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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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361 | 2024-11-17 |
Combining single-cell RNA sequencing and network pharmacology to explore the target of cangfu daotan decoction in the treatment of obese polycystic ovary syndrome from an immune perspective
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1451300
PMID:39539629
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研究论文 | 本文结合单细胞RNA测序和网络药理学,从免疫角度探讨苍附导痰汤治疗肥胖型多囊卵巢综合征的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学,揭示苍附导痰汤在肥胖型多囊卵巢综合征中的免疫调节机制 | 研究样本量较小,且为单中心研究,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨苍附导痰汤在肥胖型多囊卵巢综合征中的作用机制,特别是其免疫调节作用 | 肥胖型多囊卵巢综合征患者及其免疫微环境 | 数字病理学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 129例,包括肥胖型多囊卵巢综合征患者、正常体重多囊卵巢综合征患者和健康女性 |
362 | 2024-11-17 |
Uncovering SPP1+ Macrophage, Neutrophils and Their Related Diagnostic Biomarkers in Intracranial Aneurysm and Subarachnoid Hemorrhage
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S493828
PMID:39539729
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研究论文 | 本研究通过单细胞和转录组数据分析,揭示了颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中SPP1+巨噬细胞和嗜中性粒细胞的作用及其相关诊断生物标志物 | 首次通过单细胞测序和孟德尔随机化分析揭示了SPP1+巨噬细胞在颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中的有害作用,并识别出CD36作为风险因素和有效的血液生物标志物 | NA | 探讨颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血的分子机制和诊断生物标志物 | 颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中的巨噬细胞、嗜中性粒细胞及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞测序、转录组分析、孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞数据、转录组数据 | 从GEO数据库获取的单细胞和转录组数据,以及建立的临床队列 |
363 | 2024-11-17 |
Differences in cell subsets between sun-exposed and unexposed skin: preliminary single-cell sequencing and biological analysis from a single case
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1453940
PMID:39540047
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和生物分析,比较了同一患者阳光暴露和未暴露皮肤中的细胞亚群差异 | 首次揭示了光老化皮肤中单个病例的细胞成分变化,并提供了关于细胞亚群和病理学的新见解 | 研究仅基于单一病例,结果的普遍性和代表性有待进一步验证 | 评估光老化皮肤中细胞亚群变化的生物学过程和机制 | 阳光暴露和未暴露的皮肤细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 单一病例,包括阳光暴露的前臂皮肤和未暴露的臀部皮肤 |
364 | 2024-11-17 |
Identify novel therapeutic targets for type II diabetes and periodontitis: insights from single-cell analysis and Mendelian randomization analysis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1410537
PMID:39544234
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研究论文 | 通过单细胞分析和孟德尔随机化分析,识别II型糖尿病和牙周炎的新治疗靶点 | 整合单细胞分析、孟德尔随机化分析和共定位分析,识别出II型糖尿病和牙周炎的新治疗靶点 | NA | 揭示II型糖尿病和牙周炎之间的关联,并识别新的治疗靶点 | II型糖尿病和牙周炎 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞分析、孟德尔随机化分析、共定位分析 | NA | 基因数据 | NA |
365 | 2024-11-17 |
Possible involvement of Toll-like receptor 8-positive monocytes/macrophages in the pathogenesis of Sjögren's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1480675
PMID:39544932
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研究论文 | 研究探讨了Toll样受体8阳性单核细胞/巨噬细胞在干燥综合征发病机制中的可能作用 | 首次通过单细胞RNA测序和多色免疫荧光染色技术,揭示了Toll样受体8阳性单核细胞/巨噬细胞在干燥综合征中的表达和功能 | 研究样本量较小,且仅限于干燥综合征患者,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨Toll样受体在干燥综合征发病机制中的作用 | 干燥综合征患者的唾液腺组织 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、实时PCR、多色免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 32例实时PCR样本,19例多色免疫荧光染色样本 |
366 | 2024-11-15 |
A distinct immune landscape in anti-synthetase syndrome profiled by a single-cell genomic study
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1436114
PMID:39512337
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组学方法分析了抗合成酶综合征患者外周血单个核细胞的转录组特征及其免疫谱系 | 首次在单细胞水平上揭示了抗合成酶综合征患者免疫系统的独特特征,并发现了与健康对照和MDA5+ DM患者相比的显著差异 | 样本量较小,仅包括3名抗合成酶综合征患者和3名MDA5+ DM患者 | 研究抗合成酶综合征患者外周血单个核细胞的转录组特征及其免疫谱系 | 抗合成酶综合征患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3名抗合成酶综合征患者、3名MDA5+ DM患者和4名健康对照 |
367 | 2024-11-15 |
Deciphering the role of CCL4-CCR5 in coronary artery disease pathogenesis: insights from Mendelian randomization, bulk RNA sequencing, single-cell RNA, and clinical validation
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.99518
PMID:39512689
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序和临床验证,探讨了CCL4-CCR5在冠状动脉疾病发病机制中的作用 | 首次通过多种技术手段综合分析CCL4及其受体CCR5在冠状动脉疾病中的因果关系和潜在机制 | 研究主要基于现有数据集和临床样本,未来需更多实验验证 | 分析CCL4及其受体CCR5在冠状动脉疾病中的作用机制 | CCL4、CCR5及其在冠状动脉疾病中的表达和功能 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 91种循环炎症蛋白、人类动脉粥样硬化斑块样本、CAD患者血清样本 |
368 | 2024-11-15 |
CDKN1A as a target of senescence in heart failure: insights from a multiomics study
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1446300
PMID:39512814
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研究论文 | 本研究通过多组学数据整合,探讨了心肌细胞衰老与心力衰竭之间的关系,并确定了CDKN1A作为潜在的治疗靶点 | 首次通过多组学数据揭示了CDKN1A在心肌细胞衰老和心力衰竭中的因果关系 | 研究主要基于现有数据库和数据集,缺乏体内实验验证 | 通过多组学数据确定心肌细胞衰老相关基因与心力衰竭的遗传关联 | 心肌细胞衰老相关基因及其在心力衰竭中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)、孟德尔随机化 (MR)、贝叶斯共定位分析 | NA | 基因表达数据、DNA甲基化数据、蛋白质表达数据 | 39个衰老相关基因 (SRGs) 在心肌细胞中的表达数据 |
369 | 2024-11-15 |
Integrative analysis of single-cell and bulk multi-omics data to reveal subtype-specific characteristics and therapeutic strategies in clear cell renal cell carcinoma patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101451
PMID:39513109
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量多组学数据,揭示了透明细胞肾细胞癌患者的亚型特异性特征和治疗策略 | 本研究创新性地结合了单细胞RNA测序和批量数据,识别出两种异质性亚型,并分析了其分子特征、免疫治疗反应和药物敏感性差异 | 本研究主要基于已有的数据集进行分析,未来需要更多的临床验证和实验数据来进一步验证和优化结果 | 揭示透明细胞肾细胞癌患者的亚型特异性特征和治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤亚型及其分子特征、免疫治疗反应和药物敏感性 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达、DNA甲基化和基因突变数据 | NA |
370 | 2024-11-15 |
Immunofluorescence-Verified Sphingolipid Signatures Indicate Improved Prognosis in Liver Cancer Patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101330
PMID:39513103
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研究论文 | 本文通过多组学整合和免疫荧光验证,开发了一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型,并探讨了其在免疫治疗反应中的应用 | 首次通过多组学整合和免疫荧光验证,开发了一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型,并揭示了其在免疫治疗反应中的潜在应用 | 需要进一步的实验验证和临床试验来验证模型的临床应用 | 开发一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型,并探讨其在免疫治疗反应中的应用 | 肝细胞癌患者及其预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq, AUCell算法, Cox比例风险模型, Lasso回归, 免疫荧光 | Cox比例风险模型, Lasso回归 | 基因表达数据 | 独立验证队列来自国际癌症基因组联盟(ICGC) |
371 | 2024-11-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals hub genes of myocardial infarction-associated endothelial cells
2024-01-24, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-024-03727-z
PMID:38267885
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了心肌梗死相关内皮细胞的枢纽基因 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析心肌梗死和假手术小鼠的内皮细胞,识别出关键的枢纽基因,并验证了这些基因对内皮细胞迁移和管形成的影响 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类中验证结果 | 揭示心肌梗死相关内皮细胞的具体机制,并识别关键的枢纽基因 | 心肌梗死和假手术小鼠的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 心肌梗死和假手术小鼠的单细胞RNA测序数据,以及人类脐静脉内皮细胞的培养数据 |
372 | 2024-11-13 |
Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.10.574997
PMID:38260455
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研究论文 | 研究探讨了机械微环境如何通过机械敏感的基因增强子影响细胞转录和表型 | 发现了新型机械敏感的基因增强子,这些增强子能够响应机械微环境的变化,调控细胞关键功能 | NA | 揭示机械微环境如何精确影响表观遗传状态以调控转录 | 机械敏感的基因增强子及其对细胞功能的影响 | 表观遗传学 | NA | 基因组范围的表观基因组分析、表观基因组编辑、单细胞RNA测序CRISPR筛选 | NA | 基因组数据、表观遗传数据、单细胞RNA测序数据 | NA |
373 | 2024-11-13 |
Single-cell transcriptome analysis identifies a novel tumor-associated macrophage subtype predicting better prognosis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1466767
PMID:39507421
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,鉴定出一种新的胰腺导管腺癌相关巨噬细胞亚型,该亚型预示着更好的预后 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据,鉴定出一种新的良性M2样巨噬细胞亚型(bM2-like TAMs),并揭示其在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤作用 | 本研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 深入了解胰腺导管腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞亚型及其对预后的影响,为免疫治疗提供新策略 | 胰腺导管腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大量单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 |
374 | 2024-11-13 |
Comprehensive single-cell and bulk transcriptomic analyses to develop an NK cell-derived gene signature for prognostic assessment and precision medicine in breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460607
PMID:39507529
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组分析,开发了一种基于NK细胞的基因特征,用于乳腺癌的预后评估和精准医疗 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组分析,开发了一种新的NK细胞相关基因特征,用于乳腺癌的预后评估和治疗反应预测 | NA | 开发一种新的NK细胞相关基因特征,用于乳腺癌的预后评估和精准医疗 | 乳腺癌中的NK细胞相关基因及其在预后评估和治疗反应预测中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、加权相关网络分析(WGCNA)、LASSO回归、空间转录组学(ST)、免疫组化(IHC) | NA | 基因表达数据 | 数据主要来源于TCGA和GEO数据库,具体样本数量未明确提及 |
375 | 2024-11-12 |
STING agonist inflames the cervical cancer immune microenvironment and overcomes anti-PD-1 therapy resistance
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1342647
PMID:38550593
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研究论文 | 研究探讨了STING激动剂在宫颈癌免疫微环境中的作用及其与抗PD-1疗法联合使用的潜力 | 首次探讨了STING激动剂MSA-2在宫颈癌治疗中的应用,并展示了其与抗PD-1疗法联合使用的显著效果 | 研究主要基于小鼠模型和公开数据集,需进一步验证在人体中的效果 | 探索STING激动剂在宫颈癌治疗中的作用及其与免疫检查点抑制剂联合使用的潜力 | 宫颈癌及其免疫微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据集的基因表达和临床病理数据,以及小鼠肿瘤模型U14和TC-1 |
376 | 2024-11-09 |
Humanized CXCL12 antibody delays onset and modulates immune response in alopecia areata mice: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1444777
PMID:39483478
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序探讨人源化CXCL12抗体在斑秃小鼠模型中的作用机制 | 首次使用人源化CXCL12抗体治疗斑秃,并通过单细胞RNA测序揭示其分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,需进一步在人体中验证 | 探讨人源化CXCL12抗体在斑秃治疗中的作用及其分子机制 | 斑秃小鼠模型及其免疫细胞 | NA | 斑秃 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的皮肤样本 |
377 | 2024-11-09 |
mRNA-seq-based analysis predicts: AEG-1 is a therapeutic target and immunotherapy biomarker for pan-cancer, including OSCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1484226
PMID:39483471
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研究论文 | 本文通过mRNA-seq分析预测AEG-1是泛癌治疗靶点和免疫治疗生物标志物,包括OSCC | 首次全面分析了AEG-1表达与OSCC及其他肿瘤类型中免疫浸润的关系,并发现AEG-1与免疫浸润标志物之间的强相关性 | NA | 探讨AEG-1在泛癌中的表达及其与免疫浸润和患者预后的关系 | AEG-1在不同肿瘤类型中的表达水平、预后和临床病理特征 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | mRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个数据库中的多种肿瘤样本,包括OSCC |
378 | 2024-11-09 |
Potential molecular mechanisms of ETV6-RUNX1-positive B progenitor cell cluster in acute lymphoblastic leukemia revealed by single-cell RNA sequencing
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18445
PMID:39498293
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇在急性淋巴细胞白血病中的潜在分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇在急性淋巴细胞白血病中的细胞周期调控机制及其与NK细胞和T细胞的相互作用 | NA | 探索免疫景观和免疫细胞在急性淋巴细胞白血病进展中的作用 | ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇及其在急性淋巴细胞白血病中的作用 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GSE132509的ETV6-RUNX1和健康儿科样本的骨髓单个核细胞 |
379 | 2024-11-08 |
Inflammatory Mediators Suppress FGFR2 Expression in Human Keratinocytes to Promote Inflammation
2024, Molecular and cellular biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1080/10985549.2024.2399766
PMID:39340759
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研究论文 | 研究探讨了炎症介质如何抑制人角质形成细胞中FGFR2的表达以促进炎症 | 首次揭示了FGFR2在人角质形成细胞中抑制炎症的关键作用,并提出了FGFR2下调在特应性皮炎及其他炎症性疾病发病机制中的潜在作用 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内实验验证 | 探讨FGFR2在人角质形成细胞中的功能及其在炎症性疾病中的作用 | 人角质形成细胞及特应性皮炎患者皮肤样本 | NA | 特应性皮炎 | CRISPR/Cas9基因编辑技术,RNA测序 | NA | RNA | 体外培养的人角质形成细胞及特应性皮炎患者皮肤样本 |
380 | 2024-11-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals STAT1 Drives LHPP Downregulation in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241293485
PMID:39497541
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据探讨了食管鳞状细胞癌(ESCC)中STAT1对LHPP下调的驱动作用 | 发现了STAT1在ESCC发病机制中对LHPP表达的调控作用,揭示了STAT1与LHPP之间的复杂调控回路 | NA | 探索食管鳞状细胞癌(ESCC)的分子机制和细胞动力学,特别是转录因子STAT1及其与LHPP的调控关系 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者及其细胞系 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 21名ESCC患者 |