单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-11-29 |
Identification and Validation of Senescence-Related Signature by Combining Single Cell and Bulk Transcriptome Data Analysis to Predict the Prognosis and Identify the Key Gene CAV1 in Pancreatic Cancer
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S489985
PMID:39600676
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研究论文 | 本研究结合单细胞和批量转录组数据分析，识别和验证了与衰老相关的特征，用于预测胰腺癌的预后并鉴定关键基因CAV1 | 开发了一种新的衰老相关预后工具，用于胰腺癌患者分层，并识别了CAV1作为潜在的治疗靶点 | NA | 研究细胞衰老在胰腺癌肿瘤微环境中的作用，特别是其对预后和免疫治疗结果的影响 | 胰腺癌患者的单细胞和批量转录组数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序、RNA-seq | COX比例风险模型、LASSO回归 | 基因表达数据 | 三个患者队列：TCGA队列、PAAD-AU队列和PAAD-CA队列 |
| 322 | 2024-11-29 |
Applications of single-cell RNA sequencing in rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491318
PMID:39600707
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review | 本文综述了单细胞RNA测序技术在类风湿性关节炎研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的细胞异质性和功能的详细视图，有助于解析细胞和分子机制 | 该技术仍面临成本较高、低丰度转录本检测灵敏度较低以及数据分析流程相对复杂等挑战 | 探讨单细胞RNA测序技术在类风湿性关节炎研究中的应用，为创新和更有效的治疗策略铺平道路 | 类风湿性关节炎的细胞状态和过渡 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 323 | 2024-11-29 |
Causal links of human serum metabolites on the risk of prostate cancer: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing, and metabolic pathway analysis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1443330
PMID:39600951
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研究论文 | 本文通过孟德尔随机化研究探讨了人类血清代谢物与前列腺癌风险之间的因果关系 | 首次通过孟德尔随机化方法结合单细胞RNA测序和代谢途径分析，揭示了三种血清代谢物与前列腺癌风险的因果关系 | 研究结果需要进一步的机制研究来阐明这些血清代谢物和代谢途径如何影响前列腺癌的发生和发展 | 探讨血清代谢物与前列腺癌风险之间的因果关系 | 血清代谢物与前列腺癌风险 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、代谢途径分析 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | 7824名欧洲人 |
| 324 | 2024-11-27 |
scRNA-Seq Analysis Revealed CAFs Regulating HCC Cells via PTN Signaling
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S493675
PMID:39582814
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过PTN信号通路调控肝细胞癌（HCC）细胞 | 首次揭示了CAFs通过PTN/SDC2信号通路促进HCC进展的机制 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据和有限的临床样本，未来需更多实验验证 | 探讨CAFs在肝细胞癌微环境中的作用机制 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肝细胞癌细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集（GSE158723和GSE112271）以及来自HCC患者的临床样本 |
| 325 | 2024-11-27 |
Single-cell data revealed the function of natural killer cells and macrophage cells in chemotherapy tolerance in acute myeloid leukemia
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18521
PMID:39583114
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析，揭示了自然杀伤细胞和巨噬细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的功能 | 首次通过单细胞RNA测序数据揭示了自然杀伤细胞和巨噬细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的潜在作用 | 研究主要基于单细胞转录组数据，缺乏体内实验验证 | 探讨免疫细胞在急性髓系白血病化疗耐药中的调控机制 | 急性髓系白血病患者的免疫细胞亚群及其标记基因 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 急性髓系白血病患者 |
| 326 | 2024-11-27 |
MUC1 and CREB3 are Hub Ferroptosis Suppressors for Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus Degeneration by Integrated Bioinformatics and Experimental Verification
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S489052
PMID:39583856
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验验证，探讨了MUC1和CREB3作为核心铁死亡抑制因子在椎间盘退变中的作用 | 首次揭示了MUC1和CREB3作为椎间盘退变中的铁死亡抑制因子，并构建了药物和竞争性内源RNA网络 | 实验验证和单细胞RNA测序分析的样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探索铁死亡相关基因及其在椎间盘退变中的作用 | 椎间盘的髓核和纤维环 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 基因表达分析、GO和KEGG分析、LASSO和SVM-RFE算法、GSEA和GSVA分析、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 髓核和纤维环的基因表达数据来自Gene Expression Omnibus数据库，实验验证和单细胞RNA测序分析的具体样本量未详细说明 |
| 327 | 2024-11-27 |
Prognostic features of bladder cancer based on five neddylation-related genes
2024, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
DOI:10.62347/RWCH7802
PMID:39584004
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研究论文 | 研究基于五个neddylation相关基因的膀胱癌预后特征 | 首次探讨neddylation在膀胱癌发病和进展中的潜在影响 | NA | 探索neddylation在膀胱癌中的作用及其对发病和进展的影响 | 膀胱癌的预后特征 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 基因表达数据分析 | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 11,361个差异表达基因和1,500个枢纽基因 |
| 328 | 2024-11-27 |
A Mendelian randomisation approach to explore genetic factors associated with erectile dysfunction based on pooled genomic data
2024, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
DOI:10.62347/GENV7771
PMID:39584007
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化方法探索与勃起功能障碍相关的遗传因素 | 首次利用孟德尔随机化分析结合全血表达数量性状位点和GWAS数据，筛选出与勃起功能障碍高度相关的基因MDM4 | 研究样本主要来自芬兰数据库，可能存在地域和人群偏倚 | 探索勃起功能障碍的遗传因素，为个性化治疗提供依据 | 勃起功能障碍相关的遗传基因 | 遗传学 | 男性健康 | 孟德尔随机化分析 | NA | 基因组数据 | 共95178个个体，包括1154个病例和94024个对照 |
| 329 | 2024-11-27 |
Prognostic characteristics and drug sensitivity analysis of hepatocellular carcinoma based on histone modification-related genes: a multi-omics integrated study revealing potential therapeutic targets and individualized treatment strategies
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1489469
PMID:39584133
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研究论文 | 本研究整合多组学数据，分析了肝细胞癌中与组蛋白修饰相关的基因，并开发了一种基于组蛋白修饰的预后特征，揭示了潜在的治疗靶点和个性化治疗策略 | 首次通过多组学整合分析，定义了110个与组蛋白相关的基因，并开发了一种新的预后特征，为肝细胞癌的个性化治疗提供了新的见解 | 研究主要基于现有数据集，未来需要进一步的临床验证 | 探讨组蛋白修饰在肝细胞癌中的作用，并开发新的预后特征和治疗策略 | 肝细胞癌患者及其组蛋白修饰相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 机器学习 | 基因组数据、临床信息 | 多个队列的数据，包括单细胞RNA测序和批量RNA测序 |
| 330 | 2024-11-27 |
Multi-Omics Exploration of the Role of PTGS2 as a Hub Gene in Ferroptosis Within the Artery of Takayasu Arteritis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S478413
PMID:39588139
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研究论文 | 本研究探讨了PTGS2作为Takayasu动脉炎中铁死亡相关枢纽基因的多组学作用 | 首次通过高通量和单细胞转录组学研究Takayasu动脉炎中的铁死亡机制，并识别出PTGS2作为核心基因 | 研究样本量较小，且缺乏动脉样本 | 探索Takayasu动脉炎中铁死亡的机制 | Takayasu动脉炎患者的动脉样本 | 数字病理学 | Takayasu动脉炎 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8名Takayasu动脉炎患者和8名肾移植供体的样本，以及3个公共颈动脉样本 |
| 331 | 2024-11-27 |
CXCR6 expression predicts prognosis and immunotherapeutic benefit in muscle-invasive bladder cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1498579
PMID:39588301
|
研究论文 | 研究探讨了CXCR6在肌肉浸润性膀胱癌中的表达及其对预后和免疫治疗效果的预测作用 | 首次系统研究了CXCR6在肌肉浸润性膀胱癌中的表达及其对预后和免疫治疗效果的影响 | NA | 探讨CXCR6在肌肉浸润性膀胱癌中的作用及其对预后和免疫治疗效果的预测价值 | 肌肉浸润性膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 391名肌肉浸润性膀胱癌患者的数据，212名来自GEO，131名来自本中心，195名来自IMvigor210队列，以及9名膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据 |
| 332 | 2024-11-27 |
Periodontal ligament tissues support neutrophil differentiation and maturation processes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1446541
PMID:39588378
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研究论文 | 研究牙周韧带组织支持中性粒细胞分化和成熟过程 | 首次揭示牙周韧带中中性粒细胞的异质性及其在成熟过程中的不同阶段 | 研究仅基于小鼠牙周韧带中的单细胞RNA测序数据，未涉及人类样本 | 探讨牙周韧带中中性粒细胞的分化和成熟过程 | 牙周韧带中的中性粒细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠牙周韧带中的单细胞RNA测序数据 |
| 333 | 2024-11-27 |
Ferroptosis-related prognostic model of mantle cell lymphoma
2024, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2024-1090
PMID:39588389
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研究论文 | 本研究建立了一个与铁死亡相关的基因模型，用于评估套细胞淋巴瘤患者的预后 | 首次建立了基于铁死亡相关基因的套细胞淋巴瘤预后模型，并预测了潜在的治疗药物 | NA | 开发一个基于铁死亡相关基因的预后模型，用于评估套细胞淋巴瘤患者的预后 | 套细胞淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归和Least absolute selection and shrinkage Operator回归分析 | 基因表达数据 | 使用了GSE184031和GSE32018数据集中的样本 |
| 334 | 2024-11-27 |
Causal impact of gut microbiota on five liver diseases: insights from mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1362139
PMID:39588518
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研究论文 | 研究肠道微生物群对五种肝脏疾病的因果影响，通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析 | 首次通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序揭示了肠道微生物群与五种肝脏疾病之间的因果关系，并发现Prevotella具有保护作用 | 研究依赖于现有的大规模全基因组关联研究数据，可能存在数据偏差 | 探讨肠道微生物群与肝脏疾病之间的因果关系，并评估Prevotella的保护作用 | 肠道微生物群和五种肝脏疾病（酒精性肝病、肝硬化、肝功能衰竭、良性肝肿瘤和原发性肝恶性肿瘤） | NA | 肝脏疾病 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 13,266个样本用于全基因组关联研究 |
| 335 | 2024-11-27 |
Spatial Omics: Navigating Neuroscience Research into the New Era
2024, Advances in neurobiology
DOI:10.1007/978-3-031-69188-1_6
PMID:39589713
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研究论文 | 本文探讨了空间组学技术在神经科学研究中的应用及其对脑组织结构理解的革命性影响 | 本文介绍了空间组学技术，特别是结合转录组学和蛋白质组学的技术，如何通过FISH、ISS和NGS等方法提供详细的空间背景信息，克服了传统技术的分辨率和全面性限制 | 尽管空间组学技术在成本、速度和数据分析方面存在挑战，但其仍在不断发展 | 本文旨在探讨空间组学技术在神经科学研究中的应用，以深入理解脑组织结构和神经退行性疾病 | 本文主要研究对象是人类大脑的神经元和突触，以及这些结构在神经发育和疾病中的作用 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间组学技术，包括FISH、ISS和NGS | NA | 基因表达和表观遗传状态数据 | NA |
| 336 | 2024-11-24 |
Nature and nurture in fruit fly hearing
2024, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2024.1503438
PMID:39568979
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review | 本文综述了果蝇听觉感知中的“先天与后天”现象，特别是歌曲偏好学习的神经机制 | 整合了单细胞转录组和脑连接组等组学数据库，结合传统分子遗传学，使果蝇成为研究听觉感知和行为中“先天与后天”神经基础的杰出模型 | NA | 探讨果蝇歌曲偏好学习的神经机制及其在听觉感知和行为中的作用 | 果蝇的歌曲偏好学习及其神经回路 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-11-24 |
Single-cell sequencing reveals transcriptional dynamics regulated by ERα in mouse ovaries
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0313867
PMID:39570927
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序揭示ERα在小鼠卵巢中的转录调控动态 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了ERα缺失对卵巢细胞转录组的影响 | 研究仅限于αERKO小鼠模型，可能无法完全代表所有卵巢功能障碍的情况 | 阐明ERα调控卵巢细胞转录动力学的分子机制 | ERα敲除小鼠的卵巢细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 野生型和αERKO小鼠的卵巢细胞 |
| 338 | 2024-11-24 |
BreCML: identifying breast cancer cell state in scRNA-seq via machine learning
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1482726
PMID:39574916
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的预测工具BreCML，用于准确分类乳腺癌细胞亚群及其相关标记基因 | BreCML在训练数据集上达到了98.92%的准确率，并在测试数据集上展示了卓越的准确性、精确度、召回率和F1分数 | NA | 开发一种能够准确分类乳腺癌细胞亚群及其相关标记基因的机器学习预测工具 | 乳腺癌细胞及其相关标记基因 | 机器学习 | 乳腺癌 | scRNA-seq | XGBoost | 基因数据 | NA |
| 339 | 2024-11-24 |
Cellular Characterization and Interspecies Evolution of the Tree Shrew Retina across Postnatal Lifespan
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0536
PMID:39574940
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研究论文 | 研究了树鼩视网膜细胞在出生后生命周期中的细胞特征和跨物种进化 | 建立了树鼩视网膜细胞的年龄相关单细胞RNA测序图谱，并进行了跨物种分析 | NA | 探讨树鼩视网膜细胞在不同年龄阶段的细胞组成和基因表达模式 | 树鼩视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15只树鼩 |
| 340 | 2024-11-24 |
Integrated analysis of single-cell, spatial and bulk RNA-sequencing identifies a cell-death signature for predicting the outcomes of head and neck cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1487966
PMID:39575251
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，识别出一种细胞死亡特征，用于预测头颈部癌症的预后 | 本文创新性地整合了单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，构建了一个细胞死亡相关特征风险评分模型（CDRscore），用于预测头颈部癌症的预后 | NA | 研究细胞死亡在头颈部癌症复发和术后预后中的作用，并开发一种预测预后的模型 | 头颈部癌症患者的单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 涉及五种主要亚型的头颈部癌症相关单细胞RNA测序数据，以及来自TCGA数据集的批量RNA测序数据和喉鳞状细胞癌的空间转录组学数据 |