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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-12-08 |
Exploring the shared pathogenic mechanisms of tuberculosis and COVID-19: emphasizing the role of VNN1 in severe COVID-19
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1453466
PMID:39639868
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研究论文 | 研究探讨了结核病和COVID-19之间的共同发病机制,特别强调了VNN1在严重COVID-19中的作用 | 识别了GMNN、SCD和FUT7作为COVID-19的强诊断标记,并发现VNN1与严重COVID-19的进展密切相关 | NA | 探讨结核病和COVID-19的共同发病机制,并寻找新的诊断和治疗靶点 | COVID-19和结核病的共同发病基因和免疫细胞浸润 | 生物信息学 | 传染病 | 机器学习、单细胞测序、分子对接 | 随机森林分析 | 基因表达数据 | 从GEO数据库中获取的COVID-19和结核病数据 | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-12-08 |
Identification of key biomarkers related to fibrocartilage chondrocytes for osteoarthritis based on bulk, single-cell transcriptomic data
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1482361
PMID:39640258
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序和微阵列数据,探索了纤维软骨细胞在骨关节炎进展中的作用,并识别了与纤维软骨细胞相关的关键生物标志物 | 本研究首次通过多组学方法识别了六个与纤维软骨细胞相关的骨关节炎生物标志物,并构建了一个探索性的风险模型 | 本研究仅在有限的样本中验证了生物标志物的蛋白质表达水平,未来需要在更大规模的样本中进行验证 | 探索纤维软骨细胞在骨关节炎进展中的作用,并识别相关的关键生物标志物 | 纤维软骨细胞及其在骨关节炎中的生物标志物 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 骨关节炎和正常软骨样本 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-12-07 |
Statistical inference with a manifold-constrained RNA velocity model uncovers cell cycle speed modulations
2024-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576093
PMID:38328127
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研究论文 | 本文开发了一种生成模型和贝叶斯推断方法,用于解决现有RNA速度算法的不稳定性和缺乏统计控制的问题,并在细胞周期研究中验证了其有效性 | 提出了一个生成模型和贝叶斯推断方法,将速度场和流形估计结合在一个统一的框架中,以一致地识别自主动力系统的参数 | NA | 开发一种新的RNA速度推断方法,以解决现有算法的不稳定性和缺乏统计控制的问题 | 细胞周期中的基因调控动力学 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA速度 | 生成模型 | 基因表达数据 | 多个样本和全基因组Perturb-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-12-06 |
Machine learning-informed liquid-liquid phase separation for personalized breast cancer treatment assessment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1485123
PMID:39628476
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的液-液相分离(MDLS)模型,用于提高乳腺癌患者的预后准确性和个性化治疗策略 | 本文创新性地结合了多组学数据和机器学习算法,构建了一个具有高预测能力的MDLS模型,用于乳腺癌的个性化治疗评估 | NA | 开发一种新的机器学习模型,以提高乳腺癌患者的预后准确性和个性化治疗策略 | 乳腺癌患者及其分子机制 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法 | MDLS模型 | 多组学和单细胞数据 | 9723名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-12-06 |
Co-inhibition of PGF and VEGFA enhances the effectiveness of immunotherapy in bladder cancer
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.100957
PMID:39628692
|
研究论文 | 研究探讨了在膀胱癌中联合抑制PGF和VEGFA对免疫治疗效果的增强作用 | 首次发现联合抑制PGF和VEGFA能够显著增强PD-1抑制剂在膀胱癌中的治疗效果 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未在人体中验证 | 探索在膀胱癌中抑制血管生成和免疫检查点阻断联合治疗的有效策略 | 膀胱癌细胞和血管生成相关分子 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用了膀胱癌细胞系MBT2和人类脐静脉内皮细胞(HUVECs) | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-12-05 |
FSCN1 is a Potential Therapeutic Target for Atherosclerosis Revealed by Single-Cell and Bulk RNA Sequencing
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S480528
PMID:39618922
|
研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序数据,研究了动脉粥样硬化中的细胞表型、细胞间通讯和潜在治疗靶点 | 发现FSCN1在动脉粥样硬化中的高表达,并验证了其在细胞凋亡和迁移中的作用,提示其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨动脉粥样硬化中的细胞表型、细胞间通讯和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化中的细胞类型、FSCN1的表达及其在疾病发展中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、ELISA | NA | RNA测序数据 | 包括Apoeko小鼠和颈动脉内膜切除术患者的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-12-05 |
Corrigendum: Unraveling the ecological landscape of mast cells in esophageal cancer through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522632
PMID:39620211
|
correction | 对先前发表的文章进行更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-12-05 |
Cellular and molecular characterization of peripheral glia in the lung and other organs
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0310303
PMID:39621665
|
研究论文 | 系统分析了肺部及其他器官中外周胶质细胞的细胞和分子特征 | 利用单细胞RNA测序技术,首次全面描述了小鼠肺部Sox10+胶质细胞系的解剖、细胞和分子特征,并扩展到灵长类和其他器官 | 研究主要集中在小鼠、鼠狐猴和人类,其他物种的数据有限 | 揭示外周胶质细胞在肺部及其他器官中的分子差异和定位 | 小鼠、鼠狐猴和人类的外周胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约700个外周胶质细胞样本,来自小鼠、鼠狐猴和人类 | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-12-02 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Crucial Genes Influencing the Polarization of Tumor-Associated Macrophages in Liver Cancer
2024, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/2024/7263358
PMID:38938448
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,识别了影响肝癌中肿瘤相关巨噬细胞极化的关键基因 | 首次通过单细胞转录组学技术,揭示了PRDM1基因在肝癌肿瘤微环境中调控M2巨噬细胞极化的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的数据,缺乏体内实验验证 | 探讨肝癌中肿瘤相关巨噬细胞的功能转变及其关键调控基因 | 肝癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其极化过程 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 74,742个细胞和23,110个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-12-01 |
demuxSNP: supervised demultiplexing single-cell RNA sequencing using cell hashing and SNPs
2024-Jan-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae090
PMID:39607981
|
研究论文 | 提出了一种名为demuxSNP的监督算法,利用细胞标记和单核苷酸多态性(SNPs)进行单细胞RNA测序数据的解复用 | demuxSNP结合了细胞标记和SNP数据,解决了仅使用单一数据模态的解复用方法的局限性,提高了低质量标记数据下的解复用性能 | NA | 开发一种新的解复用算法,以提高单细胞RNA测序实验的成本效益和数据质量 | 单细胞RNA测序数据,特别是低质量标记数据和存在类大小不平衡的数据 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 监督学习 | RNA测序数据 | 模拟和真实数据,包括5-50%的双胞率 | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-12-01 |
Deciphering the impact of senescence in kidney transplant rejection: An integrative machine learning and multi-omics analysis via bulk and single-cell RNA sequencing
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312272
PMID:39602449
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研究论文 | 本文通过综合机器学习和多组学分析,研究了衰老在肾移植排斥中的影响 | 首次整合衰老相关基因(SRGs)和机器学习算法,开发了急性排斥(AR)诊断模型和长期移植物存活预测模型 | 研究主要基于公开数据集,未涉及临床试验验证 | 探讨衰老与肾移植排斥的关系,开发诊断和预测模型 | 衰老相关基因(SRGs)在肾移植排斥中的作用 | 机器学习 | 肾移植 | RNA测序 | 随机森林(RF)、支持向量机(SVM)、XGBoost、广义线性模型(GLM)和LASSO | 基因表达数据 | 多个公开数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-12-01 |
Integrative analysis of single-cell transcriptomic and multilayer signaling networks in glioma reveal tumor progression stage
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1446903
PMID:39606019
|
研究论文 | 本文介绍了一种综合框架,利用单细胞RNA测序数据和多层信号网络模型研究胶质瘤进展阶段的分子变化 | 本文创新性地结合单细胞RNA测序数据和多层网络模型,揭示了胶质瘤进展阶段的关键分子关系和信号通路 | NA | 研究胶质瘤进展阶段的分子变化及其对治疗和预后的影响 | 胶质瘤的单细胞RNA测序数据和多层信号网络 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 多层网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-12-01 |
Identification of altered immune cell types and molecular mechanisms in Alzheimer's disease progression by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2024.1477327
PMID:39610716
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别阿尔茨海默病进展中改变的免疫细胞类型和分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别阿尔茨海默病中特定的免疫细胞类型和差异表达基因,并发现UFC1可能作为潜在的生物标志物 | 研究主要基于已有的数据集,缺乏对新样本的验证 | 揭示阿尔茨海默病进展中的分子机制,寻找潜在的治疗靶点和生物标志物 | 阿尔茨海默病中的免疫细胞类型和差异表达基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE181279、GSE63060和GSE63061数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-12-01 |
Exploring the feasibility of using mice as a substitute model for investigating microglia in aging and Alzheimer's disease though single cell analysis
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311374
PMID:39591421
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研究论文 | 研究通过单细胞分析探讨小鼠作为衰老和阿尔茨海默病中微胶质细胞替代模型的可行性 | 首次通过单核RNA测序和单细胞RNA测序比较人类和小鼠在衰老和阿尔茨海默病中微胶质细胞的异同 | 小鼠模型无法完全替代人类样本进行阿尔茨海默病和衰老研究 | 探讨小鼠作为研究衰老和阿尔茨海默病中微胶质细胞的替代模型的可行性 | 人类和小鼠的微胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 (snRNA-seq) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 人类数据集GSE198323和GSE127892的小鼠数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-11-29 |
Transcriptional profiling of zebrafish intestines identifies macrophages as host cells for human norovirus infection
2024 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2024.2431167
PMID:39584740
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术,研究斑马鱼肠道中的转录组,发现巨噬细胞是人诺如病毒的宿主细胞 | 首次在斑马鱼模型中验证了巨噬细胞是人诺如病毒的宿主细胞,并揭示了病毒在巨噬细胞中的复制机制 | 研究仅限于斑马鱼模型,尚未在人类中验证 | 探究人诺如病毒的宿主细胞及其在宿主细胞中的复制机制 | 斑马鱼肠道中的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼幼体肠道样本 | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-11-29 |
Tumor microenvironment and cancer metastasis: molecular mechanisms and therapeutic implications
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1442888
PMID:39600368
|
综述 | 本文综述了肿瘤微环境在癌症发展和转移中的重要作用,重点探讨了分子机制和治疗意义 | 本文通过多学科视角,强调了理解肿瘤微环境的分子基础对于开发更有效的癌症治疗方案的重要性,并指出了未来研究的方向 | NA | 探讨肿瘤微环境在癌症转移中的分子机制及其治疗意义 | 肿瘤微环境中的关键成分,如癌症相关成纤维细胞、免疫细胞、内皮细胞、细胞因子及细胞外基质 | NA | 癌症 | 单细胞分析、空间转录组学、表观遗传学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-11-29 |
Identification and Validation of Senescence-Related Signature by Combining Single Cell and Bulk Transcriptome Data Analysis to Predict the Prognosis and Identify the Key Gene CAV1 in Pancreatic Cancer
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S489985
PMID:39600676
|
研究论文 | 本研究结合单细胞和批量转录组数据分析,识别和验证了与衰老相关的特征,用于预测胰腺癌的预后并鉴定关键基因CAV1 | 开发了一种新的衰老相关预后工具,用于胰腺癌患者分层,并识别了CAV1作为潜在的治疗靶点 | NA | 研究细胞衰老在胰腺癌肿瘤微环境中的作用,特别是其对预后和免疫治疗结果的影响 | 胰腺癌患者的单细胞和批量转录组数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序、RNA-seq | COX比例风险模型、LASSO回归 | 基因表达数据 | 三个患者队列:TCGA队列、PAAD-AU队列和PAAD-CA队列 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-11-29 |
Causal links of human serum metabolites on the risk of prostate cancer: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing, and metabolic pathway analysis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1443330
PMID:39600951
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研究论文 | 本文通过孟德尔随机化研究探讨了人类血清代谢物与前列腺癌风险之间的因果关系 | 首次通过孟德尔随机化方法结合单细胞RNA测序和代谢途径分析,揭示了三种血清代谢物与前列腺癌风险的因果关系 | 研究结果需要进一步的机制研究来阐明这些血清代谢物和代谢途径如何影响前列腺癌的发生和发展 | 探讨血清代谢物与前列腺癌风险之间的因果关系 | 血清代谢物与前列腺癌风险 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、代谢途径分析 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | 7824名欧洲人 | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-11-27 |
scRNA-Seq Analysis Revealed CAFs Regulating HCC Cells via PTN Signaling
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S493675
PMID:39582814
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了癌症相关成纤维细胞(CAFs)通过PTN信号通路调控肝细胞癌(HCC)细胞 | 首次揭示了CAFs通过PTN/SDC2信号通路促进HCC进展的机制 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据和有限的临床样本,未来需更多实验验证 | 探讨CAFs在肝细胞癌微环境中的作用机制 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肝细胞癌细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集(GSE158723和GSE112271)以及来自HCC患者的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-11-27 |
Single-cell data revealed the function of natural killer cells and macrophage cells in chemotherapy tolerance in acute myeloid leukemia
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18521
PMID:39583114
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析,揭示了自然杀伤细胞和巨噬细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的功能 | 首次通过单细胞RNA测序数据揭示了自然杀伤细胞和巨噬细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的潜在作用 | 研究主要基于单细胞转录组数据,缺乏体内实验验证 | 探讨免疫细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的调控机制 | 急性髓系白血病患者的免疫细胞亚群及其标记基因 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 急性髓系白血病患者 | NA | NA | NA | NA |