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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2024-08-04 |
A systematic overview of single-cell transcriptomics databases, their use cases, and limitations
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1417428
PMID:39040140
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综述 | 本文系统性地审查了大规模单细胞RNA测序数据库，分类并讨论了其用途及局限性 | 提出了单细胞RNA测序数据库的分类，并指出理解其局限性对有效利用数据的重要性 | 未具体提及具体案例或数据分析的细节 | 探讨单细胞转录组数据库的使用案例及面临的技术挑战 | 大规模的单细胞RNA-seq数据库 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 742 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of human PBMCs in healthy and type 2 diabetes populations: dysregulated immune networks in type 2 diabetes unveiled through single-cell profiling
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1397661
PMID:39072276
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研究论文 | 本文通过单细胞分析揭示了2型糖尿病患者中免疫网络的失调 | 首次通过单细胞RNA测序特征化了2型糖尿病患者免疫细胞的性质和网络 | 缺乏对其他类型糖尿病和健康人群的比较分析 | 探讨与2型糖尿病相关的免疫细胞的特征 | 健康人和2型糖尿病患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 来自非糖尿病和2型糖尿病患者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 743 | 2024-08-04 |
Inferring Tree-Shaped Single-Cell Trajectories with Totem
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_9
PMID:39068362
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研究论文 | 本文介绍了通过Totem推断树状单细胞轨迹和伪时间的方法 | 提出了两种用户友好的协议，可以灵活地推断树状单细胞轨迹，解决复杂拓扑结构预测的挑战 | 主要集中在单细胞转录组数据的应用，未涉及其他类型的数据 | 研究单细胞转录组数据中细胞发育过程的轨迹推断 | 人类骨髓CD34+细胞，研究三条谱系的分支：红系、淋巴系和单核系 | 数字病理学 | NA | 转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 744 | 2024-08-04 |
Unsupervised Single-Cell Clustering with Asymmetric Within-Sample Transformation and Per-Cluster Supervised Features Selection
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_8
PMID:39068361
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研究论文 | 本文展示了如何将不对称样本内变换应用于单细胞RNA测序数据，与之前的缺失值插补相匹配 | 提出了一种不对称变换的方法以处理低表达强度，同时保留高表达基因水平，并结合每个基因的熵估计进行非信息基因的去除 | 样本量和不同基因类型的影响可能未在研究中充分探索 | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析和基因特征选择 | 研究对象为单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | GLM | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 745 | 2024-08-04 |
RNA-Seq Analysis of Mammalian Prion Disease
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_20
PMID:39068373
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研究论文 | 本文介绍了利用单细胞RNA测序数据分析哺乳动物朊病毒病的RNA测序方法 | 提出了一种可重复使用的RNA测序分析协议，以揭示朊病毒病中的转录变化 | NA | 揭示哺乳动物朊病毒病的转录特征 | 哺乳动物朊病毒病的单细胞RNA测序数据 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 使用自NCBI GEO数据库获得的单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 746 | 2024-08-05 |
Inferring Novel Cells in Single-Cell RNA-Sequencing Data
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_7
PMID:39068360
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞RNA测序数据中推断新细胞类型的方法 | 提出了三类推断新细胞的方法，包括未监督和异常检测的方法、监督和半监督的方法、以及基于拷贝数变异的方法 | 推断新细胞在常规单细胞RNA测序分析中仍然具有挑战性 | 研究单细胞RNA测序技术中识别和表征新细胞类型 | 利用单细胞RNA测序技术分析细胞类型及其亚群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 747 | 2024-08-05 |
Zebrafish Thrombocyte Transcriptome Analysis and Functional Genomics
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_10
PMID:39068363
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研究论文 | 本文探讨了斑马鱼血小板的成熟过程与功能基因组学 | 采用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析年轻和成熟血小板的转录组，以识别特定基因并揭示其在成熟过程中的角色 | 在血液循环中成熟的具体机制尚不明确 | 理解斑马鱼血小板成熟的机制 | 年轻和成熟的斑马鱼血小板 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 多个斑马鱼血小板样本，包括年轻和成熟类型 | NA | NA | NA | NA |
| 748 | 2024-08-05 |
Comprehensive integrated single-cell RNA sequencing analysis of brain metastasis and glioma microenvironment: Contrasting heterogeneity landscapes
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0306220
PMID:39058687
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研究论文 | 该文章综合分析了脑转移和胶质瘤微环境中的异质性特征 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了不同来源的脑转移在微环境中的异质性差异 | 本研究的数据来自于公开数据库，可能存在数据偏倚 | 探究不同来源的脑肿瘤微环境中的异质性，以指导治疗决策 | 本研究对象为17名患者的脑转移和胶质瘤样本 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA序列数据 | 90,168个细胞样本来自17名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 749 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomic profiling of isolated microregions in tissue sections utilizing laser-induced forward transfer
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0305977
PMID:39052564
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研究论文 | 本研究提出了一种基于激光诱导前转移的新的空间转录组学分析方法。 | 创新点在于结合了激光诱导前转移和全长mRNA测序协议，实现了特定区域组织的基因表达分析。 | 暂未提及该方法的实际应用限制，可能需要进一步研究以确认其适用性。 | 研究旨在开发一种新方法，以便在组织切片中进行空间转录组学分析。 | 研究对象为小鼠大脑皮层和海马中的特定微区域。 | 数字病理学 | NA | mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠大脑的多个切片 | NA | NA | NA | NA |
| 750 | 2024-08-05 |
Autophagy Contributes to Homeostasis in Esophageal Epithelium Where High Autophagic Vesicle Level Marks Basal Cells With Limited Proliferation and Enhanced Self-Renewal Potential
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.018
PMID:38452871
|
研究论文 | 该研究定义了自噬在食管上皮内稳态中的角色 | 研究揭示了自噬与食管基底细胞增殖和自我更新能力之间的关系 | 本研究的局限性在于未考虑自噬在其他类型细胞中的作用 | 探讨自噬在食管上皮稳态中的作用 | 生成了特定于鳞状上皮的Atg7条件性基因敲除小鼠来评估其对食管稳态的影响 | 数字病理学 | 食管病理 | RNA测序，免疫染色 | NA | 细胞，组织 | 使用了敲除小鼠以及分选的食管基底细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 751 | 2024-08-04 |
Understanding testicular single cell transcriptional atlas: from developmental complications to male infertility
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1394812
PMID:39055054
|
综述 | 这篇文章讨论了睾丸单细胞转录组研究以及其与男性不育的关系 | 强调了单细胞RNA测序在测试材料基因表达中的优势和应用 | 关于睾丸转录组以及相关疾病的全面评论仍然有限 | 旨在深入理解睾丸的转录组特征与男性生育力之间的关系 | 主要关注睾丸内不同细胞类型的基因表达特征 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 752 | 2024-08-05 |
The Sex and Age-Associated Infiltration of B Cells May Result in the Dimorphic Behaviors Observed in Papillary Thyroid Carcinomas
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S467704
PMID:39055976
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研究论文 | 这项研究探讨了性别和年龄在乳头状甲状腺癌中的差异性浸润机制 | 揭示了与性别和年龄有关的B细胞浸润如何影响甲状腺癌的生物表现 | 仅分析了2261名患者的临床病理特征，可能影响结果的普遍性 | 阐明性别和年龄对乳头状甲状腺癌发病机制的影响 | 针对2261名乳头状甲状腺癌患者进行综合分析 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多变量逻辑回归分析 | 基因表达数据 | 2261名患者和497个样本的基因表达信息 | NA | NA | NA | NA |
| 753 | 2024-08-05 |
Cross-species single-cell landscapes identify the pathogenic gene characteristics of inherited retinal diseases
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1409016
PMID:39055259
|
研究论文 | 该研究通过跨物种单细胞RNA测序分析识别了与遗传性视网膜疾病（IRD）相关的致病基因特征。 | 研究建立了视网膜细胞的全景表达视图，并揭示了不同物种间的基因表达模式以及细胞特异性调控网络。 | 研究可能存在对细胞类型及其功能复杂性理解不足的局限性。 | 本研究旨在理解遗传性视网膜疾病的临床表现及其致病基础。 | 研究对象为来自三种物种（人类、小鼠和斑马鱼）的视网膜样本，涉及259,087个细胞。 | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 35个视网膜样本，来自3种物种 | NA | NA | NA | NA |
| 754 | 2024-08-04 |
Integrative Pan-Cancer Analysis Reveals the Oncogenic Role of MND1 and Validation of MND1's Role in Breast Cancer
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S458832
PMID:39051055
|
研究论文 | 本研究全面分析了MND1在多种癌症中的表达和生物学功能 | 发现MND1在多种癌症中特别是乳腺癌中具有促进肿瘤进展的作用，并且能够作为生物标志物用于癌症预后和免疫治疗 | 本研究主要依赖于数据库分析，缺乏大规模临床样本的实验证据 | 探讨MND1在不同癌症中的角色及其与乳腺癌的关系 | MND1在不同类型癌症中的表达、预后意义及功能进行研究 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组化染色、CCK8、EdU、克隆形成和流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自不同癌症的多种样本及相关数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 755 | 2024-08-05 |
Developing an advanced diagnostic model for hepatocellular carcinoma through multi-omics integration leveraging diverse cell-death patterns
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1410603
PMID:39044829
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合构建了一种针对肝细胞癌的先进诊断模型 | 创新性地利用程序性细胞死亡相关基因构建了一个七基因的诊断模型，并揭示了其与免疫检查点抑制治疗的关联 | 样本量相对较小，仅使用了50个样本和104,288个单细胞，可能限制了模型的广泛适应性 | 明确程序性细胞死亡基因在肝细胞癌中的作用并构建诊断模型 | 肝细胞癌患者样本，包括血液来源的外泌体和肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 50个样本，104,288个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 756 | 2024-08-05 |
Hemicentin-1 is an essential extracellular matrix component during tooth root formation by promoting mesenchymal cells differentiation
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1435241
PMID:39050894
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研究论文 | 该文章探讨了Hemicentin-1在牙根形成中的作用，特别是在牙本质形成过程中的影响 | 识别并强调了Hemicentin-1作为牙根与牙冠之间牙本质形成差异的关键外部矩阵成分 | 未提供与人类牙髓细胞相关的体内实验数据 | 研究Hemicentin-1在牙根形成过程中的作用，特别是其在牙本质形成中的功能 | 使用小鼠的牙齿组织，特别是切牙和磨牙，作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫组化染色，CCK8检测，BrdU检测，创伤愈合检测，ALP染色，茜素红染色 | NA | 组织样本 | 小鼠切牙和磨牙组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 757 | 2024-08-05 |
Mapping Single-Cell Transcriptomes of Endometrium Reveals Potential Biomarkers in Endometrial Cancer
2024, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S470994
PMID:39050484
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了子宫内膜癌中的潜在生物标志物 | 首次综合分析了59,397个子宫内膜样本的单细胞转录组，识别出多种细胞亚型及其转录因子活性 | 未提及实验验证阶段的具体样本数据或者临床试验结果 | 研究子宫内膜的动态免疫微环境及其在子宫内膜癌中的作用 | 分析了十个子宫内膜样本中的59397个细胞的转录组 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 10个子宫内膜样本和535个子宫内膜癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 758 | 2024-08-05 |
Characterization of the Prognosis and Tumor Microenvironment of Cellular Senescence-related Genes through scRNA-seq and Bulk RNA-seq Analysis in GC
2024, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞衰老相关基因在胃癌中的预后作用和分子亚型 | 该研究首次基于细胞衰老相关基因划分胃癌分子亚型并发展了相应的风险模型 | 研究可能缺乏外部验证，依赖于特定的数据库资源 | 研究细胞衰老相关基因在胃癌中的作用和影响 | 胃癌患者的细胞衰老相关基因及其临床信息 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq和Bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 利用了TCGA数据库中各类胃癌患者的临床和基因表达数据 | NA | NA | NA | NA |
| 759 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Steroidogenesis and Spermatogenesis Impairment in the Testis of db/db Mice
2024, International journal of endocrinology
IF:2.3Q3
DOI:10.1155/2024/8797972
PMID:38817616
|
研究论文 | 本研究探讨了db/db小鼠睾丸中类固醇生成和精子发生的障碍机制 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了db/db小鼠中睾丸的类固醇生成和精子发生缺陷 | 本研究仅限于db/db小鼠，可能不适用于其他类型的糖尿病模型 | 探究2型糖尿病对男性类固醇生成和精子发生的影响 | db/db小鼠及其对照C57BL/6J小鼠的睾丸 | 数字病理学 | 糖尿病相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | db/db小鼠和C57BL/6J小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 760 | 2024-08-05 |
A disulfidptosis-related lncRNAs cluster to forecast the prognosis and immune landscapes of ovarian cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1397011
PMID:39045330
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研究论文 | 本文探讨了与二硫化物死亡相关的长链非编码RNA（DRLs）在卵巢癌预后和免疫特征中的作用 | 首次构建了一个基于DRLs的卵巢癌预后模型，并揭示了其与RNA甲基化和免疫细胞浸润的相关性 | 未深入探讨DRLs在卵巢癌治疗中的具体机制 | 研究与二硫化物死亡相关的lncRNAs在卵巢癌中的预后和免疫特征 | 卵巢癌患者的lncRNA数据和临床信息 | 数字病理学 | 卵巢癌 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 随机生存森林 | 临床数据，RNA表达数据 | 卵巢癌和正常样本的lncRNA数据，具体样本数量未说明 | NA | NA | NA | NA |