单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202401-202401] [清除筛选条件]
当前共找到 1397 篇文献,本页显示第 221 - 240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
221 2026-05-06
Single-cell RNA sequencing highlights the influence of innate and adaptive immune response mechanisms in psoriatic arthritis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者的外周血单个核细胞,揭示先天性和适应性免疫反应机制对疾病异质性的影响 首次在单细胞水平上比较无皮肤银屑病的银屑病关节炎患者与伴有皮肤银屑病的银屑病关节炎患者的基因表达差异,揭示临床表型与免疫机制之间的关联 直接比较两组患者未发现差异表达基因,且样本量有限 探索银屑病关节炎患者临床异质性与免疫机制的关联,区分不同临床表型在免疫细胞水平上的差异 70名银屑病关节炎患者(包括无皮肤银屑病和伴有皮肤银屑病两种表型)和10名健康对照者的外周血单个核细胞 数字病理学 银屑病关节炎 单细胞RNA测序(scRNAseq) NA 基因表达数据 70名银屑病关节炎患者和10名健康对照者的外周血单个核细胞 BD Biosciences 单细胞RNA测序 BD Rhapsody BD Rhapsody™ 单细胞分析系统
222 2026-05-04
Machine learning-based selection of immune cell markers in osteosarcoma: prognostic determination and validation of CLK1 in disease progression
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过机器学习选择骨肉瘤免疫细胞标志物,构建预后模型并验证CLK1在疾病进展中的作用 利用多算法计算框架结合20种机器学习算法构建基于肿瘤浸润免疫细胞的预后模型,并发现CLK1作为潜在癌基因促进骨肉瘤细胞增殖和迁移 未提及具体的局限性 提高对骨肉瘤肿瘤微环境的理解,开发预后模型并识别新的治疗靶点 骨肉瘤患者临床和RNA表达数据、单细胞RNA测序数据以及人骨肉瘤细胞系MG63和U2OS 机器学习 骨肉瘤 RNA测序、单细胞RNA测序 机器学习算法 RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 11例骨肉瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
223 2026-05-02
scRNA-seq reveals that origin recognition complex subunit 6 regulates mouse spermatogonial cell proliferation and apoptosis via activation of Wnt/β-catenin signaling
2024-01-01, Asian journal of andrology IF:3.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析发现ORC6通过激活Wnt/β-catenin信号调控小鼠精原细胞增殖与凋亡 首次揭示ORC6在精原细胞中上调并通过Wnt/β-catenin信号通路调控精原细胞增殖与凋亡 研究仅限于小鼠C18-4细胞系,需在体内实验进一步验证 探究ORC6基因在精原细胞增殖和凋亡中的作用机制 小鼠睾丸精原细胞及C18-4细胞系 单细胞转录组学 生殖相关疾病 scRNA-seq, 西方印迹, 免疫荧光, EdU, TUNEL, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 细胞系实验数据 小鼠睾丸组织样本及C18-4细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
224 2026-05-02
Identification and Validation of Cytotoxicity-Related Features to Predict Prognostic and Immunotherapy Response in Patients with Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2024, Genetics research IF:1.4Q4
研究论文 基于细胞毒性相关特征构建并验证透明细胞肾细胞癌患者预后及免疫治疗反应预测模型 首次利用单细胞RNA测序数据鉴定细胞毒性相关T细胞簇,并基于此构建预后风险模型,结合免疫浸润分析评估免疫治疗反应 仅依赖公共数据集GSE224630,缺乏独立外部验证队列;模型临床转化需进一步前瞻性研究验证 开发基于细胞毒性相关特征的预后模型,指导ccRCC患者免疫治疗决策 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者 机器学习和数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因共表达网络分析(WGCNA)、免疫浸润分析(CIBERSORT、MCP-counter、TIMER) Cox比例风险模型、列线图 单细胞转录组数据和批量转录组数据 GSE224630数据集中的ccRCC样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
225 2026-04-29
HIF2A mediates lineage transition to aggressive phenotype of cancer-associated fibroblasts in lung cancer brain metastasis
2024, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 通过对肺转移性肺癌单细胞RNA测序数据的再分析,发现癌症相关成纤维细胞在缺氧条件下经历由HIF-2α驱动的谱系转变,从而增强血管生成并促进肿瘤生长,揭示了肺癌脑转移的新机制 发现HIF-2α驱动癌症相关成纤维细胞谱系转变至更具侵袭性的表型,并明确其在肺癌脑转移微环境中的功能变化,提供了潜在的治疗靶点 未明确定量分析的样本规模有限,仅使用了四个配对的脑转移和原发肺癌样本进行验证 阐明肺癌脑转移中癌症相关成纤维细胞的谱系组成和功能变化及其分子机制 肺癌患者(包含原发灶和脑转移灶)的癌症相关成纤维细胞 机器学习和数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、多重免疫组织化学 NA 基因表达数据(单细胞和批量RNA测序)、免疫组化图像 四个配对的脑转移和原发肺癌样本(用于多重免疫组化验证) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA 基于公共数据集GSE131907的分析
226 2026-04-29
SIGLEC15, negatively correlated with PD-L1 in HCC, could induce CD8+ T cell apoptosis to promote immune evasion
2024, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 探究SIGLEC15在肝细胞癌中与PD-L1的负相关性及其通过诱导CD8+ T细胞凋亡促进免疫逃逸的机制 首次揭示SIGLEC15与PD-L1在肝细胞癌中的负相关表达模式,阐明SIGLEC15通过抑制CD8+ T细胞活力和诱导凋亡而非直接促进肿瘤增殖来介导免疫逃逸 未提及研究的明显局限 阐明SIGLEC15在肝细胞癌免疫逃逸中的功能及其与PD-L1的表达关系 肝细胞癌细胞系、免疫缺陷和免疫健全小鼠模型、Jurkat T细胞 机器学习 肝细胞癌 PCR分析、免疫组化、流式细胞术、RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、测序数据 肝细胞癌组织样本、小鼠肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
227 2026-04-25
Elucidating the changes in the heterogeneity and function of radiation-induced cardiac macrophages using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示辐射诱导心脏巨噬细胞的异质性和功能变化 首次在辐射诱导心脏损伤动物模型中,表征早期阶段巨噬细胞的多样性、特征及演化 NA 探究辐射后心脏功能的早期变化及心脏巨噬细胞在此过程中的作用 辐射诱导心脏损伤小鼠模型中的心脏巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠心脏组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
228 2026-04-25
ΔNp63 Regulates Homeostasis, Stemness, and Suppression of Inflammation in the Adult Epidermis
2024-01, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示ΔNp63在成年表皮中调控稳态、干细胞性和抑制炎症的关键作用 首次通过急性基因敲除实验证明ΔNp63在成年表皮中维持角质形成细胞增殖和自我更新,并抑制银屑病样炎症 仅在小鼠模型中研究,未在人体表皮中验证;ΔNp63敲除后细胞消失机制未完全阐明 探究ΔNp63在成年表皮中的功能及其调控机制 成年小鼠表皮角质形成细胞 分子生物学 银屑病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠表皮样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
229 2026-04-24
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文描述了表观遗传调控的记忆性星形胶质细胞亚群,通过整合过去刺激事件加剧炎性反应,促进中枢神经系统病理过程 首次发现星形胶质细胞存在表观遗传控制的记忆亚群,并阐明ACLY-p300通路通过乙酰辅酶A调节染色质可及性来维持促炎记忆的机制 主要基于动物模型(EAE),人体验证仅限于MS慢性病灶的关联分析,记忆功能在人类中的直接证据有限 探究疾病相关星形胶质细胞亚群的稳定性、调控机制及其对后续刺激的响应能力 多发性硬化症(MS)及实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型中的星形胶质细胞 神经科学 多发性硬化症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ATAC-seq、ChIP-seq、FIND-seq、CRISPR/Cas9基因编辑 NA 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、组蛋白修饰数据 EAE模型小鼠(急性/慢性),以及慢性MS患者脑组织样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'转录组测序,Illumina NovaSeq高通量测序平台
230 2026-04-18
Enhancing Spatial Transcriptomics Analysis by Integrating Image-Aware Deep Learning Methods
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160299
研究论文 本研究提出了一种整合空间转录组学与组织病理学图像数据的新型深度学习方法,以更好地捕捉癌症组织中的生物学模式 首次将ResNet深度学习模型提取的形态学特征与空间基因表达数据相结合进行聚类分析,实现了图像感知的特征发现 方法主要针对胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌等侵袭性癌症类型,在其他癌症类型中的普适性有待验证 通过整合多模态数据提升空间转录组学分析的生物学洞察力 胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌组织样本 数字病理学 胶质母细胞瘤, 三阴性乳腺癌 空间转录组学, 组织病理学成像 ResNet-50, Louvain聚类 空间基因表达数据, 高分辨率全切片组织学图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
231 2026-04-08
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2024-01-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了前列腺癌进展中肿瘤微环境内间充质细胞的分子变化及其关键作用 首次通过跨物种(小鼠模型与人类肿瘤)单细胞分析,系统鉴定了八个保守的间充质细胞亚群,并发现骨转移相关基质特征,提出了超越Gleason评分的新型预后基因标志物 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类样本验证相对有限;未深入探讨间充质细胞与其他肿瘤微环境成分的动态互作机制 解析前列腺癌进展过程中肿瘤基质细胞的分子特征与功能作用 前列腺癌肿瘤微环境中的间充质细胞 单细胞组学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 四种基因工程小鼠模型及对应人类肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
232 2026-04-07
The bone marrow of mouse-rat chimeras contains progenitors of multiple pulmonary cell lineages
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过创建小鼠-大鼠嵌合体,探索了其骨髓中富含的肺细胞谱系前体细胞在辐射诱导肺损伤修复中的作用 利用跨物种嵌合体技术生成富含呼吸系统前体细胞的骨髓移植,首次证明这些细胞能贡献于肺内皮细胞和基质细胞 研究仅在小鼠模型中进行,尚未验证在人类或临床环境中的适用性 开发一种能促进辐射诱导肺损伤后肺修复的新型骨髓移植方法 小鼠-大鼠嵌合体的骨髓细胞及其在辐射诱导肺损伤小鼠模型中的移植效果 数字病理学 肺损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据、免疫染色和流式细胞术数据 未明确指定具体样本数量,但涉及小鼠-大鼠嵌合体及移植实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
233 2026-04-06
PAGER-scFGA: unveiling cell functions and molecular mechanisms in cell trajectories through single-cell functional genomics analysis
2024, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本文介绍了PAGER-scFGA工具,用于通过单细胞功能基因组学分析揭示细胞轨迹中的细胞功能和分子机制 开发了PAGER-scFGA工具,整合细胞功能注释和基因集富集分析到单细胞分析流程中,支持细胞轨迹的功能探索和基因网络构建 NA 促进细胞群的功能注释和细胞轨迹分子机制的表征 小鼠自然杀伤细胞 单细胞功能基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
234 2026-04-05
An IL-4 signalling axis in bone marrow drives pro-tumorigenic myelopoiesis
2024-01, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了IL-4信号轴在骨髓中驱动促肿瘤性髓系生成的关键作用,并探索了其作为免疫检查点阻断联合疗法的潜力 首次在人类和小鼠非小细胞肺癌中通过单细胞RNA测序鉴定出IL-4是肿瘤浸润单核细胞来源巨噬细胞表型的主要驱动因子,并发现骨髓中嗜碱性粒细胞和嗜酸性粒细胞来源的IL-4通过作用于粒细胞-单核细胞祖细胞编程免疫抑制性肿瘤促进髓系细胞的发育 临床试验样本量较小(仅6名患者),且仅有一名患者显示出接近完全的临床反应,需要更大规模的验证 探究免疫抑制性髓系细胞状态的分子驱动机制,并开发针对癌症的系统性治疗策略 人类和小鼠的非小细胞肺癌病变组织及骨髓细胞 单细胞测序与免疫学 肺癌 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞RNA测序数据 人类和小鼠非小细胞肺癌样本,临床试验涉及6名复发或难治性非小细胞肺癌患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
235 2026-04-03
Multi-omics in exploring the pathophysiology of diabetic retinopathy
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)及其他多组学技术在探索糖尿病视网膜病变(DR)病理生理机制中的重要作用 系统性地整合并强调了scRNA-seq与其他多组学技术(如转录组学、遗传关联研究、代谢组学)的协同作用,为揭示DR的复杂分子机制、发现新生物标志物和治疗靶点提供了革命性的视角 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据,其结论基于对现有研究的总结和展望 探讨多组学技术,特别是scRNA-seq,在阐明糖尿病视网膜病变(DR)病理生理机制中的应用与贡献 糖尿病视网膜病变(DR)的分子机制、细胞类型、信号通路、生物标志物及潜在治疗靶点 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多组学分析(包括转录组学、遗传关联研究、代谢组学) NA NA NA NA 单细胞RNA测序,多组学分析 NA NA
236 2026-04-03
Breast pericytes: a newly identified driver of tumor cell proliferation
2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和细胞培养实验,揭示了乳腺周细胞作为肿瘤微环境中的关键因子,能显著促进乳腺癌细胞增殖 首次成功分离并纯化乳腺周细胞,利用单细胞RNA测序定义了其异质性,并发现周细胞在部分乳腺肿瘤中脱离血管成为主要间充质细胞类型,且能诱导肿瘤细胞快速生长 周细胞在肿瘤中的具体刺激机制尚未完全阐明,且样本量可能有限,需要进一步研究验证 探究乳腺周细胞在乳腺癌微环境中的作用及其对肿瘤细胞增殖的影响 乳腺组织中的周细胞和乳腺癌细胞 数字病理学 乳腺癌 FACS, 单细胞RNA测序, 转录组深度测序 NA RNA序列数据, 细胞培养数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
237 2026-04-01
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究探讨了套细胞淋巴瘤对PRMT5靶向治疗产生耐药性的机制,并发现mTOR信号通路上调是耐药的关键因素,通过mTORC1抑制剂temsirolimus可克服耐药性 首次在套细胞淋巴瘤中系统研究PRMT5抑制剂耐药机制,结合患者来源异种移植模型和细胞系模型,通过单细胞RNA测序揭示mTOR信号通路在耐药中的核心作用,并验证了联合靶向治疗的协同效应 研究主要基于体外细胞系和PDX模型,缺乏大规模临床样本验证;耐药机制可能涉及其他未被发现的通路;长期联合治疗的安全性和有效性需进一步评估 探究套细胞淋巴瘤对PRMT5靶向治疗产生耐药性的分子机制,并寻找克服耐药性的治疗策略 套细胞淋巴瘤细胞系、患者来源异种移植模型 肿瘤生物学 套细胞淋巴瘤 RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 8个细胞系(4个敏感,4个原发耐药),4个耐药细胞系,PDX模型 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
238 2026-03-21
Identification and exploration of aging-related subtypes and distinctive role of SERPINE1 in heart failure based on single-cell and bulk RNA sequencing data
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞和bulk RNA测序数据,探索了衰老相关基因在心力衰竭中的作用,并识别了新的诊断生物标志物和分子亚型 结合单细胞和bulk RNA测序数据,首次识别了SERPINE1在心力衰竭中的关键作用,并揭示了其与衰老相关亚型、免疫浸润和代谢微环境的关联 研究样本量有限(仅20个血液样本用于RT-qPCR验证),且未进行大规模临床验证 探索心力衰竭的新诊断生物标志物、分子分型和治疗策略 心力衰竭患者和正常对照的血液样本及测序数据 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR 诊断模型 RNA测序数据, 基因表达数据 未明确总测序样本数,但包括10名正常对照和10名心力衰竭患者的血液样本用于验证 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
239 2026-03-21
Peroxisome proliferator-activated receptors signature reveal the head and neck squamous cell carcinoma energy metabolism phenotype and clinical outcome
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过多数据集分析揭示了过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)相关基因在头颈部鳞状细胞癌(HNSC)中的作用,构建了预后模型并探讨了其与能量代谢和免疫治疗响应的关联 首次在HNSC中利用单细胞RNA测序数据全面分析PPAR相关基因特征,构建了基于七个PPAR相关基因的高精度预后模型,并发现这些基因能区分HNSC的能量代谢异质性 研究主要基于公共数据集,缺乏独立的前瞻性临床队列验证,且未进行实验验证PPAR相关基因的具体功能机制 探究PPAR相关基因在HNSC中的表达特征、预后价值及其与能量代谢和免疫微环境的关系 头颈部鳞状细胞癌(HNSC)患者样本,包括肿瘤组织和正常组织 生物信息学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,免疫组化分析,功能富集分析 LASSO回归,Cox回归模型 RNA测序数据,单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据 多个公共数据集(TCGA-HNSC, GSE41613, GSE139324, PRJEB23709, IMVigor),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
240 2026-03-21
Cross-talk of pyroptosis-based subtypes, the development of a risk classifier and immune responses in cervical cancer
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究基于焦亡相关基因对宫颈癌进行分型,开发了一个风险分类器,并探讨了其与免疫应答的关系 首次基于焦亡相关基因对宫颈癌进行分子分型,并构建了一个包含四个基因(PEG3、FSCN1、CDH3和SLC2A1)的风险分类器,同时揭示了不同风险组间的免疫微环境差异 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列验证;单细胞测序分析可能受限于样本量和细胞类型覆盖 探索焦亡在宫颈癌中的预后价值及其对免疫代谢的调控作用 宫颈癌患者样本和细胞系 生物信息学与计算生物学 宫颈癌 单细胞测序、PCR、CIBERSORT算法、无监督聚类分析、逐步Cox回归 风险分类器(基于Cox回归) 基因表达数据、单细胞测序数据、临床生存数据 两个独立队列共501例宫颈癌样本(C1组259例,C2组242例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部