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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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321 | 2024-09-30 |
Single-nuclei transcriptome analysis of channel catfish spleen provides insight into the immunome of an aquaculture-relevant species
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309397
PMID:39325796
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序技术分析了养殖相关物种——通道鲶鱼脾脏的转录组,揭示了其免疫系统的细胞组成和基因表达特征 | 首次对通道鲶鱼脾脏进行单核RNA测序,识别了多种免疫细胞亚群及其基因表达特征 | 研究仅限于通道鲶鱼脾脏,未涉及其他组织或物种 | 深入研究通道鲶鱼的免疫系统,特别是脾脏的免疫细胞组成和基因表达 | 通道鲶鱼脾脏的免疫细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从8,157个细胞中生成了278,717,872条reads,整合数据包括19,613个细胞和20,121个基因 |
322 | 2024-09-30 |
Specific cell subclusters of dental pulp stem cells respond to distinct pathogens through the ROS pathway
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1452124
PMID:39328360
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研究论文 | 研究分析了牙髓干细胞在受到口腔真菌和细菌感染时的细胞和分子特性 | 发现了一个特定的牙髓干细胞亚群对不同病原体感染有特异性反应,并通过ROS途径激活MAPK和NF-κB通路引发免疫反应 | NA | 研究牙髓干细胞在不同病原体感染下的反应机制 | 牙髓干细胞及其在真菌和细菌感染下的反应 | NA | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | 6名健康受试者的阻生第三磨牙中的牙髓干细胞 |
323 | 2024-09-30 |
Monocytes as an early risk factor for acute graft-versus-host disease after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1433091
PMID:39328417
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了异基因造血干细胞移植后急性移植物抗宿主病(aGVHD)的早期风险因素 | 首次发现移植后第21天外周血单核细胞的显著增加和激活与aGVHD的发生密切相关 | 研究样本量较小,需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性 | 识别异基因造血干细胞移植后急性移植物抗宿主病的潜在生物标志物,以预防和治疗该疾病 | 异基因造血干细胞移植后发生或未发生急性移植物抗宿主病的患者 | NA | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及发生和未发生急性移植物抗宿主病的患者样本 |
324 | 2024-09-28 |
Crosstalk Between Cancer-associated Fibroblasts and Myeloid Cells Shapes the Heterogeneous Microenvironment of Gastric Cancer
2024, Current genomics
IF:1.8Q3
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研究论文 | 研究探讨了胃癌微环境中癌症相关成纤维细胞与骨髓细胞之间的相互作用及其对微环境异质性的影响 | 首次识别了两种癌症相关成纤维细胞亚型,并揭示了炎症性癌症相关成纤维细胞在EMT和脂质代谢中的作用,以及肿瘤浸润性骨髓细胞的功能多样性 | 研究主要基于生物信息学分析和单细胞RNA测序数据,实验验证部分有限 | 深入了解胃癌微环境的异质性,为精准治疗提供新思路 | 胃癌微环境中的癌症相关成纤维细胞和骨髓细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及八个细胞群体的单细胞图谱 |
325 | 2024-09-28 |
Identify BCAT1 plays an oncogenic role and promotes EMT in KIRC via single cell RNA-seq and experiment
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1446324
PMID:39324007
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研究论文 | 本研究探讨了BCAT1在肾透明细胞癌(KIRC)中的致癌作用及其通过上皮间质转化(EMT)促进肿瘤侵袭和转移的机制 | 首次系统研究了BCAT1在KIRC中的致癌作用及其通过EMT促进肿瘤侵袭和转移的机制 | NA | 探讨BCAT1在肾透明细胞癌(KIRC)中的致癌作用及其机制 | BCAT1在KIRC中的功能和机制 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE159115单细胞转录组数据,并进行了临床组织样本的Western Blotting和免疫组化染色 |
326 | 2024-09-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals the communications between tumor microenvironment components and tumor metastasis in osteosarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1445555
PMID:39324133
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤中肿瘤微环境成分与肿瘤转移之间的通信机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨肉瘤中肿瘤微环境成分与肿瘤转移之间的复杂通信机制 | 研究仅基于特定数据集,结果的普适性有待进一步验证 | 探索骨肉瘤的转移机制,为癌症治疗开辟新途径 | 骨肉瘤中的肿瘤微环境成分与肿瘤转移 | 数字病理学 | 骨癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及GSE152048、GSE14359和GSE49003数据集中的样本 |
327 | 2024-09-27 |
Single-cell transcriptomic landscape reveals the role of intermediate monocytes in aneurysmal subarachnoid hemorrhage
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1401573
PMID:39318997
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了动脉瘤性蛛网膜下腔出血后的单核细胞,揭示了中间单核细胞在神经炎症中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了动脉瘤性蛛网膜下腔出血后中间单核细胞在神经炎症中的关键作用 | 研究样本量较小,仅包括两名男性患者,可能影响结果的普遍性 | 探讨动脉瘤性蛛网膜下腔出血后神经炎症的机制 | 单核细胞及其亚群在动脉瘤性蛛网膜下腔出血后的表达和功能 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共17,242个细胞,包括7,224个脑脊液细胞和10,018个外周血细胞 |
328 | 2024-09-26 |
Multi-omics Analysis Identifies Hypoxia Subtypes and S100A2 as an Immunosuppressive Factor in Cervical Cancer
2024-01, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-023-01304-x
PMID:37648942
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研究论文 | 本研究通过多组学分析,在宫颈癌样本中识别出三种缺氧亚型,并发现S100A2作为免疫抑制因子 | 首次在宫颈癌中研究缺氧景观,并识别出S100A2作为缺氧诱导的免疫抑制因子 | NA | 研究宫颈癌中的缺氧亚型及其对免疫治疗反应的影响 | 宫颈癌样本及其缺氧相关基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自The Cancer Genome Atlas数据集的宫颈癌样本 |
329 | 2024-09-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals that MYBL2 in malignant epithelial cells is involved in the development and progression of ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1438198
PMID:39136009
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术揭示了恶性上皮细胞中的MYBL2在卵巢癌发展和进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面研究了卵巢癌患者的细胞组成,并识别了关键的亚群和影响卵巢癌进展的转录因子 | 研究样本仅限于六名卵巢癌伴网膜转移的患者,可能影响结果的普适性 | 深入理解恶性上皮细胞在卵巢癌中的作用,并探讨卵巢癌免疫微环境和免疫耗竭的影响 | 卵巢癌患者的恶性上皮细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 六名卵巢癌伴网膜转移的患者 |
330 | 2024-09-26 |
γδ T-cells in human malignancies: insights from single-cell studies and analytical considerations
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1438962
PMID:39281674
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综述 | 本文综述了单细胞研究在不同恶性肿瘤中对γδ T细胞的生物学特性和调控机制的见解 | 介绍了高分辨率单细胞测序技术在γδ T细胞研究中的应用 | γδ T细胞的低丰度使得其生物学特性仍不明确 | 探讨γδ T细胞在人类恶性肿瘤中的作用及其生物学机制 | γδ T细胞及其在不同恶性肿瘤中的效应子亚群和调控机制 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
331 | 2024-09-26 |
Platinum-based chemotherapy promotes antigen presenting potential in monocytes of patients with high-grade serous ovarian carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1414716
PMID:39315092
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研究论文 | 研究探讨了铂类化疗对高级别浆液性卵巢癌患者单核细胞抗原呈递潜力的影响 | 首次揭示了铂类化疗通过转录上调MHC II类分子在单核细胞中诱导抗原呈递,而非通过表观遗传变化 | 研究仅限于高级别浆液性卵巢癌患者,且样本量未明确 | 揭示肿瘤特异性转录和表观遗传变化,以及化疗如何重编程单核细胞 | 高级别浆液性卵巢癌患者的单核细胞 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
332 | 2024-09-26 |
Causal effects of systemic inflammatory proteins on Guillain-Barre Syndrome: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing analysis, and network pharmacology
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1456663
PMID:39315093
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研究论文 | 本研究通过全基因组孟德尔随机化、单细胞RNA测序分析和网络药理学探讨了系统性炎症蛋白对吉兰-巴雷综合征的因果效应 | 首次通过孟德尔随机化分析确定了四种与吉兰-巴雷综合征因果相关的炎症蛋白,并结合单细胞RNA测序和分子对接技术预测了潜在的治疗靶点 | 研究样本仅限于欧洲血统的参与者,可能限制了结果的普适性 | 探讨系统性炎症蛋白与吉兰-巴雷综合征的因果关系,并寻找潜在的治疗靶点 | 系统性炎症蛋白与吉兰-巴雷综合征的因果关系 | 生物信息学 | 神经疾病 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、分子对接技术 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 8293名欧洲血统的参与者 |
333 | 2024-09-25 |
Gene panel selection for targeted spatial transcriptomics
2024-01-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03174-1
PMID:38273415
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研究论文 | 本文介绍了一种名为gpsFISH的计算方法,用于优化已知细胞类型的基因选择,以实现靶向空间转录组学 | 本文提出的gpsFISH方法通过建模和调整平台效应,优于其他基因选择方法,并能整合细胞类型层次结构和自定义基因偏好 | 现有基因选择方法依赖于scRNA-seq数据,忽略了技术之间的平台效应 | 开发一种新的计算方法,用于优化靶向空间转录组学中的基因选择 | 靶向空间转录组学中的基因选择 | 生物信息学 | NA | 计算建模 | NA | 转录组数据 | NA |
334 | 2024-09-25 |
Transcriptomic profiling of immune cells in murine polymicrobial sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1347453
PMID:38343542
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠多微生物脓毒症中免疫细胞的转录组图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了脓毒症中免疫细胞的转录组特征,并识别了不同细胞类型的激活通路 | NA | 揭示脓毒症中免疫细胞的转录组特征,以增强对脓毒症病理生理学的理解 | 小鼠多微生物脓毒症中的免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本,包括脾脏和腹腔灌洗液 |
335 | 2024-09-25 |
Single cell RNA-Sequencing Reveals Mast Cells Enhance Mononuclear Phagocytes Infiltration in Bladder Cancer Microenvironment
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.99554
PMID:39308672
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研究论文 | 研究膀胱癌微环境中肥大细胞与单核吞噬细胞的相互作用,以揭示潜在的免疫治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了肥大细胞在膀胱癌微环境中增强单核吞噬细胞浸润的作用 | 样本量较小,仅涉及12名膀胱癌患者 | 揭示膀胱癌微环境中肥大细胞与单核吞噬细胞的相互作用 | 肥大细胞和单核吞噬细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12名膀胱癌患者 |
336 | 2024-09-25 |
Pan-cancer analysis of the role of α2C-adrenergic receptor (ADRA2C) in human tumors and validation in glioblastoma multiforme models
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.98240
PMID:39308687
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研究论文 | 本文通过RNA测序数据和生物信息学方法,全面分析了α2C-肾上腺素受体(ADRA2C)在多种癌症中的作用,并在胶质母细胞瘤模型中进行了验证 | 首次进行了全面的泛癌分析,揭示了ADRA2C在不同癌症中的表达水平及其与临床阶段、预后和免疫浸润细胞的关系 | 研究主要基于TCGA数据库的数据,缺乏体内实验的长期随访数据 | 探讨ADRA2C在泛癌中的作用及其作为癌症诊断、预后和治疗靶点的潜力 | α2C-肾上腺素受体(ADRA2C)在多种癌症中的表达及其生物学功能 | 数字病理学 | 脑癌 | RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及33种癌症类型,包括乳腺癌、食管腺癌、肾癌和肺癌等 |
337 | 2024-09-24 |
A Novel Tumor-Associated Neutrophil-Related Risk Signature Based on Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Analyses Predicts the Prognosis and Immune Landscape of Breast Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.100338
PMID:39308692
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞和批量RNA测序分析的新型肿瘤相关中性粒细胞相关风险特征,用于预测乳腺癌的预后和免疫景观 | 首次基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据开发了肿瘤相关中性粒细胞相关风险特征,并验证了其在多个队列中的预后预测能力 | NA | 开发一种新型肿瘤相关中性粒细胞相关风险特征,用于预测乳腺癌的预后和免疫景观 | 乳腺癌患者的预后和免疫景观 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | Cox回归和LASSO回归 | RNA | 多个队列的乳腺癌患者样本 |
338 | 2024-09-25 |
Comprehensive analysis of macrophage-associated inflammatory genes in AMI based on bulk combined with single-cell sequencing data
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17981
PMID:39308815
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研究论文 | 本研究通过结合bulk和单细胞测序数据,全面分析了AMI中与巨噬细胞相关的炎症基因 | 本研究首次结合bulk和单细胞测序数据,系统分析了AMI中巨噬细胞相关的炎症基因,并筛选出关键基因Saa3、Ms4a4c、Acp5和Fcgr4 | 本研究主要基于现有数据库和动物实验,尚未在人体样本中验证这些基因的表达和功能 | 探讨AMI后巨噬细胞在炎症反应中的作用,并筛选潜在的生物标志物 | AMI后巨噬细胞相关的炎症基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、bulk RNA-seq、qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 包括GSE163465、GSE236374、GSE183272和GSE114695数据集,以及AMI小鼠心肌组织 |
339 | 2024-09-25 |
MCT1-mediated endothelial cell lactate shuttle as a target for promoting axon regeneration after spinal cord injury
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.96374
PMID:39310103
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研究论文 | 研究探讨了脊髓损伤后内皮细胞乳酸穿梭对轴突再生的促进作用 | 首次揭示了脊髓损伤后内皮细胞乳酸穿梭与神经功能恢复之间的关联 | 研究仅在脊髓损伤小鼠模型中进行,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨脊髓损伤后内皮细胞乳酸穿梭对神经组织重塑和功能恢复的影响 | 脊髓损伤后的内皮细胞和神经元 | NA | 脊髓损伤 | 代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 脊髓损伤小鼠 |
340 | 2024-09-25 |
Conditional ablation of DIS3L2 ribonuclease in pre-meiotic germ cells causes defective spermatogenesis and infertility in male mice
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.98620
PMID:39310107
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研究论文 | 研究了DIS3L2核糖核酸酶在雄性小鼠生殖细胞发育中的作用,发现其在精子发生和雄性生育中的关键作用 | 首次揭示了DIS3L2在雄性生殖细胞发育中的作用,特别是其在精子发生和生育中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证DIS3L2的作用 | 探讨DIS3L2在雄性小鼠生殖细胞发育中的生物学功能及其对精子发生和生育的影响 | 雄性小鼠的生殖细胞和精子发生过程 | NA | NA | RNA-seq | NA | RNA | 小鼠模型 |