单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202401-202401] [清除筛选条件]
当前共找到 1392 篇文献,本页显示第 621 - 640 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
621 2024-10-12
Identification of a senescence-related transcriptional signature to uncover molecular subtypes and key genes in hepatocellular carcinoma
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据,分析了肝细胞癌患者的基因表达特征,识别出与衰老相关的分子亚型和关键基因 本研究开发了一个肝细胞癌特异性的细胞衰老风险模型,并识别出G6PD作为潜在的衰老相关靶点 由于肿瘤异质性和缺乏通用的细胞衰老标志物,准确测量不同类型肿瘤中的细胞衰老水平具有挑战性 研究肝细胞癌中与衰老相关的分子特征 肝细胞癌患者的基因表达特征 数字病理学 肝癌 RNA测序 NA 基因表达数据 肝细胞癌样本 NA NA NA NA
622 2024-10-12
Integrating transcriptomics, eQTL, and Mendelian randomization to dissect monocyte roles in severe COVID-19 and gout flare
2024, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文通过整合转录组学、eQTL和孟德尔随机化方法,探讨了单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的作用 本文首次综合利用单细胞RNA测序、大规模全基因组关联研究和表达数量性状位点数据,分析了单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的分子机制 本文主要依赖于现有数据集的分析,缺乏实验验证 阐明单核细胞在痛风和COVID-19中的分子基础,以开发更有效的治疗方法 单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的功能 数字病理学 痛风 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 基因表达数据 涉及严重COVID-19、痛风和正常对照组的单细胞RNA测序数据 NA NA NA NA
623 2024-10-12
Batch-effect correction in single-cell RNA sequencing data using JIVE
2024, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文提出了一种增强的JIVE方法,用于大规模单细胞RNA测序数据的批次效应校正 本文改进了JIVE方法,使其适用于大规模单细胞数据,并引入了新的应用场景 NA 解决单细胞RNA测序分析中的批次效应问题 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 JIVE 基因表达数据 多个单细胞测序数据集 NA NA NA NA
624 2024-10-11
Single-cell RNA sequencing unveils unique transcriptomic signatures of endothelial cells and role of ENO1 in response to disturbed flow
2024-Jan-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞在不同流体剪切力下的独特转录组特征,并探讨了ENO1在响应扰流中的作用 首次通过单细胞RNA测序技术分析了扰流和脉动剪切力对内皮细胞转录组的影响,并揭示了ENO1在响应扰流中的关键作用 研究主要集中在体外实验,需要进一步的体内实验验证结果 探讨不同流体剪切力对内皮细胞转录组的影响及其在动脉粥样硬化中的作用 内皮细胞及其在扰流和脉动剪切力下的转录组变化 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 多个内皮细胞样本 NA NA NA NA
625 2024-10-11
Machine learning-based discovery of UPP1 as a key oncogene in tumorigenesis and immune escape in gliomas
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过机器学习方法发现UPP1基因在胶质瘤发生和免疫逃逸中的关键作用 本文首次将UPP1识别为胶质瘤发生和免疫逃逸的关键驱动基因 NA 揭示胶质瘤发生和进展的分子机制,以改进治疗和患者预后 胶质瘤样本的单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 机器学习 脑肿瘤 RNA测序 NA RNA 大规模胶质瘤样本 NA NA NA NA
626 2024-10-10
A Strategy to Compare Single-Cell RNA Sequencing Data Sets Provides Phenotypic Insight into Cellular Heterogeneity Underlying Biological Similarities and Differences Between Samples
2024, Bioinformatics and biology insights IF:2.3Q3
研究论文 本文介绍了一种名为scCompare的计算管道,用于比较单细胞RNA测序数据集,以评估样本间的生物相似性和差异 scCompare通过相关性映射将已知数据集的表型身份转移到另一个数据集,并使用统计学方法确定表型包容性的下限,有助于检测潜在的新细胞类型 NA 开发一种方法来评估单细胞RNA测序数据集之间的生物相似性和差异 单细胞RNA测序数据集 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用了来自人类外周血单核细胞和心肌细胞的数据集 NA NA NA NA
627 2024-10-10
Integrated multi-omics profiling reveals the ZZZ3/CD70 axis is a super-enhancer-driven regulator of diffuse large B-cell lymphoma cell-natural killer cell interactions
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
研究论文 研究探讨了超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞相互作用的机制 首次揭示了ZZZ3/CD70轴通过超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与自然杀伤细胞相互作用 研究主要基于体外实验和数据分析,缺乏体内实验验证 探究超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞相互作用的机制 弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞的相互作用 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序、批量RNA测序、H3K27ac ChIP-seq NA 基因表达数据 来自Heidelberg Open Research Data数据库和Gene Expression Omnibus数据库的数据 NA NA NA NA
628 2024-10-10
Unveiling the role of IGF1R in autism spectrum disorder: a multi-omics approach to decipher common pathogenic mechanisms in the IGF signaling pathway
2024, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用多组学方法探讨了胰岛素样生长因子(IGF)信号通路在自闭症谱系障碍(ASD)中的致病机制,特别是IGF1R的作用 首次通过多组学方法揭示了IGF1R在ASD中的关键作用,并发现了其在PV中间神经元发育中的影响 研究样本主要来自中国汉族人群和SFARI SPARK数据库,可能存在样本偏倚 探讨IGF信号通路在自闭症谱系障碍中的致病机制 自闭症谱系障碍患者及其相关基因和信号通路 基因组学 自闭症谱系障碍 全外显子测序(WES)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析、基因调控网络(GRN)分析 NA 基因组数据、转录组数据 中国汉族ASD患者群体及SFARI SPARK数据库中的ASD患者 NA NA NA NA
629 2024-10-10
Single-Cell Sequencing Combined with Transcriptome Sequencing to Explore the Molecular Mechanisms Related to Psoriasis
2024, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
研究论文 本研究结合单细胞测序和转录组测序,探索银屑病相关的分子机制 揭示了银屑病潜在的治疗药物和发病机制,为后续机制研究提供了新思路 NA 进一步探索银屑病的发病分子机制 银屑病的基因表达谱和差异表达基因 数字病理学 皮肤疾病 单细胞测序、转录组测序 NA 基因表达数据 涉及GSE151177、GSE41664、GSE30999三个数据集的基因表达谱 NA NA NA NA
630 2024-10-09
MerTK-dependent efferocytosis by monocytic-MDSCs mediates resolution of post-lung transplant injury
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究探讨了MerTK依赖的单核细胞来源的髓系抑制细胞(M-MDSCs)在肺移植后缺血再灌注损伤(IRI)中的作用 首次揭示了MerTK在M-MDSCs中的作用,通过吞噬凋亡细胞促进肺IRI的恢复 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 探讨MerTK在M-MDSCs中的作用,以促进肺移植后IRI的恢复 肺移植患者和小鼠模型中的M-MDSCs 数字病理学 肺移植相关疾病 单细胞RNA测序、流式细胞术 NA RNA序列数据 包括肺移植患者和小鼠模型的多个样本 NA NA NA NA
631 2024-10-09
The single-cell transcriptome of mTECs and CD4+ thymocytes under adhesion revealed heterogeneity of mTECs and a network controlled by Aire and lncRNAs
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究了在粘附过程中,自身免疫调节因子(Aire)基因缺陷对胸腺髓质上皮细胞(mTECs)和CD4+胸腺细胞单细胞转录组的影响 揭示了mTECs在转录组水平上的异质性,并发现Aire和长链非编码RNAs(lncRNAs)在调控mTECs和胸腺细胞网络中的作用 NA 探讨Aire基因缺陷对胸腺髓质上皮细胞和胸腺细胞在粘附过程中的影响 胸腺髓质上皮细胞(mTECs)和CD4+胸腺细胞 基因表达 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 野生型(WT)和Aire缺陷型(Aire-deficient)mTECs与WT单阳性(SP)CD4胸腺细胞共培养的单细胞库 NA NA NA NA
632 2024-10-09
The Role of Polycystic Kidney Disease-Like Homologs in Planarian Nervous System Regeneration and Function
2024, Integrative organismal biology (Oxford, England)
研究论文 研究了多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 首次全面研究了涡虫基因组中所有基因在感觉神经元中的表达和功能,并开发了用于机械感觉刺激的自动化设置 对数十种神经元亚型的功能了解仍然有限 探讨多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 涡虫的感觉神经元及其在机械刺激和食物检测中的功能 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涡虫的无性和雌雄同体品系 NA NA NA NA
633 2024-10-09
Prognosis of colorectal cancer, prognostic index of immunogenic cell death associated genes in response to immunotherapy, and potential therapeutic effects of ferroptosis inducers
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用生物信息学和医学大数据整合了来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)的数据集,全面概述了免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因在结直肠癌(CRC)中的表达 研究揭示了ICD相关基因在CRC中的分子通路和基因网络,并探讨了细胞死亡诱导剂(包括铁死亡诱导剂)的治疗潜力及其在精准医学中的应用 NA 阐明ICD在结直肠癌中的分子机制及其在治疗中的潜在应用 结直肠癌(CRC)中的免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因 生物信息学 结直肠癌 差异表达分析、共识聚类、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自GEO和TCGA的多个结直肠癌样本 NA NA NA NA
634 2024-10-09
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Transcriptional Signatures of Macrophages in Intrahepatic Cholestasis of Pregnancy
2024, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征 首次揭示了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征,并发现了炎症状态的倾向 NA 探究妊娠期肝内胆汁淤积症中免疫细胞和免疫基因的调控机制 妊娠期肝内胆汁淤积症中的巨噬细胞 数字病理学 妊娠期肝内胆汁淤积症 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA NA NA NA
635 2024-10-09
Dynamics of alternative polyadenylation in single root cells of Arabidopsis thaliana
2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
研究论文 研究了拟南芥根细胞中单细胞RNA测序数据中的选择性多聚腺苷酸化(APA)动态 开发了一种新的流程来识别和整合来自不同单细胞RNA测序数据的APA位点,并分析单细胞中的APA动态 NA 揭示选择性多聚腺苷酸化在拟南芥根细胞发育中的动态变化 拟南芥根细胞中的选择性多聚腺苷酸化位点及其动态变化 基因表达调控 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 超过150,000个细胞,涵盖四个主要组织分支、十二种细胞类型和三个发育阶段 NA NA NA NA
636 2024-08-07
Pegylated interferon-α for chronic hepatitis B … not ready to be shelved yet! New insights on its role using single-cell transcriptomics
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
637 2024-10-06
Enhanced mitophagy driven by ADAR1-GLI1 editing supports the self-renewal of cancer stem cells in HCC
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 研究探讨了ADAR1通过编辑GLI1促进肝癌干细胞自我更新的机制 首次揭示了ADAR1通过编辑GLI1在肝癌干细胞中调控线粒体自噬的新机制 NA 探讨ADAR1编辑在肝癌干细胞生成和维持中的作用机制 肝癌干细胞和ADAR1编辑的GLI1 癌症研究 肝癌 RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA NA NA NA
638 2024-10-06
Single-cell RNA sequencing reveals the immunoregulatory roles of PegIFN-α in patients with chronic hepatitis B
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了PegIFN-α在慢性乙型肝炎患者中的免疫调节作用 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了慢性乙型肝炎患者在接受PegIFN-α治疗前后外周免疫细胞的转录组图谱,并发现了三种特定的细胞亚群及其在治疗前后的变化 研究仅限于慢性乙型肝炎患者,且样本量未明确提及,可能影响结果的普适性 探讨慢性乙型肝炎患者的免疫细胞特征及PegIFN-α治疗的免疫调节作用 慢性乙型肝炎患者的外周免疫细胞 数字病理学 肝炎 单细胞RNA测序 NA RNA NA NA NA NA NA
639 2024-10-06
Embryonic development grand challenge: crosslinking advances
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
评论 本文讨论了胚胎发育研究的新进展及其跨学科意义 本文介绍了基于干细胞的3D方法在胚胎发育研究中的最新进展 本文主要讨论了胚胎发育研究的挑战和潜力,未提供具体的研究数据或方法 探讨胚胎发育研究的跨学科意义及其在基础生物医学科学中的潜力 胚胎发育的生物机制及其在科学、社会和政治领域的复杂性 NA NA 干细胞3D方法 NA NA NA NA NA NA NA
640 2024-10-06
Multi-omics profiling and experimental verification of tertiary lymphoid structure-related genes: molecular subgroups, immune infiltration, and prognostic implications in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能,包括分子亚型、免疫浸润和预后意义 首次全面研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能,并开发了精确的诺模图以增强其临床应用 研究依赖于公开数据,可能存在数据偏差;实验验证仅通过qRT-PCR进行,未涉及其他验证方法 探讨三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 肺腺癌患者及其三级淋巴结构相关基因 数字病理学 肺癌 单细胞测序 NA 基因表达数据 基于公开数据,具体样本数量未明确提及 NA NA NA NA
回到顶部