单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1284 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-10-10 |
From womb to wellness: early environmental exposures, cord blood DNA methylation and disease origins
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2390823
PMID:39263926
|
研究论文 | 本文探讨了早期环境暴露对脐带血DNA甲基化的影响及其与疾病起源的关系 | 本文介绍了单细胞测序等新兴技术在克服现有甲基化阵列覆盖范围有限和细胞组成变异性等技术挑战方面的潜力 | 本文指出了组织特异性问题、当前甲基化阵列覆盖范围有限以及细胞组成变异性等技术挑战 | 本文旨在研究早期环境暴露对脐带血DNA甲基化的影响及其与健康轨迹的关系 | 本文研究对象包括脐带血DNA甲基化、母体因素（如营养、吸烟和毒素暴露）及其对健康的影响 | 数字病理学 | NA | DNA甲基化测序 | NA | DNA | NA |
| 282 | 2024-10-10 |
A Strategy to Compare Single-Cell RNA Sequencing Data Sets Provides Phenotypic Insight into Cellular Heterogeneity Underlying Biological Similarities and Differences Between Samples
2024, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322241280866
PMID:39376245
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scCompare的计算管道，用于比较单细胞RNA测序数据集，以评估样本间的生物相似性和差异 | scCompare通过相关性映射将已知数据集的表型身份转移到另一个数据集，并使用统计学方法确定表型包容性的下限，有助于检测潜在的新细胞类型 | NA | 开发一种方法来评估单细胞RNA测序数据集之间的生物相似性和差异 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自人类外周血单核细胞和心肌细胞的数据集 |
| 283 | 2024-10-10 |
Integrated multi-omics profiling reveals the ZZZ3/CD70 axis is a super-enhancer-driven regulator of diffuse large B-cell lymphoma cell-natural killer cell interactions
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10155
PMID:39376717
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研究论文 | 研究探讨了超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞相互作用的机制 | 首次揭示了ZZZ3/CD70轴通过超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与自然杀伤细胞相互作用 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证 | 探究超级增强子调控弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞相互作用的机制 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞与肿瘤浸润免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、H3K27ac ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 来自Heidelberg Open Research Data数据库和Gene Expression Omnibus数据库的数据 |
| 284 | 2024-10-10 |
Unveiling the role of IGF1R in autism spectrum disorder: a multi-omics approach to decipher common pathogenic mechanisms in the IGF signaling pathway
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1483574
PMID:39376742
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研究论文 | 本研究利用多组学方法探讨了胰岛素样生长因子（IGF）信号通路在自闭症谱系障碍（ASD）中的致病机制，特别是IGF1R的作用 | 首次通过多组学方法揭示了IGF1R在ASD中的关键作用，并发现了其在PV中间神经元发育中的影响 | 研究样本主要来自中国汉族人群和SFARI SPARK数据库，可能存在样本偏倚 | 探讨IGF信号通路在自闭症谱系障碍中的致病机制 | 自闭症谱系障碍患者及其相关基因和信号通路 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 全外显子测序（WES）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析、基因调控网络（GRN）分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 中国汉族ASD患者群体及SFARI SPARK数据库中的ASD患者 |
| 285 | 2024-10-10 |
Single-Cell Sequencing Combined with Transcriptome Sequencing to Explore the Molecular Mechanisms Related to Psoriasis
2024, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S484034
PMID:39376789
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和转录组测序，探索银屑病相关的分子机制 | 揭示了银屑病潜在的治疗药物和发病机制，为后续机制研究提供了新思路 | NA | 进一步探索银屑病的发病分子机制 | 银屑病的基因表达谱和差异表达基因 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞测序、转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及GSE151177、GSE41664、GSE30999三个数据集的基因表达谱 |
| 286 | 2024-10-10 |
Leveraging single-cell transcriptomic data to uncover immune suppressive cancer cell subsets in triple-negative canine breast cancers
2024, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2024.1434617
PMID:39376916
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，识别和表征了三阴性犬乳腺癌中的免疫抑制性癌细胞亚群 | 首次利用整合的单细胞RNA测序数据，识别了犬乳腺癌中的免疫调节性亚群，并揭示了其潜在的免疫逃避机制 | 研究仅基于已发表的数据集，未进行新的实验验证 | 识别和表征三阴性犬乳腺癌中的免疫抑制性亚群，并揭示其免疫逃避机制 | 三阴性犬乳腺癌细胞及其免疫抑制性亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 30只狗的六个数据集 |
| 287 | 2024-10-09 |
MerTK-dependent efferocytosis by monocytic-MDSCs mediates resolution of post-lung transplant injury
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576261
PMID:38328174
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研究论文 | 研究探讨了MerTK依赖的单核细胞来源的髓系抑制细胞（M-MDSCs）在肺移植后缺血再灌注损伤（IRI）中的作用 | 首次揭示了MerTK在M-MDSCs中的作用，通过吞噬凋亡细胞促进肺IRI的恢复 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨MerTK在M-MDSCs中的作用，以促进肺移植后IRI的恢复 | 肺移植患者和小鼠模型中的M-MDSCs | 数字病理学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 包括肺移植患者和小鼠模型的多个样本 |
| 288 | 2024-10-09 |
Regulatory T cells in skin mediate immune privilege of the hair follicle stem cell niche
2024-Jan-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adh0152
PMID:38181095
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研究论文 | 研究皮肤中调节性T细胞在维持毛囊干细胞微环境免疫特权中的作用 | 开发了一种新技术，将基因重组限制在皮肤中的调节性T细胞，揭示了皮肤T细胞在毛囊干细胞微环境中的免疫保护作用 | NA | 探讨非淋巴器官中自我耐受的维持机制 | 皮肤中的调节性T细胞和毛囊干细胞 | 免疫学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 289 | 2024-10-09 |
Pain sensitivity genes as therapeutic targets in knee osteoarthritis: A comprehensive analysis
2024 Jan-Dec, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069241289961
PMID:39313491
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研究论文 | 本研究系统分析了疼痛敏感基因在膝骨关节炎中的作用，并探讨了其作为治疗靶点的潜力 | 通过综合分析RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据，识别出关键的疼痛敏感基因，并验证了其在膝骨关节炎中的重要作用 | NA | 探讨疼痛敏感基因在膝骨关节炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 疼痛敏感基因在膝骨关节炎患者中的表达和作用 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq | LASSO, SVM, 随机森林 | RNA-seq数据 | 涉及GSE114007、GSE169077、GSE152805、GSE133449和GSE104782等多个数据集 |
| 290 | 2024-10-09 |
The single-cell transcriptome of mTECs and CD4+ thymocytes under adhesion revealed heterogeneity of mTECs and a network controlled by Aire and lncRNAs
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1376655
PMID:39328409
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研究论文 | 研究了在粘附过程中，自身免疫调节因子（Aire）基因缺陷对胸腺髓质上皮细胞（mTECs）和CD4+胸腺细胞单细胞转录组的影响 | 揭示了mTECs在转录组水平上的异质性，并发现Aire和长链非编码RNAs（lncRNAs）在调控mTECs和胸腺细胞网络中的作用 | NA | 探讨Aire基因缺陷对胸腺髓质上皮细胞和胸腺细胞在粘附过程中的影响 | 胸腺髓质上皮细胞（mTECs）和CD4+胸腺细胞 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 野生型（WT）和Aire缺陷型（Aire-deficient）mTECs与WT单阳性（SP）CD4胸腺细胞共培养的单细胞库 |
| 291 | 2024-10-09 |
The Role of Polycystic Kidney Disease-Like Homologs in Planarian Nervous System Regeneration and Function
2024, Integrative organismal biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/iob/obae035
PMID:39364443
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研究论文 | 研究了多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 首次全面研究了涡虫基因组中所有基因在感觉神经元中的表达和功能，并开发了用于机械感觉刺激的自动化设置 | 对数十种神经元亚型的功能了解仍然有限 | 探讨多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 涡虫的感觉神经元及其在机械刺激和食物检测中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涡虫的无性和雌雄同体品系 |
| 292 | 2024-10-09 |
Altered immune cell in human severe acute pancreatitis revealed by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1354926
PMID:39372399
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了严重急性胰腺炎患者中免疫细胞的变化 | 首次构建了严重急性胰腺炎患者外周血单细胞图谱，并发现了一种表达高水平PPBP和PF4的新型单核细胞亚群 | 样本量较小，仅包括7名未治疗的严重急性胰腺炎患者 | 研究严重急性胰腺炎中特定免疫细胞亚型的变化及其机制，并识别预测急性胰腺炎严重程度的潜在生物标志物 | 严重急性胰腺炎患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名未治疗的严重急性胰腺炎患者和6名健康对照 |
| 293 | 2024-10-09 |
Prognosis of colorectal cancer, prognostic index of immunogenic cell death associated genes in response to immunotherapy, and potential therapeutic effects of ferroptosis inducers
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458270
PMID:39372411
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研究论文 | 本研究利用生物信息学和医学大数据整合了来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)的数据集，全面概述了免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因在结直肠癌(CRC)中的表达 | 研究揭示了ICD相关基因在CRC中的分子通路和基因网络，并探讨了细胞死亡诱导剂（包括铁死亡诱导剂）的治疗潜力及其在精准医学中的应用 | NA | 阐明ICD在结直肠癌中的分子机制及其在治疗中的潜在应用 | 结直肠癌(CRC)中的免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 差异表达分析、共识聚类、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA的多个结直肠癌样本 |
| 294 | 2024-10-09 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Transcriptional Signatures of Macrophages in Intrahepatic Cholestasis of Pregnancy
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S471374
PMID:39372590
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征 | 首次揭示了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征，并发现了炎症状态的倾向 | NA | 探究妊娠期肝内胆汁淤积症中免疫细胞和免疫基因的调控机制 | 妊娠期肝内胆汁淤积症中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 295 | 2024-10-09 |
Dynamics of alternative polyadenylation in single root cells of Arabidopsis thaliana
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1437118
PMID:39372861
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研究论文 | 研究了拟南芥根细胞中单细胞RNA测序数据中的选择性多聚腺苷酸化（APA）动态 | 开发了一种新的流程来识别和整合来自不同单细胞RNA测序数据的APA位点，并分析单细胞中的APA动态 | NA | 揭示选择性多聚腺苷酸化在拟南芥根细胞发育中的动态变化 | 拟南芥根细胞中的选择性多聚腺苷酸化位点及其动态变化 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过150,000个细胞，涵盖四个主要组织分支、十二种细胞类型和三个发育阶段 |
| 296 | 2024-10-08 |
An IL-4 signalling axis in bone marrow drives pro-tumorigenic myelopoiesis
2024-Jan, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06797-9
PMID:38057662
|
研究论文 | 研究揭示了IL-4信号轴在骨髓中驱动肿瘤促进性髓系生成的作用 | 首次发现IL-4在骨髓中通过调节粒细胞-单核细胞前体细胞的转录程序，促进免疫抑制性肿瘤促进髓系细胞的生成 | 研究主要基于小鼠模型和临床试验的初步结果，需要更多临床数据验证 | 探讨IL-4信号轴在肿瘤免疫抑制中的作用及其潜在治疗策略 | 非小细胞肺癌中的髓系细胞和IL-4信号通路 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和小鼠的非小细胞肺癌样本 |
| 297 | 2024-08-07 |
Pegylated interferon-α for chronic hepatitis B … not ready to be shelved yet! New insights on its role using single-cell transcriptomics
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000560
PMID:37676248
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 298 | 2024-10-06 |
Enhanced mitophagy driven by ADAR1-GLI1 editing supports the self-renewal of cancer stem cells in HCC
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000299
PMID:36683360
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研究论文 | 研究探讨了ADAR1通过编辑GLI1促进肝癌干细胞自我更新的机制 | 首次揭示了ADAR1通过编辑GLI1在肝癌干细胞中调控线粒体自噬的新机制 | NA | 探讨ADAR1编辑在肝癌干细胞生成和维持中的作用机制 | 肝癌干细胞和ADAR1编辑的GLI1 | 癌症研究 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 299 | 2024-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immunoregulatory roles of PegIFN-α in patients with chronic hepatitis B
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000524
PMID:37368993
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了PegIFN-α在慢性乙型肝炎患者中的免疫调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了慢性乙型肝炎患者在接受PegIFN-α治疗前后外周免疫细胞的转录组图谱，并发现了三种特定的细胞亚群及其在治疗前后的变化 | 研究仅限于慢性乙型肝炎患者，且样本量未明确提及，可能影响结果的普适性 | 探讨慢性乙型肝炎患者的免疫细胞特征及PegIFN-α治疗的免疫调节作用 | 慢性乙型肝炎患者的外周免疫细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 300 | 2024-10-06 |
Embryonic development grand challenge: crosslinking advances
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1467261
PMID:39364136
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评论 | 本文讨论了胚胎发育研究的新进展及其跨学科意义 | 本文介绍了基于干细胞的3D方法在胚胎发育研究中的最新进展 | 本文主要讨论了胚胎发育研究的挑战和潜力，未提供具体的研究数据或方法 | 探讨胚胎发育研究的跨学科意义及其在基础生物医学科学中的潜力 | 胚胎发育的生物机制及其在科学、社会和政治领域的复杂性 | NA | NA | 干细胞3D方法 | NA | NA | NA |