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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-10-20 |
Profiling the heterogeneity of colorectal cancer consensus molecular subtypes using spatial transcriptomics
2024-Jan-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00488-4
PMID:38200223
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术,解析了结直肠癌共识分子亚型的空间细胞和分子组成 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了结直肠癌共识分子亚型的空间异质性和肿瘤微环境中的细胞通讯事件 | NA | 进一步阐明结直肠癌的组成和结构,以推进个性化治疗 | 结直肠癌共识分子亚型的空间异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 602 | 2024-10-20 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals tumor cell heterogeneity and immune microenvironment features of pituitary neuroendocrine tumors
2024-01-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01267-3
PMID:38167466
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析了垂体神经内分泌肿瘤的细胞异质性和免疫微环境特征 | 揭示了垂体神经内分泌肿瘤的内在细胞异质性和肿瘤微环境特征,发现了一种新的具有侵袭性特征的皮质激素瘤亚型 | NA | 研究垂体神经内分泌肿瘤的细胞特征和免疫微环境 | 垂体神经内分泌肿瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4个正常样本和24个垂体神经内分泌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 603 | 2024-10-20 |
ZNF689 deficiency promotes intratumor heterogeneity and immunotherapy resistance in triple-negative breast cancer
2024-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00909-w
PMID:38168642
|
研究论文 | 研究探讨了ZNF689缺乏如何促进三阴性乳腺癌中的肿瘤内异质性和免疫治疗抵抗 | 首次揭示了ZNF689缺乏通过激活LINE-1逆转录转座子加剧基因组不稳定性,从而促进肿瘤内异质性和免疫治疗抵抗 | NA | 探讨三阴性乳腺癌中肿瘤内异质性与免疫治疗抵抗的关系及其关键决定因素 | 三阴性乳腺癌患者的多组学数据和免疫治疗数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间分辨转录组学、流式细胞术 | NA | 多组学数据 | 260例来自本中心的患者、134例来自TCGA的患者和109例接受免疫治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 604 | 2024-10-20 |
scRNA+TCR-seq reveals the pivotal role of dual receptor T lymphocytes in the pathogenesis of Kawasaki disease and during IVIG treatment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1457687
PMID:39421738
|
研究论文 | 本研究通过scRNA-seq和TCR-seq技术,分析了健康对照组和川崎病(KD)患者在接受IVIG治疗前后的外周血单个核细胞,探讨了双受体T细胞在KD发病机制和IVIG治疗中的作用 | 首次揭示了双受体T细胞在川崎病发病机制和IVIG治疗中的关键作用 | 样本量较小,仅包括3名健康对照和6名KD患者 | 探讨双受体T细胞在川崎病发病机制和IVIG治疗中的作用 | 健康对照组和川崎病(KD)患者在接受IVIG治疗前后的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 川崎病 | scRNA-seq和TCR-seq | NA | 单细胞RNA测序数据和T细胞受体测序数据 | 3名健康对照和6名KD患者 | NA | NA | NA | NA |
| 605 | 2024-10-20 |
The role of lactylation in plasma cells and its impact on rheumatoid arthritis pathogenesis: insights from single-cell RNA sequencing and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1453587
PMID:39421742
|
研究论文 | 研究探讨了乳酸化在浆细胞中的作用及其对类风湿性关节炎发病机制的影响 | 通过单细胞RNA测序和机器学习技术,首次揭示了乳酸化在浆细胞中的重要作用,并识别出七个核心乳酸化促进基因 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,未涉及体内实验验证 | 探索乳酸化在浆细胞中的作用及其对类风湿性关节炎发病机制的影响 | 浆细胞和类风湿性关节炎患者 | 机器学习 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA | 10,163个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 606 | 2024-10-19 |
Single-cell sequencing dissects the transcriptional identity of activated fibroblasts and identifies novel persistent distal tubular injury patterns in kidney fibrosis
2024-01-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50195-0
PMID:38172172
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析,揭示了激活的成纤维细胞和肾小管上皮细胞损伤的转录特征,并发现了肾纤维化中新的远端小管损伤模式 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了肾纤维化中激活的成纤维细胞的分子和细胞景观,并发现了新的远端小管损伤模式 | NA | 深入理解肾纤维化的机制,并为慢性肾病(CKD)的靶向治疗提供新策略 | 肾纤维化中的激活成纤维细胞和肾小管上皮细胞损伤 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 两个临床相关的肾纤维化模型 | NA | NA | NA | NA |
| 607 | 2024-10-19 |
An overview of the detection of bovine respiratory disease complex pathogens using immunohistochemistry: emerging trends and opportunities
2024-Jan, Journal of veterinary diagnostic investigation : official publication of the American Association of Veterinary Laboratory Diagnosticians, Inc
IF:1.2Q3
DOI:10.1177/10406387231210489
PMID:37982437
|
综述 | 本文综述了使用免疫组织化学(IHC)检测牛呼吸道疾病复合体(BRDC)病原体的技术和方法,并探讨了新兴趋势和机会 | 本文介绍了多重IHC用于检测共感染、数字成像和自动化、改进的荧光染料检测系统以及IHC与空间转录组学的整合等新兴趋势 | NA | 探讨IHC在BRDC研究中的应用及其未来发展方向 | 牛呼吸道疾病复合体(BRDC)病原体及其相关技术 | NA | 牛呼吸道疾病 | 免疫组织化学(IHC) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 608 | 2024-10-19 |
Lung lymphatic endothelial cells undergo inflammatory and prothrombotic changes in a model of chronic obstructive pulmonary disease
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1344070
PMID:38440076
|
研究论文 | 研究了慢性阻塞性肺疾病(COPD)模型中肺淋巴内皮细胞的炎症和促凝血变化 | 首次探讨了香烟烟雾和凝血酶对肺淋巴内皮细胞的直接影响,并发现这些因素导致细胞的纤维蛋白溶解活性降低和炎症标志物表达增加 | 需要进一步研究这些变化如何影响淋巴功能并驱动COPD中的组织损伤 | 探讨COPD中肺淋巴内皮细胞的炎症和促凝血变化 | 肺淋巴内皮细胞 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序,免疫组织化学染色 | NA | RNA | 使用了来自COPD患者和对照组的肺组织样本,以及暴露于香烟烟雾的小鼠肺淋巴内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 609 | 2024-10-19 |
Cluster of differentiation-44 as a novel biomarker of lupus nephritis and its role in kidney inflammation and fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1443153
PMID:39411720
|
研究论文 | 研究CD44作为狼疮性肾炎的新型生物标志物及其在肾脏炎症和纤维化中的作用 | 首次探讨CD44在狼疮性肾炎中的病理作用,并验证其作为早期诊断标志物的潜力 | 研究仅限于小鼠模型和部分患者样本,需进一步临床验证 | 探讨CD44在狼疮性肾炎中的作用及其作为生物标志物的潜力 | CD44在狼疮性肾炎患者和小鼠模型中的表达及其与肾脏炎症和纤维化的关系 | NA | 狼疮性肾炎 | ELISA, ScRNA-Seq | NA | 血液, 肾脏组织 | NZB/W F1小鼠模型, 狼疮性肾炎患者 | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2024-10-19 |
Single-cell profiling of cellular changes in the somatic peripheral nerves following nerve injury
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1448253
PMID:39415832
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在周围神经损伤后背根神经节和周围神经中的最新发现,揭示了周围神经的细胞异质性和损伤后的变化 | 提供了单细胞分辨率下周围神经损伤后细胞变化的全面和深入的视角 | NA | 探讨周围神经损伤后的病理变化,为神经再生治疗的发展提供基础 | 周围神经损伤后的背根神经节和周围神经的单细胞转录组状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 611 | 2024-10-19 |
Attenuation of aggressive tumor progression of anaplastic thyroid cancer by p53
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/KXJJ8824
PMID:39417187
|
研究论文 | 研究探讨了野生型p53在抑制未分化甲状腺癌(ATC)进展中的作用 | 首次证明了外源表达的野生型p53能够抑制突变型p53的致癌作用,并提出了使用CRISPR/Cas9基因编辑技术修改p53等位基因以治疗ATC的可能性 | 研究仅限于细胞和动物模型,尚未在临床试验中验证 | 探讨野生型p53在抑制未分化甲状腺癌进展中的作用 | 未分化甲状腺癌细胞(8505C细胞)和其异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了8505C细胞及其表达野生型和突变型p53的变体,以及相应的异种移植小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 612 | 2024-10-17 |
IGFBP7+ subpopulation and IGFBP7 risk score in astrocytoma: insights from scRNA-Seq and bulk RNA-Seq
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1434300
PMID:39403379
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序探讨了星形细胞瘤中IGFBP7+亚群及其风险评分的影响 | 首次揭示了C0 IGFBP7+胶质瘤细胞在星形细胞瘤分化和进展中的重要作用,并开发了基于IGFBP7风险评分的预测模型 | 研究主要基于体外实验和数据分析,缺乏临床试验验证 | 深入理解星形细胞瘤的细胞组成多样性,探讨影响其预后的多种因素 | 星形细胞瘤中的IGFBP7+亚群及其风险评分 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq) | 预测模型 | RNA序列数据 | 七个不同亚组的星形细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 613 | 2024-10-16 |
Multi-omics Data Integration Analysis Identified Therapeutic Targets and Potential Reuse Drugs for Osteoporosis
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据整合分析,识别了骨质疏松症的治疗靶点和潜在的再利用药物 | 本研究提供了一种新的基于网络的药物再利用框架,并首次识别了针对CD74的骨质疏松症治疗药物 | NA | 促进骨质疏松症治疗药物的发现和开发 | 骨髓间充质干细胞(BM-MSCs)在骨质疏松症和骨关节炎患者中的主要分子及其潜在再利用药物 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | GSE147287数据集中的BM-MSCs样本,GSE35959数据集中的骨质疏松症样本和对照样本,GSE13850数据集中的差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 614 | 2024-10-16 |
A CD8+ T cell related immune score predicts survival and refines the risk assessment in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1408109
PMID:39346926
|
研究论文 | 研究开发了一种与CD8+ T细胞相关的免疫风险评分,用于预测急性髓系白血病患者的生存和细化风险评估 | 构建了一个包含15个基因的预测模型CTCG15,该模型在不同平台的数据集中得到了验证,并能独立于已有的预后标志物,提高预后预测的准确性 | NA | 开发一种新的免疫风险评分,以提高急性髓系白血病患者的预后预测和风险分层 | 急性髓系白血病患者及其骨髓中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 涉及六个不同平台的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 615 | 2024-10-16 |
Construction and validation of immune-associated lncRNA model for predicting immune status and therapeutic reactions of triple-negative breast cancer
2024, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/VIXN9362
PMID:39398616
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研究论文 | 构建并验证了一个与免疫相关的lncRNA模型,用于预测三阴性乳腺癌的免疫状态和治疗反应 | 首次构建了一个基于lncRNA的模型,用于区分三阴性乳腺癌的免疫沙漠和免疫炎症亚型,并评估其对肿瘤药物的敏感性 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据,缺乏临床试验验证 | 探索与三阴性乳腺癌免疫状态相关的关键lncRNA,并构建预测模型 | 三阴性乳腺癌患者的免疫状态和治疗反应 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、基因集富集分析、非负矩阵分解、加权基因共表达网络分析 | lncRNA模型 | RNA测序数据、临床信息 | 来自TCGA和GEO数据库的三阴性乳腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 616 | 2024-10-14 |
Hidden syndinian and perkinsid infections in dinoflagellate hosts revealed by single-cell transcriptomics
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae188
PMID:39325969
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示了寄生在甲藻宿主中的隐秘的syndinian和perkinsid感染 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了这些难以直接观察或培养的寄生虫的感染情况,并构建了基于192个基因的系统发育树 | 研究仅限于14个感染宿主细胞,且仅通过光显微镜在收集时识别出5个含有寄生虫的细胞 | 揭示隐秘的单细胞寄生虫的进化历史及其与宿主的关系 | 自由生活的甲藻及其寄生虫 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 14个感染宿主细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 617 | 2024-10-13 |
Revealing the association between East Asian oral microbiome and colorectal cancer through Mendelian randomization and multi-omics analysis
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1452392
PMID:39355266
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化(MR)和多组学分析探讨东亚人口口腔微生物群与结直肠癌(CRC)之间的关联 | 首次通过MR分析和多组学整合揭示口腔微生物群与结直肠癌之间的因果关系,并利用单细胞RNA测序和药物预测分析揭示关键通路和潜在治疗药物 | NA | 探索口腔微生物群与结直肠癌之间的因果关系,并揭示其影响细胞代谢和癌症发展的机制 | 口腔微生物群与结直肠癌的关联 | NA | 结直肠癌 | 孟德尔随机化(MR)、全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据、基因组数据、单细胞RNA数据 | 2017个舌样本和1915个唾液样本,6692个CRC病例和27178个对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 618 | 2024-10-13 |
A comprehensive analysis of genes associated with hypoxia and cuproptosis in pulmonary arterial hypertension using machine learning methods and immune infiltration analysis: AHR is a key gene in the cuproptosis process
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1435068
PMID:39391037
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法和免疫浸润分析,全面分析了与低氧和铜死亡相关的基因在肺动脉高压中的作用,并确定AHR是铜死亡过程中的关键基因 | 本研究首次将机器学习方法应用于肺动脉高压中与低氧和铜死亡相关的基因分析,并构建了诊断模型 | 本研究主要基于GEO数据库和genecad的表达谱和单细胞RNA-seq数据,未涵盖所有可能的数据来源 | 探讨肺动脉高压与低氧和铜死亡相关基因之间的关联,并寻找潜在的生物标志物 | 肺动脉高压患者与对照组的基因表达差异,以及免疫细胞浸润情况 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA-seq | LASSO和随机森林 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 619 | 2024-10-13 |
Case report: Tenosynovial giant cell tumor
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1445427
PMID:39391235
|
病例报告 | 报告了一例45岁男性患者右髋部疼痛和肿胀的病例,通过全外显子测序和RNA测序确诊为腱鞘巨细胞瘤 | 通过全外显子测序和RNA测序发现CSF1::GAPDHP64融合,并使用单细胞转录组分析揭示了肿瘤细胞与巨噬细胞之间的相互作用 | 病例报告的局限性在于其样本量小,结果可能不适用于所有腱鞘巨细胞瘤患者 | 探讨腱鞘巨细胞瘤的分子诊断和治疗策略 | 腱鞘巨细胞瘤及其分子机制 | NA | 腱鞘巨细胞瘤 | 全外显子测序、RNA测序、单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 1例患者 | NA | NA | NA | NA |
| 620 | 2024-10-13 |
Identification and validation of SHC1 and FGFR1 as novel immune-related oxidative stress biomarkers of non-obstructive azoospermia
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1356959
PMID:39391879
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研究论文 | 本文通过现有数据集识别并验证了SHC1和FGFR1作为非阻塞性无精子症的新型免疫相关氧化应激生物标志物 | 本文首次识别并验证了SHC1和FGFR1作为非阻塞性无精子症的新型免疫相关氧化应激生物标志物,并探讨了其在诊断和预后中的应用 | NA | 识别和验证非阻塞性无精子症的新型生物标志物 | SHC1和FGFR1基因在非阻塞性无精子症中的表达和功能 | 数字病理学 | 男性不育症 | RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 非阻塞性无精子症和阻塞性无精子症患者的睾丸组织样本 | NA | NA | NA | NA |