单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1284 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-10-17 |
IGFBP7+ subpopulation and IGFBP7 risk score in astrocytoma: insights from scRNA-Seq and bulk RNA-Seq
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1434300
PMID:39403379
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序探讨了星形细胞瘤中IGFBP7+亚群及其风险评分的影响 | 首次揭示了C0 IGFBP7+胶质瘤细胞在星形细胞瘤分化和进展中的重要作用，并开发了基于IGFBP7风险评分的预测模型 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏临床试验验证 | 深入理解星形细胞瘤的细胞组成多样性，探讨影响其预后的多种因素 | 星形细胞瘤中的IGFBP7+亚群及其风险评分 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 预测模型 | RNA序列数据 | 七个不同亚组的星形细胞瘤样本 |
| 262 | 2024-10-17 |
Macrophage Dysfunction in Respiratory Disease
2024, Results and problems in cell differentiation
DOI:10.1007/978-3-031-65944-7_9
PMID:39406908
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研究论文 | 本文探讨了肺泡巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制 | 利用谱系追踪和单细胞RNA测序技术，深入理解了肺泡巨噬细胞在肺部稳态调节中的作用 | 未详细讨论具体的靶向治疗方法 | 研究肺泡巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制，为开发针对性治疗提供理论基础 | 肺泡巨噬细胞及其在呼吸系统疾病中的功能变化 | NA | 呼吸系统疾病 | 谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 263 | 2024-10-16 |
Multi-omics Data Integration Analysis Identified Therapeutic Targets and Potential Reuse Drugs for Osteoporosis
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学数据整合分析，识别了骨质疏松症的治疗靶点和潜在的再利用药物 | 本研究提供了一种新的基于网络的药物再利用框架，并首次识别了针对CD74的骨质疏松症治疗药物 | NA | 促进骨质疏松症治疗药物的发现和开发 | 骨髓间充质干细胞（BM-MSCs）在骨质疏松症和骨关节炎患者中的主要分子及其潜在再利用药物 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | GSE147287数据集中的BM-MSCs样本，GSE35959数据集中的骨质疏松症样本和对照样本，GSE13850数据集中的差异表达基因 |
| 264 | 2024-10-16 |
Hepatocyte-specific Smad4 deficiency inhibits hepatocarcinogenesis by promoting CXCL10/CXCR3-dependent CD8+- T cell-mediated anti-tumor immunity
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.97276
PMID:39346534
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研究论文 | 研究探讨了肝细胞特异性Smad4缺乏对肝细胞癌发生的影响及其机制 | 首次揭示了肝细胞特异性Smad4缺乏通过促进CXCL10/CXCR3依赖的CD8+ T细胞介导的抗肿瘤免疫抑制肝细胞癌的发生 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探讨Smad4在肝细胞中的特异性作用及其对肝细胞癌发生的影响 | 肝细胞特异性Smad4缺乏的小鼠模型及肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及肝细胞癌患者样本 |
| 265 | 2024-10-16 |
A CD8+ T cell related immune score predicts survival and refines the risk assessment in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1408109
PMID:39346926
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研究论文 | 研究开发了一种与CD8+ T细胞相关的免疫风险评分，用于预测急性髓系白血病患者的生存和细化风险评估 | 构建了一个包含15个基因的预测模型CTCG15，该模型在不同平台的数据集中得到了验证，并能独立于已有的预后标志物，提高预后预测的准确性 | NA | 开发一种新的免疫风险评分，以提高急性髓系白血病患者的预后预测和风险分层 | 急性髓系白血病患者及其骨髓中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 涉及六个不同平台的数据集 |
| 266 | 2024-10-16 |
Construction and validation of immune-associated lncRNA model for predicting immune status and therapeutic reactions of triple-negative breast cancer
2024, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/VIXN9362
PMID:39398616
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研究论文 | 构建并验证了一个与免疫相关的lncRNA模型，用于预测三阴性乳腺癌的免疫状态和治疗反应 | 首次构建了一个基于lncRNA的模型，用于区分三阴性乳腺癌的免疫沙漠和免疫炎症亚型，并评估其对肿瘤药物的敏感性 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，缺乏临床试验验证 | 探索与三阴性乳腺癌免疫状态相关的关键lncRNA，并构建预测模型 | 三阴性乳腺癌患者的免疫状态和治疗反应 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、基因集富集分析、非负矩阵分解、加权基因共表达网络分析 | lncRNA模型 | RNA测序数据、临床信息 | 来自TCGA和GEO数据库的三阴性乳腺癌样本 |
| 267 | 2024-10-15 |
Aggressive high-grade NF2 mutant meningiomas downregulate oncogenic YAP signaling via the upregulation of VGLL4 and FAT3/4
2024 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae148
PMID:39380691
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研究论文 | 研究了NF2突变型脑膜瘤中YAP信号通路的调控机制 | 发现了高级别NF2突变型脑膜瘤通过上调VGLL4和FAT3/4来下调YAP信号通路 | 研究仅限于体外细胞实验和RNA测序数据分析 | 探讨不同级别NF2突变型脑膜瘤中YAP信号通路的依赖性 | NF2突变型脑膜瘤 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量人类脑膜瘤样本 |
| 268 | 2024-10-14 |
Hidden syndinian and perkinsid infections in dinoflagellate hosts revealed by single-cell transcriptomics
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae188
PMID:39325969
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示了寄生在甲藻宿主中的隐秘的syndinian和perkinsid感染 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了这些难以直接观察或培养的寄生虫的感染情况，并构建了基于192个基因的系统发育树 | 研究仅限于14个感染宿主细胞，且仅通过光显微镜在收集时识别出5个含有寄生虫的细胞 | 揭示隐秘的单细胞寄生虫的进化历史及其与宿主的关系 | 自由生活的甲藻及其寄生虫 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 14个感染宿主细胞 |
| 269 | 2024-10-13 |
MICA: a multi-omics method to predict gene regulatory networks in early human embryos
2024-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302415
PMID:37879938
|
研究论文 | 本文评估了不同线性和非线性基因调控网络（GRN）预测方法在早期人类胚胎单细胞转录组数据中的应用 | 提出了一种基于互信息（MI）和染色质可及性（CA）的非线性方法MICA，用于预测早期人类胚胎中的基因调控网络 | NA | 比较不同基因调控网络预测方法在早期人类胚胎单细胞数据中的表现 | 早期人类胚胎中的基因调控网络 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 非线性模型 | 转录组数据 | 早期人类胚胎的单细胞样本 |
| 270 | 2024-10-13 |
Revealing the association between East Asian oral microbiome and colorectal cancer through Mendelian randomization and multi-omics analysis
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1452392
PMID:39355266
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化（MR）和多组学分析探讨东亚人口口腔微生物群与结直肠癌（CRC）之间的关联 | 首次通过MR分析和多组学整合揭示口腔微生物群与结直肠癌之间的因果关系，并利用单细胞RNA测序和药物预测分析揭示关键通路和潜在治疗药物 | NA | 探索口腔微生物群与结直肠癌之间的因果关系，并揭示其影响细胞代谢和癌症发展的机制 | 口腔微生物群与结直肠癌的关联 | NA | 结直肠癌 | 孟德尔随机化（MR）、全基因组关联研究（GWAS）、单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据、基因组数据、单细胞RNA数据 | 2017个舌样本和1915个唾液样本，6692个CRC病例和27178个对照组 |
| 271 | 2024-10-13 |
A comprehensive analysis of genes associated with hypoxia and cuproptosis in pulmonary arterial hypertension using machine learning methods and immune infiltration analysis: AHR is a key gene in the cuproptosis process
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1435068
PMID:39391037
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法和免疫浸润分析，全面分析了与低氧和铜死亡相关的基因在肺动脉高压中的作用，并确定AHR是铜死亡过程中的关键基因 | 本研究首次将机器学习方法应用于肺动脉高压中与低氧和铜死亡相关的基因分析，并构建了诊断模型 | 本研究主要基于GEO数据库和genecad的表达谱和单细胞RNA-seq数据，未涵盖所有可能的数据来源 | 探讨肺动脉高压与低氧和铜死亡相关基因之间的关联，并寻找潜在的生物标志物 | 肺动脉高压患者与对照组的基因表达差异，以及免疫细胞浸润情况 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA-seq | LASSO和随机森林 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 272 | 2024-10-13 |
Case report: Tenosynovial giant cell tumor
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1445427
PMID:39391235
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病例报告 | 报告了一例45岁男性患者右髋部疼痛和肿胀的病例，通过全外显子测序和RNA测序确诊为腱鞘巨细胞瘤 | 通过全外显子测序和RNA测序发现CSF1::GAPDHP64融合，并使用单细胞转录组分析揭示了肿瘤细胞与巨噬细胞之间的相互作用 | 病例报告的局限性在于其样本量小，结果可能不适用于所有腱鞘巨细胞瘤患者 | 探讨腱鞘巨细胞瘤的分子诊断和治疗策略 | 腱鞘巨细胞瘤及其分子机制 | NA | 腱鞘巨细胞瘤 | 全外显子测序、RNA测序、单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 1例患者 |
| 273 | 2024-10-13 |
Sphingosine 1-phosphate receptor 2 in keratinocytes plays a key role in reducing inflammation in psoriasis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1469829
PMID:39391307
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研究论文 | 研究探讨了角质形成细胞中的S1PR2受体在银屑病炎症中的作用 | 首次研究了S1PR2在银屑病中的作用，并发现其作为下调因子抑制Th17细胞的招募 | 仅限于IMQ诱导的银屑病样炎症模型，未涉及其他银屑病模型 | 探讨S1PR2在银屑病中的作用及其潜在治疗价值 | S1PR2受体在角质形成细胞中的功能及其对银屑病炎症的影响 | NA | 银屑病 | 空间转录组学、RT-qPCR、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞数据 | S1pr2fl/fl K14-Cre小鼠和野生型小鼠 |
| 274 | 2024-10-13 |
Identification and validation of SHC1 and FGFR1 as novel immune-related oxidative stress biomarkers of non-obstructive azoospermia
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1356959
PMID:39391879
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研究论文 | 本文通过现有数据集识别并验证了SHC1和FGFR1作为非阻塞性无精子症的新型免疫相关氧化应激生物标志物 | 本文首次识别并验证了SHC1和FGFR1作为非阻塞性无精子症的新型免疫相关氧化应激生物标志物，并探讨了其在诊断和预后中的应用 | NA | 识别和验证非阻塞性无精子症的新型生物标志物 | SHC1和FGFR1基因在非阻塞性无精子症中的表达和功能 | 数字病理学 | 男性不育症 | RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 非阻塞性无精子症和阻塞性无精子症患者的睾丸组织样本 |
| 275 | 2024-10-12 |
Identification of a senescence-related transcriptional signature to uncover molecular subtypes and key genes in hepatocellular carcinoma
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311696
PMID:39383169
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据，分析了肝细胞癌患者的基因表达特征，识别出与衰老相关的分子亚型和关键基因 | 本研究开发了一个肝细胞癌特异性的细胞衰老风险模型，并识别出G6PD作为潜在的衰老相关靶点 | 由于肿瘤异质性和缺乏通用的细胞衰老标志物，准确测量不同类型肿瘤中的细胞衰老水平具有挑战性 | 研究肝细胞癌中与衰老相关的分子特征 | 肝细胞癌患者的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 肝细胞癌样本 |
| 276 | 2024-10-12 |
Integrating transcriptomics, eQTL, and Mendelian randomization to dissect monocyte roles in severe COVID-19 and gout flare
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1385316
PMID:39385934
|
研究论文 | 本文通过整合转录组学、eQTL和孟德尔随机化方法，探讨了单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的作用 | 本文首次综合利用单细胞RNA测序、大规模全基因组关联研究和表达数量性状位点数据，分析了单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的分子机制 | 本文主要依赖于现有数据集的分析，缺乏实验验证 | 阐明单核细胞在痛风和COVID-19中的分子基础，以开发更有效的治疗方法 | 单核细胞在严重COVID-19和痛风发作中的功能 | 数字病理学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及严重COVID-19、痛风和正常对照组的单细胞RNA测序数据 |
| 277 | 2024-10-12 |
Batch-effect correction in single-cell RNA sequencing data using JIVE
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae134
PMID:39387061
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研究论文 | 本文提出了一种增强的JIVE方法，用于大规模单细胞RNA测序数据的批次效应校正 | 本文改进了JIVE方法，使其适用于大规模单细胞数据，并引入了新的应用场景 | NA | 解决单细胞RNA测序分析中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | JIVE | 基因表达数据 | 多个单细胞测序数据集 |
| 278 | 2024-10-11 |
Single-cell RNA sequencing unveils unique transcriptomic signatures of endothelial cells and role of ENO1 in response to disturbed flow
2024-Jan-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2318904121
PMID:38261622
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞在不同流体剪切力下的独特转录组特征，并探讨了ENO1在响应扰流中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了扰流和脉动剪切力对内皮细胞转录组的影响，并揭示了ENO1在响应扰流中的关键作用 | 研究主要集中在体外实验，需要进一步的体内实验验证结果 | 探讨不同流体剪切力对内皮细胞转录组的影响及其在动脉粥样硬化中的作用 | 内皮细胞及其在扰流和脉动剪切力下的转录组变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个内皮细胞样本 |
| 279 | 2024-10-11 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Applications in Pituitary Research
2024, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000540352
PMID:39053437
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在垂体研究中的应用，强调了其在揭示垂体细胞异质性和相互作用方面的潜力 | 单细胞RNA测序技术为研究垂体细胞的异质性和相互作用提供了前所未有的手段 | 目前该技术在探索垂体复杂性方面的应用还较少 | 加深对垂体及其在疾病状态下功能障碍的理解 | 垂体细胞及其在生理和病理机制中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 280 | 2024-10-11 |
Machine learning-based discovery of UPP1 as a key oncogene in tumorigenesis and immune escape in gliomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1475206
PMID:39380997
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研究论文 | 本文通过机器学习方法发现UPP1基因在胶质瘤发生和免疫逃逸中的关键作用 | 本文首次将UPP1识别为胶质瘤发生和免疫逃逸的关键驱动基因 | NA | 揭示胶质瘤发生和进展的分子机制，以改进治疗和患者预后 | 胶质瘤样本的单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 | 机器学习 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 大规模胶质瘤样本 |