单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1298 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2024-08-05 |
Unraveling metabolic characteristics and clinical implications in gastric cancer through single-cell resolution analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1399679
PMID:38831933
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研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率分析揭示了胃癌的代谢特征及其临床意义 | 利用单细胞RNA测序技术，首次深入探讨了不同细胞类型在胃癌中的代谢路径和调控机制 | 研究的局限性未在摘要中提及 | 综合研究胃癌中不同细胞类型的代谢路径及其调控机制 | 胃癌肿瘤样本和正常样本中的各种细胞类型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | RNA数据 | NA |
| 702 | 2024-08-04 |
A potential defensive role of TIM-3 on T lymphocytes in the inflammatory involvement of diabetic kidney disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1365226
PMID:38812511
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研究论文 | 本研究探讨了TIM-3在糖尿病肾病中T淋巴细胞的潜在防御作用 | 提出了TIM-3在糖尿病肾病进展中的保护性作用，并基于CD3+TIM-3+ T细胞的监测建议识别高风险患者 | 尚未完全了解各种T淋巴细胞亚群在糖尿病肾病中的调节机制 | 研究糖尿病肾病中T淋巴细胞的免疫检查点分子的功能及其对疾病进展的影响 | 360名糖尿病肾病成人患者和DKD小鼠模型的肾脏样本 | 数字病理 | 糖尿病肾病 | 流式细胞术, 免疫荧光染色, 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 图像和基因数据 | 360个糖尿病肾病患者 |
| 703 | 2024-08-04 |
Deciphering the role of CX3CL1-CX3CR1 in aortic aneurysm pathogenesis: insights from Mendelian randomization and transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1383607
PMID:38715600
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研究论文 | 本研究探讨了CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤发病机制中的作用 | 通过孟德尔随机化和转录组分析揭示了CX3CL1-CX3CR1信号通路在主动脉瘤中的潜在致病性 | 未提供具体实验验证结果的详细信息 | 研究CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤中的致病机制 | 研究了91种循环炎症蛋白与主动脉瘤之间的因果关系 | 数字病理学 | 主动脉瘤 | 孟德尔随机化分析, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了731种免疫特征和91种循环炎症蛋白 |
| 704 | 2024-08-04 |
Uncover spatially informed variations for single-cell spatial transcriptomics with STew
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae064
PMID:38827413
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研究论文 | 本文介绍了一种新的空间转录组分析方法STew，用于联合分析空间信息和基因表达 | STew通过引入空间转录组多角度表示学习方法，克服了有效利用空间信息的挑战 | 未提及具体的实验限制或适用范围 | 旨在提高空间转录组数据分析的准确性和可扩展性 | 研究涉及不同的空间转录组数据，包括单细胞和多细胞分辨率的技术 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | 多角度表示学习 | 转录组数据 | 使用来自人类背外侧前额叶和小鼠主嗅 bulb 的数据进行基准测试 |
| 705 | 2024-08-05 |
The many faces of the megakaryocytes and their biological implications
2024-01-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000793
PMID:37910197
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综述 | 本综述讨论了巨核细胞亚群的功能和表型可塑性以及其对健康和疾病的影响 | 阐明了巨核细胞的多种亚群及其不同的功能，提供了健康调节的潜力 | 未详细说明研究中使用的具体实验方法与数据 | 探讨巨核细胞在健康和疾病中的生物学意义 | 巨核细胞亚群及其转录异质性 | 生物医学 | 相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 706 | 2024-08-05 |
Comprehensive scRNA-seq Analysis and Identification of CD8_+T Cell Related Gene Markers for Predicting Prognosis and Drug Resistance of Hepatocellular Carcinoma
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究分析了CD8+T细胞亚型对肝细胞癌预后和药物耐受性的影响 | 开发了一个基于CD8+ T细胞异质性的12基因标志，用于预测肝细胞癌的生存结果和免疫治疗反应 | 未提及具体的局限性 | 研究CD8+ T细胞亚型对肝细胞癌的影响，以预测预后和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者的CD8+ T细胞亚型及其相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数据来自于多个数据库的患者信息 |
| 707 | 2024-08-04 |
Exploring the diversity of cancer-associated fibroblasts: insights into mechanisms of drug resistance
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1403122
PMID:38818409
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综述 | 本文综合分析了癌症相关成纤维细胞（CAFs）的多样性及其在药物耐药机制中的作用 | 研究整合了36项独立单细胞RNA测序研究的数据，深入探讨了CAFs的亚群体及其在不同肿瘤类型中的预后相关性和功能贡献 | 可能缺乏某些肿瘤类型的全面数据，且对CAFs的具体机制仍需进一步验证 | 揭示CAFs的多样性及其在化疗耐药中的作用 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）在17种不同的人类恶性肿瘤类型中的特征 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 36项独立单细胞RNA测序研究涉及的17种人类恶性肿瘤类型的样本 |
| 708 | 2024-08-05 |
Exploring the role of innate immunity in Cholangiocarcinoma: implications for prognosis, immune infiltration, and tumor metastasis
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94194
PMID:38817870
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研究论文 | 本研究探讨了先天免疫系统在胆道癌中的作用，特别是在预后、免疫浸润和肿瘤转移中的影响 | 阐明了先天免疫途径与胆道癌之间的关系，并提出其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 当前研究关于先天免疫途径与癌症之间相互作用的文献有限且效果不一致 | 揭示先天免疫途径在胆道癌中的作用及其影响因素 | 胆道癌患者的肿瘤组织和正常组织样本 | 数字病理学 | 胆道癌 | 生物信息学和数据分析 | 单细胞转录组分析 | 基因表达数据和蛋白质组数据 | 胆道癌患者的肿瘤组织切片和HPA数据库中的正常组织切片 |
| 709 | 2024-08-05 |
Deconvolution analysis identified altered hepatic cell landscape in primary sclerosing cholangitis and primary biliary cholangitis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1327973
PMID:38818402
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研究论文 | 本文通过去卷积分析揭示了原发性硬化性胆管炎和原发性胆汁性胆管炎中肝细胞的变化。 | 首次利用CIBERSORTx和自定义签名矩阵系统识别特定肝细胞型的组成，展示了肝细胞在疾病中的不同功能。 | 需要更多研究以阐明这些肝细胞表型在胆汁淤积性肝损伤中的角色。 | 探讨原发性硬化性胆管炎和原发性胆汁性胆管炎中肝细胞的组成及其功能。 | 研究对象为原发性硬化性胆管炎和原发性胆汁性胆管炎患者的肝组织样本。 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序和去卷积分析 | CIBERSORTx | 基因组数据 | 分析了来自PSC和PBC患者的肝组织的多个样本 |
| 710 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial transcriptome sequencing uncover a platinum-resistant cluster overexpressed TACSTD2 in high-grade serous ovarian cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.95269
PMID:38817863
|
研究论文 | 本研究揭示了高恶性度浆液性卵巢癌中与铂耐药性相关的E0亚群及其TACSTD2的表达 | 首次识别出铂耐药性上调TACSTD2的上皮细胞亚群，探讨了其在铂耐药性机制中的作用 | 样本量较小，仅涉及6名患者，可能限制结果的普遍性 | 分析高恶性度浆液性卵巢癌中的耐药机制及潜在靶点 | 研究对象为3名铂敏感患者和3名铂耐药患者的肿瘤组织 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个肿瘤样本 |
| 711 | 2024-08-04 |
Non-coding genome contribution to ALS
2024, International review of neurobiology
DOI:10.1016/bs.irn.2024.04.002
PMID:38802183
|
研究论文 | 总结了非编码基因组在肌肉萎缩侧索硬化症（ALS）中的贡献 | 提出细胞特异性功能注释对于发现ALS相关遗传变异的重要性 | 缺乏针对大多数ALS患者的特定遗传驱动因素的理解 | 探索非编码基因组中的遗传风险变异对ALS的影响 | ALS患者的非编码基因组遗传变异 | 数字病理学 | 肌肉萎缩侧索硬化症 | 单细胞表观遗传学分析和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 712 | 2024-08-04 |
Comparative Methods for Demystifying Spatial Transcriptomics
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3838-5_17
PMID:38819570
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组技术(ST)的比较方法。 | 提出了通过比较不同基因组或转录组参考对ST实验结果影响的新见解。 | 研究中只集中于Visium平台提供的分析软件，未涵盖其他可能的ST平台。 | 分析空间转录组实验中的基因表达特征并优化分析流程。 | 研究对象包括使用ST技术的细胞群体及其基因表达数据。 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 图像和基因表达数据 | 使用了不同点的多组RNA读取数据 |
| 713 | 2024-08-04 |
Dynamic changes of immunocyte subpopulations in thermogenic activation of adipose tissues
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1375138
PMID:38812501
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研究论文 | 本研究探讨了不同冷暴露期间脂肪组织内免疫细胞的动态变化 | 识别了几种新的免疫细胞亚群，这些亚群可能有助于脂肪组织在冷暴露下的产热激活 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不完全反映人类的情况 | 探讨冷暴露对热生成脂肪组织内免疫细胞的整体变化 | 不同冷暴露期间的热生成性脂肪组织中的免疫细胞 | NA | 代谢疾病 | 单细胞测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 定量实时PCR | NA | 免疫细胞数据 | 使用了两个不同类型的热生成性脂肪组织的样本 |
| 714 | 2024-08-04 |
Dissecting Spatiotemporal Structures in Spatial Transcriptomics via Diffusion-Based Adversarial Learning
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0390
PMID:38812530
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研究论文 | 本文介绍了一种计算框架PearlST，用于准确推断空间转录组数据中的时空结构 | 提出了结合偏微分方程增强对抗图自编码器的新方法，显著提升从空间转录组数据中提取特征的能力 | 未知所涉及的具体技术限制和数据集限制 | 研究空间转录组数据中的时空结构推断 | 空间转录组数据及其相关生物学背景 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 对抗图自编码器 | Wasserstein对抗正则化图自编码器 | 空间转录组数据 | 多个不同分辨率的空间转录组数据集 |
| 715 | 2024-08-05 |
Autoimmune CD8+ T cells in type 1 diabetes: from single-cell RNA sequencing to T-cell receptor redirection
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1377322
PMID:38800484
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评论 | 本文探讨了1型糖尿病中自身免疫CD8+ T细胞及其T细胞受体的机制。 | 提出了通过调节自身反应性CD8+ T细胞来治疗或显著改善1型糖尿病的潜在策略。 | 缺乏对CD8+ T细胞的精确和稳定靶向治疗的机制探讨。 | 探讨1型糖尿病中自身免疫CD8+ T细胞及其TCR的作用机制。 | 自身免疫CD8+ T细胞和T细胞受体。 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9, CAR-T | NA | NA | NA |
| 716 | 2024-08-05 |
Genetic and Functional Analyses of Cutibacterium Acnes Isolates Reveal the Association of a Linear Plasmid with Skin Inflammation
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.029
PMID:37478901
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研究论文 | 本研究分析了不同Cutibacterium acnes菌株与皮肤炎症的关系 | 发现了与皮肤炎症相关的线性质粒及其在不同菌株中的作用 | 该研究未能完全解析菌株类型与疾病之间的相关性 | 理解不同菌株如何导致皮肤炎症 | 从健康及痤疮患者的皮肤拭子中提取的C. acnes菌株 | 数字病理学 | 痤疮 | 全基因组测序 | NA | 细菌样本 | 从健康个体和痤疮患者中提取的多个菌株 |
| 717 | 2024-08-05 |
Development and verification of a manganese metabolism- and immune-related genes signature for prediction of prognosis and immune landscape in gastric cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1377472
PMID:38807601
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种与锰代谢和免疫相关的基因标志，以预测胃癌的预后和免疫环境 | 首次利用锰代谢和免疫相关基因来识别胃癌的预后相关基因 | 未提及此研究的具体局限性 | 研究旨在预测胃癌患者的临床结果并指导未来的免疫治疗干预 | 胃癌患者及其相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，基因表达组数据库分析 | 未提供 | 转录组信息，临床数据 | 未提供具体样本数量 |
| 718 | 2024-08-05 |
Quantitative Modeling of Stemness in Single-Cell RNA Sequencing Data: A Nonlinear One-Class Support Vector Machine Method
2024-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0484
PMID:38010500
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA测序数据的干性量化模型。 | 创新性地使用一类Hadamard核支持向量机(OCHSVM)来定义和量化细胞的干性。 | NA | 研究单细胞的干性量化，以评估自我更新和分化的潜力。 | 主要研究对象包括预植入胚胎细胞、诱导多能干细胞和肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 一类Hadamard核支持向量机(OCHSVM) | 数据集，包括细胞转录组数据 | 涉及多个数据集，包括预植入胚胎细胞、诱导多能干细胞和肿瘤细胞 |
| 719 | 2024-08-05 |
Evaluation of Therapeutic Mechanism of Hedyotis Diffusa Willd (HDW)‒ Scutellaria Barbata (SB) in Clear Cell Renal Cell Carcinoma via Singlecell RNA Sequencing and Network Pharmacology
2024, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本研究旨在探讨Hedyotis diffusa Willd (HDW)和Scutellaria barbata (SB)在透明细胞肾癌(ccRCC)中的治疗机制 | 通过单细胞RNA测序和网络药理学识别了29个针对ccRCC的关键基因，揭示了其在诊断和预后中的良好表现 | 未提及具体的临床实验数据来进一步验证发现 | 研究HDW-SB在ccRCC中的治疗机制 | Hedyotis diffusa Willd和Scutellaria barbata的活性成分及其在ccRCC中的靶点基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用两个不同的数据集进行分析，其中GSE53757和GSE121638 |
| 720 | 2024-08-04 |
Alveolar macrophage-expressed Plet1 is a driver of lung epithelial repair after viral pneumonia
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44421-6
PMID:38167746
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研究论文 | 本研究探讨了Plet1在病毒性肺炎后对肺上皮修复的作用 | 首次揭示了Plet1在肺修复中的重要投射及其作为治疗潜力的作用 | 未能具体说明Plet1在其他类型的肺损伤中的效果 | 研究Plet1在肺上皮细胞增殖和修复过程中的作用 | 研究对象为经历IAV感染的骨髓衍生巨噬细胞和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 高维单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |