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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-07 |
Biomarker discovery in acetaminophen hepatotoxicity: leveraging single-cell transcriptomics and mechanistic insight
2024 Jan-Jun, Expert review of clinical pharmacology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/17512433.2024.2306219
PMID:38217408
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综述 | 本文探讨了对乙酰氨基酚肝毒性中生物标志物的发现，重点关注单细胞转录组学方法和机制研究 | 整合小鼠模型机制研究与人类对乙酰氨基酚过量病理生理学，利用单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术发现新型生物标志物 | 所有已发现的生物标志物仍需进一步验证，需要更大规模的队列研究来确认其临床实用性 | 识别对乙酰氨基酚诱导急性肝衰竭的预后生物标志物，以确定需要肝移植的患者 | 对乙酰氨基酚肝毒性机制、生物标志物发现 | 数字病理学 | 肝毒性、急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学方法 | NA | 转录组数据、分子表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 242 | 2025-10-07 |
G-protein signaling of oxytocin receptor as a potential target for cabazitaxel-resistant prostate cancer
2024-Jan, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgae002
PMID:38250514
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞，发现催产素受体信号通路可作为治疗靶点 | 首次在卡巴他赛耐药前列腺癌中发现催产素受体信号通路上调，并验证氯哌斯汀通过抑制该通路具有抗肿瘤活性 | 样本量有限，需要更大规模的临床研究验证 | 探索卡巴他赛耐药前列腺癌的耐药机制并寻找治疗靶点 | 卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞和肿瘤组织 | 单细胞测序 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间基因表达分析, 质谱磷酸化蛋白质组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 243 | 2025-10-07 |
SPANN: annotating single-cell resolution spatial transcriptome data with scRNA-seq data
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad533
PMID:38279647
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研究论文 | 提出一种名为SPANN的注释方法，用于将单细胞RNA测序数据的细胞类型标签转移到空间转录组数据并发现新型细胞 | SPANN能够自动检测未见细胞类型的新型细胞，同时在已知细胞类型上保持高注释准确性，并通过寻找空间转录组样本与RNA数据原型之间的映射实现细胞类型级别的对齐 | NA | 开发空间转录组数据的注释工具，解决现有方法在细胞类型映射和新细胞检测方面的不足 | 单细胞分辨率空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 244 | 2025-10-07 |
Negative binomial mixture model for identification of noise in antibody-antigen specificity predictions from single-cell data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae170
PMID:39659592
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研究论文 | 提出一种使用负二项混合模型对LIBRA-seq单细胞数据进行去噪的方法 | 首次将负二项混合模型应用于LIBRA-seq数据的噪声识别，通过聚类抗原计数为信号和噪声组分 | 方法在不同样本间存在数据规模和噪声结构的变异 | 提高单细胞B细胞受体测序数据中抗体-抗原特异性预测的准确性 | LIBRA-seq单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞B细胞受体测序，LIBRA-seq | 负二项混合模型 | 单细胞测序数据 | 9名供者代表的独立LIBRA-seq实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | LIBRA-seq（通过测序连接B细胞受体与抗原特异性） |
| 245 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing elucidates cellular plasticity in esophageal small cell carcinoma following chemotherapy treatment
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1477705
PMID:39850495
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析食管小细胞癌患者化疗前后的细胞可塑性变化 | 首次在单细胞水平揭示食管小细胞癌化疗后的细胞可塑性动态变化及肿瘤微环境组成改变 | 仅基于单个患者的样本分析，样本量有限 | 探究食管小细胞癌化疗后细胞可塑性的分子机制 | 食管小细胞癌患者化疗前后的肿瘤组织样本 | 单细胞测序分析 | 食管小细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者化疗前后配对的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2025-10-07 |
Hyperoxia impairs induced pluripotent stem cell-derived endothelial cells and drives an atherosclerosis-like transcriptional phenotype
2024, JVS-vascular science
DOI:10.1016/j.jvssci.2024.100193
PMID:38770110
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研究论文 | 本研究探讨高氧条件对诱导多能干细胞来源内皮细胞功能的影响及其与动脉粥样硬化表型的关联 | 首次发现高氧培养的晚期iPSC-ECs会发展为内皮-间质转化表型，且其转录表型与动脉粥样硬化内皮细胞存在重叠 | 生理氧条件虽能改善线粒体功能，但单独使用不足以保持血管生成能力 | 研究不同氧浓度条件下iPSC-ECs的功能特性和分子表型变化 | 诱导多能干细胞来源的内皮细胞 | 干细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 247 | 2025-10-07 |
SGSM2 in Uveal Melanoma: Implications for Survival, Immune Infiltration, and Drug Sensitivity
2024, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
|
研究论文 | 本研究探讨SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的表达及其与预后、免疫浸润和药物敏感性的关系 | 首次系统研究SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的表达模式及其临床意义，揭示了其与免疫浸润和药物敏感性的新关联 | 研究主要基于生物信息学分析和细胞系实验，需要更多临床样本验证 | 阐明SGSM2在葡萄膜黑色素瘤中的作用机制及其临床价值 | 葡萄膜黑色素瘤细胞系和TCGA数据库中的患者数据 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | qRT-PCR, 生物信息学分析, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据库中的葡萄膜黑色素瘤患者样本和细胞系 | NA | 单细胞测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 248 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell transcriptomics and bulk transcriptomics to explore prognostic and immunotherapeutic characteristics of nucleotide metabolism in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1466249
PMID:39845190
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和批量转录组数据，探索核苷酸代谢在肺腺癌中的预后和免疫治疗特征 | 首次构建基于核苷酸代谢相关基因的预后风险评分模型，并发现其能准确预测肺腺癌患者预后和免疫治疗反应 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索核苷酸代谢在肺腺癌预后和免疫治疗中的作用机制 | 肺腺癌患者和肺腺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序，批量转录组测序，体外细胞实验 | Lasso + Stepcox机器学习组合模型 | 转录组数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 249 | 2025-10-07 |
Magnetically functionalized hydrogels for high-throughput genomic applications
2024-Jan-22, Advanced materials technologies
IF:6.4Q1
DOI:10.1002/admt.202301155
PMID:38645306
|
研究论文 | 本研究开发了一种磁功能化水凝胶珠用于简化单细胞基因组学中的分池方法 | 首次实现水凝胶珠的磁功能化，显著提高分池方法的纯化效率和自动化潜力 | 未明确说明磁功能化珠在长期稳定性或大规模生产中的表现 | 开发自动化单细胞基因组学工作流程的新方法 | 磁功能化水凝胶珠 | 单细胞基因组学 | NA | BAG-Seq单细胞测序 | NA | 基因组序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 250 | 2025-10-07 |
GMFGRN: a matrix factorization and graph neural network approach for gene regulatory network inference
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad529
PMID:38261340
|
研究论文 | 提出一种基于矩阵分解和图神经网络的基因调控网络推断新方法GMFGRN | 结合图神经网络进行矩阵分解学习基因表征嵌入，能有效消除传递性相互作用且计算资源需求低 | NA | 从单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN), 矩阵分解 | 基因表达数据 | 8个静态单细胞RNA测序数据集和4个时间序列数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 251 | 2025-10-07 |
The lysosome-related characteristics affects the prognosis and tumor microenvironment of lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1497312
PMID:39839650
|
研究论文 | 本研究通过构建溶酶体风险特征来预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次系统研究溶酶体相关基因在肺腺癌中的作用，构建了7个关键基因的风险特征，并在单细胞水平验证其功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索溶酶体相关基因在肺腺癌预后和肿瘤微环境中的作用 | 肺腺癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外实验 | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 252 | 2025-10-07 |
Comparative evaluation of ACetic - MEthanol high salt dissociation approach for single-cell transcriptomics of frozen human tissues
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1469955
PMID:39839668
|
研究论文 | 评估ACME HS方法在冷冻人体组织中单细胞转录组学的应用效果 | 首次将ACME方法优化应用于人类内分泌组织，并使用高盐洗涤缓冲液替代标准PBS以稳定RNA | 主要针对人类内分泌组织，在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 开发适用于冷冻组织的单细胞分离方法，提高单细胞RNA测序质量 | 人类内分泌组织样本 | 单细胞转录组学 | 内分泌系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 41个组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 253 | 2025-10-07 |
Exploring the shared gene signatures and mechanism among three autoimmune diseases by bulk RNA sequencing integrated with single-cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1520050
PMID:39840076
|
研究论文 | 通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析探索三种自身免疫疾病的共享基因特征和机制 | 首次整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析三种自身免疫疾病的共享基因特征，并利用机器学习算法筛选诊断生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探究多发性硬化症、系统性红斑狼疮和类风湿关节炎三种自身免疫疾病的共享基因特征，识别早期诊断生物标志物 | 多发性硬化症、系统性红斑狼疮和类风湿关节炎患者及EAE小鼠模型 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, 机器学习算法, Cibersort算法 | 机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2025-10-07 |
Metabolic reprogramming and macrophage expansion define ACPA-negative rheumatoid arthritis: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1512483
PMID:39830504
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示ACPA阴性类风湿关节炎的代谢重编程和巨噬细胞扩增特征 | 首次在单细胞水平系统揭示ACPA阴性类风湿关节炎的独特代谢特征和免疫细胞相互作用 | 样本量有限，需要更大规模验证 | 阐明ACPA阴性类风湿关节炎的细胞和代谢特征以寻找诊断标志物和治疗靶点 | ACPA阴性和阳性类风湿关节炎患者及健康对照的外周血单核细胞和滑膜组织 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞转录组数据 | ACPA阴性RA患者、ACPA阳性RA患者和健康对照的PBMC和滑膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 255 | 2025-10-07 |
Myeloid dendritic cells and periodontal disease association: integrated study of single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522281
PMID:39830509
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研究论文 | 通过单细胞测序和孟德尔随机化分析研究髓系树突状细胞与牙周病的关联 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析揭示LIMA1基因在牙周病进展中的因果作用 | 研究依赖于公共数据集，样本来源有限 | 探索牙周病发病机制中的关键细胞类型和基因 | 牙周病患者免疫细胞亚型 | 生物信息学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | Seurat, CellChat, ClusterProfilerR | 单细胞转录组数据, GWAS数据 | GSE152042数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 256 | 2025-10-07 |
scRNA-seq reveals elevated interferon responses and TNF-α signaling via NFkB in monocytes in children with uncomplicated malaria
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10233
PMID:39830896
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童非复杂性疟疾患者单核细胞的免疫反应特征 | 首次在儿童非复杂性疟疾中发现单核细胞中干扰素反应和TNF-α/NFκB信号通路上调 | 样本量有限（仅11名参与者进行单细胞测序），仅针对非复杂性疟疾 | 确定与症状性疟疾相关的宿主-寄生虫因素和免疫反应差异 | 224名疟疾感染者（134名患者和90名无症状对照） | 单细胞基因组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 224名参与者，其中11名进行单细胞测序（18,176个外周血单核细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 257 | 2025-10-07 |
Unveiling and validating biomarkers related to the IL-10 family in chronic sinusitis with nasal polyps: insights from transcriptomics and single-cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1513951
PMID:39830981
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研究论文 | 通过转录组学和单细胞RNA测序分析识别并验证与IL-10家族相关的慢性鼻窦炎伴鼻息肉生物标志物 | 首次系统探索IL-10家族在CRSwNP中的生物学作用，通过多算法筛选和单细胞测序验证发现四个新型生物标志物 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 识别和验证与IL-10家族相关的慢性鼻窦炎伴鼻息肉生物标志物 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者组织样本 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | LASSO, SVM-RFE, Boruta算法 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE136825, GSE179265, GSE196169) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 258 | 2025-10-07 |
Identification and validation of five ferroptosis-related molecular signatures in keloids based on multiple transcriptome data analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1490745
PMID:39834787
|
研究论文 | 本研究通过多组转录组数据分析鉴定并验证了与瘢痕疙瘩相关的五个铁死亡相关分子标志物 | 首次系统性地识别了瘢痕疙瘩中与铁死亡相关的关键基因，并通过单细胞测序等多重分析验证了这些基因在纤维化过程中的作用 | 样本量相对有限（24个瘢痕疙瘩和17个正常皮肤样本），需要更大规模的研究验证 | 探索铁死亡在瘢痕疙瘩形成机制中的作用，并识别相关关键基因 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 生物信息学 | 皮肤疾病 | 转录组测序, qRT-PCR, Western blot, 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 24个瘢痕疙瘩样本和17个正常皮肤样本（转录组数据），外加5个瘢痕疙瘩和5个正常皮肤活检（实验验证） | NCBI | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | GEO数据库 | NCBI GEO数据库中的GSE145725、GSE7890、GSE44270和GSE181316数据集 |
| 259 | 2025-10-07 |
An exhausted-like microglial population accumulates in aged and APOE4 genotype Alzheimer's brains
2024-01-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.12.001
PMID:38159571
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现阿尔茨海默病大脑中积累了一种类似耗竭状态的炎症性小胶质细胞群 | 首次鉴定出在衰老和APOE4基因型阿尔茨海默病大脑中积累的终末炎症性小胶质细胞(TIM)群体 | 研究主要基于AD模型小鼠，人类样本验证有限 | 探究年龄和APOE4基因变异如何改变神经免疫功能 | 携带三种常见人类APOE等位基因的AD模型小鼠和人类AD患者脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序,染色质可及性分析,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | AD模型小鼠和人类AD患者脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 260 | 2025-10-07 |
The bone marrow is the primary site of thrombopoiesis
2024-01-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020895
PMID:37879046
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研究论文 | 本研究通过多种成像技术和单细胞RNA测序分析证实骨髓是血小板生成的主要场所 | 首次系统比较骨髓、脾脏和肺部巨核细胞的相对丰度及血小板生成能力，结合多种先进成像技术和单细胞测序数据分析 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据来源于已发表的单细胞测序数据库，需要进一步实验验证 | 确定在稳态条件下血小板生成的主要器官及其相对贡献 | 成年小鼠的骨髓、脾脏和肺部巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 双光子活体成像, 光片显微镜, 定量组织成像 | NA | 图像, 测序数据, 流式数据 | 成年小鼠骨髓、脾脏和肺部组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |