单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1290 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-25 |
Multi-transcriptomics analysis of microvascular invasion-related malignant cells and development of a machine learning-based prognostic model in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1436131
PMID:39176099
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索肝细胞癌中与微血管侵犯相关的恶性细胞，并开发了一种基于机器学习的预后模型 | 本研究首次通过综合多组学分析揭示了与微血管侵犯相关的恶性细胞的生物学功能，并开发了一种新的预后模型 | NA | 探索肝细胞癌中微血管侵犯的机制并开发预后模型 | 肝细胞癌中的微血管侵犯相关恶性细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq | 机器学习算法 | RNA-seq数据 | 使用TCGA和HCCDB的bulk RNA-seq数据，GEO数据库的单细胞RNA-seq数据，以及CNCB数据库的空间转录组数据 |
| 422 | 2024-08-25 |
Revealing the regulation of allergic asthma airway epithelial cell inflammation by STEAP4 targeting MIF through machine learning algorithms and single-cell sequencing analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1427352
PMID:39176391
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法和单细胞测序分析，揭示了STEAP4通过调控MIF在过敏性哮喘气道上皮细胞炎症中的作用。 | 首次发现STEAP4在过敏性哮喘中的作用，并通过机器学习和单细胞测序技术验证了其调控MIF的机制。 | 研究主要基于数据库中的微阵列数据和动物模型，尚未在人体中进行直接验证。 | 探索过敏性哮喘气道上皮细胞炎症的调控机制。 | 过敏性哮喘患者的气道上皮细胞。 | 机器学习 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 微阵列数据 | 包括哮喘患者和健康个体的气道上皮样本，以及哮喘小鼠模型。 |
| 423 | 2024-08-24 |
Integrated multi-omics analyses identify anti-viral host factors and pathways controlling SARS-CoV-2 infection
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44175-1
PMID:38168026
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研究论文 | 本研究通过全基因组CRISPR剔除筛选和多组学数据的综合分析，揭示了控制SARS-CoV-2感染的宿主抗病毒因子及其途径 | 本研究发现了许多目前被低估的宿主因子，如V-ATP酶、ESCRT和N-糖基化途径的组成部分，以及作为抗病毒途径的凝聚素复合物 | NA | 揭示控制SARS-CoV-2感染的宿主抗病毒因子及其途径 | SARS-CoV-2感染的宿主抗病毒因子及其途径 | 基因组学 | COVID-19 | CRISPR, 全基因组关联研究, 单细胞RNA-Seq, 宿主-病毒蛋白质或蛋白质/RNA相互作用组 | NA | 多组学数据 | NA |
| 424 | 2024-08-24 |
Comprehensive multi-omics analysis of pyroptosis for optimizing neoadjuvant immunotherapy in patients with gastric cancer
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.93124
PMID:38773976
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了焦亡在胃癌中的免疫调节作用及其对新辅助免疫治疗的影响 | 构建了焦亡风险评分（PRS），并验证了其在胃癌新辅助免疫治疗中的预测价值 | NA | 探讨焦亡在胃癌肿瘤微环境重塑和免疫治疗中的作用 | 胃癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序和多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | 共涉及1903个样本，包括公共数据库和独立中国医学队列的胃癌样本，以及接受新辅助免疫治疗和化疗的胃癌患者 |
| 425 | 2024-08-24 |
scX: a user-friendly tool for scRNAseq exploration
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae062
PMID:38779177
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research paper | 本文介绍了一个名为scX的R包，该包基于Shiny框架，旨在简化单细胞RNA测序（scRNAseq）数据的分析、探索和可视化 | scX提供了一个交互式图形界面，简化了scRNAseq分析的复杂性，并能与常用的单细胞数据对象Seurat和SingleCellExperiment无缝集成 | NA | 开发一个用户友好的工具，用于简化单细胞RNA测序数据的探索和分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNAseq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 426 | 2024-08-24 |
Constructing immune and prognostic features associated with ADCP in hepatocellular carcinoma and pan-cancer based on scRNA-seq and bulk RNA-seq
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1397541
PMID:38774870
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，筛选与肝细胞癌（LIHC）中抗体依赖性细胞吞噬作用（ADCP）相关的免疫调节因子和预后基因，构建基于ADCP的LIHC风险评分模型。 | 本研究首次在肝细胞癌中识别出与ADCP相关的关键基因GYPA、CLDN18和IRX5，并验证了这些基因与免疫浸润细胞和免疫治疗效果的相关性。 | 研究主要基于scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，未涉及临床试验验证，未来需进一步的临床研究来验证这些发现。 | 开发基于ADCP的肝细胞癌风险分层系统和筛选相关靶点。 | 肝细胞癌（LIHC）及其相关免疫治疗靶点。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq） | LASSO Cox回归分析 | RNA测序数据 | 涉及肝细胞癌组织和细胞样本，具体数量未详细说明。 |
| 427 | 2024-08-24 |
Hub genes identification and validation of ferroptosis in SARS-CoV-2 induced ARDS: perspective from transcriptome analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1407924
PMID:39170609
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法分析了SARS-CoV-2诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中铁死亡相关枢纽基因的鉴定与验证 | 本研究首次鉴定了与SARS-CoV-2诱导的ARDS中铁死亡相关的枢纽基因MTF1、SAT1和TXN，并提供了免疫治疗和靶向治疗的潜在目标 | 需要进一步的实验验证来巩固这些发现并探索针对COVID-19背景下ARDS的治疗干预措施 | 理解COVID-19患者中ARDS的潜在机制，为临床治疗提供有效策略 | SARS-CoV-2诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）患者 | 生物信息学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、差异基因表达分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 916个差异表达基因，15个枢纽基因，BEAS-2B细胞体外模型 |
| 428 | 2024-08-24 |
EMT-related gene classifications predict the prognosis, immune infiltration, and therapeutic response of osteosarcoma
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1419040
PMID:39170698
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研究论文 | 本研究通过整合上皮-间质转化相关基因（EMT-RGs）来预测骨肉瘤（OS）患者的预后、免疫浸润和治疗反应 | 开发了一种新的上皮-间质转化相关风险特征，可作为骨肉瘤的独立预测因子 | NA | 旨在通过整合上皮-间质转化相关基因来预测骨肉瘤患者的预后、免疫浸润和治疗反应 | 骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 53个与预后相关的上皮-间质转化相关基因 |
| 429 | 2024-08-23 |
Mechanosensitive protein polycystin-1 promotes periosteal stem/progenitor cells osteochondral differentiation in fracture healing
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.93269
PMID:38646641
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研究论文 | 本研究使用多种小鼠模型和单细胞RNA测序技术，分析了机械敏感蛋白polycystin-1在骨折愈合中促进骨膜干细胞/祖细胞骨软骨分化的关键作用 | 首次揭示了polycystin-1通过PC1-TAZ轴感知机械力，促进骨折愈合的新机制 | NA | 探究机械力在骨折愈合中的调控机制 | 机械敏感蛋白polycystin-1及其在骨折愈合中的作用 | NA | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用多种小鼠模型进行研究 |
| 430 | 2024-08-23 |
Targeting the Cascade Amplification of Macrophage Colony-stimulating Factor to Alleviate the Immunosuppressive Effects Following Radiotherapy
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0450
PMID:39165639
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研究论文 | 本文研究了放射治疗（RT）后免疫抑制效应的缓解方法，通过靶向巨噬细胞集落刺激因子（MCSF）的级联放大作用来增强RT的免疫激活效应。 | 本文首次发现并验证了放射治疗后肿瘤细胞来源的MCSF上调，并通过抑制MCSF来增强RT的免疫激活效应。 | NA | 研究如何通过调节放射治疗后的免疫抑制环境来增强其治疗效果。 | 放射治疗后的免疫抑制效应及巨噬细胞集落刺激因子（MCSF）的作用机制。 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 431 | 2024-08-23 |
Insights into preeclampsia: a bioinformatics approach to deciphering genetic and immune contributions
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1372164
PMID:39165753
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化（MR）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，探讨了子痫前期的遗传和分子机制，为诊断和治疗提供了新视角 | 通过scRNA-seq技术发现了子痫前期患者与对照组在T辅助细胞（Th细胞）中的显著细胞类型分布差异，并揭示了与子痫前期直接相关的6个基因 | 由于数据限制，pQTL分析结果不明确 | 阐明子痫前期的遗传和分子基础，探索新的诊断和治疗途径 | 子痫前期的遗传和免疫贡献 | 生物信息学 | 妊娠相关疾病 | 孟德尔随机化（MR）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、表达数据、蛋白质定量性状位点（eQTL和pQTL）数据、单细胞数据 | 外周血单个核细胞（PBMCs） |
| 432 | 2024-08-23 |
Corrigendum: Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from acute myocardial infarction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1462970
PMID:39170610
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 433 | 2024-08-22 |
Fibroblasts under pressure: cardiac fibroblast responses to hypertension and antihypertensive therapies
2024-01-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00401.2023
PMID:37999643
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综述 | 本文综述了高血压和抗高血压治疗对心脏成纤维细胞的影响，以及单细胞RNA测序技术在高血压和压力超负荷模型中对成纤维细胞异质性的发现 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了高血压和压力超负荷模型中左心室成纤维细胞的异质性 | NA | 探讨高血压和压力超负荷对心脏成纤维细胞的特定变化，以及抗高血压治疗的效果 | 心脏成纤维细胞在高血压和压力超负荷下的反应及其在抗高血压治疗中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 434 | 2024-08-22 |
Identification and validation of tryptophan-related gene signatures to predict prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma reveals a critical role for PTTG1
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1386427
PMID:39144144
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研究论文 | 本研究通过分析色氨酸代谢相关基因，构建了预测肺腺癌预后和免疫治疗反应的模型，并探讨了PTTG1在其中的关键作用 | 首次揭示了色氨酸代谢在肺腺癌中的模式和分子特征，并建立了色氨酸代谢相关的肺腺癌预后模型 | NA | 研究色氨酸代谢在肺腺癌中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的多个数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 435 | 2024-08-22 |
Development of a Novel CD8+ T Cell-Associated Signature for Prognostic Assessment in Hepatocellular Carcinoma
2024 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748241270583
PMID:39152700
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研究论文 | 本研究旨在分析CD8+ T细胞相关调控基因在肝细胞癌（HCC）中的临床意义和预后价值 | 构建了一个新的8基因CD8+ T细胞相关签名，用于肝细胞癌的预后评估 | NA | 分析CD8+ T细胞相关调控基因在肝细胞癌中的临床意义和预后价值 | CD8+ T细胞相关调控基因在肝细胞癌中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | qRT-PCR, 免疫组织化学, 组织微阵列, CIBERSORT算法 | Lasso-Cox回归分析 | RNA测序数据 | 使用了TCGA-LIHC和单细胞RNA测序数据 |
| 436 | 2024-08-22 |
G0 arrest gene patterns to predict the prognosis and drug sensitivity of patients with lung adenocarcinoma
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309076
PMID:39159158
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研究论文 | 本研究旨在开发基于G0停滞（G0A）相关基因的肺腺癌（LUAD）患者基因特征，并探讨其与预后、肿瘤免疫微环境和治疗反应的关系 | 成功建立了一个包含六个基因（CHCHD4, DUT, LARP1, PTTG1IP, RBM14, 和 WBP11）的特征，该特征对LUAD患者的总体生存具有显著的预测能力，并显示出独立的预后价值 | NA | 开发肺腺癌患者的基因特征，并研究其与预后、肿瘤免疫微环境和治疗反应的关系 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | qRT-PCR | Cox和lasso回归模型 | 转录组数据 | 使用TCGA-LUAD数据库作为发现队列，验证模型使用了多个转录组数据集（GSE50081, GSE72094, GSE127465, GSE131907 和 EMTAB6149） |
| 437 | 2024-08-22 |
The single-cell atlas of the epididymis in mice reveals the changes in epididymis function before and after sexual maturity
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1440914
PMID:39161591
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了5周龄和10周龄C57 BL/6J雄性小鼠的附睾头和尾部细胞，揭示了附睾功能在性成熟前后的变化 | 首次构建了小鼠附睾的单细胞图谱，并分析了主要细胞类型在性成熟前后的功能变化 | NA | 探究附睾在性成熟前后的功能变化及其对精子成熟和免疫反应的影响 | 5周龄和10周龄C57 BL/6J雄性小鼠的附睾头和尾部细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 5周龄和10周龄C57 BL/6J雄性小鼠的附睾头和尾部细胞 |
| 438 | 2024-08-22 |
Combining Bulk and Single Cell RNA-Sequencing Data to Identify Hub Genes of Fibroblasts in Dilated Cardiomyopathy
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S470860
PMID:39161677
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研究论文 | 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别扩张型心肌病中成纤维细胞的关键基因 | 本研究首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，通过细胞间通信网络和活性分析，筛选出与扩张型心肌病相关的重要细胞和基因 | 本研究主要基于公开数据集，未来需进一步在更大规模和多样性的样本中验证结果 | 揭示扩张型心肌病的病理生理机制 | 扩张型心肌病中的成纤维细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了公开的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据集 |
| 439 | 2024-08-21 |
Enhancing radiotherapy response via intratumoral injection of the TLR9 agonist CpG to stimulate CD8 T cells in an autochthonous mouse model of sarcoma
2024-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.03.573968
PMID:38260522
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研究论文 | 本研究通过使用CRISPR/Cas9和化学致癌物3-甲基胆蒽（MCA）生成具有高肿瘤突变负荷的自体软组织肉瘤模型，探讨了TLR9激动剂CpG与放射治疗（RT）联合使用对肿瘤反应的增强作用及其机制。 | 首次在自体软组织肉瘤模型中验证了TLR9激动剂CpG与放射治疗联合使用对肿瘤反应的增强作用，并揭示了CD8 T细胞在其中的关键作用。 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步的临床试验来验证这些发现。 | 探讨TLR9激动剂CpG与放射治疗联合使用对软组织肉瘤的治疗效果及其机制。 | 自体软组织肉瘤模型中的肿瘤反应及免疫细胞变化。 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | CRISPR/Cas9, RNA测序, 质谱细胞术 | NA | RNA | 多个自体软组织肉瘤模型样本 |
| 440 | 2024-08-21 |
The Downregulation of ITGAX Exacerbates Amyloid-β Plaque Deposition in Alzheimer's Disease by Increasing Polarization of M1 Microglia
2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-240118
PMID:38905043
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研究论文 | 本研究探讨了ITGAX下调通过增加M1型小胶质细胞极化加剧阿尔茨海默病中淀粉样β斑块沉积的分子机制 | 通过单细胞RNA测序和APP/PS1小鼠模型，揭示了ITGAX表达上调与阿尔茨海默病病理过程中的关系 | NA | 识别阿尔茨海默病中小胶质细胞参与的更精确分子靶点，并探索其潜在机制 | ITGAX在阿尔茨海默病中的作用及其对小胶质细胞极化和淀粉样β斑块沉积的影响 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | APP/PS1小鼠模型 | RNA | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的单细胞RNA测序数据 |