单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1387 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2024-09-13 |
Polycystic ovarian syndrome (PCOS) and recurrent spontaneous abortion (RSA) are associated with the PI3K-AKT pathway activation
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17950
PMID:39253602
|
研究论文 | 研究探讨了多囊卵巢综合征（PCOS）和复发性自然流产（RSA）的共同病理机制，并揭示了PI3K-AKT信号通路在其中的作用 | 首次揭示了PCOS和RSA之间共同的病理机制，并探讨了PI3K-AKT信号通路在两种疾病中的作用 | NA | 阐明导致多囊卵巢综合征（PCOS）和复发性自然流产（RSA）的机制 | 多囊卵巢综合征（PCOS）和复发性自然流产（RSA）的病理机制 | NA | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（RNA-seq）、实时定量PCR（RT-qPCR）、细胞计数试剂盒-8（CCK-8）、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据库的PCOS和RSA患者的单细胞RNA-seq数据集 |
| 542 | 2024-09-13 |
Chemokine receptors in primary and secondary lymphoid tissues
2024, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2023.11.003
PMID:39260934
|
综述 | 本文综述了趋化因子受体在初级和次级淋巴组织中的存在和功能 | 介绍了新技术如高维光谱流式细胞术和单细胞测序在趋化因子受体网络及其配体研究中的应用 | NA | 探讨趋化因子受体在免疫细胞中的作用及其在初级和次级淋巴器官中的分布 | 趋化因子受体及其在骨髓、胸腺、脾脏、淋巴结和派尔集合淋巴结等淋巴组织中的功能 | NA | NA | 高维光谱流式细胞术、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 543 | 2024-09-11 |
Increased Expression of Mevalonate Pathway-Related Enzymes in Angiotensin II-Induced Abdominal Aortic Aneurysms
2024, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-623
PMID:39085115
|
研究论文 | 研究探讨了血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中甲羟戊酸途径相关酶的表达变化 | 首次揭示了甲羟戊酸途径在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中的重要作用 | 仅限于动物模型研究，未涉及临床数据 | 探讨甲羟戊酸途径在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中的作用 | 腹主动脉瘤的形成和动脉重塑 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | Western blot和单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质和RNA | 包括Ang II 28D、Ang II 5D和Sham组 |
| 544 | 2024-09-11 |
Transcriptomic analysis of the spatiotemporal axis of oogenesis and fertilization in C. elegans
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1436975
PMID:39224437
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统进行了转录组分析，揭示了卵母细胞形成过程中的基因表达和剪接事件 | 本文首次对秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统进行了详细的转录组分析，揭示了卵母细胞形成过程中的基因表达和剪接事件，并提供了新的机制见解 | 本文仅限于对秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统进行分析，未涉及其他物种或性别 | 研究秀丽隐杆线虫卵母细胞形成过程中的基因表达和剪接事件 | 秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7个不同阶段的生殖系统组织和受精卵 |
| 545 | 2024-09-11 |
Integrating single-cell transcriptomics to reveal the ferroptosis regulators in the tumor microenvironment that contribute to bladder urothelial carcinoma progression and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427124
PMID:39238647
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据，通过非负矩阵分解（NMF）聚类分析，揭示了膀胱尿路上皮癌肿瘤微环境中铁死亡调控因子及其对癌症进展和免疫治疗的影响 | 首次通过单细胞转录组数据识别出膀胱癌肿瘤微环境中与铁死亡相关的新型细胞亚型，并发现ACSL4+CAFs和SDC1作为重要的膀胱癌生物标志物 | 本研究主要基于单细胞转录组数据进行分析，缺乏体内实验验证 | 探讨铁死亡在膀胱癌肿瘤微环境中的调控机制及其对癌症进展和免疫治疗的影响 | 膀胱尿路上皮癌肿瘤微环境中的细胞亚型及其与铁死亡的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF） | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 546 | 2024-09-11 |
The landscape of miRNA-mRNA regulatory network and cellular sources in inflammatory bowel diseases: insights from text mining and single cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1454532
PMID:39238649
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研究论文 | 本研究通过文本挖掘和单细胞RNA测序分析，构建了炎症性肠病中的miRNA-mRNA调控网络，并确定了关键miRNA的细胞来源及其在疾病发病机制中的作用 | 本研究通过整合多个数据库的预测和实验验证结果，构建了全面的miRNA-mRNA调控网络，并结合大规模单细胞RNA测序数据，确定了miRNA的细胞来源及其与临床状态和功能变化的关联 | 研究主要依赖于已发表的文献和现有数据库，可能存在样本多样性、平台变异性和批次效应等限制 | 构建全面的miRNA-mRNA调控网络，确定关键miRNA在炎症性肠病发病机制中的细胞来源和功能 | 炎症性肠病（包括溃疡性结肠炎和克罗恩病）中的miRNA-mRNA调控网络及其细胞来源 | 基因组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本数据和基因表达数据 | 两个大规模单细胞RNA测序数据集 |
| 547 | 2024-09-11 |
Obtention of viable cell suspensions from breast cancer tumor biopsies for 3D chromatin conformation and single-cell transcriptome analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1420308
PMID:39239354
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研究论文 | 本文介绍了一种从乳腺癌肿瘤活检中获取高存活率细胞悬液的优化方案，并利用这些细胞悬液进行了3D染色质构象和单细胞转录组分析 | 提出了一种成本效益高的优化方案，能够从乳腺癌肿瘤活检中简单高效地获取高存活率细胞悬液 | 样本处理仍然是主要挑战，包括样本采集前的治疗、组织获取量、运输以及无法处理新鲜样本等问题 | 开发一种优化方案，从乳腺癌肿瘤活检中获取高存活率细胞悬液，以进行个性化肿瘤分子特征分析 | 乳腺癌肿瘤活检样本 | NA | 乳腺癌 | Hi-C, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞悬液 | NA |
| 548 | 2024-09-11 |
Single cell RNA-sequencing delineates CD8+ tissue resident memory T cells maintaining rejection in liver transplantation
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.96928
PMID:39239518
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法分析了人（n=17）和鼠（n=16）肝移植样本，揭示了肝移植中CD8+组织驻留记忆T细胞在排斥反应中的作用 | 本研究首次全面揭示了肝移植中CD8+组织驻留记忆T细胞在排斥反应中的表达特征和功能作用 | 样本量相对较小，且仅限于人和鼠的肝移植样本 | 探讨肝移植中组织驻留记忆T细胞在排斥反应中的免疫机制 | 人（n=17）和鼠（n=16）的肝移植样本 | 免疫学 | 肝移植 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫学技术 | NA | RNA | 人（n=17）和鼠（n=16）的肝移植样本，共235,116个细胞 |
| 549 | 2024-09-11 |
MS4A1-PTGS2 axis induces taurine metabolic reprogramming to exacerbate abdominal aortic aneurysm progression
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.99659
PMID:39239552
|
研究论文 | 本研究揭示了牛磺酸代谢重编程在腹主动脉瘤（AAA）发展和进展中的关键作用 | 本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和加权基因共表达网络分析（WGCNA），首次将代谢变化与细胞外基质（ECM）和血管平滑肌细胞（SMCs）的功能联系起来，并引入了创新的代谢谱分析技术，识别出AAA中的差异代谢物，为非手术干预提供了潜在的生物标志物和治疗靶点 | NA | 研究腹主动脉瘤（AAA）的发展和进展机制 | 腹主动脉瘤（AAA）的细胞和分子机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | RNA，代谢物 | 使用小鼠模型（GSE152583数据集）和人类AAA组织样本进行分析 |
| 550 | 2024-09-11 |
HMGB2 drives tumor progression and shapes the immunosuppressive microenvironment in hepatocellular carcinoma: insights from multi-omics analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1415435
PMID:39247201
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了HMGB2在肝细胞癌中的作用及其对免疫抑制微环境的影响 | 首次揭示了HMGB2在肝细胞癌进展和免疫抑制微环境中的关键作用 | NA | 优化肝细胞癌管理策略并提高患者预后 | HMGB2在肝细胞癌中的表达及其对免疫抑制微环境的影响 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化 | NA | RNA | 多个肝细胞癌患者队列 |
| 551 | 2024-09-11 |
Identification and Validation of Cytotoxicity-Related Features to Predict Prognostic and Immunotherapy Response in Patients with Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2024, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2024/3468209
PMID:39247556
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因共表达网络分析，识别并验证了与细胞毒性相关的特征，以预测透明细胞肾细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次基于细胞毒性相关特征构建了透明细胞肾细胞癌的生存预测模型，并评估了其对免疫治疗反应的预测能力 | 本研究仅基于GSE224630数据集进行分析，未来需要更多数据集验证模型的普适性 | 开发一种基于细胞毒性相关特征的透明细胞肾细胞癌生存预测模型，并评估其对免疫治疗反应的预测能力 | 透明细胞肾细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 11个透明细胞肾细胞癌亚群 |
| 552 | 2024-09-11 |
Tuberculosis to lung cancer: application of tuberculosis signatures in identification of lung adenocarcinoma subtypes and marker screening
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.97898
PMID:39247607
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研究论文 | 研究探讨了肺结核与肺腺癌之间的关联，并利用肺结核特征识别肺腺癌亚型和筛选标记物 | 首次全面利用肺结核特征进行生物信息学分析，识别肺腺癌亚型，并预测预后和潜在标记物 | NA | 阐明肺结核在肺腺癌发展中的作用，并识别肺腺癌亚型和潜在标记物 | 肺结核和肺腺癌的差异表达基因，以及肺腺癌的分子亚型和预后模型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 共识聚类分析，RT-qPCR | NA | 转录组数据 | 六个队列的数据 |
| 553 | 2024-09-11 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals MMP mediated expression patterns by distinct tumor microenvironment immune profiles in cervical cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96429
PMID:39247608
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，分析了宫颈癌中MMP介导的表达模式与肿瘤微环境免疫特征的关系 | 首次综合分析了单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了MMP在宫颈癌中的表达模式与肿瘤微环境免疫特征的关联 | NA | 阐明宫颈癌中MMP表达的景观和评分，并探讨其与肿瘤微环境免疫特征的关系 | 宫颈癌中的MMP表达模式及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qRT-PCR | NA | RNA | NA |
| 554 | 2024-09-11 |
IL-6 signaling accelerates iron overload by upregulating DMT1 in endothelial cells to promote aortic dissection
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.99511
PMID:39247821
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研究论文 | 研究IL-6信号通路如何通过上调内皮细胞中的DMT1来加速铁过载，从而促进主动脉夹层 | 首次揭示了IL-6信号通路通过上调DMT1表达来加速铁过载，从而促进主动脉夹层的机制 | NA | 探讨IL-6信号通路在主动脉夹层形成中的作用机制 | 内皮细胞中的铁离子运输和主动脉夹层 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 555 | 2024-09-10 |
Inhibition of heme oxygenase 1 alleviates thoracic aortic aneurysm via restoration of extracellular matrix
2024-01-29, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2023.149405
PMID:38147696
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研究论文 | 研究探讨了血红素氧合酶1（HO-1）在胸主动脉瘤（TAA）中的作用及其通过抑制HO-1减轻TAA的机制 | 首次揭示了HO-1阳性巨噬细胞在TAA中的重要作用，并证明了通过抑制HO-1可以减轻TAA并恢复细胞外基质（ECM） | 研究主要基于小鼠模型和临床样本，缺乏更大规模的人类临床试验验证 | 探讨HO-1在胸主动脉瘤中的作用及其潜在的治疗机制 | 胸主动脉瘤（TAA）及其相关细胞和分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、Western blot、组织学检测 | NA | RNA序列、蛋白质表达数据 | 113,800个胸主动脉细胞样本，BAPN诱导的TAA小鼠模型及TAA患者样本 |
| 556 | 2024-09-08 |
Cardiac reprogramming reduces inflammatory macrophages and improves cardiac function in chronic myocardial infarction
2024-01-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2023.149272
PMID:37992523
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研究论文 | 本文研究了心脏重编程对慢性心肌梗死后炎症巨噬细胞和心脏功能的影响 | 首次展示了心脏重编程可以减少心肌梗死后的炎症巨噬细胞，并改善心脏功能 | 尚未明确心脏重编程通过MGTH过表达影响炎症细胞的具体机制 | 探讨心脏重编程在慢性心肌梗死后减少炎症和改善心脏功能的作用 | 慢性心肌梗死后的心脏纤维母细胞和炎症细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 557 | 2024-09-08 |
Research progress and application strategies of sugar transport mechanisms in rice
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1454615
PMID:39233915
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综述 | 本文综述了水稻中糖运输机制的遗传和分子基础及其调控 | 本文强调了质外体途径在水稻韧皮部装载中的主导作用，并总结了糖运输基因的调控途径 | 本文指出当前研究方法的不足，并讨论了先进的分析技术如质谱成像和单细胞RNA测序的潜在应用 | 本文旨在深入理解水稻中糖运输过程及其调控机制，为高产水稻育种提供指导 | 本文主要研究水稻中的糖运输机制及其相关蛋白质和基因 | NA | NA | 质谱成像和单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 558 | 2024-09-08 |
Comprehensive analysis of hypoxia-related genes in diagnosis and immune infiltration in acute myocardial infarction: based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1448705
PMID:39234566
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞RNA测序数据，全面分析了缺氧相关基因在急性心肌梗死诊断和免疫浸润中的作用 | 开发了一个基于缺氧相关基因的急性心肌梗死预测模型，并验证了其与免疫细胞浸润的强关联 | NA | 研究缺氧相关基因在急性心肌梗死中的作用及其与免疫细胞浸润的关系 | 急性心肌梗死患者及其缺氧相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | 随机森林模型 | RNA | 训练数据集GSE66360，验证数据集GSE48060，单细胞RNA数据集GSE163956 |
| 559 | 2024-09-07 |
Proteomic analysis of serum small extracellular vesicles identifies diagnostic biomarkers for neuroblastoma
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1367159
PMID:39228987
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研究论文 | 本文通过蛋白质组学分析血清中小细胞外囊泡，识别神经母细胞瘤的诊断生物标志物 | 首次通过蛋白质组学分析血清中小细胞外囊泡，识别出神经母细胞瘤的潜在诊断生物标志物 | 需要进一步的临床验证和大规模样本研究以确认这些生物标志物的诊断效用 | 识别神经母细胞瘤的诊断生物标志物 | 血清中的小细胞外囊泡 | 蛋白质组学 | 神经母细胞瘤 | 无标签蛋白质组学、多反应监测、Western blot分析 | NA | 蛋白质数据、RNA-seq数据 | 104个差异表达蛋白质，26个潜在生物标志物 |
| 560 | 2024-09-07 |
Single-cell RNA sequencing in endometrial cancer: exploring the epithelial cells and the microenvironment landscape
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1425212
PMID:39229264
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在子宫内膜癌中的应用，探讨了肿瘤细胞和微环境的复杂性 | 本文强调了单细胞RNA测序技术在揭示子宫内膜癌肿瘤细胞和微环境复杂性方面的贡献 | 本文指出了单细胞RNA测序研究中存在的技术偏差和样本量限制，并强调需要更大规模的研究来涵盖更广泛的子宫内膜癌组织学亚型 | 本文旨在通过综述单细胞RNA测序技术在子宫内膜癌中的应用，推动对该复杂疾病的理解 | 本文主要研究对象是子宫内膜癌的肿瘤细胞和微环境 | 数字病理学 | 妇科肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 本文未具体提及样本量 |