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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-10-07 |
Comparative evaluation of ACetic - MEthanol high salt dissociation approach for single-cell transcriptomics of frozen human tissues
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1469955
PMID:39839668
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研究论文 | 评估ACME HS方法在冷冻人体组织中单细胞转录组学的应用效果 | 首次将ACME方法优化应用于人类内分泌组织,并使用高盐洗涤缓冲液替代标准PBS以稳定RNA | 主要针对人类内分泌组织,在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 开发适用于冷冻组织的单细胞分离方法,提高单细胞RNA测序质量 | 人类内分泌组织样本 | 单细胞转录组学 | 内分泌系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 41个组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 462 | 2025-10-07 |
Exploring the shared gene signatures and mechanism among three autoimmune diseases by bulk RNA sequencing integrated with single-cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1520050
PMID:39840076
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研究论文 | 通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析探索三种自身免疫疾病的共享基因特征和机制 | 首次整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析三种自身免疫疾病的共享基因特征,并利用机器学习算法筛选诊断生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探究多发性硬化症、系统性红斑狼疮和类风湿关节炎三种自身免疫疾病的共享基因特征,识别早期诊断生物标志物 | 多发性硬化症、系统性红斑狼疮和类风湿关节炎患者及EAE小鼠模型 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, 机器学习算法, Cibersort算法 | 机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 463 | 2025-10-07 |
Metabolic reprogramming and macrophage expansion define ACPA-negative rheumatoid arthritis: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1512483
PMID:39830504
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示ACPA阴性类风湿关节炎的代谢重编程和巨噬细胞扩增特征 | 首次在单细胞水平系统揭示ACPA阴性类风湿关节炎的独特代谢特征和免疫细胞相互作用 | 样本量有限,需要更大规模验证 | 阐明ACPA阴性类风湿关节炎的细胞和代谢特征以寻找诊断标志物和治疗靶点 | ACPA阴性和阳性类风湿关节炎患者及健康对照的外周血单核细胞和滑膜组织 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞转录组数据 | ACPA阴性RA患者、ACPA阳性RA患者和健康对照的PBMC和滑膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 464 | 2025-10-07 |
Myeloid dendritic cells and periodontal disease association: integrated study of single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522281
PMID:39830509
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研究论文 | 通过单细胞测序和孟德尔随机化分析研究髓系树突状细胞与牙周病的关联 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析揭示LIMA1基因在牙周病进展中的因果作用 | 研究依赖于公共数据集,样本来源有限 | 探索牙周病发病机制中的关键细胞类型和基因 | 牙周病患者免疫细胞亚型 | 生物信息学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | Seurat, CellChat, ClusterProfilerR | 单细胞转录组数据, GWAS数据 | GSE152042数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 465 | 2025-10-07 |
scRNA-seq reveals elevated interferon responses and TNF-α signaling via NFkB in monocytes in children with uncomplicated malaria
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10233
PMID:39830896
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童非复杂性疟疾患者单核细胞的免疫反应特征 | 首次在儿童非复杂性疟疾中发现单核细胞中干扰素反应和TNF-α/NFκB信号通路上调 | 样本量有限(仅11名参与者进行单细胞测序),仅针对非复杂性疟疾 | 确定与症状性疟疾相关的宿主-寄生虫因素和免疫反应差异 | 224名疟疾感染者(134名患者和90名无症状对照) | 单细胞基因组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 224名参与者,其中11名进行单细胞测序(18,176个外周血单核细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 466 | 2025-10-07 |
Unveiling and validating biomarkers related to the IL-10 family in chronic sinusitis with nasal polyps: insights from transcriptomics and single-cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1513951
PMID:39830981
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研究论文 | 通过转录组学和单细胞RNA测序分析识别并验证与IL-10家族相关的慢性鼻窦炎伴鼻息肉生物标志物 | 首次系统探索IL-10家族在CRSwNP中的生物学作用,通过多算法筛选和单细胞测序验证发现四个新型生物标志物 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 识别和验证与IL-10家族相关的慢性鼻窦炎伴鼻息肉生物标志物 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者组织样本 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | LASSO, SVM-RFE, Boruta算法 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE136825, GSE179265, GSE196169) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 467 | 2025-10-07 |
Identification and validation of five ferroptosis-related molecular signatures in keloids based on multiple transcriptome data analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1490745
PMID:39834787
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研究论文 | 本研究通过多组转录组数据分析鉴定并验证了与瘢痕疙瘩相关的五个铁死亡相关分子标志物 | 首次系统性地识别了瘢痕疙瘩中与铁死亡相关的关键基因,并通过单细胞测序等多重分析验证了这些基因在纤维化过程中的作用 | 样本量相对有限(24个瘢痕疙瘩和17个正常皮肤样本),需要更大规模的研究验证 | 探索铁死亡在瘢痕疙瘩形成机制中的作用,并识别相关关键基因 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 生物信息学 | 皮肤疾病 | 转录组测序, qRT-PCR, Western blot, 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 24个瘢痕疙瘩样本和17个正常皮肤样本(转录组数据),外加5个瘢痕疙瘩和5个正常皮肤活检(实验验证) | NCBI | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | GEO数据库 | NCBI GEO数据库中的GSE145725、GSE7890、GSE44270和GSE181316数据集 |
| 468 | 2025-10-07 |
An exhausted-like microglial population accumulates in aged and APOE4 genotype Alzheimer's brains
2024-01-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.12.001
PMID:38159571
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现阿尔茨海默病大脑中积累了一种类似耗竭状态的炎症性小胶质细胞群 | 首次鉴定出在衰老和APOE4基因型阿尔茨海默病大脑中积累的终末炎症性小胶质细胞(TIM)群体 | 研究主要基于AD模型小鼠,人类样本验证有限 | 探究年龄和APOE4基因变异如何改变神经免疫功能 | 携带三种常见人类APOE等位基因的AD模型小鼠和人类AD患者脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序,染色质可及性分析,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | AD模型小鼠和人类AD患者脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 469 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Applications in Pituitary Research
2024, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000540352
PMID:39053437
|
综述 | 概述单细胞RNA测序技术及其在垂体研究中的应用前景 | 首次系统综述单细胞RNA测序技术在垂体研究中的潜力和应用现状 | 该技术在垂体研究中的应用尚不广泛,具体机制仍需深入探索 | 探讨单细胞RNA测序技术在垂体研究中的应用价值和发展方向 | 垂体腺体中的激素分泌细胞和非分泌细胞(如成纤维细胞、内皮细胞) | 单细胞组学 | 垂体疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 470 | 2025-10-07 |
Alteration of Thyroid Hormones in Mouse Models of Alzheimer's Disease and Aging
2024, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000536089
PMID:38228117
|
研究论文 | 本研究通过阿尔茨海默病和自然衰老小鼠模型探究甲状腺激素变化及其与免疫细胞浸润的关系 | 首次在AD和衰老小鼠模型中同时发现甲状腺激素改变,并揭示甲状腺免疫细胞浸润是潜在机制 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究阿尔茨海默病和衰老过程中甲状腺激素变化的机制 | FAD4T转基因AD小鼠模型和自然衰老小鼠 | 生物医学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | FAD4T和自然衰老小鼠模型 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 471 | 2025-10-07 |
Optimization of Tissue Digestion Methods for Characterization of Photoaged Skin by Single Cell RNA Sequencing Reveals Preferential Enrichment of T Cell Subsets
2024-01-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13030266
PMID:38334658
|
研究论文 | 比较三种人体皮肤组织消化方法,评估细胞产量和活力,并发现顺序消化法能提高非抗原呈递肥大细胞和CD8 T细胞比例 | 首次系统比较皮肤组织消化方法对单细胞RNA测序中免疫细胞亚群富集的影响,揭示顺序消化法对特定T细胞亚群的偏好性富集 | 仅比较三种消化方法,样本量有限,未评估长期保存样本的效果 | 优化皮肤组织消化方法以提高单细胞RNA测序的细胞产量和活力 | 人体皮肤组织 | 单细胞测序 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 472 | 2025-01-07 |
Spatial transcriptomics in breast cancer: providing insight into tumor heterogeneity and promoting individualized therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1499301
PMID:39749323
|
研究论文 | 本文综述了空间转录组学的关键技术方法、最新进展及其在乳腺癌中的应用,并讨论了当前空间转录组学方法的局限性和未来发展前景 | 空间转录组学解决了单细胞RNA测序缺乏空间信息的问题,能够定位和区分特定组织区域内功能基因的活跃表达,有助于识别新的乳腺癌亚型和空间区分特征,促进个体化精准治疗 | 当前空间转录组学方法仍存在局限性,未来需要进一步发展和改进 | 推进乳腺癌研究,全面理解肿瘤异质性、肿瘤微环境和耐药机制 | 乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2025-01-07 |
New Posttranslational Modification Lactylation Brings New Inspiration for the Treatment of Rheumatoid Arthritis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497240
PMID:39758940
|
综述 | 本文综述了乳酸化在类风湿性关节炎(RA)相关细胞和机制中的研究,为RA的发病机制、诊断和治疗提供了新的见解 | 提出了乳酸化作为一种新的翻译后修饰在RA中的关键作用,并发现了潜在的生物标志物 | 本文为综述文章,未涉及具体实验数据,缺乏直接的研究验证 | 探讨乳酸化在类风湿性关节炎中的作用及其潜在的治疗应用 | 类风湿性关节炎相关细胞,如成纤维样滑膜细胞(FLSs)和巨噬细胞 | 生物医学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 474 | 2025-01-07 |
Unveiling Ventilator-Associated Pneumonia: S100A8 as a Promising Biomarker Through Integrated RNA-Seq Analysis
2024, Journal of multidisciplinary healthcare
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/JMDH.S495121
PMID:39759083
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研究论文 | 本研究通过整合RNA-Seq分析,揭示了S100A8作为呼吸机相关性肺炎(VAP)的潜在生物标志物 | 结合bulk RNA-seq和scRNA-seq分析,筛选并验证了S100A8作为VAP诊断的潜在生物标志物,为VAP诊断提供了新的视角 | 样本量相对较小,仅分析了46个VAP样本和48个正常样本 | 探索VAP的发病机制并识别潜在的生物标志物 | 呼吸机相关性肺炎(VAP)患者 | 生物信息学 | 肺炎 | RNA-Seq, scRNA-seq, Western blot | NA | RNA序列数据 | 46个VAP样本和48个正常样本 | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2025-01-07 |
Spatially-resolved analyses of muscle invasive bladder cancer microenvironment unveil a distinct fibroblast cluster associated with prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522582
PMID:39759522
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研究论文 | 本研究利用成像质谱流式细胞术(IMC)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,分析了肌肉浸润性膀胱癌(MIBC)微环境的空间异质性,并揭示了一个与预后相关的特定成纤维细胞簇 | 通过IMC和scRNA-seq技术结合空间转录组学(ST),首次揭示了MIBC微环境中特定成纤维细胞簇(S3)与内皮细胞之间的相互作用及其对预后的影响 | 样本量相对较小(40个组织样本),且研究结果需要进一步验证 | 评估MIBC微环境的空间异质性,并探索其临床意义 | 肌肉浸润性膀胱癌(MIBC)的微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 成像质谱流式细胞术(IMC)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST) | 机器学习算法 | 图像、RNA序列数据 | 40个组织样本中的185个感兴趣区域 | NA | NA | NA | NA |
| 476 | 2025-01-05 |
Identification of virus-rich intermediate cells as crucial players in SARS-CoV-2 infection and differentiation dynamics of human airway epithelium
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1507852
PMID:39735182
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据,揭示了SARS-CoV-2感染早期人类气道上皮细胞的动态变化,并发现了一种新的病毒富集中间细胞(VRI细胞) | 首次识别出病毒富集中间细胞(VRI细胞),并揭示了其在SARS-CoV-2感染中的关键作用 | 研究主要依赖于体外培养的气道上皮细胞模型,可能无法完全反映体内复杂的感染环境 | 研究SARS-CoV-2与人类气道上皮细胞的早期相互作用,以揭示病毒复制和传播机制 | 人类鼻腔和气管上皮细胞 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个公开的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2025-01-05 |
Unveiling Key Biomarkers and Mechanisms in Septic Cardiomyopathy: A Comprehensive Transcriptome Analysis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S486763
PMID:39735900
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了脓毒性心肌病(SCM)的关键生物标志物及其潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序和功能富集分析,揭示了SCM与免疫反应、铁死亡、焦亡、铜死亡及m6A RNA甲基化修饰之间的联系 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 识别SCM的关键生物标志物并探索其潜在机制 | 正常小鼠和SCM小鼠 | 生物信息学 | 脓毒性心肌病 | 转录组分析、单细胞RNA测序、qPCR | NA | RNA测序数据 | GSE53007和GSE207363数据集中的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 478 | 2025-01-05 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Heterogeneity of T Cells in Mice with Systemic Lupus Erythematosus and Neuronal Inflammation
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S474211
PMID:39735894
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,探索了系统性红斑狼疮(SLE)小鼠中T细胞的异质性及其从脾脏到大脑的迁移 | 发现了SLE小鼠中显著表达Eomes和其他特定标志物的双阴性T细胞群体,并揭示了这些细胞与细胞衰老和耗竭的强关联 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类患者 | 探索系统性红斑狼疮小鼠中T细胞的异质性及其在神经炎症中的作用 | MRL/lpr小鼠和BALB/c小鼠的脑和脾脏组织 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 27704个来自MRL/lpr小鼠的细胞和25355个来自BALB/c小鼠的健康对照细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2025-01-05 |
Single-Cell Sequencing and Machine Learning Integration to Identify Candidate Biomarkers in Psoriasis: INSIG1
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S492875
PMID:39735895
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和机器学习整合,识别了银屑病中的候选生物标志物INSIG1,并验证了其治疗潜力 | 结合单细胞RNA测序和机器学习方法,识别了银屑病中新的候选基因INSIG1,并验证了其与T细胞的负相关性及其在脂肪酸代谢中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,仍需进一步的临床和体内实验验证 | 识别银屑病中的新治疗靶点和候选生物标志物 | 银屑病患者和T细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2025-01-05 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and prognostic markers of myeloid precursor cells in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494106
PMID:39737198
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和单细胞RNA测序数据,识别了与急性髓性白血病(AML)预后相关的关键基因,并建立了一个预后评估模型 | 识别了八个与AML预后显著相关的关键基因,并构建了一个有效的预后评估模型,揭示了AML细胞在免疫功能和代谢途径上的差异 | NA | 提高AML预后预测的准确性 | 急性髓性白血病(AML)患者 | 生物信息学 | 急性髓性白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 预后评估模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |