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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-07 |
Macrophages protect against sensory axon degeneration in diabetic neuropathy
2024-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.30.577801
PMID:38352324
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞在糖尿病神经病变中对感觉轴突退化的保护作用 | 首次发现CCR2+巨噬细胞在糖尿病神经病变早期浸润神经并具有神经保护功能,延迟轴突退化 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究炎症反应在糖尿病周围神经病变发病机制中的作用 | 高脂高果糖饮食诱导的糖尿病小鼠模型 | 神经科学 | 糖尿病神经病变 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2025-10-07 |
Gene panel selection for targeted spatial transcriptomics
2024-01-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03174-1
PMID:38273415
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研究论文 | 开发了一种名为gpsFISH的计算方法,用于优化靶向空间转录组学中的基因面板选择 | 通过建模和调整平台效应,克服了现有方法依赖scRNA-seq数据而忽略技术间平台效应的局限性 | NA | 优化靶向空间转录组学中的基因选择方法 | 复杂组织中的细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 靶向空间转录组学,单细胞RNA测序 | 计算模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 403 | 2025-10-07 |
Combining Cre-LoxP and single-cell sequencing technologies: insights into the extracellular vesicle cargo transfer
2024, Extracellular vesicles and circulating nucleic acids
DOI:10.20517/evcna.2024.58
PMID:39811732
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研究论文 | 本研究首次将Cre-LoxP重组系统与单细胞测序技术结合,用于追踪胰腺导管腺癌模型中肿瘤来源细胞外囊泡的摄取和功能 | 首次将Cre-LoxP重组系统与单细胞测序技术相结合,能够在不干扰EV生物发生或表型的情况下特异性识别单个EV受体细胞 | NA | 研究肿瘤来源细胞外囊泡在受体非恶性细胞中的摄取和功能 | 胰腺导管腺癌小鼠模型中的巨噬细胞、中性粒细胞和肥大细胞 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | Cre-LoxP重组系统,单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 404 | 2025-10-07 |
Neurodegeneration: 2024 update
2024-Jan, Free neuropathology
|
综述 | 本文回顾了过去一年神经退行性疾病神经病理学领域的重要研究进展 | 综合展示了从传统病理学到单细胞RNA测序、人工智能等前沿技术在神经退行性疾病研究中的应用 | 仅代表作者个人选择的文献,可能无法涵盖该领域所有重要研究 | 总结神经退行性疾病神经病理学领域的最新研究进展 | 人类组织样本和神经退行性疾病相关研究 | 神经病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,人工智能,人诱导多能干细胞模型,临床病理解剖相关研究 | NA | 组织病理学数据,基因组数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 405 | 2025-10-07 |
Increased Chemokine Production is a Hallmark of Rhesus Macaque Natural Killer Cells Mediating Robust Anti-HIV Envelope-Specific Antibody-Dependent Cell-Mediated Cytotoxicity
2024, Pathogens & immunity
DOI:10.20411/pai.v10i1.734
PMID:39911143
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析恒河猴自然杀伤细胞在介导抗HIV抗体依赖性细胞毒性反应中的功能异质性 | 首次在单细胞水平揭示CD107a+恒河猴NK细胞亚群具有更强的趋化因子产生能力 | 研究仅限于恒河猴模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究恒河猴自然杀伤细胞在抗HIV抗体依赖性细胞毒性反应中的功能特征 | 恒河猴自然杀伤细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 406 | 2025-10-07 |
A single-cell atlas of IL-23 inhibition in cutaneous psoriasis distinguishes clinical response
2024-01-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adi2848
PMID:38277466
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析银屑病患者皮肤免疫细胞,揭示IL-23抑制治疗的临床反应机制 | 首次在单细胞水平建立银屑病IL-23抑制治疗的临床反应图谱,发现治疗抵抗性T17细胞活化和不可逆免疫异常状态 | 样本量有限,未明确不可逆免疫异常的分子机制 | 解析IL-23信号阻断治疗银屑病的临床反应机制 | 银屑病患者皮肤组织中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 银屑病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 银屑病患者皮肤样本(未明确具体数量) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 407 | 2025-10-07 |
Tuft cells and fibroblasts promote thymus regeneration through ILC2-mediated type 2 immune response
2024-01-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq6930
PMID:38215193
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研究论文 | 本研究揭示了簇细胞和成纤维细胞通过激活ILC2介导的2型免疫反应促进胸腺再生的新机制 | 首次发现胸腺簇细胞和成纤维细胞通过产生警报素IL-25和IL-33激活ILC2,进而促进胸腺上皮细胞分化的再生机制 | 研究仅使用地塞米松诱导的急性胸腺萎缩小鼠模型,未验证其他应激模型 | 探究胸腺再生过程中非T细胞的造血细胞如何参与调控机制 | 小鼠胸腺组织中的造血细胞(不包括T细胞),特别是ILC2、簇细胞和成纤维细胞 | 免疫学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 地塞米松诱导胸腺萎缩的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 408 | 2025-10-07 |
Altered ontogeny and transcriptomic signatures of tissue-resident pulmonary interstitial macrophages ameliorate allergic airway hyperresponsiveness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1371764
PMID:38983858
|
研究论文 | 本研究探讨组织驻留肺间质巨噬细胞发育轨迹改变对过敏性气道高反应性的影响 | 首次揭示LPS诱导肺损伤后巨噬细胞发育谱系改变可减轻过敏性气道反应,并通过单细胞测序鉴定出与过敏性疾病相关的间质巨噬细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证 | 阐明环境暴露引起的巨噬细胞发育轨迹改变对过敏性气道反应的影响机制 | 组织驻留肺巨噬细胞和屋尘螨诱导的过敏性气道反应 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、胚胎谱系标记 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2025-10-07 |
From local to global gene co-expression estimation using single-cell RNA-seq data
2024-Jan-29, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujae001
PMID:38465983
|
研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA-seq数据的基因共表达估计方法,从局部到全局分析基因关系 | 提出细胞特异性基因网络概念和平均局部密度差(aLDG)这一新的单变量依赖度量,能够检测非线性、非单调关系 | NA | 开发能够捕捉局部基因依赖关系的统计方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数估计器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 410 | 2025-10-07 |
Aryl hydrocarbon receptor and IL-13 signaling crosstalk in human keratinocytes and atopic dermatitis
2024, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2024.1323405
PMID:38344408
|
研究论文 | 本研究探讨芳香烃受体与IL-13信号通路在人类角质形成细胞和特应性皮炎中的相互作用机制 | 首次揭示AHR通过全基因组转录调控作用调节IL-13下游信号通路,而不影响STAT6核转位 | 研究主要基于体外HaCaT细胞模型,需要更多体内实验验证 | 阐明AHR在特应性皮炎中部分改善病情的分子机制 | 人类皮肤活检组织和人角质形成细胞系HaCaT | 分子生物学 | 特应性皮炎 | RNA测序, 单细胞RNA测序, Western blot, ELISA, qRT-PCR | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 人类皮肤活检组织(患者与健康对照)和HaCaT细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 411 | 2025-10-07 |
Multi-omics analyses reveal bacteria and catalase associated with keloid disease
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104904
PMID:38061241
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示细菌和过氧化氢酶与瘢痕疙瘩疾病的关联 | 首次综合运用微生物组、宏蛋白质组、代谢组、单细胞转录组和CDX小鼠模型研究细菌在瘢痕疙瘩中的作用机制 | 研究样本量有限,未明确说明具体样本数量 | 探索细菌在瘢痕疙瘩疾病发生发展中的作用机制 | 瘢痕疙瘩组织、健康皮肤组织、瘢痕疙瘩成纤维细胞、BALB/c雌性裸鼠 | 多组学分析 | 瘢痕疙瘩 | 16S rRNA测序, 宏蛋白质组学, 代谢组学, 单细胞RNA测序, 细胞源性异种移植模型 | CDX小鼠模型 | 微生物组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 412 | 2025-10-07 |
A longitudinal molecular and cellular lung atlas of lethal SARS-CoV-2 infection in K18-hACE2 transgenic mice
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104932
PMID:38118400
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建K18-hACE2转基因小鼠在SARS-CoV-2致死感染过程中的肺部分子和细胞图谱 | 首次在K18-hACE2转基因小鼠模型中利用单细胞RNA测序技术系统揭示SARS-CoV-2感染过程中肺部细胞动态变化和分子机制 | 研究基于转基因小鼠模型,与人类疾病存在物种差异 | 探究SARS-CoV-2在肺部组织中的致病机制和细胞响应 | K18-hACE2转基因小鼠的肺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | K18-hACE2转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 413 | 2025-10-07 |
Single Cell Sequencing Technology and Its Application in Alzheimer's Disease
2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-230861
PMID:38217599
|
综述 | 概述单细胞测序技术及其在阿尔茨海默病研究中的应用 | 系统总结单细胞测序技术在解析阿尔茨海默病中枢神经系统细胞异质性方面的独特优势 | NA | 探讨单细胞测序技术在阿尔茨海默病研究中的应用价值 | 中枢神经系统细胞 | 单细胞测序 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学, 单细胞表观基因组学, 单细胞基因组学, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 414 | 2025-10-07 |
Harnessing Nanotechnology for Gout Therapy: Colchicine-Loaded Nanoparticles Regulate Macrophage Polarization and Reduce Inflammation
2024, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0089
PMID:39665079
|
研究论文 | 本研究开发了负载秋水仙碱的纳米颗粒系统,通过调控巨噬细胞极化来治疗痛风炎症 | 首次发现AHNAK是秋水仙碱调控巨噬细胞极化的关键靶点,并开发了R4F肽修饰的中性粒细胞膜包被纳米载体 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 探究秋水仙碱调控巨噬细胞极化的机制并开发靶向纳米药物治疗痛风 | 痛风小鼠模型和外周血单核细胞 | 生物医学工程 | 痛风 | 单细胞RNA测序,分子对接,慢病毒干预 | NA | 基因表达数据,生化指标数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 415 | 2025-10-07 |
The role of epigenetic regulation in pancreatic ductal adenocarcinoma progression and drug response: an integrative genomic and pharmacological prognostic prediction model
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1498031
PMID:39640482
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据构建了基于表观遗传特征的胰腺导管腺癌预后预测模型 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示PDAC表观遗传调控全景,并构建了优于现有模型的机器学习预后预测模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性临床研究验证 | 探索表观遗传调控在胰腺导管腺癌进展和药物反应中的作用并建立预后预测模型 | 胰腺导管腺癌患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | Lasso, 随机生存森林 | 基因表达数据, 临床数据 | 多个公共数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 416 | 2025-10-07 |
Copper drives remodeling of metabolic state and progression of clear cell renal cell carcinoma
2024-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.16.575895
PMID:38293110
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研究论文 | 本研究揭示了铜通过驱动代谢重塑促进肾透明细胞癌进展的机制 | 首次阐明铜通过调控线粒体呼吸链复合物形成和谷胱甘肽生物合成,协调能量代谢与氧化还原平衡的新机制 | 未明确铜积累的具体调控机制及其在其他癌症类型中的普适性 | 探究铜在肾透明细胞癌代谢重塑和肿瘤进展中的作用机制 | 肾透明细胞癌细胞和肿瘤组织 | 癌症代谢研究 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 417 | 2025-10-07 |
Integrated scRNAseq analyses of mouse cochlear supporting cells reveal the involvement of Ezh2 in hair cell regeneration
2024-Jan-28, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-09173-y
PMID:38281217
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研究论文 | 通过整合分析小鼠耳蜗支持细胞的单细胞RNA测序数据,揭示Ezh2在毛细胞再生中的潜在作用 | 首次通过整合多个发育时间点的单细胞RNA测序数据,识别出与发育阶段相关的共表达基因,并发现Ezh2和KLF15可能是关键转录调控因子 | 研究主要基于公共数据库的测序数据,需要进一步实验验证Ezh2的具体调控机制 | 探索小鼠耳蜗毛细胞再生能力的分子基础 | 小鼠耳蜗前感觉细胞和支持细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损伤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠耳蜗组织从胚胎期14天到出生后33天的多个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 418 | 2025-10-07 |
The transcription factor Aiolos restrains the activation of intestinal intraepithelial lymphocytes
2024-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01693-w
PMID:38049581
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Aiolos通过调控肠道上皮内淋巴细胞活化来限制其效应功能 | 首次发现Aiolos作为IELs活化的调节因子,并阐明其通过影响IL-15信号通路和染色质可及性来调控效应功能 | Ikzf3缺陷仅部分解释观察到的表型,表明存在其他调控机制 | 探究Aiolos在肠道上皮内淋巴细胞活化调控中的作用机制 | 小鼠肠道上皮内淋巴细胞 | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序,染色质可及性分析,组蛋白乙酰化检测 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | Ikzf3+/+和Ikzf3-/-小鼠IELs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 419 | 2025-10-07 |
High throughput single cell metagenomic sequencing with semi-permeable capsules: unraveling microbial diversity at the single-cell level in sewage and fecal microbiomes
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1516656
PMID:39968047
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研究论文 | 本研究验证了使用微流控和半透性胶囊技术对污水和猪粪便样本进行高通量单细胞宏基因组测序的方法 | 开发了结合半透性胶囊和组合拆分-合并单扩增基因组条形码的高通量单细胞测序方法,可在单细胞水平解析微生物多样性 | 仅测试了污水和猪粪便两种样本类型,样本量相对有限 | 开发和应用高通量单细胞测序技术研究微生物群落 | 污水和猪粪便样本中的单个细菌细胞 | 宏基因组学 | NA | 单细胞测序,微流控技术,组合拆分-合并单扩增基因组条形码,短读长测序 | NA | 基因组测序数据 | 污水样本和猪粪便样本各1个,深测序检测1,796和1,220个SAGs,浅测序检测12,731和17,909个SAGs | Atrandi | 单细胞测序,微流控技术 | 半透性胶囊技术 | 微流控和半透性胶囊单细胞分离技术,结合组合拆分-合并单扩增基因组条形码 |
| 420 | 2025-10-07 |
Mechanism of mTOR/RILP-regulated autophagic flux in increased susceptibility to myocardial ischemia-reperfusion in diabetic mice
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1506401
PMID:39958873
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病小鼠心肌缺血再灌注损伤易感性增加的机制,重点关注mTOR/RILP通路调控的自噬流 | 首次通过单细胞测序分析糖尿病心肌缺血再灌注后自噬相关基因的转录组变化,并揭示mTOR/RILP通路在调节自噬流中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究糖尿病心肌缺血再灌注损伤易感性增加的内在机制 | 糖尿病小鼠模型和高糖培养的心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序, qRT-PCR, 蛋白质印迹, 透射电镜, HE染色 | 动物模型和细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 形态学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |