单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1284 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-09-19 |
Expansion of a Novel Subset of L-Selectin+ Classical Monocytes in Kawasaki Disease
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S468472
PMID:39281780
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研究论文 | 研究川崎病中L-选择素阳性经典单核细胞的新亚群的扩展 | 发现了一种新的L-选择素阳性经典单核细胞亚群，并探讨了其在川崎病中的诊断价值 | 样本量相对较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探讨川崎病与L-选择素阳性经典单核细胞之间的关系 | 川崎病患者、发热患者和健康儿童的外周血样本 | 免疫学 | 川崎病 | 流式细胞术 | NA | 血液样本 | 81名川崎病患者、18名发热患者和36名健康儿童 |
| 362 | 2024-09-15 |
Dihydroartemisinin Regulated the MMP-Mediated Cellular Microenvironment to Alleviate Rheumatoid Arthritis
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0459
PMID:39257420
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研究论文 | 研究了双氢青蒿素通过调节MMP介导的细胞微环境来缓解类风湿性关节炎的作用机制 | 揭示了双氢青蒿素通过抑制MMP2和MMP3来改善类风湿性关节炎的免疫微环境的机制 | 研究主要集中在体外和体内实验，缺乏临床试验数据 | 揭示双氢青蒿素对抗类风湿性关节炎的药理机制 | 类风湿性关节炎的免疫微环境和双氢青蒿素的作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（RNA-seq）、蛋白质组学、转录组学 | NA | RNA、蛋白质 | 涉及RA大鼠和MH7A细胞 |
| 363 | 2024-09-15 |
Single-cell and spatial transcriptome assays reveal heterogeneity in gliomas through stress responses and pathway alterations
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1452172
PMID:39257581
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了胶质瘤在应激反应和通路改变中的异质性 | 首次从空间角度探讨了氧化应激反应在胶质瘤异质性中的机制 | 研究主要集中在高级别和低级别胶质瘤，未涵盖所有胶质瘤类型 | 探讨胶质瘤异质性的分子机制，特别是氧化应激反应的影响 | 高级别和低级别胶质瘤中的氧化应激反应基因 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | 涉及高级别和低级别胶质瘤的样本 |
| 364 | 2024-09-15 |
Exploring the molecular mechanisms of macrophages in islet transplantation using single-cell analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1407118
PMID:39267737
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析探索了巨噬细胞在胰岛移植中的分子机制 | 揭示了巨噬细胞在同种异体移植中的复杂相互作用和调控机制，并发现了潜在的治疗靶点 | NA | 研究巨噬细胞在胰岛移植中的作用及其对移植存活的影响 | 巨噬细胞在胰岛移植中的分子机制 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自GSE198865的同种异体和异种胰岛移植移植物的ScRNA-seq数据 |
| 365 | 2024-09-15 |
Application and research progress of single cell sequencing technology in leukemia
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1389468
PMID:39267837
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在白血病研究中的应用和进展 | 单细胞测序技术能够在单细胞水平上研究白血病的基因表达谱、突变和表观遗传特征，为白血病研究提供了新的视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在白血病研究中的应用，增强对白血病发病机制的理解，发现治疗靶点和个性化治疗 | 白血病细胞的基因表达谱、突变和表观遗传特征 | 数字病理 | 白血病 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 366 | 2024-09-15 |
Multi-omics analysis reveals the landscape of tumor microenvironments in left-sided and right-sided colon cancer
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1403171
PMID:39267963
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了左侧和右侧结肠癌肿瘤微环境的差异 | 首次通过多组学分析揭示了左侧和右侧结肠癌肿瘤微环境中免疫细胞浸润的显著差异，并发现右侧结肠癌中肿瘤细胞具有更高的突变频率和更强的免疫原性 | 研究样本量较小，可能影响结果的普适性 | 探讨左侧和右侧结肠癌肿瘤微环境的差异及其对免疫治疗效果的影响 | 左侧和右侧结肠癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结肠癌 | 多组学分析，包括bulk RNA测序、单细胞RNA测序和全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 左侧结肠癌115例，右侧结肠癌162例 |
| 367 | 2024-09-15 |
Single-cell transcriptomics reveals tumor microenvironment remodeling in hepatocellular carcinoma with varying tumor subclonal complexity
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1467682
PMID:39268081
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研究论文 | 研究探讨了肝细胞癌中肿瘤亚克隆复杂性与肿瘤微环境重塑之间的关系 | 提出了一个基于离散拷贝数变异（CNVs）的稳健指标，用于准确量化每个样本的亚克隆复杂度 | NA | 揭示肝细胞癌中肿瘤亚克隆复杂性与肿瘤微环境之间的关系 | 肝细胞癌中的肿瘤亚克隆复杂性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 30个样本 |
| 368 | 2024-09-15 |
Dynamic changes in cellular atlases and communication patterns within yak ovaries across diverse reproductive states unveiled by single-cell analysis
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1444706
PMID:39268087
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞图谱和细胞间通信模式的动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术描绘了牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞图谱，并构建了细胞间通信网络 | NA | 研究牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞和分子特征，以深入了解其卵巢功能 | 牦牛卵巢在不同生殖状态下的细胞图谱和细胞间通信模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 369 | 2024-09-15 |
Inhibition of ALOX12-12-HETE Alleviates Lung Ischemia-Reperfusion Injury by Reducing Endothelial Ferroptosis-Mediated Neutrophil Extracellular Trap Formation
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0473
PMID:39268501
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研究论文 | 研究通过抑制ALOX12-12-HETE减轻肺缺血-再灌注损伤，减少内皮细胞铁死亡介导的中性粒细胞胞外陷阱形成 | 首次揭示了ALOX12及其代谢物12-HETE在促进肺缺血-再灌注损伤中的关键作用，并证明了ML355作为ALOX12的靶向抑制剂在减轻肺损伤中的有效性 | 研究主要基于小鼠和细胞模型，尚未在临床试验中验证其疗效 | 探讨ALOX12在肺缺血-再灌注损伤中的作用机制，并寻找潜在的治疗策略 | 小鼠肺组织、人肺移植受者血浆、人内皮细胞和肺功能 | NA | 肺部疾病 | 代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 组织、血浆、细胞 | 小鼠模型、人肺移植受者血浆、人内皮细胞 |
| 370 | 2024-09-15 |
Applications of spatial transcriptomics and artificial intelligence to develop integrated management of pancreatic cancer
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.007
PMID:39271261
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综述 | 本文综述了空间转录组学和人工智能在胰腺癌综合管理中的应用 | 结合空间转录组学和人工智能分析，有助于理解肿瘤微环境中的细胞间通讯，并识别新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探讨空间转录组学和人工智能在胰腺癌管理中的应用 | 胰腺癌及其微环境中的细胞间通讯 | 机器学习 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 371 | 2024-09-15 |
Crosstalk between tumor and microenvironment: Insights from spatial transcriptomics
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.009
PMID:39271263
|
综述 | 本文综述了肿瘤与微环境之间的相互作用，并探讨了空间转录组学技术在揭示这些相互作用中的应用 | 本文利用空间转录组学技术，提供了对肿瘤异质性和微环境相互作用的高分辨率分子图谱 | NA | 探讨肿瘤异质性、肿瘤进化和克隆状态的驱动因素 | 肿瘤与微环境之间的相互作用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 372 | 2024-09-15 |
Current computational methods for spatial transcriptomics in cancer biology
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.006
PMID:39271268
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综述 | 本文综述了当前用于癌症生物学中空间转录组学的计算方法 | 介绍了空间转录组技术如何通过保留细胞在组织中的位置信息来帮助理解微环境中细胞行为的失常 | NA | 探讨如何利用数学或统计方法来理解多细胞生物中细胞行为的自组织系统 | 癌症生物学中的空间转录组学 | 生物信息学 | 癌症 | 空间转录组技术 | NA | 转录组 | NA |
| 373 | 2024-09-15 |
Data enhancement in the age of spatial biology
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.008
PMID:39271267
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综述 | 本文探讨了空间转录组学与其他数据类型（如单细胞转录组学和组织染色图像）的整合方法，以克服当前技术的局限性 | 本文介绍了通过整合空间转录组学与其他数据类型来克服现有技术局限性的计算方法 | 当前空间转录组学技术在分辨率和同时分析的基因数量上存在局限性 | 旨在通过整合不同数据类型，提高对癌症生物学的理解 | 空间转录组学数据与其他数据类型的整合 | 生物信息学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 374 | 2024-09-13 |
Polycystic ovarian syndrome (PCOS) and recurrent spontaneous abortion (RSA) are associated with the PI3K-AKT pathway activation
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17950
PMID:39253602
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研究论文 | 研究探讨了多囊卵巢综合征（PCOS）和复发性自然流产（RSA）的共同病理机制，并揭示了PI3K-AKT信号通路在其中的作用 | 首次揭示了PCOS和RSA之间共同的病理机制，并探讨了PI3K-AKT信号通路在两种疾病中的作用 | NA | 阐明导致多囊卵巢综合征（PCOS）和复发性自然流产（RSA）的机制 | 多囊卵巢综合征（PCOS）和复发性自然流产（RSA）的病理机制 | NA | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（RNA-seq）、实时定量PCR（RT-qPCR）、细胞计数试剂盒-8（CCK-8）、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据库的PCOS和RSA患者的单细胞RNA-seq数据集 |
| 375 | 2024-09-13 |
Chemokine receptors in primary and secondary lymphoid tissues
2024, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2023.11.003
PMID:39260934
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综述 | 本文综述了趋化因子受体在初级和次级淋巴组织中的存在和功能 | 介绍了新技术如高维光谱流式细胞术和单细胞测序在趋化因子受体网络及其配体研究中的应用 | NA | 探讨趋化因子受体在免疫细胞中的作用及其在初级和次级淋巴器官中的分布 | 趋化因子受体及其在骨髓、胸腺、脾脏、淋巴结和派尔集合淋巴结等淋巴组织中的功能 | NA | NA | 高维光谱流式细胞术、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-09-11 |
Increased Expression of Mevalonate Pathway-Related Enzymes in Angiotensin II-Induced Abdominal Aortic Aneurysms
2024, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-623
PMID:39085115
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研究论文 | 研究探讨了血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中甲羟戊酸途径相关酶的表达变化 | 首次揭示了甲羟戊酸途径在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中的重要作用 | 仅限于动物模型研究，未涉及临床数据 | 探讨甲羟戊酸途径在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中的作用 | 腹主动脉瘤的形成和动脉重塑 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | Western blot和单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质和RNA | 包括Ang II 28D、Ang II 5D和Sham组 |
| 377 | 2024-09-11 |
Transcriptomic analysis of the spatiotemporal axis of oogenesis and fertilization in C. elegans
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1436975
PMID:39224437
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统进行了转录组分析，揭示了卵母细胞形成过程中的基因表达和剪接事件 | 本文首次对秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统进行了详细的转录组分析，揭示了卵母细胞形成过程中的基因表达和剪接事件，并提供了新的机制见解 | 本文仅限于对秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统进行分析，未涉及其他物种或性别 | 研究秀丽隐杆线虫卵母细胞形成过程中的基因表达和剪接事件 | 秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7个不同阶段的生殖系统组织和受精卵 |
| 378 | 2024-09-11 |
Integrating single-cell transcriptomics to reveal the ferroptosis regulators in the tumor microenvironment that contribute to bladder urothelial carcinoma progression and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427124
PMID:39238647
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据，通过非负矩阵分解（NMF）聚类分析，揭示了膀胱尿路上皮癌肿瘤微环境中铁死亡调控因子及其对癌症进展和免疫治疗的影响 | 首次通过单细胞转录组数据识别出膀胱癌肿瘤微环境中与铁死亡相关的新型细胞亚型，并发现ACSL4+CAFs和SDC1作为重要的膀胱癌生物标志物 | 本研究主要基于单细胞转录组数据进行分析，缺乏体内实验验证 | 探讨铁死亡在膀胱癌肿瘤微环境中的调控机制及其对癌症进展和免疫治疗的影响 | 膀胱尿路上皮癌肿瘤微环境中的细胞亚型及其与铁死亡的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF） | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 379 | 2024-09-11 |
The landscape of miRNA-mRNA regulatory network and cellular sources in inflammatory bowel diseases: insights from text mining and single cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1454532
PMID:39238649
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研究论文 | 本研究通过文本挖掘和单细胞RNA测序分析，构建了炎症性肠病中的miRNA-mRNA调控网络，并确定了关键miRNA的细胞来源及其在疾病发病机制中的作用 | 本研究通过整合多个数据库的预测和实验验证结果，构建了全面的miRNA-mRNA调控网络，并结合大规模单细胞RNA测序数据，确定了miRNA的细胞来源及其与临床状态和功能变化的关联 | 研究主要依赖于已发表的文献和现有数据库，可能存在样本多样性、平台变异性和批次效应等限制 | 构建全面的miRNA-mRNA调控网络，确定关键miRNA在炎症性肠病发病机制中的细胞来源和功能 | 炎症性肠病（包括溃疡性结肠炎和克罗恩病）中的miRNA-mRNA调控网络及其细胞来源 | 基因组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本数据和基因表达数据 | 两个大规模单细胞RNA测序数据集 |
| 380 | 2024-09-11 |
Obtention of viable cell suspensions from breast cancer tumor biopsies for 3D chromatin conformation and single-cell transcriptome analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1420308
PMID:39239354
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研究论文 | 本文介绍了一种从乳腺癌肿瘤活检中获取高存活率细胞悬液的优化方案，并利用这些细胞悬液进行了3D染色质构象和单细胞转录组分析 | 提出了一种成本效益高的优化方案，能够从乳腺癌肿瘤活检中简单高效地获取高存活率细胞悬液 | 样本处理仍然是主要挑战，包括样本采集前的治疗、组织获取量、运输以及无法处理新鲜样本等问题 | 开发一种优化方案，从乳腺癌肿瘤活检中获取高存活率细胞悬液，以进行个性化肿瘤分子特征分析 | 乳腺癌肿瘤活检样本 | NA | 乳腺癌 | Hi-C, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞悬液 | NA |