单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1387 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-10-09 |
Prognosis of colorectal cancer, prognostic index of immunogenic cell death associated genes in response to immunotherapy, and potential therapeutic effects of ferroptosis inducers
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458270
PMID:39372411
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研究论文 | 本研究利用生物信息学和医学大数据整合了来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)的数据集，全面概述了免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因在结直肠癌(CRC)中的表达 | 研究揭示了ICD相关基因在CRC中的分子通路和基因网络，并探讨了细胞死亡诱导剂（包括铁死亡诱导剂）的治疗潜力及其在精准医学中的应用 | NA | 阐明ICD在结直肠癌中的分子机制及其在治疗中的潜在应用 | 结直肠癌(CRC)中的免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 差异表达分析、共识聚类、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA的多个结直肠癌样本 |
| 462 | 2024-10-09 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Transcriptional Signatures of Macrophages in Intrahepatic Cholestasis of Pregnancy
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S471374
PMID:39372590
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征 | 首次揭示了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征，并发现了炎症状态的倾向 | NA | 探究妊娠期肝内胆汁淤积症中免疫细胞和免疫基因的调控机制 | 妊娠期肝内胆汁淤积症中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 463 | 2024-10-09 |
Dynamics of alternative polyadenylation in single root cells of Arabidopsis thaliana
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1437118
PMID:39372861
|
研究论文 | 研究了拟南芥根细胞中单细胞RNA测序数据中的选择性多聚腺苷酸化（APA）动态 | 开发了一种新的流程来识别和整合来自不同单细胞RNA测序数据的APA位点，并分析单细胞中的APA动态 | NA | 揭示选择性多聚腺苷酸化在拟南芥根细胞发育中的动态变化 | 拟南芥根细胞中的选择性多聚腺苷酸化位点及其动态变化 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过150,000个细胞，涵盖四个主要组织分支、十二种细胞类型和三个发育阶段 |
| 464 | 2024-10-08 |
An IL-4 signalling axis in bone marrow drives pro-tumorigenic myelopoiesis
2024-Jan, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06797-9
PMID:38057662
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研究论文 | 研究揭示了IL-4信号轴在骨髓中驱动肿瘤促进性髓系生成的作用 | 首次发现IL-4在骨髓中通过调节粒细胞-单核细胞前体细胞的转录程序，促进免疫抑制性肿瘤促进髓系细胞的生成 | 研究主要基于小鼠模型和临床试验的初步结果，需要更多临床数据验证 | 探讨IL-4信号轴在肿瘤免疫抑制中的作用及其潜在治疗策略 | 非小细胞肺癌中的髓系细胞和IL-4信号通路 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和小鼠的非小细胞肺癌样本 |
| 465 | 2024-08-07 |
Pegylated interferon-α for chronic hepatitis B … not ready to be shelved yet! New insights on its role using single-cell transcriptomics
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000560
PMID:37676248
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 466 | 2024-10-06 |
Enhanced mitophagy driven by ADAR1-GLI1 editing supports the self-renewal of cancer stem cells in HCC
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000299
PMID:36683360
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研究论文 | 研究探讨了ADAR1通过编辑GLI1促进肝癌干细胞自我更新的机制 | 首次揭示了ADAR1通过编辑GLI1在肝癌干细胞中调控线粒体自噬的新机制 | NA | 探讨ADAR1编辑在肝癌干细胞生成和维持中的作用机制 | 肝癌干细胞和ADAR1编辑的GLI1 | 癌症研究 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 467 | 2024-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immunoregulatory roles of PegIFN-α in patients with chronic hepatitis B
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000524
PMID:37368993
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了PegIFN-α在慢性乙型肝炎患者中的免疫调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了慢性乙型肝炎患者在接受PegIFN-α治疗前后外周免疫细胞的转录组图谱，并发现了三种特定的细胞亚群及其在治疗前后的变化 | 研究仅限于慢性乙型肝炎患者，且样本量未明确提及，可能影响结果的普适性 | 探讨慢性乙型肝炎患者的免疫细胞特征及PegIFN-α治疗的免疫调节作用 | 慢性乙型肝炎患者的外周免疫细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 468 | 2024-10-06 |
Embryonic development grand challenge: crosslinking advances
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1467261
PMID:39364136
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评论 | 本文讨论了胚胎发育研究的新进展及其跨学科意义 | 本文介绍了基于干细胞的3D方法在胚胎发育研究中的最新进展 | 本文主要讨论了胚胎发育研究的挑战和潜力，未提供具体的研究数据或方法 | 探讨胚胎发育研究的跨学科意义及其在基础生物医学科学中的潜力 | 胚胎发育的生物机制及其在科学、社会和政治领域的复杂性 | NA | NA | 干细胞3D方法 | NA | NA | NA |
| 469 | 2024-10-06 |
Multi-omics profiling and experimental verification of tertiary lymphoid structure-related genes: molecular subgroups, immune infiltration, and prognostic implications in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1453220
PMID:39364403
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研究论文 | 研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能，包括分子亚型、免疫浸润和预后意义 | 首次全面研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能，并开发了精确的诺模图以增强其临床应用 | 研究依赖于公开数据，可能存在数据偏差；实验验证仅通过qRT-PCR进行，未涉及其他验证方法 | 探讨三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者及其三级淋巴结构相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于公开数据，具体样本数量未明确提及 |
| 470 | 2024-10-06 |
Immune and inflammatory insights in atherosclerosis: development of a risk prediction model through single-cell and bulk transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1448662
PMID:39364414
|
研究论文 | 本文通过单细胞和批量转录组分析，开发了一种用于预测动脉粥样硬化风险的模型，揭示了免疫和炎症在动脉粥样硬化中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了动脉粥样硬化斑块中免疫细胞的异质性，并开发了一个基于机器学习的风险评分模型 | 需要进一步的临床验证和更大规模的样本以验证模型的普适性和准确性 | 研究动脉粥样硬化中的免疫异质性，并开发一种个性化免疫疗法的风险预测模型 | 动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 471 | 2024-10-05 |
Stimulation of fracture mineralization by salt-inducible kinase inhibitors
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1450611
PMID:39359266
|
研究论文 | 研究盐诱导激酶抑制剂对骨折矿化的刺激作用 | 首次测试了盐诱导激酶抑制剂YKL-05-099对骨折愈合的加速作用，并开发了基于水凝胶的siRNA递送系统 | NA | 研究盐诱导激酶抑制剂对骨折愈合的影响 | 骨折愈合过程中的矿化和组织结构 | NA | NA | RT-qPCR, 单细胞RNA测序, μCT成像 | NA | RNA, 图像 | 126只雌性小鼠 |
| 472 | 2024-10-05 |
Recent progress and applications of single-cell sequencing technology in breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1417415
PMID:39359479
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在乳腺癌研究中的最新进展和应用 | 单细胞RNA测序和单细胞DNA测序技术结合多组学技术，显著增强了我们对肿瘤微环境中细胞多样性的理解 | NA | 探讨单细胞测序技术在乳腺癌研究中的潜力，特别是其在解码驱动疾病进展、治疗抵抗和转移的复杂基因组景观中的作用 | 乳腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞DNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 473 | 2024-10-05 |
Food antigens suppress small intestinal tumorigenesis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1373766
PMID:39359724
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研究论文 | 研究食物抗原在小肠肿瘤发生中的抑制作用 | 首次报道食物抗原通过Peyer's patches（PPs）在小肠肿瘤发生中起到抑制作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨食物抗原在小肠肿瘤发生中的作用 | 小肠肿瘤、Peyer's patches（PPs）、食物抗原 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型中的免疫细胞 |
| 474 | 2024-10-05 |
Single-cell RNA sequencing data locate ALDH1A2-mediated retinoic acid synthetic pathway to glomerular parietal epithelial cells
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10167
PMID:39360029
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review | 本文通过挖掘单细胞和单核RNA测序数据库，发现肾小球壁上皮细胞中存在完整的视黄酸合成途径 | 首次在肾小球壁上皮细胞中发现ALDH1A2介导的视黄酸合成途径，并探讨了其在肾脏生理和病理中的潜在作用 | 需要进一步的实验验证和临床研究来证实ALDH1A2在肾脏中的具体作用 | 探讨ALDH1A2在肾脏生理和病理中的作用 | 肾小球壁上皮细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括小鼠和人类肾脏的单细胞和单核RNA测序数据 |
| 475 | 2024-10-05 |
Discovery of GJC1 as a prognostic biomarker in glioma cells: insights into its cell-cycle relationship and differential expression in non-neuronal cells
2024, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2024.1440409
PMID:39360264
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研究论文 | 本研究探讨了GJC1作为胶质瘤细胞中的预后生物标志物的潜力及其与细胞周期的关系 | 发现GJC1在胶质瘤中具有独立的预后价值，并揭示了其在非神经细胞中的差异表达 | 研究主要基于回顾性分析，未来需要进一步的实验验证 | 研究GJC1在胶质瘤中的预后价值及其与细胞周期的关系 | 胶质瘤细胞及其与GJC1表达的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库的数据 |
| 476 | 2024-10-04 |
APP-CD74 axis mediates endothelial cell-macrophage communication to promote kidney injury and fibrosis
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1437113
PMID:39351084
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研究论文 | 研究揭示了APP-CD74轴在肾损伤和纤维化过程中介导内皮细胞与巨噬细胞之间的通信机制 | 首次揭示了APP-CD74轴在肾损伤修复过程中内皮细胞与巨噬细胞之间的重要通信作用 | 研究主要基于体外细胞共培养和小鼠模型，需要进一步的临床验证 | 探讨肾损伤修复过程中内皮细胞与巨噬细胞之间的复杂动态和多样性 | 肾损伤和纤维化过程中的内皮细胞与巨噬细胞 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、Western blot分析、流式细胞术、免疫组化、免疫荧光染色 | NA | RNA | 使用了单侧输尿管梗阻（UUO）模型和肾缺血再灌注损伤（IRI）模型的数据，以及体外细胞共培养系统 |
| 477 | 2024-10-04 |
Integrated analyses reveal IDO1 as a prognostic biomarker coexpressed with PD-1 on tumor-associated macrophages in esophageal squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1466779
PMID:39351094
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研究论文 | 研究探讨了IDO1在食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境中的表达模式及其对患者预后和治疗反应的影响 | 首次揭示了IDO1与PD-1在肿瘤相关巨噬细胞中的共表达，并探讨了其对化疗药物敏感性和免疫检查点阻断抵抗性的影响 | 研究样本量较小，且仅基于TCGA数据库和临床中心的数据，可能存在数据偏倚 | 研究IDO1在食管鳞状细胞癌中的表达及其对患者预后和治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境中的IDO1表达 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序、数字免疫组化、多重免疫荧光 | NA | RNA序列数据、图像 | 95名食管鳞状细胞癌患者 |
| 478 | 2024-10-04 |
Identification and validation of ferroptosis-related biomarkers in intervertebral disc degeneration
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1416345
PMID:39351146
|
研究论文 | 本研究通过分析公共数据集和FerrDb数据库，鉴定并验证了与椎间盘退变相关的铁死亡相关生物标志物 | 本研究首次系统地鉴定了与椎间盘退变相关的铁死亡相关基因，并验证了其在疾病进展中的表达模式和潜在的免疫调节功能 | 本研究的样本量较小，且仅限于特定的公共数据集和数据库，未来需要更大规模和多样化的样本进行验证 | 揭示椎间盘退变中铁死亡的关键基因及其分子机制，为疾病的诊断和治疗提供新的靶点 | 椎间盘退变中的铁死亡相关基因及其在疾病进展中的表达和功能 | 生物信息学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床样本和鼠模型 |
| 479 | 2024-10-04 |
Differential modulation of mutant CALR and JAK2 V617F-driven oncogenesis by HLA genotype in myeloproliferative neoplasms
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427810
PMID:39351227
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研究论文 | 研究HLA基因型对CALR突变和JAK2 V617F驱动的骨髓增殖性肿瘤（MPN）中癌症发生的影响 | 首次探讨了HLA基因型在CALR突变和JAK2 V617F驱动的MPN中的潜在作用，并发现HLA基因型对这两种突变驱动的癌症发生有不同的限制作用 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定类型的MPN患者 | 探讨HLA基因型在CALR突变和JAK2 V617F驱动的MPN中的潜在作用 | CALR突变和JAK2 V617F驱动的MPN患者 | NA | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因型数据 | 42名CALR突变阳性患者，158名JAK2 V617F阳性患者，1083名健康对照 |
| 480 | 2024-10-04 |
From single-cell to spatial transcriptomics: decoding the glioma stem cell niche and its clinical implications
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1475235
PMID:39355251
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，解析了胶质瘤干细胞微环境及其临床意义 | 首次全面描述了胶质瘤干细胞及其与髓源抑制细胞的相互作用，并开发了一种新的预后标志物GSCS | NA | 识别和表征胶质瘤干细胞，分析其与其他细胞类型的相互作用，并开发预后标志物 | 胶质瘤干细胞及其微环境中的细胞类型 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、基因调控网络分析、CellChat分析 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 44个原发性胶质瘤样本 |