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当前共找到 1397 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-09-10 |
Identifying HIF1A and HGF as two hub genes in aortic dissection and function analysis by integrating RNA sequencing and single-cell RNA sequencing data
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1475991
PMID:39479394
|
研究论文 | 通过整合RNA测序和单细胞RNA测序数据，筛选并验证了主动脉夹层中的两个关键基因HIF1A和HGF，并分析了其潜在功能。 | 创新性地结合RNA-seq和scRNA-seq数据筛选出HIF1A和HGF为主动脉夹层的关键基因，并在单细胞水平揭示了它们在巨噬细胞和血管平滑肌细胞中的特异表达及调控网络。 | 研究基于公共数据集和动物模型，缺乏临床样本验证，且功能实验仅限于初步的mRNA表达检测，未深入探究蛋白水平和具体机制。 | 探索主动脉夹层的发病机制，为诊断和治疗提供参考。 | 主动脉夹层患者及BAPN诱导的小鼠模型主动脉组织样本和细胞。 | 基因组学、生物信息学 | 主动脉夹层 | RNA-seq、单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、ROC曲线分析、实时定量PCR | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | 涉及多个GEO数据集，包括GSE153434、GSE98770、GSE52093和GSE213740，以及BAPN处理的小鼠主动脉组织。 | NA | RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-09-09 |
ABCA7-dependent Neuropeptide-Y signalling is a resilience mechanism required for synaptic integrity in Alzheimer's disease
2024-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.02.573893
PMID:38260408
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研究论文 | 该研究通过CRISPR/Cas9基因编辑技术生成ABCA7基因敲除的斑马鱼模型，结合单细胞转录组学和人类临床数据，揭示了ABCA7依赖性神经肽Y信号在维持阿尔茨海默病突触完整性中的韧性机制。 | 首次揭示ABCA7通过NPY信号传导调节神经元与胶质细胞间的交互，从而维持突触完整性，并提出ABCA7功能受损降低大脑韧性是AD风险因素的新机制。 | 研究主要基于斑马鱼模型，其与人类疾病的相关性需进一步验证；临床数据中ABCA7表达与Braak阶段的关联为观察性，因果关系未直接证明。 | 探究ABCA7基因（AD风险基因）在阿尔茨海默病中的作用机制，特别是其如何影响突触完整性和大脑韧性。 | ABCA7基因敲除的斑马鱼模型、Aβ42诱导的病理模型、人类AD临床样本（包括基因表达、遗传变异和表观遗传数据）。 | 神经科学、分子生物学、基因组学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞转录组测序、临床基因关联分析、表观遗传分析 | 基因敲除斑马鱼模型、细胞间信号传导模型 | 单细胞转录组数据、临床基因表达数据、遗传变异和表观遗传数据 | 斑马鱼模型（具体数量未在摘要中提供）、人类AD样本（具体数量未在摘要中提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-09-09 |
Polycystic ovarian syndrome (PCOS) and recurrent spontaneous abortion (RSA) are associated with the PI3K-AKT pathway activation
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17950
PMID:39253602
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示多囊卵巢综合征（PCOS）和复发性自然流产（RSA）共有的病理机制，特别是PI3K-AKT信号通路的激活。 | 首次整合PCOS和RSA的单细胞RNA-seq数据，利用WGCNA和GSEA等生物信息学方法，鉴定了两个疾病共有的关键基因和通路，并通过实验验证了PRLR基因在PI3K-AKT通路中的作用。 | 仅基于公开数据库的数据进行分析，缺乏体内实验验证，且样本量有限，可能限制结果的普遍性。 | 阐明PCOS和RSA共有的病理机制，探索PI3K-AKT信号通路在两种疾病中的作用，为临床治疗提供新方向。 | 多囊卵巢综合征（PCOS）和复发性自然流产（RSA）患者的数据集（GSE168404、GSE193123、GSE113790、GSE178535）及KGN细胞。 | 生物信息学、医学研究 | 多囊卵巢综合征、复发性自然流产 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、基因集富集分析（GSEA）、RT-qPCR、细胞活力测定（CCK-8）、流式细胞术 | NA | 基因表达数据（单细胞RNA-seq）和实验数据 | 四个公开数据集，具体样本数未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-09-09 |
The burgeoning spatial multi-omics in human gastrointestinal cancers
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17860
PMID:39285924
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综述 | 本文全面概述了空间转录组学、空间蛋白质组学和空间代谢组学等技术及其在食管癌、胃癌和结直肠癌研究中的应用，旨在推动空间多组学技术在消化系统肿瘤疾病中的研究与应用。 | 整合了空间多组学技术（包括转录组、蛋白质组、代谢组）在人类消化道癌症（食管癌、胃癌和结直肠癌）中的最新应用，强调了这些技术如何通过保留空间信息来增强对肿瘤微环境和异质性的理解 | 本文为综述性文章，不包含原始实验数据；未详细讨论各技术的局限性或比较不同空间多组学技术的具体性能差异 | 综述空间多组学技术在人类消化道癌症中的应用进展，为分子生物学研究者提供新的技术见解 | 食管癌、胃癌和结直肠癌组织样本中的空间多组学数据 | 数字病理学 | 消化道癌症（食管癌、胃癌、结直肠癌） | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学 | NA | 空间组学数据（转录组、蛋白质组、代谢组） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2026-09-08 |
G0 arrest gene patterns to predict the prognosis and drug sensitivity of patients with lung adenocarcinoma
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309076
PMID:39159158
|
研究论文 | 本研究基于G0期停滞相关基因构建了肺腺癌患者的预后和药物敏感性预测模型，并验证了其与肿瘤微环境和治疗反应的关系 | 首次开发了基于G0A相关基因的六基因特征，用于预测肺腺癌患者的生存预后和药物敏感性，并通过多种数据集和实验验证了其可靠性 | 未提及具体局限性，但可能受限于回顾性数据分析和外部验证数据集的异质性 | 开发并验证一种基于G0A相关基因的预后信号，以改善肺腺癌患者的预后预测和个性化治疗策略 | 肺腺癌患者，涉及TCGA-LUAD队列及多个公共转录组数据集（GSE50081, GSE72094, GSE127465, GSE131907, EMTAB6149）中的肿瘤样本和细胞系 | 基因组学、生物信息学 | 肺腺癌 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、实时定量PCR | Cox回归模型、Lasso回归模型、列线图 | 基因表达数据、临床数据、单细胞转录组数据 | TCGA-LUAD队列及多个外部数据集，涉及数百至上千例患者样本，具体数量未提及 | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-09-05 |
Heat Inactivation of Nipah Virus for Downstream Single-Cell RNA Sequencing Does Not Interfere with Sample Quality
2024-01-09, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13010062
PMID:38251369
|
研究论文 | 本研究评估了在单细胞RNA测序流程中加入热处理步骤对灭活尼帕病毒的效果，并确认该步骤不影响样本质量 | 首次验证在商用微流控单细胞RNA测序平台中，通过在cDNA合成后加入85°C热处理5分钟，可有效灭活BSL-4级别的尼帕病毒，同时保持样本质量和测序结果不受影响 | 研究仅限于尼帕病毒和特定商用平台，可能不适用于其他BSL-4病原体或不同测序平台 | 确保在处理BSL-4病原体样本时，单细胞RNA测序流程包含有效的病毒灭活步骤，同时不影响下游分析质量 | 尼帕病毒（NiV）感染的细胞样本，用于单细胞RNA测序分析 | 单细胞测序，病毒学 | 尼帕病毒感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 商用微流控分区单细胞RNA测序平台，具体配置未明确，但涉及cDNA合成后的热处理步骤 |
| 27 | 2026-09-05 |
Identification of ligand and receptor interactions in CKD and MASH through the integration of single cell and spatial transcriptomics
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0302853
PMID:38768139
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学数据，识别慢性肾脏病和代谢功能障碍相关脂肪性肝炎中的配体-受体相互作用 | 建立了整合单细胞和空间转录组数据的分析框架，以揭示细胞特异性配体-受体相互作用，并发现新的潜在治疗靶点 | 信息不足，未提供具体限制 | 深入理解CKD和MASH的分子机制，通过整合单细胞和空间转录组学数据识别细胞间的配体-受体相互作用 | 慢性肾脏病和代谢功能障碍相关脂肪性肝炎患者的人体样本 | 转录组学 | 慢性肾脏病，代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 两个人类队列 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 28 | 2026-09-04 |
Dandelion uses the single-cell adaptive immune receptor repertoire to explore lymphocyte developmental origins
2024-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01734-7
PMID:37055623
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研究论文 | 介绍了一种名为Dandelion的计算流程，用于单细胞适应性免疫受体测序数据分析，以探索淋巴细胞的发育起源。 | 提出了一个基于单细胞数据集的AIR特征空间构建策略，用于差分VDJ使用分析和拟时间轨迹推断，并改进了VDJ序列比对和鉴定非生产性及部分剪接的contigs。 | 未明确说明局限性，可能受限于数据质量和计算资源。 | 开发一种计算流程以改进单细胞AIR测序分析，并应用于淋巴细胞发育轨迹和起源研究。 | 人类胸腺发育中的双阳性T细胞、成熟单阳性CD4/CD8 T细胞、B1细胞和ILC/NK细胞。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞VDJ测序 | NA | 单细胞基因表达和适应性免疫受体序列数据 | 人类胸腺样本（未明确数量） | NA | 单细胞RNA测序，单细胞VDJ测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-09-04 |
A relay velocity model infers cell-dependent RNA velocity
2024-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01728-5
PMID:37012448
|
研究论文 | 本文提出了一个名为cellDancer的可扩展深度神经网络，用于从单细胞RNA测序数据中推断细胞依赖的RNA速度，通过局部推断每个细胞的速度并中继一系列局部速度来提供单细胞分辨率的速率动力学推断。 | cellDancer首次实现了对每个细胞独立推断RNA速度，克服了传统模型假设所有细胞具有相同动力学速率的限制，适用于多阶段和多谱系细胞状态转换的实验，并提供细胞特异性的转录、剪接和降解速率预测。 | 摘要中未提及明确的局限性。 | 开发一种新方法，以单细胞分辨率推断RNA速度，解决现有RNA速度模型在多阶段和多谱系细胞状态转换中的不足。 | 小鼠胰腺、红细胞成熟和hippocampus发育过程中的细胞状态转换。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2026-09-04 |
Single-cell sequencing reveals transcriptional dynamics regulated by ERα in mouse ovaries
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0313867
PMID:39570927
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示ERα敲除小鼠卵巢细胞中由ERα调控的转录动态变化 | 首次通过单细胞分辨率揭示ERα在卵巢不同细胞类型（卵母细胞和颗粒细胞）中的转录调控作用，并识别出ERα依赖的Greb1表达 | 摘要中未提及研究的局限性 | 阐明ERα在卵巢细胞中调控转录动态的分子机制 | 野生型和ERα敲除（αERKO）小鼠的卵巢细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢功能障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | ERα敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 涉及野生型和αERKO小鼠的卵巢细胞，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-09-03 |
Single-cell transcriptome analysis reveals distinct cell populations in dorsal root ganglia and their potential roles in diabetic peripheral neuropathy
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0306424
PMID:39083491
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了背根神经节中的不同细胞群及其在糖尿病周围神经病变中的潜在作用。 | 首次利用单细胞RNA测序技术对糖尿病周围神经病变大鼠模型的背根神经节进行系统分析，识别出八个细胞群及其亚型，并揭示了细胞间通信和与DPN相关的异常转录本。 | 研究仅基于大鼠模型，可能不完全等同于人类DRG的细胞异质性，且未进行功能实验验证特定细胞类型在DPN中的作用。 | 探讨背根神经节在糖尿病周围神经病变发病机制中的作用，并深入理解DRG细胞组成及其不同细胞类型在介导DPN中的角色。 | 健康对照和糖尿病周围神经病变大鼠的背根神经节组织。 | 单细胞转录组学 | 糖尿病周围神经病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照和DPN大鼠的DRG组织样本，具体数量在摘要中未提及。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-09-03 |
Cancer-wide in silico analyses using differentially expressed genes demonstrate the functions and clinical relevance of JAG, DLL, and NOTCH
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0307943
PMID:39074091
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研究论文 | 利用差异表达基因进行全癌症范围的计算机分析，揭示JAG、DLL和NOTCH家族在癌症中的功能及临床相关性 | 采用跨15种癌症类型的差异表达基因与标志性基因集富集分析，结合单细胞RNA测序数据，探索JAG、DLL和NOTCH家族的新调控功能及合成致死效应 | 主要基于计算机分析和公开数据库，缺乏实验验证 | 阐明JAG、DLL和NOTCH家族在多种癌症中的普遍功能及其与临床特征的联系 | 15种癌症类型的基因表达数据及单细胞RNA测序数据 | 生物信息学, 癌症基因组学 | 泛癌种 | 差异表达基因分析, 基因集富集分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 15种癌症类型的临床样本数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-09-03 |
Single-cell RNA sequencing of nc886, a non-coding RNA transcribed by RNA polymerase III, with a primer spike-in strategy
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0301562
PMID:39190696
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研究论文 | 本研究开发了一种通过引物加标策略对RNA聚合酶III转录的非编码RNA nc886进行单细胞RNA测序的方法，并在三种不同表达水平的细胞系中验证了其效果 | 首次提出针对Pol III转录的非编码RNA的单细胞测序方案，通过引物加标策略捕获无polyA尾的nc886，并分离测序文库以避免干扰转录组分析 | 寡核苷酸标签的识别特异性有限，但可通过测序读数校正非特异性引发 | 开发用于单细胞水平分析Pol III转录非编码RNA的测量方案，以nc886为例进行初步探索 | 表达高、低和零水平nc886的三种细胞系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 5' scRNA-seq |
| 34 | 2026-09-02 |
Comprehensive analysis of macrophage-associated inflammatory genes in AMI based on bulk combined with single-cell sequencing data
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17981
PMID:39308815
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研究论文 | 本研究综合分析了急性心肌梗死中巨噬细胞相关炎症基因，结合批量与单细胞测序数据，鉴定出关键基因并验证其表达上调 | 结合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，首次全面分析AMI中巨噬细胞相关炎症基因，并鉴定出Saa3、Acp5、Fcgr4作为潜在生物标志物 | 本研究依赖生物信息学分析，实验验证仅限于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探索急性心肌梗死后巨噬细胞相关炎症反应中的关键靶点，提供治疗新视角 | 急性心肌梗死中的巨噬细胞及相关炎症基因 | 生物信息学 | 急性心肌梗死 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qRT-PCR | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 多个数据集（GSE163465, GSE236374, GSE183272, GSE114695）及小鼠心肌组织 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-09-01 |
HMGB2 drives tumor progression and shapes the immunosuppressive microenvironment in hepatocellular carcinoma: insights from multi-omics analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1415435
PMID:39247201
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，发现HMGB2在肝细胞癌的转移亚群中显著上调，并与免疫抑制微环境和不良预后相关，提示其作为治疗靶点和预后标志物的潜力 | 采用多组学整合方法，包括单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学和多重免疫组化，首次揭示HMGB2在肝癌转移和免疫抑制中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据，未深入探讨HMGB2的上下游调控机制，且临床样本验证规模有限 | 探究肝细胞癌中影响肿瘤进展和免疫抑制微环境的关键因子，特别是HMGB2的作用 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本及临床数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 多个肝癌患者队列的临床样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 36 | 2026-09-01 |
Platinum-based chemotherapy promotes antigen presenting potential in monocytes of patients with high-grade serous ovarian carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1414716
PMID:39315092
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高级别浆液性卵巢癌患者外周血单核细胞，发现铂类化疗可促进单核细胞的抗原呈递潜力 | 首次揭示铂类化疗通过转录上调MHC II类分子而非表观遗传改变来诱导单核细胞抗原呈递，且该效应在三个单核细胞亚群中均存在 | 未提供具体局限性信息 | 揭示高级别浆液性卵巢癌患者外周血单核细胞的肿瘤特异性转录和表观遗传变化，以及化疗如何重编程单核细胞及其与其他免疫亚群的关系 | 高级别浆液性卵巢癌患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-09-01 |
Single-cell and bulk transcriptomic datasets enable the development of prognostic models based on dynamic changes in the tumor immune microenvironment in patients with hepatocellular carcinoma and portal vein tumor thrombus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1414121
PMID:39530087
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研究论文 | 本研究整合单细胞和批量转录组数据，开发基于肝细胞癌伴门静脉癌栓患者肿瘤免疫微环境动态变化的预后模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，系统分析原发肿瘤与门静脉癌栓细胞的异质性，并建立能预测免疫治疗和预后结局的风险模型 | 体外实验仅部分验证了生物学预测结果，且研究基于公共数据库，可能存在样本选择偏倚 | 开发基于肿瘤免疫微环境动态变化的预后模型，以预测肝细胞癌伴门静脉癌栓患者的免疫治疗和预后结局 | 肝细胞癌伴门静脉癌栓患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 聚类模型、风险模型 | 转录组数据 | 未明确说明（基于公共数据库） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-08-29 |
Developing an advanced diagnostic model for hepatocellular carcinoma through multi-omics integration leveraging diverse cell-death patterns
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1410603
PMID:39044829
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研究论文 | 通过整合多组学数据，利用多种细胞死亡模式构建了肝细胞癌（HCC）的七基因诊断模型，并验证了其诊断效能及潜在机制。 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组测序及血液外泌体RNA测序，基于六类细胞死亡相关基因构建了一个七基因诊断模型，并探索了关键基因与免疫检查点阻断治疗的相关性。 | 未明确提及局限性，但可能受限于样本量较小、数据库来源的异质性以及临床验证的广度。 | 阐明程序性细胞死亡相关基因在肝细胞癌中的作用，并构建高效的诊断模型以改善HCC的诊断方法。 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织和血液来源外泌体样本，以及相应的单细胞和空间转录组数据。 | 数字病理学、机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序、RNA测序、定量聚合酶链反应、免疫组织化学 | 机器学习模型（具体未指定） | 基因表达数据、影像数据（空间转录组）、文本（临床信息） | 50个样本和104,288个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-08-29 |
Mitotic catastrophe heterogeneity: implications for prognosis and immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1409448
PMID:39015573
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研究论文 | 本研究基于有丝分裂灾难（MC）相关基因，通过多组学数据分析揭示肝细胞癌中MC异质性对预后和免疫治疗的影响，并构建预后风险模型 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组分析，揭示MC异质性与免疫逃逸及治疗抵抗的关联，并构建结合MC风险评分和传统指标的预后列线图 | 主要依赖公共数据库数据，缺乏实验验证；MC基因列表基于既往研究，可能存在选择偏倚 | 探究肝细胞癌中有丝分裂灾难异质性与免疫逃逸及治疗反应的关系，并开发预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本及其肿瘤微环境中的免疫特征和空间表达数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组分析 | 风险评分模型 | 转录组数据、空间转录组数据、临床数据 | 基于TCGA、GEO、ICLC等公共数据库的肝细胞癌患者数据，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2026-08-29 |
Identification of novel biomarkers related to neutrophilic inflammation in COPD
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1410158
PMID:38873611
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研究论文 | 本研究通过生物信息学预测和实验验证，识别出与慢性阻塞性肺疾病中性粒细胞炎症相关的新型枢纽基因 | 结合单细胞RNA测序、批量RNA测序、孟德尔随机化和蛋白质-蛋白质相互作用网络分析，识别出9个与COPD中性粒细胞炎症相关的新型枢纽基因，并验证了其中两个作为COPD风险因素的潜在生物标志物 | 研究主要依赖公开数据集和有限的临床样本验证，可能限制发现的普遍性；qRT-PCR验证在白细胞中进行，未在肺组织中直接验证 | 识别与COPD中性粒细胞炎症相关的新型枢纽基因，并探索其作为临床严重程度生物标志物的潜力 | COPD患者和对照组的肺组织和外周血白细胞 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、蛋白质-蛋白质相互作用网络、实时定量PCR | Seurat, irGSEA, Monocle2, CIBERSORT, WGCNA | 基因表达数据（scRNA-seq和RNA-seq）、临床标本数据 | GSE173896（scRNA-seq）和GSE57148（RNA-seq）数据集，临床标本中的外周血白细胞（具体数量未在摘要中提供） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |