单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-10-15 |
Aggressive high-grade NF2 mutant meningiomas downregulate oncogenic YAP signaling via the upregulation of VGLL4 and FAT3/4
2024 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae148
PMID:39380691
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研究论文 | 研究了NF2突变型脑膜瘤中YAP信号通路的调控机制 | 发现了高级别NF2突变型脑膜瘤通过上调VGLL4和FAT3/4来下调YAP信号通路 | 研究仅限于体外细胞实验和RNA测序数据分析 | 探讨不同级别NF2突变型脑膜瘤中YAP信号通路的依赖性 | NF2突变型脑膜瘤 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量人类脑膜瘤样本 |
| 482 | 2024-10-14 |
Hidden syndinian and perkinsid infections in dinoflagellate hosts revealed by single-cell transcriptomics
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae188
PMID:39325969
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示了寄生在甲藻宿主中的隐秘的syndinian和perkinsid感染 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了这些难以直接观察或培养的寄生虫的感染情况，并构建了基于192个基因的系统发育树 | 研究仅限于14个感染宿主细胞，且仅通过光显微镜在收集时识别出5个含有寄生虫的细胞 | 揭示隐秘的单细胞寄生虫的进化历史及其与宿主的关系 | 自由生活的甲藻及其寄生虫 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 14个感染宿主细胞 |
| 483 | 2024-10-13 |
Revealing the association between East Asian oral microbiome and colorectal cancer through Mendelian randomization and multi-omics analysis
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1452392
PMID:39355266
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化（MR）和多组学分析探讨东亚人口口腔微生物群与结直肠癌（CRC）之间的关联 | 首次通过MR分析和多组学整合揭示口腔微生物群与结直肠癌之间的因果关系，并利用单细胞RNA测序和药物预测分析揭示关键通路和潜在治疗药物 | NA | 探索口腔微生物群与结直肠癌之间的因果关系，并揭示其影响细胞代谢和癌症发展的机制 | 口腔微生物群与结直肠癌的关联 | NA | 结直肠癌 | 孟德尔随机化（MR）、全基因组关联研究（GWAS）、单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据、基因组数据、单细胞RNA数据 | 2017个舌样本和1915个唾液样本，6692个CRC病例和27178个对照组 |
| 484 | 2024-10-13 |
A comprehensive analysis of genes associated with hypoxia and cuproptosis in pulmonary arterial hypertension using machine learning methods and immune infiltration analysis: AHR is a key gene in the cuproptosis process
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1435068
PMID:39391037
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法和免疫浸润分析，全面分析了与低氧和铜死亡相关的基因在肺动脉高压中的作用，并确定AHR是铜死亡过程中的关键基因 | 本研究首次将机器学习方法应用于肺动脉高压中与低氧和铜死亡相关的基因分析，并构建了诊断模型 | 本研究主要基于GEO数据库和genecad的表达谱和单细胞RNA-seq数据，未涵盖所有可能的数据来源 | 探讨肺动脉高压与低氧和铜死亡相关基因之间的关联，并寻找潜在的生物标志物 | 肺动脉高压患者与对照组的基因表达差异，以及免疫细胞浸润情况 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA-seq | LASSO和随机森林 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 485 | 2024-10-13 |
Case report: Tenosynovial giant cell tumor
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1445427
PMID:39391235
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病例报告 | 报告了一例45岁男性患者右髋部疼痛和肿胀的病例，通过全外显子测序和RNA测序确诊为腱鞘巨细胞瘤 | 通过全外显子测序和RNA测序发现CSF1::GAPDHP64融合，并使用单细胞转录组分析揭示了肿瘤细胞与巨噬细胞之间的相互作用 | 病例报告的局限性在于其样本量小，结果可能不适用于所有腱鞘巨细胞瘤患者 | 探讨腱鞘巨细胞瘤的分子诊断和治疗策略 | 腱鞘巨细胞瘤及其分子机制 | NA | 腱鞘巨细胞瘤 | 全外显子测序、RNA测序、单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 1例患者 |
| 486 | 2024-10-13 |
Sphingosine 1-phosphate receptor 2 in keratinocytes plays a key role in reducing inflammation in psoriasis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1469829
PMID:39391307
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研究论文 | 研究探讨了角质形成细胞中的S1PR2受体在银屑病炎症中的作用 | 首次研究了S1PR2在银屑病中的作用，并发现其作为下调因子抑制Th17细胞的招募 | 仅限于IMQ诱导的银屑病样炎症模型，未涉及其他银屑病模型 | 探讨S1PR2在银屑病中的作用及其潜在治疗价值 | S1PR2受体在角质形成细胞中的功能及其对银屑病炎症的影响 | NA | 银屑病 | 空间转录组学、RT-qPCR、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞数据 | S1pr2fl/fl K14-Cre小鼠和野生型小鼠 |
| 487 | 2024-10-13 |
Identification and validation of SHC1 and FGFR1 as novel immune-related oxidative stress biomarkers of non-obstructive azoospermia
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1356959
PMID:39391879
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研究论文 | 本文通过现有数据集识别并验证了SHC1和FGFR1作为非阻塞性无精子症的新型免疫相关氧化应激生物标志物 | 本文首次识别并验证了SHC1和FGFR1作为非阻塞性无精子症的新型免疫相关氧化应激生物标志物，并探讨了其在诊断和预后中的应用 | NA | 识别和验证非阻塞性无精子症的新型生物标志物 | SHC1和FGFR1基因在非阻塞性无精子症中的表达和功能 | 数字病理学 | 男性不育症 | RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 非阻塞性无精子症和阻塞性无精子症患者的睾丸组织样本 |
| 488 | 2024-10-12 |
Identification of a senescence-related transcriptional signature to uncover molecular subtypes and key genes in hepatocellular carcinoma
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311696
PMID:39383169
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据，分析了肝细胞癌患者的基因表达特征，识别出与衰老相关的分子亚型和关键基因 | 本研究开发了一个肝细胞癌特异性的细胞衰老风险模型，并识别出G6PD作为潜在的衰老相关靶点 | 由于肿瘤异质性和缺乏通用的细胞衰老标志物，准确测量不同类型肿瘤中的细胞衰老水平具有挑战性 | 研究肝细胞癌中与衰老相关的分子特征 | 肝细胞癌患者的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 肝细胞癌样本 |
| 489 | 2024-10-12 |
Integrating transcriptomics, eQTL, and Mendelian randomization to dissect monocyte roles in severe COVID-19 and gout flare
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1385316
PMID:39385934
|
研究论文 | 本文通过整合转录组学、eQTL和孟德尔随机化方法，探讨了单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的作用 | 本文首次综合利用单细胞RNA测序、大规模全基因组关联研究和表达数量性状位点数据，分析了单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的分子机制 | 本文主要依赖于现有数据集的分析，缺乏实验验证 | 阐明单核细胞在痛风和COVID-19中的分子基础，以开发更有效的治疗方法 | 单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的功能 | 数字病理学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及严重COVID-19、痛风和正常对照组的单细胞RNA测序数据 |
| 490 | 2024-10-12 |
Batch-effect correction in single-cell RNA sequencing data using JIVE
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae134
PMID:39387061
|
研究论文 | 本文提出了一种增强的JIVE方法，用于大规模单细胞RNA测序数据的批次效应校正 | 本文改进了JIVE方法，使其适用于大规模单细胞数据，并引入了新的应用场景 | NA | 解决单细胞RNA测序分析中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | JIVE | 基因表达数据 | 多个单细胞测序数据集 |
| 491 | 2024-10-11 |
Single-cell RNA sequencing unveils unique transcriptomic signatures of endothelial cells and role of ENO1 in response to disturbed flow
2024-Jan-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2318904121
PMID:38261622
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞在不同流体剪切力下的独特转录组特征，并探讨了ENO1在响应扰流中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了扰流和脉动剪切力对内皮细胞转录组的影响，并揭示了ENO1在响应扰流中的关键作用 | 研究主要集中在体外实验，需要进一步的体内实验验证结果 | 探讨不同流体剪切力对内皮细胞转录组的影响及其在动脉粥样硬化中的作用 | 内皮细胞及其在扰流和脉动剪切力下的转录组变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个内皮细胞样本 |
| 492 | 2024-10-11 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Applications in Pituitary Research
2024, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000540352
PMID:39053437
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在垂体研究中的应用，强调了其在揭示垂体细胞异质性和相互作用方面的潜力 | 单细胞RNA测序技术为研究垂体细胞的异质性和相互作用提供了前所未有的手段 | 目前该技术在探索垂体复杂性方面的应用还较少 | 加深对垂体及其在疾病状态下功能障碍的理解 | 垂体细胞及其在生理和病理机制中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 493 | 2024-10-11 |
Machine learning-based discovery of UPP1 as a key oncogene in tumorigenesis and immune escape in gliomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1475206
PMID:39380997
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研究论文 | 本文通过机器学习方法发现UPP1基因在胶质瘤发生和免疫逃逸中的关键作用 | 本文首次将UPP1识别为胶质瘤发生和免疫逃逸的关键驱动基因 | NA | 揭示胶质瘤发生和进展的分子机制，以改进治疗和患者预后 | 胶质瘤样本的单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 | 机器学习 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 大规模胶质瘤样本 |
| 494 | 2024-10-10 |
From womb to wellness: early environmental exposures, cord blood DNA methylation and disease origins
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2390823
PMID:39263926
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研究论文 | 本文探讨了早期环境暴露对脐带血DNA甲基化的影响及其与疾病起源的关系 | 本文介绍了单细胞测序等新兴技术在克服现有甲基化阵列覆盖范围有限和细胞组成变异性等技术挑战方面的潜力 | 本文指出了组织特异性问题、当前甲基化阵列覆盖范围有限以及细胞组成变异性等技术挑战 | 本文旨在研究早期环境暴露对脐带血DNA甲基化的影响及其与健康轨迹的关系 | 本文研究对象包括脐带血DNA甲基化、母体因素（如营养、吸烟和毒素暴露）及其对健康的影响 | 数字病理学 | NA | DNA甲基化测序 | NA | DNA | NA |
| 495 | 2024-10-10 |
A Strategy to Compare Single-Cell RNA Sequencing Data Sets Provides Phenotypic Insight into Cellular Heterogeneity Underlying Biological Similarities and Differences Between Samples
2024, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322241280866
PMID:39376245
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scCompare的计算管道，用于比较单细胞RNA测序数据集，以评估样本间的生物相似性和差异 | scCompare通过相关性映射将已知数据集的表型身份转移到另一个数据集，并使用统计学方法确定表型包容性的下限，有助于检测潜在的新细胞类型 | NA | 开发一种方法来评估单细胞RNA测序数据集之间的生物相似性和差异 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自人类外周血单核细胞和心肌细胞的数据集 |
| 496 | 2024-10-10 |
Integrated multi-omics profiling reveals the ZZZ3/CD70 axis is a super-enhancer-driven regulator of diffuse large B-cell lymphoma cell-natural killer cell interactions
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10155
PMID:39376717
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研究论文 | 研究探讨了超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞相互作用的机制 | 首次揭示了ZZZ3/CD70轴通过超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与自然杀伤细胞相互作用 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证 | 探究超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞相互作用的机制 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、H3K27ac ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 来自Heidelberg Open Research Data数据库和Gene Expression Omnibus数据库的数据 |
| 497 | 2024-10-10 |
Unveiling the role of IGF1R in autism spectrum disorder: a multi-omics approach to decipher common pathogenic mechanisms in the IGF signaling pathway
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1483574
PMID:39376742
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研究论文 | 本研究利用多组学方法探讨了胰岛素样生长因子（IGF）信号通路在自闭症谱系障碍（ASD）中的致病机制，特别是IGF1R的作用 | 首次通过多组学方法揭示了IGF1R在ASD中的关键作用，并发现了其在PV中间神经元发育中的影响 | 研究样本主要来自中国汉族人群和SFARI SPARK数据库，可能存在样本偏倚 | 探讨IGF信号通路在自闭症谱系障碍中的致病机制 | 自闭症谱系障碍患者及其相关基因和信号通路 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 全外显子测序（WES）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析、基因调控网络（GRN）分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 中国汉族ASD患者群体及SFARI SPARK数据库中的ASD患者 |
| 498 | 2024-10-10 |
Single-Cell Sequencing Combined with Transcriptome Sequencing to Explore the Molecular Mechanisms Related to Psoriasis
2024, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S484034
PMID:39376789
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和转录组测序，探索银屑病相关的分子机制 | 揭示了银屑病潜在的治疗药物和发病机制，为后续机制研究提供了新思路 | NA | 进一步探索银屑病的发病分子机制 | 银屑病的基因表达谱和差异表达基因 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞测序、转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及GSE151177、GSE41664、GSE30999三个数据集的基因表达谱 |
| 499 | 2024-10-09 |
MerTK-dependent efferocytosis by monocytic-MDSCs mediates resolution of post-lung transplant injury
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576261
PMID:38328174
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研究论文 | 研究探讨了MerTK依赖的单核细胞来源的髓系抑制细胞（M-MDSCs）在肺移植后缺血再灌注损伤（IRI）中的作用 | 首次揭示了MerTK在M-MDSCs中的作用，通过吞噬凋亡细胞促进肺IRI的恢复 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨MerTK在M-MDSCs中的作用，以促进肺移植后IRI的恢复 | 肺移植患者和小鼠模型中的M-MDSCs | 数字病理学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 包括肺移植患者和小鼠模型的多个样本 |
| 500 | 2024-10-09 |
Pain sensitivity genes as therapeutic targets in knee osteoarthritis: A comprehensive analysis
2024 Jan-Dec, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069241289961
PMID:39313491
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研究论文 | 本研究系统分析了疼痛敏感基因在膝骨关节炎中的作用，并探讨了其作为治疗靶点的潜力 | 通过综合分析RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据，识别出关键的疼痛敏感基因，并验证了其在膝骨关节炎中的重要作用 | NA | 探讨疼痛敏感基因在膝骨关节炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 疼痛敏感基因在膝骨关节炎患者中的表达和作用 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq | LASSO, SVM, 随机森林 | RNA-seq数据 | 涉及GSE114007、GSE169077、GSE152805、GSE133449和GSE104782等多个数据集 |