单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-11-21 |
Single-cell RNA sequencing analysis identifies acute changes in the tumor microenvironment induced by interferon α gene therapy in a murine bladder cancer model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387229
PMID:39559365
|
研究论文 | 研究了在小鼠膀胱癌模型中，干扰素α基因疗法对肿瘤微环境的影响，并通过单细胞RNA测序分析了急性变化 | 首次在小鼠膀胱癌模型中使用单细胞RNA测序分析干扰素α基因疗法对肿瘤微环境的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探讨干扰素α基因疗法对膀胱癌肿瘤微环境的影响，并寻找提高患者选择和治疗效果的机制 | 小鼠膀胱癌模型中的肿瘤细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠膀胱组织中的单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-11-21 |
Single-cell sequencing unveils mitophagy-related prognostic model for triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1489444
PMID:39559367
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据构建了一个与三阴性乳腺癌相关的线粒体自噬相关基因的预后模型 | 首次构建了基于线粒体自噬相关基因的三阴性乳腺癌预后模型，并验证了其在多个独立队列中的预测准确性 | NA | 研究线粒体自噬在三阴性乳腺癌中的预后意义 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 多个独立队列的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-11-20 |
Spatially resolved transcriptomic signatures of hippocampal subregions and Arc-expressing ensembles in active place avoidance memory
2024, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2024.1386239
PMID:39544521
|
研究论文 | 研究通过批量RNA测序和空间转录组学实验，分析了海马体背侧在主动位置回避记忆（APA）回忆后的基因表达变化 | 首次通过空间转录组学技术，研究了海马体不同亚区在APA记忆回忆后的基因表达差异，并发现了与突触可塑性和记忆相关的基因富集 | 研究仅限于海马体背侧，未涵盖整个海马体区域；样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨海马体在主动位置回避记忆回忆后的基因表达变化及其与记忆形成的关系 | 海马体背侧的CA1、CA3和齿状回（DG）亚区 | 神经科学 | NA | RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 训练和未训练的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-11-20 |
VCAN in the extracellular matrix drives glioma recurrence by enhancing cell proliferation and migration
2024, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2024.1501906
PMID:39554845
|
研究论文 | 本文研究了细胞外基质中的VCAN蛋白在胶质瘤复发中的作用，发现VCAN通过增强细胞增殖和迁移促进胶质瘤复发 | 首次揭示了VCAN在胶质瘤复发中的关键作用，并提出了通过抑制PI3K/Akt通路来治疗胶质瘤复发的新策略 | NA | 探讨VCAN在胶质瘤复发中的作用机制，并寻找潜在的治疗策略 | 胶质瘤细胞、VCAN蛋白、PI3K/Akt信号通路 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序、免疫组化染色 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-11-20 |
NFIL3/Tim3 axis regulates effector Th1 inflammation in COPD mice
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1482213
PMID:39555065
|
研究论文 | 研究NFIL3/Tim3轴在COPD小鼠模型中对Th1炎症的调节作用 | 首次揭示NFIL3/Tim3轴在COPD小鼠中通过抑制Th1分化来调节Th1失衡 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨COPD相关Th1细胞的调节因子及其在炎症机制中的作用 | COPD小鼠的Th1细胞及其相关基因NFIL3和Tim3 | 免疫学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞测序、流式细胞术 | NA | 细胞 | COPD小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-11-20 |
Bulk- and single cell-RNA sequencing reveal KIF20A as a key driver of hepatocellular carcinoma progression and immune evasion
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1469827
PMID:39555078
|
研究论文 | 本研究通过bulk RNA-seq和scRNA-seq数据分析，揭示了KIF20A在肝细胞癌进展和免疫逃逸中的关键作用 | 首次发现KIF20A在肝细胞癌中高表达，并证实其促进癌细胞增殖、侵袭和转移，同时影响免疫微环境 | NA | 探讨KIF20A在肝细胞癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | KIF20A在肝细胞癌中的表达及其与诊断、预后和免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-11-20 |
Analysis of immunogenic cell death in periodontitis based on scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1438998
PMID:39555084
|
研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，研究了牙周炎中免疫原性细胞死亡（ICD）的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出与ICD相关的细胞群和关键基因，并构建了诊断模型 | 研究仅限于牙周炎样本，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨牙周炎中免疫原性细胞死亡的机制及其在疾病发展中的作用 | 牙周炎中的免疫原性细胞死亡及相关基因 | 数字病理学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序、qPCR、酶联免疫吸附测定（ELISA）、免疫荧光（IF）染色 | 机器学习 | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-11-19 |
Vulture: cloud-enabled scalable mining of microbial reads in public scRNA-seq data
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giad117
PMID:38195165
|
研究论文 | 介绍了一种名为Vulture的可扩展云端管道，用于在公共单细胞RNA测序数据中进行微生物读取的挖掘 | Vulture比本地工具和现有云端工具更快，且在云端计算系统上成本更低，能够从大规模公共单细胞RNA测序数据中挖掘未知的宿主-微生物相互作用 | NA | 开发一种可扩展且经济的框架，用于从大规模公共单细胞RNA测序数据中挖掘宿主-微生物相互作用 | 单细胞RNA测序数据中的微生物读取 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 2个COVID-19患者、3个肝细胞癌患者和2个胃癌患者的公共测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-11-19 |
EAGS: efficient and adaptive Gaussian smoothing applied to high-resolved spatial transcriptomics
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giad097
PMID:38373746
|
研究论文 | 本文提出了一种高效自适应高斯平滑（EAGS）方法，用于高分辨率空间转录组数据的插补 | EAGS方法通过自适应的双因子平滑，基于细胞的空间和表达信息创建模式，并利用这些模式为平滑过程创建自适应权重，从而恢复基因表达谱 | NA | 提高高分辨率空间转录组数据的信噪比和数据质量 | 高分辨率空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 高斯平滑 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠大脑和嗅球的高分辨率空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-11-19 |
Deciphering spatial domains from spatially resolved transcriptomics with Siamese graph autoencoder
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae003
PMID:38373745
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SGAE的新框架，用于空间域识别，结合了Siamese图自编码器的优势，以改进空间转录组数据分析中的细胞聚类性能 | SGAE通过在样本和特征层面减少信息相关性，提高了表示的区分能力，从而解决了现有GNN方法中的表示崩溃问题 | NA | 解决空间转录组数据分析中细胞聚类的表示崩溃问题，提高聚类性能 | 空间转录组数据中的细胞聚类 | 机器学习 | NA | 图神经网络 (GNN) | Siamese图自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-11-19 |
Improved integration of single-cell transcriptome data demonstrates common and unique signatures of heart failure in mice and humans
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae011
PMID:38573186
|
研究论文 | 本文通过改进的单细胞转录组数据整合方法，比较了小鼠和人类心力衰竭的转录特征 | 提出了名为OrthoIntegrate的整合管道，能够独特地分配直系同源基因并合并不同物种的单细胞RNA测序数据 | 发现小鼠模型与人类心力衰竭患者之间存在独特的调控途径，表明两者之间的可比性有限 | 研究小鼠和人类心力衰竭的共同和独特转录特征，以提高疾病模型的相似性和预测价值 | 心力衰竭患者和小鼠的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 心力衰竭患者和小鼠的心脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-11-19 |
TooManyCellsInteractive: A visualization tool for dynamic exploration of single-cell data
2024-Jan-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae056
PMID:39172544
|
研究论文 | 介绍了一种名为TooManyCellsInteractive的基于浏览器的JavaScript应用程序，用于交互式探索单细胞数据 | 提供了一个直观的界面，用于可视化和操作层次化细胞亚群的径向树表示，并允许用户在多个分辨率下轻松叠加、过滤和比较生物学特征 | NA | 开发一种用户友好的工具，用于探索和可视化大规模单细胞测序数据 | 单细胞数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-11-19 |
Interindividual Variation in Gut Nitrergic Neuron Density Is Regulated By GDNF Levels and ETV1
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101405
PMID:39299667
|
研究论文 | 研究探讨了GDNF水平和ETV1对肠道一氧化氮能神经元密度个体间差异的调控机制 | 首次揭示了GDNF水平通过调节ETV1转录因子影响肠道一氧化氮能神经元密度和功能的机制 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类中验证 | 探究调控肠道神经系统的机制及其在常见人类疾病中的作用 | 人类和小鼠的肠道神经系统和GDNF水平 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA | 41个正常成人结肠活检样本和人类及小鼠发育中肠道的单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-11-18 |
The development and application of cleavage under targets and tagmentation (CUT&Tag) technology
2024, Journal of biological methods
DOI:10.14440/jbm.2024.0017
PMID:39544184
|
综述 | 本文综述了CUT&Tag技术的发展及其在表观遗传学中的应用 | CUT&Tag技术能够快速检测染色质修饰和转录因子，并已适应于同时检测多种表观遗传修饰 | NA | 提供CUT&Tag及其衍生技术在表观遗传调控中的最新发展和应用概述 | 染色质结构、基因转录调控、表观遗传修饰 | 表观遗传学 | NA | CUT&Tag | NA | 基因组数据 | 不同物种的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-11-17 |
The shared biomarkers and immune landscape in psoriatic arthritis and rheumatoid arthritis: Findings based on bioinformatics, machine learning and single-cell analysis
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0313344
PMID:39509434
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学、机器学习和单细胞分析方法，识别了银屑病关节炎和类风湿性关节炎的共享生物标志物和免疫景观 | 本研究首次通过机器学习算法和单细胞分析，识别了RPL22L1和LY96作为银屑病关节炎和类风湿性关节炎的潜在诊断标志物，并揭示了它们与T细胞发育和VEGF信号的关联 | 本研究主要基于现有数据集进行分析，未来需要更多的实验验证和临床样本验证 | 识别银屑病关节炎和类风湿性关节炎的共享标志基因和机制相似性 | 银屑病关节炎和类风湿性关节炎的共享生物标志物和免疫细胞功能 | 机器学习 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | LASSO和支持向量机递归特征消除 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-11-17 |
Combining single-cell RNA sequencing and network pharmacology to explore the target of cangfu daotan decoction in the treatment of obese polycystic ovary syndrome from an immune perspective
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1451300
PMID:39539629
|
研究论文 | 本文结合单细胞RNA测序和网络药理学，从免疫角度探讨苍附导痰汤治疗肥胖型多囊卵巢综合征的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学，揭示苍附导痰汤在肥胖型多囊卵巢综合征中的免疫调节机制 | 研究样本量较小，且为单中心研究，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨苍附导痰汤在肥胖型多囊卵巢综合征中的作用机制，特别是其免疫调节作用 | 肥胖型多囊卵巢综合征患者及其免疫微环境 | 数字病理学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 129例，包括肥胖型多囊卵巢综合征患者、正常体重多囊卵巢综合征患者和健康女性 | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-11-17 |
Uncovering SPP1+ Macrophage, Neutrophils and Their Related Diagnostic Biomarkers in Intracranial Aneurysm and Subarachnoid Hemorrhage
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S493828
PMID:39539729
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和转录组数据分析，揭示了颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中SPP1+巨噬细胞和嗜中性粒细胞的作用及其相关诊断生物标志物 | 首次通过单细胞测序和孟德尔随机化分析揭示了SPP1+巨噬细胞在颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中的有害作用，并识别出CD36作为风险因素和有效的血液生物标志物 | NA | 探讨颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血的分子机制和诊断生物标志物 | 颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中的巨噬细胞、嗜中性粒细胞及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞测序、转录组分析、孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞数据、转录组数据 | 从GEO数据库获取的单细胞和转录组数据，以及建立的临床队列 | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-11-17 |
Differences in cell subsets between sun-exposed and unexposed skin: preliminary single-cell sequencing and biological analysis from a single case
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1453940
PMID:39540047
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和生物分析，比较了同一患者阳光暴露和未暴露皮肤中的细胞亚群差异 | 首次揭示了光老化皮肤中单个病例的细胞成分变化，并提供了关于细胞亚群和病理学的新见解 | 研究仅基于单一病例，结果的普遍性和代表性有待进一步验证 | 评估光老化皮肤中细胞亚群变化的生物学过程和机制 | 阳光暴露和未暴露的皮肤细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 单一病例，包括阳光暴露的前臂皮肤和未暴露的臀部皮肤 | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-11-17 |
Identify novel therapeutic targets for type II diabetes and periodontitis: insights from single-cell analysis and Mendelian randomization analysis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1410537
PMID:39544234
|
研究论文 | 通过单细胞分析和孟德尔随机化分析，识别II型糖尿病和牙周炎的新治疗靶点 | 整合单细胞分析、孟德尔随机化分析和共定位分析，识别出II型糖尿病和牙周炎的新治疗靶点 | NA | 揭示II型糖尿病和牙周炎之间的关联，并识别新的治疗靶点 | II型糖尿病和牙周炎 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞分析、孟德尔随机化分析、共定位分析 | NA | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-11-17 |
Possible involvement of Toll-like receptor 8-positive monocytes/macrophages in the pathogenesis of Sjögren's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1480675
PMID:39544932
|
研究论文 | 研究探讨了Toll样受体8阳性单核细胞/巨噬细胞在干燥综合征发病机制中的可能作用 | 首次通过单细胞RNA测序和多色免疫荧光染色技术，揭示了Toll样受体8阳性单核细胞/巨噬细胞在干燥综合征中的表达和功能 | 研究样本量较小，且仅限于干燥综合征患者，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨Toll样受体在干燥综合征发病机制中的作用 | 干燥综合征患者的唾液腺组织 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、实时PCR、多色免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 32例实时PCR样本，19例多色免疫荧光染色样本 | NA | NA | NA | NA |