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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-06-20
CellSTAR: a comprehensive resource for single-cell transcriptomic annotation
2024-01-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 CellSTAR是一个全面的单细胞转录组注释资源数据库,整合了 expertly 注释的参考数据和数万个标记基因,用于细胞类型注释 首次提供涵盖数百种细胞类型的综合专家注释参考数据,并整合了参考数据和标记基因的集体考量 无可用信息 开发一个全面的单细胞转录组注释资源数据库,支持细胞类型注释和细胞异质性研究 单细胞转录组数据中的细胞类型注释 生物信息学 无可用信息 单细胞转录组测序 NA 文本数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2026-06-20
CellCommuNet: an atlas of cell-cell communication networks from single-cell RNA sequencing of human and mouse tissues in normal and disease states
2024-01-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
research paper CellCommuNet是一个综合性数据资源,用于探索人类和小鼠组织在正常和疾病状态下单细胞RNA测序数据中的细胞间通信网络 首次构建了包含376个单数据集和118个疾病与正常样本比较数据集的细胞间通信网络图谱,提供交互式图形展示和差异分析功能 NA 建立全面的细胞间通信网络数据库,促进生物学研究 人类和小鼠组织在正常和疾病状态下的单细胞RNA测序数据 machine learning NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 376个单数据集和118个比较数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
23 2026-06-19
DiSignAtlas: an atlas of human and mouse disease signatures based on bulk and single-cell transcriptomics
2024-01-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 DiSignAtlas是一个整合人类和小鼠多种疾病转录组特征的综合数据库,提供基于批量与单细胞测序数据的疾病分子标志物资源 首次构建覆盖1836种疾病类型、包含181434个转录组图谱和10306个比较数据集的大型跨物种疾病特征数据库,并整合单细胞RNA测序数据与多维度分析工具 未提及数据库的更新频率及用户自定义分析功能的支持程度 构建全面的人类和小鼠疾病转录组特征资源库,支持生物标志物发现与转化研究 人类和小鼠的1836种非冗余疾病类型的转录组数据 生物信息学 多疾病类型 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 181434个转录组图谱,包括328个单细胞RNA测序数据集,包含疾病组与对照组 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
24 2026-06-19
SCAN: Spatiotemporal Cloud Atlas for Neural cells
2024-01-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 构建了一个名为SCAN的神经网络细胞时空云图谱数据库,整合并分析了神经系统的高质量单细胞RNA测序和空间转录组数据 首次系统整合了超过1000万个细胞的神经系统中单细胞RNA测序和空间转录组数据,覆盖900多个物种并包含100多种神经系统疾病数据,创建了交互式数据库SCAN 未提及 构建神经系统的时空云图谱数据库,以促进神经科学研究和神经系统疾病诊断策略开发 神经系统的单细胞RNA测序和空间转录组数据 机器学习 阿尔茨海默病、帕金森病、唐氏综合征 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 10679684个细胞 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
25 2026-06-18
Multipotent progenitors instruct ontogeny of the superior colliculus
2024-01-17, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 通过MADM-CloneSeq技术分析小鼠上丘的发育谱系,揭示径向胶质前体细胞的多能性及PTEN依赖的细胞类型比例调控机制 首次在单细胞水平建立哺乳动物上丘发育的谱系框架,发现单个径向胶质前体细胞可产生所有兴奋性和抑制性神经元类型,并揭示PTEN信号调控不同神经元类型的适当比例 未明确说明实验样本量大小及是否涵盖所有上丘区域或发育阶段 阐明哺乳动物上丘细胞类型多样性的发育原理 小鼠上丘的径向胶质前体细胞及其产生的兴奋性和抑制性神经元与胶质细胞 数字病理学 NA 单细胞测序, 遗传镶嵌分析, MADM-CloneSeq NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA MADM-CloneSeq(基于遗传镶嵌分析与双标记的单细胞克隆分析)
26 2026-06-18
STOmicsDB: a comprehensive database for spatial transcriptomics data sharing, analysis and visualization
2024-01-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 介绍STOmicsDB,一个综合性的空间转录组学数据库,用于数据共享、分析和可视化 整合218个手工整理的数据集,涵盖17个物种,并支持用户自定义子数据库和快速可视化百万细胞 未明确说明局限性,但可能依赖手动整理数据集的完整性和覆盖范围 为空间转录组学数据提供一站式共享、分析和可视化平台 空间转录组学数据集(218个数据集,涵盖17个物种) 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 图像和基因表达数据 218个数据集,涵盖17个物种 NA 空间转录组学 NA NA
27 2026-06-18
StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination
2024-01-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 StemDriver是一个综合性知识库,致力于功能注释参与造血干细胞命运决定的基因 利用单细胞RNA测序数据构建了完整的造血谱系图谱,并提供了标准化的数据分析流程 当前版本仅整合了42项研究数据,覆盖14种组织类型,可能未涵盖所有相关数据 为参与造血干细胞命运决定的基因提供功能注释和参考数据集 造血干细胞和成熟细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 人类样本23,839个基因,小鼠样本29,533个基因 NA 单细胞RNA测序 NA NA
28 2026-06-18
Enhancing radiotherapy response via intratumoral injection of the TLR9 agonist CpG to stimulate CD8 T cells in an autochthonous mouse model of sarcoma
2024-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过瘤内注射TLR9激动剂CpG增强自发性肉瘤小鼠模型对放疗的应答 首次在自发性肉瘤模型中验证CpG联合放疗对CD8 T细胞的依赖性机制,并结合CRISPR/Cas9和化学致癌物MCA构建高肿瘤突变负担模型 未在人体临床试验中验证,且机制研究主要基于小鼠模型 探究TLR9激动剂CpG增强放疗对软组织肉瘤的免疫应答机制 自发性软组织肉瘤小鼠模型 机器学习 软组织肉瘤 CRISPR/Cas9, 化学诱导, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱流式细胞术 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 质谱流式数据 自发性肉瘤小鼠模型,具体数量未在摘要中给出 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
29 2026-06-18
Single-cell transcriptome atlas of peripheral immune features to Omicron breakthrough infection under booster vaccination strategies
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组测序,揭示了加强免疫策略下Omicron突破感染的外周免疫特征 首次在单细胞水平系统解析Omicron突破感染后的免疫特征,发现加强疫苗诱导的积极抗病毒潜力以及第四剂吸入式Ad5-nCoV可能引发的“训练免疫”现象 NA 研究加强疫苗接种策略下Omicron突破感染的外周免疫特征 15例外周血单核细胞(PBMC)样本,包括Omicron感染者和未感染但加强免疫的对照 单细胞转录组学 Omicron突破感染 单细胞RNA测序,T细胞/B细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据,TCR/BCR测序数据 15例外周血单核细胞样本 NA 单细胞RNA测序,单细胞TCR/BCR测序 NA NA
30 2026-06-17
The activator protein-1 complex governs a vascular degenerative transcriptional programme in smooth muscle cells to trigger aortic dissection and rupture
2024-01-27, European heart journal IF:37.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了激活蛋白-1复合物在平滑肌细胞中调控血管退行性转录程序,从而引发主动脉夹层和破裂的机制 首次在单细胞水平系统描绘主动脉夹层进展中平滑肌细胞表型转化的时间动态特征,并鉴定了肿瘤坏死因子-氧化磷酸化-AP-1轴作为潜在治疗靶点 基于横截面数据而非纵向追踪,且样本量有限,动物模型结果向临床转化仍需验证 阐明主动脉夹层发病过程中平滑肌细胞表型转化的分子机制及潜在干预策略 Stanford A型主动脉夹层患者升主动脉组织及β-氨基丙腈单富马酸盐诱导的主动脉夹层动物模型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 9例主动脉夹层患者和5例心脏移植对照者的升主动脉组织样本,共93,397个单细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
31 2026-06-17
Research progress in isolation and identification of rumen probiotics
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
综述 综述了瘤胃益生菌分离与鉴定的研究进展 介绍了基于液滴的高通量细胞培养和单细胞测序技术以及培养组学技术在瘤胃益生菌开发中的潜力 未详细讨论各技术的具体实验操作步骤和实际应用中的挑战 为瘤胃微生物学研究提供技术参考以推动该领域发展 瘤胃益生菌 数字病理学 NA 培养组学,单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
32 2026-06-17
Ribogenesis boosts controlled by HEATR1-MYC interplay promote transition into brain tumour growth
2024-01, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 揭示脑肿瘤起始细胞在肿瘤生长过渡期由HEATR1-MYC相互作用驱动的核糖体生成增强机制 首次发现HEATR1在肿瘤启动前促进核糖体生成,并通过与MYC结合调控其核仁定位,为脑肿瘤早期发生提供新机制 基于果蝇模型,人类肿瘤样本验证有限,且未深入探讨HEATR1-MYC互作在肿瘤微环境中的具体调控细节 阐明脑肿瘤起始细胞在肿瘤发生早期的分子事件及核糖体生成调控机制 果蝇脑肿瘤起始细胞、胶质瘤患者样本、患者来源的胶质母细胞瘤干细胞 分子生物学 脑肿瘤 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据、果蝇模型数据 果蝇脑肿瘤模型及胶质瘤患者样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium 单细胞3'测序,Illumina NovaSeq 测序平台
33 2026-06-17
Single-cell transcriptional profiling reveals aberrant gene expression patterns and cell states in autoimmune diseases
2024-01, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示多发性硬化症、原发性干燥综合征和系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病中异常的基因表达模式和细胞状态 首次在单细胞水平上比较三种自身免疫性疾病(MS、pSS、SLE)患者与健康对照的PBMC转录组,揭示共享的免疫细胞亚群变化和信号通路差异 NA 探索自身免疫性疾病在单细胞层面的细胞类型和状态,以理解发病机制和治疗靶点 17名初治患者(5名MS、5名pSS、7名SLE)和10名健康对照的外周血单核细胞(PBMC) 转录组学 多发性硬化症、原发性干燥综合征、系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 153550个细胞,来自17名患者和10名健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
34 2026-06-15
Galectin-3 aggravates microglial activation and tau transmission in tauopathy
2024-01-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 揭示了半乳糖凝集素-3在tau蛋白病中加剧小胶质细胞活化和tau蛋白传播的机制 首次发现Gal3在tau蛋白病小鼠和人类的小胶质细胞中上调,并阐明其通过细胞外囊泡和游离形式促进致病性tau蛋白积累和纤维化,以及单细胞RNA-seq揭示Gal3相关小胶质细胞亚群 未明确提及具体局限性,但可能包括对THY-Tau22小鼠模型的依赖性以及人体验证的进一步需求 探究Galectin-3在tau蛋白病中的作用及其机制 人诱导多能干细胞衍生的小胶质细胞、THY-Tau22小鼠模型、tau蛋白病患者样本 机器学习 阿尔茨海默病,tau蛋白病 单细胞RNA测序,蛋白质相互作用分析 NA 单细胞基因表达数据,蛋白质数据 THY-Tau22小鼠模型及人类样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium用于单细胞RNA-Seq分析小鼠海马组织
35 2026-06-15
Age-related loss of Notch3 underlies brain vascular contractility deficiencies, glymphatic dysfunction, and neurodegeneration in mice
2024-01-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 研究揭示年龄相关的Notch3信号缺失导致小鼠脑血管收缩功能缺陷、脑淋巴功能障碍和神经退行性变 首次证明年龄相关的Notch3缺失通过影响血管收缩功能和细胞外基质积累,直接导致脑淋巴流动障碍和神经退行性变,并发现与CADASIL病理特征相似 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,部分机制仍需进一步探索 阐明年龄如何影响脑血管系统及其分子机制,特别是Notch3信号通路的作用 小鼠和人脑血管组织 机器学习 血管性痴呆、神经退行性疾病 单细胞转录组学、MRI NA 单细胞转录组数据、MRI成像数据 小鼠模型和人类脑组织样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
36 2026-06-07
ImmunoPET imaging of Trop2 expression in solid tumors with nanobody tracers
2024-01, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1
研究论文 开发针对Trop2的纳米抗体免疫PET探针,并在胰腺癌和胃癌临床前模型中评估其诊断能力 首次构建两种靶向Trop2的纳米抗体免疫PET探针([68Ga]Ga-NOTA-RTD98和[68Ga]Ga-NOTA-RTD01),在临床前模型中展示出优于[18F]-FDG的诊断性能 仅限临床前模型验证,尚未在人体中进行评估 研究跨膜糖蛋白Trop2在实体瘤中的表达,并开发特异性免疫PET探针用于肿瘤诊断 胰腺癌和胃癌细胞系及患者来源模型 计算机视觉 胰腺癌, 胃癌 免疫PET成像, 单细胞测序, 免疫组化, 流式细胞术 NA 图像, 测序数据, 组织微阵列 胰腺癌组织微阵列及多种胰腺癌细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
37 2026-06-07
Infiltrating lipid-rich macrophage subpopulations identified as a regulator of increasing prostate size in human benign prostatic hyperplasia
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析发现,在良性前列腺增生中,富含脂质的巨噬细胞亚群(TREM2高表达和MARCO高表达)可调节前列腺体积增大 首次定义了两个新的良性前列腺增生免疫亚群(TREM2高表达和MARCO高表达巨噬细胞),并揭示了脂质丰富的巨噬细胞可能加剧大前列腺患者的下尿路症状 需要进一步研究评估靶向这些细胞在良性前列腺增生中的治疗益处 探究巨噬细胞表型转变及其代谢改变在良性前列腺增生导致前列腺体积增大中的作用 来自10个大前列腺(>90克)和10个小前列腺(<40克)的CD45+过渡区白细胞 数字病理学 前列腺疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 20个前列腺组织样本(10个大前列腺和10个小前列腺) NA 单细胞RNA-seq NA NA
38 2026-06-07
Single-cell transcriptome analysis of medaka lymphocytes reveals absence of fully mature T cells in the thymus and the T-lineage commitment in the kidney
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过对青鳉淋巴细胞进行单细胞转录组分析,揭示了胸腺中缺乏完全成熟的T细胞以及肾脏中T谱系定向分化的特征 首次利用scRNA-seq分析青鳉淋巴细胞发育,发现与斑马鱼不同的种属特异性特征,包括胸腺中缺乏成熟SP T细胞及肾脏中存在T谱系定向淋巴细胞前体 仅分析了胸腺和肾脏两个器官,未覆盖其他淋巴组织;研究基于单一突变体模型,可能无法完全反映正常发育过程 理解青鳉淋巴细胞发育的分子和细胞机制,并与斑马鱼进行比较以揭示硬骨鱼类的共性和种属特异性 青鳉淋巴细胞 单细胞转录组学 NA scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 包含突变体和野生型青鳉的胸腺和肾脏淋巴细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
39 2026-06-07
ScRNA-seq unveils the functional characteristics of glioma-associated macrophages and the regulatory effects of chlorogenic acid on the immune microenvironment-a study based on mouse models and clinical practice
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示胶质瘤相关巨噬细胞的功能特性及绿原酸对免疫微环境的调控作用 首次通过单细胞转录组学解析绿原酸对骨髓来源单核巨噬细胞和小胶质细胞分化轨迹及功能的调控机制,并验证其与STAT1的高亲和力 仅基于小鼠模型和单例临床患者数据,缺乏大规模临床验证 揭示胶质瘤相关巨噬细胞亚群与功能特征,探索绿原酸对免疫微环境的调控作用及临床应用潜力 胶质瘤模型小鼠、一例胶质瘤患者 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序, PPI蛋白互作网络, 分子对接 NA 单细胞转录组数据 胶质瘤模型小鼠及1例患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
40 2026-06-07
Identification and validation of BATF as a prognostic biomarker and regulator of immune cell infiltration in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 鉴定并验证BATF在急性髓系白血病中作为预后生物标志物和免疫细胞浸润调节因子的作用 首次系统研究BATF在AML中的表达与预后关联、免疫调节作用及药物敏感性影响,结合生物信息学分析与实验验证 未提及具体局限性,可能包括样本量有限或机制研究深度不足 探索BATF在急性髓系白血病中的表达、预后价值及免疫调节机制 急性髓系白血病患者和细胞系(C1498小鼠模型) 生物信息学 急性髓系白血病 RNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, 流式细胞术, 单细胞测序, EdU试验, 集落形成试验, CCK-8试验 NA 基因表达数据, 临床数据, 单细胞数据 来自TCGA和GEO数据库的AML患者数据,以及C1498小鼠模型 NA 单细胞测序, RNA-seq NA NA
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