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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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561 | 2024-09-07 |
Effects of Leydig cell elimination on testicular interstitial cell populations: characterization by scRNA-seq and immunocytochemical techniques
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1423801
PMID:39229372
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研究论文 | 研究了睾丸间质细胞群在莱迪细胞消除后的变化,并通过单细胞RNA测序和免疫细胞化学技术进行了表征 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫细胞化学技术详细表征了成年大鼠睾丸间质细胞的类型及其动态变化,并分析了莱迪细胞消除对间质稳态的影响 | 研究仅限于成年大鼠,结果可能不适用于其他物种 | 表征睾丸间质细胞的类型及其动态变化,并分析莱迪细胞消除对间质稳态的影响 | 成年大鼠的睾丸间质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序和免疫细胞化学技术 | NA | 转录组数据 | 成年大鼠 |
562 | 2024-09-06 |
IRF9 and STAT1 as biomarkers involved in T-cell immunity in atherosclerosis
2024, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:39234946
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研究论文 | 研究旨在识别与程序性细胞死亡(PCD)相关的生物标志物,并探索动脉粥样硬化的关键调控机制 | 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)和单细胞RNA测序数据,识别了与动脉粥样硬化相关的免疫细胞类型和关键基因 | 研究主要基于基因表达数据和单细胞RNA测序数据,缺乏实验验证 | 识别与动脉粥样硬化相关的生物标志物和调控机制 | 动脉粥样硬化和对照组的基因表达数据,以及单细胞RNA测序数据 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | GSE20129和GSE23746的基因表达数据,GSE159677的单细胞RNA测序数据 |
563 | 2024-09-05 |
ROCK1 is a multifunctional factor maintaining the primordial follicle reserve and follicular development in mice
2024-01-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00019.2023
PMID:37661919
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研究论文 | 研究揭示了ROCK1在维持小鼠原始卵泡储备和卵泡发育中的重要作用 | 发现ROCK1通过HIPPO信号通路调节原始卵泡储备和卵泡发育,为维持女性生殖生理提供了新的见解 | NA | 探讨ROCK1在原始卵泡发育和维持中的作用 | 小鼠的原始卵泡和卵泡发育 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
564 | 2024-09-05 |
Advances in cellular and tissue-based imaging techniques for sarcoid granulomas
2024-01-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00507.2023
PMID:37955119
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综述 | 本文综述了用于观察和表征结节病肉芽肿的细胞和组织成像技术的进展 | 介绍了最新的空间转录组学和基质辅助激光解吸电离质谱成像(MALDI-MSI)等前沿技术 | NA | 旨在揭示结节病研究的发展方向 | 结节病肉芽肿的成像和表征 | 数字病理学 | 结节病 | 空间转录组学,基质辅助激光解吸电离质谱成像(MALDI-MSI) | NA | 图像 | NA |
565 | 2024-09-05 |
Comprehensive Analysis of Ligand-receptor Interactions in Colon Adenocarcinoma to Identify of Tumor Microenvironment Oxidative Stress and Prognosis Model
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,分析了结肠腺癌中的配体-受体相互作用,并基于此开发了一个预后模型 | 首次基于配体-受体对开发了结肠腺癌的预后模型,并揭示了不同分子亚型的临床和分子特征 | NA | 探讨配体-受体相互作用在结肠腺癌中的功能,并开发基于此的预后模型 | 结肠腺癌中的配体-受体相互作用及其对预后的影响 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO | RNA测序数据 | 涉及结肠腺癌的单细胞RNA测序数据 |
566 | 2024-09-05 |
A novel missense variant in PNLDC1 associated with nonobstructive azoospermia
2024, Journal of genetics
IF:1.4Q4
PMID:39223739
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研究论文 | 本文通过家系外显子测序研究了一个近亲结婚家庭中的非阻塞性无精症(NOA),旨在确定导致特发性NOA的遗传变异,以辅助未来的临床遗传诊断和治疗策略 | 发现了一个与NOA相关的新型错义变异PNLDC1 Gly237Asp,该变异位于CAF1域的保守区域,可能导致局部结构不稳定和蛋白质磷酸化位点的改变 | NA | 确定导致特发性非阻塞性无精症的遗传变异 | 一个近亲结婚家庭中的非阻塞性无精症患者 | NA | 男性不育症 | 外显子测序,Sanger测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因序列数据 | 一个家庭中的三名NOA患者 |
567 | 2024-09-05 |
Elucidating the role of tumor-associated ALOX5+ mast cells with transformative function in cervical cancer progression via single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1434450
PMID:39224598
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了肿瘤相关ALOX5+肥大细胞在宫颈癌进展中的作用及其机制。 | 首次鉴定了宫颈癌中具有转化功能的肿瘤相关肥大细胞亚群C2 ALOX5+ MCs,并揭示了其在肿瘤分化关键阶段的作用。 | 研究仅基于十份宫颈癌肿瘤样本的数据,可能需要更多样本以验证结果的普遍性。 | 探索肥大细胞与宫颈癌肿瘤微环境相互作用的机制,为宫颈癌的预防、诊断和治疗提供科学依据。 | 宫颈癌细胞及其微环境中的肥大细胞亚群。 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 93,524个高质量细胞 |
568 | 2024-09-04 |
Reclassify High-Grade Serous Ovarian Cancer Patients Into Different Molecular Subtypes With Discrepancy Prognoses and Therapeutic Responses Based on Cancer-Associated Fibroblast-Enriched Prognostic Genes
2024, Biomedical engineering and computational biology
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11795972241274024
PMID:39221174
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研究论文 | 本研究基于癌症相关成纤维细胞富集的预后基因,将高级别浆液性卵巢癌患者重新分类为具有不同预后和治疗反应的分子亚型 | 首次基于癌症相关成纤维细胞富集的预后基因对高级别浆液性卵巢癌患者进行重新分类,并发现这些亚型对传统化疗和免疫治疗的反应存在差异 | 研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的数据,可能存在样本选择偏倚 | 旨在通过癌症相关成纤维细胞富集的预后基因,筛选出预后不良和治疗反应不佳的高级别浆液性卵巢癌患者 | 高级别浆液性卵巢癌患者及其治疗反应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 肿瘤组织样本来自TCGA和GEO数据库 |
569 | 2024-09-03 |
[Recent advances in capillary electrophoresis-mass spectrometry analysis of trace biomolecules]
2024, Nihon yakurigaku zasshi. Folia pharmacologica Japonica
DOI:10.1254/fpj.24036
PMID:39218679
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综述 | 本文综述了毛细管电泳-质谱(CE-MS)在痕量生物分子分析中的最新进展,特别是单细胞分析方面 | 结合高灵敏度的纳米电喷雾电离质谱(MS)和在线样品预浓缩方法,能够检测到纳摩尔至亚纳摩尔级别的生物分子 | NA | 探讨和总结CE-MS在痕量生物分子分析中的应用,特别是单细胞分析 | 痕量生物分子,特别是单细胞中的代谢物、蛋白质、脂质等 | 分析化学 | NA | 毛细管电泳(CE)、纳米电喷雾电离质谱(MS) | NA | 生物分子 | 单细胞级别 |
570 | 2024-08-31 |
Reversal of tamoxifen resistance by artemisinin in ER+ breast cancer: bioinformatics analysis and experimental validation
2024, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2024.047257
PMID:38827320
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探讨了青蒿素逆转雌激素受体阳性乳腺癌中他莫昔芬耐药性的机制 | 本研究首次通过生物信息学分析和实验验证,揭示了青蒿素逆转他莫昔芬耐药性的潜在机制 | 研究中未详细说明所使用的五个特征基因和七个药物-疾病交叉基因的具体信息 | 探索青蒿素逆转他莫昔芬在雌激素受体阳性乳腺癌中的耐药性 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞及他莫昔芬耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | WGCNA交叉分析, scRNA-seq分析, 分子目标对接 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确 |
571 | 2024-08-31 |
Single-cell RNA sequencing of nc886, a non-coding RNA transcribed by RNA polymerase III, with a primer spike-in strategy
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0301562
PMID:39190696
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研究论文 | 本研究开发了一种针对nc886的单细胞RNA测序方法,通过引入特定的oligo-tagged nc886引物,实现了对RNA聚合酶III转录的非编码RNA的测序 | 首次采用引物混合策略,成功捕获并测序了RNA聚合酶III转录的非编码RNA nc886,为单细胞水平上非编码RNA的研究提供了新方法 | 引物混合策略在目标特异性方面存在局限,需要通过后续的序列验证来确保基因表达计数的准确性 | 开发一种新的单细胞RNA测序方法,用于研究RNA聚合酶III转录的非编码RNA | nc886作为RNA聚合酶III转录的非编码RNA的代表 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三种细胞系,分别表达高、低和零水平的nc886 |
572 | 2024-08-31 |
The significance of CD16+ monocytes in the occurrence and development of chronic thromboembolic pulmonary hypertension: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1446710
PMID:39192976
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨CD16+单核细胞在慢性血栓栓塞性肺动脉高压(CTEPH)发生发展中的作用及其分子特征 | 首次系统研究了CTEPH患者中单核细胞亚群的分布、基因表达谱及分化轨迹,揭示了CD16+单核细胞在肺动脉血栓形成和内膜重塑中的重要作用 | NA | 揭示CTEPH患者中单核细胞的特征和功能,为CTEPH的诊断和治疗提供新见解 | CTEPH患者的外周血单个核细胞(PBMCs)及肺动脉内膜切除术(PEA)后的组织 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 健康对照、CTEPH患者及CTEPH患者肺动脉内膜切除术后的组织样本 |
573 | 2024-08-31 |
Identification and validation of Rab GTPases RAB13 as biomarkers for peritoneal metastasis and immune cell infiltration in colorectal cancer patients
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1403008
PMID:39192986
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研究论文 | 本研究旨在识别和验证Rab GTPases RAB13作为结直肠癌患者腹膜转移和免疫细胞浸润的生物标志物 | 首次探讨了RAB13在结直肠癌腹膜转移中的作用及其与免疫细胞浸润的关系 | NA | 确定与结直肠癌腹膜转移相关的生物标志物及其与免疫细胞浸润的关系 | 结直肠癌患者的腹膜转移和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 使用了公共数据库中的结直肠癌组织样本 |
574 | 2024-08-30 |
Single-cell transcriptome reveals the heterogeneity of malignant ductal cells and the prognostic value of REG4 and SPINK1 in primary pancreatic ductal adenocarcinoma
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17350
PMID:38827297
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了胰腺导管腺癌的异质性,并鉴定了REG4和SPINK1作为潜在的预后标志物。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了胰腺导管腺癌中恶性导管细胞的异质性,并发现了REG4和SPINK1在胰腺导管腺癌中的重要作用。 | 研究主要基于体外实验,需要进一步的临床试验验证REG4和SPINK1作为治疗靶点的有效性。 | 旨在全面描绘胰腺导管腺癌的异质性并识别预后靶点。 | 胰腺导管腺癌的恶性导管细胞及其预后标志物。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了16个原发性胰腺导管腺癌和3个邻近病变中的32,480个细胞。 |
575 | 2024-08-30 |
DNA methylation and gene expression profiling reveal potential association of retinol metabolism related genes with hepatocellular carcinoma development
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17916
PMID:39193514
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研究论文 | 本研究通过全基因组亚硫酸氢盐测序和RNA测序技术,分析了肝细胞癌组织与正常邻近组织的DNA甲基化和基因表达谱,揭示了视黄醇代谢相关基因在肝细胞癌发展中的潜在关联 | 本研究首次综合分析了DNA甲基化和RNA测序数据,识别出987个甲基化驱动的候选基因,并发现视黄醇代谢途径中的四个基因在肝细胞癌中的表达水平可以对患者进行分层 | 本研究主要依赖于多组学数据分析,未涉及体外或体内实验验证 | 旨在全面研究肝细胞癌中由甲基化驱动的基因表达改变 | 肝细胞癌组织与正常邻近组织的DNA甲基化和基因表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS),RNA测序(RNA-seq),单细胞RNA测序(scRNA seq) | NA | DNA甲基化数据,RNA表达数据 | 肝细胞癌组织与正常邻近组织样本,具体数量未在摘要中明确 |
576 | 2024-08-29 |
Single-Cell Atlas of Human Ovaries Reveals The Role Of The Pyroptotic Macrophage in Ovarian Aging
2024-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305175
PMID:38036420
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了不同生育年龄的人类卵巢,揭示了随着年龄增长,卵巢中巨噬细胞的焦亡途径激活增加,从而影响卵巢的免疫微环境,加速生殖功能衰退。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类卵巢衰老过程中巨噬细胞焦亡途径的激活及其对免疫微环境的影响。 | 研究主要基于细胞和动物实验,未来需要更多临床数据验证这些发现。 | 探索人类卵巢衰老过程中细胞和分子层面的变化及其机制。 | 人类卵巢中的巨噬细胞及其焦亡途径。 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 不同生育年龄的人类卵巢样本 |
577 | 2024-08-29 |
Single-Cell Transcriptome Atlas and Regulatory Dynamics in Developing Cotton Anthers
2024-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304017
PMID:37974530
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研究论文 | 本研究建立了棉花花药的第一个单细胞转录组图谱和染色质可及性调查,揭示了花药中不同细胞类型的特异性表达和表观遗传景观,并探讨了高温应激对花药细胞的异质性响应。 | 首次在棉花花药中建立了单细胞转录组图谱和染色质可及性调查,重建了减数分裂细胞、绒毡层细胞和中层细胞的发育轨迹,并揭示了高温应激下花药细胞的异质性响应。 | NA | 研究花药发育过程中的空间表达图谱和调控动态,以及高温应激下的响应机制。 | 棉花花药中的不同细胞类型及其在高温应激下的响应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
578 | 2024-08-28 |
Single-cell RNA sequencing of aging neural progenitors reveals loss of excitatory neuron potential and a population with transcriptional immune response
2024, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2024.1400963
PMID:39184324
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了衰老神经前体细胞的转录变化,发现兴奋性神经元潜能的丧失及具有转录免疫反应的细胞群 | 首次在单细胞水平上比较了不同神经发生区域的前体细胞转录谱,并揭示了衰老相关炎症对这些细胞的影响 | NA | 探究衰老过程中神经前体细胞的转录变化及其与衰老相关炎症的关系 | 成年小鼠大脑中的神经干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
579 | 2024-08-28 |
Characteristics and impact of infiltration of B-cells from systemic sclerosis patients in a 3D healthy skin model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1373464
PMID:39185406
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研究论文 | 研究了系统性硬化症(SSc)患者B细胞与健康皮肤模型中成纤维细胞的相互作用及其影响 | 首次展示了激活的B细胞改变了健康和SSc成纤维细胞的转录组特征,向促炎(TNF和IL-17信号传导)和干扰素特征转变 | NA | 探讨B细胞与成纤维细胞在组织水平上的相互作用及其机制 | 系统性硬化症患者B细胞与三维重建的健康皮肤模型中的成纤维细胞、角质形成细胞和细胞外基质的共培养 | NA | 系统性硬化症 | 细胞成像策略、流式细胞术、批量和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
580 | 2024-08-25 |
Prediction Model for Therapeutic Responses in Ovarian Cancer Patients using Paclitaxel-resistant Immune-related lncRNAs
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究开发了一种基于紫杉醇耐药免疫相关长链非编码RNAs(lncRNAs)的卵巢癌患者治疗反应预测模型 | 首次构建了包含9个紫杉醇耐药免疫相关lncRNAs的预测模型,用于预测卵巢癌患者的免疫治疗和化疗反应及预后 | NA | 开发一种预测卵巢癌患者治疗反应的模型 | 卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归分析 | RNA序列数据 | 186个差异表达的紫杉醇耐药lncRNAs和225个免疫相关lncRNAs |