单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2024-08-09 |
Identification of CGNL1 as a diagnostic marker in fibroblasts of diabetic foot ulcers: Insights from single cell RNA sequencing and bulk sequencing data
2024 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320241265945
PMID:39102374
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研究论文 | 本研究旨在探索糖尿病足溃疡（DFUs）中成纤维细胞亚型的独特转录特征及铁死亡的作用 | 通过单细胞RNA测序和批量测序数据，本研究首次确定了CGNL1作为成纤维细胞中的一个独特诊断标志物，并揭示了其在促炎性成纤维细胞中的正相关性 | NA | 探索糖尿病足溃疡中成纤维细胞亚型的独特转录特征及铁死亡的作用 | 糖尿病足溃疡中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 83529个单细胞转录组来自足部样本 |
| 662 | 2024-08-09 |
Deciphering the immune-metabolic nexus in sepsis: a single-cell sequencing analysis of neutrophil heterogeneity and risk stratification
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1398719
PMID:39108261
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了脓毒症中的免疫细胞景观及其与代谢途径的关联，揭示了中性粒细胞在脓毒症代谢紊乱中的作用及其异质性 | 通过单细胞RNA测序和机器学习技术，本研究首次揭示了脓毒症中中性粒细胞的复杂交互作用和其在代谢紊乱中的关键角色，并开发了一种新的风险评分模型用于预测脓毒症预后 | NA | 旨在深入理解脓毒症中的免疫代谢相互作用，并开发新的预后和治疗策略 | 脓毒症中的免疫细胞和代谢途径 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 663 | 2024-08-08 |
nf-core/airrflow: an adaptive immune receptor repertoire analysis workflow employing the Immcantation framework
2024-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576147
PMID:38293151
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研究论文 | 本文介绍了nf-core/airrflow，一个集成Immcantation框架的适应性免疫受体谱分析工作流程，用于处理批量和单细胞的AIRR-seq数据 | nf-core/airrflow提供了跨样本的并行化、可扩展性和对高性能计算基础设施的便携性，这是现有工具所不具备的 | NA | 开发一个端到端的工作流程，用于处理和分析AIRR-seq数据，以研究免疫状态 | B细胞和T细胞受体序列的重建以及克隆关系的推断 | 生物信息学 | 传染病 | AIRR-seq | NA | 序列数据 | 分析了97名COVID-19感染者和99名健康对照者的数据 |
| 664 | 2024-08-08 |
Advancing bladder cancer management: development of a prognostic model and personalized therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1430792
PMID:39104534
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞和批量RNA测序数据，开发和验证一种基于基底鳞状亚型相关基因的膀胱癌预后模型，并探索个性化治疗策略。 | 本研究首次基于基底鳞状亚型相关基因开发了一种新的膀胱癌预后模型，并验证了其在不同临床环境中的预测性能。 | NA | 提高对膀胱癌分子异质性的理解，并开发有效的预后模型和个性化治疗策略。 | 膀胱癌的分子亚型、预后模型和个性化治疗策略。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | LASSO和Cox回归分析 | RNA测序数据 | 使用了来自多个来源的单细胞和批量RNA测序数据，包括GSE135337、GSE13507、GSE31684、GSE32894、GSE69795和TCGA-BLCA。 |
| 665 | 2024-08-08 |
Multiplexed spatial transcriptomics methods and the application of expansion microscopy
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1378875
PMID:39105173
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综述 | 本文综述了空间转录组学方法，特别是序列（ISS）方法、杂交（ISH）技术以及基于下一代测序（NGS）的区域捕获测序技术，并探讨了扩展显微镜（ExM）在这些技术中的应用 | 扩展显微镜（ExM）通过控制生物样本的放大，实现了超分辨率成像，克服了传统显微镜的衍射极限，使得在空间转录组学方法中精确观察RNA成为可能 | 空间转录组学实验的一个挑战是细胞内RNA检测的光学拥挤限制 | 探讨空间转录组学方法及其在生物学和医学中的应用 | 空间转录组学技术及其与扩展显微镜（ExM）的结合 | NA | NA | 扩展显微镜（ExM） | NA | 转录组数据 | NA |
| 666 | 2024-08-07 |
Exploring myometrial microenvironment changes at the single-cell level from nonpregnant to term pregnant states
2024-Jan-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和空间转录组学（ST）技术，构建了非妊娠（NP）和足月妊娠（TP）状态下人类子宫肌层单个细胞的转录组图谱 | 首次在单细胞水平上探索了人类子宫肌层从非妊娠到足月妊娠状态的微环境变化 | NA | 研究妊娠期间子宫肌层微环境和细胞群的特定变化 | 人类子宫肌层在非妊娠和足月妊娠状态下的单细胞水平变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | 12个人类子宫肌层组织中的87,845个高质量单个细胞 |
| 667 | 2024-08-07 |
Elucidating T cell dynamics and molecular mechanisms in syngeneic and allogeneic islet transplantation through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429205
PMID:39100662
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了同种异体和异种胰岛移植中T细胞动态和分子机制 | 揭示了同种异体和异种胰岛移植中T细胞亚群的基因变异和分子差异，以及细胞间通信模式的复杂性 | NA | 阐明胰岛移植中T细胞动态和分子机制，以增强移植物接受度和更有效地管理糖尿病治疗 | 同种异体和异种胰岛移植中的T细胞亚群及其基因表达差异 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | t-SNE | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 668 | 2024-08-07 |
AGBL4 promotes malignant progression of glioblastoma via modulation of MMP-1 and inflammatory pathways
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1420182
PMID:39007144
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研究论文 | 本研究探讨了AGBL4在胶质母细胞瘤（GBM）恶性进展中的作用及其与炎症途径的关联 | 发现AGBL4通过调节MMP-1和炎症途径促进GBM的恶性进展，并建立了一个新的调控轴 | NA | 阐明GBM的分子机制，特别是AGBL4与炎症途径的关系，以发现可行的治疗靶点 | AGBL4在GBM中的表达及其对细胞增殖、迁移、侵袭和炎症反应的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 669 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular dynamics and therapeutic effects of astragaloside IV in slow transit constipation
2024-Jan-29, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.10187
PMID:38289380
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了黄芪甲苷IV在治疗慢传输型便秘中的细胞动态和治疗效果 | 首次揭示了黄芪甲苷IV对慢传输型便秘模型中肠道细胞比例和功能的调节作用，并通过网络药理学分析了其作用机制 | 研究仅限于动物模型，需要进一步的人体试验验证 | 确定慢传输型便秘模型中结肠组织细胞的动态变化，并研究黄芪甲苷IV治疗的效果 | 慢传输型便秘的小鼠模型和黄芪甲苷IV的治疗效果 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用洛哌丁胺诱导的慢传输型便秘小鼠模型 |
| 670 | 2024-08-07 |
Dysregulation of endometrial stromal serotonin homeostasis leading to abnormal phosphatidylcholine metabolism impairs decidualization in patients with recurrent implantation failure
2024, Human reproduction open
IF:8.3Q1
DOI:10.1093/hropen/hoae042
PMID:39091587
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研究论文 | 本研究探讨了异常的血清素稳态是否导致反复植入失败（RIF）患者子宫内膜蜕膜化受损 | 发现RIF患者子宫内膜中血清素代谢稳态异常，伴随单胺氧化酶（MAO）表达减少，影响子宫内膜基质细胞的蜕膜化，导致胚胎植入失败 | 研究揭示了血清素代谢稳态受损和MAO表达异常降低是RIF的原因之一，但血清素在子宫内膜中的来源和其他潜在功能仍需进一步探索 | 探讨异常的血清素稳态是否导致反复植入失败（RIF）患者子宫内膜蜕膜化受损及其机制 | 反复植入失败（RIF）患者的子宫内膜样本和生育能力正常的患者子宫内膜样本 | NA | 生殖系统疾病 | ELISA、免疫荧光组织化学、单细胞测序、RNA测序（RNA-seq）、液相色谱-质谱（LC/MS） | NA | 细胞、基因表达数据 | 50个子宫内膜样本（25个RIF患者和25个生育能力正常的患者） |
| 671 | 2024-08-07 |
Identifying potential therapeutic targets in lung adenocarcinoma: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1433147
PMID:39092217
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据与孟德尔随机化方法，旨在识别肺腺癌的新治疗靶点 | 本研究采用多组学方法，结合批量和单细胞RNA测序数据，以及孟德尔随机化分析，揭示了肺腺癌的潜在治疗靶点 | NA | 识别肺腺癌的新治疗靶点 | 肺腺癌及其相关基因和细胞类型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 513个肺腺癌组织和59个非肿瘤组织 |
| 672 | 2024-08-07 |
The role of metabolic memory in diabetic kidney disease: identification of key genes and therapeutic targets
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1379821
PMID:39092227
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研究论文 | 本研究探讨了代谢记忆在糖尿病肾病中的作用，并通过单细胞RNA测序数据识别关键基因和治疗靶点 | 本研究首次结合人类数据和动物模型，识别出与代谢记忆和纤维化相关的关键基因NDRG1，并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于数据库数据和动物模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探索代谢记忆在糖尿病肾病中的作用及潜在的治疗靶点 | 糖尿病肾病中的代谢记忆和纤维化相关基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及12种细胞类型，包括人类和动物模型 |
| 673 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptome analysis reveals distinct cell populations in dorsal root ganglia and their potential roles in diabetic peripheral neuropathy
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0306424
PMID:39083491
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研究论文 | 单细胞转录组分析揭示了背根神经节中不同细胞群体及其在糖尿病周围神经病中的潜在作用 | 首次系统性地分析了背根神经节的细胞组成及其在糖尿病周围神经病中的作用 | 缺乏对背根神经节在糖尿病周围神经病发病机制的深入探索 | 深入了解背根神经节的细胞类型组成及其在糖尿病周围神经病中的角色 | 健康对照组及糖尿病周围神经病大鼠的背根神经节组织 | 数字病理学 | 糖尿病周围神经病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自健康对照组和糖尿病周围神经病大鼠的背根神经节组织 |
| 674 | 2024-08-05 |
Systems biology-based analysis exploring shared biomarkers and pathogenesis of myocardial infarction combined with osteoarthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1398990
PMID:39086489
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研究论文 | 本研究通过系统生物学探讨了心肌梗死和骨关节炎共享的生物标志物和发病机制 | 首次揭示了DUSP1、FOS和THBS1作为心肌梗死和骨关节炎的三个新共享生物标志物及其相关信号通路 | 未提及研究的具体局限性 | 探讨心肌梗死与骨关节炎的共享生物标志物和发病机制 | 心肌梗死（MI）和骨关节炎（OA）患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 心肌梗死与骨关节炎 | 基因表达分析，单细胞RNA测序，RT-qPCR | 无特定模型类型 | 基因表达数据 | 涉及心肌细胞和软骨细胞的样本，具体样本数量未说明 |
| 675 | 2024-08-05 |
HIF2A mediates lineage transition to aggressive phenotype of cancer-associated fibroblasts in lung cancer brain metastasis
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2356942
PMID:38778816
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研究论文 | 这篇文章探讨了HIF2A在肺癌脑转移中促进癌症相关成纤维细胞的谱系转变及其侵袭性表型的机制 | 本研究揭示了肺癌脑转移中HIF-2α诱导的CAF谱系转变及其功能改变的新机制 | 本研究的局限性在于数据主要来源于单细胞RNA测序，可能无法全面反映所有CAF的复杂性 | 本研究的目的是探讨肺癌脑转移中的肿瘤微环境变化及CAF的作用 | 研究对象为不同转移阶段的肺癌患者的CAF及其在脑转移中的表现 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 大规模RNA测序, 多重免疫组化 | NA | RNA数据 | 包括四对脑转移和原发肺癌样本的配对样本 |
| 676 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell analysis of longitudinal t(8;21) AML reveals heterogeneous immune cell infiltration and prognostic signatures
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1424933
PMID:39086485
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研究论文 | 本研究对t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫微环境进行了综合单细胞分析 | 本研究通过scRNA-seq发现了与疾病进展和药物耐受性相关的独特T细胞特征 | 论文未提及具体的样本数量及其来源，限制了结果的普遍性 | 探究急性髓性白血病患者的免疫细胞浸润状况与预后的关系 | t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫细胞特征 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞浸润数据 | 包括原发和纵向t(8;21)急性髓性白血病样本以及外部队列 |
| 677 | 2024-08-04 |
Integrated analyses of single-cell transcriptome and Mendelian randomization reveal the protective role of FCRL3 in multiple sclerosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1428962
PMID:39076991
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析，发现FCRL3在多发性硬化中的保护作用 | 创新点在于整合了单细胞转录组和孟德尔随机化分析来寻找MS的新治疗靶点 | 本文未提及具体的实验验证或临床试验数据 | 发现多发性硬化的新治疗靶点 | 对FCRL3在多发性硬化中的作用进行分析 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序，孟德尔随机化 | NA | 基因组数据，单细胞转录组数据 | 收集了1123个在七种外周细胞类型中观察到的表达变化 |
| 678 | 2024-08-04 |
Methazolamide Can Treat Atherosclerosis by Increasing Immunosuppressive Cells and Decreasing Expressions of Genes Related to Proinflammation, Calcification, and Tissue Remodeling
2024, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2024/5009637
PMID:39081633
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研究论文 | 本研究探讨了美唑胺通过增加免疫抑制细胞和减少与炎症、钙化及组织重塑相关基因表达来治疗动脉粥样硬化的机制 | 首次将美唑胺的治疗机制与动脉粥样硬化发病机制结合起来，揭示了其在免疫调节方面的作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性尚待进一步验证 | 探讨美唑胺在动脉粥样硬化治疗中的作用及其机制 | 使用ApoE-/-小鼠建立的动脉粥样硬化动物模型 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | 生物样本数据 | ApoE-/-小鼠，数量未具体提及 |
| 679 | 2024-08-04 |
Elucidating the multifaceted role of MGAT1 in hepatocellular carcinoma: integrative single-cell and spatial transcriptomics reveal novel therapeutic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1442722
PMID:39081317
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研究论文 | 本研究探讨了糖基转移酶相关基因在肝细胞癌中的作用，提供了新的免疫治疗见解 | 利用单细胞和空间转录组学结合的技术揭示了MGAT1作为潜在免疫治疗靶点的创新潜力 | 未提供特定的研究限制信息 | 探讨糖基转移酶基因在肝细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌中不同细胞亚群及其糖基转移酶基因的活性 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | RNA-seq | 未提供特定样本数量信息 |
| 680 | 2024-08-05 |
SIGLEC15, negatively correlated with PD-L1 in HCC, could induce CD8+ T cell apoptosis to promote immune evasion
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2376264
PMID:38988824
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研究论文 | 本研究探讨了SIGLEC15在肝细胞癌中的功能角色及其对免疫逃逸的影响 | 发现SIGLEC15在肝细胞癌组织中增加，并与PD-L1呈负相关，以促进免疫逃逸 | 未能直接影响肿瘤增殖的机制尚不完全清楚 | 阐明SIGLEC15在肝细胞癌中的作用及其如何促进免疫逃逸 | 主要研究肝细胞癌中的SIGLEC15表达及其对CD8+ T细胞的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | PCR分析、免疫组化、流式细胞术、RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本、RNA序列数据 | 使用了HCC样本和小鼠模型的多种细胞系及单细胞样本 |