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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-12-18 |
Fibroblast growth factor receptor risk signature predicts patient prognosis and immunotherapy resistance in colorectal cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1493673
PMID:39676867
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研究论文 | 本文研究了成纤维细胞生长因子受体（FGFR）风险特征在结直肠癌（CRC）患者预后和免疫治疗抵抗中的作用 | 首次揭示了FGFR风险特征在CRC患者中的预后预测能力和对免疫治疗的抵抗作用，并发现PHA-793887可能作为潜在的FGFR风险特征抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人体临床试验中验证 | 探讨FGFR风险特征在结直肠癌患者预后和免疫治疗抵抗中的作用 | 结直肠癌患者的FGFR风险特征及其对预后和免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、机器学习技术、基因集富集分析（GSEA）、京都基因与基因组百科全书（KEGG）、流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 包括CRC患者的单细胞和bulk RNA测序数据，以及MC38小鼠肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 322 | 2024-12-18 |
Direct and indirect RANK and CD40 signaling regulate the maintenance of thymic epithelial cell frequency and properties in the adult thymus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1500908
PMID:39676866
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研究论文 | 研究探讨了RANK和CD40信号在成年胸腺中对胸腺上皮细胞（TECs）维持的作用 | 首次揭示了RANK和CD40信号在成年胸腺中对胸腺上皮细胞的直接和间接作用，并阐明了其对TEC祖细胞和皮质TEC基因表达的间接影响 | 研究主要集中在体外实验和单细胞RNA测序分析，缺乏体内实验验证 | 探讨RANK和CD40信号在成年胸腺中对胸腺上皮细胞维持的分子机制 | 胸腺髓质上皮细胞（mTECs）及其祖细胞 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2024-12-18 |
Single-cell RNA-seq reveals FGF12 as a prognostic biomarker in low-grade endometrial stromal sarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1513076
PMID:39676856
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了FGF12作为低级别子宫内膜间质肉瘤的预后生物标志物 | 首次通过单细胞转录组分析识别出与低级别子宫内膜间质肉瘤预后相关的肿瘤细胞亚群，并发现FGF12基因的高表达与患者生存期缩短显著相关 | 研究样本量较小，可能影响结果的普适性 | 识别低级别子宫内膜间质肉瘤的预后生物标志物，以改善患者分层和指导治疗策略 | 低级别子宫内膜间质肉瘤的肿瘤微环境及预后相关基因 | 数字病理学 | 子宫内膜间质肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2024-12-18 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Based on EcoTyper Machine Learning Framework Identifies Cell-State-Specific M2 Macrophage Markers Associated with Gastric Cancer Prognosis
2024, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S490075
PMID:39678138
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，利用EcoTyper机器学习框架，识别与胃癌预后相关的细胞状态特异性M2巨噬细胞标记物 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，利用EcoTyper框架识别与胃癌预后相关的M2巨噬细胞标记物，揭示了肿瘤生态系统的异质性 | NA | 识别与胃癌预后相关的细胞状态特异性M2巨噬细胞标记物，揭示肿瘤微环境中的细胞状态变化 | 胃癌患者的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其细胞状态 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和bulk RNA测序 | 机器学习框架（EcoTyper） | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 325 | 2024-12-18 |
Building a FAIR data ecosystem for incorporating single-cell transcriptomics data into agricultural genome to phenome research
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1460351
PMID:39678381
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研究论文 | 本文探讨了如何构建一个FAIR数据生态系统，将单细胞转录组学数据整合到农业基因组到表型研究中 | 本文利用人类基因组学基础设施的最新进展，开发了连接不同资源的数据工具，并扩展了功能以实现数据在不同平台间的传输和分析 | 本文仅描述了一个试点项目，未来需要进一步构建更完善的数据资源和分析生态系统 | 构建一个基于FAIR原则的科学家友好的数据资源和分析生态系统，以促进单细胞水平的基因组分析 | 单细胞转录组学数据在农业基因组到表型研究中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 包括植物、原生生物和动物（包括人类）的高通量测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 326 | 2024-12-18 |
Spatial transcriptomics and in situ immune cell profiling of the host ectocervical landscape of HIV infected Kenyan sex working women
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483346
PMID:39687623
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和多表位配体绘图技术，研究了HIV感染的肯尼亚性工作者宫颈外组织的免疫细胞图谱 | 首次结合空间转录组学和多表位配体绘图技术，深入分析了慢性HIV感染下宫颈外组织的免疫景观 | 样本仅来自肯尼亚的性工作者，可能限制了研究结果的普适性 | 研究慢性HIV感染对宫颈外组织免疫景观的影响 | HIV感染和未感染的肯尼亚女性性工作者的宫颈外组织 | 数字病理学 | HIV感染 | 空间转录组学，多表位配体绘图 | NA | 组织样本 | HIV阳性组和阴性组的宫颈外组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 327 | 2024-12-17 |
Leveraging single-cell ATAC-seq and RNA-seq to identify disease-critical fetal and adult brain cell types
2024-Jan-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44742-0
PMID:38233398
|
研究论文 | 本文通过整合全基因组关联研究（GWAS）与单细胞染色质可及性（scATAC-seq）和基因表达（scRNA-seq）数据，识别了与疾病相关的重要胎儿和成人脑细胞类型 | 首次将GWAS与scATAC-seq数据整合，识别出更多与疾病相关的重要脑细胞类型 | 研究仅限于28种脑相关疾病/特征，且样本量和细胞类型数量有限 | 通过整合GWAS与单细胞功能数据，优先识别与疾病相关的重要细胞类型 | 胎儿和成人脑细胞类型 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据 | 28种脑相关疾病/特征的GWAS汇总统计数据（平均N=298K），320万scATAC-seq和scRNA-seq数据，83种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-12-16 |
Analyzing scRNA-seq data by CCP-assisted UMAP and tSNE
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311791
PMID:39671349
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研究论文 | 本文研究了如何通过CCP辅助的UMAP和tSNE方法分析scRNA-seq数据，以提高可视化和准确性 | 本文引入了CCP方法作为UMAP和tSNE的初始化工具，显著提高了这两种降维技术的可视化和准确性 | NA | 提高scRNA-seq数据分析的准确性和可视化效果 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 21个公开数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 329 | 2024-12-15 |
Genomic tumor evolution dictates human medulloblastoma progression
2024 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae172
PMID:39659836
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据分析了髓母细胞瘤的肿瘤进化过程，揭示了不同分子亚组的肿瘤细胞相互作用及其与拷贝数变异的关系 | 首次通过单细胞测序数据揭示了髓母细胞瘤的肿瘤进化轨迹，并识别了早期和晚期标记物，特别是SOX4的上调作为Group 3和Group 4髓母细胞瘤的潜在治疗靶点 | 研究样本量较小，且仅限于14名患者，可能无法全面代表所有髓母细胞瘤患者的情况 | 揭示髓母细胞瘤的肿瘤进化机制，特别是Group 3和Group 4亚组的肿瘤进展 | 髓母细胞瘤的肿瘤细胞及其分子亚组 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 14名髓母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 330 | 2024-12-15 |
Expression of programmed death receptor-1 ligand (PD-L1) in human cancer is of prognostic value and associated with macrophage infiltration
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.99781
PMID:39668828
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析评估了PD-L1在人类癌症中的预后价值及其与巨噬细胞浸润的关系 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析发现PD-L1在肿瘤相关巨噬细胞上的表达与某些癌症的免疫治疗反应相关 | 研究依赖于现有数据库的数据，可能存在数据偏差和局限性 | 评估PD-L1在人类癌症中的预后价值及其与巨噬细胞浸润的关系 | PD-L1在不同癌症中的表达及其与患者总体生存率和巨噬细胞浸润的关系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 331 | 2024-12-15 |
Senescence Reprogramming by MTHFD2 Deficiency Facilitates Tumor Progression
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.99168
PMID:39668825
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研究论文 | 研究探讨了年龄对癌症预后的影响，并开发了一个基于基因的衰老相关预后模型 | 首次揭示了MTHFD2在癌症衰老中的关键作用，其缺失通过诱导细胞衰老和促进衰老相关分泌表型（SASP）促进肿瘤生长 | 研究主要基于基因表达和单细胞RNA测序数据，可能缺乏对其他潜在因素的全面考虑 | 探讨年龄对癌症预后的影响，并开发衰老相关预后模型 | 老年和年轻癌症患者的肿瘤样本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 收集了老年和年轻癌症患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 332 | 2024-12-15 |
Evaluating the prognostic potential of telomerase signature in breast cancer through advanced machine learning model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1462953
PMID:39669558
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研究论文 | 本文通过先进的机器学习模型评估端粒酶特征在乳腺癌中的预后潜力 | 开发了一种基于机器学习的端粒酶特征（MLTS），并展示了其在乳腺癌预后中的优越预测性能 | 未来研究需要进一步整合MLTS与其他分子特征以增强其临床应用 | 评估端粒酶特征在乳腺癌中的预后潜力 | 乳腺癌患者的生存预后 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法 | 机器学习模型 | 多组学数据 | 九个独立的乳腺癌数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 333 | 2024-12-15 |
The effector function of mucosal associated invariant T cells alters with aging and is regulated by RORγt
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1504806
PMID:39669566
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研究论文 | 本研究探讨了黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）在衰老过程中的转录组和功能变化，并揭示了RORγt在调节这些变化中的作用 | 首次揭示了衰老过程中MAIT细胞从MAIT17到MAIT1的功能转变，并发现RORγt在调节这一转变中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类肠道MAIT细胞，可能无法完全反映其他组织或物种中的情况 | 探讨衰老对MAIT细胞功能的影响及其潜在的分子机制 | 肠道中的MAIT细胞及其在衰老过程中的转录组和功能变化 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和人类肠道MAIT细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 334 | 2024-12-15 |
Integrated immunogenomic analyses of high-grade serous ovarian cancer reveal vulnerability to combination immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1489235
PMID:39669575
|
研究论文 | 本文通过综合免疫基因组分析高级别浆液性卵巢癌，揭示了其对联合免疫治疗的脆弱性 | 开发了一个24基因特征来预测BRCAness，并创建了一个网络应用程序和R包OvRSeq，用于全面表征卵巢癌患者样本并评估对联合免疫治疗的脆弱性 | NA | 研究高级别浆液性卵巢癌对联合免疫治疗的反应，并开发预测工具 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本及其免疫微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序、免疫荧光分析、免疫组化 | 机器学习分类模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个患者队列的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-12-15 |
Integrative multiomics analysis reveals association of gut microbiota and its metabolites with susceptibility to keloids
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1475984
PMID:39669776
|
研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了肠道微生物及其代谢产物与瘢痕疙瘩易感性之间的关联 | 首次通过整合粪便宏基因组、血浆代谢组和组织代谢组等多组学数据，揭示了肠道微生物及其代谢产物在瘢痕疙瘩形成中的作用 | 研究样本量较小，且仅限于特定人群，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨肠道微生物及其代谢产物与瘢痕疙瘩易感性之间的关系 | 瘢痕疙瘩患者和正常瘢痕对照组的肠道微生物、血浆代谢物和组织代谢物 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 宏基因组分析、代谢组学、单细胞测序 | 随机森林模型 | 粪便宏基因组数据、血浆代谢组数据、组织代谢组数据 | 瘢痕疙瘩患者56例，正常瘢痕对照组60例，组织代谢组分析分别为35例和32例，靶向组织代谢组分析分别为41例和36例 | NA | NA | NA | NA |
| 336 | 2024-12-14 |
GPU-accelerated Kendall distance computation for large or sparse data
2024-Jan-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae088
PMID:39658191
|
研究论文 | 本文介绍了一种GPU加速的Kendall距离矩阵计算软件GADES，适用于大规模或稀疏数据的处理 | 提出了GPU加速的Kendall-$ au$距离矩阵计算方法，并解决了数据稀疏性带来的算法挑战 | 未提及具体的局限性 | 开发高效的计算策略，用于高性能的Kendall距离矩阵计算 | 大规模或稀疏的多维数据集，如单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | GPU加速计算 | NA | 数据矩阵 | 未提及具体的样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-12-14 |
Unveiling the role of TGF-β signaling pathway in breast cancer prognosis and immunotherapy
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1488137
PMID:39664194
|
研究论文 | 本研究探讨了TGF-β信号通路在乳腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 开发了一种新的TGF-β通路相关预后签名（TSPRS），并验证了其在乳腺癌预后和免疫治疗中的预测能力 | NA | 研究TGF-β信号通路与乳腺癌临床结果及其对肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响 | 乳腺癌患者的转录组和单细胞测序数据 | NA | 乳腺癌 | 转录组测序，单细胞测序，加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌转录组和单细胞测序数据，涉及54个与TGF-β信号通路相关的基因 | NA | NA | NA | NA |
| 338 | 2024-12-13 |
Computational analysis of the functional impact of MHC-II-expressing triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1497251
PMID:39664386
|
研究论文 | 研究分析了MHC-II表达的三阴性乳腺癌的功能影响 | 揭示了MHC-II表达的肿瘤细胞在调节免疫环境和影响患者生存结果中的功能重要性，并开发了一个包含40个显著基因的预后标志物，通过机器学习模型成功预测了患者的生存结果和免疫浸润程度 | NA | 理解MHC-II表达的肿瘤细胞在肿瘤微环境中的作用 | 三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习模型 | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 339 | 2024-12-14 |
Complement C1q is a key player in tumor-associated macrophage-mediated CD8+ T cell and NK cell dysfunction in malignant pleural effusion
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.100607
PMID:39664577
|
研究论文 | 本研究探讨了补体C1q在肿瘤相关巨噬细胞介导的CD8+ T细胞和NK细胞功能障碍中的作用 | 首次揭示了C1q在M2巨噬细胞极化中的依赖性作用，并证明了C1q缺乏可以恢复CD8 T细胞的耗竭状态，增强CD8 T细胞和NK细胞的免疫活性 | 实验仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 研究C1q在恶性胸腔积液中的作用及其对免疫细胞功能的影响 | 恶性胸腔积液中的巨噬细胞、CD8+ T细胞和NK细胞 | 免疫学 | 癌症 | scRNA-seq、代谢组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、代谢物数据 | 使用C1qa小鼠MPE模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2024-12-13 |
Cellular MSI-H score: a robust predictive biomarker for immunotherapy response and survival in gastrointestinal cancer
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/AIWP6518
PMID:39659917
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞水平的MSI-H评分方法，用于预测免疫治疗反应和胃肠道癌症患者的生存率 | 通过单细胞RNA测序数据，开发了一种新的细胞MSI-H评分方法，相比传统的分子MSI-H评分，能够更准确地预测免疫治疗反应和生存率 | 需要进一步的临床试验来验证该方法在不同癌症类型和患者群体中的适用性 | 开发一种更准确的MSI-H评分方法，以指导胃肠道癌症的免疫治疗决策 | 胃肠道癌症患者的免疫治疗反应和生存率 | 数字病理学 | 胃肠道癌 | 单细胞RNA测序 | 高斯有限混合模型 | 基因表达数据 | 97名接受免疫治疗的胃肠道癌症患者 | NA | NA | NA | NA |