单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-12-28 |
Migrasome regulator TSPAN4 shapes the suppressive tumor immune microenvironment in pan-cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1419420
PMID:39723210
|
研究论文 | 本文探讨了TSPAN4在多种癌症中的表达及其对肿瘤免疫抑制微环境的影响 | 首次揭示了TSPAN4作为迁移体调节因子在泛癌症中塑造免疫抑制肿瘤微环境的关键作用 | TSPAN4在癌症中的具体机制仍需进一步实验验证 | 研究TSPAN4在癌症中的表达及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 多种癌症类型，特别是胶质瘤 | 癌症研究 | 泛癌症 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | TCGA Pan-Cancer (PANCAN) 和 TCGA TARGET GTEx 数据集 |
| 262 | 2024-12-28 |
Multi-omics in exploring the pathophysiology of diabetic retinopathy
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1500474
PMID:39723239
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）及其他多组学技术在糖尿病视网膜病变（DR）研究中的重要作用 | 通过整合scRNA-seq与转录组学、遗传关联研究及多组学分析，揭示了DR发病机制的新见解，并识别了新的生物标志物、易感基因和潜在治疗靶点 | 尽管多组学技术提供了丰富的数据，但其在DR研究中的应用仍处于早期阶段，需要更多的验证和临床转化研究 | 探索糖尿病视网膜病变的病理生理机制 | 糖尿病视网膜病变（DR） | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多组学分析 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA |
| 263 | 2024-12-26 |
Single-cell profiling uncovers synovial fibroblast subpopulations associated with chondrocyte injury in osteoarthritis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1479909
PMID:39720254
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞损伤之间的相互作用和关联 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞之间的相互作用，并识别了具有修复和保护作用的CILP+成纤维细胞以及可能加剧软骨损伤的POSTN+成纤维细胞 | 研究主要基于单细胞测序数据，缺乏体内实验验证，且样本量未明确说明 | 阐明骨关节炎中滑膜细胞与软骨细胞之间的相互作用和关联，以深化对骨关节炎发病机制的理解 | 骨关节炎患者的滑膜细胞和软骨细胞 | 单细胞测序 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 264 | 2024-12-25 |
Cell and tissue-specific glycosylation pathways informed by single-cell transcriptomics
2024-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559616
PMID:38260527
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了人类组织和细胞类型中的糖基化相关基因表达，揭示了细胞和组织特异性糖基化途径 | 首次在糖科学领域应用单细胞转录组学，揭示了糖基化基因和糖基化途径表达的层次结构，并展示了细胞和组织特异性糖基化模式 | 研究依赖于Tabula Sapiens数据集，可能无法涵盖所有人类组织和细胞类型 | 探讨单细胞水平上糖基化相关基因的表达模式及其在不同组织和细胞类型中的特异性 | 人类组织和细胞类型中的糖基化相关基因和糖基化途径 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | Tabula Sapiens数据集中的人类组织和细胞类型 |
| 265 | 2024-12-25 |
Cell-Specific Targeting of the Endothelium in the Cardiorenal Syndrome
2024, Cardiorenal medicine
IF:2.4Q2
DOI:10.1159/000537764
PMID:38342088
|
研究论文 | 本文探讨了针对心血管肾综合征中内皮细胞的靶向治疗策略 | 本文提出了基于病毒载体的细胞特异性内皮细胞靶向治疗，以避免非靶向效应，改善治疗抵抗，并减少疾病进展的残留风险 | NA | 开发针对心血管肾综合征的新型靶向治疗策略 | 内皮细胞在心血管和肾脏疾病中的作用 | NA | 心血管疾病 | 测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 266 | 2024-12-25 |
Integrative multi-omics analysis reveals a novel subtype of hepatocellular carcinoma with biological and clinical relevance
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517312
PMID:39712016
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了一种新的肝细胞癌亚型，并构建了预测模型 | 本研究通过整合多种组学数据，包括bulk RNA测序、蛋白质组分析、单细胞RNA测序、空间转录组测序和基因组测序，发现了一种新的肝细胞癌亚型XPO1+Epithelial，并构建了肿瘤纯度和肿瘤微环境相关的预后风险模型 | 本研究主要基于实验室数据和公共数据集，样本量和临床验证可能存在局限性 | 本研究的目的是通过多组学分析揭示肝细胞癌的新亚型，并构建预后预测模型 | 本研究的对象是肝细胞癌患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 多组学分析（bulk RNA测序、蛋白质组分析、单细胞RNA测序、空间转录组测序、基因组测序） | NA | 多组学数据（RNA、蛋白质、基因组、单细胞RNA、空间转录组） | 实验室数据和公共数据集中的肝细胞癌样本 |
| 267 | 2024-12-25 |
Exploring the heterogeneity of osteosarcoma cell characteristics and metabolic states and their association with clinical prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1507476
PMID:39712023
|
研究论文 | 本研究探讨了骨肉瘤细胞特征和代谢状态的异质性及其与临床预后的关联 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢途径分析，揭示了骨肉瘤细胞的异质性，并开发了一个包含风险特征的预测模型，为骨肉瘤的靶向治疗和预后评估提供了新的视角 | 本研究的样本量较小，且仅基于公开数据库的数据，可能影响结果的普适性 | 阐明骨肉瘤的分子机制和代谢特征及其与患者预后的关系 | 骨肉瘤细胞的特征和代谢状态及其与临床预后的关联 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 风险特征模型 | 基因表达数据 | 9个样本的单细胞测序数据，多个公共数据库中的骨肉瘤样本和健康对照样本 |
| 268 | 2024-12-25 |
Effects of PGK1 on immunoinfiltration by integrated single-cell and bulk RNA-sequencing analysis in sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1449975
PMID:39712033
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，探讨了磷酸甘油酸激酶1（PGK1）在脓毒症中的免疫浸润作用 | 首次揭示了PGK1在脓毒症中的显著上调及其作为诊断标志物的潜力，并探讨了其在免疫相关通路和细胞类型中的作用 | 研究主要基于现有数据集，缺乏体内实验验证 | 探讨PGK1在脓毒症中的作用及其作为诊断标志物的潜力 | PGK1在脓毒症患者中的表达及其对免疫浸润的影响 | NA | 脓毒症 | RNA测序 | NA | RNA | 多个数据集中的脓毒症患者样本 |
| 269 | 2024-12-25 |
Exploring the impact of deubiquitination on melanoma prognosis through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1509049
PMID:39712483
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索去泛素化对黑色素瘤预后的影响，并构建了一个新的预后模型 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析去泛素化相关基因在黑色素瘤中的作用，并构建了一个有效的预后模型 | 需要进一步的临床验证以确认模型的适用性 | 研究去泛素化在黑色素瘤中的作用，并开发新的预后模型 | 黑色素瘤细胞和患者的预后 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林和岭回归 | RNA测序数据 | 使用了来自TCGA队列和外部验证队列的数据 |
| 270 | 2024-12-25 |
Single-Cell Sequencing Combined with Transcriptome Sequencing to Explore the Molecular Mechanisms Related to Skin Photoaging
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496328
PMID:39713718
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组测序探索皮肤光老化的分子机制 | 发现了三个关键基因（Atp2b1、Plekho2和Tspan13）在光老化过程中的重要作用，并验证了这些基因在免疫细胞浸润和代谢途径中的关键作用 | NA | 揭示皮肤光老化的分子机制 | 光老化患者的基因表达谱和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞测序、转录组测序、RT-qPCR、免疫荧光标记、Western blotting | LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的光老化患者基因表达数据 |
| 271 | 2024-12-25 |
Construction and clinical application of a risk model based on N6-methyladenosine regulators for colorectal cancer
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18719
PMID:39717046
|
研究论文 | 本研究基于N6-甲基腺苷（m6A）调控因子构建了一个结直肠癌（CRC）的风险模型，并探讨了其在临床中的应用 | 首次基于m6A调控因子构建了CRC的风险评分模型，并验证了其在区分高风险和低风险患者中的有效性 | 研究主要基于现有数据集，缺乏大规模的临床验证 | 开发一个基于m6A调控因子的风险模型，用于预测结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者的m6A调控因子表达及其与预后的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归模型 | RNA序列数据 | AC-ICAM和GSE33113数据集中的结直肠癌样本，以及GSE146771单细胞RNA-seq数据集 |
| 272 | 2024-12-25 |
Neuron stress-related genes serve as new biomarkers in hypothalamic tissue following high fat diet
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1443880
PMID:39717104
|
研究论文 | 研究探讨了高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中神经应激相关基因的表达变化及其作为新生物标志物的潜力 | 首次揭示了高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中神经应激相关基因的表达变化，并发现Bmi1基因作为关键基因反映肥胖的病理生理机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床转化和人类应用仍需进一步验证 | 探讨高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中基因表达变化，寻找新的生物标志物 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中的神经应激相关基因 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞测序 RNA-seq 蛋白质印迹 免疫荧光染色 | LASSO模型 | 基因表达数据 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型 |
| 273 | 2024-12-25 |
Vascular Smooth Muscle Cells Transdifferentiate into Chondrocyte-Like Cells and Facilitate Meniscal Fibrocartilage Regeneration
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0555
PMID:39717465
|
研究论文 | 本文研究了血管平滑肌细胞向类软骨细胞的转分化及其在半月板纤维软骨再生中的作用 | 首次发现血管平滑肌细胞可以转分化为纤维软骨细胞，并参与自发性的半月板再生；低强度脉冲超声刺激可以增强这种转分化过程 | 研究主要在动物模型中进行，尚未在人体中验证其有效性和安全性 | 探索有效的半月板纤维软骨再生策略 | 血管平滑肌细胞、半月板纤维软骨、低强度脉冲超声刺激 | NA | NA | 低强度脉冲超声（LIPUS）、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用了平滑肌细胞系追踪转基因小鼠和比格犬的半月板缺损模型 |
| 274 | 2024-12-25 |
Machine Learning and Mendelian Randomization Reveal Molecular Mechanisms and Causal Relationships of Immune-Related Biomarkers in Periodontitis
2024, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9983323
PMID:39717623
|
研究论文 | 本研究利用机器学习和孟德尔随机化方法，揭示了牙周炎中免疫相关生物标志物的分子机制和因果关系 | 本研究整合了机器学习、孟德尔随机化和单细胞测序，提供了一种新颖的方法来增强对牙周炎中免疫动态和基因相互作用的理解 | 研究受限于数据集的人口统计和样本量，可能影响结果的普遍性 | 探讨牙周炎的分子机制并识别关键的免疫相关生物标志物 | 牙周炎中的免疫相关生物标志物及其分子机制 | 机器学习 | 牙周疾病 | 机器学习算法、孟德尔随机化、单细胞测序 | XGBoost | 基因表达数据 | 682个差异表达基因，19个核心基因 |
| 275 | 2024-12-25 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals That C5AR1 in Follicle Monocyte Cells Could Predict the Development of POI
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S490996
PMID:39717665
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了卵泡单核细胞中的C5AR1基因在预测早发性卵巢功能不全（POI）发展中的潜在作用 | 首次揭示了C5AR1基因在卵泡单核细胞中的高表达，并发现其在预测POI发展中的潜在作用 | 样本量较小，仅包括9名接受IVF或ICSI治疗的女性 | 探讨早发性卵巢功能不全（POI）患者的卵泡微环境，并识别潜在的治疗靶点 | 早发性卵巢功能不全（POI）患者的卵泡微环境 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9名接受IVF或ICSI治疗的女性 |
| 276 | 2024-12-25 |
Integration of Microarray Data and Single-Cell Sequencing Analysis to Explore Key Genes Associated with Macrophage Infiltration in Heart Failure
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S475633
PMID:39717663
|
研究论文 | 本文整合了微阵列数据和单细胞测序分析，探索与心力衰竭中巨噬细胞浸润相关的关键基因 | 本文通过整合单细胞和批量RNA测序数据，结合机器学习算法，识别出具有诊断价值的巨噬细胞相关基因，并进行了体内验证 | 本文的局限性在于其依赖于现有的测序数据和机器学习算法，可能存在数据偏差和算法局限性 | 探索心力衰竭中巨噬细胞的机制及其相关的关键基因 | 心力衰竭中的巨噬细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA |
| 277 | 2024-12-25 |
Innovative strategies to optimise colorectal cancer immunotherapy through molecular mechanism insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1509658
PMID:39717768
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析结直肠癌患者的肿瘤微环境，识别关键细胞类型和分子通路，以优化免疫治疗策略 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了结直肠癌中的关键细胞亚型，并验证了DLX2基因作为潜在治疗靶点的可行性 | 研究样本量较小，仅包括4名患者的13个组织样本，可能影响结果的普适性 | 通过分子机制研究优化结直肠癌的免疫治疗策略 | 结直肠癌患者的肿瘤微环境和分子机制 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名患者的13个组织样本 |
| 278 | 2024-12-24 |
MICA: a multi-omics method to predict gene regulatory networks in early human embryos
2024-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302415
PMID:37879938
|
研究论文 | 本文评估了不同线性和非线性基因调控网络（GRN）预测方法在单细胞模拟和人类胚胎转录组数据集上的应用，并比较了表达归一化对GRN预测的影响 | 提出了基于互信息（MI）和染色质可及性（CA）的非线性方法MICA，用于单细胞转录组数据集的GRN预测，捕捉复杂的非单调依赖性和反馈回路 | NA | 在早期人类胚胎中预测基因调控网络 | 单细胞模拟数据集和人类胚胎转录组数据集 | 基因组学 | NA | 单细胞组学 | 非线性方法 | 转录组数据 | NA |
| 279 | 2024-12-22 |
The conserved wobble uridine tRNA thiolase Ctu1 is required for angiogenesis and embryonic development
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0315854
PMID:39705244
|
研究论文 | 本文研究了保守的摇摆尿苷tRNA硫醇酶Ctu1在血管生成和胚胎发育中的作用 | 首次发现Ctu1对脊椎动物的血管生成和胚胎发育至关重要 | 对Ctu1在脊椎动物模型中的生物学功能研究尚不充分 | 探讨Ctu1在血管生成和胚胎发育中的作用 | Ctu1在斑马鱼胚胎和人类内皮细胞中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼胚胎和人类内皮细胞 |
| 280 | 2024-12-21 |
Comprehensive analysis of skin growth-related hub genes and microenvironment characterization in a mouse expanded skin model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1306353
PMID:39703504
|
研究论文 | 本文分析了在小鼠扩展皮肤模型中与皮肤生长相关的关键基因及其微环境特征 | 本文通过随机森林和蛋白质-蛋白质相互作用网络分析，识别出与皮肤再生相关的关键基因，并揭示了这些基因在不同细胞类型中的表达及其相互作用 | 本文的研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨机械拉伸介导的组织扩展过程中皮肤生长的细胞和分子机制，并识别关键基因和细胞类型 | 小鼠扩展皮肤模型中的关键基因和微环境特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的小鼠芯片测序数据和单细胞测序数据 |