单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1397 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-11-09 |
Humanized CXCL12 antibody delays onset and modulates immune response in alopecia areata mice: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1444777
PMID:39483478
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序探讨人源化CXCL12抗体在斑秃小鼠模型中的作用机制 | 首次使用人源化CXCL12抗体治疗斑秃，并通过单细胞RNA测序揭示其分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，需进一步在人体中验证 | 探讨人源化CXCL12抗体在斑秃治疗中的作用及其分子机制 | 斑秃小鼠模型及其免疫细胞 | NA | 斑秃 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 602 | 2024-11-09 |
mRNA-seq-based analysis predicts: AEG-1 is a therapeutic target and immunotherapy biomarker for pan-cancer, including OSCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1484226
PMID:39483471
|
研究论文 | 本文通过mRNA-seq分析预测AEG-1是泛癌治疗靶点和免疫治疗生物标志物，包括OSCC | 首次全面分析了AEG-1表达与OSCC及其他肿瘤类型中免疫浸润的关系，并发现AEG-1与免疫浸润标志物之间的强相关性 | NA | 探讨AEG-1在泛癌中的表达及其与免疫浸润和患者预后的关系 | AEG-1在不同肿瘤类型中的表达水平、预后和临床病理特征 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | mRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个数据库中的多种肿瘤样本，包括OSCC | NA | NA | NA | NA |
| 603 | 2024-11-09 |
Potential molecular mechanisms of ETV6-RUNX1-positive B progenitor cell cluster in acute lymphoblastic leukemia revealed by single-cell RNA sequencing
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18445
PMID:39498293
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇在急性淋巴细胞白血病中的潜在分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇在急性淋巴细胞白血病中的细胞周期调控机制及其与NK细胞和T细胞的相互作用 | NA | 探索免疫景观和免疫细胞在急性淋巴细胞白血病进展中的作用 | ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇及其在急性淋巴细胞白血病中的作用 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GSE132509的ETV6-RUNX1和健康儿科样本的骨髓单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 604 | 2024-11-08 |
Inflammatory Mediators Suppress FGFR2 Expression in Human Keratinocytes to Promote Inflammation
2024, Molecular and cellular biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1080/10985549.2024.2399766
PMID:39340759
|
研究论文 | 研究探讨了炎症介质如何抑制人角质形成细胞中FGFR2的表达以促进炎症 | 首次揭示了FGFR2在人角质形成细胞中抑制炎症的关键作用，并提出了FGFR2下调在特应性皮炎及其他炎症性疾病发病机制中的潜在作用 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨FGFR2在人角质形成细胞中的功能及其在炎症性疾病中的作用 | 人角质形成细胞及特应性皮炎患者皮肤样本 | NA | 特应性皮炎 | CRISPR/Cas9基因编辑技术，RNA测序 | NA | RNA | 体外培养的人角质形成细胞及特应性皮炎患者皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 605 | 2024-11-08 |
Ustekinumab affects myofibroblast metabolism to alleviate intestinal fibrosis by targeting KDELC1 in Crohn's disease through multi-machine learning combined with single-cell sequencing analysis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1476592
PMID:39502647
|
研究论文 | 本研究通过多机器学习结合单细胞测序分析，探讨了乌司奴单抗通过靶向KDELC1基因缓解克罗恩病肠道纤维化的机制 | 首次揭示了乌司奴单抗通过靶向KDELC1基因影响肌成纤维细胞代谢，从而缓解肠道纤维化的机制 | 研究样本量较小，且仅限于克罗恩病患者，未来需扩大样本量并验证在其他疾病中的适用性 | 探讨乌司奴单抗在克罗恩病中缓解肠道纤维化的遗传机制 | 克罗恩病患者的肠道组织及健康对照组的肠道组织 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 克罗恩病患者和健康对照组的内镜手术标本 | NA | NA | NA | NA |
| 606 | 2024-11-08 |
Histamine and Th2 cytokines independently and synergistically upregulate MMP12 expression in human M2 macrophages
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429009
PMID:39502691
|
研究论文 | 研究探讨了组胺和Th2细胞因子在人M2巨噬细胞中独立及协同上调MMP12表达的机制 | 揭示了Th2细胞因子和组胺调控MMP12表达的新机制，可能影响特应性皮炎皮肤屏障稳态 | NA | 研究MMP12在特应性皮炎皮肤病变中的表达及其调控机制 | 特应性皮炎患者的皮肤病变和健康个体的M2巨噬细胞 | NA | 特应性皮炎 | RNA测序 (scRNA-seq), 定量PCR, ELISA | NA | RNA | 特应性皮炎患者和健康个体的M2巨噬细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 607 | 2024-11-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals Immune Education promotes T cell survival in mice subjected to the cecal ligation and puncture sepsis model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366955
PMID:38562928
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究免疫教育对小鼠T细胞在盲肠结扎和穿刺脓毒症模型中存活的影响 | 首次通过单细胞RNA测序探讨了免疫教育对小鼠T细胞在脓毒症模型中存活的影响 | 仅在单一早期时间点进行了研究，未探讨长期效应 | 研究免疫教育对小鼠T细胞在脓毒症模型中存活的影响 | 小鼠脾脏T细胞在盲肠结扎和穿刺脓毒症模型中的反应 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四组小鼠样本：对照组、免疫教育组、CLP组和免疫教育CLP组 | NA | NA | NA | NA |
| 608 | 2024-11-07 |
Revisiting roles of mast cells and neural cells in keloid: exploring their connection to disease activity
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1339336
PMID:38524141
|
研究论文 | 本文探讨了肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩中的作用及其与疾病活动的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析了活动性瘢痕疙瘩、非活动性瘢痕疙瘩和成熟瘢痕样本，揭示了肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩微环境中的重要作用 | 样本量较小，可能影响结果的普适性 | 阐明肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩发病机制中的作用及其与疾病活动的关系 | 瘢痕疙瘩样本中的肥大细胞和神经细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个活动性瘢痕疙瘩样本，4个非活动性瘢痕疙瘩样本，3个成熟瘢痕样本 | NA | NA | NA | NA |
| 609 | 2024-11-07 |
Comprehensive analysis of lactylation-related gene sets and mitochondrial functions in gastric adenocarcinoma: implications for prognosis and therapeutic strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1451725
PMID:39478860
|
研究论文 | 本研究探讨了乳酸化相关基因集和线粒体功能在胃腺癌中的预后意义，并提出了新的治疗策略 | 本研究通过整合大规模基因组数据，利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了胃腺癌中独特的分子亚型及其与生存结果和免疫特征的关系，并提出了优于现有模型的预后模型 | NA | 探讨乳酸化相关基因集和线粒体功能在胃腺癌中的预后意义，并提出新的治疗策略 | 胃腺癌中的乳酸化相关基因集、线粒体功能、肿瘤微环境、分子亚型、免疫细胞浸润和响应 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 预后模型 | 基因组数据 | 大规模基因组数据，包括TCGA和多个GEO数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2024-11-07 |
Identification and validation of efferocytosis-related biomarkers for the diagnosis of metabolic dysfunction-associated steatohepatitis based on bioinformatics analysis and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460431
PMID:39497821
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和机器学习方法，识别并验证了与代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）诊断相关的吞噬作用相关生物标志物 | 本研究首次系统地探讨了吞噬作用与MASH之间的关系，并通过机器学习构建了有效的诊断模型 | 本研究主要基于生物信息学分析和机器学习，缺乏大规模临床样本的验证 | 识别并验证与MASH诊断相关的吞噬作用相关生物标志物 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）及其相关的吞噬作用过程 | 机器学习 | 肝病 | 机器学习算法 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 611 | 2024-11-06 |
Tertiary lymphoid structure-related score as a predictor for survival prognosis and immunotherapy response in head and neck squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483497
PMID:39493749
|
研究论文 | 研究构建了一个基于三级淋巴结构相关基因的评分系统，用于预测头颈部鳞状细胞癌患者的生存预后和免疫治疗反应 | 首次构建了基于三级淋巴结构相关基因的评分系统，并验证了其在预测头颈部鳞状细胞癌患者生存预后和免疫治疗反应中的有效性 | 研究主要基于生物信息学方法和体外实验，缺乏大规模临床验证 | 研究旨在开发一种新的预测模型，用于评估三级淋巴结构的存在及其在头颈部鳞状细胞癌患者中的预后和免疫治疗反应 | 头颈部鳞状细胞癌患者及其三级淋巴结构 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序、单细胞测序、流式细胞术 | 评分模型 | 基因数据、单细胞数据 | 23个三级淋巴结构相关基因，头颈部鳞状细胞癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 612 | 2024-11-06 |
eMCI: An Explainable Multimodal Correlation Integration Model for Unveiling Spatial Transcriptomics and Intercellular Signaling
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0522
PMID:39494219
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为eMCI的可解释多模态相关性集成模型，用于揭示空间转录组学和细胞间信号传导 | eMCI通过融合单细胞RNA测序和空间转录组数据，实现了对空间表达模式和细胞间通信的复杂关系的全面分析 | NA | 开发一种新的集成分析框架，以更好地解析空间转录组并阐明细胞间信号传导机制 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 数据融合 | 包括斑马鱼黑色素瘤、大豆根瘤成熟和人类胚胎肺在内的3个跨物种数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 613 | 2024-11-06 |
Prognostic and therapeutic potential of gene profiles related to tertiary lymphoid structures in colorectal cancer
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18401
PMID:39494300
|
研究论文 | 本研究开发了一种新的三级淋巴结构（TLS）量化系统，用于预测结直肠癌的预后和治疗反应，并全面描绘了TLS的景观 | 首次建立了TLS评分系统，并验证了其在预测免疫治疗效果中的有效性 | NA | 探讨三级淋巴结构在结直肠癌中的预后和治疗潜力 | 结直肠癌患者的三级淋巴结构及相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 1184名结直肠癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 614 | 2024-11-04 |
Exploring tumor endothelial cells heterogeneity in hepatocellular carcinoma: insights from single-cell sequencing and pseudotime analysis
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18362
PMID:39484208
|
研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌中肿瘤内皮细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和伪时间分析揭示了肝细胞癌中肿瘤内皮细胞的异质性及其在肿瘤进展中的动态变化 | 研究样本量较小，且仅基于公开数据库的数据进行分析 | 探索肝细胞癌中肿瘤内皮细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用，以识别新的治疗靶点和策略 | 肝细胞癌中的肿瘤内皮细胞及其在肿瘤进展中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9个原发性肝癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 615 | 2024-11-02 |
Regulation of lymphoid-myeloid lineage bias through regnase-1/3-mediated control of Nfkbiz
2024-01-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020903
PMID:37922454
|
研究论文 | 研究揭示了regnase-1和regnase-3通过调控Nfkbiz mRNA的降解，影响造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的淋巴-髓系分化倾向 | 首次阐明了regnase-1和regnase-3在HSPCs中通过调控Nfkbiz mRNA的降解，决定淋巴系命运并限制髓系分化的机制 | NA | 探讨造血干细胞和祖细胞（HSPCs）中淋巴-髓系分化倾向的调控机制 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 616 | 2024-10-26 |
IDEIS: a tool to identify PTPRC/CD45 isoforms from single-cell transcriptomic data
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1446931
PMID:39445006
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为IDEIS的工具，用于从单细胞转录组数据中识别PTPRC/CD45的异构体 | IDEIS软件能够直接从单细胞转录组数据中量化CD45异构体，无需生成额外的DNA测序文库 | NA | 开发一种工具，用于从单细胞转录组数据中准确识别和量化CD45异构体 | PTPRC/CD45基因的异构体及其在免疫细胞亚群中的表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 使用10× Genomics 5'测序技术生成的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 617 | 2024-11-02 |
Arid3c identifies an uncharacterized subpopulation of V2 interneurons during embryonic spinal cord development
2024, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2024.1466056
PMID:39479525
|
研究论文 | 研究旨在通过比较胚胎脊髓V2中间神经元与其他细胞的转录组，识别新的标记基因以描述V2中间神经元群体的多样性 | 发现了Arid3c基因，识别出一个未被描述的V2中间神经元亚群，该亚群与V2c中间神经元部分重叠，并具有Onecut因子和Sox2的表达特征 | 研究未完全解析导致这种神经元多样化的机制 | 识别新的标记基因以进一步描述脊髓V2中间神经元群体的多样性 | 胚胎脊髓V2中间神经元及其亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 胚胎脊髓V2中间神经元及其他细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 618 | 2024-10-30 |
SAW: an efficient and accurate data analysis workflow for Stereo-seq spatial transcriptomics
2024, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.111
PMID:38434930
|
研究论文 | 本文介绍了一种高效且准确的空间转录组数据分析工作流程SAW，用于处理Stereo-seq技术生成的大规模数据 | 开发了名为Stereo-seq分析工作流程（SAW）的高性能和准确的空间转录组数据分析工具，显著提高了处理速度和效率 | NA | 提高空间转录组数据分析的效率和准确性 | 空间转录组数据分析中的基因表达信息 | 生物信息学 | NA | 空间转录组技术（Stereo-seq） | NA | 转录组数据 | 1 GB reads 1 × 1 cm芯片测试数据 | NA | NA | NA | NA |
| 619 | 2024-10-30 |
Acyloxyacyl Hydrolase Protects against Kidney Injury via Inhibition of Tubular CD74-Macrophage Crosstalk
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.91237
PMID:38904010
|
研究论文 | 研究了乙酰氧乙酰水解酶（AOAH）通过抑制肾小管上皮细胞CD74信号通路来保护肾脏免受损伤和纤维化的作用 | 首次揭示了AOAH在肾脏损伤中的保护作用，并提出了通过靶向肾脏AOAH来预防肾纤维化进展的策略 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体中验证AOAH的作用 | 探讨AOAH在肾脏损伤和纤维化中的作用及其机制 | 乙酰氧乙酰水解酶（AOAH）、肾小管上皮细胞（PTECs）、巨噬细胞 | NA | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了野生型（WT）和AOAH缺失的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 620 | 2024-10-30 |
CD8 T cells induce the peritubular capillary rarefaction during AKI to CKD transition
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.96812
PMID:38904017
|
研究论文 | 研究探讨了CD8 T细胞在急性肾损伤（AKI）向慢性肾病（CKD）转变过程中诱导肾小管周围毛细血管稀疏的作用 | 首次揭示了CD8 T细胞通过CXCL16-CXCR6途径介导的巨噬细胞招募，诱导内皮细胞凋亡，从而在AKI向CKD转变过程中导致肾小管周围毛细血管稀疏 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证其机制 | 探讨AKI向CKD转变过程中CD8 T细胞的作用机制 | CD8 T细胞在AKI向CKD转变中的作用及其机制 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |