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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-12-20 |
Identification of Macrophage-Related Biomarkers for Abdominal Aortic Aneurysm Through Combined Single-Cell Sequencing and Machine Learning
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S499593
PMID:39697792
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞测序和机器学习技术,揭示了巨噬细胞在腹主动脉瘤(AAA)进展中的作用机制,并识别了相关的生物标志物 | 首次通过单细胞测序和机器学习结合的方法,揭示了THBS1-CD47信号通路在巨噬细胞驱动AAA进展中的关键作用,并验证了THBS1作为潜在治疗靶点的可能性 | 研究主要基于单细胞测序和机器学习分析,未来需要更多临床样本验证和进一步的功能实验 | 揭示巨噬细胞在腹主动脉瘤进展中的作用机制,并识别相关的生物标志物,以开发新的靶向治疗和改善患者预后 | 腹主动脉瘤患者样本中的巨噬细胞及相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,机器学习 | NA | 基因表达数据 | 腹主动脉瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-12-20 |
Deciphering the evolving niche interactome of human hematopoietic stem cells from ontogeny to aging
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1479605
PMID:39698109
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,系统地描述了从胚胎发育到衰老过程中人类造血干细胞(HSC)微环境的相互作用网络 | 首次系统地揭示了HSC微环境在不同发育阶段和衰老过程中的动态变化,特别是细胞间相互作用和信号通路的变化 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能无法完全捕捉到所有细胞间的相互作用和微环境的复杂性 | 揭示从胚胎发育到衰老过程中HSC微环境的动态变化,为维持HSC功能和促进健康衰老提供新的干预策略 | 人类造血干细胞(HSC)及其微环境中的细胞间相互作用网络 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及不同发育阶段和衰老时期的HSC微环境样本 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-12-20 |
Narrative Review of Mesenchymal Stem Cell Therapy in Renal Diseases: Mechanisms, Clinical Applications, and Future Directions
2024, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/sci/8658246
PMID:39698513
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综述 | 本文综述了间充质干细胞在肾脏疾病中的应用,讨论了其机制、临床应用及未来发展方向 | 本文探讨了间充质干细胞在肾脏疾病治疗中的潜力,并展望了结合单细胞测序、CRISPR/Cas9基因编辑等前沿技术的未来研究方向,以实现更安全、更有效的个性化治疗 | 本文主要基于过去五年内的研究,可能未能涵盖所有相关研究,且未来研究方向仍需进一步验证 | 探讨间充质干细胞在肾脏疾病治疗中的应用及其未来发展方向 | 间充质干细胞在急性肾损伤和慢性肾病中的应用 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞测序、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-12-20 |
Revealing induced pluripotent stem cells' potential as a better alternative to embryonic stem cells for Parkinson's disease treatment based on single-cell RNA-seq
2024, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2024e13482
PMID:39699375
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据比较了诱导多能干细胞(iPSCs)和胚胎干细胞(ESCs)在帕金森病(PD)治疗中的细胞类型差异,探讨了iPSCs作为ESCs替代品的潜力 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了iPSCs在细胞类型多样性和基因表达上与ESCs的差异,并提出了iPSCs在PD治疗中的潜在优势 | 研究主要基于GEO数据库的数据,未进行体内实验验证iPSCs在PD治疗中的实际效果 | 探讨iPSCs作为ESCs替代品在帕金森病治疗中的可行性 | 诱导多能干细胞(iPSCs)和胚胎干细胞(ESCs)在帕金森病(PD)治疗中的细胞类型差异 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库收集的ESCs和iPSCs的单细胞RNA测序数据和微阵列数据 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-12-19 |
Single-cell transcriptome analysis reveals status changes of immune cells in chronic kidney disease
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1434535
PMID:39691368
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析揭示了慢性肾病中免疫细胞的状态变化 | 构建了慢性肾病肾脏的免疫细胞图谱,并发现了SPP1巨噬细胞作为一种独特的细胞类型 | NA | 深入了解慢性肾病中免疫细胞的组成和功能变化,发现新的治疗靶点 | 慢性肾病患者的肾脏免疫细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 42个正常样本和23个慢性肾病样本 | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-12-19 |
A new perspective on macrophage-targeted drug research: the potential of KDELR2 in bladder cancer immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1485109
PMID:39691708
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和临床数据,构建了膀胱癌的RNA转录组图谱,并验证了KDELR2在膀胱癌免疫治疗中的潜在作用 | 本研究首次强调了KDELR2在促进细胞增殖、侵袭和迁移中的作用,并提出了其在膀胱癌免疫治疗中的新治疗见解 | NA | 探讨KDELR2在膀胱癌免疫治疗中的潜在作用 | 膀胱癌细胞及其与骨髓细胞的相互作用 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-12-19 |
Identification of SPP1 + macrophages as an immune suppressor in hepatocellular carcinoma using single-cell and bulk transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1446453
PMID:39691723
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组学分析,揭示了SPP1+巨噬细胞在肝细胞癌中的免疫抑制作用 | 首次通过整合批量和单细胞RNA测序数据,确定了SPP1+巨噬细胞在肝细胞癌中的免疫抑制作用,并提出了SPP1作为肝细胞癌免疫治疗潜在靶点的可能性 | 研究主要基于数据分析,缺乏体内实验验证 | 探讨肝细胞癌中巨噬细胞和T细胞的功能多样性,并确定潜在的免疫治疗靶点 | 肝细胞癌中的巨噬细胞和T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个大规模肝细胞癌队列的RNA测序数据,以及肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-12-19 |
CD8+ T-Cell Signatures as Prognostic and Immunotherapy Response Predictors in Non-Small Cell Lung Cancer
2024, Folia biologica
IF:1.1Q4
DOI:10.14712/fb2024070040196
PMID:39692574
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞和批量RNA测序技术,基于CD8+ T细胞标记基因识别并验证一种新的生物标志物特征,用于预测非小细胞肺癌患者的治疗反应 | 本研究首次结合单细胞和批量RNA测序技术,生成了基于CD8+ T细胞的生物标志物特征,强调了其在非小细胞肺癌预后和治疗中的关键作用 | 本研究的样本量虽然较大,但仍需在更多临床试验中验证该生物标志物特征的普适性和准确性 | 识别并验证一种新的生物标志物特征,用于预测非小细胞肺癌患者的治疗反应 | 非小细胞肺癌患者的CD8+ T细胞标记基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 1200个样本,包括4个非小细胞肺癌样本通过单细胞RNA测序分析,1000个来自TCGA的非小细胞肺癌样本,以及196个来自GSE37745队列的非小细胞肺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-12-18 |
Decoding the molecular pathways governing trophoblast migration and placental development; a literature review
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1486608
PMID:39665023
|
综述 | 本文深入分析了调控滋养层迁移和胎盘发育的关键信号通路,并探讨了新兴技术在胎盘生物学研究中的应用 | 本文介绍了新兴技术如滋养层类器官、单细胞RNA测序和胎盘芯片模型,这些工具有望推动对胎盘生物学的理解并开发新的干预措施 | 本文为综述性文章,未提供新的实验数据或研究结果 | 探讨调控滋养层迁移和胎盘发育的分子机制,并评估新兴技术在改善妊娠结局中的潜力 | 滋养层迁移、胎盘发育及相关妊娠并发症 | NA | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-12-18 |
Fibroblast growth factor receptor risk signature predicts patient prognosis and immunotherapy resistance in colorectal cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1493673
PMID:39676867
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研究论文 | 本文研究了成纤维细胞生长因子受体(FGFR)风险特征在结直肠癌(CRC)患者预后和免疫治疗抵抗中的作用 | 首次揭示了FGFR风险特征在CRC患者中的预后预测能力和对免疫治疗的抵抗作用,并发现PHA-793887可能作为潜在的FGFR风险特征抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人体临床试验中验证 | 探讨FGFR风险特征在结直肠癌患者预后和免疫治疗抵抗中的作用 | 结直肠癌患者的FGFR风险特征及其对预后和免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、机器学习技术、基因集富集分析(GSEA)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 包括CRC患者的单细胞和bulk RNA测序数据,以及MC38小鼠肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-12-18 |
Direct and indirect RANK and CD40 signaling regulate the maintenance of thymic epithelial cell frequency and properties in the adult thymus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1500908
PMID:39676866
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研究论文 | 研究探讨了RANK和CD40信号在成年胸腺中对胸腺上皮细胞(TECs)维持的作用 | 首次揭示了RANK和CD40信号在成年胸腺中对胸腺上皮细胞的直接和间接作用,并阐明了其对TEC祖细胞和皮质TEC基因表达的间接影响 | 研究主要集中在体外实验和单细胞RNA测序分析,缺乏体内实验验证 | 探讨RANK和CD40信号在成年胸腺中对胸腺上皮细胞维持的分子机制 | 胸腺髓质上皮细胞(mTECs)及其祖细胞 | NA | NA | 流式细胞术,单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-12-18 |
Single-cell RNA-seq reveals FGF12 as a prognostic biomarker in low-grade endometrial stromal sarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1513076
PMID:39676856
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了FGF12作为低级别子宫内膜间质肉瘤的预后生物标志物 | 首次通过单细胞转录组分析识别出与低级别子宫内膜间质肉瘤预后相关的肿瘤细胞亚群,并发现FGF12基因的高表达与患者生存期缩短显著相关 | 研究样本量较小,可能影响结果的普适性 | 识别低级别子宫内膜间质肉瘤的预后生物标志物,以改善患者分层和指导治疗策略 | 低级别子宫内膜间质肉瘤的肿瘤微环境及预后相关基因 | 数字病理学 | 子宫内膜间质肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-12-18 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Based on EcoTyper Machine Learning Framework Identifies Cell-State-Specific M2 Macrophage Markers Associated with Gastric Cancer Prognosis
2024, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S490075
PMID:39678138
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,利用EcoTyper机器学习框架,识别与胃癌预后相关的细胞状态特异性M2巨噬细胞标记物 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,利用EcoTyper框架识别与胃癌预后相关的M2巨噬细胞标记物,揭示了肿瘤生态系统的异质性 | NA | 识别与胃癌预后相关的细胞状态特异性M2巨噬细胞标记物,揭示肿瘤微环境中的细胞状态变化 | 胃癌患者的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其细胞状态 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和bulk RNA测序 | 机器学习框架(EcoTyper) | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-12-18 |
Building a FAIR data ecosystem for incorporating single-cell transcriptomics data into agricultural genome to phenome research
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1460351
PMID:39678381
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研究论文 | 本文探讨了如何构建一个FAIR数据生态系统,将单细胞转录组学数据整合到农业基因组到表型研究中 | 本文利用人类基因组学基础设施的最新进展,开发了连接不同资源的数据工具,并扩展了功能以实现数据在不同平台间的传输和分析 | 本文仅描述了一个试点项目,未来需要进一步构建更完善的数据资源和分析生态系统 | 构建一个基于FAIR原则的科学家友好的数据资源和分析生态系统,以促进单细胞水平的基因组分析 | 单细胞转录组学数据在农业基因组到表型研究中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 包括植物、原生生物和动物(包括人类)的高通量测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-12-18 |
Spatial transcriptomics and in situ immune cell profiling of the host ectocervical landscape of HIV infected Kenyan sex working women
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483346
PMID:39687623
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和多表位配体绘图技术,研究了HIV感染的肯尼亚性工作者宫颈外组织的免疫细胞图谱 | 首次结合空间转录组学和多表位配体绘图技术,深入分析了慢性HIV感染下宫颈外组织的免疫景观 | 样本仅来自肯尼亚的性工作者,可能限制了研究结果的普适性 | 研究慢性HIV感染对宫颈外组织免疫景观的影响 | HIV感染和未感染的肯尼亚女性性工作者的宫颈外组织 | 数字病理学 | HIV感染 | 空间转录组学,多表位配体绘图 | NA | 组织样本 | HIV阳性组和阴性组的宫颈外组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-12-16 |
Analyzing scRNA-seq data by CCP-assisted UMAP and tSNE
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311791
PMID:39671349
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研究论文 | 本文研究了如何通过CCP辅助的UMAP和tSNE方法分析scRNA-seq数据,以提高可视化和准确性 | 本文引入了CCP方法作为UMAP和tSNE的初始化工具,显著提高了这两种降维技术的可视化和准确性 | NA | 提高scRNA-seq数据分析的准确性和可视化效果 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 21个公开数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-12-15 |
Genomic tumor evolution dictates human medulloblastoma progression
2024 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae172
PMID:39659836
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据分析了髓母细胞瘤的肿瘤进化过程,揭示了不同分子亚组的肿瘤细胞相互作用及其与拷贝数变异的关系 | 首次通过单细胞测序数据揭示了髓母细胞瘤的肿瘤进化轨迹,并识别了早期和晚期标记物,特别是SOX4的上调作为Group 3和Group 4髓母细胞瘤的潜在治疗靶点 | 研究样本量较小,且仅限于14名患者,可能无法全面代表所有髓母细胞瘤患者的情况 | 揭示髓母细胞瘤的肿瘤进化机制,特别是Group 3和Group 4亚组的肿瘤进展 | 髓母细胞瘤的肿瘤细胞及其分子亚组 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 14名髓母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-12-15 |
Expression of programmed death receptor-1 ligand (PD-L1) in human cancer is of prognostic value and associated with macrophage infiltration
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.99781
PMID:39668828
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析评估了PD-L1在人类癌症中的预后价值及其与巨噬细胞浸润的关系 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析发现PD-L1在肿瘤相关巨噬细胞上的表达与某些癌症的免疫治疗反应相关 | 研究依赖于现有数据库的数据,可能存在数据偏差和局限性 | 评估PD-L1在人类癌症中的预后价值及其与巨噬细胞浸润的关系 | PD-L1在不同癌症中的表达及其与患者总体生存率和巨噬细胞浸润的关系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-12-15 |
Senescence Reprogramming by MTHFD2 Deficiency Facilitates Tumor Progression
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.99168
PMID:39668825
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研究论文 | 研究探讨了年龄对癌症预后的影响,并开发了一个基于基因的衰老相关预后模型 | 首次揭示了MTHFD2在癌症衰老中的关键作用,其缺失通过诱导细胞衰老和促进衰老相关分泌表型(SASP)促进肿瘤生长 | 研究主要基于基因表达和单细胞RNA测序数据,可能缺乏对其他潜在因素的全面考虑 | 探讨年龄对癌症预后的影响,并开发衰老相关预后模型 | 老年和年轻癌症患者的肿瘤样本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 收集了老年和年轻癌症患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-12-15 |
Evaluating the prognostic potential of telomerase signature in breast cancer through advanced machine learning model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1462953
PMID:39669558
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研究论文 | 本文通过先进的机器学习模型评估端粒酶特征在乳腺癌中的预后潜力 | 开发了一种基于机器学习的端粒酶特征(MLTS),并展示了其在乳腺癌预后中的优越预测性能 | 未来研究需要进一步整合MLTS与其他分子特征以增强其临床应用 | 评估端粒酶特征在乳腺癌中的预后潜力 | 乳腺癌患者的生存预后 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法 | 机器学习模型 | 多组学数据 | 九个独立的乳腺癌数据集 | NA | NA | NA | NA |