单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1284 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-10-06 |
Multi-omics profiling and experimental verification of tertiary lymphoid structure-related genes: molecular subgroups, immune infiltration, and prognostic implications in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1453220
PMID:39364403
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研究论文 | 研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能，包括分子亚型、免疫浸润和预后意义 | 首次全面研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能，并开发了精确的诺模图以增强其临床应用 | 研究依赖于公开数据，可能存在数据偏差；实验验证仅通过qRT-PCR进行，未涉及其他验证方法 | 探讨三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者及其三级淋巴结构相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于公开数据，具体样本数量未明确提及 |
| 302 | 2024-10-06 |
Immune and inflammatory insights in atherosclerosis: development of a risk prediction model through single-cell and bulk transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1448662
PMID:39364414
|
研究论文 | 本文通过单细胞和批量转录组分析，开发了一种用于预测动脉粥样硬化风险的模型，揭示了免疫和炎症在动脉粥样硬化中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了动脉粥样硬化斑块中免疫细胞的异质性，并开发了一个基于机器学习的风险评分模型 | 需要进一步的临床验证和更大规模的样本以验证模型的普适性和准确性 | 研究动脉粥样硬化中的免疫异质性，并开发一种个性化免疫疗法的风险预测模型 | 动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 303 | 2024-10-05 |
Stimulation of fracture mineralization by salt-inducible kinase inhibitors
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1450611
PMID:39359266
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研究论文 | 研究盐诱导激酶抑制剂对骨折矿化的刺激作用 | 首次测试了盐诱导激酶抑制剂YKL-05-099对骨折愈合的加速作用，并开发了基于水凝胶的siRNA递送系统 | NA | 研究盐诱导激酶抑制剂对骨折愈合的影响 | 骨折愈合过程中的矿化和组织结构 | NA | NA | RT-qPCR, 单细胞RNA测序, μCT成像 | NA | RNA, 图像 | 126只雌性小鼠 |
| 304 | 2024-10-05 |
Recent progress and applications of single-cell sequencing technology in breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1417415
PMID:39359479
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在乳腺癌研究中的最新进展和应用 | 单细胞RNA测序和单细胞DNA测序技术结合多组学技术，显著增强了我们对肿瘤微环境中细胞多样性的理解 | NA | 探讨单细胞测序技术在乳腺癌研究中的潜力，特别是其在解码驱动疾病进展、治疗抵抗和转移的复杂基因组景观中的作用 | 乳腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞DNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 305 | 2024-10-05 |
Food antigens suppress small intestinal tumorigenesis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1373766
PMID:39359724
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研究论文 | 研究食物抗原在小肠肿瘤发生中的抑制作用 | 首次报道食物抗原通过Peyer's patches（PPs）在小肠肿瘤发生中起到抑制作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨食物抗原在小肠肿瘤发生中的作用 | 小肠肿瘤、Peyer's patches（PPs）、食物抗原 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型中的免疫细胞 |
| 306 | 2024-10-05 |
Single-cell RNA sequencing data locate ALDH1A2-mediated retinoic acid synthetic pathway to glomerular parietal epithelial cells
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10167
PMID:39360029
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review | 本文通过挖掘单细胞和单核RNA测序数据库，发现肾小球壁上皮细胞中存在完整的视黄酸合成途径 | 首次在肾小球壁上皮细胞中发现ALDH1A2介导的视黄酸合成途径，并探讨了其在肾脏生理和病理中的潜在作用 | 需要进一步的实验验证和临床研究来证实ALDH1A2在肾脏中的具体作用 | 探讨ALDH1A2在肾脏生理和病理中的作用 | 肾小球壁上皮细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括小鼠和人类肾脏的单细胞和单核RNA测序数据 |
| 307 | 2024-10-05 |
Discovery of GJC1 as a prognostic biomarker in glioma cells: insights into its cell-cycle relationship and differential expression in non-neuronal cells
2024, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2024.1440409
PMID:39360264
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研究论文 | 本研究探讨了GJC1作为胶质瘤细胞中的预后生物标志物的潜力及其与细胞周期的关系 | 发现GJC1在胶质瘤中具有独立的预后价值，并揭示了其在非神经细胞中的差异表达 | 研究主要基于回顾性分析，未来需要进一步的实验验证 | 研究GJC1在胶质瘤中的预后价值及其与细胞周期的关系 | 胶质瘤细胞及其与GJC1表达的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库的数据 |
| 308 | 2024-10-04 |
APP-CD74 axis mediates endothelial cell-macrophage communication to promote kidney injury and fibrosis
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1437113
PMID:39351084
|
研究论文 | 研究揭示了APP-CD74轴在肾损伤和纤维化过程中介导内皮细胞与巨噬细胞之间的通信机制 | 首次揭示了APP-CD74轴在肾损伤修复过程中内皮细胞与巨噬细胞之间的重要通信作用 | 研究主要基于体外细胞共培养和小鼠模型，需要进一步的临床验证 | 探讨肾损伤修复过程中内皮细胞与巨噬细胞之间的复杂动态和多样性 | 肾损伤和纤维化过程中的内皮细胞与巨噬细胞 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、Western blot分析、流式细胞术、免疫组化、免疫荧光染色 | NA | RNA | 使用了单侧输尿管梗阻（UUO）模型和肾缺血再灌注损伤（IRI）模型的数据，以及体外细胞共培养系统 |
| 309 | 2024-10-04 |
Integrated analyses reveal IDO1 as a prognostic biomarker coexpressed with PD-1 on tumor-associated macrophages in esophageal squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1466779
PMID:39351094
|
研究论文 | 研究探讨了IDO1在食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境中的表达模式及其对患者预后和治疗反应的影响 | 首次揭示了IDO1与PD-1在肿瘤相关巨噬细胞中的共表达，并探讨了其对化疗药物敏感性和免疫检查点阻断抵抗性的影响 | 研究样本量较小，且仅基于TCGA数据库和临床中心的数据，可能存在数据偏倚 | 研究IDO1在食管鳞状细胞癌中的表达及其对患者预后和治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境中的IDO1表达 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序、数字免疫组化、多重免疫荧光 | NA | RNA序列数据、图像 | 95名食管鳞状细胞癌患者 |
| 310 | 2024-10-04 |
Identification and validation of ferroptosis-related biomarkers in intervertebral disc degeneration
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1416345
PMID:39351146
|
研究论文 | 本研究通过分析公共数据集和FerrDb数据库，鉴定并验证了与椎间盘退变相关的铁死亡相关生物标志物 | 本研究首次系统地鉴定了与椎间盘退变相关的铁死亡相关基因，并验证了其在疾病进展中的表达模式和潜在的免疫调节功能 | 本研究的样本量较小，且仅限于特定的公共数据集和数据库，未来需要更大规模和多样化的样本进行验证 | 揭示椎间盘退变中铁死亡的关键基因及其分子机制，为疾病的诊断和治疗提供新的靶点 | 椎间盘退变中的铁死亡相关基因及其在疾病进展中的表达和功能 | 生物信息学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床样本和鼠模型 |
| 311 | 2024-10-04 |
Differential modulation of mutant CALR and JAK2 V617F-driven oncogenesis by HLA genotype in myeloproliferative neoplasms
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427810
PMID:39351227
|
研究论文 | 研究HLA基因型对CALR突变和JAK2 V617F驱动的骨髓增殖性肿瘤（MPN）中癌症发生的影响 | 首次探讨了HLA基因型在CALR突变和JAK2 V617F驱动的MPN中的潜在作用，并发现HLA基因型对这两种突变驱动的癌症发生有不同的限制作用 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定类型的MPN患者 | 探讨HLA基因型在CALR突变和JAK2 V617F驱动的MPN中的潜在作用 | CALR突变和JAK2 V617F驱动的MPN患者 | NA | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因型数据 | 42名CALR突变阳性患者，158名JAK2 V617F阳性患者，1083名健康对照 |
| 312 | 2024-10-04 |
From single-cell to spatial transcriptomics: decoding the glioma stem cell niche and its clinical implications
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1475235
PMID:39355251
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，解析了胶质瘤干细胞微环境及其临床意义 | 首次全面描述了胶质瘤干细胞及其与髓源抑制细胞的相互作用，并开发了一种新的预后标志物GSCS | NA | 识别和表征胶质瘤干细胞，分析其与其他细胞类型的相互作用，并开发预后标志物 | 胶质瘤干细胞及其微环境中的细胞类型 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、基因调控网络分析、CellChat分析 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 44个原发性胶质瘤样本 |
| 313 | 2024-10-04 |
Machine learning-based identification of an immunotherapy-related signature to enhance outcomes and immunotherapy responses in melanoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1451103
PMID:39355255
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的免疫治疗相关基因模型（ITRGM）签名，用于预测黑色素瘤患者的免疫治疗反应和预后 | 本文通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和多种机器学习算法，识别出66个共识免疫治疗预后基因（CITPGs），并构建了ITRGM签名，该签名在多个黑色素瘤队列中表现优于已发表的37个签名 | NA | 开发一种稳定的、强健的预测模型，用于将黑色素瘤患者分为'免疫热'和'免疫冷'肿瘤，以增强免疫治疗的效果和预后 | 黑色素瘤患者的免疫治疗反应和预后 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、共识聚类、机器学习算法 | 机器学习模型 | RNA测序数据、病理切片 | 包括两个黑色素瘤队列、三个额外黑色素瘤队列、TCGA-SKCM队列以及八个其他癌症队列 |
| 314 | 2024-10-04 |
Analyses of single-cell and bulk RNA sequencing combined with machine learning reveal the expression patterns of disrupted mitophagy in schizophrenia
2024, Frontiers in psychiatry
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fpsyt.2024.1429437
PMID:39355378
|
研究论文 | 研究通过单细胞和批量RNA测序结合机器学习，揭示了精神分裂症中受损线粒体自噬的表达模式 | 发现了与精神分裂症发病相关的线粒体自噬特征基因，并构建了诊断模型 | NA | 探讨线粒体自噬与精神分裂症之间的关系，并开发新的诊断和治疗方法 | 精神分裂症患者的外周血和脑类器官的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 精神分裂症 | RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 精神分裂症患者和健康对照的外周血和脑类器官样本 |
| 315 | 2024-10-02 |
Macrophages Promote Atherosclerosis Development by Inhibiting CD8T Cell Apoptosis
2024, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2024/1929766
PMID:39345351
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞通过抑制CD8T细胞凋亡促进动脉粥样硬化发展的机制 | 首次揭示了巨噬细胞通过C1q-C1qbp轴抑制CD8T细胞凋亡，从而促进动脉粥样硬化发展的机制 | 研究主要基于小鼠模型，需进一步在人体中验证 | 探讨巨噬细胞与CD8T细胞相互作用在动脉粥样硬化发展中的作用 | 巨噬细胞和CD8T细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | scRNA-seq, qPCR, 流式细胞术, ChIP-qPCR, 蛋白质印迹, 抗体阻断实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 小鼠模型 |
| 316 | 2024-10-02 |
HPV-driven heterogeneity in cervical cancer: study on the role of epithelial cells and myofibroblasts in the tumor progression based on single-cell RNA sequencing analysis
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18158
PMID:39346086
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了人乳头瘤病毒（HPV）感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响，特别是上皮细胞和肌成纤维细胞在肿瘤进展中的作用 | 首次系统分析了HPV阳性及阴性宫颈癌样本中单细胞RNA测序数据，揭示了HPV感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响及其分子机制 | 研究样本仅来自Gene Expression Omnibus数据库，可能存在数据偏差；未涉及临床验证 | 探索HPV感染对宫颈癌肿瘤微环境的影响，为优化宫颈癌的预防筛查和个性化治疗提供新的分子基础 | HPV阳性及阴性宫颈癌样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12,431个细胞 |
| 317 | 2024-10-02 |
DSP-0509, a TLR7 agonist, exerted synergistic anti-tumor immunity combined with various immune therapies through modulating diverse immune cells in cancer microenvironment
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1410373
PMID:39346737
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研究论文 | 研究了TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用 | 首次合成了可系统注射的TLR7激动剂DSP-0509，并研究了其与IDO1抑制剂、抗PD-1抗体和AXL抑制剂联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证其疗效 | 探讨TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用，以增强抗肿瘤免疫效果 | TLR7激动剂DSP-0509、IDO1抑制剂、抗PD-1抗体、AXL抑制剂以及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠肿瘤模型 |
| 318 | 2024-10-02 |
Transcriptional bursting dynamics in gene expression
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1451461
PMID:39346775
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综述 | 本文综述了基因表达中的转录爆发动力学机制，并比较了不同基因表达模型的优缺点 | 提供了关于转录爆发的关键指标的详细总结，并探讨了跨物种的转录爆发时间动态及其分子机制 | 缺乏一个全面的定量模型来研究转录爆发 | 指导研究人员选择最适合其研究背景的基因表达模型，并深入理解细胞过程、细胞命运决定和癌症诊断 | 基因表达模型、转录爆发动力学、细胞表型多样性 | NA | NA | 单细胞测序、多组学整合 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 319 | 2024-10-02 |
Unraveling the role of ADAMs in clinical heterogeneity and the immune microenvironment of hepatocellular carcinoma: insights from single-cell, spatial transcriptomics, and bulk RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1461424
PMID:39346916
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研究论文 | 本研究探讨了ADAM基因家族在肝细胞癌临床异质性和免疫微环境中的作用，通过单细胞、空间转录组学和批量RNA测序技术揭示了ADAM家族基因的分子特征及其对HCC发展和预后的影响 | 首次报道了ADAM家族信号在肝细胞癌肿瘤微环境中的有害影响和预后意义 | NA | 探讨ADAM基因家族在肝细胞癌中的作用及其对临床预后的影响 | 肝细胞癌中的ADAM基因家族及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、空间转录组学、批量RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA |
| 320 | 2024-09-30 |
Deep learning-based multimodal spatial transcriptomics analysis for cancer
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.08.001
PMID:39271260
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研究论文 | 本文探讨了深度学习与多模态空间转录组学在癌症研究中的整合应用 | 本文创新性地将深度学习与多模态空间转录组学结合，用于癌症诊断、治疗规划和精准医学 | NA | 本文旨在探讨深度学习与多模态空间转录组学在癌症研究中的应用 | 本文研究对象为癌症诊断、治疗规划和精准医学 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 卷积神经网络 | 多模态数据 | NA |