 | 原代人胰腺细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 754 | 2024-08-05 |
A Strategy based on Bioinformatics and Machine Learning Algorithms Reveals Potential Mechanisms of Shelian Capsule against Hepatocellular Carcinoma
2024, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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研究论文 | 这项研究利用生物信息学方法揭示了Shelian胶囊对肝细胞癌的潜在机制 | 通过机器学习算法和网络分析确定了四个特征基因，提供了对Shelian胶囊潜在药理机制的初步见解 | 未在临床环境中直接验证所发现的机制 | 研究Shelian胶囊在治疗肝细胞癌中的潜在机制 | 肝细胞癌相关疾病基因和Shelian胶囊的生物活性成分 | 数字病理学 | 肝癌 | 机器学习算法，生物信息学 | NA | 基因表达数据 | 153种成分和170个候选靶点，494个HCC相关疾病基因 |
| 755 | 2024-08-05 |
Single cell analysis of short-term dry eye induced changes in cornea immune cell populations
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1362336
PMID:38560382
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研究论文 | 本研究评估了干眼如何改变角膜免疫细胞群体的比例和转录特征 | 通过单细胞RNA测序揭示了干眼条件下角膜免疫细胞的转录谱变化 | 未提及具体的临床试验或长期跟踪研究 | 探究干眼对角膜免疫细胞影响的机制 | 角膜中的免疫细胞群体 | 数字病理学 | 干眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 十二种角膜免疫细胞群体 |
| 756 | 2024-08-05 |
Single cell analysis reveals an antiviral network that controls Zika virus infection in human dendritic cells
2024-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.19.576293
PMID:38293140
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研究论文 | 本研究揭示了Zika病毒在人体树突细胞中的抗病毒网络 | 提出了一种新范式，通过单细胞基因表达与实验性蛋白相互作用数据相结合，评估特定病毒的抗病毒反应 | 未提及相关的限制 | 深入理解宿主对Zika病毒感染的反应 | 感染了Zika病毒的人类单核细胞来源的树突细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 757 | 2024-08-04 |
Screening and validation of atherosclerosis PAN-apoptotic immune-related genes based on single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1297298
PMID:38736872
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研究论文 | 本文筛选并验证了与颈动脉粥样硬化相关的PAN-凋亡免疫相关基因 | 首次探索了与颈动脉粥样硬化有关的PAN-光体相关基因，并通过机器学习识别出四个诊断基因 | 研究的样本量和类型未详细提及 | 旨在筛选与颈动脉粥样硬化有关的PAN-光体相关诊断基因 | 主要研究对象是颈动脉粥样硬化相关的不同ially expressed genes | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 758 | 2024-08-04 |
Exploring the Relevance of Disulfidptosis to the Pathophysiology of Ulcerative Colitis by Bioinformatics Analysis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S454668
PMID:38737111
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研究论文 | 本研究探讨了二硫键死亡与溃疡性结肠炎的相关性 | 首次识别了与二硫键死亡相关的溃疡性结肠炎亚型，并建立了高准确度的预测模型 | 样本来源于公共数据库，可能存在选择偏倚 | 探究二硫键死亡在溃疡性结肠炎中的相关性 | 溃疡性结肠炎患者的样本与二硫键死亡相关基因 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序分析，qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 180个溃疡性结肠炎样本 |
| 759 | 2024-08-05 |
Neutrophil extracellular traps promoting fibroblast activation and aggravating limb ischemia through Wnt5a pathway
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/SQOC7984
PMID:38726275
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）在肢体缺血病理进展中的作用 | 首次揭示了NETs通过Wnt5a通路在肢体缺血中促进成纤维细胞激活的机制 | 尚未在人类样本中验证结果的临床相关性 | 研究NETs在肢体缺血中的功能及其与成纤维细胞的相互作用 | 主要研究对象为缺血小鼠模型中的成纤维细胞和光滑肌细胞 | 数字病理学 | 肢体缺血 | 单细胞RNA测序，免疫组化，西方印迹 | NA | 组织样本 | 9个不同细胞簇 |
| 760 | 2024-08-04 |
Identifying specific TLS-associated genes as potential biomarkers for predicting prognosis and evaluating the efficacy of immunotherapy in soft tissue sarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372692
PMID:38720884
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研究论文 | 本研究探讨了TLS相关基因作为软组织肉瘤预后和免疫治疗疗效的潜在生物标志物 | 本研究系统性地探索了TLS及其相关基因，并建立了与预后和免疫治疗反应相关的风险评分和标志基因 | 研究仍需进一步验证TLS分数和生物标志物在临床中的有效性 | 探讨TLS结构在软组织肉瘤中的作用以及相关生物标志物 | 从TCGA-SARC和GSE212527队列收集的RNAseq和单细胞测序样本 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | RNA测序、单细胞测序 | 无 | RNA测序数据 | 256个RNAseq样本和7个单细胞测序样本 |