单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1284 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-09-25 |
Revelation of comprehensive cell profiling of primary and metastatic tumour ecosystems in oral squamous cell carcinoma by single-cell transcriptomic analysis
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.97404
PMID:39310253
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示口腔鳞状细胞癌原发和转移肿瘤生态系统的综合细胞图谱 | 发现了两种新型细胞类型（CD1C-CD141-树突状细胞和CD1C+_B树突状细胞），并确定了IL1RN和C15orf48作为新的标记物 | NA | 理解口腔鳞状细胞癌在单细胞水平上的细胞起源和基因表达特征 | 口腔鳞状细胞癌的原发和转移肿瘤组织中的细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括来自口腔鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、转移淋巴结、放射治疗后的第二原发肿瘤等多种组织样本 |
| 342 | 2024-09-25 |
Comprehensive analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data reveals Schlafen-5 (SLFN5) as a novel prognosis and immunity
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.97975
PMID:39310264
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，探讨了Schlafen家族基因在结直肠腺癌（COAD）中的诊断和预后潜力 | 首次揭示了SLFN5在COAD中的显著上调及其与不良预后和免疫反应的关系 | NA | 探索Schlafen家族基因在结直肠腺癌中的诊断和预后潜力 | Schlafen家族基因在结直肠腺癌中的表达及其与预后和免疫反应的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 结直肠癌患者和正常组织的样本 |
| 343 | 2024-09-25 |
Investigation and Confirmation of PYCARD as a Potential Biomarker for the Management of Psoriasis Disease
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S468746
PMID:39310902
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研究论文 | 本文探讨了坏死性凋亡相关基因在银屑病中的分子机制，并筛选出PYCARD作为潜在的银屑病生物标志物 | 首次将PYCARD确定为银屑病的潜在生物标志物，并通过多种实验验证了其在银屑病发展中的重要作用 | NA | 探索银屑病中坏死性凋亡相关基因的分子机制，并筛选潜在的生物标志物 | 银屑病患者和银屑病样皮炎小鼠模型 | 生物信息学 | 银屑病 | 实时荧光定量PCR、Western blot、免疫组化、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及GSE13355和GSE14905数据集中的银屑病差异表达基因，以及临床样本和动物实验 |
| 344 | 2024-09-23 |
Innovative super-resolution in spatial transcriptomics: a transformer model exploiting histology images and spatial gene expression
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae052
PMID:38436557
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TransformerST的创新无监督模型，利用Transformer架构提升空间转录组学数据的分辨率，并展示了其在不同平台上的适应性 | 本文的创新点在于引入了一种无需参考数据的无监督Transformer模型，能够将Visium数据从多细胞级别提升到单细胞级别，并展示了其在不同空间转录组学平台上的适应性 | NA | 提升空间转录组学数据的分辨率，揭示组织结构的复杂性 | 空间转录组学数据和组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学技术 | Transformer | 图像和基因表达数据 | NA |
| 345 | 2024-09-23 |
A brief history of somatostatin interneuron taxonomy or: how many somatostatin subtypes are there, really?
2024, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2024.1436915
PMID:39091993
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研究论文 | 本文回顾了催产素中间神经元分类学的历史，并讨论了单细胞RNA测序技术在皮质神经元分类中的应用 | 提出了将催产素中间神经元细分为约十个“超类型”的分类方法，认为这种分类更符合传统形态学、电生理学和神经化学特征 | 指出基于基因表达微小差异的更细分类（如“t-类型”或“集群”）可能对研究人员不太有用，甚至可能违背分类的初衷 | 探讨催产素中间神经元的分类及其在实验神经科学中的应用 | 催产素中间神经元的分类及其在皮质网络中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量皮质神经元样本 |
| 346 | 2024-09-23 |
Mitophagy Promotes Hair Regeneration by Activating Glutathione Metabolism
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0433
PMID:39091635
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研究论文 | 本文研究了线粒体自噬通过调节谷胱甘肽代谢促进毛发生长的机制 | 首次揭示了线粒体自噬在毛发生长早期通过激活谷胱甘肽代谢促进毛囊干细胞增殖的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证 | 探讨线粒体自噬在毛发生长中的作用及其分子机制 | 毛囊干细胞和线粒体自噬相关基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序、透射电子显微镜、免疫荧光染色、分子对接 | NA | RNA | 小鼠毛囊干细胞样本 |
| 347 | 2024-09-23 |
CD36 restricts lipid-associated macrophages accumulation in white adipose tissues during atherogenesis
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1436865
PMID:39156133
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研究论文 | 研究探讨了CD36在动脉粥样硬化过程中对白色脂肪组织中脂质相关巨噬细胞积累的调控作用 | 首次发现CD36缺陷通过促进脂质相关巨噬细胞的积累，减少炎症并增加脂质代谢 | 研究仅在饮食诱导的动脉粥样硬化小鼠模型中进行，结果的普适性有待验证 | 探讨CD36在白色脂肪组织中对脂质代谢和炎症的调控作用 | 白色脂肪组织中的巨噬细胞及其亚群 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用饮食诱导的动脉粥样硬化小鼠模型进行研究 |
| 348 | 2024-09-23 |
Spatial transcriptomics of fetal membrane-Decidual interface reveals unique contributions by cell types in term and preterm births
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309063
PMID:39159152
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学方法，分析了足月和早产情况下胎儿膜-蜕膜界面各层的转录组网络，揭示了不同细胞类型在妊娠结局中的独特贡献 | 首次在空间水平上解析了胎儿膜-蜕膜界面各层在足月和早产情况下的转录组网络，识别了不同细胞类型在早产中的关键作用 | 样本量较小，仅包括13名患者的数据，可能影响结果的普适性 | 研究胎儿膜-蜕膜界面各层在足月和早产情况下的转录组特征，揭示其在妊娠结局中的作用 | 胎儿膜-蜕膜界面的各层细胞，包括羊膜上皮细胞、羊膜间质细胞、绒毛膜和蜕膜 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 13名患者，包括足月未分娩、足月分娩、早产和早产伴胎膜早破 |
| 349 | 2024-09-20 |
Deciphering colorectal cancer radioresistance and immune microrenvironment: unraveling the role of EIF5A through single-cell RNA sequencing and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1466226
PMID:39290702
|
研究论文 | 研究探讨了EIF5A在结直肠癌放疗抵抗中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和机器学习揭示了EIF5A在结直肠癌放疗抵抗中的关键作用，并验证了其在调节肿瘤免疫微环境中的功能 | NA | 研究EIF5A在结直肠癌放疗反应中的作用及其对肿瘤干细胞和肿瘤免疫微环境的影响 | EIF5A基因在结直肠癌放疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA | NA |
| 350 | 2024-09-19 |
Research and experimental verification on the mechanisms of cellular senescence in triple-negative breast cancer
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16935
PMID:38435998
|
研究论文 | 研究了三阴性乳腺癌中细胞衰老的机制，并通过实验验证了相关特征 | 首次系统地分析了三阴性乳腺癌中细胞衰老相关通路，并构建了风险模型 | 实验验证仅限于体外细胞系，缺乏临床样本的验证 | 探讨三阴性乳腺癌中细胞衰老的机制及其对预后的影响 | 三阴性乳腺癌患者及其细胞衰老相关特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 风险模型 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA数据集的三阴性乳腺癌患者样本，并进行了体外细胞系实验 |
| 351 | 2024-09-19 |
Integrin-associated transcriptional characteristics of circulating tumor cells in breast cancer patients
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16678
PMID:38250718
|
研究论文 | 研究了乳腺癌患者循环肿瘤细胞中整合素相关转录特征 | 首次探讨了不同整合素亚单位表达的循环肿瘤细胞的转录谱与其功能活性及转移潜能之间的关系 | 研究仅限于乳腺癌患者，且样本量较小 | 探讨循环肿瘤细胞中整合素表达与转录特征及其对转移潜能的影响 | 乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 乳腺癌患者的CD45阴性细胞 |
| 352 | 2024-09-19 |
The burgeoning spatial multi-omics in human gastrointestinal cancers
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17860
PMID:39285924
|
综述 | 本文综述了空间多组学技术在人类消化系统癌症中的应用 | 介绍了空间多组学技术如何保留组织样本中的空间信息，从而增强对个体发育和疾病病理的理解 | NA | 促进空间多组学技术在消化系统肿瘤疾病研究中的应用 | 食管癌、胃癌和结直肠癌 | 数字病理学 | 消化系统癌症 | 空间多组学技术 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和表观基因组数据 | NA |
| 353 | 2024-09-19 |
Comprehensive analysis of splicing factor SRs-related gene characteristics: predicting osteosarcoma prognosis and immune regulation status
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1456986
PMID:39286028
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研究论文 | 研究了剪接因子SRs相关基因对骨肉瘤患者总体生存和预后的影响，并通过单细胞RNA测序数据分析了SRs在骨肉瘤免疫细胞中的致癌途径 | 构建了基于SRs的预后模型，并揭示了SRs在骨肉瘤免疫细胞中的致癌途径 | NA | 探讨SRs相关基因对骨肉瘤患者预后和免疫调节状态的影响 | 骨肉瘤患者的总体生存和预后，以及SRs在免疫细胞中的作用 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | Lasso回归 | RNA | NA |
| 354 | 2024-09-19 |
Multi-omics landscape of Interferon-stimulated gene OASL reveals a potential biomarker in pan-cancer: from prognosis to tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1402951
PMID:39286258
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研究论文 | 本文通过多组学分析探讨了OASL在泛癌中的潜在生物标志物作用，从预后到肿瘤微环境的影响 | 首次系统性地研究了OASL在33种肿瘤中的表达及其与预后和肿瘤微环境的关系 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨OASL在泛癌中的预后和免疫学作用 | OASL在33种肿瘤中的表达及其与预后和肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 泛癌 | COX和Log-Rank回归分析 | NA | 基因表达数据 | 33种肿瘤 |
| 355 | 2024-09-19 |
Novel insights from human induced pluripotent stem cells on origins and roles of fibro/adipogenic progenitors as heterotopic ossification precursors
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1457344
PMID:39286484
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综述 | 本文综述了成纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）的起源和功能，并探讨了其在异位骨化中的作用 | 利用患者来源的诱导多能干细胞和异位骨化的小鼠模型，提供了关于FAPs起源和功能的新见解 | NA | 探讨FAPs的起源和功能，并研究其在异位骨化中的作用 | 成纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）及其在肌肉组织中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-09-19 |
A cheminformatics and network pharmacology approach to elucidate the mechanism of action of Mycobacterium tuberculosis γ-carbonic anhydrase inhibitors
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1457012
PMID:39286631
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研究论文 | 本研究采用化学信息学和网络药理学方法，揭示结核分枝杆菌γ-碳酸酐酶抑制剂的作用机制 | 本研究首次通过同源建模和虚拟筛选方法，识别出与Cas9蛋白具有高结合亲和力的化合物，并分析了这些化合物在免疫反应和肺组织完整性相关通路中的作用 | 研究结果仍需实验验证以证明候选化合物在结核分枝杆菌感染中的疗效 | 探索结核分枝杆菌发病机制的生物学联系，并研究靶向Cas9蛋白的抗结核化合物的作用机制 | 结核分枝杆菌的γ-碳酸酐酶及其抑制剂 | 生物信息学 | 结核病 | 同源建模、虚拟筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 357 | 2024-09-19 |
The shared molecular mechanism of spinal cord injury and sarcopenia: a comprehensive genomics analysis
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1373605
PMID:39281413
|
研究论文 | 本研究通过综合基因组分析，探讨脊髓损伤与肌肉减少症之间的共享分子机制 | 本研究首次通过RNA-seq数据分析，识别出脊髓损伤与肌肉减少症共有的关键基因，并构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 本研究主要依赖于公共数据库中的基因表达数据，未进行体内实验验证 | 旨在识别脊髓损伤与肌肉减少症共有的生物标志物，以辅助急性期和康复期的诊断与预后评估 | 脊髓损伤与肌肉减少症的共有生物标志物 | 基因组学 | 脊髓损伤 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的多个数据集 |
| 358 | 2024-09-19 |
Unveiling the cellular landscape: insights from single-cell RNA sequencing in multiple myeloma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458638
PMID:39281682
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究多发性骨髓瘤细胞间的通信过程，并探索潜在的治疗标志物 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了多发性骨髓瘤患者中的基因表达模式和分子通路，为未来的研究和临床干预提供了新的视角 | NA | 深入理解细胞通信过程，发现治疗多发性骨髓瘤的潜在标志物 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 32个骨髓样本，来自22名不同疾病进展阶段的多发性骨髓瘤患者和9名健康个体 |
| 359 | 2024-09-19 |
Alterations in Astrocyte Subpopulations in Glioma and Identification of Cuproptosis-Related Genes Using Single-Cell RNA Sequencing
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S473932
PMID:39281776
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研究论文 | 研究探讨了胶质瘤中星形胶质细胞亚群的变化及铜死亡相关基因的鉴定 | 首次揭示了铜死亡相关基因在胶质瘤微环境中的预后价值，并建立了一个新的三基因预后模型 | 研究样本量较小，且仅限于特定数据集，可能影响结果的普适性 | 探讨铜死亡相关基因在胶质瘤微环境中的作用及其预后价值 | 胶质瘤中的星形胶质细胞亚群及铜死亡相关基因 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 32,293个细胞来自三个内部单细胞RNA测序数据集，6,148个细胞来自中国胶质瘤基因组图谱（CGGA）涉及14名胶质瘤患者 |
| 360 | 2024-09-19 |
Single-Cell WGCNA Combined with Transcriptome Sequencing to Study the Molecular Mechanisms of Inflammation-Related Ferroptosis in Myocardial Ischemia-Reperfusion Injury
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S476456
PMID:39281774
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术结合加权基因共表达网络分析（WGCNA）探讨心肌缺血-再灌注损伤（MIRI）中炎症相关铁死亡的分子机制 | 首次结合单细胞转录组测序和WGCNA技术，深入研究MIRI中不同细胞亚型的变化及其与铁死亡相关基因和免疫浸润的调控网络 | 实验验证仅限于大鼠模型，未在人体样本中进行验证 | 揭示心肌缺血-再灌注损伤中炎症和铁死亡的分子机制 | 心肌缺血-再灌注损伤中的细胞亚型变化、铁死亡相关基因调控网络及免疫浸润 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus的四个数据集（GSE146285, GSE83472, GSE61592, GSE160516），并建立了MIRI大鼠模型进行验证 |