单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1387 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2024-08-05 |
Systems biology-based analysis exploring shared biomarkers and pathogenesis of myocardial infarction combined with osteoarthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1398990
PMID:39086489
|
研究论文 | 本研究通过系统生物学探讨了心肌梗死和骨关节炎共享的生物标志物和发病机制 | 首次揭示了DUSP1、FOS和THBS1作为心肌梗死和骨关节炎的三个新共享生物标志物及其相关信号通路 | 未提及研究的具体局限性 | 探讨心肌梗死与骨关节炎的共享生物标志物和发病机制 | 心肌梗死（MI）和骨关节炎（OA）患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 心肌梗死与骨关节炎 | 基因表达分析，单细胞RNA测序，RT-qPCR | 无特定模型类型 | 基因表达数据 | 涉及心肌细胞和软骨细胞的样本，具体样本数量未说明 |
| 642 | 2024-08-05 |
HIF2A mediates lineage transition to aggressive phenotype of cancer-associated fibroblasts in lung cancer brain metastasis
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2356942
PMID:38778816
|
研究论文 | 这篇文章探讨了HIF2A在肺癌脑转移中促进癌症相关成纤维细胞的谱系转变及其侵袭性表型的机制 | 本研究揭示了肺癌脑转移中HIF-2α诱导的CAF谱系转变及其功能改变的新机制 | 本研究的局限性在于数据主要来源于单细胞RNA测序，可能无法全面反映所有CAF的复杂性 | 本研究的目的是探讨肺癌脑转移中的肿瘤微环境变化及CAF的作用 | 研究对象为不同转移阶段的肺癌患者的CAF及其在脑转移中的表现 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 大规模RNA测序, 多重免疫组化 | NA | RNA数据 | 包括四对脑转移和原发肺癌样本的配对样本 |
| 643 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell analysis of longitudinal t(8;21) AML reveals heterogeneous immune cell infiltration and prognostic signatures
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1424933
PMID:39086485
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研究论文 | 本研究对t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫微环境进行了综合单细胞分析 | 本研究通过scRNA-seq发现了与疾病进展和药物耐受性相关的独特T细胞特征 | 论文未提及具体的样本数量及其来源，限制了结果的普遍性 | 探究急性髓性白血病患者的免疫细胞浸润状况与预后的关系 | t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫细胞特征 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞浸润数据 | 包括原发和纵向t(8;21)急性髓性白血病样本以及外部队列 |
| 644 | 2024-08-04 |
Integrated analyses of single-cell transcriptome and Mendelian randomization reveal the protective role of FCRL3 in multiple sclerosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1428962
PMID:39076991
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析，发现FCRL3在多发性硬化中的保护作用 | 创新点在于整合了单细胞转录组和孟德尔随机化分析来寻找MS的新治疗靶点 | 本文未提及具体的实验验证或临床试验数据 | 发现多发性硬化的新治疗靶点 | 对FCRL3在多发性硬化中的作用进行分析 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序，孟德尔随机化 | NA | 基因组数据，单细胞转录组数据 | 收集了1123个在七种外周细胞类型中观察到的表达变化 |
| 645 | 2024-08-04 |
Methazolamide Can Treat Atherosclerosis by Increasing Immunosuppressive Cells and Decreasing Expressions of Genes Related to Proinflammation, Calcification, and Tissue Remodeling
2024, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2024/5009637
PMID:39081633
|
研究论文 | 本研究探讨了美唑胺通过增加免疫抑制细胞和减少与炎症、钙化及组织重塑相关基因表达来治疗动脉粥样硬化的机制 | 首次将美唑胺的治疗机制与动脉粥样硬化发病机制结合起来，揭示了其在免疫调节方面的作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性尚待进一步验证 | 探讨美唑胺在动脉粥样硬化治疗中的作用及其机制 | 使用ApoE-/-小鼠建立的动脉粥样硬化动物模型 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | 生物样本数据 | ApoE-/-小鼠，数量未具体提及 |
| 646 | 2024-08-04 |
Elucidating the multifaceted role of MGAT1 in hepatocellular carcinoma: integrative single-cell and spatial transcriptomics reveal novel therapeutic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1442722
PMID:39081317
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研究论文 | 本研究探讨了糖基转移酶相关基因在肝细胞癌中的作用，提供了新的免疫治疗见解 | 利用单细胞和空间转录组学结合的技术揭示了MGAT1作为潜在免疫治疗靶点的创新潜力 | 未提供特定的研究限制信息 | 探讨糖基转移酶基因在肝细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌中不同细胞亚群及其糖基转移酶基因的活性 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | RNA-seq | 未提供特定样本数量信息 |
| 647 | 2024-08-05 |
SIGLEC15, negatively correlated with PD-L1 in HCC, could induce CD8+ T cell apoptosis to promote immune evasion
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2376264
PMID:38988824
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研究论文 | 本研究探讨了SIGLEC15在肝细胞癌中的功能角色及其对免疫逃逸的影响 | 发现SIGLEC15在肝细胞癌组织中增加，并与PD-L1呈负相关，以促进免疫逃逸 | 未能直接影响肿瘤增殖的机制尚不完全清楚 | 阐明SIGLEC15在肝细胞癌中的作用及其如何促进免疫逃逸 | 主要研究肝细胞癌中的SIGLEC15表达及其对CD8+ T细胞的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | PCR分析、免疫组化、流式细胞术、RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本、RNA序列数据 | 使用了HCC样本和小鼠模型的多种细胞系及单细胞样本 |
| 648 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies downregulated phosphodiesterase 8B as a novel oncogene in IDH-mutant glioma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427200
PMID:38989284
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别下调的磷酸二酯酶8B为IDH突变胶质瘤中的新型癌基因 | 本研究首次阐明磷酸二酯酶8B在高等级胶质瘤中的独特表达模式，并揭示其作为代谢相关癌基因的双重角色 | 研究主要集中在胶质瘤的代谢通路和基因表达，未深入分析其他可能影响结果的因素 | 本研究旨在揭示不同等级胶质瘤的细胞和代谢特征 | 研究对象是高等级（胶质母细胞瘤，WHO IV级）和低等级（少突胶质瘤，WHO II级）胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 包括多个胶质瘤细胞类型的样本，具体样本量未提供 |
| 649 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics Resolve an Emphysema-Specific Lymphoid Follicle B Cell Signature in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-01-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0507LE
PMID:37934672
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研究论文 | 这篇文章探讨了慢性阻塞性肺疾病中气肿特有的淋巴滤泡B细胞特征的转录组学。 | 本研究通过空间转录组学方法揭示了在气肿患者中B细胞活化的独特特征和转录网络 | 样本量相对较小，且仅限于特定患者群体 | 研究气肿对慢性阻塞性肺疾病患者淋巴滤泡中B细胞转录组特征的影响 | 研究对象为40名慢性阻塞性肺疾病患者和曾经吸烟者的肺部样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 空间转录组学 | NA | 肺部组织样本 | 40名患者的样本 |
| 650 | 2024-08-05 |
Cancer-wide in silico analyses using differentially expressed genes demonstrate the functions and clinical relevance of JAG, DLL, and NOTCH
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0307943
PMID:39074091
|
研究论文 | 本文通过分析差异表达基因揭示了JAG、DLL和NOTCH家族在癌症恶性进展中的功能和临床相关性 | 通过综合差异表达基因和生存分析，提出了JAG、DLL和NOTCH家族的未被探索的调控功能和协同效应 | NA | 阐明JAG、DLL和NOTCH家族的普遍功能及其与各种生物功能的联系 | 15种癌症的差异表达基因 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15种癌症类型的临床数据 |
| 651 | 2024-08-05 |
Multiomics Analysis of Disulfidptosis Patterns and Integrated Machine Learning to Predict Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨了二硫化物死亡对肺腺癌免疫微环境和免疫治疗的影响 | 本研究引入了一种基于二硫化物死亡基因的预测风险模型，能够有效预测肺腺癌患者的生存率和治疗结果 | 未提及具体局限性 | 研究二硫化物细胞死亡对肺腺癌患者免疫治疗反应的影响 | 聚焦于与二硫化物死亡相关的基因在肺腺癌中的作用 | 机器学习 | 肺癌 | 转录组学、机器学习算法 | 预测模型 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌多组学队列 |
| 652 | 2024-08-05 |
Nicotinamide phosphoribosyltransferase prompts bleomycin-induced pulmonary fibrosis by driving macrophage M2 polarization in mice
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.94482
PMID:38773984
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研究论文 | 该研究探讨了烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)在小鼠中的肺纤维化中驱动巨噬细胞M2极化的作用 | 研究首次揭示了NAMPT在肺纤维化发病机制中的作用，特别是在巨噬细胞M2极化中的创新机制 | 该研究主要基于小鼠模型，未能在临床试验中验证结果 | 研究NAMPT在特发性肺纤维化中的作用及其机制 | 研究对象为肺纤维化患者的临床样本及小鼠模型 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA测序、Western blot、qRT-PCR、ELISA和免疫组化染色 | 小鼠模型 | 临床样本和小鼠肺纤维化模型数据 | 临床样本和小鼠模型，具体样本数量未说明 |
| 653 | 2024-08-04 |
Short-chain fatty acids regulate erastin-induced cardiomyocyte ferroptosis and ferroptosis-related genes
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1409321
PMID:39070785
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研究论文 | 这项研究探讨了短链脂肪酸对心肌细胞铁死亡的影响以及ATF3的表达。 | 本研究首次揭示了短链脂肪酸在缺血刺激心肌细胞中对铁死亡途径的调节作用。 | 本研究未在临床环境中验证短链脂肪酸的效果。 | 探讨短链脂肪酸对心肌细胞铁死亡及其相关基因的影响。 | 主要研究对象为缺血刺激下的心肌细胞。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序, RT-PCR, Western blot | 模仿缺血再灌注的细胞模型 | 单细胞RNA数据 | 从公共人类心肌梗死单细胞RNA-seq数据集中提取并重新聚类的心肌细胞数据 |
| 654 | 2024-08-04 |
A systematic overview of single-cell transcriptomics databases, their use cases, and limitations
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1417428
PMID:39040140
|
综述 | 本文系统性地审查了大规模单细胞RNA测序数据库，分类并讨论了其用途及局限性 | 提出了单细胞RNA测序数据库的分类，并指出理解其局限性对有效利用数据的重要性 | 未具体提及具体案例或数据分析的细节 | 探讨单细胞转录组数据库的使用案例及面临的技术挑战 | 大规模的单细胞RNA-seq数据库 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 655 | 2024-08-04 |
Targeting tumor cell-to-macrophage communication by blocking Vtn-C1qbp interaction inhibits tumor progression via enhancing macrophage phagocytosis
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.94537
PMID:38773982
|
研究论文 | 该研究探讨了通过阻断Vtn-C1qbp相互作用来增强巨噬细胞吞噬作用从而抑制肿瘤进展 | 发现Vtn-C1qbp轴是肿瘤中的一种新的抗吞噬信号，并提出以Vtn和C1qbp相互作用作为抗肿瘤免疫治疗的新分子靶点 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏对人类肿瘤的直接验证 | 探究调控巨噬细胞吞噬作用的关键分子及其相互作用，为肿瘤治疗提供新策略 | 研究Vtn和C1qbp在巨噬细胞吞噬作用中的功能 | 数字病理 | 乳腺癌 | CRISPR筛选、RNA测序、免疫沉淀、质谱分析、免疫荧光 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用单细胞测序数据并分析来自癌症基因组图谱数据库的数据 |
| 656 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of human PBMCs in healthy and type 2 diabetes populations: dysregulated immune networks in type 2 diabetes unveiled through single-cell profiling
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1397661
PMID:39072276
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研究论文 | 本文通过单细胞分析揭示了2型糖尿病患者中免疫网络的失调 | 首次通过单细胞RNA测序特征化了2型糖尿病患者免疫细胞的性质和网络 | 缺乏对其他类型糖尿病和健康人群的比较分析 | 探讨与2型糖尿病相关的免疫细胞的特征 | 健康人和2型糖尿病患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 来自非糖尿病和2型糖尿病患者的外周血单核细胞样本 |
| 657 | 2024-08-04 |
Inferring Tree-Shaped Single-Cell Trajectories with Totem
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_9
PMID:39068362
|
研究论文 | 本文介绍了通过Totem推断树状单细胞轨迹和伪时间的方法 | 提出了两种用户友好的协议，可以灵活地推断树状单细胞轨迹，解决复杂拓扑结构预测的挑战 | 主要集中在单细胞转录组数据的应用，未涉及其他类型的数据 | 研究单细胞转录组数据中细胞发育过程的轨迹推断 | 人类骨髓CD34+细胞，研究三条谱系的分支：红系、淋巴系和单核系 | 数字病理学 | NA | 转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 658 | 2024-08-04 |
Unsupervised Single-Cell Clustering with Asymmetric Within-Sample Transformation and Per-Cluster Supervised Features Selection
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_8
PMID:39068361
|
研究论文 | 本文展示了如何将不对称样本内变换应用于单细胞RNA测序数据，与之前的缺失值插补相匹配 | 提出了一种不对称变换的方法以处理低表达强度，同时保留高表达基因水平，并结合每个基因的熵估计进行非信息基因的去除 | 样本量和不同基因类型的影响可能未在研究中充分探索 | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析和基因特征选择 | 研究对象为单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | GLM | 文本 | NA |
| 659 | 2024-08-04 |
RNA-Seq Analysis of Mammalian Prion Disease
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_20
PMID:39068373
|
研究论文 | 本文介绍了利用单细胞RNA测序数据分析哺乳动物朊病毒病的RNA测序方法 | 提出了一种可重复使用的RNA测序分析协议，以揭示朊病毒病中的转录变化 | NA | 揭示哺乳动物朊病毒病的转录特征 | 哺乳动物朊病毒病的单细胞RNA测序数据 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 使用自NCBI GEO数据库获得的单细胞数据集 |
| 660 | 2024-08-05 |
Inferring Novel Cells in Single-Cell RNA-Sequencing Data
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_7
PMID:39068360
|
研究论文 | 本文探讨了在单细胞RNA测序数据中推断新细胞类型的方法 | 提出了三类推断新细胞的方法，包括未监督和异常检测的方法、监督和半监督的方法、以及基于拷贝数变异的方法 | 推断新细胞在常规单细胞RNA测序分析中仍然具有挑战性 | 研究单细胞RNA测序技术中识别和表征新细胞类型 | 利用单细胞RNA测序技术分析细胞类型及其亚群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA |