单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1298 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2024-08-04 |
Mitophagy and clear cell renal cell carcinoma: insights from single-cell and spatial transcriptomics analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1400431
PMID:38994370
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体自噬在透明细胞肾癌中的变化及其对肿瘤微环境的影响 | 揭示了UBB基因及其相关的泛素化过程在透明细胞肾癌发展中的重要性 | NA | 深入研究透明细胞肾癌中线粒体自噬活性变化及其对肿瘤代谢和发展策略的影响 | 透明细胞肾癌肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 多个透明细胞肾癌肿瘤组织样本 |
| 562 | 2024-08-05 |
A High Immune-Related Index with the Suppression of cGAS-STING Pathway is a Key Determinant to Herceptin Resistance in HER2+ Breast Cancer
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.94868
PMID:38993569
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研究论文 | 本研究探讨了免疫相关指标与HER2+乳腺癌Herceptin耐药性之间的关系 | 提出了一种可信的免疫相关预后指标，该指标考虑了免疫渗透，与Herceptin耐药的乳腺癌有重要关联 | 缺乏理想的预后模型全面考虑免疫渗透 | 研究HER2+乳腺癌中的免疫微环境及其对Herceptin耐药性的影响 | 与HER2+乳腺癌相关的细胞系和样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | Cox回归、XGBoost和Lasso算法 | 基因表达数据 | 85例HER2+乳腺癌样本 |
| 563 | 2024-08-05 |
Type 1 immunity enables neonatal thymic ILC1 production
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh5520
PMID:38232171
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研究论文 | 本研究探讨了1型免疫如何促进新生儿胸腺来源的ILC1细胞扩展和外周定居 | 揭示了新生儿胸腺驻留的ILC1细胞是在与其他初级淋巴器官相比具有独特和幼稚的亚群 | 尚未探索1型免疫对其他类型淋巴细胞的具体影响 | 研究1型免疫对胸腺驻留先天淋巴细胞(ILCs)的影响 | 重点研究了新生儿胸腺内的ILC1细胞及其与1型细胞因子的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 采用小鼠新生儿胸腺组织进行实验 |
| 564 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell sequencing with machine learning and Mendelian randomization analysis identifies the NAP1L1 gene as a predictive biomarker for Alzheimer's disease
2024, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2024.1406160
PMID:38988327
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞测序、机器学习和孟德尔随机化分析识别NAP1L1基因作为阿尔茨海默病的预测生物标志物 | 该文章首次将单细胞测序与机器学习及孟德尔随机化结合，以识别与阿尔茨海默病相关的特定基因 | 研究可能在外部验证样本的范围和多样性方面有局限性 | 识别可靠的阿尔茨海默病生物标志物，以便提前预测疾病并及时干预 | 阿尔茨海默病患者的外周血单核细胞及对照组样本 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 565 | 2024-08-04 |
Network-based prioritization and validation of regulators of vascular smooth muscle cell proliferation in disease
2024, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00474-4
PMID:38898928
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研究论文 | 本文阐明了影响血管平滑肌细胞增殖的分子决定因素。 | 文章创新性地识别并优先考虑了以前未被认识的增殖调节因子，如RUNX1和TIMP1。 | 未提及特定的研究限制。 | 旨在通过重建基因调控网络，阐明血管平滑肌细胞在疾病中的增殖机制。 | 研究对象为血管平滑肌细胞，尤其是增殖倾向的细胞状态。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学和表观遗传学分析 | NA | 基因表达数据 | 人类血管平滑肌细胞的样本 |
| 566 | 2024-08-05 |
New HCC Subtypes Based on CD8 Tex-Related lncRNA Signature Could Predict Prognosis, Immunological and Drug Sensitivity Characteristics of Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S459150
PMID:38983937
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研究论文 | 该文章探讨了CD8 Tex相关lncRNA在肝细胞癌中的作用及其与预后、免疫和药物敏感性的关系 | 首次基于CD8 Tex相关lncRNA签名识别新的HCC亚型，揭示了其在HCC中的预后和免疫特性 | 尚未深入探讨CD8 Tex相关lncRNAs的具体功能机制 | 研究CD8 Tex相关lncRNAs在肝细胞癌中的作用及其对免疫和药物反应的影响 | CD8 Tex相关lncRNAs及其在HCC细胞中的表达和功能 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据 | 多样本（具体数量未提及） |
| 567 | 2024-08-04 |
Cuproptosis-Related Genes as Prognostic Biomarkers for Sepsis: Insights into Immune Function and Personalized Immunotherapy
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S461766
PMID:38979432
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研究论文 | 本研究旨在通过分析新型细胞死亡过程cuproptosis，发现败血症免疫治疗的诊断和预后生物标志物 | 首次将cuproptosis相关基因与败血症的免疫功能和个性化免疫疗法联系起来 | 研究可能受到样本量和群体分类的限制 | 探讨cuproptosis相关基因在败血症预后中的作用 | 败血症患者的转录组数据以及cuproptosis相关基因 | 数字病理学 | 败血症 | 转录组测序，单细胞测序，实时定量PCR | 预测模型 | 转录组数据 | 涉及败血症患者和健康对照的样本 |
| 568 | 2024-08-04 |
Deciphering head and neck cancer microenvironment: Single-cell and spatial transcriptomics reveals human papillomavirus-associated differences
2024-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29386
PMID:38235919
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研究论文 | 本文研究了人乳头瘤病毒（HPV）相关的头颈癌微环境的分子特征 | 通过单细胞和空间转录组学分析，发现了HPV感染与癌症干细胞特性之间的关键基因PKM2及其在转移肿瘤中的作用 | 样本数量有限，仅包括8个单细胞RNA样本和6个空间转录组样本 | 探讨HPV在头颈鳞状细胞癌中的微环境作用及其对转移的影响 | 主要研究基于HPV状态的原发肿瘤和淋巴结转移肿瘤的分子特征 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 8个单细胞RNA样本和6个空间转录组样本 |
| 569 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell sequencing and machine learning identifies a signature based on monocyte/macrophage hub genes to analyze the intracranial aneurysm associated immune microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1397475
PMID:38979407
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习分析识别与颅内动脉瘤相关的单核细胞/巨噬细胞基因特征，以阐明其与免疫微环境的关系 | 结合六种机器学习算法识别出与单核细胞/巨噬细胞相关的关键基因，并开发了多层感知机神经模型用于颅内动脉瘤的诊断 | 尽管研究揭示了单核细胞浸润的分子特征，但在针对颅内动脉瘤的靶向治疗方面的有效性仍需进一步验证 | 识别单核细胞/巨噬细胞相关的基因特征，以阐明其在颅内动脉瘤发病机制和免疫微环境中的作用 | 主要研究对象为颅内动脉瘤中的单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 多层感知机（MLP） | 基因数据 | NA |
| 570 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas of the aging mouse ovary
2024-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00552-5
PMID:38200272
|
研究论文 | 本研究绘制了小鼠卵巢衰老的单细胞转录组图谱 | 首次提供了衰老小鼠卵巢的全面细胞图谱，揭示了早期卵巢衰退的驱动因素 | 该研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全转化到人类卵巢衰老 | 研究小鼠卵巢衰老过程中的转录组变化 | 对3个月和9个月小鼠卵巢组织进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠卵巢组织，3个月和9个月各一组 |
| 571 | 2024-08-05 |
Lysyl oxidase-like 1 predicts the prognosis of patients with primary glioblastoma and promotes tumor invasion via EMT pathway
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17579
PMID:38978755
|
研究论文 | 这篇文章探讨了赖氨酸氧化酶样1（LOXL1）在原发性胶质母细胞瘤患者预后中的预测作用及其通过上皮-间质转化（EMT）途径促进肿瘤侵犯的机制 | 提出了基于LOXL1的预后风险评分模型和诺莫图，展示了其在评估胶质母细胞瘤患者预后中的潜在应用 | 只使用了TCGA和CGGA数据进行分析，结果可能受限于数据的可获取性和样本的多样性 | 研究LOXs在胶质母细胞瘤中的作用及其对患者预后的影响 | 主要研究对象是原发性胶质母细胞瘤患者及其相关的LOXs基因 | 肿瘤病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，CCK-8，western blot，伤口愈合实验，Transwell侵袭实验 | NA | 基因组数据，临床生存数据 | 使用TCGA和CGGA数据集的患者，具体样本量未在摘要中提及 |
| 572 | 2024-08-05 |
The association between vitamin D and the progression of diabetic nephropathy: insights into potential mechanisms
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1388074
PMID:38978780
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研究论文 | 本研究调查了维生素D水平与糖尿病肾病进展之间的关联及潜在机制 | 揭示了维生素D缺乏与糖尿病肾病进展相关的分子机制 | 本研究仅基于特定患者群体，可能存在样本选择偏差 | 探索维生素D水平与糖尿病肾病进展之间的关系和机制 | 567名2型糖尿病患者及221名健康对照的临床数据 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | RNA-seq，scRNA-seq | NA | 临床数据，基因表达数据 | 567名2型糖尿病患者和221名健康对照 |
| 573 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomic analysis to unveil heterogeneity in high-grade serous ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1420847
PMID:38975339
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示高等级浆液性卵巢癌的异质性 | 该研究首次揭示了HGSOC的特定细胞特征与不良结果的相关性，并提出了代谢通路的治疗靶点 | 本研究主要集中在HGSOC的特定特征上，可能限制了其他类型卵巢癌的适用性 | 研究HGSOC的复杂机制并识别其异质性 | HGSOC的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 肿瘤组织样本 | 包括转移样本在内的多种HGSOC样本 |
| 574 | 2024-08-05 |
An age-and sex-matched postoperative therapy should be required in thyroid papillary carcinoma
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1339191
PMID:38974575
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研究论文 | 本研究探讨了甲状腺乳头状癌（PTC）的淋巴结转移风险因素并提出了差异化治疗方案。 | 首次指出性别和年龄对PTC术后治疗的影响，并建议在治疗中考虑这些因素。 | 未能明确TSH对PTC行为的影响，且部分临床数据可能存在偏差。 | 研究PTC术后淋巴结转移的风险因素，并开发针对PTC的差异化治疗。 | 分析2073例PTC患者的临床信息及基因表达数据。 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 临床数据、基因表达数据 | 2073例 |
| 575 | 2024-08-05 |
A comprehensive exploration of the heterogeneity of immune cells in Han and Zang systemic lupus erythematosus patients via single-cell RNA sequencing
2024-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110770
PMID:38128704
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索汉族和藏族系统性红斑狼疮患者免疫细胞的异质性 | 首次揭示汉族和藏族SLE患者免疫细胞的异质性 | 可能样本量有限，未包括其他民族的比较 | 揭示SLE患者免疫细胞的异质性 | 汉族和藏族的系统性红斑狼疮患者 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 576 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of spatial and single-cell transcriptome data from human pancreatic cancer reveals an intermediate cancer cell population associated with poor prognosis
2024-01-31, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01287-7
PMID:38297291
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研究论文 | 本文通过整合空间和单细胞转录组数据揭示了与差病预后相关的中间癌细胞群体 | 识别了一种新型癌细胞亚群Ep_VGLL1，具有基底样和经典亚型之间的过渡特征 | 由于肿瘤的内部和外部异质性，分子特征和生物学意义尚未明确阐明 | 探讨胰腺癌的细胞异质性及其与预后的关系 | 来自17个胰腺肿瘤组织的单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 17个胰腺肿瘤组织样本（16个胰腺癌和一个高等级发育不良样本） |
| 577 | 2024-08-04 |
Unsupervised spatially embedded deep representation of spatial transcriptomics
2024-01-12, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01283-x
PMID:38217035
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研究论文 | 本文介绍了一种用于空间转录组学的无监督深度表示方法SEDR | 提出了一种结合深度自编码器和掩蔽自监督学习机制的新方法SEDR，用于构建低维基因表达的潜在表示 | NA | 优化转录组数据与空间信息的整合，以解析组织异质性和映射细胞间通讯 | 使用10×Visium数据集进行聚类性能的评估 | 数字病理学 | NA | 深度自编码器 | 变分图自编码器 | 基因表达数据 | 手动注释的10×Visium数据集 |
| 578 | 2024-08-05 |
Activation of TLR9 signaling suppresses the immunomodulating functions of CD55lo fibroblastic reticular cells during bacterial peritonitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1337384
PMID:38827745
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研究论文 | 该文章研究了TLR9信号的激活如何抑制CD55lo成纤维网格细胞在细菌性腹膜炎中的免疫调节功能 | 首次确认在不同FRC亚群中TLR9信号的调节作用，并揭示CD55和CD55亚群在腹膜免疫中的不同功能 | 缺乏对不同组织和器官中FRC亚群功能的全面了解 | 探究TLR9信号在成纤维网格细胞中的作用及其对细菌性腹膜炎的影响 | 集中于小肠系膜FALC中的CD55和CD55 FRC亚群 | 数字病理 | 腹膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 参与研究的样本类型为小肠系膜FALC中的成纤维网格细胞，具体样本数量未说明 |
| 579 | 2024-08-05 |
Single cell RNA-sequencing in uveal melanoma: advances in heterogeneity, tumor microenvironment and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427348
PMID:38966635
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序在葡萄膜黑色素瘤中的应用，重点关注异质性、肿瘤微环境和免疫治疗进展 | 结合生物信息学分析的单细胞RNA测序为理解肿瘤内异质性和微环境提供了新的视角，有助于发现与预后相关的分子指标 | 由于葡萄膜黑色素瘤的特殊生物学特性，免疫治疗的效果有限 | 提高葡萄膜黑色素瘤患者免疫治疗的疗效 | 葡萄膜黑色素瘤患者的肿瘤特征和微环境 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 580 | 2024-08-04 |
Deciphering the shared mechanisms of Gegen Qinlian Decoction in treating type 2 diabetes and ulcerative colitis via bioinformatics and machine learning
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1406149
PMID:38962743
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研究论文 | 本研究探讨了葛根芩莲汤在治疗2型糖尿病和溃疡性结肠炎中的共享机制 | 揭示了T2DM和UC之间的共病机制，并识别了新的生物标志物和治疗策略 | 缺乏临床试验数据以验证研究结果 | 探究T2DM与UC之间的共享致病机制，并阐明葛根芩莲汤的作用机制 | 研究对象包括2型糖尿病和溃疡性结肠炎的相关靶点 | 生物信息学 | 2型糖尿病, 溃疡性结肠炎 | 生物信息学和机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |