单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1298 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-08-05 |
Hemicentin-1 is an essential extracellular matrix component during tooth root formation by promoting mesenchymal cells differentiation
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1435241
PMID:39050894
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研究论文 | 该文章探讨了Hemicentin-1在牙根形成中的作用，特别是在牙本质形成过程中的影响 | 识别并强调了Hemicentin-1作为牙根与牙冠之间牙本质形成差异的关键外部矩阵成分 | 未提供与人类牙髓细胞相关的体内实验数据 | 研究Hemicentin-1在牙根形成过程中的作用，特别是其在牙本质形成中的功能 | 使用小鼠的牙齿组织，特别是切牙和磨牙，作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫组化染色，CCK8检测，BrdU检测，创伤愈合检测，ALP染色，茜素红染色 | NA | 组织样本 | 小鼠切牙和磨牙组织样本 |
| 522 | 2024-08-05 |
Mapping Single-Cell Transcriptomes of Endometrium Reveals Potential Biomarkers in Endometrial Cancer
2024, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S470994
PMID:39050484
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了子宫内膜癌中的潜在生物标志物 | 首次综合分析了59,397个子宫内膜样本的单细胞转录组，识别出多种细胞亚型及其转录因子活性 | 未提及实验验证阶段的具体样本数据或者临床试验结果 | 研究子宫内膜的动态免疫微环境及其在子宫内膜癌中的作用 | 分析了十个子宫内膜样本中的59397个细胞的转录组 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 10个子宫内膜样本和535个子宫内膜癌样本 |
| 523 | 2024-08-05 |
Characterization of the Prognosis and Tumor Microenvironment of Cellular Senescence-related Genes through scRNA-seq and Bulk RNA-seq Analysis in GC
2024, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究探讨了细胞衰老相关基因在胃癌中的预后作用和分子亚型 | 该研究首次基于细胞衰老相关基因划分胃癌分子亚型并发展了相应的风险模型 | 研究可能缺乏外部验证，依赖于特定的数据库资源 | 研究细胞衰老相关基因在胃癌中的作用和影响 | 胃癌患者的细胞衰老相关基因及其临床信息 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq和Bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 利用了TCGA数据库中各类胃癌患者的临床和基因表达数据 |
| 524 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Steroidogenesis and Spermatogenesis Impairment in the Testis of db/db Mice
2024, International journal of endocrinology
IF:2.3Q3
DOI:10.1155/2024/8797972
PMID:38817616
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研究论文 | 本研究探讨了db/db小鼠睾丸中类固醇生成和精子发生的障碍机制 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了db/db小鼠中睾丸的类固醇生成和精子发生缺陷 | 本研究仅限于db/db小鼠，可能不适用于其他类型的糖尿病模型 | 探究2型糖尿病对男性类固醇生成和精子发生的影响 | db/db小鼠及其对照C57BL/6J小鼠的睾丸 | 数字病理学 | 糖尿病相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | db/db小鼠和C57BL/6J小鼠 |
| 525 | 2024-08-05 |
A disulfidptosis-related lncRNAs cluster to forecast the prognosis and immune landscapes of ovarian cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1397011
PMID:39045330
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研究论文 | 本文探讨了与二硫化物死亡相关的长链非编码RNA（DRLs）在卵巢癌预后和免疫特征中的作用 | 首次构建了一个基于DRLs的卵巢癌预后模型，并揭示了其与RNA甲基化和免疫细胞浸润的相关性 | 未深入探讨DRLs在卵巢癌治疗中的具体机制 | 研究与二硫化物死亡相关的lncRNAs在卵巢癌中的预后和免疫特征 | 卵巢癌患者的lncRNA数据和临床信息 | 数字病理学 | 卵巢癌 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 随机生存森林 | 临床数据，RNA表达数据 | 卵巢癌和正常样本的lncRNA数据，具体样本数量未说明 |
| 526 | 2024-08-05 |
Single cell RNA sequencing of human FAPs reveals different functional stages in Duchenne muscular dystrophy
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1399319
PMID:39045456
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研究论文 | 这篇文章探讨了单细胞RNA测序在人类FAPs中的应用，以了解杜兴肌肉萎缩症中的不同功能阶段 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了DMD患者与健康对照组FAPs在转录谱上的显著差异 | 样本量有限，只有9个额外样本进行了qPCR验证，可能影响结果的普遍性 | 揭示FAPs在杜兴肌肉萎缩症中的功能多样性及其分子机制 | 健康个体和杜兴肌肉萎缩症患者的FAPs | 数字病理学 | 杜兴肌肉萎缩症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个样本（健康和DMD患者的FAPs） |
| 527 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing uncovers cellular heterogeneity and the progression of heterotopic ossification of the elbow
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1434146
PMID:39045052
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了肘部异位骨化的细胞异质性和进展 | 识别了13个HOE细胞簇并进一步分析了4种主要细胞类型的亚簇，提供了更高分辨率的细胞图谱 | 该研究尚未深入探讨HOE细胞的交互作用在不同阶段的具体作用机制 | 探索肘部异位骨化的细胞起源和进展 | 主要研究对象为肘部异位骨化患者中的不同细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 528 | 2024-08-05 |
Integrative transcriptome-proteome approach reveals key hypoxia-related features involved in the neuroprotective effects of Yang Xue oral liquid on Alzheimer's and Parkinson's disease
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1411273
PMID:39045051
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研究论文 | 本研究探讨了缺氧相关基因在杨血口服液对阿尔茨海默病和帕金森病神经保护效应中的作用 | 首次整合转录组和蛋白质组分析，确定了与缺氧相关的关键基因，开发了人工智能驱动的缺氧标志 | 未提及具体实验的局限性 | 研究杨血口服液对阿尔茨海默病和帕金森病的神经保护作用及其机制 | 阿尔茨海默病和帕金森病患者的缺氧相关基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 1713，来自九个独立队列 |
| 529 | 2024-08-05 |
Mincle receptor in macrophage and neutrophil contributes to the unresolved inflammation during the transition from acute kidney injury to chronic kidney disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1385696
PMID:38770013
|
研究论文 | 本文揭示了Mincle受体在急性肾损伤向慢性肾病过渡期间在巨噬细胞和中性粒细胞中的作用 | 研究首次探讨了Mincle在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的角色及其机制 | 尚未明确Mincle在慢性转变过程中的所有影响 | 研究急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的炎症机制 | 以小鼠为模型研究Mincle在急性肾损伤后炎症和纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 在急性肾损伤后，对多时间点的小鼠样本进行分析 |
| 530 | 2024-08-04 |
A subpopulation of human bone marrow erythroid cells displays a myeloid gene expression signature similar to that of classic monocytes
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0305816
PMID:39038020
|
研究论文 | 本研究探讨了人类骨髓红细胞亚群的特征及其在先天免疫中的作用 | 首次揭示人类骨髓红细胞的亚群表现出与经典单核细胞相似的髓系基因表达特征 | 研究可能受限于样本规模和单细胞RNA测序数据的可用性 | 阐明人类骨髓红细胞的特性及其在先天免疫反应中的潜在角色 | 人类骨髓红细胞亚群 | 数字病理学 | NA | NanoString基因表达分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 531 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of PPP4C's impact on prognosis, immune microenvironment, and immunotherapy response in lung adenocarcinoma using single-cell sequencing and multi-omics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1416632
PMID:39026674
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研究论文 | 本研究分析了PPP4C对肺腺癌预后、免疫微环境和免疫治疗反应的影响 | 提出了一个基于PPP4C水平的预后框架，能够有效预测肺腺癌患者的预后以及免疫治疗的有效性 | 对PPP4C如何影响特定免疫细胞类型的执行机制的研究仍然不够深入 | 探讨PPP4C在肺腺癌中的角色及其与免疫微环境的相互作用 | 肺腺癌患者的PPP4C表达水平及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序与多组学分析 | WGCNA | RNA测序数据 | LUAD患者样本和相关免疫基因数据集 |
| 532 | 2024-08-05 |
Matrix Reordering for Noisy Disordered Matrices: Optimality and Computationally Efficient Algorithms
2024-Jan, IEEE transactions on information theory
IF:2.2Q3
DOI:10.1109/tit.2023.3305538
PMID:39036782
|
研究论文 | 本文研究了基于噪声无序单调Toeplitz矩阵模型的矩阵重排序问题 | 提出了一种新的多项式时间自适应排序算法，并保证性能改进 | 分析的多项式时间算法的计算复杂度较高，存在一定的局限性 | 探讨矩阵重排序在单细胞生物学和宏基因组学中的应用 | 聚焦于噪声无序的单调Toeplitz矩阵模型 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 文本 | 两个真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 533 | 2024-08-05 |
O-GlcNAc transferase regulates collagen deposition and fibrosis resolution in idiopathic pulmonary fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387197
PMID:38665916
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研究论文 | 本研究探讨了O-GlcNAc转移酶在特发性肺纤维化中的作用。 | 这项研究首次揭示了OGT在特发性肺纤维化中的调节作用及其在胶原沉积和纤维化消退中的关键角色。 | 尚未在临床试验中验证OGT抑制对纤维化分辨率的影响。 | 研究OGT在特发性肺纤维化中的作用及其对胶原沉积和纤维化消退的影响。 | 本研究的对象包括来自特发性肺纤维化及非特发性肺纤维化捐赠者的人肺组织和孤立成纤维细胞。 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 实验模型 | 组织样本和细胞样本 | 未提供具体样本量 |
| 534 | 2024-08-05 |
Migration Inhibition Factor Secreted by Peripheral Blood Memory B Cells Binding to CD74-CD44 Receptor Complex Drives Macrophage Behavior in Alzheimer's Disease
2024 Jan-Dec, American journal of Alzheimer's disease and other dementias
DOI:10.1177/15333175241238577
PMID:38491918
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研究论文 | 本研究探讨了外周血记忆B细胞分泌的迁移抑制因子如何影响阿尔茨海默病中的巨噬细胞行为 | 发现迁移抑制因子与巨噬细胞上的CD74-CD44受体复合物结合，影响巨噬细胞行为 | NA | 探究外周免疫系统在阿尔茨海默病中的作用，特别是记忆B细胞的影响 | 外周血记忆B细胞及其分泌的迁移抑制因子 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq，免疫荧光及流式细胞术 | NA | 细胞数据 | NA |
| 535 | 2024-08-05 |
Involvement of S100A6/S100A11 in T-Cell Immune Regulatory in HCC Revealed by Single Cell RNA-seq
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241252610
PMID:38766816
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研究论文 | 本研究探讨了S100A6/S100A11在肝细胞癌（HCC）T细胞免疫调节中的作用 | 首次揭示S100A6/S100A11在HCC T细胞中的差异表达及其与NF-κB途径的相关性 | 未详细探讨其他S100家族蛋白对肝癌免疫的潜在影响 | 研究S100蛋白在肝细胞癌免疫细胞中的作用 | S100A6/S100A11在肝细胞癌及与乙型肝炎相关的HCC中的表达 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 分析了HCC及与乙型肝炎相关的HCC的单细胞RNA测序数据 |
| 536 | 2024-08-04 |
Microbial consortium assembly and functional analysis via isotope labelling and single-cell manipulation of polycyclic aromatic hydrocarbon degraders
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae115
PMID:38913500
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研究论文 | 文章提出了一种构建功能性微生物 consortium 的创新方法 | 通过使用单细胞识别和分选技术，首次在原位构建了基于基因组指导的功能性微生物 consortium | 研究中可能未涵盖所有类型的污染物降解微生物 | 探索构建原位功能性微生物 consortium 的方法以提高多环芳香烃的生物降解能力 | 聚焦于降解 phenanthrene 的细菌，如 Achromobacter sp. 和 Pseudomonas sp. | 数字病理学 | NA | 拉曼激活细胞分选-稳定同位素探测 | NA | 基因组数据和细胞功能数据 | 涉及 phenanthrene 降解细菌的单细胞 |
| 537 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics of gastric cancer brain metastasis reveals atypical vasculature strategies with supportive immune profiles
2024, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goae067
PMID:39027914
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研究论文 | 本研究揭示了胃癌脑转移中不典型血管化策略和支持性免疫特征的空间转录组学。 | 本研究展示了肿瘤与免疫成分之间的空间互动，特别是不同的血管招募策略，提供了对GCBM的新的分子见解。 | 该研究的样本数量有限，仅研究了三例GCBM患者，可能影响结果的广泛适用性。 | 研究胃癌脑转移患者中不同细胞成分之间的空间相互作用，尤其是血管系统与脑微环境的关系。 | 研究对象为三名胃癌脑转移患者的肿瘤、免疫和脑组织区域。 | 数字病理学 | 胃癌 | 数字空间分析 | NA | 转录组数据 | 三名胃癌脑转移患者的140个区域 |
| 538 | 2024-08-05 |
scVIC: deep generative modeling of heterogeneity for scRNA-seq data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae086
PMID:39027640
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研究论文 | 本文介绍了scVIC，一种用于单细胞RNA测序数据的深度生成建模算法 | scVIC创新性地同时处理生物异质性和批次效应，解决了传统方法的局限性 | 本文未提及具体的限制性因素 | 该研究旨在开发一种有效的方法以准确分析单细胞层面的异质性 | 研究对象为模拟和生物单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 变分推断 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用了模拟和生物scRNA-seq数据集 |
| 539 | 2024-08-05 |
Network-based pharmacology and UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS reveal Jinhua Qinggan granule's mechanism in reducing cellular inflammation in COVID-19
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382524
PMID:39026676
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研究论文 | 本研究探讨了金华清感颗粒在治疗COVID-19中减少细胞炎症的机制 | 首次利用网络药理学和UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS识别金华清感颗粒的成分及其在COVID-19中的作用机制 | 该研究未提供金华清感颗粒在临床应用中的长期效果数据 | 研究金华清感颗粒在COVID-19中的功效及其机制 | 主要研究金华清感颗粒对外周血单核细胞中免疫细胞的影响 | 数字病理学 | COVID-19 | UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS，单细胞RNA测序 | NA | 化学成分，免疫细胞的RNA数据 | 分析了73种化合物和外周血单核细胞 |
| 540 | 2024-08-05 |
Advancing immunotherapy for melanoma: the critical role of single-cell analysis in identifying predictive biomarkers
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1435187
PMID:39026661
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研究论文 | 该文章探讨了单细胞分析在黑色素瘤免疫治疗中的关键作用 | 首次强调了单细胞分析技术在预测黑色素瘤患者治疗反应的潜力 | 存在RNA-蛋白表达不一致和肿瘤异质性等挑战 | 研究黑色素瘤的免疫微环境及其对治疗反应的影响 | 探索黑色素瘤细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |