单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1387 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-10-04 |
From single-cell to spatial transcriptomics: decoding the glioma stem cell niche and its clinical implications
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1475235
PMID:39355251
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，解析了胶质瘤干细胞微环境及其临床意义 | 首次全面描述了胶质瘤干细胞及其与髓源抑制细胞的相互作用，并开发了一种新的预后标志物GSCS | NA | 识别和表征胶质瘤干细胞，分析其与其他细胞类型的相互作用，并开发预后标志物 | 胶质瘤干细胞及其微环境中的细胞类型 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、基因调控网络分析、CellChat分析 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 44个原发性胶质瘤样本 |
| 482 | 2024-10-04 |
Machine learning-based identification of an immunotherapy-related signature to enhance outcomes and immunotherapy responses in melanoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1451103
PMID:39355255
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的免疫治疗相关基因模型（ITRGM）签名，用于预测黑色素瘤患者的免疫治疗反应和预后 | 本文通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和多种机器学习算法，识别出66个共识免疫治疗预后基因（CITPGs），并构建了ITRGM签名，该签名在多个黑色素瘤队列中表现优于已发表的37个签名 | NA | 开发一种稳定的、强健的预测模型，用于将黑色素瘤患者分为'免疫热'和'免疫冷'肿瘤，以增强免疫治疗的效果和预后 | 黑色素瘤患者的免疫治疗反应和预后 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、共识聚类、机器学习算法 | 机器学习模型 | RNA测序数据、病理切片 | 包括两个黑色素瘤队列、三个额外黑色素瘤队列、TCGA-SKCM队列以及八个其他癌症队列 |
| 483 | 2024-10-04 |
Analyses of single-cell and bulk RNA sequencing combined with machine learning reveal the expression patterns of disrupted mitophagy in schizophrenia
2024, Frontiers in psychiatry
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fpsyt.2024.1429437
PMID:39355378
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研究论文 | 研究通过单细胞和批量RNA测序结合机器学习，揭示了精神分裂症中受损线粒体自噬的表达模式 | 发现了与精神分裂症发病相关的线粒体自噬特征基因，并构建了诊断模型 | NA | 探讨线粒体自噬与精神分裂症之间的关系，并开发新的诊断和治疗方法 | 精神分裂症患者的外周血和脑类器官的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 精神分裂症 | RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 精神分裂症患者和健康对照的外周血和脑类器官样本 |
| 484 | 2024-10-02 |
Macrophages Promote Atherosclerosis Development by Inhibiting CD8T Cell Apoptosis
2024, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2024/1929766
PMID:39345351
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞通过抑制CD8T细胞凋亡促进动脉粥样硬化发展的机制 | 首次揭示了巨噬细胞通过C1q-C1qbp轴抑制CD8T细胞凋亡，从而促进动脉粥样硬化发展的机制 | 研究主要基于小鼠模型，需进一步在人体中验证 | 探讨巨噬细胞与CD8T细胞相互作用在动脉粥样硬化发展中的作用 | 巨噬细胞和CD8T细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | scRNA-seq, qPCR, 流式细胞术, ChIP-qPCR, 蛋白质印迹, 抗体阻断实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 小鼠模型 |
| 485 | 2024-10-02 |
HPV-driven heterogeneity in cervical cancer: study on the role of epithelial cells and myofibroblasts in the tumor progression based on single-cell RNA sequencing analysis
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18158
PMID:39346086
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了人乳头瘤病毒（HPV）感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响，特别是上皮细胞和肌成纤维细胞在肿瘤进展中的作用 | 首次系统分析了HPV阳性及阴性宫颈癌样本中单细胞RNA测序数据，揭示了HPV感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响及其分子机制 | 研究样本仅来自Gene Expression Omnibus数据库，可能存在数据偏差；未涉及临床验证 | 探索HPV感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响，为优化宫颈癌的预防筛查和个性化治疗提供新的分子基础 | HPV阳性及阴性宫颈癌样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12,431个细胞 |
| 486 | 2024-10-02 |
DSP-0509, a TLR7 agonist, exerted synergistic anti-tumor immunity combined with various immune therapies through modulating diverse immune cells in cancer microenvironment
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1410373
PMID:39346737
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研究论文 | 研究了TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用 | 首次合成了可系统注射的TLR7激动剂DSP-0509，并研究了其与IDO1抑制剂、抗PD-1抗体和AXL抑制剂联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证其疗效 | 探讨TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用，以增强抗肿瘤免疫效果 | TLR7激动剂DSP-0509、IDO1抑制剂、抗PD-1抗体、AXL抑制剂以及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠肿瘤模型 |
| 487 | 2024-10-02 |
Transcriptional bursting dynamics in gene expression
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1451461
PMID:39346775
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综述 | 本文综述了基因表达中的转录爆发动力学机制，并比较了不同基因表达模型的优缺点 | 提供了关于转录爆发的关键指标的详细总结，并探讨了跨物种的转录爆发时间动态及其分子机制 | 缺乏一个全面的定量模型来研究转录爆发 | 指导研究人员选择最适合其研究背景的基因表达模型，并深入理解细胞过程、细胞命运决定和癌症诊断 | 基因表达模型、转录爆发动力学、细胞表型多样性 | NA | NA | 单细胞测序、多组学整合 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 488 | 2024-10-02 |
Unraveling the role of ADAMs in clinical heterogeneity and the immune microenvironment of hepatocellular carcinoma: insights from single-cell, spatial transcriptomics, and bulk RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1461424
PMID:39346916
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研究论文 | 本研究探讨了ADAM基因家族在肝细胞癌临床异质性和免疫微环境中的作用，通过单细胞、空间转录组学和批量RNA测序技术揭示了ADAM家族基因的分子特征及其对HCC发展和预后的影响 | 首次报道了ADAM家族信号在肝细胞癌肿瘤微环境中的有害影响和预后意义 | NA | 探讨ADAM基因家族在肝细胞癌中的作用及其对临床预后的影响 | 肝细胞癌中的ADAM基因家族及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、空间转录组学、批量RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA |
| 489 | 2024-09-30 |
Deep learning-based multimodal spatial transcriptomics analysis for cancer
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.08.001
PMID:39271260
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研究论文 | 本文探讨了深度学习与多模态空间转录组学在癌症研究中的整合应用 | 本文创新性地将深度学习与多模态空间转录组学结合，用于癌症诊断、治疗规划和精准医学 | NA | 本文旨在探讨深度学习与多模态空间转录组学在癌症研究中的应用 | 本文研究对象为癌症诊断、治疗规划和精准医学 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 卷积神经网络 | 多模态数据 | NA |
| 490 | 2024-09-30 |
Single-nuclei transcriptome analysis of channel catfish spleen provides insight into the immunome of an aquaculture-relevant species
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309397
PMID:39325796
|
研究论文 | 本文通过单核RNA测序技术分析了养殖相关物种——通道鲶鱼脾脏的转录组，揭示了其免疫系统的细胞组成和基因表达特征 | 首次对通道鲶鱼脾脏进行单核RNA测序，识别了多种免疫细胞亚群及其基因表达特征 | 研究仅限于通道鲶鱼脾脏，未涉及其他组织或物种 | 深入研究通道鲶鱼的免疫系统，特别是脾脏的免疫细胞组成和基因表达 | 通道鲶鱼脾脏的免疫细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从8,157个细胞中生成了278,717,872条reads，整合数据包括19,613个细胞和20,121个基因 |
| 491 | 2024-09-30 |
Specific cell subclusters of dental pulp stem cells respond to distinct pathogens through the ROS pathway
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1452124
PMID:39328360
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研究论文 | 研究分析了牙髓干细胞在受到口腔真菌和细菌感染时的细胞和分子特性 | 发现了一个特定的牙髓干细胞亚群对不同病原体感染有特异性反应，并通过ROS途径激活MAPK和NF-κB通路引发免疫反应 | NA | 研究牙髓干细胞在不同病原体感染下的反应机制 | 牙髓干细胞及其在真菌和细菌感染下的反应 | NA | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | 6名健康受试者的阻生第三磨牙中的牙髓干细胞 |
| 492 | 2024-09-30 |
Monocytes as an early risk factor for acute graft-versus-host disease after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1433091
PMID:39328417
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了异基因造血干细胞移植后急性移植物抗宿主病（aGVHD）的早期风险因素 | 首次发现移植后第21天外周血单核细胞的显著增加和激活与aGVHD的发生密切相关 | 研究样本量较小，需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性 | 识别异基因造血干细胞移植后急性移植物抗宿主病的潜在生物标志物，以预防和治疗该疾病 | 异基因造血干细胞移植后发生或未发生急性移植物抗宿主病的患者 | NA | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及发生和未发生急性移植物抗宿主病的患者样本 |
| 493 | 2024-09-28 |
Crosstalk Between Cancer-associated Fibroblasts and Myeloid Cells Shapes the Heterogeneous Microenvironment of Gastric Cancer
2024, Current genomics
IF:1.8Q3
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研究论文 | 研究探讨了胃癌微环境中癌症相关成纤维细胞与骨髓细胞之间的相互作用及其对微环境异质性的影响 | 首次识别了两种癌症相关成纤维细胞亚型，并揭示了炎症性癌症相关成纤维细胞在EMT和脂质代谢中的作用，以及肿瘤浸润性骨髓细胞的功能多样性 | 研究主要基于生物信息学分析和单细胞RNA测序数据，实验验证部分有限 | 深入了解胃癌微环境的异质性，为精准治疗提供新思路 | 胃癌微环境中的癌症相关成纤维细胞和骨髓细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及八个细胞群体的单细胞图谱 |
| 494 | 2024-09-28 |
Identify BCAT1 plays an oncogenic role and promotes EMT in KIRC via single cell RNA-seq and experiment
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1446324
PMID:39324007
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研究论文 | 本研究探讨了BCAT1在肾透明细胞癌（KIRC）中的致癌作用及其通过上皮间质转化（EMT）促进肿瘤侵袭和转移的机制 | 首次系统研究了BCAT1在KIRC中的致癌作用及其通过EMT促进肿瘤侵袭和转移的机制 | NA | 探讨BCAT1在肾透明细胞癌（KIRC）中的致癌作用及其机制 | BCAT1在KIRC中的功能和机制 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE159115单细胞转录组数据，并进行了临床组织样本的Western Blotting和免疫组化染色 |
| 495 | 2024-09-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals the communications between tumor microenvironment components and tumor metastasis in osteosarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1445555
PMID:39324133
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤中肿瘤微环境成分与肿瘤转移之间的通信机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤中肿瘤微环境成分与肿瘤转移之间的复杂通信机制 | 研究仅基于特定数据集，结果的普适性有待进一步验证 | 探索骨肉瘤的转移机制，为癌症治疗开辟新途径 | 骨肉瘤中的肿瘤微环境成分与肿瘤转移 | 数字病理学 | 骨癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及GSE152048、GSE14359和GSE49003数据集中的样本 |
| 496 | 2024-09-27 |
Single-cell transcriptomic landscape reveals the role of intermediate monocytes in aneurysmal subarachnoid hemorrhage
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1401573
PMID:39318997
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了动脉瘤性蛛网膜下腔出血后的单核细胞，揭示了中间单核细胞在神经炎症中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了动脉瘤性蛛网膜下腔出血后中间单核细胞在神经炎症中的关键作用 | 研究样本量较小，仅包括两名男性患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨动脉瘤性蛛网膜下腔出血后神经炎症的机制 | 单核细胞及其亚群在动脉瘤性蛛网膜下腔出血后的表达和功能 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共17,242个细胞，包括7,224个脑脊液细胞和10,018个外周血细胞 |
| 497 | 2024-09-26 |
Multi-omics Analysis Identifies Hypoxia Subtypes and S100A2 as an Immunosuppressive Factor in Cervical Cancer
2024-01, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-023-01304-x
PMID:37648942
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，在宫颈癌样本中识别出三种缺氧亚型，并发现S100A2作为免疫抑制因子 | 首次在宫颈癌中研究缺氧景观，并识别出S100A2作为缺氧诱导的免疫抑制因子 | NA | 研究宫颈癌中的缺氧亚型及其对免疫治疗反应的影响 | 宫颈癌样本及其缺氧相关基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自The Cancer Genome Atlas数据集的宫颈癌样本 |
| 498 | 2024-09-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals that MYBL2 in malignant epithelial cells is involved in the development and progression of ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1438198
PMID:39136009
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术揭示了恶性上皮细胞中的MYBL2在卵巢癌发展和进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面研究了卵巢癌患者的细胞组成，并识别了关键的亚群和影响卵巢癌进展的转录因子 | 研究样本仅限于六名卵巢癌伴网膜转移的患者，可能影响结果的普适性 | 深入理解恶性上皮细胞在卵巢癌中的作用，并探讨卵巢癌免疫微环境和免疫耗竭的影响 | 卵巢癌患者的恶性上皮细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 六名卵巢癌伴网膜转移的患者 |
| 499 | 2024-09-26 |
γδ T-cells in human malignancies: insights from single-cell studies and analytical considerations
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1438962
PMID:39281674
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综述 | 本文综述了单细胞研究在不同恶性肿瘤中对γδ T细胞的生物学特性和调控机制的见解 | 介绍了高分辨率单细胞测序技术在γδ T细胞研究中的应用 | γδ T细胞的低丰度使得其生物学特性仍不明确 | 探讨γδ T细胞在人类恶性肿瘤中的作用及其生物学机制 | γδ T细胞及其在不同恶性肿瘤中的效应子亚群和调控机制 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 500 | 2024-09-26 |
Platinum-based chemotherapy promotes antigen presenting potential in monocytes of patients with high-grade serous ovarian carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1414716
PMID:39315092
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研究论文 | 研究探讨了铂类化疗对高级别浆液性卵巢癌患者单核细胞抗原呈递潜力的影响 | 首次揭示了铂类化疗通过转录上调MHC II类分子在单核细胞中诱导抗原呈递，而非通过表观遗传变化 | 研究仅限于高级别浆液性卵巢癌患者，且样本量未明确 | 揭示肿瘤特异性转录和表观遗传变化，以及化疗如何重编程单核细胞 | 高级别浆液性卵巢癌患者的单核细胞 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |