单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
201 2024-10-27
NSUN6 and HTR7 disturbed the stability of carotid atherosclerotic plaques by regulating the immune responses of macrophages
2024, Open medicine (Warsaw, Poland)
研究论文 研究通过识别和验证八个关键基因,探讨了它们在颈动脉粥样硬化斑块稳定性中的作用 首次发现NSUN6和HTR7通过调节巨噬细胞的免疫反应影响颈动脉粥样硬化斑块的稳定性 研究主要基于体外实验和数据分析,缺乏体内实验验证 寻找促进颈动脉粥样硬化斑块从稳定状态转变为不稳定状态的关键基因 颈动脉粥样硬化斑块和巨噬细胞 NA 心血管疾病 RT-qPCR, ELISA, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 五组数据集,中风患者的样本
202 2024-10-26
LIG1 is a novel marker for bladder cancer prognosis: evidence based on experimental studies, machine learning and single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文探讨了LIG1在膀胱癌中的作用及其与预后的关系 首次系统研究LIG1在膀胱癌中的作用,结合实验研究、机器学习和单细胞测序技术 实验验证主要基于体外和细胞系,缺乏临床样本的直接验证 阐明LIG1与膀胱癌的相互作用及其与临床病理因素的相关性 LIG1在膀胱癌中的表达、功能及其与预后的关系 数字病理学 膀胱癌 单细胞测序 机器学习 基因表达数据 来自GEO数据库的膀胱癌和癌旁组织样本
203 2024-10-26
TP63 transcriptionally regulates SLC7A5 to suppress ferroptosis in head and neck squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究探讨了TP63通过转录调控SLC7A5抑制头颈鳞状细胞癌中的铁死亡机制 首次揭示了TP63+ SLC7A5+头颈鳞状细胞癌亚群通过TP63上调SLC7A5表达抑制铁死亡,从而促进肿瘤生长和免疫治疗抵抗的新机制 NA 研究头颈鳞状细胞癌在免疫治疗前后肿瘤微环境的异质性及其机制 头颈鳞状细胞癌患者在免疫治疗前后的肿瘤微环境 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA RNA NA
204 2024-10-26
Transcriptomic signatures of WNT-driven pathways and granulosa cell-oocyte interactions during primordial follicle activation
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞相互作用的调控机制 首次使用Wntless条件性敲除小鼠模型,揭示了WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞转录组变化的影响 研究仅限于Wntless条件性敲除小鼠模型,未探讨其他信号通路的影响 探讨WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞相互作用的调控机制 颗粒细胞和卵母细胞在原始卵泡激活过程中的转录组变化 生殖生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 Wntless条件性敲除小鼠
205 2024-10-26
Application of a risk score model based on glycosylation-related genes in the prognosis and treatment of patients with low-grade glioma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究基于糖基化相关基因的风险评分模型在低级别胶质瘤患者预后和治疗中的应用 首次构建了基于糖基化相关基因的风险评分模型,用于低级别胶质瘤的预后预测和治疗指导 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据,需要进一步的临床验证 探讨糖基化相关基因在低级别胶质瘤中的生物学功能及其在预后和治疗中的应用 低级别胶质瘤患者及其糖基化相关基因 数字病理 脑肿瘤 RNA-seq, scRNA-seq LASSO回归分析 基因表达数据 来自TCGA和GEO数据库的低级别胶质瘤患者数据
206 2024-10-26
Single-cell sequencing technology in skin wound healing
2024, Burns & trauma IF:6.3Q1
研究论文 本文探讨了单细胞测序技术在皮肤伤口愈合中的应用价值 单细胞测序技术能够准确检测细胞表达和基因序列,为伤口愈合研究提供了新的概念和工具 NA 探讨单细胞测序技术在皮肤伤口愈合中的应用及其在临床中的价值 皮肤伤口愈合过程中的细胞和分子机制 数字病理学 皮肤疾病 单细胞测序(SCS) NA 基因序列 NA
207 2024-10-25
Regulation of Bacteroides acidifaciens by the aryl hydrocarbon receptor in IL-22-producing immune cells has sex-dependent consequential impact on colitis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究了芳香烃受体(AhR)在IL-22产生免疫细胞中对Bacteroides acidifaciens的调控及其对结肠炎的性别依赖性影响 首次揭示了AhR在IL-22产生免疫细胞中对Bacteroides acidifaciens的调控作用及其对结肠炎的性别依赖性影响 研究仅限于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类 探讨AhR在IL-22产生免疫细胞中对Bacteroides acidifaciens的调控及其对结肠炎的影响 AhR缺陷小鼠、野生型小鼠及其同窝小鼠,以及Bacteroides acidifaciens 免疫学 炎症性肠病 单细胞RNA测序(scRNAseq)、16S rRNA微生物组分析 NA 基因表达数据、微生物组数据 AhR缺陷小鼠、野生型小鼠及其同窝小鼠,以及Bacteroides acidifaciens
208 2024-10-25
A comprehensive analysis of the role of cuproptosis in periodontitis through integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing
2024, Archives of medical science : AMS IF:3.0Q1
研究论文 本文通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据,全面探讨了铜死亡在牙周炎中的作用 首次综合利用单细胞和批量RNA测序数据分析铜死亡相关基因在牙周炎中的表达 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 探讨铜死亡与牙周炎之间的关系 牙周炎中的铜死亡相关基因 数字病理学 牙周病 RNA测序 NA RNA 小鼠模型
209 2024-10-25
Spatial transcriptomics: a new frontier in accurate localization of breast cancer diagnosis and treatment
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文总结了空间转录组学在乳腺癌诊断和治疗中的最新发现 空间转录组学为研究肿瘤内部结构差异和肿瘤微环境组成提供了新的视角 NA 探讨空间转录组学在乳腺癌精准治疗中的应用 乳腺癌及其肿瘤微环境 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学 NA 转录组数据 NA
210 2024-10-25
Exploring shared biomarkers and shared pathways in insomnia and atherosclerosis using integrated bioinformatics analysis
2024, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析,探索失眠与动脉粥样硬化之间的共享生物标志物和通路 首次通过整合生物信息学分析,筛选出失眠与动脉粥样硬化之间的共享基因,并构建了预测模型 研究主要基于现有数据库数据,未进行实验验证 探索失眠与动脉粥样硬化之间的共享通路和诊断生物标志物 失眠和动脉粥样硬化 生物信息学 心血管疾病 加权基因共表达网络分析、基因差异表达分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、机器学习算法 NA 基因表达数据 NA
211 2024-10-25
Integrating Bulk and Single-cell RNA-seq to Construct a Macrophage-related Prognostic Model for Prognostic Stratification in Triple-negative Breast Cancer
2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究整合了bulk和单细胞RNA测序数据,构建了一个与巨噬细胞相关的预后模型,用于三阴性乳腺癌的预后分层 本研究首次整合bulk和单细胞RNA测序数据,构建了一个与巨噬细胞相关的预后模型,用于三阴性乳腺癌的预后分层 本研究仅限于三阴性乳腺癌,未涵盖其他类型的乳腺癌 探索三阴性乳腺癌中巨噬细胞的异质性,并建立一个与巨噬细胞相关的预后模型,用于三阴性乳腺癌的预后分层 三阴性乳腺癌中的巨噬细胞及其相关基因 数字病理学 乳腺癌 RNA测序 NA 基因表达数据 NA
212 2024-10-25
Bibliometric and visual analysis of single-cell multiomics in neurodegenerative disease arrest studies
2024, Frontiers in neurology IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过文献计量学方法分析了单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用现状和趋势 首次系统性地利用文献计量学方法分析单细胞多组学在神经退行性疾病研究中的应用 主要依赖于文献计量学方法,缺乏实验数据和具体技术细节的深入分析 分析单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用现状和趋势 单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用 生物信息学 神经退行性疾病 单细胞多组学 NA 文献 596篇出版物
213 2024-10-24
Genetic variation in IL-4 activated tissue resident macrophages alters the epigenetic state to determine strain specific synergistic responses to LPS
2024-Jan-18, Research square
研究论文 研究探讨了不同遗传背景下IL-4激活的组织驻留巨噬细胞对LPS刺激的协同反应 揭示了遗传变异通过改变IL-4诱导的细胞内在表观遗传重编程,导致对LPS暴露的特定品系协同反应 NA 研究不同遗传背景下的组织驻留巨噬细胞对多重刺激的整合机制 C57BL/6和BALB/c品系的组织驻留巨噬细胞 表观遗传学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 混合骨髓嵌合小鼠
214 2024-10-24
CREB activation drives acinar to ductal reprogramming and promote pancreatic cancer progression in animal models of alcoholic chronic pancreatitis
2024-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究CREB激活在酒精性慢性胰腺炎动物模型中驱动腺泡细胞向导管细胞重编程并促进胰腺癌进展的作用 首次探讨了CREB与致癌基因Kras G12D/+在酒精性慢性胰腺炎中促进胰腺癌进展的协同作用 仅在动物模型中进行研究,尚未在人体中验证 探讨CREB激活在酒精性慢性胰腺炎中对胰腺癌进展的影响 酒精性慢性胰腺炎动物模型中的胰腺组织 NA 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNAseq) NA RNA 多种基因型小鼠模型,包括Ptf1a CreERTM/+、KC和KCC -/-小鼠
215 2024-10-24
Designing Oligonucleotide-Based FISH Probe Sets with PaintSHOP
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了使用PaintSHOP平台设计基于寡核苷酸的FISH探针集的方法 PaintSHOP平台提供了用户友好的网页界面,用于设计基于寡核苷酸的FISH探针集,并包含大量预先发现的探针序列和功能序列 NA 介绍如何使用PaintSHOP平台设计基于寡核苷酸的FISH探针集 基于寡核苷酸的FISH探针集的设计 生物信息学 NA 荧光原位杂交 (FISH) NA 序列数据 NA
216 2024-10-24
Transcriptome meta-analysis of Kawasaki disease in humans and mice
2024, Frontiers in pediatrics IF:2.1Q2
meta-analysis 本研究对川崎病(KD)在人类和小鼠中的转录组数据进行了元分析,以探索KD的转录组特征并评估动物模型 本研究首次对人类和小鼠的KD转录组数据进行了全面的元分析,揭示了关键的差异表达基因和通路,并验证了KD动物模型在识别治疗靶点方面的有效性 本研究主要依赖于bulk和单细胞RNA-seq数据,未来需要更全面的单细胞测序来详细描述不同血液细胞群体中的基因表达 探索川崎病的转录组特征并评估动物模型 川崎病患者的血液和冠状动脉样本,以及川崎病小鼠模型的心脏和大动脉样本 数字病理学 儿童疾病 RNA测序 NA 基因表达数据 包括来自KD患者的血液和冠状动脉样本,以及KD小鼠模型的心脏和大动脉样本
217 2024-10-24
[Molecular pathogenesis of adult T-cell leukemia/lymphoma]
2024, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
研究论文 本文总结了成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)的分子发病机制,重点关注遗传、表观遗传和单细胞分析的最新进展 本文通过遗传、表观遗传和单细胞分析揭示了ATLL的分子发病机制,特别是T细胞受体/NF-κB通路和免疫相关分子的频繁改变 NA 探讨成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)的分子发病机制 成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)的分子发病机制 NA 白血病 单细胞转录组分析 NA 基因数据 NA
218 2024-10-24
[Immune microenvironment and immunotherapy resistance in multiple myeloma]
2024, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
研究论文 本文探讨了多发性骨髓瘤(MM)的免疫微环境及其对免疫治疗抵抗的影响 利用单细胞RNA测序和飞行时间流式细胞术分析了MM患者骨髓中MM细胞与免疫细胞之间的时空相互作用 未提及具体的研究局限性 研究MM的免疫微环境及其对免疫治疗抵抗的机制,为开发长期完全缓解和治愈的免疫治疗策略提供依据 多发性骨髓瘤(MM)患者的免疫微环境 NA 血液肿瘤 单细胞RNA测序、飞行时间流式细胞术 NA RNA 未提及具体样本数量
219 2024-10-24
Discovery of plasma biomarkers related to blood-brain barrier dysregulation in Alzheimer's disease
2024, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本研究旨在通过整合公开的组学数据集,识别与阿尔茨海默病(AD)相关的血浆生物标志物,特别是与血脑屏障功能障碍相关的蛋白质 本研究首次通过整合血浆和脑蛋白质组数据,识别出五个符合生物标志物标准的蛋白质,并验证了其在AD中的生物学有效性 研究尚未深入探讨蛋白质通过血脑屏障泄漏的机制 识别与阿尔茨海默病相关的血浆生物标志物 血浆和脑蛋白质组数据 NA 阿尔茨海默病 蛋白质组学分析 NA 蛋白质组数据 NA
220 2024-10-24
Single-cell sequencing decodes the secrets of the RAP phenomenon of corticotomy
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序揭示了皮质切开术后铁代谢相关基因的显著增加,并探讨了Atf3+巨噬细胞在加速牙齿移动中的关键作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了皮质切开术后巨噬细胞的转录组异质性,并发现Atf3+巨噬细胞在加速牙齿移动中的新作用 研究主要集中在巨噬细胞和铁代谢上,未全面探讨其他细胞类型和分子机制 探讨皮质切开术后加速牙齿移动的分子机制 皮质切开术后的巨噬细胞和铁代谢 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 皮质切开术后的巨噬细胞样本
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