单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1387 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2024-08-05 |
Zebrafish Thrombocyte Transcriptome Analysis and Functional Genomics
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_10
PMID:39068363
|
研究论文 | 本文探讨了斑马鱼血小板的成熟过程与功能基因组学 | 采用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析年轻和成熟血小板的转录组，以识别特定基因并揭示其在成熟过程中的角色 | 在血液循环中成熟的具体机制尚不明确 | 理解斑马鱼血小板成熟的机制 | 年轻和成熟的斑马鱼血小板 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 多个斑马鱼血小板样本，包括年轻和成熟类型 |
| 662 | 2024-08-05 |
Comprehensive integrated single-cell RNA sequencing analysis of brain metastasis and glioma microenvironment: Contrasting heterogeneity landscapes
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0306220
PMID:39058687
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研究论文 | 该文章综合分析了脑转移和胶质瘤微环境中的异质性特征 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了不同来源的脑转移在微环境中的异质性差异 | 本研究的数据来自于公开数据库，可能存在数据偏倚 | 探究不同来源的脑肿瘤微环境中的异质性，以指导治疗决策 | 本研究对象为17名患者的脑转移和胶质瘤样本 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA序列数据 | 90,168个细胞样本来自17名患者 |
| 663 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomic profiling of isolated microregions in tissue sections utilizing laser-induced forward transfer
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0305977
PMID:39052564
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研究论文 | 本研究提出了一种基于激光诱导前转移的新的空间转录组学分析方法。 | 创新点在于结合了激光诱导前转移和全长mRNA测序协议，实现了特定区域组织的基因表达分析。 | 暂未提及该方法的实际应用限制，可能需要进一步研究以确认其适用性。 | 研究旨在开发一种新方法，以便在组织切片中进行空间转录组学分析。 | 研究对象为小鼠大脑皮层和海马中的特定微区域。 | 数字病理学 | NA | mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠大脑的多个切片 |
| 664 | 2024-08-05 |
Autophagy Contributes to Homeostasis in Esophageal Epithelium Where High Autophagic Vesicle Level Marks Basal Cells With Limited Proliferation and Enhanced Self-Renewal Potential
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.018
PMID:38452871
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研究论文 | 该研究定义了自噬在食管上皮内稳态中的角色 | 研究揭示了自噬与食管基底细胞增殖和自我更新能力之间的关系 | 本研究的局限性在于未考虑自噬在其他类型细胞中的作用 | 探讨自噬在食管上皮稳态中的作用 | 生成了特定于鳞状上皮的Atg7条件性基因敲除小鼠来评估其对食管稳态的影响 | 数字病理学 | 食管病理 | RNA测序，免疫染色 | NA | 细胞，组织 | 使用了敲除小鼠以及分选的食管基底细胞 |
| 665 | 2024-08-04 |
Understanding testicular single cell transcriptional atlas: from developmental complications to male infertility
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1394812
PMID:39055054
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综述 | 这篇文章讨论了睾丸单细胞转录组研究以及其与男性不育的关系 | 强调了单细胞RNA测序在测试材料基因表达中的优势和应用 | 关于睾丸转录组以及相关疾病的全面评论仍然有限 | 旨在深入理解睾丸的转录组特征与男性生育力之间的关系 | 主要关注睾丸内不同细胞类型的基因表达特征 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 666 | 2024-08-05 |
The Sex and Age-Associated Infiltration of B Cells May Result in the Dimorphic Behaviors Observed in Papillary Thyroid Carcinomas
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S467704
PMID:39055976
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研究论文 | 这项研究探讨了性别和年龄在乳头状甲状腺癌中的差异性浸润机制 | 揭示了与性别和年龄有关的B细胞浸润如何影响甲状腺癌的生物表现 | 仅分析了2261名患者的临床病理特征，可能影响结果的普遍性 | 阐明性别和年龄对乳头状甲状腺癌发病机制的影响 | 针对2261名乳头状甲状腺癌患者进行综合分析 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多变量逻辑回归分析 | 基因表达数据 | 2261名患者和497个样本的基因表达信息 |
| 667 | 2024-08-05 |
Cross-species single-cell landscapes identify the pathogenic gene characteristics of inherited retinal diseases
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1409016
PMID:39055259
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研究论文 | 该研究通过跨物种单细胞RNA测序分析识别了与遗传性视网膜疾病（IRD）相关的致病基因特征。 | 研究建立了视网膜细胞的全景表达视图，并揭示了不同物种间的基因表达模式以及细胞特异性调控网络。 | 研究可能存在对细胞类型及其功能复杂性理解不足的局限性。 | 本研究旨在理解遗传性视网膜疾病的临床表现及其致病基础。 | 研究对象为来自三种物种（人类、小鼠和斑马鱼）的视网膜样本，涉及259,087个细胞。 | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 35个视网膜样本，来自3种物种 |
| 668 | 2024-08-04 |
Integrative Pan-Cancer Analysis Reveals the Oncogenic Role of MND1 and Validation of MND1's Role in Breast Cancer
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S458832
PMID:39051055
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研究论文 | 本研究全面分析了MND1在多种癌症中的表达和生物学功能 | 发现MND1在多种癌症中特别是乳腺癌中具有促进肿瘤进展的作用，并且能够作为生物标志物用于癌症预后和免疫治疗 | 本研究主要依赖于数据库分析，缺乏大规模临床样本的实验证据 | 探讨MND1在不同癌症中的角色及其与乳腺癌的关系 | MND1在不同类型癌症中的表达、预后意义及功能进行研究 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组化染色、CCK8、EdU、克隆形成和流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自不同癌症的多种样本及相关数据库 |
| 669 | 2024-08-05 |
Developing an advanced diagnostic model for hepatocellular carcinoma through multi-omics integration leveraging diverse cell-death patterns
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1410603
PMID:39044829
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研究论文 | 本研究通过多组学整合构建了一种针对肝细胞癌的先进诊断模型 | 创新性地利用程序性细胞死亡相关基因构建了一个七基因的诊断模型，并揭示了其与免疫检查点抑制治疗的关联 | 样本量相对较小，仅使用了50个样本和104,288个单细胞，可能限制了模型的广泛适应性 | 明确程序性细胞死亡基因在肝细胞癌中的作用并构建诊断模型 | 肝细胞癌患者样本，包括血液来源的外泌体和肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 50个样本，104,288个单细胞 |
| 670 | 2024-08-05 |
Hemicentin-1 is an essential extracellular matrix component during tooth root formation by promoting mesenchymal cells differentiation
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1435241
PMID:39050894
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研究论文 | 该文章探讨了Hemicentin-1在牙根形成中的作用，特别是在牙本质形成过程中的影响 | 识别并强调了Hemicentin-1作为牙根与牙冠之间牙本质形成差异的关键外部矩阵成分 | 未提供与人类牙髓细胞相关的体内实验数据 | 研究Hemicentin-1在牙根形成过程中的作用，特别是其在牙本质形成中的功能 | 使用小鼠的牙齿组织，特别是切牙和磨牙，作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫组化染色，CCK8检测，BrdU检测，创伤愈合检测，ALP染色，茜素红染色 | NA | 组织样本 | 小鼠切牙和磨牙组织样本 |
| 671 | 2024-08-05 |
Mapping Single-Cell Transcriptomes of Endometrium Reveals Potential Biomarkers in Endometrial Cancer
2024, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S470994
PMID:39050484
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了子宫内膜癌中的潜在生物标志物 | 首次综合分析了59,397个子宫内膜样本的单细胞转录组，识别出多种细胞亚型及其转录因子活性 | 未提及实验验证阶段的具体样本数据或者临床试验结果 | 研究子宫内膜的动态免疫微环境及其在子宫内膜癌中的作用 | 分析了十个子宫内膜样本中的59397个细胞的转录组 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 10个子宫内膜样本和535个子宫内膜癌样本 |
| 672 | 2024-08-05 |
Characterization of the Prognosis and Tumor Microenvironment of Cellular Senescence-related Genes through scRNA-seq and Bulk RNA-seq Analysis in GC
2024, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究探讨了细胞衰老相关基因在胃癌中的预后作用和分子亚型 | 该研究首次基于细胞衰老相关基因划分胃癌分子亚型并发展了相应的风险模型 | 研究可能缺乏外部验证，依赖于特定的数据库资源 | 研究细胞衰老相关基因在胃癌中的作用和影响 | 胃癌患者的细胞衰老相关基因及其临床信息 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq和Bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 利用了TCGA数据库中各类胃癌患者的临床和基因表达数据 |
| 673 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Steroidogenesis and Spermatogenesis Impairment in the Testis of db/db Mice
2024, International journal of endocrinology
IF:2.3Q3
DOI:10.1155/2024/8797972
PMID:38817616
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研究论文 | 本研究探讨了db/db小鼠睾丸中类固醇生成和精子发生的障碍机制 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了db/db小鼠中睾丸的类固醇生成和精子发生缺陷 | 本研究仅限于db/db小鼠，可能不适用于其他类型的糖尿病模型 | 探究2型糖尿病对男性类固醇生成和精子发生的影响 | db/db小鼠及其对照C57BL/6J小鼠的睾丸 | 数字病理学 | 糖尿病相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | db/db小鼠和C57BL/6J小鼠 |
| 674 | 2024-08-05 |
A disulfidptosis-related lncRNAs cluster to forecast the prognosis and immune landscapes of ovarian cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1397011
PMID:39045330
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研究论文 | 本文探讨了与二硫化物死亡相关的长链非编码RNA（DRLs）在卵巢癌预后和免疫特征中的作用 | 首次构建了一个基于DRLs的卵巢癌预后模型，并揭示了其与RNA甲基化和免疫细胞浸润的相关性 | 未深入探讨DRLs在卵巢癌治疗中的具体机制 | 研究与二硫化物死亡相关的lncRNAs在卵巢癌中的预后和免疫特征 | 卵巢癌患者的lncRNA数据和临床信息 | 数字病理学 | 卵巢癌 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 随机生存森林 | 临床数据，RNA表达数据 | 卵巢癌和正常样本的lncRNA数据，具体样本数量未说明 |
| 675 | 2024-08-05 |
Single cell RNA sequencing of human FAPs reveals different functional stages in Duchenne muscular dystrophy
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1399319
PMID:39045456
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研究论文 | 这篇文章探讨了单细胞RNA测序在人类FAPs中的应用，以了解杜兴肌肉萎缩症中的不同功能阶段 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了DMD患者与健康对照组FAPs在转录谱上的显著差异 | 样本量有限，只有9个额外样本进行了qPCR验证，可能影响结果的普遍性 | 揭示FAPs在杜兴肌肉萎缩症中的功能多样性及其分子机制 | 健康个体和杜兴肌肉萎缩症患者的FAPs | 数字病理学 | 杜兴肌肉萎缩症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个样本（健康和DMD患者的FAPs） |
| 676 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing uncovers cellular heterogeneity and the progression of heterotopic ossification of the elbow
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1434146
PMID:39045052
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了肘部异位骨化的细胞异质性和进展 | 识别了13个HOE细胞簇并进一步分析了4种主要细胞类型的亚簇，提供了更高分辨率的细胞图谱 | 该研究尚未深入探讨HOE细胞的交互作用在不同阶段的具体作用机制 | 探索肘部异位骨化的细胞起源和进展 | 主要研究对象为肘部异位骨化患者中的不同细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 677 | 2024-08-05 |
Integrative transcriptome-proteome approach reveals key hypoxia-related features involved in the neuroprotective effects of Yang Xue oral liquid on Alzheimer's and Parkinson's disease
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1411273
PMID:39045051
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研究论文 | 本研究探讨了缺氧相关基因在杨血口服液对阿尔茨海默病和帕金森病神经保护效应中的作用 | 首次整合转录组和蛋白质组分析，确定了与缺氧相关的关键基因，开发了人工智能驱动的缺氧标志 | 未提及具体实验的局限性 | 研究杨血口服液对阿尔茨海默病和帕金森病的神经保护作用及其机制 | 阿尔茨海默病和帕金森病患者的缺氧相关基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 1713，来自九个独立队列 |
| 678 | 2024-08-05 |
Mincle receptor in macrophage and neutrophil contributes to the unresolved inflammation during the transition from acute kidney injury to chronic kidney disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1385696
PMID:38770013
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研究论文 | 本文揭示了Mincle受体在急性肾损伤向慢性肾病过渡期间在巨噬细胞和中性粒细胞中的作用 | 研究首次探讨了Mincle在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的角色及其机制 | 尚未明确Mincle在慢性转变过程中的所有影响 | 研究急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的炎症机制 | 以小鼠为模型研究Mincle在急性肾损伤后炎症和纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 在急性肾损伤后，对多时间点的小鼠样本进行分析 |
| 679 | 2024-08-04 |
A subpopulation of human bone marrow erythroid cells displays a myeloid gene expression signature similar to that of classic monocytes
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0305816
PMID:39038020
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研究论文 | 本研究探讨了人类骨髓红细胞亚群的特征及其在先天免疫中的作用 | 首次揭示人类骨髓红细胞的亚群表现出与经典单核细胞相似的髓系基因表达特征 | 研究可能受限于样本规模和单细胞RNA测序数据的可用性 | 阐明人类骨髓红细胞的特性及其在先天免疫反应中的潜在角色 | 人类骨髓红细胞亚群 | 数字病理学 | NA | NanoString基因表达分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 680 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of PPP4C's impact on prognosis, immune microenvironment, and immunotherapy response in lung adenocarcinoma using single-cell sequencing and multi-omics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1416632
PMID:39026674
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研究论文 | 本研究分析了PPP4C对肺腺癌预后、免疫微环境和免疫治疗反应的影响 | 提出了一个基于PPP4C水平的预后框架，能够有效预测肺腺癌患者的预后以及免疫治疗的有效性 | 对PPP4C如何影响特定免疫细胞类型的执行机制的研究仍然不够深入 | 探讨PPP4C在肺腺癌中的角色及其与免疫微环境的相互作用 | 肺腺癌患者的PPP4C表达水平及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序与多组学分析 | WGCNA | RNA测序数据 | LUAD患者样本和相关免疫基因数据集 |