单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1298 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2024-08-04 |
MicroRNAs: exploring their role in farm animal disease and mycotoxin challenges
2024, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2024.1372961
PMID:38803799
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综述 | 本综述文章总结了微小RNA（miRNA）在农场动物疾病和霉菌毒素挑战中的作用 | 该文章创新地展示了miRNA在特定农场动物疾病中的作用，强调它们作为生物标志物和减缓策略的潜力 | 目前只有少量的miRNA在农场动物中被功能性特征化，尚需更专注的研究 | 探讨miRNA在农场动物疾病及霉菌毒素中的潜在角色和应用 | 研究涉及多种农场动物疾病，包括病毒和细菌感染及霉菌中毒 | 数字病理学 | 农场动物疾病 | CRISPR-Cas9筛查、单细胞测序、综合多组学方法 | NA | 文献综述 | NA |
| 722 | 2024-08-04 |
Single cells and TRUST4 reveal immunological features of the HFRS transcriptome
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1403335
PMID:38803345
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研究论文 | 本研究利用TRUST4工具揭示了HFRS转录组的免疫特征 | 通过单细胞RNA测序数据进行免疫细胞克隆性和多样性的深入分析，探索了免疫细胞亚群和细胞间相互作用的机制 | 现有的T细胞受体和B细胞受体库的测序技术存在成本高和局限性 | 阐明HFRS发病过程中的免疫细胞动态变化 | 来自HFRS患者的外周血样本中提取的单细胞免疫细胞 | 数字病理学 | 肾综合征出血热 | RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从HFRS患者的外周血样本中提取的11种细胞亚群 |
| 723 | 2024-08-05 |
B-cell immune dysregulation with low soluble CD22 levels in refractory seronegative myasthenia gravis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382320
PMID:38711503
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研究论文 | 本研究揭示了难治性无抗体型重症肌无力的免疫病理，强调了以B细胞为中心的免疫失调和可溶性CD22水平降低 | 首次使用单细胞RNA测序和血浆蛋白质组分析研究无抗体型重症肌无力的病理机制 | 样本量较小，仅涉及30名患者，可能影响结果的普遍性 | 阐明难治性无抗体型重症肌无力的病理机制 | 对30名女性患者（健康对照、早发AChR阳性MG和难治性早发无抗体型MG患者）的外周血样本进行分析 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序，血浆蛋白组分析 | NA | 血液样本 | 30名女性患者，包括10名健康对照，10名早发AChR阳性MG患者，10名难治性早发无抗体型MG患者 |
| 724 | 2024-08-05 |
Novel insights into the ontogeny of basophils
2024, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2024.1402841
PMID:38803659
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综述 | 本文总结了小鼠和人类嗜碱性粒细胞的发育新发现 | 提出了嗜碱性粒细胞分化与红细胞/巨核细胞相关的观点，并发现了小鼠骨髓中新型嗜碱性粒细胞祖细胞 | 主要集中在小鼠模型和scRNA-seq技术，限制了对其他物种或技术的广泛应用 | 探讨嗜碱性粒细胞的发育过程及其相关机制 | 嗜碱性粒细胞及其祖细胞 | 数字病理学 | 过敏反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 725 | 2024-08-05 |
Serglycin secreted by late-stage nucleus pulposus cells is a biomarker of intervertebral disc degeneration
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44313-9
PMID:38167807
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研究论文 | 本文探讨了晚期髓核细胞分泌的serglycin作为椎间盘退变的生物标志物 | 首次识别了晚期髓核细胞并确认了serglycin如何调节椎间盘退变的潜在机制 | 样本量较小，仅包含三名男性和四名女性 | 研究serglycin在椎间盘退变中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 晚期髓核细胞及其分泌的serglycin | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 七个（男性三名，女性四名） |
| 726 | 2024-08-04 |
PANoptosis and Autophagy-Related Molecular Signature and Immune Landscape in Ulcerative Colitis: Integrated Analysis and Experimental Validation
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S455862
PMID:38800594
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研究论文 | 本研究调查了与PANoptosis和自噬相关的溃疡性结肠炎(UC)的分子特征和免疫微环境 | 本研究首次识别并验证了与UC相关的PANoptosis和自噬的新分子特征，可能影响免疫失调和伤口愈合 | 研究中对候选基因的验证主要基于小鼠模型，缺乏大规模临床样本支持 | 探讨溃疡性结肠炎中PANoptosis和自噬相关基因的分子特征及免疫微环境 | 溃疡性结肠炎患者及小鼠模型的相关基因和免疫细胞渗透 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 机器学习 | NA | 基因表达数据 | 分析了UC数据集GSE206285，验证了小鼠模型中的关键候选基因表达 |
| 727 | 2024-08-05 |
Unveiling the molecular complexity of proliferative diabetic retinopathy through scRNA-seq, AlphaFold 2, and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1382896
PMID:38800474
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、非负矩阵因式分解、机器学习和AlphaFold 2方法探索增殖性糖尿病视网膜病变的分子水平 | 创新点在于结合多种高科技手段对PDR的细胞和分子特征进行深入研究 | 本研究可能受到样本量和研究设计的限制 | 探究增殖性糖尿病视网膜病变的复杂分子病理机制 | 针对增殖性糖尿病视网膜病变患者和健康对照者的单细胞RNA测序数据进行分析 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), AlphaFold 2, 机器学习 | NA | 基因表达数据 | 包含增殖性糖尿病视网膜病变患者与健康对照者的样本 |
| 728 | 2024-08-05 |
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12
PMID:38622400
|
研究论文 | 本研究描述了一种针对小鼠调节性B细胞的分离协议，以进行单细胞RNA测序分析 | 提出了一种新的小鼠调节性B细胞的分离和分析方法，拓展了对调节性B细胞生物学的理解 | 研究主要集中于小鼠模型，可能在转化到人类时存在局限性 | 研究调节性B细胞在健康和疾病中的生物学特征 | 以易患狼疮的小鼠（MRL/lpr小鼠）为研究对象 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 729 | 2024-08-05 |
Lysyl Oxidase Regulates Epithelial Differentiation and Barrier Integrity in Eosinophilic Esophagitis
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.025
PMID:38340809
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研究论文 | 本研究探讨了赖氨酸氧化酶（LOX）在嗜酸性食管炎中的作用，尤其是在上皮细胞分化和屏障完整性方面 | 本研究首次揭示了LOX在食管上皮中的非经典角色，作为重要的信号分子参与上皮稳态调节 | 本研究主要基于体外实验，临床应用的直接证据有限 | 研究LOX在嗜酸性食管炎中的功能作用及其对上皮细胞分化和屏障完整性的影响 | 人类嗜酸性食管炎患者来源的类器官和细胞文化模型 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序 | 三维类器官模型 | 基因组数据 | 使用了患者来源的类器官 |
| 730 | 2024-08-05 |
Identification of CFH and FHL2 as biomarkers for idiopathic pulmonary fibrosis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1363643
PMID:38784225
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研究论文 | 本研究识别了CFH和FHL2作为特发性肺纤维化的生物标志物 | 本研究首次确认CFH和FHL2在特发性肺纤维化中的诊断价值 | 该研究缺乏长期临床验证，临床适用性尚需进一步评估 | 研究CFH和FHL2在特发性肺纤维化中的作用及其与免疫细胞的关系 | 特发性肺纤维化相关的关键基因及其在免疫细胞中的表达 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 基因微阵列分析、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 两组数据共涉及647个差异表达基因 |
| 731 | 2024-08-04 |
Network Analysis of Osteoarthritis Progression Using a Steiner Minimal Tree Algorithm
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S438407
PMID:38779430
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研究论文 | 本文提供了与骨关节炎相关基因的综合分析 | 采用Steiner最小树算法分析骨关节炎进展及发现新的生物分子 | 未提及研究的局限性 | 分析与骨关节炎相关的基因及其生物通路 | 与骨关节炎相关的177个基因 | 数字病理学 | 骨关节炎 | Steiner最小树算法 | NA | 基因数据 | 从187项研究中收集了177个与骨关节炎显著相关的基因 |
| 732 | 2024-08-04 |
Overactivated MX1 Positive Natural Killer Cells Promote the Progression of Sepsis-Induced Acute Respiratory Distress Syndrome
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S460259
PMID:38779429
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研究论文 | 本研究探讨了在脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中MX1阳性自然杀伤(NK)细胞的特征及其对疾病进展的影响 | 本研究首次识别出在脓毒症诱导的ARDS中独特的MX1+NK细胞群体，并揭示其在疾病进展中的作用 | 由于样本数量有限，需要更大规模的样本进行进一步探索 | 探讨脓毒症诱导的ARDS中NK细胞的特征及其在疾病中的作用 | 本研究以115名脓毒症患者为对象，其中包括63名发展为ARDS的患者 | 数字病理 | 急性呼吸窘迫综合征 | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 转录组数据，细胞群体数据 | 总共分析了115名脓毒症患者，其中63名发展为ARDS，52名未发展为ARDS |
| 733 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics: A Powerful Tool in Disease Understanding and Drug Discovery
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.95908
PMID:38773973
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研究论文 | 本文章介绍了空间转录组学在疾病理解和药物发现中的应用 | 空间转录组学作为一种新兴技术，提供了基因表达的空间信息，有助于药物靶点发现 | 当前在空间转录组学研究中仍存在许多挑战和问题需要解决 | 探讨空间转录组学在药物发现中的潜力和应用 | 空间转录组学的分析策略及其在新的靶点发现和药物机制解析中的应用 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 734 | 2024-08-04 |
BIOINFORMATICS APPLICATIONS UNDER CONDITION CONTROL: HIGH DIAGNOSTIC VALUE OF DDX47 IN REAL MEDICAL SETTINGS
2024-Jan-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002199
PMID:37553903
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研究论文 | 本研究提出了一种基于真实医疗场景的条件控制方法，以识别并测试DDX47在脓毒症诊断中的价值 | 提出了一种新的条件控制方法，通过控制现实医疗场景中的多个因素，识别具有独特差异基因的诊断潜力 | 尚未详述研究中的评估标准和具体限制因素 | 提高脓毒症早期识别的准确性，从而改善预后 | 脓毒症和脓毒性休克患者数据的基因表达谱 | 生物信息学 | 脓毒症 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 三组数据，包括两组来自基因表达综合数据库，第三组为2020至2021年期间在西南医院住院的脓毒症患者 |
| 735 | 2024-08-05 |
SINGLE-CELL TRANSCRIPTOME ANALYSIS IN HEALTH AND DISEASE
2024-Jan-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002274
PMID:37962963
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研究论文 | 单细胞转录组分析作为理解健康与疾病基本机制的强大工具。 | 提供了单细胞转录组分析的新方向，特别是在计算分析方面，以区分健康与疾病组织。 | 没有提及该研究的具体限制。 | 探讨单细胞转录组分析在健康和疾病条件下的应用。 | 分析不同细胞类型的转录组数据以理解生物学特性。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 736 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling reveals the spatiotemporal distribution of triterpenoid saponin biosynthesis and transposable element activity in Gynostemma pentaphyllum shoot apexes and leaves
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1394587
PMID:38779067
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序分析了Gynostemma pentaphyllum的顶芽和叶片中三萜皂苷生物合成和可转座元件活动的时空分布 | 首次在植物中单细胞水平上探讨了可转座元件的表达 | 未提及具体的实验限制 | 探讨Gynostemma pentaphyllum中三萜皂苷的生物合成及其在细胞分化中的调控作用 | 涉及Gynostemma pentaphyllum的顶芽和叶片中的单个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过50,000个单细胞 |
| 737 | 2024-08-05 |
Analyzing Immune Cell Infiltration and Copper Metabolism in Diabetic Foot Ulcers
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S452609
PMID:38774446
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研究论文 | 本研究分析了糖尿病足溃疡中免疫细胞渗透和铜代谢的关系 | 首次探讨了铜代谢在糖尿病足溃疡发展中的作用及其与免疫细胞渗透的联系 | 未提供对其他类型伤口或非糖尿病患者的比较数据 | 研究糖尿病足溃疡中与铜代谢相关的基因，以发现潜在的治疗靶点 | 分析糖尿病伤口中免疫细胞的失调及与铜代谢相关的基因 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | qRT-PCR和单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 两个糖尿病伤口GEO数据集 |
| 738 | 2024-08-05 |
Mendelian Randomization and Transcriptomic Analysis Reveal the Protective Role of NKT Cells in Sepsis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S459706
PMID:38774448
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研究论文 | 本研究揭示了NKT细胞在脓毒症中的保护作用及其与28天死亡率的关系 | 首次通过孟德尔随机化分析揭示NKT细胞在脓毒症中的保护作用，并发现了独特的FOS+NKT亚型 | 未能探索NKT细胞在脓毒症中的具体机制 | 研究NKT细胞在脓毒症中的角色及其对28天死亡率的影响 | 脓毒症患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化分析 | 基因组数据 | 115名脓毒症患者 |
| 739 | 2024-08-05 |
Exploring dendritic cell subtypes in cancer immunotherapy: unraveling the role of mature regulatory dendritic cells
2024, Upsala journal of medical sciences
IF:1.5Q2
DOI:10.48101/ujms.v129.10627
PMID:38716077
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综述 | 本文探讨了树突细胞在癌症免疫治疗中的亚型及成熟调节树突细胞的作用 | 文章通过单细胞RNA测序分析揭示了树突细胞的表型获取、转录状态和功能程序的最新研究成果 | 文章未提及具体的实验研究和数据支持 | 研究树突细胞在肿瘤免疫微环境中的功能和激活 | 重点研究树突细胞亚型及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 740 | 2024-08-04 |
Identification of ligand and receptor interactions in CKD and MASH through the integration of single cell and spatial transcriptomics
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0302853
PMID:38768139
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学和空间转录组学，识别慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎中的配体-受体相互作用 | 创建了一个整合分析框架，以更全面地分析在慢性肾病和MASH中的细胞特异性配体-受体相互作用 | 研究主要基于两个人体群体的数据，可能存在样本偏倚 | 探索慢性肾病和MASH中细胞特异性配体-受体相互作用的分子机制 | 主要研究细胞之间的配体-受体相互作用 | 数字病理学 | 慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 两个可用的人体队列 |