单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2024-08-18 |
Integrated bioinformatics analysis of nucleotide metabolism based molecular subtyping and biomarkers in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1430171
PMID:39148731
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，探讨了核苷酸代谢在肺腺癌分子分型和生物标志物中的作用 | 首次通过大规模数据分析和单细胞测序，揭示了核苷酸代谢基因在肺腺癌中的分子分型和预后差异 | 研究主要基于TCGA数据库和细胞系实验，需要进一步的临床验证 | 探讨核苷酸代谢在肺腺癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者的核苷酸代谢基因及其在临床特征和免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 非负矩阵分解（NMF）聚类，加权相关网络分析（WGCNA），机器学习技术 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 使用TCGA数据库中的肺腺癌样本，具体数量未明确 |
| 642 | 2024-08-18 |
Single-cell RNA Sequencing Identifies Natural Kill Cell-Related Transcription Factors Associated With Age-Related Macular Degeneration
2024, Evolutionary bioinformatics online
DOI:10.1177/11769343241272413
PMID:39149137
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了与年龄相关性黄斑变性（AMD）相关的自然杀伤细胞（NK细胞）的转录因子 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和机器学习模型，揭示了NK细胞在AMD中的调控机制和关键转录因子 | NA | 揭示NK细胞在年龄相关性黄斑变性中的免疫反应和细胞因子调控作用 | 自然杀伤细胞（NK细胞）及其在年龄相关性黄斑变性（AMD）中的作用 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | 随机森林和决策树 | 转录组数据 | NA |
| 643 | 2024-08-17 |
NOP16 promotes hepatocellular carcinoma progression and triggers EMT through the Keap1-Nrf2 signaling pathway
2024, Technology and health care : official journal of the European Society for Engineering and Medicine
IF:1.4Q3
DOI:10.3233/THC-231256
PMID:38251077
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研究论文 | 本研究分析了NOP16在肝细胞癌中的表达及其临床意义，并探讨了其通过Keap1-Nrf2信号通路促进肝细胞癌进展和触发上皮-间质转化的机制。 | 首次报道NOP16在肝细胞癌中的高表达及其作为独立不良预后因素的作用，并揭示了NOP16通过激活Keap/Nrf2信号通路影响细胞周期、细胞凋亡和上皮-间质转化的功能。 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的分析以及体外实验，缺乏体内实验验证。 | 探讨NOP16在肝细胞癌中的表达及其临床意义，并揭示其促进肝细胞癌进展的分子机制。 | NOP16在肝细胞癌中的表达及其与临床特征的关系，以及其通过Keap1-Nrf2信号通路影响肝细胞癌进展的机制。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA干扰、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 包括20种癌症类型的泛癌分析，以及肝细胞癌患者的肿瘤组织和正常组织样本。 |
| 644 | 2024-08-17 |
Evaluating the causal effect of circulating proteome on the risk of inflammatory bowel disease-related traits using Mendelian randomization
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1434369
PMID:39144148
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化（MR）分析框架，旨在识别与炎症性肠病（IBD）特征因果关联的循环蛋白质 | 本研究采用大规模的两样本MR方法，结合单细胞测序分析、蛋白质-蛋白质相互作用评估、通路富集分析和药物靶点评估，以深入探讨IBD的潜在机制和治疗靶点 | NA | 识别与炎症性肠病特征因果关联的循环蛋白质 | 循环蛋白质与炎症性肠病及其亚型的遗传关联 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 孟德尔随机化（MR） | NA | 蛋白质 | 利用炎症性肠病遗传学联盟的信息进行分析 |
| 645 | 2024-08-15 |
Single-Cell Histone Modification Profiling with Cell Enrichment Using sortChIC
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4071-5_14
PMID:39141239
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研究论文 | 本文介绍了一种名为sortChIC的排序辅助单细胞染色质免疫切割测序技术，用于在单细胞水平上绘制组蛋白后转录修饰（PTMs）图谱 | 该技术结合了组蛋白PTM位置的映射与基于表面染色的细胞富集，使得可以整合现有的稀有细胞类型富集策略 | NA | 旨在研究细胞类型特异性动态变化，特别是在异质性体内环境中 | 单细胞中的组蛋白后转录修饰（PTMs） | 生物技术 | NA | sortChIC | NA | 单细胞数据 | NA |
| 646 | 2024-08-14 |
Sleep Deprivation Impairs Intestinal Mucosal Barrier by Activating Endoplasmic Reticulum Stress in Goblet Cells
2024-01, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2023.10.004
PMID:37918798
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研究论文 | 研究探讨了睡眠剥夺对肠道杯状细胞的影响及其机制 | 首次揭示了睡眠剥夺通过激活内质网应激损害肠道黏膜屏障的机制 | 研究仅使用了小鼠模型，可能需要进一步的人体研究验证 | 探究睡眠剥夺对肠道杯状细胞的影响及其机制 | 肠道杯状细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 647 | 2024-08-14 |
Integrating Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing to identify therapeutic targets of baicalin for type 2 diabetes mellitus
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1403943
PMID:39130628
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术，从遗传角度识别了黄芩苷治疗2型糖尿病的潜在治疗靶点 | 本研究创新性地结合了孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术，为天然产物开发提供了一种新的分析框架 | 需要进一步的基础实验和临床研究来深入探讨2型糖尿病的分子机制 | 从遗传角度识别黄芩苷治疗2型糖尿病的潜在治疗靶点 | 黄芩苷的治疗靶点及其与胰岛细胞的关联 | NA | 2型糖尿病 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据, 转录组数据 | 74,124例病例 vs. 824,006例对照, 9,978例病例 vs. 12,348例对照 |
| 648 | 2024-08-14 |
Prognostic and immunotherapeutic significances of M2 macrophage-related genes signature in lung cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.98044
PMID:39132146
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研究论文 | 研究旨在探讨M2巨噬细胞相关基因在肺癌患者中的免疫学意义，特别是构建一个风险评分来预测患者的预后和免疫治疗反应 | 开发了一种新的风险评分，通过识别和整合12个M2巨噬细胞相关基因，并探索了高风险和低风险组之间的潜在功能差异 | NA | 研究M2巨噬细胞相关基因在肺癌中的预后和免疫治疗意义 | 肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA数据集和免疫治疗反应数据库进行分析 |
| 649 | 2024-08-14 |
ELF4 was a prognostic biomarker and related to immune infiltrates in glioma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96886
PMID:39132148
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研究论文 | 本研究探讨了ELF4作为胶质瘤的预后生物标志物及其与免疫浸润的关系 | 首次详细分析了ELF4在胶质瘤病理中的作用及其对临床结果的影响，并揭示了ELF4在免疫调节中的作用 | NA | 研究ELF4在胶质瘤中的作用及其对预后的影响 | ELF4在胶质瘤中的表达及其与恶性表型和不良临床结果的关系 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST-seq） | NA | 基因组数据 | 使用了CGGA、TCGA和Gravendeel等多个数据库的数据 |
| 650 | 2024-08-14 |
Screening of PDSS1 as a Potential Biomarker for Hepatocellular Carcinoma Based on a Copper-Related Prognostic Signature through Bulk and Single-cell RNA-sequencing Analysis
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96867
PMID:39132167
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序分析，探讨了铜相关基因在肝细胞癌中的作用，并鉴定PDSS1作为潜在的生物标志物。 | 首次综合分析了铜死亡相关基因在肝细胞癌中的作用，并利用单细胞RNA测序技术揭示了PDSS1在肿瘤微环境中的表达特征和功能。 | NA | 旨在通过多组学方法全面分析铜死亡相关基因在肝细胞癌中的作用。 | 肝细胞癌中的铜死亡相关基因及其潜在生物标志物PDSS1。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA表达数据 | 使用了来自TCGA和ICGC数据库的数据，以及单细胞RNA测序数据。 |
| 651 | 2024-08-14 |
The combination of single-cell and RNA sequencing analysis decodes the melanoma tumor microenvironment and identifies novel T cell-associated signature genes
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96484
PMID:39132169
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了34个黑色素瘤样本，识别出与免疫治疗相关的T细胞标志性基因，并探讨了这些基因与免疫微环境的关系 | 首次揭示了标志性基因PEB4B与黑色素瘤免疫微环境的潜在关联，并通过多种免疫荧光和免疫浸润评估进行了探索 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术解码黑色素瘤肿瘤微环境，并识别新的T细胞相关标志性基因 | 黑色素瘤患者的免疫治疗反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和COX回归分析 | 基因数据 | 34个黑色素瘤样本 |
| 652 | 2024-08-14 |
Systematic analysis on the horse-shoe-like effect in PCA plots of scRNA-seq data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae109
PMID:39132288
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研究论文 | 本研究系统分析了单细胞RNA测序数据PCA图中马蹄形效应的现象 | 首次系统解释了PCA图中马蹄形效应，并提出了一个数学模型来解释这一现象 | NA | 探索并解释单细胞RNA测序数据PCA图中的马蹄形效应 | 单细胞RNA测序数据的PCA图中的马蹄形效应 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA | 数据集 | 使用模拟和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 653 | 2024-08-13 |
Characterizing Rare Dormant and Cycling Lineages Using the Watermelon System
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3882-8_12
PMID:39037657
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研究论文 | 本文介绍了Watermelon系统，该系统能够在单细胞水平上同时追踪细胞谱系、转录状态和增殖状态 | Watermon系统通过使用基于条形码的谱系追踪方法，实现了从单细胞RNA测序转录数据中解卷积谱系身份 | NA | 开发一种能够在单细胞水平上同时追踪细胞谱系、转录状态和增殖状态的新系统 | 罕见的休眠和循环细胞谱系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录数据 | NA |
| 654 | 2024-08-12 |
Commensal bacteria promote type I interferon signaling to maintain immune tolerance in mice
2024-Jan-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230063
PMID:38085267
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研究论文 | 本文揭示了共生细菌Bacteroides fragilis通过经典的抗病毒途径调节肠道树突细胞和调节T细胞反应，从而促进肠道免疫耐受 | 首次阐明共生细菌通过I型干扰素信号途径支持肠道免疫耐受的机制 | NA | 探究共生细菌如何通过I型干扰素信号途径维持肠道免疫耐受 | 共生细菌Bacteroides fragilis、肠道树突细胞和调节T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肠道调节T细胞 |
| 655 | 2024-08-11 |
Revealing the characteristics of SETD2-mutated clear cell renal cell carcinoma through tumor heterogeneity analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1447139
PMID:39119581
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了SETD2突变的透明细胞肾细胞癌的肿瘤异质性特征 | 发现了SETD2突变诱导的亚群可以刺激巨噬细胞M2极化，增加了转移倾向，并建立了一个有效的预测透明细胞肾细胞癌患者总体生存的预后模型 | NA | 探究SETD2突变对透明细胞肾细胞癌特征和行为的影响 | 透明细胞肾细胞癌中的SETD2突变 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | PCA, Leiden算法, InferCNV, VIA, cellphoneDB, Deseq2, hdWGCNA, Cox, LASSO | RNA测序数据 | 69和53个独特的细胞集群，进一步分类为12种独特的细胞类型 |
| 656 | 2024-08-10 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Reveals Ferroptosis as The Most Enriched Programmed Cell Death Process in Hemorrhage Stroke-induced Oligodendrocyte-mediated White Matter Injury
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.96262
PMID:39113700
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组和空间转录组技术，探讨了脑出血后程序性细胞死亡相关基因表达趋势，发现铁死亡是主要程序性细胞死亡过程，主要影响成熟的少突胶质细胞 | 首次揭示了脑出血后铁死亡作为主要程序性细胞死亡过程，并阐明了微胶质细胞与少突胶质细胞之间的特定相互作用 | 研究仅在 rat 模型上进行，需要进一步在人类中验证 | 探讨脑出血后不同程序性细胞死亡模式的区别及其对白质损伤的影响 | 脑出血后的程序性细胞死亡过程及其对神经系统的影响 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞 RNA 测序，空间 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | rat 脑组织样本 |
| 657 | 2024-08-10 |
scRNA sequencing technology for PitNET studies
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1414223
PMID:39114291
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综述 | 本文综述了使用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）研究垂体神经内分泌肿瘤（PitNETs）的最新进展 | scRNA-seq技术因其单细胞水平的高分辨率而在研究中发挥重要作用 | NA | 理解调控这些高度异质性肿瘤的分子机制 | 垂体神经内分泌肿瘤（PitNETs） | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA数据 | NA |
| 658 | 2024-08-10 |
Single-cell RNA sequencing in ovarian cancer: revealing new perspectives in the tumor microenvironment
2024, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/SMSG9047
PMID:39114691
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在卵巢癌肿瘤微环境研究中的应用和进展 | 单细胞测序技术揭示了卵巢癌肿瘤微环境中细胞异质性和细胞间复杂交互作用的新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在卵巢癌肿瘤微环境研究中的应用，以改善诊断和治疗策略 | 卵巢癌肿瘤微环境中的细胞异质性和细胞间交互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 659 | 2024-08-10 |
scDiffCoAM: A complete framework to identify potential biomarkers for esophageal squamous cell carcinoma using scRNA-Seq data analysis
2024, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:39119913
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研究论文 | 本文提出了一种完整的差异共表达分析框架scDiffCoAM，用于从scRNA-Seq数据中提取网络模块并识别关键基因，以发现食管鳞状细胞癌的潜在生物标志物 | 该方法在大多数情况下表现优于其他四种现有的关键基因发现方法，并能识别其他方法未检测到的独特潜在生物标志物 | NA | 旨在通过scRNA-Seq数据分析识别食管鳞状细胞癌的潜在生物标志物 | 食管鳞状细胞癌的scRNA-Seq数据 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | scRNA-Seq | 差异共表达分析 | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 660 | 2024-08-09 |
Histamine H4 receptor and TRPV1 mediate itch induced by cadaverine, a metabolite of the microbiome
2024 Jan-Dec, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069241272149
PMID:39079948
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研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物代谢产物尸胺是否通过组胺H4受体（H4R）和瞬时受体电位香草酸亚型1（TRPV1）介导小鼠的瘙痒反应 | 首次发现尸胺可能作为H4R的内源性配体，并通过H4R/TRPV1信号通路在初级感觉神经元中诱导瘙痒 | NA | 研究尸胺在生理和病理条件下是否调节疼痛或瘙痒 | 尸胺对小鼠瘙痒反应的影响及其分子机制 | NA | NA | 分子对接模拟、scRNA-Seq数据分析、钙成像分析、膜片钳记录 | NA | 基因表达数据、钙成像数据、电生理数据 | 小鼠模型 |