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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-12-25 |
Cell and tissue-specific glycosylation pathways informed by single-cell transcriptomics
2024-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559616
PMID:38260527
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了人类组织和细胞类型中的糖基化相关基因表达,揭示了细胞和组织特异性糖基化途径 | 首次在糖科学领域应用单细胞转录组学,揭示了糖基化基因和糖基化途径表达的层次结构,并展示了细胞和组织特异性糖基化模式 | 研究依赖于Tabula Sapiens数据集,可能无法涵盖所有人类组织和细胞类型 | 探讨单细胞水平上糖基化相关基因的表达模式及其在不同组织和细胞类型中的特异性 | 人类组织和细胞类型中的糖基化相关基因和糖基化途径 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | Tabula Sapiens数据集中的人类组织和细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-12-25 |
Integrative multi-omics analysis reveals a novel subtype of hepatocellular carcinoma with biological and clinical relevance
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517312
PMID:39712016
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了一种新的肝细胞癌亚型,并构建了预测模型 | 本研究通过整合多种组学数据,包括bulk RNA测序、蛋白质组分析、单细胞RNA测序、空间转录组测序和基因组测序,发现了一种新的肝细胞癌亚型XPO1+Epithelial,并构建了肿瘤纯度和肿瘤微环境相关的预后风险模型 | 本研究主要基于实验室数据和公共数据集,样本量和临床验证可能存在局限性 | 本研究的目的是通过多组学分析揭示肝细胞癌的新亚型,并构建预后预测模型 | 本研究的对象是肝细胞癌患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 多组学分析(bulk RNA测序、蛋白质组分析、单细胞RNA测序、空间转录组测序、基因组测序) | NA | 多组学数据(RNA、蛋白质、基因组、单细胞RNA、空间转录组) | 实验室数据和公共数据集中的肝细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-12-25 |
Exploring the heterogeneity of osteosarcoma cell characteristics and metabolic states and their association with clinical prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1507476
PMID:39712023
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研究论文 | 本研究探讨了骨肉瘤细胞特征和代谢状态的异质性及其与临床预后的关联 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢途径分析,揭示了骨肉瘤细胞的异质性,并开发了一个包含风险特征的预测模型,为骨肉瘤的靶向治疗和预后评估提供了新的视角 | 本研究的样本量较小,且仅基于公开数据库的数据,可能影响结果的普适性 | 阐明骨肉瘤的分子机制和代谢特征及其与患者预后的关系 | 骨肉瘤细胞的特征和代谢状态及其与临床预后的关联 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 风险特征模型 | 基因表达数据 | 9个样本的单细胞测序数据,多个公共数据库中的骨肉瘤样本和健康对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-12-25 |
Effects of PGK1 on immunoinfiltration by integrated single-cell and bulk RNA-sequencing analysis in sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1449975
PMID:39712033
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,探讨了磷酸甘油酸激酶1(PGK1)在脓毒症中的免疫浸润作用 | 首次揭示了PGK1在脓毒症中的显著上调及其作为诊断标志物的潜力,并探讨了其在免疫相关通路和细胞类型中的作用 | 研究主要基于现有数据集,缺乏体内实验验证 | 探讨PGK1在脓毒症中的作用及其作为诊断标志物的潜力 | PGK1在脓毒症患者中的表达及其对免疫浸润的影响 | NA | 脓毒症 | RNA测序 | NA | RNA | 多个数据集中的脓毒症患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-12-25 |
Exploring the impact of deubiquitination on melanoma prognosis through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1509049
PMID:39712483
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索去泛素化对黑色素瘤预后的影响,并构建了一个新的预后模型 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析去泛素化相关基因在黑色素瘤中的作用,并构建了一个有效的预后模型 | 需要进一步的临床验证以确认模型的适用性 | 研究去泛素化在黑色素瘤中的作用,并开发新的预后模型 | 黑色素瘤细胞和患者的预后 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林和岭回归 | RNA测序数据 | 使用了来自TCGA队列和外部验证队列的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-12-25 |
Single-Cell Sequencing Combined with Transcriptome Sequencing to Explore the Molecular Mechanisms Related to Skin Photoaging
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496328
PMID:39713718
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组测序探索皮肤光老化的分子机制 | 发现了三个关键基因(Atp2b1、Plekho2和Tspan13)在光老化过程中的重要作用,并验证了这些基因在免疫细胞浸润和代谢途径中的关键作用 | NA | 揭示皮肤光老化的分子机制 | 光老化患者的基因表达谱和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞测序、转录组测序、RT-qPCR、免疫荧光标记、Western blotting | LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的光老化患者基因表达数据 | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-12-25 |
Construction and clinical application of a risk model based on N6-methyladenosine regulators for colorectal cancer
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18719
PMID:39717046
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研究论文 | 本研究基于N6-甲基腺苷(m6A)调控因子构建了一个结直肠癌(CRC)的风险模型,并探讨了其在临床中的应用 | 首次基于m6A调控因子构建了CRC的风险评分模型,并验证了其在区分高风险和低风险患者中的有效性 | 研究主要基于现有数据集,缺乏大规模的临床验证 | 开发一个基于m6A调控因子的风险模型,用于预测结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者的m6A调控因子表达及其与预后的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归模型 | RNA序列数据 | AC-ICAM和GSE33113数据集中的结直肠癌样本,以及GSE146771单细胞RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-12-25 |
Neuron stress-related genes serve as new biomarkers in hypothalamic tissue following high fat diet
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1443880
PMID:39717104
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研究论文 | 研究探讨了高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中神经应激相关基因的表达变化及其作为新生物标志物的潜力 | 首次揭示了高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中神经应激相关基因的表达变化,并发现Bmi1基因作为关键基因反映肥胖的病理生理机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果的临床转化和人类应用仍需进一步验证 | 探讨高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中基因表达变化,寻找新的生物标志物 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中的神经应激相关基因 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞测序 RNA-seq 蛋白质印迹 免疫荧光染色 | LASSO模型 | 基因表达数据 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-12-25 |
Vascular Smooth Muscle Cells Transdifferentiate into Chondrocyte-Like Cells and Facilitate Meniscal Fibrocartilage Regeneration
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0555
PMID:39717465
|
研究论文 | 本文研究了血管平滑肌细胞向类软骨细胞的转分化及其在半月板纤维软骨再生中的作用 | 首次发现血管平滑肌细胞可以转分化为纤维软骨细胞,并参与自发性的半月板再生;低强度脉冲超声刺激可以增强这种转分化过程 | 研究主要在动物模型中进行,尚未在人体中验证其有效性和安全性 | 探索有效的半月板纤维软骨再生策略 | 血管平滑肌细胞、半月板纤维软骨、低强度脉冲超声刺激 | NA | NA | 低强度脉冲超声(LIPUS)、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用了平滑肌细胞系追踪转基因小鼠和比格犬的半月板缺损模型 | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-12-25 |
Machine Learning and Mendelian Randomization Reveal Molecular Mechanisms and Causal Relationships of Immune-Related Biomarkers in Periodontitis
2024, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9983323
PMID:39717623
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研究论文 | 本研究利用机器学习和孟德尔随机化方法,揭示了牙周炎中免疫相关生物标志物的分子机制和因果关系 | 本研究整合了机器学习、孟德尔随机化和单细胞测序,提供了一种新颖的方法来增强对牙周炎中免疫动态和基因相互作用的理解 | 研究受限于数据集的人口统计和样本量,可能影响结果的普遍性 | 探讨牙周炎的分子机制并识别关键的免疫相关生物标志物 | 牙周炎中的免疫相关生物标志物及其分子机制 | 机器学习 | 牙周疾病 | 机器学习算法、孟德尔随机化、单细胞测序 | XGBoost | 基因表达数据 | 682个差异表达基因,19个核心基因 | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-12-25 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals That C5AR1 in Follicle Monocyte Cells Could Predict the Development of POI
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S490996
PMID:39717665
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了卵泡单核细胞中的C5AR1基因在预测早发性卵巢功能不全(POI)发展中的潜在作用 | 首次揭示了C5AR1基因在卵泡单核细胞中的高表达,并发现其在预测POI发展中的潜在作用 | 样本量较小,仅包括9名接受IVF或ICSI治疗的女性 | 探讨早发性卵巢功能不全(POI)患者的卵泡微环境,并识别潜在的治疗靶点 | 早发性卵巢功能不全(POI)患者的卵泡微环境 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9名接受IVF或ICSI治疗的女性 | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-12-25 |
Integration of Microarray Data and Single-Cell Sequencing Analysis to Explore Key Genes Associated with Macrophage Infiltration in Heart Failure
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S475633
PMID:39717663
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研究论文 | 本文整合了微阵列数据和单细胞测序分析,探索与心力衰竭中巨噬细胞浸润相关的关键基因 | 本文通过整合单细胞和批量RNA测序数据,结合机器学习算法,识别出具有诊断价值的巨噬细胞相关基因,并进行了体内验证 | 本文的局限性在于其依赖于现有的测序数据和机器学习算法,可能存在数据偏差和算法局限性 | 探索心力衰竭中巨噬细胞的机制及其相关的关键基因 | 心力衰竭中的巨噬细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-12-25 |
Innovative strategies to optimise colorectal cancer immunotherapy through molecular mechanism insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1509658
PMID:39717768
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析结直肠癌患者的肿瘤微环境,识别关键细胞类型和分子通路,以优化免疫治疗策略 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了结直肠癌中的关键细胞亚型,并验证了DLX2基因作为潜在治疗靶点的可行性 | 研究样本量较小,仅包括4名患者的13个组织样本,可能影响结果的普适性 | 通过分子机制研究优化结直肠癌的免疫治疗策略 | 结直肠癌患者的肿瘤微环境和分子机制 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名患者的13个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-12-21 |
Pan-cancer single cell and spatial transcriptomics analysis deciphers the molecular landscapes of senescence related cancer-associated fibroblasts and reveals its predictive value in neuroblastoma via integrated multi-omics analysis and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506256
PMID:39703515
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研究论文 | 本研究通过泛癌单细胞和空间转录组学分析,揭示了衰老相关癌症相关成纤维细胞(senes CAF)的分子特征,并利用多组学分析和机器学习方法开发了神经母细胞瘤的诊断和预后标志物 | 首次系统性地探索了衰老相关癌症相关成纤维细胞(senes CAF)在神经母细胞瘤中的分子特征,并开发了基于多组学分析和机器学习的诊断和预后标志物 | 研究主要集中在神经母细胞瘤,未来可能需要进一步验证在其他癌症类型中的适用性 | 揭示衰老相关癌症相关成纤维细胞的分子特征,并开发用于神经母细胞瘤的诊断和预后标志物 | 衰老相关癌症相关成纤维细胞(senes CAF)及其在神经母细胞瘤中的作用 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞和空间转录组学分析 | 随机森林(RF)算法和SuperPC算法 | 单细胞和空间转录组数据 | 泛癌样本,具体数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-12-20 |
Heterogeneous immune landscapes and macrophage dynamics in primary and lung metastatic adenoid cystic carcinoma of the head and neck
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483887
PMID:39697346
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研究论文 | 研究探讨了头颈部腺样囊性癌原发肿瘤和肺转移瘤的免疫微环境及巨噬细胞动态 | 首次通过RNA测序和单细胞测序分析了原发肿瘤和肺转移瘤的免疫景观,揭示了肺转移瘤中免疫抑制性肿瘤相关巨噬细胞的存在 | 研究样本量相对较小,可能影响结果的普适性 | 探讨头颈部腺样囊性癌原发肿瘤和肺转移瘤的肿瘤免疫微环境,理解免疫治疗的挑战 | 头颈部腺样囊性癌的原发肿瘤和肺转移瘤 | 数字病理学 | 头颈部肿瘤 | RNA测序、免疫组织化学、单细胞测序 | NA | RNA序列数据、图像 | 25个原发肿瘤和34个肺转移瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-12-20 |
Identification of Macrophage-Related Biomarkers for Abdominal Aortic Aneurysm Through Combined Single-Cell Sequencing and Machine Learning
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S499593
PMID:39697792
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞测序和机器学习技术,揭示了巨噬细胞在腹主动脉瘤(AAA)进展中的作用机制,并识别了相关的生物标志物 | 首次通过单细胞测序和机器学习结合的方法,揭示了THBS1-CD47信号通路在巨噬细胞驱动AAA进展中的关键作用,并验证了THBS1作为潜在治疗靶点的可能性 | 研究主要基于单细胞测序和机器学习分析,未来需要更多临床样本验证和进一步的功能实验 | 揭示巨噬细胞在腹主动脉瘤进展中的作用机制,并识别相关的生物标志物,以开发新的靶向治疗和改善患者预后 | 腹主动脉瘤患者样本中的巨噬细胞及相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,机器学习 | NA | 基因表达数据 | 腹主动脉瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-12-20 |
Deciphering the evolving niche interactome of human hematopoietic stem cells from ontogeny to aging
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1479605
PMID:39698109
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,系统地描述了从胚胎发育到衰老过程中人类造血干细胞(HSC)微环境的相互作用网络 | 首次系统地揭示了HSC微环境在不同发育阶段和衰老过程中的动态变化,特别是细胞间相互作用和信号通路的变化 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能无法完全捕捉到所有细胞间的相互作用和微环境的复杂性 | 揭示从胚胎发育到衰老过程中HSC微环境的动态变化,为维持HSC功能和促进健康衰老提供新的干预策略 | 人类造血干细胞(HSC)及其微环境中的细胞间相互作用网络 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及不同发育阶段和衰老时期的HSC微环境样本 | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-12-20 |
Narrative Review of Mesenchymal Stem Cell Therapy in Renal Diseases: Mechanisms, Clinical Applications, and Future Directions
2024, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/sci/8658246
PMID:39698513
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综述 | 本文综述了间充质干细胞在肾脏疾病中的应用,讨论了其机制、临床应用及未来发展方向 | 本文探讨了间充质干细胞在肾脏疾病治疗中的潜力,并展望了结合单细胞测序、CRISPR/Cas9基因编辑等前沿技术的未来研究方向,以实现更安全、更有效的个性化治疗 | 本文主要基于过去五年内的研究,可能未能涵盖所有相关研究,且未来研究方向仍需进一步验证 | 探讨间充质干细胞在肾脏疾病治疗中的应用及其未来发展方向 | 间充质干细胞在急性肾损伤和慢性肾病中的应用 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞测序、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-12-20 |
Revealing induced pluripotent stem cells' potential as a better alternative to embryonic stem cells for Parkinson's disease treatment based on single-cell RNA-seq
2024, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2024e13482
PMID:39699375
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据比较了诱导多能干细胞(iPSCs)和胚胎干细胞(ESCs)在帕金森病(PD)治疗中的细胞类型差异,探讨了iPSCs作为ESCs替代品的潜力 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了iPSCs在细胞类型多样性和基因表达上与ESCs的差异,并提出了iPSCs在PD治疗中的潜在优势 | 研究主要基于GEO数据库的数据,未进行体内实验验证iPSCs在PD治疗中的实际效果 | 探讨iPSCs作为ESCs替代品在帕金森病治疗中的可行性 | 诱导多能干细胞(iPSCs)和胚胎干细胞(ESCs)在帕金森病(PD)治疗中的细胞类型差异 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库收集的ESCs和iPSCs的单细胞RNA测序数据和微阵列数据 | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-12-19 |
Single-cell transcriptome analysis reveals status changes of immune cells in chronic kidney disease
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1434535
PMID:39691368
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析揭示了慢性肾病中免疫细胞的状态变化 | 构建了慢性肾病肾脏的免疫细胞图谱,并发现了SPP1巨噬细胞作为一种独特的细胞类型 | NA | 深入了解慢性肾病中免疫细胞的组成和功能变化,发现新的治疗靶点 | 慢性肾病患者的肾脏免疫细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 42个正常样本和23个慢性肾病样本 | NA | NA | NA | NA |