单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-12-15 |
Expression of programmed death receptor-1 ligand (PD-L1) in human cancer is of prognostic value and associated with macrophage infiltration
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.99781
PMID:39668828
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析评估了PD-L1在人类癌症中的预后价值及其与巨噬细胞浸润的关系 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析发现PD-L1在肿瘤相关巨噬细胞上的表达与某些癌症的免疫治疗反应相关 | 研究依赖于现有数据库的数据，可能存在数据偏差和局限性 | 评估PD-L1在人类癌症中的预后价值及其与巨噬细胞浸润的关系 | PD-L1在不同癌症中的表达及其与患者总体生存率和巨噬细胞浸润的关系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 302 | 2024-12-15 |
Senescence Reprogramming by MTHFD2 Deficiency Facilitates Tumor Progression
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.99168
PMID:39668825
|
研究论文 | 研究探讨了年龄对癌症预后的影响，并开发了一个基于基因的衰老相关预后模型 | 首次揭示了MTHFD2在癌症衰老中的关键作用，其缺失通过诱导细胞衰老和促进衰老相关分泌表型（SASP）促进肿瘤生长 | 研究主要基于基因表达和单细胞RNA测序数据，可能缺乏对其他潜在因素的全面考虑 | 探讨年龄对癌症预后的影响，并开发衰老相关预后模型 | 老年和年轻癌症患者的肿瘤样本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 收集了老年和年轻癌症患者的肿瘤样本 |
| 303 | 2024-12-15 |
Evaluating the prognostic potential of telomerase signature in breast cancer through advanced machine learning model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1462953
PMID:39669558
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研究论文 | 本文通过先进的机器学习模型评估端粒酶特征在乳腺癌中的预后潜力 | 开发了一种基于机器学习的端粒酶特征（MLTS），并展示了其在乳腺癌预后中的优越预测性能 | 未来研究需要进一步整合MLTS与其他分子特征以增强其临床应用 | 评估端粒酶特征在乳腺癌中的预后潜力 | 乳腺癌患者的生存预后 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法 | 机器学习模型 | 多组学数据 | 九个独立的乳腺癌数据集 |
| 304 | 2024-12-15 |
The effector function of mucosal associated invariant T cells alters with aging and is regulated by RORγt
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1504806
PMID:39669566
|
研究论文 | 本研究探讨了黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）在衰老过程中的转录组和功能变化，并揭示了RORγt在调节这些变化中的作用 | 首次揭示了衰老过程中MAIT细胞从MAIT17到MAIT1的功能转变，并发现RORγt在调节这一转变中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类肠道MAIT细胞，可能无法完全反映其他组织或物种中的情况 | 探讨衰老对MAIT细胞功能的影响及其潜在的分子机制 | 肠道中的MAIT细胞及其在衰老过程中的转录组和功能变化 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和人类肠道MAIT细胞样本 |
| 305 | 2024-12-15 |
Integrated immunogenomic analyses of high-grade serous ovarian cancer reveal vulnerability to combination immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1489235
PMID:39669575
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研究论文 | 本文通过综合免疫基因组分析高级别浆液性卵巢癌，揭示了其对联合免疫治疗的脆弱性 | 开发了一个24基因特征来预测BRCAness，并创建了一个网络应用程序和R包OvRSeq，用于全面表征卵巢癌患者样本并评估对联合免疫治疗的脆弱性 | NA | 研究高级别浆液性卵巢癌对联合免疫治疗的反应，并开发预测工具 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本及其免疫微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序、免疫荧光分析、免疫组化 | 机器学习分类模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个患者队列的数据 |
| 306 | 2024-12-15 |
Integrative multiomics analysis reveals association of gut microbiota and its metabolites with susceptibility to keloids
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1475984
PMID:39669776
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了肠道微生物及其代谢产物与瘢痕疙瘩易感性之间的关联 | 首次通过整合粪便宏基因组、血浆代谢组和组织代谢组等多组学数据，揭示了肠道微生物及其代谢产物在瘢痕疙瘩形成中的作用 | 研究样本量较小，且仅限于特定人群，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨肠道微生物及其代谢产物与瘢痕疙瘩易感性之间的关系 | 瘢痕疙瘩患者和正常瘢痕对照组的肠道微生物、血浆代谢物和组织代谢物 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 宏基因组分析、代谢组学、单细胞测序 | 随机森林模型 | 粪便宏基因组数据、血浆代谢组数据、组织代谢组数据 | 瘢痕疙瘩患者56例，正常瘢痕对照组60例，组织代谢组分析分别为35例和32例，靶向组织代谢组分析分别为41例和36例 |
| 307 | 2024-12-14 |
GPU-accelerated Kendall distance computation for large or sparse data
2024-Jan-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae088
PMID:39658191
|
研究论文 | 本文介绍了一种GPU加速的Kendall距离矩阵计算软件GADES，适用于大规模或稀疏数据的处理 | 提出了GPU加速的Kendall-$ au$距离矩阵计算方法，并解决了数据稀疏性带来的算法挑战 | 未提及具体的局限性 | 开发高效的计算策略，用于高性能的Kendall距离矩阵计算 | 大规模或稀疏的多维数据集，如单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | GPU加速计算 | NA | 数据矩阵 | 未提及具体的样本数量 |
| 308 | 2024-12-14 |
Unveiling the role of TGF-β signaling pathway in breast cancer prognosis and immunotherapy
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1488137
PMID:39664194
|
研究论文 | 本研究探讨了TGF-β信号通路在乳腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 开发了一种新的TGF-β通路相关预后签名（TSPRS），并验证了其在乳腺癌预后和免疫治疗中的预测能力 | NA | 研究TGF-β信号通路与乳腺癌临床结果及其对肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响 | 乳腺癌患者的转录组和单细胞测序数据 | NA | 乳腺癌 | 转录组测序，单细胞测序，加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌转录组和单细胞测序数据，涉及54个与TGF-β信号通路相关的基因 |
| 309 | 2024-12-13 |
Computational analysis of the functional impact of MHC-II-expressing triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1497251
PMID:39664386
|
研究论文 | 研究分析了MHC-II表达的三阴性乳腺癌的功能影响 | 揭示了MHC-II表达的肿瘤细胞在调节免疫环境和影响患者生存结果中的功能重要性，并开发了一个包含40个显著基因的预后标志物，通过机器学习模型成功预测了患者的生存结果和免疫浸润程度 | NA | 理解MHC-II表达的肿瘤细胞在肿瘤微环境中的作用 | 三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习模型 | RNA-seq数据 | NA |
| 310 | 2024-12-14 |
Complement C1q is a key player in tumor-associated macrophage-mediated CD8+ T cell and NK cell dysfunction in malignant pleural effusion
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.100607
PMID:39664577
|
研究论文 | 本研究探讨了补体C1q在肿瘤相关巨噬细胞介导的CD8+ T细胞和NK细胞功能障碍中的作用 | 首次揭示了C1q在M2巨噬细胞极化中的依赖性作用，并证明了C1q缺乏可以恢复CD8 T细胞的耗竭状态，增强CD8 T细胞和NK细胞的免疫活性 | 实验仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 研究C1q在恶性胸腔积液中的作用及其对免疫细胞功能的影响 | 恶性胸腔积液中的巨噬细胞、CD8+ T细胞和NK细胞 | 免疫学 | 癌症 | scRNA-seq、代谢组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、代谢物数据 | 使用C1qa小鼠MPE模型进行实验 |
| 311 | 2024-12-14 |
Harnessing Nanotechnology for Gout Therapy: Colchicine-Loaded Nanoparticles Regulate Macrophage Polarization and Reduce Inflammation
2024, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0089
PMID:39665079
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研究论文 | 本研究探讨了秋水仙碱对巨噬细胞极化的调控作用，并开发了一种基于纳米载体的秋水仙碱递送系统，以增强痛风炎症的治疗效果 | 首次揭示了秋水仙碱通过关键基因AHNAK调控巨噬细胞极化的机制，并开发了一种基于R4F-NM@F127纳米载体的秋水仙碱递送系统，能够靶向调节巨噬细胞极化，减少对正常组织的毒性 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证其疗效和安全性 | 探讨秋水仙碱对巨噬细胞极化的调控作用，并开发一种新的纳米载体系统以增强痛风的治疗效果 | 痛风小鼠模型中的巨噬细胞极化和炎症反应 | NA | 痛风 | 单细胞RNA测序、分子对接、慢病毒干预、生物化学指标检测 | NA | 单细胞RNA测序数据、生物化学指标数据 | 小鼠模型和外周血单核细胞样本 |
| 312 | 2024-12-13 |
Cellular MSI-H score: a robust predictive biomarker for immunotherapy response and survival in gastrointestinal cancer
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/AIWP6518
PMID:39659917
|
研究论文 | 本文提出了一种基于细胞水平的MSI-H评分方法，用于预测免疫治疗反应和胃肠道癌症患者的生存率 | 通过单细胞RNA测序数据，开发了一种新的细胞MSI-H评分方法，相比传统的分子MSI-H评分，能够更准确地预测免疫治疗反应和生存率 | 需要进一步的临床试验来验证该方法在不同癌症类型和患者群体中的适用性 | 开发一种更准确的MSI-H评分方法，以指导胃肠道癌症的免疫治疗决策 | 胃肠道癌症患者的免疫治疗反应和生存率 | 数字病理学 | 胃肠道癌 | 单细胞RNA测序 | 高斯有限混合模型 | 基因表达数据 | 97名接受免疫治疗的胃肠道癌症患者 |
| 313 | 2024-12-13 |
Effect of subcutaneous adipose tissue-associated CSRP2 on the progression of prostate cancer via the WDR5/USP44 pathway
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/AHQT5920
PMID:39659944
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研究论文 | 研究探讨了皮下脂肪组织相关蛋白CSRP2通过WDR5/USP44途径影响前列腺癌进展的机制 | 首次揭示了CSRP2通过抑制WDR5的去泛素化来抑制前列腺癌细胞增殖的机制 | 研究主要基于细胞实验和动物模型，尚未在人体中验证该机制 | 探讨肥胖相关蛋白CSRP2在前列腺癌进展中的作用及其分子机制 | 前列腺癌细胞及其相关蛋白CSRP2、WDR5和USP44 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、组织芯片、免疫共沉淀、质谱分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas的前列腺癌转录组数据以及来自前列腺癌细胞的单细胞RNA测序和组织芯片数据 |
| 314 | 2024-12-13 |
Multi-modal transcriptomics: integrating machine learning and convolutional neural networks to identify immune biomarkers in atherosclerosis
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1397407
PMID:39660117
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习和卷积神经网络技术，分析多模态转录组数据，以识别与动脉粥样硬化相关的免疫生物标志物 | 本研究首次揭示了与动脉粥样硬化相关的三个关键基因（CD36、S100A10、CSNK1A1），并提出了基于这些基因的两种不同亚型（C2和C1），为临床免疫药物研究提供了新范式 | 本研究主要基于公开的GEO数据集，样本量和数据多样性可能有限，未来需要更大规模和多样化的实验验证 | 建立计算模型，揭示与动脉粥样硬化相关的分子水平标志物 | 动脉粥样硬化相关的免疫生物标志物 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 卷积神经网络（CNN） | 基因表达数据 | 共分析了198个样本（包括104个动脉粥样硬化病变样本和94个对照样本）以及30,498个单细胞 |
| 315 | 2024-12-13 |
A novel molecular classification system based on the molecular feature score identifies patients sensitive to immune therapy and target therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1466069
PMID:39660131
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研究论文 | 本研究基于多维分子特征评分开发了一种新的分子分类系统，用于识别对免疫治疗和靶向治疗敏感的肝细胞癌患者 | 提出了基于多维分子特征评分的分子分类系统，并开发了实用的预测软件，识别了对免疫治疗和靶向治疗敏感的患者群体 | NA | 研究肝细胞癌的多维分子特征评分，并基于此进行分子分类，以指导精准医学 | 肝细胞癌患者的分子特征和分类 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、单核苷酸变异分析、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据 | NA |
| 316 | 2024-12-13 |
Decoding NY-ESO-1 TCR T cells: transcriptomic insights reveal dual mechanisms of tumor targeting in a melanoma murine xenograft model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1507218
PMID:39660132
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研究论文 | 本研究探讨了靶向NY-ESO-1抗原的TCR-T细胞在黑色素瘤小鼠异种移植模型中的功能状态和肿瘤靶向机制 | 首次揭示了NY-ESO-1 TCR-T细胞通过抗原非依赖性NK样和抗原特异性CTL样反应实现双重抗肿瘤效应 | 研究仅在特定的小鼠模型中进行，结果的临床转化仍需进一步验证 | 探讨TCR-T细胞在治疗实体瘤中的作用机制 | 靶向NY-ESO-1抗原的TCR-T细胞及其在黑色素瘤中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | NanoString技术、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | SK-Mel-37异种移植模型中的TCR-T细胞 |
| 317 | 2024-12-12 |
Endothelial Erg Regulates Expression of Pulmonary Lymphatic Junctional and Inflammation Genes in Mouse Lungs Impacting Lymphatic Transport
2024-Jan-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3808970/v1
PMID:38343832
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研究论文 | 研究探讨了ERG转录因子在肺淋巴内皮细胞中的作用，揭示了其对淋巴运输和炎症基因表达的影响 | 首次通过单细胞转录组学和CellChatDB整合分析，揭示了ERG下调对肺淋巴内皮细胞功能和通信途径的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中进行验证 | 探讨ERG在肺淋巴内皮细胞中的作用及其对淋巴运输和炎症的影响 | ERG在肺淋巴内皮细胞中的表达及其对基因表达和淋巴运输的影响 | NA | 肺纤维化 | 单细胞转录组学，流式细胞术，qPCR，FITC-Dextran示踪分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 318 | 2024-12-12 |
Skin treatment with non-thermal plasma modulates the immune system through miR-223-3p and its target genes
2024-01, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2024.2361571
PMID:38828710
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研究论文 | 研究非热等离子体对小鼠耳部皮肤的治疗效果及其通过miR-223-3p及其靶基因调节免疫系统的机制 | 首次通过非编码RNA测序和单细胞血液测序揭示了非热等离子体对miRNA表达的特定影响及其在伤口愈合和组织再生中的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证其效果 | 探讨非热等离子体在皮肤治疗中的分子机制及其对免疫系统的影响 | 小鼠耳部皮肤及血液中的miRNA和靶基因 | NA | NA | 非编码RNA测序，单细胞血液测序 | NA | RNA | 小鼠耳部皮肤样本及血液样本 |
| 319 | 2024-12-12 |
Pan-cancer dissection of vasculogenic mimicry characteristic to provide potential therapeutic targets
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1346719
PMID:38694917
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研究论文 | 本研究基于多组学数据分析了不同癌症类型中血管拟态（VM）的特征，并提供了潜在的治疗靶点和策略 | 首次全面解析了跨癌症类型的血管拟态特征，揭示了其与肿瘤侵袭性、转移潜力、恶性程度和预后的相关性，并发现了与免疫抑制微环境的关系 | 研究主要基于现有数据库数据，缺乏实验验证，且样本量和数据类型可能限制了结果的普适性 | 阐明不同癌症类型中血管拟态的特征及其调控机制，并提供潜在的治疗靶点 | 跨癌症类型的血管拟态特征及其与肿瘤侵袭性、免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 多种癌症 | 多组学数据分析、单细胞转录组数据分析 | NA | 多组学数据、转录组数据、药物反应数据 | 来自The Cancer Genome Atlas的多组学数据和Genomics of Drug Sensitivity in Cancer数据库的转录组及药物反应数据 |
| 320 | 2024-12-12 |
Identification of early Alzheimer's disease subclass and signature genes based on PANoptosis genes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1462003
PMID:39650656
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研究论文 | 本研究基于PANoptosis基因识别阿尔茨海默病（AD）的早期亚类和特征基因 | 本研究首次基于PANoptosis基因识别了AD的两个亚类，并预测了针对早期AD的治疗候选药物 | 本研究的样本量较小，且仅基于GEO数据库的数据进行分析，可能存在数据偏倚 | 识别阿尔茨海默病的不同分子亚型并探索潜在的治疗药物 | 阿尔茨海默病及其相关PANoptosis基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的三个数据集（GSE48350, GSE5281, GSE122063） |