单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-12-11 |
Comprehensive Analysis of circRNA-Related mRNAs as Prognostic Factors in Non-Smoking Women with Lung Adenocarcinoma
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S490478
PMID:39650787
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研究论文 | 本文研究了circRNA相关的mRNA作为非吸烟女性肺腺癌的预后标志物 | 构建了circRNA-miRNA-mRNA网络，并基于相关mRNA创建了预后风险评分模型 | 样本量较小，仅16对肿瘤和癌旁组织样本 | 探讨circRNA相关的mRNA在非吸烟女性肺腺癌中的预后价值 | 非吸烟女性肺腺癌患者的肿瘤和癌旁组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 高通量测序、免疫组织化学 | NA | RNA | 16对肺腺癌组织及其对应的癌旁组织 |
| 322 | 2024-12-12 |
Integrating multi-omics techniques and in vitro experiments reveals that GLRX3 regulates the immune microenvironment and promotes hepatocellular carcinoma cell proliferation and invasion through iron metabolism pathways
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1496886
PMID:39654899
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研究论文 | 本研究通过整合多组学技术和体外实验，揭示了GLRX3通过铁代谢途径调控免疫微环境并促进肝细胞癌细胞增殖和侵袭 | 首次系统分析了肝细胞癌肿瘤微环境中铁代谢的变化，并揭示了GLRX3在铁代谢调控中的关键作用及其对肿瘤细胞增殖和免疫逃逸的机制 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 系统分析肝细胞癌肿瘤微环境中铁代谢的变化，并探讨铁代谢调控对肝癌患者生存的影响 | 肝细胞癌患者的单细胞测序数据以及GLRX3基因的表达和功能 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | 来自GEO数据库的肝细胞癌患者单细胞测序数据 |
| 323 | 2024-12-11 |
Holliday junction recognition protein (HJURP) could reflect the clinical outcomes of lung adenocarcinoma patients, and impact the choice of precision therapy
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1475511
PMID:39649097
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研究论文 | 本文研究了HJURP蛋白在肺腺癌患者中的表达及其对临床结果和精准治疗选择的影响 | 首次揭示了HJURP作为肺腺癌的可靠预后生物标志物，并探讨了其在精准治疗中的潜在作用 | 研究结果需要在更大规模的队列中进行验证 | 识别肺腺癌的可靠预后生物标志物和潜在治疗靶点，以改善患者预后 | HJURP蛋白在肺腺癌中的表达及其与临床结果、遗传改变、免疫细胞浸润和治疗反应的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共1507例肺腺癌患者（TCGA-LUAD: 453例，GSE31210: 226例，GSE68465: 442例，GSE72094: 386例） |
| 324 | 2024-12-10 |
Single-cell sequencing reveals the evolution of immune molecules across multiple vertebrate species
2024-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.02.017
PMID:36871615
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了多个脊椎动物物种免疫细胞的转录组特征，揭示了免疫分子在进化过程中的变化 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，系统地比较了多个脊椎动物物种的免疫细胞转录组特征，揭示了免疫分子在进化过程中的保守性和特异性 | 本文仅分析了七个脊椎动物物种的免疫细胞，可能无法全面代表所有脊椎动物的免疫进化特征 | 研究免疫系统在不同脊椎动物物种中的进化特征 | 七个脊椎动物物种的免疫细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 七个脊椎动物物种的免疫细胞 |
| 325 | 2024-12-09 |
Fibroblast heterogeneity and functions: insights from single-cell sequencing in wound healing, breast cancer, ovarian cancer and melanoma
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1304853
PMID:38525245
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了成纤维细胞在伤口愈合、乳腺癌、卵巢癌和黑色素瘤中的异质性和功能 | 利用单细胞RNA测序技术提供了更高的分辨率，揭示了成纤维细胞在不同疾病中的基因表达差异、表观遗传修饰、成纤维细胞谱系、新的临床相关基因和蛋白质以及与其他细胞类型的空间信号相互作用 | NA | 探讨成纤维细胞在不同疾病中的异质性和功能 | 成纤维细胞在伤口愈合、乳腺癌、卵巢癌和黑色素瘤中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 326 | 2024-12-09 |
CATD: a reproducible pipeline for selecting cell-type deconvolution methods across tissues
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae048
PMID:38638280
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研究论文 | 本文介绍了一种可重复的细胞类型反卷积方法选择管道CATD，用于跨组织评估多种方法 | 提出了CATD管道，集成了生成参考数据和伪批量数据以及运行现有反卷积方法的功能，简化了大量样本的同时反卷积 | NA | 评估和选择适用于不同组织的细胞类型反卷积方法 | 31种细胞类型反卷积方法在人类和小鼠多种组织中的表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 回归模型 | 转录组数据 | 涉及人类和小鼠的多种组织样本 |
| 327 | 2024-12-09 |
Exploration of the Development and Cell Communication of Aneuploid Osteoblasts and Osteoclasts in Giant Cell Tumour of Bone Using Single-Cell RNA Sequencing
2024, Folia biologica
IF:1.1Q4
DOI:10.14712/fb2024070030166
PMID:39644111
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研究论文 | 研究了巨细胞瘤骨中非整倍体成骨细胞和破骨细胞的发育及细胞通讯 | 首次使用单细胞RNA测序技术探索巨细胞瘤骨中非整倍体成骨细胞和破骨细胞的发育及细胞通讯 | 研究仅限于巨细胞瘤骨样本，结果可能不适用于其他类型的肿瘤 | 探索巨细胞瘤骨中非整倍体成骨细胞和破骨细胞的发育及细胞通讯 | 巨细胞瘤骨中的非整倍体成骨细胞和破骨细胞 | 数字病理学 | 骨肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 9117个细胞，包括八种细胞类型 |
| 328 | 2024-12-08 |
A systematic evaluation of state-of-the-art deconvolution methods in spatial transcriptomics: insights from cardiovascular disease and chronic kidney disease
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1352594
PMID:38601476
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研究论文 | 本文系统评估了三种空间转录组学去卷积方法在心血管疾病和慢性肾病中的表现 | 首次在心血管疾病和慢性肾病样本中进行去卷积方法的基准测试 | 所有方法在去卷积过程中都需要较少的参考数据，但Cell2location在计算上更为密集 | 评估不同去卷积方法在特定疾病样本中的表现 | 心血管疾病和慢性肾病患者的组织样本 | 空间转录组学 | 心血管疾病, 慢性肾病 | 去卷积方法 | NA | 转录组数据 | 来自不同病理状态的心血管疾病和慢性肾病患者样本 |
| 329 | 2024-12-08 |
A generalizable and easy-to-use COVID-19 stratification model for the next pandemic via immune-phenotyping and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372539
PMID:38601145
|
研究论文 | 本文开发并验证了一种可推广且易于使用的COVID-19严重程度分层模型，利用机器学习算法 | 提出了基于cDCs和LDH水平的机器学习模型，用于预测COVID-19的严重程度 | NA | 开发一种可推广且易于使用的COVID-19严重程度分层模型，为未来疫情提供参考 | COVID-19患者的免疫特征和实验室参数 | 机器学习 | COVID-19 | CyTOF、单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 免疫特征数据、实验室参数数据 | 发现队列39例，验证队列840例 |
| 330 | 2024-12-08 |
Uncovering the dual roles of peripheral immune cells and their connections to brain cells in stroke and post-stroke stages through single-cell sequencing
2024, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2024.1443438
PMID:39633897
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在揭示中风及中风后阶段外周免疫细胞与脑细胞相互作用中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术无偏倚地识别中风期间和之后脑和外周血单核细胞的细胞异质性 | NA | 探索中风期间和之后不同角色细胞的表型景观，并揭示外周免疫细胞的双重作用 | 中风期间和之后的外周免疫细胞及其与脑细胞的相互作用 | NA | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 331 | 2024-12-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals key molecular drivers and immune landscape in uveal melanoma: implications for targeted therapy and prognostic modeling
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1493752
PMID:39635521
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了葡萄膜黑色素瘤的分子驱动因素和免疫景观，并开发了一种新的预后模型，为靶向治疗和预后预测提供了新思路 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了葡萄膜黑色素瘤中C5 PCOLCE+肿瘤细胞的关键作用，并开发了一种新的预后模型PTRS，识别出CITED1作为高风险基因 | 本研究主要基于GSE139829数据集，样本量有限，需要进一步的大规模验证 | 揭示葡萄膜黑色素瘤的分子驱动因素和免疫景观，开发新的预后模型和治疗靶点 | 葡萄膜黑色素瘤的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8例原发性葡萄膜黑色素瘤患者和3例转移性疾病的患者 |
| 332 | 2024-12-08 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing reveals immune-related SPP1+ macrophages as a potential strategy for predicting the prognosis and treatment of liver fibrosis and hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1455383
PMID:39635536
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研究论文 | 本研究整合单细胞和批量RNA测序，识别与肝纤维化和肝细胞癌相关的基因、细胞亚群和信号通路，并建立预测模型和潜在治疗药物 | 首次整合单细胞和批量RNA测序，识别出与肝纤维化和肝细胞癌相关的40个致病基因和15个关键细胞亚群，并发现SPP1+巨噬细胞与免疫浸润和预后发展的正相关性 | NA | 研究肝纤维化和肝细胞癌的致病基因、细胞亚群、调控机制、预后基因及潜在小分子药物 | 肝纤维化和肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、批量测序、分子对接技术 | 机器学习 | RNA | NA |
| 333 | 2024-12-08 |
Exploring the shared pathogenic mechanisms of tuberculosis and COVID-19: emphasizing the role of VNN1 in severe COVID-19
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1453466
PMID:39639868
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研究论文 | 研究探讨了结核病和COVID-19之间的共同发病机制，特别强调了VNN1在严重COVID-19中的作用 | 识别了GMNN、SCD和FUT7作为COVID-19的强诊断标记，并发现VNN1与严重COVID-19的进展密切相关 | NA | 探讨结核病和COVID-19的共同发病机制，并寻找新的诊断和治疗靶点 | COVID-19和结核病的共同发病基因和免疫细胞浸润 | 生物信息学 | 传染病 | 机器学习、单细胞测序、分子对接 | 随机森林分析 | 基因表达数据 | 从GEO数据库中获取的COVID-19和结核病数据 |
| 334 | 2024-12-08 |
Identification of key biomarkers related to fibrocartilage chondrocytes for osteoarthritis based on bulk, single-cell transcriptomic data
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1482361
PMID:39640258
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序和微阵列数据，探索了纤维软骨细胞在骨关节炎进展中的作用，并识别了与纤维软骨细胞相关的关键生物标志物 | 本研究首次通过多组学方法识别了六个与纤维软骨细胞相关的骨关节炎生物标志物，并构建了一个探索性的风险模型 | 本研究仅在有限的样本中验证了生物标志物的蛋白质表达水平，未来需要在更大规模的样本中进行验证 | 探索纤维软骨细胞在骨关节炎进展中的作用，并识别相关的关键生物标志物 | 纤维软骨细胞及其在骨关节炎中的生物标志物 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 骨关节炎和正常软骨样本 |
| 335 | 2024-12-07 |
Statistical inference with a manifold-constrained RNA velocity model uncovers cell cycle speed modulations
2024-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576093
PMID:38328127
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研究论文 | 本文开发了一种生成模型和贝叶斯推断方法，用于解决现有RNA速度算法的不稳定性和缺乏统计控制的问题，并在细胞周期研究中验证了其有效性 | 提出了一个生成模型和贝叶斯推断方法，将速度场和流形估计结合在一个统一的框架中，以一致地识别自主动力系统的参数 | NA | 开发一种新的RNA速度推断方法，以解决现有算法的不稳定性和缺乏统计控制的问题 | 细胞周期中的基因调控动力学 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA速度 | 生成模型 | 基因表达数据 | 多个样本和全基因组Perturb-seq数据 |
| 336 | 2024-12-06 |
Machine learning-informed liquid-liquid phase separation for personalized breast cancer treatment assessment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1485123
PMID:39628476
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的液-液相分离（MDLS）模型，用于提高乳腺癌患者的预后准确性和个性化治疗策略 | 本文创新性地结合了多组学数据和机器学习算法，构建了一个具有高预测能力的MDLS模型，用于乳腺癌的个性化治疗评估 | NA | 开发一种新的机器学习模型，以提高乳腺癌患者的预后准确性和个性化治疗策略 | 乳腺癌患者及其分子机制 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法 | MDLS模型 | 多组学和单细胞数据 | 9723名乳腺癌患者 |
| 337 | 2024-12-06 |
Co-inhibition of PGF and VEGFA enhances the effectiveness of immunotherapy in bladder cancer
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.100957
PMID:39628692
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研究论文 | 研究探讨了在膀胱癌中联合抑制PGF和VEGFA对免疫治疗效果的增强作用 | 首次发现联合抑制PGF和VEGFA能够显著增强PD-1抑制剂在膀胱癌中的治疗效果 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探索在膀胱癌中抑制血管生成和免疫检查点阻断联合治疗的有效策略 | 膀胱癌细胞和血管生成相关分子 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用了膀胱癌细胞系MBT2和人类脐静脉内皮细胞(HUVECs) |
| 338 | 2024-12-05 |
FSCN1 is a Potential Therapeutic Target for Atherosclerosis Revealed by Single-Cell and Bulk RNA Sequencing
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S480528
PMID:39618922
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序数据，研究了动脉粥样硬化中的细胞表型、细胞间通讯和潜在治疗靶点 | 发现FSCN1在动脉粥样硬化中的高表达，并验证了其在细胞凋亡和迁移中的作用，提示其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨动脉粥样硬化中的细胞表型、细胞间通讯和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化中的细胞类型、FSCN1的表达及其在疾病发展中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、ELISA | NA | RNA测序数据 | 包括Apoeko小鼠和颈动脉内膜切除术患者的数据 |
| 339 | 2024-12-05 |
Corrigendum: Unraveling the ecological landscape of mast cells in esophageal cancer through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522632
PMID:39620211
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correction | 对先前发表的文章进行更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2024-12-05 |
Cellular and molecular characterization of peripheral glia in the lung and other organs
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0310303
PMID:39621665
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研究论文 | 系统分析了肺部及其他器官中外周胶质细胞的细胞和分子特征 | 利用单细胞RNA测序技术，首次全面描述了小鼠肺部Sox10+胶质细胞系的解剖、细胞和分子特征，并扩展到灵长类和其他器官 | 研究主要集中在小鼠、鼠狐猴和人类，其他物种的数据有限 | 揭示外周胶质细胞在肺部及其他器官中的分子差异和定位 | 小鼠、鼠狐猴和人类的外周胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约700个外周胶质细胞样本，来自小鼠、鼠狐猴和人类 |