单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
541 2024-09-26
γδ T-cells in human malignancies: insights from single-cell studies and analytical considerations
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了单细胞研究在不同恶性肿瘤中对γδ T细胞的生物学特性和调控机制的见解 介绍了高分辨率单细胞测序技术在γδ T细胞研究中的应用 γδ T细胞的低丰度使得其生物学特性仍不明确 探讨γδ T细胞在人类恶性肿瘤中的作用及其生物学机制 γδ T细胞及其在不同恶性肿瘤中的效应子亚群和调控机制 NA NA 单细胞测序 NA 单细胞数据 NA
542 2024-09-26
Platinum-based chemotherapy promotes antigen presenting potential in monocytes of patients with high-grade serous ovarian carcinoma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究探讨了铂类化疗对高级别浆液性卵巢癌患者单核细胞抗原呈递潜力的影响 首次揭示了铂类化疗通过转录上调MHC II类分子在单核细胞中诱导抗原呈递,而非通过表观遗传变化 研究仅限于高级别浆液性卵巢癌患者,且样本量未明确 揭示肿瘤特异性转录和表观遗传变化,以及化疗如何重编程单核细胞 高级别浆液性卵巢癌患者的单核细胞 NA 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
543 2024-09-26
Causal effects of systemic inflammatory proteins on Guillain-Barre Syndrome: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing analysis, and network pharmacology
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过全基因组孟德尔随机化、单细胞RNA测序分析和网络药理学探讨了系统性炎症蛋白对吉兰-巴雷综合征的因果效应 首次通过孟德尔随机化分析确定了四种与吉兰-巴雷综合征因果相关的炎症蛋白,并结合单细胞RNA测序和分子对接技术预测了潜在的治疗靶点 研究样本仅限于欧洲血统的参与者,可能限制了结果的普适性 探讨系统性炎症蛋白与吉兰-巴雷综合征的因果关系,并寻找潜在的治疗靶点 系统性炎症蛋白与吉兰-巴雷综合征的因果关系 生物信息学 神经疾病 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、分子对接技术 NA 基因组数据、RNA测序数据 8293名欧洲血统的参与者
544 2024-09-25
Transcriptomic profiling of immune cells in murine polymicrobial sepsis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠多微生物脓毒症中免疫细胞的转录组图谱 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了脓毒症中免疫细胞的转录组特征,并识别了不同细胞类型的激活通路 NA 揭示脓毒症中免疫细胞的转录组特征,以增强对脓毒症病理生理学的理解 小鼠多微生物脓毒症中的免疫细胞 数字病理学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 小鼠样本,包括脾脏和腹腔灌洗液
545 2024-09-25
Single cell RNA-Sequencing Reveals Mast Cells Enhance Mononuclear Phagocytes Infiltration in Bladder Cancer Microenvironment
2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 研究膀胱癌微环境中肥大细胞与单核吞噬细胞的相互作用,以揭示潜在的免疫治疗靶点 首次通过单细胞RNA测序揭示了肥大细胞在膀胱癌微环境中增强单核吞噬细胞浸润的作用 样本量较小,仅涉及12名膀胱癌患者 揭示膀胱癌微环境中肥大细胞与单核吞噬细胞的相互作用 肥大细胞和单核吞噬细胞 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 12名膀胱癌患者
546 2024-09-25
Pan-cancer analysis of the role of α2C-adrenergic receptor (ADRA2C) in human tumors and validation in glioblastoma multiforme models
2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本文通过RNA测序数据和生物信息学方法,全面分析了α2C-肾上腺素受体(ADRA2C)在多种癌症中的作用,并在胶质母细胞瘤模型中进行了验证 首次进行了全面的泛癌分析,揭示了ADRA2C在不同癌症中的表达水平及其与临床阶段、预后和免疫浸润细胞的关系 研究主要基于TCGA数据库的数据,缺乏体内实验的长期随访数据 探讨ADRA2C在泛癌中的作用及其作为癌症诊断、预后和治疗靶点的潜力 α2C-肾上腺素受体(ADRA2C)在多种癌症中的表达及其生物学功能 数字病理学 脑癌 RNA测序(RNA-seq) NA 基因表达数据 涉及33种癌症类型,包括乳腺癌、食管腺癌、肾癌和肺癌等
547 2024-09-24
A Novel Tumor-Associated Neutrophil-Related Risk Signature Based on Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Analyses Predicts the Prognosis and Immune Landscape of Breast Cancer
2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究开发了一种基于单细胞和批量RNA测序分析的新型肿瘤相关中性粒细胞相关风险特征,用于预测乳腺癌的预后和免疫景观 首次基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据开发了肿瘤相关中性粒细胞相关风险特征,并验证了其在多个队列中的预后预测能力 NA 开发一种新型肿瘤相关中性粒细胞相关风险特征,用于预测乳腺癌的预后和免疫景观 乳腺癌患者的预后和免疫景观 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序和批量RNA测序 Cox回归和LASSO回归 RNA 多个队列的乳腺癌患者样本
548 2024-09-25
Comprehensive analysis of macrophage-associated inflammatory genes in AMI based on bulk combined with single-cell sequencing data
2024, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过结合bulk和单细胞测序数据,全面分析了AMI中与巨噬细胞相关的炎症基因 本研究首次结合bulk和单细胞测序数据,系统分析了AMI中巨噬细胞相关的炎症基因,并筛选出关键基因Saa3、Ms4a4c、Acp5和Fcgr4 本研究主要基于现有数据库和动物实验,尚未在人体样本中验证这些基因的表达和功能 探讨AMI后巨噬细胞在炎症反应中的作用,并筛选潜在的生物标志物 AMI后巨噬细胞相关的炎症基因 生物信息学 心血管疾病 单细胞测序、bulk RNA-seq、qRT-PCR NA 基因表达数据 包括GSE163465、GSE236374、GSE183272和GSE114695数据集,以及AMI小鼠心肌组织
549 2024-09-25
Revelation of comprehensive cell profiling of primary and metastatic tumour ecosystems in oral squamous cell carcinoma by single-cell transcriptomic analysis
2024, International journal of medical sciences IF:3.2Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示口腔鳞状细胞癌原发和转移肿瘤生态系统的综合细胞图谱 发现了两种新型细胞类型(CD1C-CD141-树突状细胞和CD1C+_B树突状细胞),并确定了IL1RN和C15orf48作为新的标记物 NA 理解口腔鳞状细胞癌在单细胞水平上的细胞起源和基因表达特征 口腔鳞状细胞癌的原发和转移肿瘤组织中的细胞 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 包括来自口腔鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、转移淋巴结、放射治疗后的第二原发肿瘤等多种组织样本
550 2024-09-25
Comprehensive analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data reveals Schlafen-5 (SLFN5) as a novel prognosis and immunity
2024, International journal of medical sciences IF:3.2Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析,探讨了Schlafen家族基因在结直肠腺癌(COAD)中的诊断和预后潜力 首次揭示了SLFN5在COAD中的显著上调及其与不良预后和免疫反应的关系 NA 探索Schlafen家族基因在结直肠腺癌中的诊断和预后潜力 Schlafen家族基因在结直肠腺癌中的表达及其与预后和免疫反应的关系 数字病理学 结直肠癌 RNA测序 NA 基因表达数据 结直肠癌患者和正常组织的样本
551 2024-09-25
Investigation and Confirmation of PYCARD as a Potential Biomarker for the Management of Psoriasis Disease
2024, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本文探讨了坏死性凋亡相关基因在银屑病中的分子机制,并筛选出PYCARD作为潜在的银屑病生物标志物 首次将PYCARD确定为银屑病的潜在生物标志物,并通过多种实验验证了其在银屑病发展中的重要作用 NA 探索银屑病中坏死性凋亡相关基因的分子机制,并筛选潜在的生物标志物 银屑病患者和银屑病样皮炎小鼠模型 生物信息学 银屑病 实时荧光定量PCR、Western blot、免疫组化、单细胞测序 NA 基因表达数据 涉及GSE13355和GSE14905数据集中的银屑病差异表达基因,以及临床样本和动物实验
552 2024-09-23
A brief history of somatostatin interneuron taxonomy or: how many somatostatin subtypes are there, really?
2024, Frontiers in neural circuits IF:3.4Q2
研究论文 本文回顾了催产素中间神经元分类学的历史,并讨论了单细胞RNA测序技术在皮质神经元分类中的应用 提出了将催产素中间神经元细分为约十个“超类型”的分类方法,认为这种分类更符合传统形态学、电生理学和神经化学特征 指出基于基因表达微小差异的更细分类(如“t-类型”或“集群”)可能对研究人员不太有用,甚至可能违背分类的初衷 探讨催产素中间神经元的分类及其在实验神经科学中的应用 催产素中间神经元的分类及其在皮质网络中的作用 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 大量皮质神经元样本
553 2024-09-23
Mitophagy Promotes Hair Regeneration by Activating Glutathione Metabolism
2024, Research (Washington, D.C.)
研究论文 本文研究了线粒体自噬通过调节谷胱甘肽代谢促进毛发生长的机制 首次揭示了线粒体自噬在毛发生长早期通过激活谷胱甘肽代谢促进毛囊干细胞增殖的作用 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类中验证 探讨线粒体自噬在毛发生长中的作用及其分子机制 毛囊干细胞和线粒体自噬相关基因 NA NA 单细胞RNA测序、透射电子显微镜、免疫荧光染色、分子对接 NA RNA 小鼠毛囊干细胞样本
554 2024-09-23
CD36 restricts lipid-associated macrophages accumulation in white adipose tissues during atherogenesis
2024, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
研究论文 研究探讨了CD36在动脉粥样硬化过程中对白色脂肪组织中脂质相关巨噬细胞积累的调控作用 首次发现CD36缺陷通过促进脂质相关巨噬细胞的积累,减少炎症并增加脂质代谢 研究仅在饮食诱导的动脉粥样硬化小鼠模型中进行,结果的普适性有待验证 探讨CD36在白色脂肪组织中对脂质代谢和炎症的调控作用 白色脂肪组织中的巨噬细胞及其亚群 心血管疾病 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用饮食诱导的动脉粥样硬化小鼠模型进行研究
555 2024-09-23
Spatial transcriptomics of fetal membrane-Decidual interface reveals unique contributions by cell types in term and preterm births
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究使用单细胞转录组学方法,分析了足月和早产情况下胎儿膜-蜕膜界面各层的转录组网络,揭示了不同细胞类型在妊娠结局中的独特贡献 首次在空间水平上解析了胎儿膜-蜕膜界面各层在足月和早产情况下的转录组网络,识别了不同细胞类型在早产中的关键作用 样本量较小,仅包括13名患者的数据,可能影响结果的普适性 研究胎儿膜-蜕膜界面各层在足月和早产情况下的转录组特征,揭示其在妊娠结局中的作用 胎儿膜-蜕膜界面的各层细胞,包括羊膜上皮细胞、羊膜间质细胞、绒毛膜和蜕膜 数字病理学 妊娠疾病 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 13名患者,包括足月未分娩、足月分娩、早产和早产伴胎膜早破
556 2024-09-20
Deciphering colorectal cancer radioresistance and immune microrenvironment: unraveling the role of EIF5A through single-cell RNA sequencing and machine learning
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究探讨了EIF5A在结直肠癌放疗抵抗中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 首次通过单细胞RNA测序和机器学习揭示了EIF5A在结直肠癌放疗抵抗中的关键作用,并验证了其在调节肿瘤免疫微环境中的功能 NA 研究EIF5A在结直肠癌放疗反应中的作用及其对肿瘤干细胞和肿瘤免疫微环境的影响 EIF5A基因在结直肠癌放疗抵抗中的作用 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 机器学习 RNA NA
557 2024-09-19
Research and experimental verification on the mechanisms of cellular senescence in triple-negative breast cancer
2024, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 研究了三阴性乳腺癌中细胞衰老的机制,并通过实验验证了相关特征 首次系统地分析了三阴性乳腺癌中细胞衰老相关通路,并构建了风险模型 实验验证仅限于体外细胞系,缺乏临床样本的验证 探讨三阴性乳腺癌中细胞衰老的机制及其对预后的影响 三阴性乳腺癌患者及其细胞衰老相关特征 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 风险模型 基因表达数据 使用了来自TCGA数据集的三阴性乳腺癌患者样本,并进行了体外细胞系实验
558 2024-09-19
Integrin-associated transcriptional characteristics of circulating tumor cells in breast cancer patients
2024, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 研究了乳腺癌患者循环肿瘤细胞中整合素相关转录特征 首次探讨了不同整合素亚单位表达的循环肿瘤细胞的转录谱与其功能活性及转移潜能之间的关系 研究仅限于乳腺癌患者,且样本量较小 探讨循环肿瘤细胞中整合素表达与转录特征及其对转移潜能的影响 乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 乳腺癌患者的CD45阴性细胞
559 2024-09-19
The burgeoning spatial multi-omics in human gastrointestinal cancers
2024, PeerJ IF:2.3Q2
综述 本文综述了空间多组学技术在人类消化系统癌症中的应用 介绍了空间多组学技术如何保留组织样本中的空间信息,从而增强对个体发育和疾病病理的理解 NA 促进空间多组学技术在消化系统肿瘤疾病研究中的应用 食管癌、胃癌和结直肠癌 数字病理学 消化系统癌症 空间多组学技术 NA 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和表观基因组数据 NA
560 2024-09-19
Comprehensive analysis of splicing factor SRs-related gene characteristics: predicting osteosarcoma prognosis and immune regulation status
2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 研究了剪接因子SRs相关基因对骨肉瘤患者总体生存和预后的影响,并通过单细胞RNA测序数据分析了SRs在骨肉瘤免疫细胞中的致癌途径 构建了基于SRs的预后模型,并揭示了SRs在骨肉瘤免疫细胞中的致癌途径 NA 探讨SRs相关基因对骨肉瘤患者预后和免疫调节状态的影响 骨肉瘤患者的总体生存和预后,以及SRs在免疫细胞中的作用 数字病理学 骨肉瘤 RNA测序 Lasso回归 RNA NA
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