单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Identification of TIMPs signatures in Randall plaque from single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) analysis
2024-01-16, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01296-0
PMID:38225514
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2025-10-05 |
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12
PMID:38622400
|
研究论文 | 本文介绍了从狼疮易感小鼠中分离调节性B细胞并进行单细胞转录组分析的方法 | 首次在狼疮易感MRL/lpr小鼠模型中建立调节性B细胞的分离方案并应用于单细胞RNA测序分析 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 深入理解调节性B细胞在健康和疾病状态下的生物学特性 | 狼疮易感MRL/lpr小鼠的调节性B细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-05 |
From womb to wellness: early environmental exposures, cord blood DNA methylation and disease origins
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2390823
PMID:39263926
|
综述 | 探讨胎儿环境暴露通过脐带血DNA甲基化影响疾病起源的机制与研究方向 | 系统阐述脐带血DNA甲基化作为胎儿表观遗传窗口的重要性，并提出单细胞测序等新技术应用前景 | 存在组织特异性问题、现有甲基化芯片覆盖度有限、细胞组成变异等混杂因素 | 阐明早期环境暴露与表观基因组相互作用机制，开发预防策略 | 脐带血DNA甲基化与胎儿环境暴露 | 表观遗传学 | 发育源性疾病 | DNA甲基化分析，单细胞测序 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-10-05 |
An update on periodontal inflammation and bone loss
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1385436
PMID:38919613
|
综述 | 本文更新了关于牙周炎症和骨丢失的最新研究进展 | 整合了单细胞RNA测序和动物研究的新发现，深入探讨牙周病与全身系统性疾病之间的联系 | NA | 探讨牙周病的发病机制及其与全身系统性疾病的关系 | 牙周病及其相关的免疫反应和微生物群 | NA | 牙周病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-05 |
Comparative Methods for Demystifying Spatial Transcriptomics
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3838-5_17
PMID:38819570
|
研究论文 | 本文比较分析了空间转录组学数据分析方法，重点关注10x Visium平台的分析流程 | 系统分解空间转录组学分析流程为四个关键步骤，并比较不同spot选择和基因组/转录组参考对分析结果的影响 | 仅聚焦于制造商提供的软件套件，未涵盖其他分析工具 | 阐明空间转录组学数据分析方法及其影响因素 | 空间转录组学数据分析流程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，RNA测序 | NA | 基因表达数据，显微镜图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 46 | 2025-10-06 |
A randomized, placebo-controlled trial of the BTK inhibitor zanubrutinib in hospitalized patients with COVID-19 respiratory distress: immune biomarker and clinical findings
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1369619
PMID:39906744
|
研究论文 | 评估布鲁顿酪氨酸激酶抑制剂赞布替尼对COVID-19呼吸窘迫住院患者的免疫生物标志物和临床疗效的随机对照试验 | 首次在COVID-19患者中评估新一代BTK抑制剂赞布替尼对免疫反应和临床结局的影响，并采用单细胞转录组分析揭示其免疫调节机制 | 大多数患者同时接受类固醇和抗病毒治疗可能影响结果，队列2样本量过小（仅4例），临床恢复指标未显示显著改善 | 评估BTK抑制剂赞布替尼在SARS-CoV-2感染伴呼吸窘迫患者中的安全性和有效性 | COVID-19住院患者（无需机械通气或机械通气≤24小时） | 临床医学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析，血清学检测 | NA | 临床数据，实验室检测数据，转录组数据 | 队列1：63例患者（赞布替尼30例，安慰剂33例）；队列2：4例患者 | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
Discovery of optimal cell type classification marker genes from single cell RNA sequencing data
2024, BMC methods
DOI:10.1186/s44330-024-00015-2
PMID:40893796
|
研究论文 | 介绍NS-Forest v4.0算法及其Python包，用于从单细胞RNA测序数据中发现最优细胞类型分类标记基因 | 开发了随机森林机器学习算法NS-Forest v4.0，引入On-Target Fraction指标量化标记基因特异性，在紧密相关细胞类型中识别具有更高特异性的标记基因组合 | NA | 从单细胞RNA测序数据中发现最优细胞类型分类标记基因 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 包含数百万细胞的大规模单细胞RNA测序图谱数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1063
PMID:37953308
|
研究论文 | 介绍了一个专门用于造血干细胞命运决定基因功能注释的综合知识库StemDriver | 整合了42项研究的单细胞RNA测序数据，构建了从胚胎期到成年期的全面造血谱系图谱 | NA | 建立造血干细胞命运决定相关基因功能的知识库 | 人类和小鼠的造血干细胞及其分化谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 整合42项研究数据，涵盖14种组织类型，评估人类23,839个基因和小鼠29,533个基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
Regulatory T cells in skin mediate immune privilege of the hair follicle stem cell niche
2024-01-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adh0152
PMID:38181095
|
研究论文 | 本研究揭示了皮肤中调节性T细胞通过IL-2信号通路保护毛囊干细胞生态位的免疫豁免机制 | 开发了皮肤特异性Treg细胞基因重组技术，首次证明非淋巴器官中存在局部免疫耐受机制 | 研究主要依赖基因工程小鼠模型，人类疾病验证仅限于罕见脱发类型 | 探究皮肤局部调节性T细胞维持自身免疫耐受的生物学机制 | 皮肤调节性T细胞、毛囊干细胞生态位、脱发疾病模型 | 免疫学 | 脱发症 | 空间转录组学、遗传重组技术 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-06 |
Heat Inactivation of Nipah Virus for Downstream Single-Cell RNA Sequencing Does Not Interfere with Sample Quality
2024-01-09, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13010062
PMID:38251369
|
研究论文 | 本研究验证了热灭活步骤对尼帕病毒样本进行单细胞RNA测序的适用性，确认不影响样本质量 | 首次证明在单细胞RNA测序流程中加入热灭活步骤可有效灭活BSL-4级病原体尼帕病毒，且不影响测序质量 | 研究仅针对尼帕病毒和特定商业平台，未测试其他BSL-4病原体或平台 | 开发适用于BSL-4病原体样本的安全单细胞RNA测序流程 | 尼帕病毒感染的细胞样本 | 单细胞测序 | 病毒传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 未指定 | 单细胞RNA测序 | 微流控分区单细胞RNA测序平台 | 商业可用的微流控分区单细胞RNA测序平台 |
| 51 | 2025-10-06 |
A Strategy based on Bioinformatics and Machine Learning Algorithms Reveals Potential Mechanisms of Shelian Capsule against Hepatocellular Carcinoma
2024, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和机器学习算法揭示了射莲胶囊抗肝细胞癌的潜在作用机制 | 首次整合生物信息学分析和多种机器学习算法系统研究射莲胶囊抗肝癌的多层次作用机制 | 研究主要基于数据库分析和计算模拟，缺乏实验验证 | 探索射莲胶囊治疗肝细胞癌的潜在药理机制 | 射莲胶囊的活性成分和肝细胞癌相关基因 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析,机器学习算法,单细胞RNA测序,分子对接 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),多种机器学习算法 | 基因表达数据,化合物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,微阵列芯片 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
leptin b and its regeneration enhancer illustrate the regenerative features of zebrafish hearts
2024-01, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.556
PMID:36495292
|
研究论文 | 本研究利用leptin b及其组织再生增强子元件解析斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞的异质性 | 首次将lepb作为再生特异性标志物来识别损伤激活的内皮细胞亚群，并发现lepb+内皮细胞作为信号中心与其他心脏细胞相互作用 | 研究仅限于斑马鱼模型，未在哺乳动物中进行验证 | 解析斑马鱼心脏再生的细胞和分子机制 | 斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞（内皮细胞、心外膜和心外膜来源细胞） | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，染色质可及性分析，转基因品系 | NA | 单细胞转录组数据，染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk transcriptome analysis of R-loop score-based signature with regard to immune microenvironment, lipid metabolism and prognosis in HCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1487372
PMID:39850878
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析，构建了基于R-loop评分的特征模型，探索其在肝细胞癌免疫微环境、脂质代谢和预后中的作用 | 首次构建了基于R-loop评分的预后模型，揭示了R-loop调节因子CLTC通过调控脂质代谢促进肝癌进展的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限；样本来源和数量可能存在限制 | 探索R-loop在肝细胞癌进展中的作用机制，并构建预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, WGCNA分析, 体外实验, 体内实验 | R-loop评分模型, 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 来自GSE149614和CRA002308数据集的HCC患者单细胞数据，TCGA数据库的批量数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-06 |
ScRNA-seq unveils the functional characteristics of glioma-associated macrophages and the regulatory effects of chlorogenic acid on the immune microenvironment-a study based on mouse models and clinical practice
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494806
PMID:39867913
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质瘤相关巨噬细胞的功能特征及绿原酸对免疫微环境的调控作用 | 首次结合小鼠模型和临床实践，系统揭示绿原酸通过JAK-STAT通路调控肿瘤相关巨噬细胞功能并改善免疫微环境 | 研究样本量有限，仅包含一个临床病例，需要更大规模的临床试验验证 | 探索胶质瘤免疫微环境特征及绿原酸的免疫调节作用 | 胶质瘤模型小鼠和临床患者 | 单细胞测序分析 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, PPI网络分析, 分子对接 | 分子对接模型 | 单细胞转录组数据, 临床数据 | 模型小鼠和1例临床患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-06 |
CD36 restricts lipid-associated macrophages accumulation in white adipose tissues during atherogenesis
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1436865
PMID:39156133
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了CD36在动脉粥样硬化过程中调控白色脂肪组织中脂质相关巨噬细胞积累的新机制 | 首次在动脉粥样硬化模型中定义了白色脂肪组织中'不健康巨噬细胞'亚群，并发现CD36缺失通过促进LAM积累来平衡脂质代谢与炎症 | 研究基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证；单细胞测序样本量有限 | 探究CD36在动脉粥样硬化过程中对白色脂肪组织巨噬细胞异质性和功能的调控作用 | 饮食诱导的动脉粥样硬化小鼠模型及其白色脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 细胞代谢分析, 功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 动脉粥样硬化小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-06 |
BIOINFORMATICS APPLICATIONS UNDER CONDITION CONTROL: HIGH DIAGNOSTIC VALUE OF DDX47 IN REAL MEDICAL SETTINGS
2024-01-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002199
PMID:37553903
|
研究论文 | 本研究提出基于真实医疗场景的条件控制方法，发现DDX47基因在脓毒症诊断中具有重要价值 | 开发了基于真实医疗场景的条件控制方法，通过逐步放宽限制识别独特的差异基因 | 研究仅包含三个数据集，样本量有限，且缺乏标准诊断金标准 | 探索基因表达谱在脓毒症诊断中的应用价值 | 脓毒症和脓毒性休克患者 | 生物信息学 | 脓毒症 | 基因表达谱分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 三个数据集，包括GEO数据库数据和华西医院2020-2021年ICU患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
SINGLE-CELL TRANSCRIPTOME ANALYSIS IN HEALTH AND DISEASE
2024-01-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002274
PMID:37962963
|
综述 | 本文概述了单细胞转录组分析在健康和疾病研究中的应用现状 | 全面总结了单细胞转录组分析的技术优势、平台多样性和计算分析方法的发展 | 未涉及具体实验数据或案例研究，仅为方法论概述 | 探讨单细胞转录组分析在揭示健康和疾病状态下组织细胞多样性与复杂性的应用 | 各类生物组织中的单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2025-10-06 |
Connecting genomic results for psychiatric disorders to human brain cell types and regions reveals convergence with functional connectivity
2024-Jan-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.01.18.24301478
PMID:38410450
|
研究论文 | 通过整合基因组关联研究与单细胞转录组数据，揭示精神疾病与特定脑细胞类型和脑区的关联 | 首次利用成人全脑单细胞图谱将精神疾病基因组结果与特定脑细胞类型和脑区连接，并验证功能连接性 | 依赖人类脑图谱数据的完整性，需进一步实验验证具体机制 | 解析精神疾病的时空脑区定位和细胞类型基础 | 精神疾病（精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症）及相关认知特征 | 生物信息学 | 精神疾病 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序 | 富集分析，功能连接分析 | 基因组数据，转录组数据，fMRI影像数据 | 精神疾病患者与神经典型对照组的fMRI数据 | NA | 单细胞RNA-seq，功能磁共振成像 | NA | 成人全脑单细胞图谱 |
| 59 | 2025-10-06 |
Identifying immune signatures of sepsis to increase diagnostic accuracy in very preterm babies
2024-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44387-5
PMID:38195661
|
研究论文 | 通过多参数流式细胞术、单细胞RNA测序和血浆分析识别极早产儿败血症的免疫特征 | 发现双调蛋白在败血症期间白细胞群体中的上调，可作为即使C反应蛋白正常时仍与疾病临床体征相关的血浆分析物 | 研究样本仅限于极早产儿(<32周妊娠)，样本量相对有限 | 提高极早产儿败血症诊断准确性 | 极早产儿(<32周妊娠)的血液样本 | 数字病理学 | 败血症 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序,血浆分析 | NA | 流式细胞数据,单细胞RNA测序数据,血浆分析数据 | 极早产儿血液样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2024-01-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44210-1
PMID:38191471
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示前列腺癌进展中不同间充质细胞状态的关键作用 | 首次在跨物种水平系统鉴定前列腺癌间质细胞亚群，发现晚期小鼠疾病与人类骨转移的间质特征相似性，并建立超越Gleason评分的转移预测基因标签 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 解析前列腺癌肿瘤微环境中间充质细胞的分子特征及其在癌症进展中的作用 | 基因工程小鼠模型和人类前列腺癌样本中的间充质细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四个基因工程小鼠模型及对应人类肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |