单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1388 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-10-25 |
Spatial transcriptomics: a new frontier in accurate localization of breast cancer diagnosis and treatment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483595
PMID:39439806
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研究论文 | 本文总结了空间转录组学在乳腺癌诊断和治疗中的最新发现 | 空间转录组学为研究肿瘤内部结构差异和肿瘤微环境组成提供了新的视角 | NA | 探讨空间转录组学在乳腺癌精准治疗中的应用 | 乳腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 382 | 2024-10-25 |
Exploring shared biomarkers and shared pathways in insomnia and atherosclerosis using integrated bioinformatics analysis
2024, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2024.1477903
PMID:39439987
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析，探索失眠与动脉粥样硬化之间的共享生物标志物和通路 | 首次通过整合生物信息学分析，筛选出失眠与动脉粥样硬化之间的共享基因，并构建了预测模型 | 研究主要基于现有数据库数据，未进行实验验证 | 探索失眠与动脉粥样硬化之间的共享通路和诊断生物标志物 | 失眠和动脉粥样硬化 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析、基因差异表达分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、机器学习算法 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 383 | 2024-10-25 |
Integrating Bulk and Single-cell RNA-seq to Construct a Macrophage-related Prognostic Model for Prognostic Stratification in Triple-negative Breast Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101042
PMID:39440065
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研究论文 | 本研究整合了bulk和单细胞RNA测序数据，构建了一个与巨噬细胞相关的预后模型，用于三阴性乳腺癌的预后分层 | 本研究首次整合bulk和单细胞RNA测序数据，构建了一个与巨噬细胞相关的预后模型，用于三阴性乳腺癌的预后分层 | 本研究仅限于三阴性乳腺癌，未涵盖其他类型的乳腺癌 | 探索三阴性乳腺癌中巨噬细胞的异质性，并建立一个与巨噬细胞相关的预后模型，用于三阴性乳腺癌的预后分层 | 三阴性乳腺癌中的巨噬细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 384 | 2024-10-25 |
Bibliometric and visual analysis of single-cell multiomics in neurodegenerative disease arrest studies
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1450663
PMID:39440247
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研究论文 | 本研究通过文献计量学方法分析了单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用现状和趋势 | 首次系统性地利用文献计量学方法分析单细胞多组学在神经退行性疾病研究中的应用 | 主要依赖于文献计量学方法，缺乏实验数据和具体技术细节的深入分析 | 分析单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用现状和趋势 | 单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞多组学 | NA | 文献 | 596篇出版物 |
| 385 | 2024-10-24 |
Designing Oligonucleotide-Based FISH Probe Sets with PaintSHOP
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3766-1_12
PMID:38502486
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研究论文 | 本文介绍了使用PaintSHOP平台设计基于寡核苷酸的FISH探针集的方法 | PaintSHOP平台提供了用户友好的网页界面，用于设计基于寡核苷酸的FISH探针集，并包含大量预先发现的探针序列和功能序列 | NA | 介绍如何使用PaintSHOP平台设计基于寡核苷酸的FISH探针集 | 基于寡核苷酸的FISH探针集的设计 | 生物信息学 | NA | 荧光原位杂交 (FISH) | NA | 序列数据 | NA |
| 386 | 2024-10-24 |
Transcriptome meta-analysis of Kawasaki disease in humans and mice
2024, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2024.1423958
PMID:39350793
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meta-analysis | 本研究对川崎病（KD）在人类和小鼠中的转录组数据进行了元分析，以探索KD的转录组特征并评估动物模型 | 本研究首次对人类和小鼠的KD转录组数据进行了全面的元分析，揭示了关键的差异表达基因和通路，并验证了KD动物模型在识别治疗靶点方面的有效性 | 本研究主要依赖于bulk和单细胞RNA-seq数据，未来需要更全面的单细胞测序来详细描述不同血液细胞群体中的基因表达 | 探索川崎病的转录组特征并评估动物模型 | 川崎病患者的血液和冠状动脉样本，以及川崎病小鼠模型的心脏和大动脉样本 | 数字病理学 | 儿童疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括来自KD患者的血液和冠状动脉样本，以及KD小鼠模型的心脏和大动脉样本 |
| 387 | 2024-10-24 |
[Molecular pathogenesis of adult T-cell leukemia/lymphoma]
2024, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.65.1019
PMID:39358256
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研究论文 | 本文总结了成人T细胞白血病/淋巴瘤（ATLL）的分子发病机制，重点关注遗传、表观遗传和单细胞分析的最新进展 | 本文通过遗传、表观遗传和单细胞分析揭示了ATLL的分子发病机制，特别是T细胞受体/NF-κB通路和免疫相关分子的频繁改变 | NA | 探讨成人T细胞白血病/淋巴瘤（ATLL）的分子发病机制 | 成人T细胞白血病/淋巴瘤（ATLL）的分子发病机制 | NA | 白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因数据 | NA |
| 388 | 2024-10-24 |
[Immune microenvironment and immunotherapy resistance in multiple myeloma]
2024, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.65.1058
PMID:39358261
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研究论文 | 本文探讨了多发性骨髓瘤（MM）的免疫微环境及其对免疫治疗抵抗的影响 | 利用单细胞RNA测序和飞行时间流式细胞术分析了MM患者骨髓中MM细胞与免疫细胞之间的时空相互作用 | 未提及具体的研究局限性 | 研究MM的免疫微环境及其对免疫治疗抵抗的机制，为开发长期完全缓解和治愈的免疫治疗策略提供依据 | 多发性骨髓瘤（MM）患者的免疫微环境 | NA | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序、飞行时间流式细胞术 | NA | RNA | 未提及具体样本数量 |
| 389 | 2024-10-24 |
Discovery of plasma biomarkers related to blood-brain barrier dysregulation in Alzheimer's disease
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1463001
PMID:39429696
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研究论文 | 本研究旨在通过整合公开的组学数据集，识别与阿尔茨海默病（AD）相关的血浆生物标志物，特别是与血脑屏障功能障碍相关的蛋白质 | 本研究首次通过整合血浆和脑蛋白质组数据，识别出五个符合生物标志物标准的蛋白质，并验证了其在AD中的生物学有效性 | 研究尚未深入探讨蛋白质通过血脑屏障泄漏的机制 | 识别与阿尔茨海默病相关的血浆生物标志物 | 血浆和脑蛋白质组数据 | NA | 阿尔茨海默病 | 蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA |
| 390 | 2024-10-24 |
Single-cell sequencing decodes the secrets of the RAP phenomenon of corticotomy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1397727
PMID:39430747
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了皮质切开术后铁代谢相关基因的显著增加，并探讨了Atf3+巨噬细胞在加速牙齿移动中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了皮质切开术后巨噬细胞的转录组异质性，并发现Atf3+巨噬细胞在加速牙齿移动中的新作用 | 研究主要集中在巨噬细胞和铁代谢上，未全面探讨其他细胞类型和分子机制 | 探讨皮质切开术后加速牙齿移动的分子机制 | 皮质切开术后的巨噬细胞和铁代谢 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 皮质切开术后的巨噬细胞样本 |
| 391 | 2024-10-24 |
Unraveling the ecological landscape of mast cells in esophageal cancer through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1470449
PMID:39430754
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了食管癌中肥大细胞的生态景观，并构建了预测模型 | 首次应用单细胞RNA测序技术全面分析食管癌中的免疫微环境，并发现了肥大细胞的特定亚型及其在肿瘤发展中的作用 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证 | 揭示食管癌肿瘤微环境中肥大细胞的作用，并探索潜在的治疗策略 | 食管癌中的肥大细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5001个肥大细胞样本 |
| 392 | 2024-10-24 |
Integrating genomics and AI to uncover molecular targets for mRNA vaccine development in lupus nephritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381445
PMID:39430760
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习技术，分析了狼疮性肾炎患者的基因表达数据，以揭示mRNA疫苗开发的潜在分子靶点 | 本研究首次将单细胞基因组学与非负矩阵分解和机器学习相结合，揭示了狼疮性肾炎中不同的白细胞元程序，并识别了潜在的mRNA疫苗靶点 | 本研究仅限于狼疮性肾炎患者，结果可能不适用于其他自身免疫性疾病 | 本研究旨在通过整合基因组学和人工智能技术，揭示狼疮性肾炎中mRNA疫苗开发的潜在分子靶点 | 本研究主要研究对象为狼疮性肾炎患者和健康对照组的单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 24名狼疮性肾炎患者和10名健康对照组 |
| 393 | 2024-10-24 |
Spatial transcriptomic sequencing reveals immune microenvironment features of Mycobacterium tuberculosis granulomas in lung and omentum
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.99038
PMID:39431015
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析了结核分枝杆菌感染的肺和网膜组织中肉芽肿的免疫微环境特征 | 首次通过空间转录组学技术揭示了结核分枝杆菌感染的肺和网膜组织中肉芽肿的细胞组成和空间分布特征，并发现了关键差异表达基因和细胞类型在肉芽肿形成中的作用 | 研究样本量较小，仅包括四个临床活检样本，可能影响结果的普适性 | 分析基于空间位置的细胞群体转录组特征，理解肉芽肿形成和发展的核心转录组特征 | 结核分枝杆菌感染的肺和网膜组织中的肉芽肿 | 数字病理学 | 肺结核 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个临床活检样本，包括两个结核分枝杆菌感染的肺和网膜组织，以及两个非结核患者的肺和网膜组织 |
| 394 | 2024-10-24 |
Targeting exercise-related genes and placental growth factor for therapeutic development in head and neck squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1476076
PMID:39431157
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，识别与头颈鳞状细胞癌（HNSCC）预后相关的运动相关基因，并特别关注胎盘生长因子（PIGF）的治疗潜力 | 本研究首次识别了与HNSCC预后相关的运动相关基因，并探讨了PIGF作为治疗靶点的潜力 | 本研究主要基于生物信息学分析和体外实验，尚未进行体内实验验证 | 识别与HNSCC预后相关的运动相关基因，并探讨PIGF的治疗潜力 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）及其相关基因和胎盘生长因子（PIGF） | NA | 头颈鳞状细胞癌 | 转录组数据分析、基因集富集分析（GSEA）、基因本体论（GO）、京都基因与基因组百科全书（KEGG） | NA | 转录组数据 | 来自TCGA数据库的HNSCC转录组数据 |
| 395 | 2024-10-24 |
RUNX2 as a novel biomarker for early identification of patients progressing to advanced-stage mycosis fungoides
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1421443
PMID:39435287
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研究论文 | 本文研究了RUNX2作为早期识别进展到晚期蕈样霉菌病患者的潜在生物标志物 | 首次证明RUNX2在识别进展到晚期蕈样霉菌病患者中的潜力，并展示了空间转录组学与单细胞RNA测序分析结合的分析优势 | 样本量较小，仅包括15名患者 | 寻找早期区分蕈样霉菌病进展到晚期阶段的生物标志物 | 蕈样霉菌病患者的皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | RNA基因表达数据 | 15名蕈样霉菌病患者 |
| 396 | 2024-10-21 |
Emerging applications of single-cell profiling in precision medicine of atherosclerosis
2024-01-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04629-y
PMID:38263066
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在动脉粥样硬化精准医学中的新兴应用 | 介绍了单细胞测序技术在揭示动脉粥样硬化斑块、血液、肝脏和肠道特征方面的创新见解 | NA | 探讨单细胞测序技术在动脉粥样硬化精准医学中的应用潜力 | 动脉粥样硬化斑块、血液、肝脏和肠道 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 397 | 2024-10-21 |
TEM1/endosialin/CD248 promotes pathologic scarring and TGF-β activity through its receptor stability in dermal fibroblasts
2024-Jan-23, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-024-01001-0
PMID:38254097
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研究论文 | 研究TEM1蛋白在病理性瘢痕形成中的作用及其通过稳定TGF-β受体促进瘢痕形成的机制 | 首次揭示了TEM1蛋白在病理性瘢痕形成中的作用，并提出了通过靶向TEM1作为治疗病理性瘢痕的新方法 | 研究主要集中在体外细胞实验和体内小鼠模型，尚未在人体上进行验证 | 探讨TEM1蛋白在病理性瘢痕形成中的作用及其机制 | TEM1蛋白、病理性瘢痕、TGF-β信号通路 | NA | NA | 免疫荧光染色、Western blotting、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 蛋白质、RNA | 包括正常皮肤、肥厚性瘢痕和瘢痕疙瘩的样本，以及小鼠模型 |
| 398 | 2024-10-21 |
Schizophrenia endothelial cells exhibit higher permeability and altered angiogenesis patterns in patient-derived organoids
2024-Jan-23, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-024-02740-2
PMID:38263175
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研究论文 | 研究使用患者来源的诱导多能干细胞（iPSCs）生成3D大脑类器官，以模拟精神分裂症（SCZ）在早期大脑发育关键时期的神经病理学特征 | 首次揭示了精神分裂症患者来源的类器官中内皮细胞的高渗透性和血管生成模式的改变 | 研究仅基于23个捐赠者的数据，样本量有限 | 探讨精神分裂症患者大脑发育过程中内皮细胞和血管功能障碍的作用 | 精神分裂症患者来源的诱导多能干细胞（iPSCs）生成的大脑类器官 | NA | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 23个捐赠者的数据 |
| 399 | 2024-10-21 |
SURGE: uncovering context-specific genetic-regulation of gene expression from single-cell RNA sequencing using latent-factor models
2024-01-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03152-z
PMID:38254214
|
研究论文 | 开发了一种名为SURGE的方法，用于从单细胞转录组数据中发现特定上下文下的表达数量性状位点（eQTLs） | SURGE方法能够在没有先验知识的情况下，发现调节遗传调控的上下文或细胞类型 | NA | 研究基因表达的遗传调控在不同细胞上下文中的变化 | 单细胞转录组数据中的表达数量性状位点（eQTLs） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 潜在因子模型 | 转录组数据 | 外周血单细胞eQTL数据 |
| 400 | 2024-10-21 |
A predisposed motor bias shapes individuality in vocal learning
2024-Jan-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2308837121
PMID:38198530
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研究论文 | 研究探讨了鸣禽通过发声学习发展个体独特性的发育和分子机制 | 首次结合实验控制的系统发声训练、无偏差判别分析和单细胞转录组学，揭示了遗传倾向的发声运动偏差在发声学习个体变异中的初始起源 | 研究仅限于F杂交鸣禽，未来研究需要扩展到其他物种以验证结果的普遍性 | 探究发声学习中个体独特性的发育和分子机制 | F杂交鸣禽的发声学习过程 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 声音特征数据 | F杂交鸣禽个体 |