单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1388 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-02-18 |
Interferon-γ signaling in eosinophilic esophagitis has implications for epithelial barrier function and programmed cell death
2024-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.26.577407
PMID:38352458
|
研究论文 | 本文探讨了干扰素-γ信号在嗜酸性食管炎中对上皮屏障功能和程序性细胞死亡的影响 | 通过单细胞RNA测序和体外器官模型揭示了干扰素-γ在食管上皮细胞中的功能影响 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全反映体内情况 | 揭示免疫细胞与上皮细胞在嗜酸性食管炎中的相互作用及其功能意义 | 嗜酸性食管炎患者的食管上皮细胞 | 生物医学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 体外器官模型 | NA | RNA测序数据 | 嗜酸性食管炎患者的食管活检样本 |
| 42 | 2025-02-17 |
Deciphering hub genes and immune landscapes related to neutrophil extracellular traps in rheumatoid arthritis: insights from integrated bioinformatics analyses and experiments
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1521634
PMID:39845946
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和实验，揭示了类风湿性关节炎（RA）中与中性粒细胞外陷阱（NETs）相关的关键基因和免疫景观 | 首次阐明了RA滑膜微环境中中性粒细胞的异质性及其与成纤维细胞的通讯机制，并识别了与NETs相关的潜在生物标志物 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受限于数据的质量和样本量 | 探索RA中NETs形成的分子机制及关键基因 | 类风湿性关节炎（RA）患者和佐剂诱导的关节炎大鼠模型 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、机器学习、免疫组织化学（IHC）、实时定量聚合酶链反应（RT-qPCR） | 机器学习模型 | RNA测序数据、微阵列数据 | 多个数据集，包括来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据和三个微阵列数据集，以及临床队列和动物模型 |
| 43 | 2025-02-14 |
The many faces of the megakaryocytes and their biological implications
2024-01-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000793
PMID:37910197
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序研究揭示的巨核细胞谱系内的转录异质性及其独特亚群的功能和表型可塑性，以及对健康和疾病的影响 | 揭示了巨核细胞（MKs）的多个亚群及其不同功能，包括血小板生成、生态位支持、免疫和循环细胞，并发现这些细胞在非造血组织中的存在及其增强的免疫相关特性 | NA | 探讨巨核细胞亚群的功能和表型可塑性及其在健康和疾病中的作用 | 巨核细胞（MKs）及其亚群 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 44 | 2025-02-14 |
Single-cell RNA sequencing revealed PPARG promoted osteosarcoma progression: based on osteoclast proliferation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506225
PMID:39936154
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PPARG在促进骨肉瘤进展中的作用，特别是通过破骨细胞增殖 | 首次在单细胞水平上详细研究破骨细胞，并发现PPARG作为新的治疗靶点 | 研究主要基于单细胞测序数据，需要进一步实验验证 | 寻找新的骨肉瘤治疗靶点，防止肿瘤进展和局部扩散 | 骨肉瘤患者的破骨细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 骨肉瘤患者的单细胞测序数据 |
| 45 | 2025-02-13 |
Innovative super-resolution in spatial transcriptomics: a transformer model exploiting histology images and spatial gene expression
2024-01-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae052
PMID:38436557
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TransformerST的创新无监督模型，基于Transformer架构，用于提升空间转录组学数据的分辨率至单细胞水平 | TransformerST模型无需参考单细胞RNA测序数据，通过视觉Transformer编码器识别图像-基因表达的潜在共表示，并利用自适应图Transformer模块增强空间相关性，显著提高了模型的准确性 | NA | 提升空间转录组学数据的分辨率至单细胞水平，并优化利用组织学图像和基因表达数据 | 空间转录组学数据，特别是Visium平台的数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | Transformer | 图像，基因表达数据 | NA |
| 46 | 2025-02-13 |
Network-based prioritization and validation of regulators of vascular smooth muscle cell proliferation in disease
2024, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00474-4
PMID:38898928
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和表观遗传分析重建基因调控网络，阐明了血管平滑肌细胞（VSMC）增殖的分子决定因素 | 发现了RUNX1和TIMP1等先前未被识别的增殖调控因子，并揭示了它们在血管疾病中的潜在作用 | 研究主要基于体外实验和计算模型，需要进一步的体内实验验证 | 阐明血管平滑肌细胞增殖的分子机制，以寻找血管疾病的潜在治疗靶点 | 血管平滑肌细胞（VSMC） | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、表观遗传分析 | 基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据、表观遗传数据 | NA |
| 47 | 2025-02-13 |
Interstitial macrophage phenotypes in Schistosoma-induced pulmonary hypertension
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372957
PMID:38779688
|
研究论文 | 本文研究了血吸虫病引起的肺动脉高压中，间质巨噬细胞亚群的作用及其表型变化 | 首次通过流式细胞术和单细胞RNA测序技术，识别并描述了血吸虫病引起的肺动脉高压中三种不同的间质巨噬细胞亚群及其功能 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探讨血吸虫病引起的肺动脉高压中，间质巨噬细胞亚群的作用及其表型变化 | 小鼠模型中的间质巨噬细胞亚群 | 生物医学 | 肺动脉高压 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 未暴露和暴露于血吸虫卵后第1、3、7天的小鼠肺部和血液样本 |
| 48 | 2025-02-13 |
The role of SASP in ischemic stroke: a deep dive into cellular mechanisms
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1513357
PMID:39931101
|
研究论文 | 本研究通过结合bulk和单细胞转录组分析，探讨了衰老相关分泌表型（SASP）在缺血性卒中（IS）中的作用及其细胞机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示了SASP相关基因在IS中的表达变化及其对细胞间相互作用网络的影响，为IS的临床诊断和治疗提供了新的视角 | 研究主要基于小鼠模型和人类外周血样本，可能无法完全反映人类IS的复杂性 | 探讨SASP在IS发病机制中的作用及其对疾病进展的影响 | 人类外周血样本和MCAO小鼠模型 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | bulk和单细胞转录组分析，RT-qPCR | NA | 转录组数据 | 人类外周血样本和MCAO小鼠模型 |
| 49 | 2025-02-12 |
Age-related loss of Notch3 underlies brain vascular contractility deficiencies, glymphatic dysfunction, and neurodegeneration in mice
2024-Jan-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI166134
PMID:38015629
|
研究论文 | 本文探讨了年龄相关的Notch3信号丢失如何导致小鼠脑血管收缩功能缺陷、淋巴功能障碍和神经退行性变 | 揭示了Notch3信号在脑血管老化中的关键作用，并发现其缺失导致血管反应性下降和神经退行性变 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的应用和验证仍需进一步研究 | 研究年龄相关Notch3信号丢失对脑血管功能和神经退行性变的影响 | 小鼠和人类脑血管 | 神经科学 | 血管性痴呆 | 单细胞转录组学、MRI | Notch3-null小鼠模型 | 基因表达数据、影像数据 | 小鼠和人类脑血管样本 |
| 50 | 2025-02-12 |
Deciphering the role of metal ion transport-related genes in T2D pathogenesis and immune cell infiltration via scRNA-seq and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1479166
PMID:39926598
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和机器学习探索2型糖尿病（T2D）的发病机制，特别是免疫细胞浸润的作用 | 结合scRNA-seq和12种机器学习算法，识别与金属离子转运相关的关键基因，并通过蛋白质-蛋白质相互作用网络和细胞间通讯分析揭示T2D的潜在治疗靶点 | 研究主要基于T2D和ND患者的胰岛细胞数据，可能无法完全反映其他组织或细胞类型在T2D中的作用 | 探索T2D的分子机制，特别是免疫细胞浸润和金属离子转运相关基因的作用 | T2D和非糖尿病（ND）患者的胰岛细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | scRNA-seq, ssGSEA, 机器学习, AlphaFold 3 | Stepglm[backward] plus GBM | RNA测序数据 | T2D和ND患者的胰岛细胞数据 |
| 51 | 2025-02-12 |
Single-cell sequencing uncovers the mechanistic role of DAPK1 in glioma and its diagnostic and prognostic implications
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1463747
PMID:39926603
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序技术探索了DAPK1在胶质瘤中的机制作用及其诊断和预后意义 | 利用单细胞RNA测序数据识别与生存相关的基因簇，并开发基于DAPK1的预后模型 | DAPK1在胶质瘤中的具体机制尚未完全阐明 | 开发基于DAPK1的预后标志物以预测胶质瘤患者的预后 | 胶质瘤患者 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和逐步回归算法 | RNA-seq和微阵列数据 | 来自TCGA和GEO的胶质瘤患者数据 |
| 52 | 2025-02-11 |
Single-cell RNA-seq and single-cell bisulfite-sequencing reveal insights into yak preimplantation embryogenesis
2024-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105562
PMID:38097189
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞亚硫酸盐测序揭示了牦牛胚胎植入前发育过程中的基因表达和DNA甲基化变化 | 结合单细胞DNA甲基化和转录组分析，鉴定了43个可能与胚胎发育相关的候选甲基化驱动基因，并确定了与组蛋白去乙酰化酶HDAC1/2相关的表观遗传修饰对胚胎发育的重要性 | 研究主要聚焦于牦牛胚胎，可能限制了其在其他物种中的普适性 | 研究牦牛胚胎植入前发育过程中的表观遗传重编程及其对转录调控网络的影响 | 牦牛的卵母细胞和不同发育阶段的胚胎 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞亚硫酸盐测序 | NA | 单细胞基因表达数据, 单细胞DNA甲基化数据 | 牦牛的卵母细胞和一系列不同发育阶段的胚胎 |
| 53 | 2025-02-11 |
Human placental cells are resistant to SARS-CoV-2 infection and replication
2024, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20514.2
PMID:39640372
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术，探讨了人类胎盘细胞对SARS-CoV-2感染的易感性及其支持病毒释放的能力 | 首次量化了胎盘细胞对SARS-CoV-2感染的易感性，并确定了其支持病毒释放的能力 | 研究主要依赖于体外实验，可能无法完全反映体内情况 | 探讨SARS-CoV-2在胎盘细胞中的感染和复制能力 | 人类胎盘细胞 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），共聚焦显微镜 | NA | RNA测序数据，显微镜图像 | 包括早期妊娠和足月胎盘细胞，以及JEG-3、JAR和HUVEC细胞系 |
| 54 | 2025-02-09 |
Single-cell RNA sequencing and AlphaFold 3 insights into cytokine signaling and its role in uveal melanoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458041
PMID:39916959
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和AlphaFold 3技术，揭示了葡萄膜黑色素瘤（UVM）中的细胞异质性，并识别了预后生物标志物 | 首次在UVM中构建了单细胞分辨率的细胞因子反应词典，并利用AlphaFold 3预测关键蛋白的3D结构 | 研究样本量有限，且主要依赖于体外实验数据，未进行大规模临床试验验证 | 阐明UVM中的细胞异质性并识别预后生物标志物 | 葡萄膜黑色素瘤（UVM）的原发性和转移性样本 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），AlphaFold 3，CRISPR-Cas9筛选分析 | LASSO回归，ROC曲线分析，伪时间轨迹映射 | RNA测序数据，蛋白质结构预测数据 | TCGA-UVM和GSE84976队列中的样本 |
| 55 | 2025-02-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the dysfunctional characteristics of PBMCs in patients with type 2 diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1501660
PMID:39916961
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了2型糖尿病患者外周血单个核细胞的功能失调特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析2型糖尿病患者外周血单个核细胞的转录组图谱，揭示了免疫细胞的功能失调特征 | 样本量较小，仅包括3名健康参与者和3名2型糖尿病患者 | 探索2型糖尿病患者外周血单个核细胞的免疫状态和潜在免疫机制 | 2型糖尿病患者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 3名健康参与者和3名2型糖尿病患者 |
| 56 | 2025-02-08 |
Leveraging single-cell transcriptomic data to uncover immune suppressive cancer cell subsets in triple-negative canine breast cancers
2024, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2024.1434617
PMID:39376916
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，识别并表征了三阴性犬乳腺癌中的免疫抑制亚群 | 首次在三阴性犬乳腺癌中识别出免疫抑制亚群，并揭示了其通过抗炎和M2样巨噬细胞等机制促进免疫逃逸的潜在途径 | 研究依赖于已发布的单细胞RNA测序数据集，样本量较小（30只犬），可能限制了结果的普适性 | 识别和表征三阴性犬乳腺癌中的免疫抑制亚群，以揭示其免疫逃逸机制 | 三阴性犬乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 30只犬的样本 |
| 57 | 2025-02-08 |
A randomized, placebo-controlled trial of the BTK inhibitor zanubrutinib in hospitalized patients with COVID-19 respiratory distress: immune biomarker and clinical findings
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1369619
PMID:39906744
|
研究论文 | 本研究评估了新一代BTK抑制剂zanubrutinib在SARS-CoV-2感染并伴有呼吸窘迫的住院患者中的疗效和免疫生物标志物 | 首次在COVID-19呼吸窘迫患者中评估zanubrutinib的疗效，并进行了单细胞转录组分析以研究其对免疫反应的影响 | zanubrutinib在临床恢复方面未显示出优于安慰剂的效果，可能与大多数患者同时使用类固醇和抗病毒治疗有关 | 评估zanubrutinib在COVID-19呼吸窘迫患者中的疗效及其对免疫反应的影响 | SARS-CoV-2感染并伴有呼吸窘迫的住院患者 | NA | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 临床数据和生物标志物数据 | 63名患者（队列1：30名zanubrutinib，33名安慰剂；队列2：4名zanubrutinib） |
| 58 | 2025-02-08 |
Immune regulatory genes impact the hot/cold tumor microenvironment, affecting cancer treatment and patient outcomes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382842
PMID:39911580
|
研究论文 | 本研究通过分析33种不同类型癌症的免疫组成，区分了热肿瘤和冷肿瘤，并识别了调节肿瘤微环境的关键基因，提出了将冷肿瘤转化为热肿瘤的潜在药物 | 开发了一个框架来区分不同癌症类型中的临床显著免疫亚型，并识别了将冷肿瘤转化为热肿瘤的潜在药物 | 尚未就热/冷肿瘤的临床相关定义达成共识，且免疫基因对热/冷肿瘤形成的影响仍知之甚少 | 研究免疫调节基因对热/冷肿瘤微环境的影响，以提高癌症治疗效果和患者预后 | 33种不同类型癌症的肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | CIBERSORT算法、单细胞RNA测序、多重免疫组化 | NA | 基因表达数据、免疫组化数据 | 33种不同类型癌症的肿瘤样本 |
| 59 | 2025-02-07 |
Transcription factor KLF2 is associated with the dysfunctional status of NK cells and the prognosis of pediatric B-ALL patients
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1456004
PMID:39906661
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子KLF2与NK细胞功能失调状态及儿童B-ALL患者预后的关系 | 首次在单细胞水平上揭示了B-ALL患者骨髓微环境中NK细胞的分子遗传学特征，并发现KLF2在NK细胞中的表达与B-ALL患者的不良预后相关 | 样本量相对较小，且仅针对儿童B-ALL患者，未涵盖其他类型的白血病 | 研究B-ALL患者骨髓微环境中NK细胞的分子遗传学特征及其功能抑制机制 | 43名健康志愿者和104名儿童B-ALL患者的外周血样本，以及139名B-ALL患者的骨髓样本 | 分子遗传学 | B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL） | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 无监督聚类 | RNA测序数据 | 147名样本（43名健康志愿者和104名儿童B-ALL患者），以及139名B-ALL患者的骨髓样本 |
| 60 | 2025-02-07 |
Novel pyroptosis-immune-related lncRNA signature exhibits a distinct immune cell infiltration landscape in breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522327
PMID:39906743
|
研究论文 | 本研究探讨了与细胞焦亡和免疫相关的长链非编码RNA（lncRNA），以识别乳腺癌（BC）的潜在治疗靶点，并构建了lncRNA特征以确定BC患者的预后和免疫治疗反应 | 构建了一个包含六个lncRNA的细胞焦亡-免疫特征，有效预测乳腺癌预后并揭示不同的免疫细胞浸润模式 | 研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本量的限制 | 识别乳腺癌的潜在治疗靶点，并构建lncRNA特征以确定患者的预后和免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 来自The Cancer Genome Atlas数据集和GSE176078单细胞测序数据的样本 |