单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
461	2024-10-21	Anoikis-related CTNND1 is associated with immuno-suppressive tumor microenvironment and predicts unfavorable immunotherapeutic outcome in non-small cell lung cancer 2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.89542 PMID:38169514	研究论文	研究探讨了与细胞凋亡相关的基因CTNND1在非小细胞肺癌中的表达及其与肿瘤微环境和免疫治疗结果的关系	首次揭示了CTNND1作为预测非小细胞肺癌免疫治疗反应的新型生物标志物	研究主要基于公共数据库数据，需要进一步的临床验证	探索细胞凋亡相关基因与非小细胞肺癌肿瘤微环境和免疫治疗结果的关系	非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和免疫细胞	数字病理学	肺癌	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	多个公共数据库和内部队列的非小细胞肺癌样本
462	2024-10-21	Establishment of a tumor-associated fibroblast associated gene score based on scRNA-seq to predict prognosis in patients with triple-negative breast cancer 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0311801 PMID:39418248	研究论文	本研究基于单细胞RNA测序数据，建立了与肿瘤相关成纤维细胞相关的基因评分，用于预测三阴性乳腺癌患者的预后	首次基于单细胞RNA测序数据，建立了与肿瘤相关成纤维细胞相关的基因评分，并验证了其与三阴性乳腺癌患者预后的相关性	研究仅基于特定数据集，结果的普适性有待进一步验证	研究肿瘤微环境中肿瘤相关成纤维细胞的异质性，并建立基因评分以预测三阴性乳腺癌患者的预后	三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的肿瘤相关成纤维细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	基于GSE118389和GSE103091数据集，涉及多个三阴性乳腺癌患者的样本
463	2024-10-20	Single-cell sequencing reveals increased LAMB3-positive basal keratinocytes and ZNF90-positive fibroblasts in autologous cultured epithelium 2024-01-10, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-023-05747-5 PMID:38200141	研究论文	研究在无血清和无饲养层条件下培养的自体表皮移植的安全性和有效性，并与传统条件进行比较	发现无血清和无饲养层培养的表皮中LAMB3阳性基底角质形成细胞和ZNF90阳性成纤维细胞数量增加，这些细胞在色素再生中起关键作用	研究仅限于稳定期的白癜风患者，未涉及其他疾病或更广泛的患者群体	探讨无血清和无饲养层条件下自体表皮移植的安全性和有效性	自体表皮移植在无血清和无饲养层条件下的细胞组成和功能	数字病理学	白癜风	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA数据	稳定期白癜风患者
464	2024-10-20	Profiling the heterogeneity of colorectal cancer consensus molecular subtypes using spatial transcriptomics 2024-Jan-10, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-023-00488-4 PMID:38200223	研究论文	本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，解析了结直肠癌共识分子亚型的空间细胞和分子组成	首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了结直肠癌共识分子亚型的空间异质性和肿瘤微环境中的细胞通讯事件	NA	进一步阐明结直肠癌的组成和结构，以推进个性化治疗	结直肠癌共识分子亚型的空间异质性和肿瘤微环境	数字病理学	结直肠癌	空间转录组学，单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
465	2024-10-20	Single-cell transcriptomic analysis reveals tumor cell heterogeneity and immune microenvironment features of pituitary neuroendocrine tumors 2024-01-02, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-023-01267-3 PMID:38167466	研究论文	本文通过单细胞转录组测序分析了垂体神经内分泌肿瘤的细胞异质性和免疫微环境特征	揭示了垂体神经内分泌肿瘤的内在细胞异质性和肿瘤微环境特征，发现了一种新的具有侵袭性特征的皮质激素瘤亚型	NA	研究垂体神经内分泌肿瘤的细胞特征和免疫微环境	垂体神经内分泌肿瘤及其免疫微环境	数字病理学	垂体肿瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	4个正常样本和24个垂体神经内分泌肿瘤样本
466	2024-10-20	ZNF689 deficiency promotes intratumor heterogeneity and immunotherapy resistance in triple-negative breast cancer 2024-01, Cell research IF:28.1Q1 DOI:10.1038/s41422-023-00909-w PMID:38168642	研究论文	研究探讨了ZNF689缺乏如何促进三阴性乳腺癌中的肿瘤内异质性和免疫治疗抵抗	首次揭示了ZNF689缺乏通过激活LINE-1逆转录转座子加剧基因组不稳定性，从而促进肿瘤内异质性和免疫治疗抵抗	NA	探讨三阴性乳腺癌中肿瘤内异质性与免疫治疗抵抗的关系及其关键决定因素	三阴性乳腺癌患者的多组学数据和免疫治疗数据	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序、空间分辨转录组学、流式细胞术	NA	多组学数据	260例来自本中心的患者、134例来自TCGA的患者和109例接受免疫治疗的患者
467	2024-10-20	scRNA+TCR-seq reveals the pivotal role of dual receptor T lymphocytes in the pathogenesis of Kawasaki disease and during IVIG treatment 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1457687 PMID:39421738	研究论文	本研究通过scRNA-seq和TCR-seq技术，分析了健康对照组和川崎病（KD）患者在接受IVIG治疗前后的外周血单个核细胞，探讨了双受体T细胞在KD发病机制和IVIG治疗中的作用	首次揭示了双受体T细胞在川崎病发病机制和IVIG治疗中的关键作用	样本量较小，仅包括3名健康对照和6名KD患者	探讨双受体T细胞在川崎病发病机制和IVIG治疗中的作用	健康对照组和川崎病（KD）患者在接受IVIG治疗前后的外周血单个核细胞	免疫学	川崎病	scRNA-seq和TCR-seq	NA	单细胞RNA测序数据和T细胞受体测序数据	3名健康对照和6名KD患者
468	2024-10-20	The role of lactylation in plasma cells and its impact on rheumatoid arthritis pathogenesis: insights from single-cell RNA sequencing and machine learning 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1453587 PMID:39421742	研究论文	研究探讨了乳酸化在浆细胞中的作用及其对类风湿性关节炎发病机制的影响	通过单细胞RNA测序和机器学习技术，首次揭示了乳酸化在浆细胞中的重要作用，并识别出七个核心乳酸化促进基因	研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及体内实验验证	探索乳酸化在浆细胞中的作用及其对类风湿性关节炎发病机制的影响	浆细胞和类风湿性关节炎患者	机器学习	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序	机器学习算法	RNA	10,163个细胞
469	2024-10-19	Single-cell sequencing dissects the transcriptional identity of activated fibroblasts and identifies novel persistent distal tubular injury patterns in kidney fibrosis 2024-01-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-023-50195-0 PMID:38172172	研究论文	通过单细胞转录组测序分析，揭示了激活的成纤维细胞和肾小管上皮细胞损伤的转录特征，并发现了肾纤维化中新的远端小管损伤模式	首次通过单细胞转录组测序揭示了肾纤维化中激活的成纤维细胞的分子和细胞景观，并发现了新的远端小管损伤模式	NA	深入理解肾纤维化的机制，并为慢性肾病（CKD）的靶向治疗提供新策略	肾纤维化中的激活成纤维细胞和肾小管上皮细胞损伤	数字病理学	慢性肾病	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	两个临床相关的肾纤维化模型
470	2024-10-19	An overview of the detection of bovine respiratory disease complex pathogens using immunohistochemistry: emerging trends and opportunities 2024-Jan, Journal of veterinary diagnostic investigation : official publication of the American Association of Veterinary Laboratory Diagnosticians, Inc IF:1.2Q3 DOI:10.1177/10406387231210489 PMID:37982437	综述	本文综述了使用免疫组织化学（IHC）检测牛呼吸道疾病复合体（BRDC）病原体的技术和方法，并探讨了新兴趋势和机会	本文介绍了多重IHC用于检测共感染、数字成像和自动化、改进的荧光染料检测系统以及IHC与空间转录组学的整合等新兴趋势	NA	探讨IHC在BRDC研究中的应用及其未来发展方向	牛呼吸道疾病复合体（BRDC）病原体及其相关技术	NA	牛呼吸道疾病	免疫组织化学（IHC）	NA	NA	NA
471	2024-10-19	Inflammatory Alterations to Renal Lymphatic Endothelial Cell Gene Expression in Mouse Models of Hypertension 2024, Kidney & blood pressure research IF:2.3Q2 DOI:10.1159/000539721 PMID:38972305	研究论文	研究了高血压模型小鼠肾脏淋巴内皮细胞基因表达的炎症变化	首次通过单细胞RNA测序揭示了高血压模型小鼠肾脏淋巴内皮细胞的基因表达变化，并发现了与炎症相关的基因和通路	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证	评估高血压状态下肾脏淋巴内皮细胞的具体变化	高血压模型小鼠的肾脏淋巴内皮细胞	心血管疾病	高血压	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用了高血压模型小鼠的肾脏CD31+和podoplanin+细胞
472	2024-10-19	Lung lymphatic endothelial cells undergo inflammatory and prothrombotic changes in a model of chronic obstructive pulmonary disease 2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2024.1344070 PMID:38440076	研究论文	研究了慢性阻塞性肺疾病（COPD）模型中肺淋巴内皮细胞的炎症和促凝血变化	首次探讨了香烟烟雾和凝血酶对肺淋巴内皮细胞的直接影响，并发现这些因素导致细胞的纤维蛋白溶解活性降低和炎症标志物表达增加	需要进一步研究这些变化如何影响淋巴功能并驱动COPD中的组织损伤	探讨COPD中肺淋巴内皮细胞的炎症和促凝血变化	肺淋巴内皮细胞	NA	慢性阻塞性肺疾病	RNA测序，免疫组织化学染色	NA	RNA	使用了来自COPD患者和对照组的肺组织样本，以及暴露于香烟烟雾的小鼠肺淋巴内皮细胞
473	2024-10-19	Cluster of differentiation-44 as a novel biomarker of lupus nephritis and its role in kidney inflammation and fibrosis 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1443153 PMID:39411720	研究论文	研究CD44作为狼疮性肾炎的新型生物标志物及其在肾脏炎症和纤维化中的作用	首次探讨CD44在狼疮性肾炎中的病理作用，并验证其作为早期诊断标志物的潜力	研究仅限于小鼠模型和部分患者样本，需进一步临床验证	探讨CD44在狼疮性肾炎中的作用及其作为生物标志物的潜力	CD44在狼疮性肾炎患者和小鼠模型中的表达及其与肾脏炎症和纤维化的关系	NA	狼疮性肾炎	ELISA, ScRNA-Seq	NA	血液, 肾脏组织	NZB/W F1小鼠模型, 狼疮性肾炎患者
474	2024-10-19	Single-cell profiling of cellular changes in the somatic peripheral nerves following nerve injury 2024, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2024.1448253 PMID:39415832	综述	本文综述了单细胞转录组学在周围神经损伤后背根神经节和周围神经中的最新发现，揭示了周围神经的细胞异质性和损伤后的变化	提供了单细胞分辨率下周围神经损伤后细胞变化的全面和深入的视角	NA	探讨周围神经损伤后的病理变化，为神经再生治疗的发展提供基础	周围神经损伤后的背根神经节和周围神经的单细胞转录组状态	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
475	2024-10-19	Attenuation of aggressive tumor progression of anaplastic thyroid cancer by p53 2024, American journal of cancer research IF:3.6Q2 DOI:10.62347/KXJJ8824 PMID:39417187	研究论文	研究探讨了野生型p53在抑制未分化甲状腺癌（ATC）进展中的作用	首次证明了外源表达的野生型p53能够抑制突变型p53的致癌作用，并提出了使用CRISPR/Cas9基因编辑技术修改p53等位基因以治疗ATC的可能性	研究仅限于细胞和动物模型，尚未在临床试验中验证	探讨野生型p53在抑制未分化甲状腺癌进展中的作用	未分化甲状腺癌细胞（8505C细胞）和其异种移植小鼠模型	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	使用了8505C细胞及其表达野生型和突变型p53的变体，以及相应的异种移植小鼠模型
476	2024-10-17	The intricate cellular ecosystem of human peripheral veins as revealed by single-cell transcriptomic analysis 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0296264 PMID:38206912	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了人体外周静脉复杂的细胞生态系统	首次在单细胞水平上解析了上臂静脉的微解剖结构，并探讨了其与壁结构、重塑过程和炎症反应的关系	研究样本仅限于非疾病的静脉，且样本量较小	探讨静脉系统的细胞组成及其在血管炎症和重塑过程中的作用	人体上臂静脉的细胞组成和功能	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	4个非疾病的人体静脉样本（3个贵要静脉，1个头静脉），共20,006个细胞
477	2024-10-17	IGFBP7+ subpopulation and IGFBP7 risk score in astrocytoma: insights from scRNA-Seq and bulk RNA-Seq 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1434300 PMID:39403379	研究论文	研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序探讨了星形细胞瘤中IGFBP7+亚群及其风险评分的影响	首次揭示了C0 IGFBP7+胶质瘤细胞在星形细胞瘤分化和进展中的重要作用，并开发了基于IGFBP7风险评分的预测模型	研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏临床试验验证	深入理解星形细胞瘤的细胞组成多样性，探讨影响其预后的多种因素	星形细胞瘤中的IGFBP7+亚群及其风险评分	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）	预测模型	RNA序列数据	七个不同亚组的星形细胞瘤样本
478	2024-10-16	Multi-omics Data Integration Analysis Identified Therapeutic Targets and Potential Reuse Drugs for Osteoporosis 2024, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2 DOI:10.2174/0109298673291526240322081017 PMID:38551048	研究论文	本研究通过多组学数据整合分析，识别了骨质疏松症的治疗靶点和潜在的再利用药物	本研究提供了一种新的基于网络的药物再利用框架，并首次识别了针对CD74的骨质疏松症治疗药物	NA	促进骨质疏松症治疗药物的发现和开发	骨髓间充质干细胞（BM-MSCs）在骨质疏松症和骨关节炎患者中的主要分子及其潜在再利用药物	数字病理学	骨质疏松症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	GSE147287数据集中的BM-MSCs样本，GSE35959数据集中的骨质疏松症样本和对照样本，GSE13850数据集中的差异表达基因
479	2024-10-16	A CD8+ T cell related immune score predicts survival and refines the risk assessment in acute myeloid leukemia 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1408109 PMID:39346926	研究论文	研究开发了一种与CD8+ T细胞相关的免疫风险评分，用于预测急性髓系白血病患者的生存和细化风险评估	构建了一个包含15个基因的预测模型CTCG15，该模型在不同平台的数据集中得到了验证，并能独立于已有的预后标志物，提高预后预测的准确性	NA	开发一种新的免疫风险评分，以提高急性髓系白血病患者的预后预测和风险分层	急性髓系白血病患者及其骨髓中的CD8+ T细胞	数字病理学	血液系统疾病	RNA测序	LASSO回归	基因表达数据	涉及六个不同平台的数据集
480	2024-10-16	Construction and validation of immune-associated lncRNA model for predicting immune status and therapeutic reactions of triple-negative breast cancer 2024, American journal of translational research IF:1.7Q4 DOI:10.62347/VIXN9362 PMID:39398616	研究论文	构建并验证了一个与免疫相关的lncRNA模型，用于预测三阴性乳腺癌的免疫状态和治疗反应	首次构建了一个基于lncRNA的模型，用于区分三阴性乳腺癌的免疫沙漠和免疫炎症亚型，并评估其对肿瘤药物的敏感性	研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，缺乏临床试验验证	探索与三阴性乳腺癌免疫状态相关的关键lncRNA，并构建预测模型	三阴性乳腺癌患者的免疫状态和治疗反应	数字病理学	乳腺癌	单细胞测序、基因集富集分析、非负矩阵分解、加权基因共表达网络分析	lncRNA模型	RNA测序数据、临床信息	来自TCGA和GEO数据库的三阴性乳腺癌样本