单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1299 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals the heterogeneity of B cells and tertiary lymphoid structures in muscle-invasive bladder cancer
2024-01-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04860-1
PMID:38216927
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研究论文 | 该研究揭示了肌肉侵袭性膀胱癌(MIBC)中B细胞和三级淋巴结构的异质性 | 本研究提供了关于MIBC中B细胞亚型的异质性及TLSs在MIBC结果中的重要作用的新见解 | 本研究的局限性在于样本大小较小，仅涉及12名膀胱癌患者 | 探索肌肉侵袭性膀胱癌中肿瘤浸润B细胞和三级淋巴结构的功能和机制 | 该研究的对象为12名膀胱癌患者的B细胞和T细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12名膀胱癌患者的11612个B细胞和55392个T细胞 |
| 622 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals aberrantly activated inter-tumor cell signaling pathways in the development of clear cell renal cell carcinoma
2024-01-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04818-9
PMID:38191424
|
研究论文 | 本研究探讨了在透明细胞肾细胞癌发展过程中异常激活的肿瘤细胞间信号传导通路 | 首次揭示了透明细胞肾细胞癌中异常激活的细胞间信号通路及其特定的癌干细胞亚群体的作用 | 只分析了少量病例，且未深入探讨信号通路的具体机制 | 研究透明细胞肾细胞癌发展相关的细胞间信号传导 | 6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本 | 数字病理学 | 透明细胞肾细胞癌 | scRNA-seq | NA | NA | 6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本 |
| 623 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals heterogeneous features of myeloid-derived suppressor cells in newborns
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1367230
PMID:38919617
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研究论文 | 本研究揭示了新生儿骨髓源抑制细胞的异质性特征和成熟轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序明确了新生儿多形核骨髓源抑制细胞的分化阶段 | 尚未深入探讨新生儿MDSCs在免疫系统中的具体功能和机制 | 探讨新生儿骨髓源抑制细胞的组成及功能异质性 | 新生儿外周血中的多形核骨髓源抑制细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 新生儿的外周血样本 |
| 624 | 2024-08-05 |
Transcriptomic profiling of thymic dysregulation and viral tropism after neonatal roseolovirus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1375508
PMID:38895117
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研究论文 | 本文描述了新生期玫瑰病毒感染后胸腺的转录组特征和病毒趋向 | 本研究首次提供了新生期玫瑰病毒感染后胸腺病毒趋向的完整图景，并揭示了感染期间细胞群体的主要转录组改变 | 未在摘要中提及具体的限制 | 研究新生期玫瑰病毒感染对胸腺的影响及其与自身免疫疾病的关联 | 小鼠模型，包括在新生期感染玫瑰病毒的成年小鼠 | 数字病理学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 新生期感染的成年小鼠 |
| 625 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Transcriptome of the Human Endometrium Reveals Epithelial Characterizations Associated with Recurrent Implantation Failure
2024-01, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300110
PMID:37690851
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序揭示了与反复植入失败（RIF）相关的子宫内膜上皮特征 | 首次表明RIF患者子宫内膜腺体中MAP2K6 EPCAM上皮细胞替代腺上皮细胞，并表明RIF患者衍生的腺体类器官对性激素反应减弱 | 研究样本量较小，仅包括3名RIF患者，可能影响结果的普适性 | 探讨反复植入失败患者中子宫内膜的细胞和分子机制 | 研究对象为3名反复植入失败患者的子宫内膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 3名反复植入失败患者，分析25,315个单个细胞 |
| 626 | 2024-08-05 |
T cell-related ubiquitination genes as prognostic indicators in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1424752
PMID:38919610
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研究论文 | 本研究开发了一种基于T细胞相关泛素化基因的HCC预后风险评分 | 提出了一种新的预后和免疫治疗效果预测指标，基于T细胞相关泛素化基因 | 未提及具体的限制 | 为肝细胞癌患者设计新的预后评估工具 | 肝细胞癌患者的T细胞相关泛素化基因 | 数字病理 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 风险评分模型 | RNA数据 | 3050个T细胞标记基因，结合TCGA的临床数据 |
| 627 | 2024-08-05 |
Relative effect size-based profiles as an alternative to differentiation analysis in multi-species single-cell transcriptional studies
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0305874
PMID:38917129
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研究论文 | 该文章展示了一种基于效应大小的替代方法，用于多物种单细胞RNA测序的差异分析 | 提出了一种基于效应大小的分析管道，适用于小样本和多物种数据的融合 | 涉及的样本小，且可能存在批次效应导致的偏差 | 旨在展示效应大小配置文件作为单细胞转录组分析的有效替代 | 探讨来自于人类和牛的外周血单核细胞的转录组数据 | 数字病理学 | 其他 | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多个物种的小样本数据，包括人类和牛的外周血单核细胞 |
| 628 | 2024-08-04 |
CellsFromSpace: a fast, accurate, and reference-free tool to deconvolve and annotate spatially distributed omics data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae081
PMID:38915885
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研究论文 | 提出了一种名为CellsFromSpace的新分析框架，用于分析空间转录组数据 | CellsFromSpace无需依赖单细胞参考数据集，通过独立成分分析(ICA)有效分析多种技术的空间转录组数据 | 尚未提及具体的局限性 | 旨在提高空间转录组学数据的分析准确性和效率 | 空间转录组学数据和不同类型细胞的分析 | 数字病理学 | NA | 独立成分分析(ICA) | NA | 空间转录组数据 | 使用真实样本进行验证，具体样本数量未提及 |
| 629 | 2024-08-05 |
Glyoxalase 1: Emerging biomarker and therapeutic target in cervical cancer progression
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0299345
PMID:38870176
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研究论文 | 本研究探讨了甘油醛酶-1（GLO1）在宫颈癌进展中的关键角色，提出其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 本研究首次系统性地评估了GLO1在宫颈癌中的表达模式及其对细胞存活和迁移的影响 | 本研究的样本量有限，进一步的研究需要更大规模的临床数据支持 | 探讨GLO1在宫颈癌进展中的作用，以期为个性化治疗方案提供依据 | 研究对象为58名宫颈癌患者的样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化 | NA | 组织样本 | 58个宫颈癌患者的样本 |
| 630 | 2024-08-04 |
DDIT3 is associated with breast cancer prognosis and immune microenvironment: an integrative bioinformatic and immunohistochemical analysis
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96491
PMID:38911383
|
研究论文 | 本研究探讨了DDIT3在乳腺癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 采用新型多组学整合策略，揭示DDIT3与乳腺癌差预后的关联及其在肿瘤微环境中的空间表达模式 | 尚未明确DDIT3在乳腺癌进展中的具体作用 | 研究DDIT3在乳腺癌中的作用及其在免疫微环境中的角色 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的DDIT3表现 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序、单细胞测序、空间转录组学、免疫组化 | NA | NA | 涉及乳腺癌患者多组学数据 |
| 631 | 2024-08-04 |
Spatial and Single-Cell Investigations Illuminate Theragnostic value and Immune Landscape of Mitochondrial Dynamin-Like GTPase in Breast Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96100
PMID:38911373
|
研究论文 | 本研究探讨了线粒体动态蛋白OPA1/3在乳腺癌中的治疗诊断价值及其免疫微环境 | 揭示了OPA1/3在乳腺癌肿瘤发生和进展中的复杂角色及其作为潜在生物标志物的价值 | 未提及具体的实验设计与样本处理的局限性 | 研究OPA1/3在乳腺癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 乳腺癌中线粒体蛋白OPA1/3的表达和功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、药物基因组学 | NA | 数据集、临床样本 | 涉及来自多个数据库的乳腺癌样本 |
| 632 | 2024-08-04 |
Experimental Validation and Multi-omics Analysis Identified ARPC1A as a Novel Oncogene and Potential Therapeutic Target in Glioblastoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94552
PMID:38911374
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研究论文 | 这项研究探讨了ARPC1A在胶质母细胞瘤中的生物学作用及其作为新的肿瘤基因和潜在治疗靶点的可能性 | 确立了ARPC1A在多种癌症中的预后价值并揭示其在胶质母细胞瘤耐药性中的调节机制 | 文章未详细探讨ARPC1A在其他癌症中的作用机制 | 研究ARPC1A在胼胶质瘤和其他多种癌症中的作用及机制 | 研究对象为ARPC1A在多种癌症中的表达、突变及其免疫微环境作用 | 数字病理 | NA | 基因组分析，基因集富集分析(GSEA)，单细胞测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 在多种癌症组织中分析了ARPC1A的表达与突变 |
| 633 | 2024-08-04 |
Transcriptional and functional remodeling of lung-resident T cells and macrophages by Simian varicella virus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1408212
PMID:38887303
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研究论文 | 这篇文章探讨了猿水痘病毒感染如何重塑肺部常驻T细胞和巨噬细胞的转录组和功能 | 提出了SVV感染后肺部细胞转录组的变化以及适应性反应的见解 | 未明确阐述SVV与人类VZV感染的所有潜在差异 | 研究SVV感染对肺部免疫反应的影响 | 肺部常驻T细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | 猕猴实验模型 | 转录组数据 | 未提供样本量信息 |
| 634 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of the clinical significance and molecular mechanism of T-box transcription factor 3 in osteosarcoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96168
PMID:38911382
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研究论文 | 该文章研究了TBX3在骨肉瘤中的临床意义和分子机制 | 文章首次揭示TBX3在骨肉瘤进展中的潜在作用及其作为生物标志物的可能性 | 研究采用的数据来自微阵列和RNA-seq，可能存在数据偏差的风险 | 研究TBX3在骨肉瘤中的作用及其临床重要性 | 重点研究TBX3在不同骨肉瘤阶段的表达以及与疾病进展的关系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | NA |
| 635 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell transcriptomics and epigenetic analysis reveals enhancer-controlled TIMP1 as a regulator of ferroptosis in colorectal cancer
2024-01, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01474-7
PMID:38032469
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研究论文 | 本研究探讨了增强子控制的基因在结直肠癌中对铁死亡的调控作用和机制。 | 发现TIMP1作为铁死亡调控因子通过增强子与转录因子SPI1结合而上调，提供了结直肠癌治疗的新分子靶点。 | 研究仅基于特定数据集的单细胞RNA测序和ChIP-seq数据，可能局限于这些特定样本的普适性。 | 研究增强子控制的基因在结直肠癌铁死亡中的作用和机制。 | 结直肠癌（CRC）中不同细胞群体及其与铁死亡的相关性。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 从GSE200997和GSE166254数据集中涉及的结直肠癌和正常结肠组织样本 |
| 636 | 2024-08-04 |
The Fibroblast Landscape in Stomach Carcinogenesis
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.001
PMID:38342299
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评论 | 本文总结和讨论了近年来关于人类胃中成纤维细胞组分从正常到化生、异型增生和癌症的研究。 | 本文创新点在于强调了成纤维细胞群体在胃癌发生过程中的异质性和可塑性，尤其是在化生和异型增生中的变化。 | 本文为综述，可能未包含某些最新的研究进展。 | 研究胃癌发生过程中成纤维细胞的组分和特征。 | 研究对象为人类胃中不同阶段（正常、化生、异型增生和癌症）的成纤维细胞。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 637 | 2024-08-04 |
Multi-omic profiling of breast tumor microenvironment uncovers a role of mitochondrial calcium gatekeepers
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.95979
PMID:38911376
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研究论文 | 本研究旨在阐明线粒体钙摄取1/2（MiCU1/2）在乳腺癌中的作用 | 采用针对整个肿瘤组织、单细胞和空间转录组分析的新型网络应用，发掘MiCU1/2与肿瘤免疫微环境之间的关联 | NA | 探讨MiCU1/2作为乳腺癌的独立诊断生物标志物及其预后预测的潜力 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学方法 | NA | 转录组数据 | 涉及乳腺癌患者的肿瘤样本 |
| 638 | 2024-08-05 |
Mussel inspired 3D elastomer enabled rapid calvarial bone regeneration through recruiting more osteoprogenitors from the dura mater
2024, Regenerative biomaterials
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/rb/rbae059
PMID:38911700
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研究论文 | 该研究开发了一种3D弹性体，促进了颅骨缺损的再生。 | 首次揭示了硬脑膜细胞与巨噬细胞之间的相互作用对颅骨全层修复的关键作用。 | 研究中未提及样本数量和临床试验情况，可能影响结果的广泛适用性。 | 探索新材料在颅骨再生中的应用及其机制。 | 主要研究硬脑膜细胞和巨噬细胞在颅骨愈合中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D弹性体 | 生物材料实验数据 | 8mm颅骨缺损模型 |
| 639 | 2024-08-05 |
A review on gene regulatory network reconstruction algorithms based on single cell RNA sequencing
2024-01, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01473-8
PMID:38032470
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综述 | 本文综述了15种基于单细胞RNA测序的基因调控网络重建工具及其优缺点 | 强调了单细胞RNA测序技术的进步如何促进了基因调控网络的重建 | 未能提供对所有GRN重建工具的深入验证 | 介绍不同的基因调控网络重建工具及其在单细胞RNA测序中的应用 | 15种基因调控网络重建工具 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 640 | 2024-08-05 |
Demultiplexing of single-cell RNA-sequencing data using interindividual variation in gene expression
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae085
PMID:38911824
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研究论文 | 本文描述了一种新颖的计算方法表达意识解混（EAD），用于利用个体间基因表达的差异性进行单细胞RNA测序的数据解混。 | 提出了表达意识解混（EAD），该方法无额外实验步骤地利用个体间差异的共表达模式进行解混。 | 在文章中没有提到具体的局限性。 | 研究如何利用个体间基因表达变异提高单细胞RNA测序的解混精度。 | 研究对象包括六只同种系近交小鼠的样本及来自脓毒症和健康个体的样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 样本数据 | 使用了30个来自脓毒症和健康个体的样本 |