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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-04-25
ΔNp63 Regulates Homeostasis, Stemness, and Suppression of Inflammation in the Adult Epidermis
2024-01, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示ΔNp63在成年表皮中调控稳态、干细胞性和抑制炎症的关键作用 首次通过急性基因敲除实验证明ΔNp63在成年表皮中维持角质形成细胞增殖和自我更新,并抑制银屑病样炎症 仅在小鼠模型中研究,未在人体表皮中验证;ΔNp63敲除后细胞消失机制未完全阐明 探究ΔNp63在成年表皮中的功能及其调控机制 成年小鼠表皮角质形成细胞 分子生物学 银屑病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠表皮样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
42 2026-04-24
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文描述了表观遗传调控的记忆性星形胶质细胞亚群,通过整合过去刺激事件加剧炎性反应,促进中枢神经系统病理过程 首次发现星形胶质细胞存在表观遗传控制的记忆亚群,并阐明ACLY-p300通路通过乙酰辅酶A调节染色质可及性来维持促炎记忆的机制 主要基于动物模型(EAE),人体验证仅限于MS慢性病灶的关联分析,记忆功能在人类中的直接证据有限 探究疾病相关星形胶质细胞亚群的稳定性、调控机制及其对后续刺激的响应能力 多发性硬化症(MS)及实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型中的星形胶质细胞 神经科学 多发性硬化症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ATAC-seq、ChIP-seq、FIND-seq、CRISPR/Cas9基因编辑 NA 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、组蛋白修饰数据 EAE模型小鼠(急性/慢性),以及慢性MS患者脑组织样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'转录组测序,Illumina NovaSeq高通量测序平台
43 2026-04-18
Enhancing Spatial Transcriptomics Analysis by Integrating Image-Aware Deep Learning Methods
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160299
研究论文 本研究提出了一种整合空间转录组学与组织病理学图像数据的新型深度学习方法,以更好地捕捉癌症组织中的生物学模式 首次将ResNet深度学习模型提取的形态学特征与空间基因表达数据相结合进行聚类分析,实现了图像感知的特征发现 方法主要针对胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌等侵袭性癌症类型,在其他癌症类型中的普适性有待验证 通过整合多模态数据提升空间转录组学分析的生物学洞察力 胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌组织样本 数字病理学 胶质母细胞瘤, 三阴性乳腺癌 空间转录组学, 组织病理学成像 ResNet-50, Louvain聚类 空间基因表达数据, 高分辨率全切片组织学图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
44 2026-04-08
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2024-01-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了前列腺癌进展中肿瘤微环境内间充质细胞的分子变化及其关键作用 首次通过跨物种(小鼠模型与人类肿瘤)单细胞分析,系统鉴定了八个保守的间充质细胞亚群,并发现骨转移相关基质特征,提出了超越Gleason评分的新型预后基因标志物 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类样本验证相对有限;未深入探讨间充质细胞与其他肿瘤微环境成分的动态互作机制 解析前列腺癌进展过程中肿瘤基质细胞的分子特征与功能作用 前列腺癌肿瘤微环境中的间充质细胞 单细胞组学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 四种基因工程小鼠模型及对应人类肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
45 2026-04-07
The bone marrow of mouse-rat chimeras contains progenitors of multiple pulmonary cell lineages
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过创建小鼠-大鼠嵌合体,探索了其骨髓中富含的肺细胞谱系前体细胞在辐射诱导肺损伤修复中的作用 利用跨物种嵌合体技术生成富含呼吸系统前体细胞的骨髓移植,首次证明这些细胞能贡献于肺内皮细胞和基质细胞 研究仅在小鼠模型中进行,尚未验证在人类或临床环境中的适用性 开发一种能促进辐射诱导肺损伤后肺修复的新型骨髓移植方法 小鼠-大鼠嵌合体的骨髓细胞及其在辐射诱导肺损伤小鼠模型中的移植效果 数字病理学 肺损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据、免疫染色和流式细胞术数据 未明确指定具体样本数量,但涉及小鼠-大鼠嵌合体及移植实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
46 2026-04-06
PAGER-scFGA: unveiling cell functions and molecular mechanisms in cell trajectories through single-cell functional genomics analysis
2024, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本文介绍了PAGER-scFGA工具,用于通过单细胞功能基因组学分析揭示细胞轨迹中的细胞功能和分子机制 开发了PAGER-scFGA工具,整合细胞功能注释和基因集富集分析到单细胞分析流程中,支持细胞轨迹的功能探索和基因网络构建 NA 促进细胞群的功能注释和细胞轨迹分子机制的表征 小鼠自然杀伤细胞 单细胞功能基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
47 2026-04-05
An IL-4 signalling axis in bone marrow drives pro-tumorigenic myelopoiesis
2024-01, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了IL-4信号轴在骨髓中驱动促肿瘤性髓系生成的关键作用,并探索了其作为免疫检查点阻断联合疗法的潜力 首次在人类和小鼠非小细胞肺癌中通过单细胞RNA测序鉴定出IL-4是肿瘤浸润单核细胞来源巨噬细胞表型的主要驱动因子,并发现骨髓中嗜碱性粒细胞和嗜酸性粒细胞来源的IL-4通过作用于粒细胞-单核细胞祖细胞编程免疫抑制性肿瘤促进髓系细胞的发育 临床试验样本量较小(仅6名患者),且仅有一名患者显示出接近完全的临床反应,需要更大规模的验证 探究免疫抑制性髓系细胞状态的分子驱动机制,并开发针对癌症的系统性治疗策略 人类和小鼠的非小细胞肺癌病变组织及骨髓细胞 单细胞测序与免疫学 肺癌 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞RNA测序数据 人类和小鼠非小细胞肺癌样本,临床试验涉及6名复发或难治性非小细胞肺癌患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
48 2026-04-03
Multi-omics in exploring the pathophysiology of diabetic retinopathy
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)及其他多组学技术在探索糖尿病视网膜病变(DR)病理生理机制中的重要作用 系统性地整合并强调了scRNA-seq与其他多组学技术(如转录组学、遗传关联研究、代谢组学)的协同作用,为揭示DR的复杂分子机制、发现新生物标志物和治疗靶点提供了革命性的视角 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据,其结论基于对现有研究的总结和展望 探讨多组学技术,特别是scRNA-seq,在阐明糖尿病视网膜病变(DR)病理生理机制中的应用与贡献 糖尿病视网膜病变(DR)的分子机制、细胞类型、信号通路、生物标志物及潜在治疗靶点 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多组学分析(包括转录组学、遗传关联研究、代谢组学) NA NA NA NA 单细胞RNA测序,多组学分析 NA NA
49 2026-04-03
Breast pericytes: a newly identified driver of tumor cell proliferation
2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和细胞培养实验,揭示了乳腺周细胞作为肿瘤微环境中的关键因子,能显著促进乳腺癌细胞增殖 首次成功分离并纯化乳腺周细胞,利用单细胞RNA测序定义了其异质性,并发现周细胞在部分乳腺肿瘤中脱离血管成为主要间充质细胞类型,且能诱导肿瘤细胞快速生长 周细胞在肿瘤中的具体刺激机制尚未完全阐明,且样本量可能有限,需要进一步研究验证 探究乳腺周细胞在乳腺癌微环境中的作用及其对肿瘤细胞增殖的影响 乳腺组织中的周细胞和乳腺癌细胞 数字病理学 乳腺癌 FACS, 单细胞RNA测序, 转录组深度测序 NA RNA序列数据, 细胞培养数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
50 2026-04-02
Spatial transcriptomics of fetal membrane-Decidual interface reveals unique contributions by cell types in term and preterm births
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术分析了胎儿膜-蜕膜界面在足月和早产中的细胞类型特异性贡献 首次在空间水平上揭示胎儿膜各层(羊膜上皮、羊膜间质、绒毛膜和蜕膜)在足月与早产中的差异基因表达模式 样本量较小(13例患者),且未涉及更广泛的妊娠并发症或种族多样性 探究胎儿膜-蜕膜界面在足月分娩和早产中的分子机制 人类胎儿膜组织(包括羊膜上皮、羊膜间质、绒毛膜和母体蜕膜) 空间转录组学 早产 单细胞转录组学 分层聚类分析 转录组数据 13例患者(包括足月未临产、足月临产、早产和早产胎膜早破) NA 空间转录组学 NA NA
51 2026-04-01
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究探讨了套细胞淋巴瘤对PRMT5靶向治疗产生耐药性的机制,并发现mTOR信号通路上调是耐药的关键因素,通过mTORC1抑制剂temsirolimus可克服耐药性 首次在套细胞淋巴瘤中系统研究PRMT5抑制剂耐药机制,结合患者来源异种移植模型和细胞系模型,通过单细胞RNA测序揭示mTOR信号通路在耐药中的核心作用,并验证了联合靶向治疗的协同效应 研究主要基于体外细胞系和PDX模型,缺乏大规模临床样本验证;耐药机制可能涉及其他未被发现的通路;长期联合治疗的安全性和有效性需进一步评估 探究套细胞淋巴瘤对PRMT5靶向治疗产生耐药性的分子机制,并寻找克服耐药性的治疗策略 套细胞淋巴瘤细胞系、患者来源异种移植模型 肿瘤生物学 套细胞淋巴瘤 RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 8个细胞系(4个敏感,4个原发耐药),4个耐药细胞系,PDX模型 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
52 2026-03-25
Lysyl Oxidase Regulates Epithelial Differentiation and Barrier Integrity in Eosinophilic Esophagitis
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了赖氨酰氧化酶在嗜酸性食管炎中通过激活BMP信号通路调节上皮分化和屏障完整性的非经典功能 首次发现LOX在食管上皮中作为信号分子通过激活BMP通路调节上皮稳态,并证明LOX/BMP轴在炎症条件下恢复上皮分化和屏障功能的作用 研究主要基于体外器官模型和细胞培养,缺乏体内实验验证;样本来源和数量未明确说明 探究赖氨酰氧化酶在嗜酸性食管炎食管上皮中的功能作用及其分子机制 人食管上皮细胞、3D器官模型、气液界面培养体系 单细胞组学 嗜酸性食管炎 单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot、组织学分析、屏障功能分析 3D器官模型、气液界面培养 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2026-03-21
Identification and exploration of aging-related subtypes and distinctive role of SERPINE1 in heart failure based on single-cell and bulk RNA sequencing data
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞和bulk RNA测序数据,探索了衰老相关基因在心力衰竭中的作用,并识别了新的诊断生物标志物和分子亚型 结合单细胞和bulk RNA测序数据,首次识别了SERPINE1在心力衰竭中的关键作用,并揭示了其与衰老相关亚型、免疫浸润和代谢微环境的关联 研究样本量有限(仅20个血液样本用于RT-qPCR验证),且未进行大规模临床验证 探索心力衰竭的新诊断生物标志物、分子分型和治疗策略 心力衰竭患者和正常对照的血液样本及测序数据 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR 诊断模型 RNA测序数据, 基因表达数据 未明确总测序样本数,但包括10名正常对照和10名心力衰竭患者的血液样本用于验证 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
54 2026-03-21
Peroxisome proliferator-activated receptors signature reveal the head and neck squamous cell carcinoma energy metabolism phenotype and clinical outcome
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过多数据集分析揭示了过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)相关基因在头颈部鳞状细胞癌(HNSC)中的作用,构建了预后模型并探讨了其与能量代谢和免疫治疗响应的关联 首次在HNSC中利用单细胞RNA测序数据全面分析PPAR相关基因特征,构建了基于七个PPAR相关基因的高精度预后模型,并发现这些基因能区分HNSC的能量代谢异质性 研究主要基于公共数据集,缺乏独立的前瞻性临床队列验证,且未进行实验验证PPAR相关基因的具体功能机制 探究PPAR相关基因在HNSC中的表达特征、预后价值及其与能量代谢和免疫微环境的关系 头颈部鳞状细胞癌(HNSC)患者样本,包括肿瘤组织和正常组织 生物信息学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,免疫组化分析,功能富集分析 LASSO回归,Cox回归模型 RNA测序数据,单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据 多个公共数据集(TCGA-HNSC, GSE41613, GSE139324, PRJEB23709, IMVigor),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
55 2026-03-21
Cross-talk of pyroptosis-based subtypes, the development of a risk classifier and immune responses in cervical cancer
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究基于焦亡相关基因对宫颈癌进行分型,开发了一个风险分类器,并探讨了其与免疫应答的关系 首次基于焦亡相关基因对宫颈癌进行分子分型,并构建了一个包含四个基因(PEG3、FSCN1、CDH3和SLC2A1)的风险分类器,同时揭示了不同风险组间的免疫微环境差异 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列验证;单细胞测序分析可能受限于样本量和细胞类型覆盖 探索焦亡在宫颈癌中的预后价值及其对免疫代谢的调控作用 宫颈癌患者样本和细胞系 生物信息学与计算生物学 宫颈癌 单细胞测序、PCR、CIBERSORT算法、无监督聚类分析、逐步Cox回归 风险分类器(基于Cox回归) 基因表达数据、单细胞测序数据、临床生存数据 两个独立队列共501例宫颈癌样本(C1组259例,C2组242例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2026-03-21
Single-cell RNA sequencing reveals the mechanism of PI3K/AKT/mTOR signaling pathway activation in lung adenocarcinoma by KRAS mutation
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了KRAS突变在肺腺癌中激活PI3K/AKT/mTOR信号通路的机制 首次在单细胞水平上结合KRAS突变状态分析PI3K/AKT/mTOR通路活性,并识别出GRB2+上皮细胞亚群作为关键靶点 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 探究KRAS突变对肺腺癌中PI3K/AKT/mTOR信号通路活性的影响机制 肺腺癌患者单细胞RNA测序数据及TCGA数据集中的基因表达和突变谱 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 Seurat包、主成分分析、AUCell评分、基因集富集分析、inferCNV包 单细胞RNA测序数据、基因表达谱、突变谱 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
57 2026-03-21
COL3A1-positive endothelial cells influence LUAD prognosis and regulate LUAD carcinogenesis by NCL-PI3K-AKT axis
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了COL3A1阳性内皮细胞在肺腺癌发生发展及免疫微环境形成中的关键作用,并鉴定出关键靶基因NCL通过PI3K-AKT通路调控癌细胞凋亡与增殖 首次在单细胞水平系统解析了COL3A1阳性内皮细胞亚群在肺腺癌中的独特功能,发现其通过NCL-PI3K-AKT轴调控肿瘤发生的新机制 研究样本量较小(16例),功能验证主要在细胞系水平进行,缺乏体内实验验证 探究肺腺癌中内皮细胞异质性及其在肿瘤发生和微环境形成中的作用机制 肺腺癌患者样本(16例)及A549、NCI-H1299肺腺癌细胞系 数字病理 肺癌 单细胞RNA测序,伪时间分析,细胞通讯分析,基因调控网络分析,流式细胞术,Western blot,EdU染色,Ki-67染色 NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据,蛋白质印迹数据 16例肺腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
58 2026-03-21
Cytotoxic T-lymphocytes in acute myeloid leukemia: Monitoring prognosis and guiding treatment choice
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究探讨了细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)在急性髓系白血病(AML)中的作用,并基于其细胞遗传学标志物构建了一个随机森林模型,用于预后分层和治疗选择指导 通过单细胞RNA测序数据识别了CTLs在AML细胞通讯中的核心作用,并利用随机森林模型基于CTLs标志基因进行预后评估和免疫治疗响应预测 研究基于公开数据集GSE116256,样本来源和数量可能有限,且模型需进一步验证 理解CTLs在AML预后监测和临床治疗响应中的作用,并开发预测模型 急性髓系白血病(AML)患者 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 随机森林 单细胞RNA测序数据 基于GSE116256数据集,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
59 2026-03-21
Machine learning reveals PANoptosis as a potential reporter and prognostic revealer of tumour microenvironment in lung adenocarcinoma
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合多种细胞死亡模式构建PANoptosis基因集,利用单细胞RNA-seq数据分析肺腺癌样本,建立风险模型并验证其预后价值及与肿瘤微环境的关联 首次将铁死亡、铜死亡、焦亡、坏死性凋亡和双硫死亡整合为PANoptosis基因集,并应用于肺腺癌的单细胞分析,揭示了其与肿瘤免疫微环境的潜在联系 研究仅基于11个肺腺癌样本的单细胞数据,样本量较小,且细胞验证仅限于两种肺腺癌细胞系 探究PANoptosis在肺腺癌中的表达模式及其作为预后生物标志物和肿瘤微环境调节因子的潜力 肺腺癌患者样本及两种肺腺癌细胞系 机器学习 肺腺癌 单细胞RNA测序 LASSO回归、COX回归 单细胞RNA-seq数据 11个肺腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
60 2026-03-21
Immune infiltration and clinical significance analyses of the cancer-associated fibroblast-related signature in skin cutaneous melanoma
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究构建了一个与癌症相关成纤维细胞(CAF)相关的10基因特征模型,用于预测皮肤黑色素瘤(SKCM)患者的预后、免疫景观及对化疗/免疫疗法的反应 基于单细胞转录组分析和加权基因共表达分析,首次构建了针对皮肤黑色素瘤的CAF相关预后特征模型,并揭示了其与免疫抑制及治疗反应的关系 研究主要基于TCGA和GEO的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证;模型在外部独立队列中的验证尚不充分 建立CAF相关特征模型,为皮肤黑色素瘤患者的预后评估和治疗方案选择提供新视角 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者 生物信息学 皮肤黑色素瘤 单细胞转录组分析,加权基因共表达分析(WGCNA) 预后特征模型(10基因模型) 基因表达数据 TCGA-SKCM队列中的样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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