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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2024-12-08 |
Exploring the shared pathogenic mechanisms of tuberculosis and COVID-19: emphasizing the role of VNN1 in severe COVID-19
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1453466
PMID:39639868
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研究论文 | 研究探讨了结核病和COVID-19之间的共同发病机制,特别强调了VNN1在严重COVID-19中的作用 | 识别了GMNN、SCD和FUT7作为COVID-19的强诊断标记,并发现VNN1与严重COVID-19的进展密切相关 | NA | 探讨结核病和COVID-19的共同发病机制,并寻找新的诊断和治疗靶点 | COVID-19和结核病的共同发病基因和免疫细胞浸润 | 生物信息学 | 传染病 | 机器学习、单细胞测序、分子对接 | 随机森林分析 | 基因表达数据 | 从GEO数据库中获取的COVID-19和结核病数据 | NA | NA | NA | NA |
| 542 | 2024-12-08 |
Identification of key biomarkers related to fibrocartilage chondrocytes for osteoarthritis based on bulk, single-cell transcriptomic data
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1482361
PMID:39640258
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序和微阵列数据,探索了纤维软骨细胞在骨关节炎进展中的作用,并识别了与纤维软骨细胞相关的关键生物标志物 | 本研究首次通过多组学方法识别了六个与纤维软骨细胞相关的骨关节炎生物标志物,并构建了一个探索性的风险模型 | 本研究仅在有限的样本中验证了生物标志物的蛋白质表达水平,未来需要在更大规模的样本中进行验证 | 探索纤维软骨细胞在骨关节炎进展中的作用,并识别相关的关键生物标志物 | 纤维软骨细胞及其在骨关节炎中的生物标志物 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 骨关节炎和正常软骨样本 | NA | NA | NA | NA |
| 543 | 2024-12-07 |
Statistical inference with a manifold-constrained RNA velocity model uncovers cell cycle speed modulations
2024-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576093
PMID:38328127
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研究论文 | 本文开发了一种生成模型和贝叶斯推断方法,用于解决现有RNA速度算法的不稳定性和缺乏统计控制的问题,并在细胞周期研究中验证了其有效性 | 提出了一个生成模型和贝叶斯推断方法,将速度场和流形估计结合在一个统一的框架中,以一致地识别自主动力系统的参数 | NA | 开发一种新的RNA速度推断方法,以解决现有算法的不稳定性和缺乏统计控制的问题 | 细胞周期中的基因调控动力学 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA速度 | 生成模型 | 基因表达数据 | 多个样本和全基因组Perturb-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 544 | 2024-12-06 |
Machine learning-informed liquid-liquid phase separation for personalized breast cancer treatment assessment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1485123
PMID:39628476
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的液-液相分离(MDLS)模型,用于提高乳腺癌患者的预后准确性和个性化治疗策略 | 本文创新性地结合了多组学数据和机器学习算法,构建了一个具有高预测能力的MDLS模型,用于乳腺癌的个性化治疗评估 | NA | 开发一种新的机器学习模型,以提高乳腺癌患者的预后准确性和个性化治疗策略 | 乳腺癌患者及其分子机制 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法 | MDLS模型 | 多组学和单细胞数据 | 9723名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 545 | 2024-12-06 |
Co-inhibition of PGF and VEGFA enhances the effectiveness of immunotherapy in bladder cancer
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.100957
PMID:39628692
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研究论文 | 研究探讨了在膀胱癌中联合抑制PGF和VEGFA对免疫治疗效果的增强作用 | 首次发现联合抑制PGF和VEGFA能够显著增强PD-1抑制剂在膀胱癌中的治疗效果 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未在人体中验证 | 探索在膀胱癌中抑制血管生成和免疫检查点阻断联合治疗的有效策略 | 膀胱癌细胞和血管生成相关分子 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用了膀胱癌细胞系MBT2和人类脐静脉内皮细胞(HUVECs) | NA | NA | NA | NA |
| 546 | 2024-12-05 |
FSCN1 is a Potential Therapeutic Target for Atherosclerosis Revealed by Single-Cell and Bulk RNA Sequencing
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S480528
PMID:39618922
|
研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序数据,研究了动脉粥样硬化中的细胞表型、细胞间通讯和潜在治疗靶点 | 发现FSCN1在动脉粥样硬化中的高表达,并验证了其在细胞凋亡和迁移中的作用,提示其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨动脉粥样硬化中的细胞表型、细胞间通讯和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化中的细胞类型、FSCN1的表达及其在疾病发展中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、ELISA | NA | RNA测序数据 | 包括Apoeko小鼠和颈动脉内膜切除术患者的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 547 | 2024-12-05 |
Corrigendum: Unraveling the ecological landscape of mast cells in esophageal cancer through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522632
PMID:39620211
|
correction | 对先前发表的文章进行更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 548 | 2024-12-05 |
Cellular and molecular characterization of peripheral glia in the lung and other organs
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0310303
PMID:39621665
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研究论文 | 系统分析了肺部及其他器官中外周胶质细胞的细胞和分子特征 | 利用单细胞RNA测序技术,首次全面描述了小鼠肺部Sox10+胶质细胞系的解剖、细胞和分子特征,并扩展到灵长类和其他器官 | 研究主要集中在小鼠、鼠狐猴和人类,其他物种的数据有限 | 揭示外周胶质细胞在肺部及其他器官中的分子差异和定位 | 小鼠、鼠狐猴和人类的外周胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约700个外周胶质细胞样本,来自小鼠、鼠狐猴和人类 | NA | NA | NA | NA |
| 549 | 2024-12-02 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Crucial Genes Influencing the Polarization of Tumor-Associated Macrophages in Liver Cancer
2024, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/2024/7263358
PMID:38938448
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,识别了影响肝癌中肿瘤相关巨噬细胞极化的关键基因 | 首次通过单细胞转录组学技术,揭示了PRDM1基因在肝癌肿瘤微环境中调控M2巨噬细胞极化的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的数据,缺乏体内实验验证 | 探讨肝癌中肿瘤相关巨噬细胞的功能转变及其关键调控基因 | 肝癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其极化过程 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 74,742个细胞和23,110个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 550 | 2024-12-01 |
Integrative analysis of single-cell transcriptomic and multilayer signaling networks in glioma reveal tumor progression stage
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1446903
PMID:39606019
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研究论文 | 本文介绍了一种综合框架,利用单细胞RNA测序数据和多层信号网络模型研究胶质瘤进展阶段的分子变化 | 本文创新性地结合单细胞RNA测序数据和多层网络模型,揭示了胶质瘤进展阶段的关键分子关系和信号通路 | NA | 研究胶质瘤进展阶段的分子变化及其对治疗和预后的影响 | 胶质瘤的单细胞RNA测序数据和多层信号网络 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 多层网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 551 | 2024-12-01 |
Identification of altered immune cell types and molecular mechanisms in Alzheimer's disease progression by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2024.1477327
PMID:39610716
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别阿尔茨海默病进展中改变的免疫细胞类型和分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别阿尔茨海默病中特定的免疫细胞类型和差异表达基因,并发现UFC1可能作为潜在的生物标志物 | 研究主要基于已有的数据集,缺乏对新样本的验证 | 揭示阿尔茨海默病进展中的分子机制,寻找潜在的治疗靶点和生物标志物 | 阿尔茨海默病中的免疫细胞类型和差异表达基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE181279、GSE63060和GSE63061数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 552 | 2024-11-29 |
Transcriptional profiling of zebrafish intestines identifies macrophages as host cells for human norovirus infection
2024 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2024.2431167
PMID:39584740
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术,研究斑马鱼肠道中的转录组,发现巨噬细胞是人诺如病毒的宿主细胞 | 首次在斑马鱼模型中验证了巨噬细胞是人诺如病毒的宿主细胞,并揭示了病毒在巨噬细胞中的复制机制 | 研究仅限于斑马鱼模型,尚未在人类中验证 | 探究人诺如病毒的宿主细胞及其在宿主细胞中的复制机制 | 斑马鱼肠道中的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼幼体肠道样本 | NA | NA | NA | NA |
| 553 | 2024-11-29 |
Tumor microenvironment and cancer metastasis: molecular mechanisms and therapeutic implications
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1442888
PMID:39600368
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综述 | 本文综述了肿瘤微环境在癌症发展和转移中的重要作用,重点探讨了分子机制和治疗意义 | 本文通过多学科视角,强调了理解肿瘤微环境的分子基础对于开发更有效的癌症治疗方案的重要性,并指出了未来研究的方向 | NA | 探讨肿瘤微环境在癌症转移中的分子机制及其治疗意义 | 肿瘤微环境中的关键成分,如癌症相关成纤维细胞、免疫细胞、内皮细胞、细胞因子及细胞外基质 | NA | 癌症 | 单细胞分析、空间转录组学、表观遗传学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 554 | 2024-11-29 |
Identification and Validation of Senescence-Related Signature by Combining Single Cell and Bulk Transcriptome Data Analysis to Predict the Prognosis and Identify the Key Gene CAV1 in Pancreatic Cancer
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S489985
PMID:39600676
|
研究论文 | 本研究结合单细胞和批量转录组数据分析,识别和验证了与衰老相关的特征,用于预测胰腺癌的预后并鉴定关键基因CAV1 | 开发了一种新的衰老相关预后工具,用于胰腺癌患者分层,并识别了CAV1作为潜在的治疗靶点 | NA | 研究细胞衰老在胰腺癌肿瘤微环境中的作用,特别是其对预后和免疫治疗结果的影响 | 胰腺癌患者的单细胞和批量转录组数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序、RNA-seq | COX比例风险模型、LASSO回归 | 基因表达数据 | 三个患者队列:TCGA队列、PAAD-AU队列和PAAD-CA队列 | NA | NA | NA | NA |
| 555 | 2024-11-29 |
Causal links of human serum metabolites on the risk of prostate cancer: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing, and metabolic pathway analysis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1443330
PMID:39600951
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研究论文 | 本文通过孟德尔随机化研究探讨了人类血清代谢物与前列腺癌风险之间的因果关系 | 首次通过孟德尔随机化方法结合单细胞RNA测序和代谢途径分析,揭示了三种血清代谢物与前列腺癌风险的因果关系 | 研究结果需要进一步的机制研究来阐明这些血清代谢物和代谢途径如何影响前列腺癌的发生和发展 | 探讨血清代谢物与前列腺癌风险之间的因果关系 | 血清代谢物与前列腺癌风险 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、代谢途径分析 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | 7824名欧洲人 | NA | NA | NA | NA |
| 556 | 2024-11-27 |
scRNA-Seq Analysis Revealed CAFs Regulating HCC Cells via PTN Signaling
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S493675
PMID:39582814
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了癌症相关成纤维细胞(CAFs)通过PTN信号通路调控肝细胞癌(HCC)细胞 | 首次揭示了CAFs通过PTN/SDC2信号通路促进HCC进展的机制 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据和有限的临床样本,未来需更多实验验证 | 探讨CAFs在肝细胞癌微环境中的作用机制 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肝细胞癌细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集(GSE158723和GSE112271)以及来自HCC患者的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 557 | 2024-11-27 |
MUC1 and CREB3 are Hub Ferroptosis Suppressors for Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus Degeneration by Integrated Bioinformatics and Experimental Verification
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S489052
PMID:39583856
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验验证,探讨了MUC1和CREB3作为核心铁死亡抑制因子在椎间盘退变中的作用 | 首次揭示了MUC1和CREB3作为椎间盘退变中的铁死亡抑制因子,并构建了药物和竞争性内源RNA网络 | 实验验证和单细胞RNA测序分析的样本量有限,可能影响结果的普适性 | 探索铁死亡相关基因及其在椎间盘退变中的作用 | 椎间盘的髓核和纤维环 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 基因表达分析、GO和KEGG分析、LASSO和SVM-RFE算法、GSEA和GSVA分析、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 髓核和纤维环的基因表达数据来自Gene Expression Omnibus数据库,实验验证和单细胞RNA测序分析的具体样本量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 558 | 2024-11-27 |
Prognostic features of bladder cancer based on five neddylation-related genes
2024, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
DOI:10.62347/RWCH7802
PMID:39584004
|
研究论文 | 研究基于五个neddylation相关基因的膀胱癌预后特征 | 首次探讨neddylation在膀胱癌发病和进展中的潜在影响 | NA | 探索neddylation在膀胱癌中的作用及其对发病和进展的影响 | 膀胱癌的预后特征 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 基因表达数据分析 | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 11,361个差异表达基因和1,500个枢纽基因 | NA | NA | NA | NA |
| 559 | 2024-11-27 |
A Mendelian randomisation approach to explore genetic factors associated with erectile dysfunction based on pooled genomic data
2024, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
DOI:10.62347/GENV7771
PMID:39584007
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化方法探索与勃起功能障碍相关的遗传因素 | 首次利用孟德尔随机化分析结合全血表达数量性状位点和GWAS数据,筛选出与勃起功能障碍高度相关的基因MDM4 | 研究样本主要来自芬兰数据库,可能存在地域和人群偏倚 | 探索勃起功能障碍的遗传因素,为个性化治疗提供依据 | 勃起功能障碍相关的遗传基因 | 遗传学 | 男性健康 | 孟德尔随机化分析 | NA | 基因组数据 | 共95178个个体,包括1154个病例和94024个对照 | NA | NA | NA | NA |
| 560 | 2024-11-27 |
Prognostic characteristics and drug sensitivity analysis of hepatocellular carcinoma based on histone modification-related genes: a multi-omics integrated study revealing potential therapeutic targets and individualized treatment strategies
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1489469
PMID:39584133
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研究论文 | 本研究整合多组学数据,分析了肝细胞癌中与组蛋白修饰相关的基因,并开发了一种基于组蛋白修饰的预后特征,揭示了潜在的治疗靶点和个性化治疗策略 | 首次通过多组学整合分析,定义了110个与组蛋白相关的基因,并开发了一种新的预后特征,为肝细胞癌的个性化治疗提供了新的见解 | 研究主要基于现有数据集,未来需要进一步的临床验证 | 探讨组蛋白修饰在肝细胞癌中的作用,并开发新的预后特征和治疗策略 | 肝细胞癌患者及其组蛋白修饰相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 机器学习 | 基因组数据、临床信息 | 多个队列的数据,包括单细胞RNA测序和批量RNA测序 | NA | NA | NA | NA |