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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-06 |
Immune cell profiling of preeclamptic pregnant and postpartum women by single-cell RNA sequencing
2024, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2022.2144291
PMID:36369864
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析先兆子痫孕妇和产后妇女的免疫细胞特征 | 首次在单细胞水平系统描绘先兆子痫患者孕期和产后免疫细胞图谱,揭示免疫细胞亚群的异质性和动态变化 | 样本量较小(3例患者和2例对照),仅使用外周血单个核细胞进行研究 | 探究先兆子痫患者免疫系统在单细胞水平的特征和异质性 | 先兆子痫孕妇和健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例早发性先兆子痫孕妇和2例健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 202 | 2025-10-06 |
Chemokine receptors in primary and secondary lymphoid tissues
2024, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2023.11.003
PMID:39260934
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综述 | 本文综述了趋化因子受体在初级和次级淋巴组织免疫细胞中的存在与功能 | 系统梳理了不同趋化因子受体在淋巴器官中的特异性功能,如CXCR4在骨髓中的作用和CCR7在胸腺及次级淋巴组织中的调控机制 | 主要关注常规趋化因子受体,对非典型受体覆盖有限,且为综述性内容缺乏原始实验数据 | 探讨趋化因子受体在淋巴组织免疫细胞中的分布和功能 | 骨髓、胸腺、脾脏、淋巴结和派尔集合淋巴结等淋巴组织中的免疫细胞 | 免疫学 | NA | 高维光谱流式细胞术、单细胞测序 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 203 | 2025-10-06 |
Digital profiling of cancer transcriptomes from histology images with grouped vision attention
2024-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.28.560068
PMID:37808782
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研究论文 | 开发了一种基于分组视觉注意力的Transformer模型,从组织学图像预测癌症转录组 | 首次将Transformer架构应用于组织学图像进行全转录组预测,并展示了在空间基因表达预测和临床预后中的应用 | 模型在组织水平训练,空间基因表达预测能力仍需进一步验证 | 从组织学图像中预测癌症转录组特征 | 9种癌症类型的肿瘤样本 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习,转录组分析 | Transformer | 组织学图像,基因表达数据 | 预训练:1,802个正常组织样本;训练评估:4,331个肿瘤样本;验证:1,305个肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 204 | 2025-10-06 |
Origin and adult renewal of the gut lacteal musculature from villus myofibroblasts
2024-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.19.523242
PMID:36712064
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研究论文 | 本研究揭示了肠道绒毛平滑肌细胞的起源和成年更新机制 | 发现绒毛上皮下成纤维细胞前体通过中间收缩性肌成纤维细胞样表型成熟为平滑肌纤维的连续谱系,并鉴定NOTCH3-DLL4信号轴调控绒毛平滑肌与乳糜管组装 | 研究主要基于小鼠模型,人类肠道中的适用性需进一步验证 | 探究肠道绒毛平滑肌细胞的形成、分化和修复机制 | 小鼠肠道组织 | 发育生物学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序,定量谱系追踪 | NA | 基因表达数据,谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 205 | 2025-10-06 |
Underrepresentation of activating KIR gene expression in single-cell RNA-seq data is due to KIR gene misassignment
2024-Jan, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350590
PMID:37944995
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研究论文 | 本文揭示了单细胞RNA测序数据中激活型KIR基因表达被低估的原因是标准比对流程对KIR转录本的错误分配 | 首次系统性地识别并验证了单细胞RNA测序标准流程中KIR转录本错误分配的问题及其对激活型KIR表达量化的影响 | NA | 探究单细胞RNA测序数据中KIR基因表达量化的准确性问题 | 杀伤性免疫球蛋白样受体(KIR)转录本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 206 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.07.574209
PMID:38249519
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学筛选胰腺癌表面受体靶点,开发靶向紧密连接蛋白claudin-4的分子成像诊疗剂 | 首次通过空间转录组学数据驱动筛选发现claudin-4作为胰腺癌诊疗靶点,开发了特异性肽类分子成像剂 | NA | 开发胰腺癌分子成像和诊疗新方法 | 胰腺癌组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 分子成像 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 207 | 2025-05-08 |
A review of single-cell transcriptomics and epigenomics studies in maternal and child health
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2343276
PMID:38709139
|
review | 本文综述了单细胞转录组学和表观基因组学在母婴健康领域的研究 | 总结了16个人类和哺乳动物胎盘的单细胞图谱以及31项关于母体暴露和并发症的单细胞研究 | NA | 综述单细胞测序技术在母婴健康领域的应用 | 人类和哺乳动物胎盘以及母体暴露和并发症 | 单细胞测序 | 母婴健康相关疾病 | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 单细胞测序数据 | 16个单细胞图谱和31项单细胞研究 | NA | NA | NA | NA |
| 208 | 2025-05-07 |
Characterizing tumor biology and immune microenvironment in high-grade serous ovarian cancer via single-cell RNA sequencing: insights for targeted and personalized immunotherapy strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1500153
PMID:39896800
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究高级别浆液性卵巢癌的肿瘤生物学特性及免疫微环境,为靶向和个性化免疫治疗策略提供见解 | 利用单细胞RNA测序技术系统研究HGSOC的肿瘤异质性和免疫微环境,发现与不良预后相关的C2 IGF2+肿瘤细胞亚型及其与肿瘤进展的关联 | 研究依赖于公开数据库的scRNA-seq数据,可能受限于样本量和数据质量 | 揭示HGSOC进展和治疗抵抗的分子机制,开发更有效的个性化治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)的肿瘤细胞亚型及其免疫微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 预后模型 | RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2025-10-07 |
Genetic variation in IL-4 activated tissue resident macrophages alters the epigenetic state to determine strain specific synergistic responses to LPS
2024-Jan-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3759654/v1
PMID:38712032
|
研究论文 | 本研究探讨了C57BL/6和BALB/c小鼠品系中组织驻留巨噬细胞对IL-4激活的差异表观遗传反应及其对LPS协同响应的影响 | 首次揭示遗传背景通过改变IL-4诱导的表观遗传重编程决定巨噬细胞对LPS的品系特异性协同反应 | 研究仅限于腹膜腔组织驻留巨噬细胞,未涉及其他组织来源的巨噬细胞 | 解析遗传变异如何影响巨噬细胞整合多重刺激的表观遗传机制 | C57BL/6和BALB/c小鼠品系的腹膜腔组织驻留巨噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 表观基因组分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 两个小鼠品系的组织驻留巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 210 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics and chromatin accessibility profiling elucidate the kidney-protective mechanism of mineralocorticoid receptor antagonists
2024-01-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157165
PMID:37906287
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和染色质可及性分析揭示盐皮质激素受体拮抗剂的肾脏保护机制 | 首次结合单细胞表达和染色质可及性工具系统阐明盐皮质激素在肾脏中的靶基因和细胞类型,并比较不同降压药物的肾脏保护效果 | 研究基于大鼠模型,人类样本验证尚不充分 | 探究盐皮质激素受体拮抗剂在高血压相关肾脏疾病中的保护机制 | 大鼠肾脏细胞及人类肾脏样本 | 单细胞多组学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 染色质可及性数据 | 大鼠模型及人类肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 211 | 2025-10-07 |
Tuberculous meningitis diagnosis and treatment: classic approaches and high-throughput pathways
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1543009
PMID:39867878
|
综述 | 本文综述结核性脑膜炎的经典诊断治疗方法及高通量技术新途径 | 系统评估核酸检测、宏基因组测序和单细胞测序等新兴技术,探索代谢组学和蛋白质组学生物标志物的诊断潜力 | NA | 优化结核性脑膜炎诊断策略并推动多组学技术的临床转化 | 结核性脑膜炎的诊断和治疗技术 | NA | 结核性脑膜炎 | 核酸检测、宏基因组下一代测序、单细胞测序、代谢组学、蛋白质组学 | NA | 基因组数据、代谢组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 宏基因组下一代测序, 单细胞测序 | Xpert Ultra | NA |
| 212 | 2025-10-07 |
Infiltrating lipid-rich macrophage subpopulations identified as a regulator of increasing prostate size in human benign prostatic hyperplasia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494476
PMID:39867899
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了良性前列腺增生中富含脂质的巨噬细胞亚群,并探讨其与前列腺体积增大的关系 | 首次在良性前列腺增生中鉴定出TREM2高表达和MARCO高表达两种新型巨噬细胞亚群,揭示了脂质代谢重编程在巨噬细胞表型转变中的关键作用 | 样本量相对有限,需要进一步研究验证这些巨噬细胞亚群作为治疗靶点的潜力 | 探究巨噬细胞表型变化与良性前列腺增生发展的关系 | 人类良性前列腺增生组织中的CD45+过渡区白细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 20例人类前列腺组织(10例大于90克,10例小于40克) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 213 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of medaka lymphocytes reveals absence of fully mature T cells in the thymus and the T-lineage commitment in the kidney
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517467
PMID:39867910
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较野生型和突变型青鳉淋巴细胞,揭示其T细胞发育的独特特征 | 首次在青鳉中发现胸腺中缺乏完全成熟的T细胞,并在肾脏中鉴定出已定向T系发育的淋巴祖细胞 | 研究仅聚焦于青鳉和斑马鱼的比较,未涵盖其他硬骨鱼物种 | 探究硬骨鱼类淋巴细胞发育的分子和细胞机制差异 | 青鳉(野生型和V(D)J重组缺陷突变型)的胸腺和肾脏淋巴细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和突变型青鳉的胸腺和肾脏淋巴细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 214 | 2025-10-07 |
Identification of a pancreatic stellate cell gene signature and lncRNA interactions associated with type 2 diabetes progression
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1532609
PMID:39872314
|
研究论文 | 本研究通过识别胰腺星状细胞基因特征和lncRNA相互作用,揭示了2型糖尿病进展的新机制 | 首次发现COL1A2hi/VCANhi/SULF1hi胰腺星状细胞特异性特征及其在2型糖尿病中的独特作用,并构建了相关的lncRNA-mRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 | 探索2型糖尿病中胰腺星状细胞的基因表达特征及其通过lncRNA-mRNA相互作用在疾病进展中的调控机制 | 2型糖尿病患者的胰岛细胞、胰腺星状细胞和外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个2型糖尿病和1型糖尿病数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2025-10-07 |
Identification and validation of BATF as a prognostic biomarker and regulator of immune cell infiltration in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429855
PMID:39872530
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,发现BATF是急性髓系白血病中免疫细胞浸润的调节因子和预后生物标志物 | 首次系统揭示BATF在AML中的预后价值及其通过调节CD8+T细胞和NK细胞比例影响免疫细胞浸润的新机制 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,需要更多临床样本验证BATF的临床应用价值 | 探索BATF在急性髓系白血病中的预后价值和免疫调节作用 | 急性髓系白血病患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, 流式细胞术, 单细胞测序 | C1498小鼠AML模型 | 基因组数据, 临床数据, 实验数据 | TCGA-LAML和GEO(GSE37642)数据库样本 | NA | 单细胞测序, RNA-seq | NA | NA |
| 216 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals immune cell heterogeneity and increased Th17 cells in human fibrotic skin diseases
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522076
PMID:39872534
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示纤维化皮肤疾病中免疫细胞的异质性及Th17细胞增加现象 | 首次通过CD45+免疫细胞富集构建纤维化皮肤疾病的单细胞图谱,发现Th17细胞通过IL-17A促进瘢痕疙瘩成纤维细胞功能 | 研究样本量有限,仅针对瘢痕疙瘩等特定纤维化皮肤疾病 | 探究纤维化皮肤疾病中免疫细胞的细胞景观和Th17细胞的作用机制 | 瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织中的CD45+免疫细胞及成纤维细胞 | 单细胞测序分析 | 纤维化皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选, Ki-67染色, 划痕实验, 实时PCR, Western blotting | NA | 单细胞基因表达数据 | 瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 217 | 2025-10-07 |
Upregulation of interferon-γ response genes in monocytes and T cells identified by single-cell transcriptomics in patients with anti-citrullinated peptide antibody-positive early rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1439082
PMID:39877346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析比较了ACPA阳性和阴性早期类风湿关节炎患者的免疫系统差异 | 首次在单细胞水平揭示了ACPA+早期RA患者中干扰素-γ反应基因在单核细胞和T细胞中的普遍上调 | 样本量相对有限,仅分析了37,318个细胞 | 探究ACPA阳性和阴性早期类风湿关节炎患者的免疫系统差异 | 抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的早期类风湿关节炎患者 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,多重细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,血清细胞因子数据 | 37,318个CD45+细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2025-10-07 |
Immunometabolic alterations in type 2 diabetes mellitus revealed by single-cell RNA sequencing: insights into subtypes and therapeutic targets
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1537909
PMID:39877357
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示2型糖尿病中的免疫代谢改变,识别疾病亚型和潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平系统分析T2DM患者PBMCs的免疫代谢特征,基于代谢异质性定义三种疾病亚型,并识别关键转录因子和潜在治疗药物 | 样本量相对有限(37例患者和11例对照),仅分析外周血单个核细胞,未涉及组织特异性免疫代谢改变 | 阐明2型糖尿病的免疫代谢机制并识别治疗靶点 | 2型糖尿病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,基因集变异分析,机器学习 | 机器学习分类模型 | 单细胞转录组数据 | 37例2型糖尿病患者和11例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 219 | 2025-10-07 |
Characterization of NOD-like receptor-based molecular heterogeneity in glioma and its association with immune micro-environment and metabolism reprogramming
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1498583
PMID:39882240
|
研究论文 | 本研究通过分析胶质母细胞瘤患者的转录组数据,揭示了NOD样受体信号通路在肿瘤免疫微环境和代谢重编程中的关键作用 | 首次基于NLR基因表达谱将GBM患者分为具有不同临床预后的亚型,并鉴定TRIP6基因为NLR通路中的关键枢纽基因 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索NOD样受体信号通路在胶质母细胞瘤临床异质性中的作用机制 | 496例具有完整预后信息的胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序,单细胞测序,LASSO回归,COX回归,随机森林算法 | NMF聚类,LASSO,COX,随机森林 | 基因表达数据 | 496例GBM患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2025-10-07 |
Heterogeneity and synaptic plasticity analysis of hippocampus based on db-/- mice induced diabetic encephalopathy
2024-01, Psychoneuroendocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.psyneuen.2023.106412
PMID:37898037
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析db/db糖尿病小鼠海马体细胞异质性和突触可塑性,探索糖尿病脑病的发病机制 | 首次在糖尿病认知障碍模型中构建海马体单细胞转录组图谱,发现少突胶质前体细胞的五个新亚群及其与神经可塑性调控的关联 | 研究仅限于db/db小鼠模型,样本量相对有限,需要进一步验证Sstr2基因在神经可塑性中的具体作用机制 | 探索长期高血糖状态下海马体细胞异质性及其对突触可塑性的影响 | db/db糖尿病小鼠海马体细胞 | 数字病理学 | 糖尿病脑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | CI组21,379个细胞,对照组20,045个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |