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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-01-05 |
Unveiling Key Biomarkers and Mechanisms in Septic Cardiomyopathy: A Comprehensive Transcriptome Analysis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S486763
PMID:39735900
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了脓毒性心肌病(SCM)的关键生物标志物及其潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序和功能富集分析,揭示了SCM与免疫反应、铁死亡、焦亡、铜死亡及m6A RNA甲基化修饰之间的联系 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 识别SCM的关键生物标志物并探索其潜在机制 | 正常小鼠和SCM小鼠 | 生物信息学 | 脓毒性心肌病 | 转录组分析、单细胞RNA测序、qPCR | NA | RNA测序数据 | GSE53007和GSE207363数据集中的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2025-01-05 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Heterogeneity of T Cells in Mice with Systemic Lupus Erythematosus and Neuronal Inflammation
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S474211
PMID:39735894
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,探索了系统性红斑狼疮(SLE)小鼠中T细胞的异质性及其从脾脏到大脑的迁移 | 发现了SLE小鼠中显著表达Eomes和其他特定标志物的双阴性T细胞群体,并揭示了这些细胞与细胞衰老和耗竭的强关联 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类患者 | 探索系统性红斑狼疮小鼠中T细胞的异质性及其在神经炎症中的作用 | MRL/lpr小鼠和BALB/c小鼠的脑和脾脏组织 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 27704个来自MRL/lpr小鼠的细胞和25355个来自BALB/c小鼠的健康对照细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2025-01-05 |
Single-Cell Sequencing and Machine Learning Integration to Identify Candidate Biomarkers in Psoriasis: INSIG1
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S492875
PMID:39735895
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和机器学习整合,识别了银屑病中的候选生物标志物INSIG1,并验证了其治疗潜力 | 结合单细胞RNA测序和机器学习方法,识别了银屑病中新的候选基因INSIG1,并验证了其与T细胞的负相关性及其在脂肪酸代谢中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,仍需进一步的临床和体内实验验证 | 识别银屑病中的新治疗靶点和候选生物标志物 | 银屑病患者和T细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2025-01-05 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and prognostic markers of myeloid precursor cells in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494106
PMID:39737198
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和单细胞RNA测序数据,识别了与急性髓性白血病(AML)预后相关的关键基因,并建立了一个预后评估模型 | 识别了八个与AML预后显著相关的关键基因,并构建了一个有效的预后评估模型,揭示了AML细胞在免疫功能和代谢途径上的差异 | NA | 提高AML预后预测的准确性 | 急性髓性白血病(AML)患者 | 生物信息学 | 急性髓性白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 预后评估模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2025-01-05 |
Unraveling Alzheimer's disease: insights from single-cell sequencing and spatial transcriptomic
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1515981
PMID:39741706
|
综述 | 本文综述了单细胞测序和空间转录组学在阿尔茨海默病研究中的最新进展 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示了阿尔茨海默病的细胞异质性和神经免疫机制,发现了与疾病相关的小胶质细胞亚群和基因表达变化 | 需要进一步整合其他组学数据以实现对阿尔茨海默病的全面理解 | 理解复杂的细胞相互作用,以识别新的治疗靶点和生物标志物 | 阿尔茨海默病的细胞异质性和神经免疫机制 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2025-01-05 |
Single-Cell and Transcriptome Analysis of Periodontitis: Molecular Subtypes and Biomarkers Linked to Mitochondrial Dysfunction and Immunity
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S498739
PMID:39741754
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组数据分析,揭示了牙周炎中免疫反应与线粒体功能障碍之间的相互作用,并识别了新的分子亚型和生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序和转录组数据分析,识别了牙周炎的四种分子亚型,并发现了与线粒体功能障碍和免疫反应相关的生物标志物 | 研究结果需要进一步在更大规模的临床样本中进行验证,以确认其普遍性和实用性 | 阐明线粒体功能障碍和免疫反应在牙周炎发病机制中的作用,识别分子亚型并发现诊断生物标志物,以支持精准医学方法 | 牙周炎患者 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、转录组分析、qPCR、IHC | 机器学习算法 | RNA测序数据、临床样本数据 | 牙周炎患者的单细胞RNA测序和转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2025-01-05 |
Hidden features: CD36/SR-B2, a master regulator of macrophage phenotype/function through metabolism
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1468957
PMID:39742252
|
review | 本文综述了CD36/Scavenger Receptor B2在巨噬细胞表型和功能中的核心作用,特别是在代谢调控方面 | 强调了CD36在巨噬细胞代谢表达谱中的关键作用,以及其在微环境变化下对巨噬细胞功能的重塑潜力 | 主要基于现有文献综述,缺乏新的实验数据支持 | 探讨CD36/Scavenger Receptor B2在巨噬细胞表型和功能调控中的作用 | 巨噬细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化、肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2025-01-05 |
Leveraging single-cell and multi-omics approaches to identify MTOR-centered deubiquitination signatures in esophageal cancer therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1490623
PMID:39742278
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和多组学方法,识别了食管癌治疗中以MTOR为中心的去泛素化特征 | 首次开发了基于14个去泛素化相关基因(DUBGs)的基因特征模型,用于预测食管鳞状细胞癌(ESCC)患者的预后和免疫治疗反应,并验证了MTOR作为潜在治疗靶点 | 研究主要依赖于TCGA-ESCC和GSE53624数据集,样本来源可能有限,且需要进一步临床验证 | 探索去泛素化相关基因在食管鳞状细胞癌(ESCC)中的作用,并开发预测模型以指导个性化治疗 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者 | 癌症研究 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、Cox回归模型、细胞间通讯分析、基因本体富集分析、突变分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据、突变数据 | TCGA-ESCC和GSE53624数据集中的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2025-01-05 |
FB5P-seq-mAbs: monoclonal antibody production from FB5P-seq libraries for integrative single-cell analysis of B cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1505971
PMID:39742275
|
研究论文 | 本文提出了一种整合FACS-based 5'-end单细胞RNA测序(FB5P-seq)和单克隆抗体克隆的方法,用于单B细胞的综合分析 | 该方法结合了单细胞RNA测序和单克隆抗体克隆,能够从单B细胞中获取转录组和抗原受体序列,并生产相应的单克隆抗体进行功能分析 | 需要从单B细胞中克隆抗体并进行功能分析,过程较为复杂 | 开发一种用于单B细胞综合分析的集成方法,以追踪B细胞在免疫反应中的激活和成熟 | B细胞 | 单细胞分析 | NA | FACS-based 5'-end单细胞RNA测序(FB5P-seq),单克隆抗体克隆 | NA | RNA-seq数据,抗体序列数据 | 卵清蛋白特异性小鼠生发中心B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2025-01-05 |
Development and validation of a programmed cell death index to predict the prognosis and drug sensitivity of gastric cancer
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1477363
PMID:39744132
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一种基于程序性细胞死亡(PCD)的胃癌预后和药物敏感性预测指标 | 开发了一种新的十二基因标志物PCDI,用于预测胃癌患者的预后和药物敏感性,并建立了整合PCDI和临床特征的高性能列线图 | 研究依赖于公开的转录组数据和临床信息,可能受到数据质量和样本量的限制 | 开发一种基于PCD的胃癌预后和药物敏感性预测指标 | 胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 转录组数据分析 | LASSO回归分析 | 转录组数据和临床信息 | TCGA-STAD数据集以及GSE62254、GSE15459和GSE26901微阵列数据用于验证,GSE183904单细胞转录组数据用于分析 | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2025-01-05 |
ABCA1 promote tumor environment heterogeneity via epithelial mesenchymal transition in Huh7 and HepG2 liver cancer cell
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1498528
PMID:39749197
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌(HCC)中细胞通讯的内在机制,通过单细胞测序分析了恶性细胞亚群和癌症相关成纤维细胞(CAF)亚群,揭示了它们通过受体-配体相互作用的相互作用,并特别关注了SPP1 | 通过单细胞测序和湿实验室实验揭示了ABCA1在肝细胞癌中的促癌作用,并开发了基因风险评分模型来预测患者预后 | 研究主要基于Huh7和HepG2肝癌细胞系,可能无法完全代表所有肝细胞癌的异质性 | 探讨肝细胞癌中细胞通讯的内在机制及其对肿瘤微环境异质性的影响 | Huh7和HepG2肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 基因风险评分模型 | 单细胞数据 | Huh7和HepG2肝癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2025-01-05 |
Single-cell and spatiotemporal transcriptomic profiling of brain immune infiltration following Venezuelan equine encephalitis virus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1497839
PMID:39749347
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,在小鼠模型中全面分析了Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV)感染后脑部免疫细胞的转录组特征 | 揭示了VEEV感染后脑部免疫细胞的不同亚群及其独特的转录特征,包括一种表达I型干扰素的小胶质细胞亚群,以及髓系细胞和细胞毒性淋巴细胞的顺序浸润 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 阐明VEEV感染后脑部免疫反应的机制,特别是特定免疫细胞亚群的作用 | VEEV感染后的小鼠脑部免疫细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2025-01-03 |
A cost-effective protocol for single-cell RNA sequencing of human skin
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1393017
PMID:39539550
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研究论文 | 本文介绍了一种成本效益高的人类皮肤单细胞RNA测序(scRNAseq)和流式细胞术分析的新协议 | 提出了一种无标签样本多重化策略,结合souporcell算法,实现了配对血液和皮肤样本的scRNAseq分析,并提供了同时进行流式细胞术分析的详细步骤 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种成本效益高的方法,使更多研究者能够进行皮肤样本的scRNAseq和流式细胞术分析 | 人类皮肤样本 | 单细胞RNA测序 | NA | scRNAseq, 流式细胞术 | souporcell算法 | RNA序列数据, 流式细胞术数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-12-29 |
The combined use of scRNA-seq and network propagation highlights key features of pan-cancer Tumor-Infiltrating T cells
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0315980
PMID:39729479
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研究论文 | 本文结合单细胞RNA测序和网络传播技术,揭示了泛癌肿瘤浸润T细胞的关键特征 | 结合单细胞RNA测序和网络传播技术,克服了单细胞转录组学中的噪声和稀疏性问题,并揭示了TI-Treg和Tex的发育、功能及其免疫代谢特异性 | NA | 提高免疫肿瘤学中药物选择性和有效性的未来治疗发展 | 肿瘤浸润调节性T细胞(TI-Tregs)和耗竭T细胞(Tex) | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-12-29 |
[Neuronal models based on olfactory epithelial cells in the study of the pathogenesis of mental disorders]
2024, Zhurnal nevrologii i psikhiatrii imeni S.S. Korsakova
DOI:10.17116/jnevro202412412120
PMID:39731365
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综述 | 本文综述了基于嗅觉上皮细胞的神经元模型在研究精神障碍发病机制中的应用 | 利用嗅觉上皮细胞模型研究精神疾病的分子机制,特别是通过单细胞RNA测序和DNA甲基化分析等先进技术 | NA | 研究精神障碍的发病机制及个性化治疗方法 | 精神分裂症、双相情感障碍和阿尔茨海默病 | 神经科学 | 精神障碍 | 单细胞RNA测序、DNA甲基化分析 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-12-28 |
An update review of the application of single-cell RNA sequencing in pregnancy-related diseases
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1415173
PMID:39717096
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在妊娠相关疾病中的应用 | 提供了scRNA-seq技术在人类胎盘研究中的最新进展,特别是在正常妊娠和妊娠相关疾病中的应用 | 讨论了scRNA-seq技术在生殖领域中的局限性和未来展望 | 更新产科医生对scRNA-seq技术在妊娠并发症中的理解,以帮助诊断和治疗这些疾病 | 人类胎盘,特别是在正常妊娠和妊娠相关疾病中的细胞 | 生物信息学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-12-28 |
Exposure to Nanoplastics Cause Caudal Vein Plexus Damage and Hematopoietic Dysfunction by Oxidative Stress Response in Zebrafish (Danio rerio)
2024, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S485091
PMID:39723177
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研究论文 | 本研究探讨了纳米塑料对斑马鱼尾静脉丛发育和造血功能的负面影响及其机制 | 首次揭示了纳米塑料通过氧化应激反应导致斑马鱼尾静脉丛损伤和造血功能障碍的分子机制 | 研究仅基于斑马鱼胚胎模型,未涉及其他生物或人类细胞模型 | 探究纳米塑料对斑马鱼早期造血器官发育的影响 | 斑马鱼胚胎 | 环境毒理学 | NA | 荧光显微镜、RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RT-qPCR | NA | 基因表达数据、显微镜图像 | 斑马鱼胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-12-28 |
Integration of bulk/scRNA-seq and multiple machine learning algorithms identifies PIM1 as a biomarker associated with cuproptosis and ferroptosis in abdominal aortic aneurysm
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1486209
PMID:39723205
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和多种机器学习算法,识别出与腹主动脉瘤中铁死亡和铜死亡相关的生物标志物PIM1 | 首次通过整合单细胞RNA测序和多种机器学习算法,识别出与腹主动脉瘤中铁死亡和铜死亡相关的生物标志物PIM1 | 研究主要依赖于生物信息学分析和机器学习模型,实验验证部分相对有限 | 识别与腹主动脉瘤中铁死亡和铜死亡相关的生物标志物 | 腹主动脉瘤 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, RT-qPCR, western blot | LASSO, REF, RF, SVM | RNA-seq数据 | 三个小鼠模型的scRNA-seq数据集和一个人类PBMC的bulk RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-12-28 |
Migrasome regulator TSPAN4 shapes the suppressive tumor immune microenvironment in pan-cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1419420
PMID:39723210
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研究论文 | 本文探讨了TSPAN4在多种癌症中的表达及其对肿瘤免疫抑制微环境的影响 | 首次揭示了TSPAN4作为迁移体调节因子在泛癌症中塑造免疫抑制肿瘤微环境的关键作用 | TSPAN4在癌症中的具体机制仍需进一步实验验证 | 研究TSPAN4在癌症中的表达及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 多种癌症类型,特别是胶质瘤 | 癌症研究 | 泛癌症 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | TCGA Pan-Cancer (PANCAN) 和 TCGA TARGET GTEx 数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-12-26 |
Single-cell profiling uncovers synovial fibroblast subpopulations associated with chondrocyte injury in osteoarthritis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1479909
PMID:39720254
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞损伤之间的相互作用和关联 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞之间的相互作用,并识别了具有修复和保护作用的CILP+成纤维细胞以及可能加剧软骨损伤的POSTN+成纤维细胞 | 研究主要基于单细胞测序数据,缺乏体内实验验证,且样本量未明确说明 | 阐明骨关节炎中滑膜细胞与软骨细胞之间的相互作用和关联,以深化对骨关节炎发病机制的理解 | 骨关节炎患者的滑膜细胞和软骨细胞 | 单细胞测序 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |